首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 93 毫秒
1.
目的 通过生物信息学方法寻找双相情感障碍(BD)与非酒精性脂肪肝(NAFLD)之间的共表达差异基因。方法 选取GSE5388、GSE63067、GSE49541数据集作为在线数据库研究对象,在BD和NAFLD数据集中筛选疾病组与正常对照组的差异表达基因(DEG),并获得这2种疾病的共同表达的DEG。运用Web Gestalt数据库对2组间的交叉基因进行GO/KEGG分析,通过STRING数据库分析与共表达DEG有关的枢纽基因及蛋白,利用SPSS 23.0软件分别分析BD和NAFLD数据集中枢纽基因的诊断价值。结果 共筛选出59个共表达的DEG,GO/KEGG富集分析显示共表达的DEG主要在细胞代谢、生物调控等多种基因功能上发生富集。KEGG通路富集显示共表达DEG主要涉及神经活性配体-受体相互作用,神经退行性变的通路,炎症介质对TRP通道的调节、WNT信号通路、钙信号通路等多种机制通路。GAP43、ANO2、GABRG1、HTR2A和NGF 5个枢纽基因均对BD和NAFLD具有诊断价值。结论 BD和NAFLD之间具有共表达差异基因,在BD和NAFLD的发生和进展中起重要作用。  相似文献   

2.
目的分析亚砷酸钠(NaAsO2)致人肝星状细胞(LX-2细胞)纤维化及自噬相关的DNA甲基化位点, 筛选与纤维化及自噬相关的特异性甲基化基因。方法采用DNA甲基化芯片Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChips(850K甲基化芯片)对LX-2细胞(对照组)及NaAsO2干预(低、中、高剂量组:终浓度分别为5、10、15 μmol/L NaAsO2, 干预48 h)致LX-2细胞纤维化及自噬模型进行全基因组DNA检测, 寻找差异甲基化位点。对筛选出的差异甲基化基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析, 了解基因功能。结果高剂量组细胞纤维化及自噬模型构建成功。850K甲基化芯片检测结果显示, 高剂量组与对照组间存在25 817个显著差异甲基化位点, 其中高甲基化位点12 083个、低甲基化位点13 734个。GO功能富集分析显示, 差异甲基化基因参与的分子功能主要包括蛋白结合、离子结合、催化活性、酶结合。KEGG信号通路富集分析显示, 差异甲基化基因参与的通路主要包括代谢通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt...  相似文献   

3.
染矽尘大鼠早期肺组织差异基因表达谱的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 研究染矽尘大鼠早期肺组织与正常肺组织的差异基因表达谱.方法 应用气管暴露法建立雄性Wistar大鼠染矽尘模型和对照组,每组3只,应用Illumina激光共聚焦光纤微珠基因芯片技术,研究建模后14 d时的大鼠肺组织差异基因表达谱,并采用DAVID生物信息学分析工具,进行Fisher精确概率检验,对差异基因的基因功能和生物学通路进行富集统计学分析.结果 检测出的有效基因共22 107个,筛选出染矽尘组与对照组的差异基因共1567个,其中上调基因为765个,下调基因为802个.在KEGG生物学通路数据库中,共406个差异基因获得注释,上调基因为204个,其中11个生物学通路相关基因显著上调;下调的基因有202个,其中3个生物学通路相关基因显著下调.Real-time PCR实验验证了血红素加氧酶1(HMOXl)、超氧化物歧化酶2(SOD2)基因上调的趋势和基因芯片结果是一致的.结论 本次实验筛选出了染矽尘早期大鼠肺组织差异基因,提示矽尘致肺纤维化过程中可能存在相互作用的基因簇.  相似文献   

