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相似文献
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1.
目的:建立银染mRNA差异显示方法,并初步应用于筛选糖尿病早期大鼠背根神经节中差异表达基因。方法:制备糖尿病模型大鼠,以锚定引物与随机引物组合分别对正常与模型大鼠背根神经节的mRNA行DD-PCR扩增,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离后,银染法显示差异片段。结果:建立了银染mRNA差异显示方法.初步筛选出一些糖尿病早期大鼠背根神经节中差异表达的基因。结论:银染mRNA差异显示方法是简便快捷、行之有效的筛选差异基因的方法。  相似文献   

2.
银染mRNA差异显示方法的建立和吗啡诱导基因的克隆   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:建立非同位素银染mRNA差异显示方法,分离吗啡相关基因。方法:以吗啡处理的SHSY5Y细胞中提取的总RNA为模板,用5’dT12MG锚定引物和两条随机引物组合进行DDRTPCR扩增。经测序凝胶电泳分离后,用银染方法显示差异DNA条带,在直视下从凝胶中回收差异条带并进行再扩增,扩增产物克隆入pGEMT载体。结果:建立了非同位素的银染mRNA差异显示方法,分离和克隆了一些吗啡诱导的差异表达基因。结论:建立的非同位素银染差异显示方法是简单快捷和高效的分离差异表达基因的方法  相似文献   

3.
银染mRNA差异显示方法的建立和吗啡诱导基因的克隆   总被引:9,自引:0,他引:9  
目的:建立非同位素银染mRNA差异显示方法,分离吗啡相关基因。方法:以吗啡处理的SH-SY5Y细胞中提取的总RNA为模板,用5’dT12MG锚定经物和两条随机引物合进行DDRT-PCT扩增,经测序凝胶电泳分离后,用银染方法显示差异DNA条带,在直视下从凝胶中回收差异条带并进行再扩增,扩增产物克隆入pGEM-T载体。结果建立了非同位素的银染mRNA差异显示方法,分离和克隆了一些吗啡诱导的差异表达基因  相似文献   

4.
目的 :利用mRNA差异显示技术研究正常卵巢上皮和卵巢上皮癌之间的基因表达差异状况 ,筛选和克隆卵巢上皮癌相关基因。方法 :通过DD PCR分析正常卵巢上皮和卵巢上皮癌总RNA将差异片段分离并显示出来 ,将其回收 ,利用基因克隆技术将其筛选和克隆出来作为探针进行斑点杂交鉴定、DNA序列测定、通过国际互联网络检索GenBank进行同源性分析。结果 :共筛选克隆鉴定 6个差异显示片段。其中 4个为未知基因片段 ,已收录入GenBank ,GenBank登录号为AF136 413~AF136 417。两个为已知基因片段 ,其中一个克隆 3AOSKN3与GenBank中染色体 17hCIT克隆 98%同源。另外一个克隆 3AON2 8与GenBank中人类NADH :辅酶Q氧化还原酶有 99%的同源性 ,研究表明该基因与肿瘤相关。结论 :上述结果证明mRNA差异显示方法和杂交分析结合已成为一种敏感、高效、快速的差异表达基因的克隆技术  相似文献   

5.
目的建立噬菌体P1衍生的人工染色体(PAC)和细菌人工染色体(BAC)筛选人正常肝cDNA文库的方法,并期望分离到与肝癌相关的新基因。方法用位于17p13.3肝癌杂合性缺失区内的PAC579和BAC1529克隆为探针,以噬菌斑杂交筛选法筛选人正常肝cDNA文库,并对分离出的cDNA阳性克隆进行部分测序和计算机序列比较及Southern杂交分析,进一步确定可能与肝癌相关的新基因。结果以PAC579为探针,筛选出78个阳性克隆,经初步分析,其中18个为可能的肝癌相关新基因。以BAC1529为探针,筛选出8个阳性克隆,经初步分析,其中5个为可能的肝癌相关新基因。结论以PAC和BAC克隆为探针筛选cDNA文库是一种有效的表达序列分离法,将有助于疾病特别是肿瘤的病因研究。  相似文献   

