哈尔滨市肠道病毒71型VP1区基因序列分析

手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是由多种肠道病毒引起的常见传染病,多发于5岁以下婴幼儿,可引起发热和手、足、口腔等部位的皮疹、溃疡,个别患者可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症^[1],个别重症患儿病情进展快,可导致死亡^[2].在临床上EV71与CoxA16感染所引起的HFMD 难以区别,由于EV71还能够引起多种与神经系统相关的疾病,逐渐地为各国卫生工作者所重视^[3].     

肠道病毒71型SHZH03株5′-UTR区遗传进化分析

目的构建肠道病毒71型SHZH03、SHZH98、SHZH-001以及具有中枢神经毒性的MS株的5′-UTR序列的系统发育树,研究我国肠道病毒71型的神经毒性和分子流行病学。方法以肠道病毒71型SHZH03株的基因组RNA为模板,通过RT-PCR方法,扩增5非编码区(5′-UTR)序列,将其克隆至pGEM(-T载体中,对其进行序列测定,与我国早期分离的肠道病毒71型SHZH98、SHZH-001以及具有神经毒性的肠道病毒71型标准株MS的5′-UTR序列进行比较分析。结果 SHZH03株的5′-UTR序列全长743bp,与SHZH98株的5′-UTR序列的同源性为99.2%,与具有中枢神经毒性的BrCr株的5′-UTR序列的同源性为94.2%。结论我国分离的SHZH03株和SHZH98株的5′-UTR序列同源性高,而与具有中枢神经毒性的MS株的5′-UTR序列有较大差异。     

肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的了解2009—2010年山东省临沂市肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征,初步探讨VPl区核苷酸或氨基酸变异与不同临床类型的关系。方法从手足口病(HFMD)病例、重症病例和死亡病例的粪便标本中分离获得23株EV71病毒株,RT-PCR扩增VP1区,并进行序列测定和分析。结果23株分离株与A、B基因型同源性较低;与C4亚型的C4a群代表株的核苷酸和氨基酸同源性分别达到92.8%～93.5%和98.3%～99.3%,明显高于其他亚型代表株的同源性;各分离株间的氨基酸序列比对显示无特征性改变。结论2009—2010年临沂地区流行的EV71是C4亚型的C4a群,HFMD病例、重症病例和死亡病例分离株VP1区核苷酸序列和氨基酸序列无特征性差异。     

宁波市肠道病毒71型分离株全基因序列对比分析

目的 探讨浙江宁波地区2010年分离的肠道病毒71型(EV71)中神经毒性相关位点。方法 采集宁波地区2010年手足口病不同症状患者粪便标本,进行荧光聚合酶链反应检测,阳性标本病毒分离;分8个片段对EV71全基因序列和VP1区进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、克隆、测序、拼接、同源性比较,用DNAstar推导其内含子编码的氨基酸序列并比对分析。结果 6株分离株基因全长均为7 406 bp,核苷酸同源性为97.9%～99.4%,其中3株死亡病例标本内部核糖体进入位点(IRES)中的124、272及408位,碱基分别为T、G、A,区别于其他3株手足口轻症患者分离株的A、A和G;3株死亡病例标本位于主要衣壳蛋白VP1区的第715位氨基酸和3C蛋白酶的第1 704位及1 706位的氨基酸分别为甲硫氨酸(met)、精氨酸(arg)及异亮氨酸(ile),区别于3株轻症病例的亮氨酸(leu)、赖氨酸(lys)及缬氨酸(val)。结论 宁波地区2010年分离的EV71 IRES、VP1与3C位点变异与EV71神经毒性相关。     

肠道病毒71型广西株的种系进化分析

目的 通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增肠道病毒71型(EV71)VP1节段核苷酸序列,进行EV71广西株种系进化分析.方法 采集病例的心包液、疱疹液和呼吸道分泌物,用RT-PCR进行鉴定和扩增VPl区序列,并对VPl区全基因序列进行测定,同源性分析和构建系统发生树.结果 将病例的心包液、疱疹液和呼吸道分泌物同时扩增到特异片段,测序证实为EV71.广西株与安徽阜阳的分离株同源性最高,大于99%,没有发生核苷酸插入和缺失;在系统发生树上,广西株处于C基因型C4亚型分支上.结论 肠道病毒71型广西株VPl区基因全长891bp,属于EV71 C基因型C4亚型.应加强广西EV71分子流行病学监测,阐明广西EV71流行株的基因型别和基因特征.     

