上海市山夫登堡沙门菌流行特征和分子分型研究

明,菌株存在遗传克隆的不稳定性和传播途径的复杂性.     

张家港市15株山夫登堡沙门菌的分子分型和耐药性

目的 对张家港市健康体检中分离得到的山夫登堡沙门菌进行相关性和耐药性分析,为张家港市沙门菌菌型库的建立积累数据。方法 对检测中得到的15株山夫登堡沙门菌菌株采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型,利用PulseNet China网络中的BioNumerics2.6.6软件对图谱进行分析;用全自动细菌生化鉴定仪进行18种抗生素敏感性分析。结果 15株山夫登堡沙门菌分9种带型,其中有6株高度同源,相似度达93.94 %;15株山夫登堡沙门菌的药物敏感性结果完全一致,对阿米卡星、头孢唑啉、头孢替坦、庆大霉素和妥布霉素耐药,其他均敏感。结论 张家港市的山夫登堡沙门菌条带呈多样性,同时存在优势带型。不同型的菌株耐药种类相同,且有多重耐药趋势。     

一起山夫登堡沙门菌食物中毒的检测与溯源

目的查明一起食物中毒事件的病原,并对其进行溯源分析。方法对4份患者样本和8份食品留样进行病原菌的分离、培养和鉴定,对分离株进行药敏实验和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果 4份患者样本和1份食品留样中检出山夫登堡沙门菌,5株分离菌株均对磺胺甲恶唑耐药,其PFGE图谱相似性系数为100.0%。结论本起食源性疾病暴发疫情是由进食被山夫登堡沙门菌污染的食品所致。     

2018—2021年北京市大兴区腹泻患者沙门菌分子分型及耐药性分析

目的 了解北京市大兴区肠道门诊腹泻患者沙门菌的感染情况、流行病学和病原学特征及耐药状况,为沙门菌防控及临床治疗提供依据。方法 2018—2021年收集大兴区3家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本进行沙门菌检测,对分离到的沙门菌开展血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 4年共检测粪便标本1 499件,检出沙门菌65株（4.34%）,肠炎沙门菌（53.85%）为主要流行血清型;不同年龄组人群中沙门菌检出率差异有统计学意义（P<0.01）,其中1～<11岁检出率最高（10.30%）;不同性别及职业人群沙门菌检出率差异均无统计学意义（均P>0.05）。药敏结果显示,沙门菌耐药程度差异较大,除对头孢西丁、美罗培南和阿奇霉素完全敏感外,对其他抗菌药物均有一定的耐药性。35株肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳后出现20种带型,其中B8和B10带型为优势带型,菌株之间的相似系数为40.6%～98.7%。结论 北京市大兴区沙门菌的优势血清型为肠炎沙门菌,PFGE带型呈高度多态性,耐药性较强,临床治疗时需合理使用抗菌药物。     

福建省鼠伤寒沙门菌分子流行病学研究

目的了解福建省鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况,探讨各型别的流行及分布特征。方法收集2009-2010年鼠伤寒沙门菌73株,分离自临床患者及从业体检人员,选择XbaⅠ和BlnⅠ进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准。采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱,运用BioNumerics软件进行聚类分析。结果按照100%的相似度可将菌株酶切图谱分为49个PFGE型,其中P1型有15株,占20.55%(15/73),为优势型别,P17型5株,占6.85%;BlnⅠ二次酶切后P1和P17型分别只有5株和2株条带完全一致。P1型集中分布于7～9月,占到P1型菌株总数的86.67%(13/15);其他型别分布比较分散,无明显时间和地区的聚集性。结论福建省鼠伤寒沙门菌PFGE分子分型呈现多态性,该技术可用于菌株间分子流行病学研究,应加强监测的时效性和针对性以利于疾病的溯源和早期预警。     