4.
目的分析转化生长因子-β1(TGF-β1)刺激的人胚肺成纤维细胞(IMR-90细胞)微阵列芯片差异表达基因(DEGs),筛选与成纤维细胞转分化相关的潜在关键基因和信号通路。方法从高通量基因表达数据库下载TGF-β1刺激IMR-90细胞的基因表达微阵列芯片数据集GSE17518,采用GENE-E软件进行DEGs筛选,将DEGs导入DAVID网络数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析;同时采用相互作用基因库检索工具数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心基因,并构建蛋白交互作用模块。结果共筛选出394个刺激相关DEGs,其中,上调基因223个,下调基因171个。GO分析显示,DEGs广泛参与细胞质、细胞膜、细胞外基质(ECM)以及外泌体等组分构成,调控ECM形成、细胞迁移与粘附、细胞增殖与凋亡等生物学功能;KEGG通路分析结果显示,DEGs主要富集于细胞的黏着斑、ECM-受体相互作用、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)等信号通路;PPI网络筛选出10个核心基因分别为核仁抗原2(NOP2)、琥珀酸脱氢酶B、谷氨酰-脯氨酰-tRNA合成酶(EPRS)、FtsJ同系物3(FTSJ3)、前折叠蛋白亚基4、Ras相关型C3肉毒杆菌毒素基质2、信号识别颗粒受体β亚单位、琥珀酸-辅酶A-GDP结合蛋白β亚基、短小杆菌RNA结合家族成员3(KIAA0020)、一般性囊泡转运因子p115;其中NOP2、EPRS、FTSJ3、KIAA0020主要分布于M1模块,NOP2是M1模块中节点数最高的核心基因。结论共筛选出与TGF-β1刺激相关的10个核心差异基因以及7条信号通路,其中黏着斑、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路以及基因NOP2、EPRS、FTSJ3、KIAA0020可能为包括矽肺在内的多种肺纤维化疾病发生发展过程中成纤维细胞异常激活的机制研究提供新的方向。  相似文献   

5.
目的探讨基于GEO数据库挖掘妊娠期高血压疾病患者胎盘潜在标志物及可能机制。方法从GEO数据库中收集妊娠期疾病高血压疾病人群研究的胎盘mRNA基因芯片GSE98224,共计48例,并根据是否发生妊娠期高血压疾病将其分为两组,即妊娠期高血压疾病组和对照组。在GEO2R平台内进行两组间的差异mRNA分析,筛选出修正P值<0. 05的基因数据,将筛选出的差异基因导入String在线数据库,完成这些基因编码蛋白之间的相互作用,以及GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果从共计44 098个有效基因中,筛选出151个差异基因,其中丝裂原活化蛋白激酶8 (MAPK8)、硫氧蛋白还原酶1 (TXNRD1)以及V-set和免疫球蛋白结构域遏制蛋白4 (VSIG4)是处于网络核心的蛋白。差异基因主要参与的生物学过程包括对缺氧的反应、形成细胞骨架组织、吞噬作用等;主要富集的细胞组分是质膜的整体成分、细胞质膜及细胞外基质等;主要发挥的分子功能包括蛋白绑定识别、转运活性及NAD绑定等;主要参与的信号通路包括癌症中错配调节信号通路、C转运蛋白信号通路、钙附着信号通路及花生四烯酸代谢信号通路。结论妊娠期高血压的发生可能与MAPK8、TXNRD1以及VSIG4所参与的调节通路有关。  相似文献   

6.
目的 分析正常女性仅在卵泡液中特异性表达的microRNAs(miRNAs)的功能及可能的代谢途径。方法 选取2017年9月至2018年3月于河南省人民医院生殖医学中心因单纯输卵管因素不孕就诊的患者30例,于取卵日当天收取第一管清亮无血液污染的卵泡液,提取、纯化卵泡液外泌体,作为实验组;同时于取卵日当天早晨抽取入组患者外周血,提取、纯化血清外泌体,作为对照组。提取纯化外泌体miRNA,采用miRNA芯片检测技术分析两组外泌体miRNAs的表达谱,筛选出卵泡液中特有的miRNAs,生物信息学技术分析卵泡液中特有的miRNAs的功能及可能参与的调控通路。结果 卵泡液特异性外泌体miRNAs的靶基因主要富集40种信号通路,其中一些信号通路与卵子发育密切相关,如MAPK信号通路、胰岛素信号通路、TGF-beta、PI3K-Akt信号通路等;且对MAPK、TGF-β信号的靶基因进行PPI网络互作分析,筛选出与MAPK信号通路关联度较高的靶基因有FGFR1、KRAS、BDNF、BRAF、EGFR、IGF1R,与TGF-beta信号通路关联度较高的靶基因有SMAD2、ACVR1、BVP4、SMAD4...  相似文献   