6.
银染mRNA差异显示方法的建立   总被引:6,自引:1,他引:5  
目的:建立银染mRNA差异显示方法,为差异表达基因片断的分离克隆奠定基础,方法:采用随机引物和锚定引物各1条,建立差异显示反转录聚合酶链式反应(DDRT-PCR)和银染方法,对DDRT-PCR过程中各实验影响因素进行优化,割取差异条带进行二次扩增。结果:当总RNA用量为0.2ug,引物浓度为0.6-1.0umol/L,dNTP浓度为200unmol/L,MgCl2浓度为1.6-2.0mmol/L,时,同时起始5个循环的退火温度为50℃,扩增效率最佳,特异性好,背景 干净,结论:DDRT-PCR方法简便,灵敏,高效,可用于分离差异表达基因。  相似文献   

7.
mRNA差异显示法筛选大肠癌相关基因   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的:分离并克隆大肠癌相关基因。方法:分别提取大肠癌与正常大肠粘膜的组织总RNA,用mRNA差异显示法(Differential display polymerase chain reaction,DD-PCR)筛选大肠癌特异性表达产物的cDNA片段,对其进行克隆、测序、序列分析以及斑点杂交初步鉴定。结果:获得了2个在大肠癌高表达而在正常大肠粘膜组织低表达的新基因片段。结论:这2条差异显示新基因片段很可能是与大肠癌相关的致癌基因。  相似文献   

8.
应用mRNA差异显示技术进行肝癌相关基因的筛选   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的采用mRNA差异显示技术寻找肝癌及非肝癌组织的差异表达基因,筛选肝癌相关基因,为进一步研究创造条件。方法提取手术切除肝癌及非癌肝组织成对标本的总RNA,逆转录获得eDNA片段,以mRNA差异显示方法筛选差异表达基因。对所获得的差异表达基因进行序列分析,并通过CenBank/BLAST数据库进行序列的同源性比较,并以Northern杂交方法对有意义片段予以来源确认。结果自720余条扩增条带中选出28条差异条带,其中“上调”者16条,“下调”者12条。对其中5条差异最为明显的片段进一步分析,其中2条为可能的新基因片段,其中一条经Northern印迹杂交证实确来自源标本组织,且在肝癌组织中有明显高表达趋势。结论mRNA差异显示技术是一种快速、灵敏、高效的差异表达基因的克隆技术,已采用这种技术获得了1条可能的肝癌相关新基因片段,有必要进一步研究。  相似文献   

9.
肝癌相关基因HCCA2的克隆及其与肝癌的相关性研究   总被引:2,自引:1,他引:1  
目的 研究和克隆新的肝癌相关基因,探索肝癌发生的分子基础。方法 采用mRNA差异显示技术,分析肝细胞癌和癌旁组织间基因的差异表达情况,获得差异表达基因片断。用此基因片断作为探针,通过筛选胎盘cDNA文库,以获得该基因cDNA全长,并用Northern印迹杂交的方法,分析所获得的新基因在43对肝细胞癌、对应癌旁组织中的差异表达和在正常组织中的分布。结果 克隆了一个新的肝癌相关基因HCCA2的全长cDNA,其在人体正常组织中分布较为广泛,在正常肝组织中不表达。该基因在43对肝癌组织中表达的阳性率是79%(34/43)。它的表达与肝癌包膜的完整性、Ki-67蛋白的表达相关(P<0.01)。结论 肝癌差异表达新基因HCCA2可能与肝癌细胞的浸润和增殖能力有关。  相似文献   

10.
PPARγ2诱导脂肪细胞分化相关基因的克隆及鉴定   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的 分离和克隆小鼠过氧化物酶体增殖体激活受体γ2(mPPARγ2)诱导脂肪细胞分化的相关基因。方法 在体外建立mPPARγ2诱导NIH3T3成纤维细胞分化成脂肪细胞模型基础上,采用mRNA差异显示技术分离、克隆PPARγ2诱导的脂肪细胞高表达或低表达的cDNA片段,再通过半定量RT-PCR证实。结果 经mRNA差异显示技术分离到20条差异显示片段,进一步对差异显示片段进行PCR扩增,T/A亚克隆及测序分析,与Gen Bank基因数据库比较后,得到8个已知基因,一条新基因序列,2个EST序列和7个新的EST序列。半定量RT-PCR结果显示UNR基因在PPARγ2诱导的脂肪细胞中表达上调,而凋亡抑制因子5(AP15)的表达则下调。结论 UNR基因的高表达和API5基因的低表达可能与PPARγ2诱导脂肪细胞分化有关。  相似文献   