北京市西城区手足口病患儿肠道病毒71型VP1区基因进化分析

目的了解北京市西城区2015年手足口病（HFMD）患儿肠道病毒71型（EV 71）分离株VP1区基因特征,分析其变异情况。方法收集北京市西城区2015年HFMD病原学检测分型鉴定为EV 71的阳性标本,对部分标本进行病毒分离、培养,并通过实时荧光PCR鉴定阳性培养物。EV 71阳性培养物提取病毒核酸,对其VP1区全长序列进行PCR扩增和测序。从Genbank中选取EV 71不同基因型别参考序列,利用生物信息学软件进行同源性和系统进化分析。结果共分离到6株EV 71（Genbank登录号为KU376383-KU376388）,其VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.00%~99.00%和98.00%~100.00%,与参考序列VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.00%~97.00%和93.00%~100.00%。进化分析显示,6株EV 71均为C4a基因亚型。结论 2015年北京市西城区EV 71流行株属于C4a亚型,未出现明显变异。     

肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析

目的 了解2008年北京地区肠道病毒71型(EV71)分离株的全基因序列特点.方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份,对其中1份样品08YM-3,经Vero细胞分离培养,提取病毒RNA.利用RT-PCR和5'、3'RACE扩增EV71全长基因.对PCR产物克隆和测序.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树.结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒,测序后拼接为EV71全基因组,命名为BJ08株.BJ08的5'非编码区(UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的参考序列同源性均最高,分别为95.6%～96.7%、88.3%～96.1%、78.1%～94.0%、90.8%～94.6%、85.9%～94.1%和90.9%～93.9%.BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%.在全基因序列与VP1区构建的系统进化树中,BJ08株均与C4亚型在同一分支.BJ08株与C4亚型参考株VP1区的6个亚型相关氨基酸序列一致,VP1抗原性表位(92～107aa)无变异.结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型.     

肠道病毒71型SHZH03结构蛋白基因的遗传进化分析

目的对SHZH03株、SHZH98株、亚洲流行株(台湾98年、日本99年、及新加坡2000和2001年流行株等)以及一部分欧洲流行株等的结构蛋白基因进行遗传进化分析。方法在对肠道病毒71型中国(深圳)分离株SHZH03进行全基因组序列测定的基础上,利用DNA-STAR软件对结构蛋白基因进行遗传进化分析。结果SHZH03和SHZH98与亚洲流行株中的台湾98流行株、日本99流行株的遗传距离较近,而与新加坡2000和2001年流行株的遗传距离较远;SHZH03株与一些欧洲流行株有较大的差异。结论我国深圳地区流行的肠道病毒71型有可能来源于台湾1998年EV71大规模流行时的毒株。     

肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析

目的 了解2008年北京地区肠道病毒71型(EV71)分离株的全基因序列特点.方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份,对其中1份样品08YM-3,经Vero细胞分离培养,提取病毒RNA.利用RT-PCR和5'、3'RACE扩增EV71全长基因.对PCR产物克隆和测序.利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析,构建系统进化树.结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒,测序后拼接为EV71全基因组,命名为BJ08株.BJ08的5'非编码区(UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的参考序列同源性均最高,分别为95.6%～96.7%、88.3%～96.1%、78.1%～94.0%、90.8%～94.6%、85.9%～94.1%和90.9%～93.9%.BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%.在全基因序列与VP1区构建的系统进化树中,BJ08株均与C4亚型在同一分支.BJ08株与C4亚型参考株VP1区的6个亚型相关氨基酸序列一致,VP1抗原性表位(92～107aa)无变异.结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型.     

Molecular epidemiology of human enterovirus 71 strains and recent outbreaks in the Asia-Pacific region: comparative analysis of the VP1 and VP4 genes

This study provides a comprehensive overview of the molecular epidemiology of human enterovirus 71 (HEV71) in the Asia-Pacific region from 1997 through 2002. Phylogenetic analysis of the VP4 and VP1 genes of recent HEV71 strains indicates that several genogroups of the virus have been circulating in the Asia-Pacific region since 1997. The first of these recent outbreaks, described in Sarawak (Malaysian Borneo) in 1997, was caused by genogroup B3. This outbreak was followed by large outbreaks in Taiwan in 1998, caused by genogroup C2, and in Perth (Western Australia) in 1999, where viruses belonging to genogroups B3 and C2 cocirculated. Singapore, Taiwan, and Sarawak had HEV71 epidemics in 2000, caused predominantly by viruses belonging to genogroup B4; however, large numbers of fatalities were observed only in Taiwan. HEV71 was identified during an epidemic of hand, foot and mouth disease in Korea; that epidemic was found to be due to viruses constituting a new genogroup, C3.     