7.
目的应用生物信息学途径探究卵巢癌关键预后基因,有助于了解卵巢癌发生发展的分子机制,为卵巢癌患者提供新的治疗靶点。方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载浆液性卵巢癌上皮细胞和正常卵巢上皮细胞芯片数据GSE14407、GSE18520、GSE54388和GSE66957,用R语言软件筛选差异基因并得到共同差异基因。应用clusterProfiler软件对共同差异基因进行GO功能分析及KEGG通路富集分析。使用STRING建立蛋白互作用网络并使用cytoscape选出关键基因。采用survival包、survimner包对关键基因进行预后生存分析。结果经过筛选得到305个共同差异基因,其中250个基因表达上调,55个基因表达下调。共同差异基因主要富集于染色体分离、细胞周期G1/S转变、细胞黏附、细胞间连接、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(PI3K-AKT)信号通路、Rap1信号通路、细胞增殖调控和粘附斑激酶信号通路等。蛋白互作用网络筛选得到14个关键基因,生存分析显示UBE2C基因的高表达导致卵巢癌患者的总生存率明显降低。结论UBE2C基因的表达与卵巢癌患者的总生存率密切相关,有望成为提高卵巢癌患者预后的新的生物学靶点。  相似文献   

8.
目的基于GEO数据库挖掘先兆子痫(PE)患者外周血潜在标志物及可能机制。方法从GEO数据库中收集PE人群研究的外周血mRNA基因芯片GSE48424,共计36例,并根据是否发生PE将其分为两组,即PE组和对照组。在GEO2R平台内对各组的数据进行差异mRNA基因分析,剔除|Log2 Fold Change|<1、修正P值>0. 05以及信息不完整的基因数据,将筛选出的差异基因导入String在线数据库完成基因本体(GO)富集分析,并获得差异基因所编码的蛋白质之间的相互作用。结果筛选出差异基因65个,其中Toll样受体4 (TLR4)和GTP环化水解酶1 (GCH1)是处于网络核心的蛋白。差异基因主要参与的生物学过程包括对脂多糖的反应、对肿瘤坏死因子的反应、转化生长因子β生成的积极调节、Toll样受体信号通路的正调节和烟酰胺代谢过程;主要富集的细胞组分是神经元投射、突触小泡、高尔基体、质膜的整体成分和内质网;主要发挥的分子功能包括受体活性和蛋白质结合。结论 PE的发生可能与对脂多糖的受体活性调节有关,TLR4和GCH1可作为外周血中的潜在标志物。  相似文献   

9.
[目的]研究锰染毒12周大鼠体内锰的组织分布特点,以及高锰蓄积对纹状体的病理损伤。[方法]SD雄性大鼠(n=10)腹腔注射Mn Cl·4H2 2O,15 mg/kg体重,1次/d,5 d/周,持续染毒12周,同时设置对照组(n=10),腹腔内注射与染毒组等体积的生理盐水,周期相同。染毒结束,采用透射电镜观察两组大鼠(n=2)大脑纹状体病理改变;采用电感耦合等离子体发射光谱检测两组大鼠(n=8)各组织内锰含量。[结果]与对照组相比,染毒组大鼠体重增长缓慢。染毒12周后,除肺、小脑外,肝、胃、小肠、结肠、直肠、脾、肾、大脑、睾丸、心脏、毛发均有锰含量增高(P<0.05)。染毒组大鼠大脑组织锰含量[(1.29±0.05)μg/g组织]高于对照组[(0.65±0.13)μg/g组织](P=0.001)。透射电镜观察可见纹状体神经元内大量脂褐素沉积。[结论]锰在慢性锰中毒大鼠多组织贮留,主要影响消化系统、肾脏、睾丸以及大脑。锰的神经毒性可能与氧化损伤有关。  相似文献   