江苏省2012-2015年伤寒/副伤寒沙门菌耐药及分子分型研究

目的 回顾性分析2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌的耐药表型和分子分型特征。方法 采集江苏省伤寒/副伤寒监测病例的血液和粪便标本,分离培养伤寒/副伤寒沙门菌后进行生化鉴定和血清分型;采用Kirby-Bauer纸片法检测菌株对抗菌药物的敏感性;应用PFGE技术对伤寒和甲型副伤寒沙门菌进行分子分型。结果 134株伤寒沙门菌和甲型副伤寒沙门菌对萘啶酸的耐药率最高,分别为61.2%和86.7%,其余抗生素的耐药率均低于15.0%。伤寒和甲型副伤寒沙门菌中只耐1种抗生素的菌株最多,多重耐药菌在伤寒沙门菌中占2.6%,而在甲型副伤寒沙门菌中占13.3%。2015年伤寒沙门菌的全敏感菌株构成比较2012年增加了44.3%,同年副伤寒沙门菌中出现了耐5种和6种抗生素的多重耐药株。甲型副伤寒沙门菌可分为8种PFGE型别,多重耐药株与其他菌株条带相似性低,不同型别与耐药谱有对应关系;伤寒沙门菌可分为68种PFGE型别,不同型别间变异度较大,与耐药谱无对应关系。结论 2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌对抗生素的耐药性总体随时间降低,耐药种类数有所增加。伤寒沙门菌株PFGE带型呈现多样性,无耐药谱对应性;而甲型副伤寒菌株PFGE带型较少,有耐药谱对应性。需要加强重点地区重点型别菌株的监测。     

舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

一类罕见硫化氢阴性山夫登堡沙门菌腹泻株的分子溯源

[目的]研究一类罕见硫化氢阴性山夫登堡沙门菌腹泻菌株遗传克隆特征。[方法]收集、分析本地区参加全球沙门菌监测(GSS)腹泻病例中分离的山夫登堡沙门菌生化、编码SPI-1毒力岛基因(hilA、invA)和耐药特征;应用Riboprinter(r)(RP)DNA指纹图谱系统比较表型典型与不典型菌株的核糖体分型;通过Pluse Net China数据库中同型菌株的脉冲凝胶电泳(PFGE)图谱聚类比较分子型谱。[结果]2006年长宁区GSS监测病例分离出19株山夫登堡沙门菌,其中10株属于硫化氢阴性和SPI-1毒力岛缺失的表型变异菌株。RP分型证实发生变异的山夫登堡沙门菌与典型菌株间分属2个不同的克隆。Pluse Net China数据库将包括长宁区19株山夫登堡沙门菌在内的36株山夫登堡腹泻株共分18种PFGE带型。长宁区的表型变异株优势型分属4型(2株)和6型(6株),典型菌株的优势型分属11型(1株)、17型(4株)和23型(2株)。聚类分析显示,表型变异株的克隆在遗传相似度上高于典型株。[结论]分子溯源证实,SPI-1毒力岛缺失的山夫登堡沙门菌变异菌株与典型菌株同样具有引发局部爆发的致病性。2006年长宁区分离的硫化氢阴性山夫登堡沙门菌变种腹泻株与2002年深圳市的1例食物中毒案例分离的2株SPI-1毒力岛缺失株存在同源性。     

2008年-2010年上海市部分伤寒副伤寒沙门菌耐药分析及分子分型

目的:了解上海市2008年-2010年伤寒、副伤寒沙门菌的耐药及分子分型特点,初步掌握伤寒、副伤寒沙门菌的分子流行特点,为今后的防制工作提供科学依据。方法:采用WHO推荐的改良K-B纸片法,对18株伤寒、副伤寒沙门菌进行13种抗生素敏感性试验;运用脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)方法对18株伤寒、副伤寒沙门菌进行分子分型及聚类分析。结果:18株伤寒副伤寒沙门菌对利福平100%耐药,对奈啶酸的耐药率为44.4%,其中伤寒沙门菌对奈啶酸的耐药率为37.5%,5株甲型副伤寒沙门菌对奈啶酸100%耐药,乙型副伤寒对奈啶酸无耐药株。所有菌株对其他11种抗生素均敏感;18株伤寒、副伤寒沙门菌共产生16种PGFE带型,有3株甲型副伤寒沙门菌表现为同一PFGE型别。结论:2008年-2010年伤寒、副伤寒沙门菌对抗生素的敏感性较高;甲型副伤寒沙门菌之间有较高的同源性,伤寒沙门菌的PFGE带型比较分散。     