儿童肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型感染血清流行病学研究进展

  目的  了解广东省2016 — 2017年肠道病毒71型（EV71）灭活疫苗接种水平及接种期间手足口病的流行情况。  方法  从“中国免疫规划信息管理系统”提取EV71灭活疫苗接种情况报表资料;从“中国疾病预防控制信息系统”收集手足口病普通病例疫情数据、重症及死亡病例疫情数据;在广东省8家哨点医院开展手足口病普通病例EV71感染病原学监测,结合EV71哨点监测结果和网络直报疫情数据来估算EV71感染手足口病发病情况。  结果  2016年9月 — 2017年12月,广东省共报告接种EV71灭活疫苗2 304 456剂次,其中2017年5 — 9月为接种高峰,月平均接种量为198 315剂次。全省平均估算接种率2016年为3.82 %、2017年为10.07 %。21个地市中深圳估算接种率最高,2016年为6.05 %、2017年为19.76 %;汕头估算接种率最低,2016年0.78 %、2017年1.39 %。2017年广东省EV71感染手足口病发病率比2016年下降39.97 %,EV71感染手足口病重症及死亡数下降53.33 %。  结论  广东省2016年启动EV71灭活疫苗接种项目以来,疫苗接种水平逐渐增加,但仍处于较低水平;2017年EV71感染手足口病发病率、重症与死亡数比2016年有所下降。     

2010年盐城地区手足口病例肠道病毒型别调查

目的对盐城地区2010年手足口病患儿及其临床重症病例进行病原学调查。方法采集手足口病患儿咽拭子和肛拭子,对其病毒核酸进行肠道病毒检测定型。结果 481例(含重症52例)患儿采集的咽拭、肛拭标本中,共检测出病毒核酸阳性326例,阳性率为67.78%,其中CA16型44例(13.50%)、EV71型179例(54.91%)、未定型103例(31.59%)。52例重症病例中共检测出病毒核酸阳性45例,阳性率为86.54%,其中EV71型32例(71.11%)、未定型13例(28.89%)、CA16型0例。326例病毒核酸阳性患儿中男214例,女112例;45例病毒核酸阳性重症患儿中男33例,女12例。结论盐城地区手足口病患儿检测到的主要病原体是CA16和EV71等,EV71感染率高于CA16感染率,肠道病毒EV71是引起重症病例的主要病原体。     

基于EV71疫苗接种的江苏省手足口病动力学模型研究

探索肠道病毒71型（EV71）疫苗上市前后河南省重症手足口病流行特征和病原谱的变化情况,为制定重症手足口病防控策略提供相关依据。

通过中国疾病预防控制中心传染病报告信息管理系统选取河南省2014 — 2020年所有手足口病报告信息,分析EV71疫苗上市后河南省重症手足口病流行特征及病原谱变化。

2014 — 2020年,河南省共报告重症手足口病病例13535例。EV71疫苗于2017年广泛使用,与上市前（2014 — 2016年）比较,上市后（2017 — 2020年）手足口病重症病例所占比率从3.19%（10948/343585）降为0.93%（2587/278075）,差异有统计学意义（χ ² = 3672.874,P < 0.001）。全年重症发病呈现单峰分布,高发季节主要集中在4 — 7月,4 — 7月报告病例数占75.53%（10223/13535）,重症病例中男女比例为1.58 : 1;发病年龄仍然以 < 5岁婴幼儿为主,占97.34%（13175/13535）,1岁年龄组重症病例构成比从47.23%下降到42.83%,2岁年龄组重症病例构成比从25.57%下降到22.84%（χ²_1岁组 = 16.311,P_1岁组 < 0.001;χ²_2岁组 = 8.255,P_2岁组 = 0.004）;托幼机构重症病例构成比由9.13%上升为16.24% （χ² = 112.359,P < 0.001）;疫苗上市后,EV71构成比从65.14%下降到29.63%,其他肠道病毒构成比从27.49%上升到56.13%,其他肠道病毒代替EV71成为优势血清型（56.13%,737/1313）。

EV71疫苗上市后河南省手足口病重症比率明显下降,优势病原由EV71转为其他肠道病毒,应进一步加强重点人群、高发季节、重点场所的EV71疫苗推广应用工作,开展综合防控工作预防重症手足口病的发生。

     

北京地区2006-2008年肠道病毒71型VP1区基因特征分析

目的 了解2006-2008年北京地区分离的不同来源肠道病毒71型(EV71)VP1区基因特征.方法 从手足口病例、急性弛缓性麻痹病例和健康儿童的粪便、咽拭子和疱疹液标本中分离EV71病毒株,选取其中9株EV71分离株,采用RT-PCR扩增VPl区全长基因片段并进行序列测定、系统发生树构建、核苷酸同源性及组内和组间进化距离分析.结果 9株EV71在系统发生树上与C基因型中的C4亚型代表株属同一分支;在核苷酸同源性分析中,9株分离株与C4亚型代表株的同源性达到92.1%～93.9%,明显高于与C1、C2、C3亚型代表株的同源性(分别为88.8%～89.5%、89.4%～90.0%和88.4%～89.3%);三种不同来源的分离株病毒之间具有较高的同源性(95.9%～100.0%),但与1998年分离的C4亚型代表株的同源性却较低(分别为93.3%～93.9%和92.1%～92.9%).在进化距离的分析上,C4亚型内各组间距离较大,尤其是亚型代表株与分离株之间距离最大(D=0.052～0.071).结论 2006-2008年北京地区流行的EV71仍然是C4亚型,在同一时间不同地区、不同来源、不同疾病状态卞分离的EV71在VP1区全长基因序列上无明显差别;但是随着时间推移,核苷酸变异的不断积累,出现新亚型的概率也在不断增加,因此有必要加强分离株的监测以掌握EV71的变异趋势.     