10.
目的 研究产前应激(PS)诱导的抑郁样子代大鼠大脑海马体的差异表达基因(DEG)及其表达规律和调节机制。方法 2020年3—10月选择SD大鼠建立慢性束缚应激模型进行研究。使用糖水偏好实验测试子代大鼠PS易感性(PS-S),分别采用旷场实验、强迫游泳实验、悬尾实验验证PS模型和糖水偏好实验筛选个体对应激反应的有效性。应用基于高通量测序的转录组学方法来表征PS-S子代大鼠海马体中的基因网络。在数据处理和质量控制之后,使用生物信息学分析筛选差异表达基因并进行分类。结果 鉴定出486个差异表达基因,其中230个上调,256个下调。GO功能富集分析显示,上调的基因中鉴别出20个GO注释,下调的基因中鉴别出17个GO注释。诸如“气体运输”、“血红蛋白复合物”、“氧气运输”、“氧载体活性”等GO注释在DEG中排名靠前。包括“谷氨酸与激酶活性”、“对含氧化合物的反应”和“视黄醇代谢过程”等7个GO注释可同时富集在上调和下调的DEG集。KEGG富集分析表明,这些DEG主要富集于色氨酸代谢、吞噬体、蛋白消化吸收、神经活性配体受体相互作用、果糖和甘露糖代谢等信号通路。分析发现TTR、CRABP2、FABP...  相似文献   

11.
目的对涉及煤焦油沥青的工业场所进行调查,检测工人所处职业环境中的PAHs含量并评估其对工人产生的职业健康风险。方法以煤焦油沥青使用企业为研究对象,对其进行职业卫生现场调查与检测,用高效液相色谱法检测样本中的16种PAHs,分析工人在该场所中PAHs接触剂量,并用累积毒性等效剂量法、预期寿命损失法、致癌风险系数法等方法进行职业健康风险评估。结果在所涉及的15个岗位中,部分工种所接触的总PAHs浓度较高,最高接触浓度为1 931.45 ng/m^3。不同岗位因工艺不同存在不同的危害风险水平,工人的终身超额危险度明显超过可接受范围,部分工种存在较高致癌风险,作业工人的成年人预期寿命损失最高值达到1 033.95小时。结论部分煤焦油沥青职业工人所接触的PAHs浓度较高,超出职业接触限值,并存在较高的职业健康风险。  相似文献   

12.
目的 探讨游离二氧化硅(SiO2)粉尘暴露大鼠肺组织不同时间点自噬标志物微管相关蛋白1轻链3(Microtubules associated protein 1 light chain 3,LC3)和酵母自噬相关基因6(Beclin1)的变化。 方法 将72只无特定病原体级(SPF)Wistar雄性大鼠随机分为溶剂对照组和SiO2模型组,模型组大鼠采用非暴露式气管滴注法一次性给予SiO2悬浮液建立矽肺模型,溶剂对照组大鼠给予等量生理盐水。造模后两组分别于1、7、14、21、28、60 d处死6只大鼠,用苏木精-伊红(HE)染色和Masson染色观察两组大鼠不同时间点肺组织常规病理变化和纤维化程度;用酶联免疫吸附(ELISA)法检测肺组织匀浆中转化生长因子(TGF)-β、白细胞介素(IL)-1和肿瘤坏死因子(TNF)-α的水平;用Western blot法检测肺组织中自噬相关蛋白LC3和Beclin1的相对表达水平。 结果 HE染色结果显示,模型组大鼠肺组织在第1天至第60天持续存在炎性反应,炎性评分均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);Masson染色观察结果显示,模型组大鼠肺组织从第14天开始出现少量胶原纤维增生,至第60天可见大量胶原纤维,纤维化评分明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);对照组大鼠肺组织未见胶原纤维增生。ELISA法测定结果显示,模型组大鼠在染尘后各时间点肺组织匀浆中IL-1、TNF-α和TGF-β的含量均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。Western blot结果显示,模型组大鼠肺组织Beclin1蛋白表达水平在第7、14、21、28和60天时呈下降趋势,均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠肺组织LC3II/LC3I的比值在第1、7、14、21、28和60天时呈下降趋势,均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。 结论 游离SiO2粉尘致大鼠矽肺发病过程中,自噬相关蛋白LC3和Beclin1的表达水平与矽肺的不同发展阶段有关。在大鼠染矽尘早期,肺组织以炎性变化为主;随着染矽尘大鼠纤维化程度的加重。  相似文献   