广州市市售食品中部分沙门菌耐药性及分子分型特征

目的 分析近年来广州市市售食品中部分沙门菌的耐药情况和分子分型特征,为广州市沙门菌疾病的防控提供实验室数据.方法 对分离到的沙门菌进行血清分型,药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE),并用BioNumerics软件分析菌株间的同源性.结果2016-2...     

伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

目的：运用脉冲场凝胶电泳研究宁波市伤寒沙门菌的分子流行病学。方法：选择XbaⅠ酶对伤寒沙门菌染色体DNA进行酶切，采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱，了解其流行状况。结果：14株伤寒沙门菌，根据电泳图谱分析，可分为3个带型。结论：PFGE具有分辨力高，重复性好的特点，是研究伤寒沙门菌分子流行病学较好的基因分型方法。     

湖南省食源性德尔卑沙门菌耐药谱及PFGE分型研究

目的了解湖南省食源性德尔卑沙门菌的耐药谱及分子分型,建立沙门菌指纹图谱数据库。方法运用肉汤稀释法对食源性德尔卑沙门菌进行药敏试验,并采用脉冲场凝胶电泳法(PFGE)进行分子分型。结果 47株德尔卑沙门菌中,有46株对1种以上抗生素耐药(97.87%),有29株多重耐药菌株(61.70%);德尔卑沙门菌分为32种PFGE型,其中有10种PFGE型的菌株数超过1株。结论湖南省食源性德尔卑沙门菌分离株呈高耐药和多重耐药趋势,PFGE分子型别呈多态性,有同源菌株存在,PFGE分型为食源性疾病溯源和预警提供技术基础。     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。     

德尔卑沙门菌PFGE分型探索

[目的]用脉冲凝胶电泳方法绘制德尔卑沙门菌的DNA指纹图谱,为研究德尔卑沙门菌的同源性提供分子生物学技术依据。[方法]从本实验室在各类食品中分离到的12株德尔卑沙门菌中提取DNA,经过限制性内切酶Xba1的切割,再用脉冲凝胶电泳仪进行DNA分子分型,并使用Quantity OneTM软件对其同源性进行分析比较。[结果]实验得到10株菌的DNA指纹图谱,与2003年D1号菌株遗传基因密切相关的菌株占22%;与2004年D15号菌株遗传基因密切相关的菌株占44%;2005年的4株菌中有3株之间的遗传基因密切相关;2006年的4株菌,分别为2株之间的遗传基因密切相关。[结论]脉冲凝胶电泳方法是分析引起食源性疾病的致病菌的同源性的有效方法。     

扬州市2014年食品从业人员沙门菌血清学及PFGE分型分析

目的 了解扬州市食品加工从业人员感染沙门菌的血清学分布及分子流行病学特征。 方法 采集2014年扬州市专项监测的14家餐饮单位食品从业人员肛拭子标本,增菌后取可疑菌落作血清学鉴定,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。 结果 共检查食品从业人员肛拭子标本1 035份,检出沙门菌14份,带菌率1.35%。分群中以D群和E群为主。对11株沙门菌经行PFGE分型共分为7个型别(P1～P7),相似性系数60.9%～100.0%。其中一所大学食堂(P5,N=4)与一家酒店(P3,N=2)的分离株带型分别一致。 结论 扬州市食品加工从业人员沙门菌血清型以D群和E群为主。PFGE结果显示不同监测地点的分离得到的沙门菌没有共同的感染来源,有两处食品加工场所分别存在特定的传染源,具有可能发生食品安全事件的风险。     