2010一2011年湖南省郴州市手足口病EV71型VP1区基因序列分析

目的了解2010-2011年湖南省郴州市手足口病EV71病毒的基因特征,为手足口病的预防控制提供科学依据。方法从2010-2011年郴州市各县（市、区）送检的手足口病肛拭子标本中随机挑选60份标本采用RD细胞进行病毒分离,采用Realtime—RT—PCR方法检测肠道病毒核酸,挑选14株致细胞病变阳性且EV71核酸检测阳性的标本（其中2010年的4株均为郴州市手足口流行夏季高峰期分离株,2011年的毒株主要为冬季高峰期分离株）,采用RT—PCR法扩增出EV71分离株的VP1区片段,随后进行VP1区核苷酸序列测定和分析,并使用生物信息学方法作基因特性分析。结果郴州市14株EV71毒株在生物进化树上与CAa亚型的代表株属同一分支。14株EV71毒株之间核苷酸序列的同源性在96．1％～100．0％之间,氨基酸序列的同源性在99．3％～100．0％之间;与A、B、C各基因型和亚型代表株EV71VP1编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分析表明,郴州各分离株与安徽阜阳2008年毒株C4a亚型代表株（EU703812）的同源性最高,其中核苷酸同源性在91．8％-93．3％之间,氨基酸同源性均为99．3％。14株分离株与安徽阜阳2008年毒株（C4a亚型代表株）VP1区段的氨基酸编码序列进行比较,发现K98E、S283T和A293S3处位点变异,重症病例与普通病例的EV71病毒VPI氨基酸变异无明显差异。结论2010-2011年郴州市手足口病的优势毒株EV71属于C4a基因亚型。郴州市各县（市、区）的EV71亲缘关系近,毒株基因较稳定,未发现氨基酸突变位点与病例类型有关联。     

Epidemic hand,foot and mouth disease caused by human enterovirus 71, Singapore

Singapore experienced a large epidemic of hand, foot and mouth disease (HFMD) in 2000. After reviewing HFMD notifications from doctors and child-care centers, we found that the incidence of HFMD rose in September and declined at the end of October. During this period, 3,790 cases were reported. We performed enteroviral cultures on 311 and 157 specimens from 175 HFMD patients and 107 non-HFMD patients, respectively; human enterovirus 71 (HEV71) was the most frequently isolated virus from both groups. Most of the HFMD patients were 相似文献   

Willingness and influential factors of parents to vaccinate their children with novel inactivated enterovirus 71 vaccines in Guangzhou,China

Hand, foot and mouth disease (HFMD) primarily affects children younger than 5 years of age. Recently, HFMD has ranked as the top notifiable infectious disease in China. In December 2015, China approved two novel inactivated enterovirus 71 vaccines (EV71 vaccines) for HFMD. Parents’ acceptance is often essential for vaccination program success. The goal of this study was to identify willingness and influential factors to vaccinate among parents of kindergarteners in Guangzhou, China. A cross-sectional survey of face-to-face interviews was conducted from March to July 2016. Fifty-five kindergartens were randomly selected from 11 districts of Guangzhou. An anonymous self-designed questionnaire was used to investigate awareness, knowledge and attitude towards HFMD and EV71 vaccines. A total of 868 parents participated in the survey. Mean(±standard deviation) knowledge score of HFMD was 6.32(±1.70). Approximately 32.03% of parents had heard of the EV71 vaccines with 22.58% receiving information before this study. Nearly 44.24% of parents showed willingness to vaccinate their children. Previously receiving EV71 vaccine-related information [adjusted odds ratio (aOR) = 1.48, 95% confidence interval (CI): 1.04–2.11], no fear of adverse effects (aOR = 4.25, 95%CI: 2.77–6.53), perceived susceptibility of children to HFMD (aOR = 2.15, 95%CI: 1.42–3.25) and children not previously diagnosed with HFMD (aOR = 1.56, 95%CI: 1.07–2.27) were positively associated with EV71 vaccination acceptability. However, parental education background (aOR = 0.54, 95%CI: 0.37–0.80) was negatively correlated with vaccination acceptability. Our study provides baseline information for future vaccination campaigns to help improve the EV71 vaccine uptake rate. Special efforts are urgently needed to improve the awareness and knowledge of EV71 vaccines in China.