13.
目的比较肝素(heparan sulfate,HS)及其片段在大鼠急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)发病中对细胞外组蛋白的拮抗作用,研究肝素降解在炎症发展中的作用。方法实验设对照组、CTH损伤组、肝素片段dp4、dp10组和肝素干预组,每组6只大鼠。CTH损伤组经股静脉注射小牛胸腺组蛋白(calf thymus histone,CTH)复制大鼠ARDS模型,对照组给予等量生理盐水。干预组经腹腔注射给予肝素或肝素片段(10 mg/kg,每6 h 1次,24 h)进行干预。检测肺湿/干重比值、支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中蛋白含量、白细胞数量,光学显微镜下观察中性粒细胞数量、肺组织病理的改变。结果CTH损伤组大鼠的肺湿/干重比值、BALF中蛋白浓度、白细胞和中性粒细胞数量均明显高于对照组,差异有统计学意义(P〈0.01)。肝素干预组肺湿/干重比值、BALF中蛋白浓度、白细胞和中性粒细胞数量均明显低于CTH损伤组,差异有统计学意义(P〈0.05)。肝素片段dp10干预组BALF中蛋白浓度和BALF中白细胞数量明显低于CTH损伤组,差异有统计学意义(P〈0.05)。dp10干预组的肺湿/干重比值、BALF中中性粒细胞数量均低于CTH损伤组,差异均无统计学意义(P〉0.05)。肝素片段dp4干预组肺湿/干重比值、BALF中蛋白浓度、白细胞数量和中性粒细胞数量低于CTH损伤组,差异均无统计学意义(P〉0.05)。光学显微镜下可见CTH损伤组大鼠的肺组织出血、水肿、肺泡间质增厚,肺泡中弥漫分布炎症细胞。肝素片段和肝素干预组的肺组织病变程度要比CTH损伤组明显改善,而且肝素干预组的肺组织损伤程度轻于肝素片段干预组。结论肝素和肝素片段对CTH导致的肺损伤具均有防护效果,肝素全长优于肝素片段。  相似文献   

14.
Training and education in occupational health in China   总被引:1,自引:0,他引:1  
Training programmes in Occupational Health in the People's Republic of China have been expanded and improved tremendously since 10 years ago. There are 26 faculties of Public Health in the medical schools taking undergraduate students for a six-year basic training which leads to the degree of Bachelor of Medicine and Public Health. A three-year postgraduate course leading to the Master's degree in Occupational Health and two more years' specialist course for the doctorate degree in Occupational Health are offered by the Institute of Occupational Medicine, Chinese Academy of Preventive Medicine and six training centres for occupational health. Continuing education at multi-level seems to be of great benefit, yet needs further development.  相似文献   

15.
《Nutrition reviews》1976,34(11):321-327
The project that is the subject of this report was approved by the Governing Board of the National Research Council, whose members are drawn from the Councils of the National Academy of Sciences, the National Academy of Engineering, and the Institute of Medicine. The members of the Committee responsible for the report were chosen for their special competences and with regard for appropriate balance.
This report has been reviewed by a group other than the authors according to procedures approved by a Report Review Committee consisting of members of the National Academy of Sciences, the National Academy of Engineering, and the Institute of Medicine.  相似文献   