淄博市肉鸡产业链中沙门菌污染状况及其血清型 与分子分型分析

摘要:目的　对2012年淄博市肉鸡产业链中沙门菌污染状况进行调查,并进行血清型及脉冲场凝胶电泳（Pulsed-Field Gel Electrophoresis,PFGE）分子分型分析。方法　对2012年淄博市肉鸡产业链各环节样品按照国家标准方法进行沙门菌检测及血清分型,选取部分沙门菌经脉冲场凝胶电泳后用BioNumerics软件进行聚类分析。结果　共采集肉鸡产业链不同环节样品1267份,检出沙门菌298株,总检出率为23.5%,印第安纳沙门氏菌和肠炎沙门氏菌分别占48.0%和46.3%。其中98株沙门菌的PFGE指纹图谱相似度在48.9%～100.0%之间,产生74种PFGE带型,相似度在85.0%以上的带型的有9组,共82株菌,其中带型完全一致的有9组,共33株菌。结论　沙门菌在淄博市肉鸡产业链的各个环节均有检出,主要以肠炎沙门氏菌和印第安纳沙门氏菌为主。所检沙门菌PFGE带型复杂,基因多态性明显。     

用脉冲场凝胶电泳方法对O139霍乱弧菌分型的研究

目的：利用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术探讨O139群霍乱弧菌的分子分型方法。方法：用SfiⅠ酶和NotⅠ酶切O139群霍乱弧菌染色体DNA，经脉冲场凝胶电泳进行片段分离。结果：14株O139群霍乱弧菌经SfiⅠ酶切后电泳分离可得一个PFGE型，用NotⅠ酶切电泳可分为2个PFGE型。结论：脉冲场凝胶电泳技术分析O139群霍乱弧菌，分型发现微小差别有助于分析追踪疫情和来源。     

2008-2009年北京市沙门菌流行特征和分子分型

目的 分析2008-2009年北京市沙门菌流行特征及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型. 方法 对2008-2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析;利用PFGE进行分子分型. 结果 北京市2008-2009年沙门菌的流行具有明显季节性,6-9月份高发,共分离菌株84株,占64.1%(84/131);患者年龄多为18～40岁,占46.1%(58/128);男性80例,女性51例,男女比例为1.57:1.137株沙门菌分属于20种血清型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型,分别占46.7%(64/137)和17.5%(24/137).共分71种PFGE带型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都有16种PFGE型别.肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JFGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别. 结论 2008-2009年北京市沙门菌的流行具有性别、年龄和季节性分布特征;PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系.

Abstract：

Objective To study the epidemiological characteristics and molecular phenotypes of Salmonella by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) in Beijing from 2008 to 2009. Methods A total of one hundred thirty-seven isolates recovered from the WHO Global Samonella Surveillance system and entero clinic surveillance system were identified by biochemical tests and serotyping.The related epidemiological informations were also analyzed.The isolates were further typed by PFGE. Results The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed obvious seasonal character.High incidence occurred from June to September,and 64.1% (84/131) isolates were recovered in this period.Patients of 18-40 year-old were 46.1% (58/128) and 80 patients were male and 40 patients were female with the ratio of 1.57:1.These 137 Salmonella isolates belonged to 20 serotypes,including Enteritidis (46.7%,64/137) and Typhimurium (17.5%,24/137) as the dominant serotype.In total,71 PFGE profiles were identified.Four PFGE patterns of S.Enteritidis isolates (JEGX01.CN0001,JEGX01.CN0003,JEGXO1.CN0002,JEGX01.CN0019) and S.Typhimurium pattern of JPXX01.CN0001 were dominant patterns. Conclusion The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed distribution characteristics of sex,age and seasons.The numerous PFGE patterns of Salmonella showed diversity of these isolates and different clones existed in Beijing.