16.
《Nutrition reviews》1997,55(9):319-326
The term Dietary Reference Intakes (DRIs) is new to the field of nutrition. It refers to a set of at least four nutrient-based reference values that can be used for planning and assessing diets and for many other purposes. The development of DRIs replaces the periodic revisions of Recommended Dietary Allowances (RDAs), which have been published since 1941 by the National Academy of Sciences. This is a comprehensive effort being undertaken by the Standing Committee on the Scientific Evaluation of Dietary Reference Intakes of the Food and Nutrition Board, Institute of Medicine, National Academy of Sciences, with the involvement of Health Canada.  相似文献   

17.
"第六届环境与职业医学国际学术研讨会暨《环境与职业医学》杂志创办30周年研讨会"于2014年10月16—18日在上海市召开,会议的主题是"环境与健康保护:从理论到行动"。此次会议由上海市疾病预防控制中心、上海市预防医学研究院、上海市预防医学会、《环境与职业医学》杂志主办,复旦大学公共卫生学院、江苏省预防医学会、浙江省预防医学会协办。共有44位中外专家进行了报告,200余位参会者就"环境相关疾病的预防与控制""职业人群的健康保护""环境与职业医学中的组学研究""环境政策与公共卫生"等内容展开讨论。本次会议收到中英文论文投稿近200篇,同时设置了壁报展示并评选出3份优秀壁报。在"《环境与职业医学》编者、审者、作者交流会"上,编委会成员和审稿专家共同回顾了杂志创办30年来的发展历程,为杂志的发展提出了缩短出版周期、提供增值服务、进入重要数据库等意见。本次会议的成功举办可望进一步加深加强上海与国际国内在相应领域的联系与合作,更好地促进环境与职业医学领域理论与实际的结合、基础与临床的整合、微观与宏观的融合,为环境健康研究注入新的活力。  相似文献   

18.
2009年4月23~25日,以“环境与职业医学——微观与宏观的结合”为主题的“第八届全国环境与职业医学研究生学术研讨会”在苏州大学召开。此次会议由《环境与职业医学》杂志编辑委员会和苏州大学医学部放射医学与公共卫生学院共同主办,来自全国10余所高校和科研单位的60余名正式代表出席了会议,另有数十名苏大研究生旁听。研讨会为全国研究生搭建了一个相互认识、交流、合作、促进的平台,扩大了《环境与职业医学》杂志的影响。  相似文献   

19.
Oncogene protein detection may be a valuable molecular epidemiologicalmarker of commitment to the carcinogenic pathway in worker populationsexposed to carcinogens. This paper reports the use of serumimmunoblotting with monoclonal antibodies to oncogene proteinsto screen hazardous waste workers with potential carcinogenexposure who employ state-of-the-art work practices and personalprotective equipment to minimize real exposures. Two individualsin this cohort were found to be trace positive for the ras oncogeneprotein in their serum, but this may have been due to theircigarette smoking. These results are contrasted to previousresults in hazardous waste workers with real workplace carcinogenexposures. Requests for reprints should be addressed to: Dr P. W. Brandt-Rauf, Director, Occupational Medicine, Division of Environmental Sciences, Columbia University School of Public Health, 60 Haven Avenue, B-1 Level, New York, New York 10032, USA  相似文献   

20.
目的 提出新形势下职业健康检查机构的监管策略,规范检查机构从业行为。 方法 遵循与国家不断更新的法律法规相适应的原则,分析吉林省职业健康检查机构现状,提出新形势下职业健康检查机构的监管策略。 结果 职业健康检查机构普遍存在职业健康检查工作不规范,对职业病相关法律法规政策及标准理解有偏差的情况,且以往监督检查采用的考核表涵盖范围不全面,赋分不够细化,仅仅考虑了可从事职业健康检查的基本条件,并没有从质量管理、学科建设层面进行考核,以至于有些职业健康检查机构仪器设备落后,执业人员能力差、水平低,出具的职业健康检查结果不准确,给用人单位及劳动者健康带来隐患。 结论 吉林省内职业健康检查机构仍存在一定的共性问题,需遵循与国家不断更新的法律法规相适应的原则,提出新形势下职业健康检查机构的监管策略。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号