11.
目的 :探讨应用 m RNA差异显示技术分离丁酸钠诱导的人大肠癌分化相关基因的改进方法。方法 :实验过程中针对某些关键因素如引物设计及 PCR参数的优化、PCR扩增产物显示方法、差异片段的鉴定及再证实等方面进行摸索和改进 ,总结出较为行之有效的改进方法。结果 :获得的差异片段经克隆测序并与 Gene Bank比较 ,其中的一个可能是新的基因 ,另一个与鼠 SOCS家族同源。结论 :经改进的方法 ,具有工作量小、实验周期短、操作简单、重复性好、成本低的优点。  相似文献   

12.
采用信使核糖核酸(mRNA)差异显示技术(mRNADiffrentialDisplaymRNADD),寻找人正常肝与肝癌细胞表达差异的互补脱氧核糖核酸(cDNA)克隆。人正常肝组织及人肝癌细胞株(Hep3B)mRNA用3'端二个引物分别与五种不同5'端引物进行逆转录─聚合酶链反应(RT-PCR),以35S-α(dATP)参入产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)及放射自显影。获得一批表达差异的cDNA克隆。选择其中31个克隆进行部分DNA序列分析,除一个为已知序列外其余30个克隆为GeneBank中无匹配序列。经斑点杂交证明二个克隆在肝癌中高表达,一个克隆在正常肝中高表达。目前正在对有意义的克隆做进一步论证。  相似文献   

13.
14.
目的 寻找参与细胞凋亡的相关基因。方法 天花粉蛋白诱导U937细胞凋亡后,用锚定引物和随机引物进行差别显示PCR,回收差异条带,进行RNA点杂交。用细胞凋亡时高表达的差异片段筛选胎肝cDNA库,阳性克隆测序,并与凋亡细胞RNA行Northern杂交。结果 用细胞凋亡时高表达的差异片段筛选胎肝cDNA文库,获得一个1.4kb的cDNA克隆,该cDNA序列中部分碱基与人Bruton酪氨酸激酶高度同源。  相似文献   

15.
Objective To identify genes associated with the chronic progression of renal disease and astragalus and angelica (A&amp;A)’s renal protective effects. Methods The technique of silver staining mRNA differential display (DD) was used to investigate changes of gene expression in normal, sclerotic and A&amp;A treated sclerotic kidneys. We isolated genes differentially expressed during the progression of renal disease which could be normalized by A&amp;A. Results Several genes related to A&amp;A’s protective effects were isolated and one of them was confirmed by Northern blot. Conclusion Silver staining mRNA differential display is a simple and effective technique for isolating differentially expressed genes. The isolated new gene may be related to the progression of chronic renal disease and contribute to A&amp;A’s protective effects.  相似文献   

16.
目的:探讨Exendin-4(Ex-4)对胰岛素抵抗(IR)人肝癌HepG2细胞脂代谢相关因子表达的影响,阐明Ex-4改善IR的作用。方法:选取处于对数生长期的人肝癌HepG2细胞,采用高浓度胰岛素诱导HepG2细胞制备IR模型(HepG2-IR细胞),再将其分为对照组(不含胰岛素的HepG2细胞)、IR组(IR模型,即HepG2-IR细胞)和Ex-4组(IR模型中加入10 nmol·L-1 Ex-4)。采用葡萄糖氧化酶法(GOD-POD)检测细胞中葡萄糖消耗量,采用油红O染色观察细胞形态及胞内脂滴形成情况,应用甘油三酯(TG)试剂盒检测细胞中TG水平,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测细胞中乙酰辅酶A羧化酶(ACC)、脂肪酸合成酶(FAS)、固醇调节元件结合蛋白1c(SREBP-1c)和载脂蛋白B100(apoB100)等脂代谢相关因子mRNA表达水平。结果:HepG2细胞建立IR模型后,与对照组比较,IR组HepG2-IR细胞葡萄糖消耗量明显降低(P<0.01);与IR组比较,Ex-4组HepG2-IR细胞葡萄糖消耗量明显增加(P<0.05)。油红O染色法,与对照组比较,IR组细胞含脂率明显升高(P<0.05);与IR组比较,Ex-4组细胞中含脂率明显降低(P<0.05)。与对照组比较,IR组细胞中TG水平明显升高(P<0.01);与IR组比较,Ex-4组细胞中TG水平明显降低(P<0.05)。qRT-PCR检测,与对照组比较,IR组细胞中ACC、FAS和SREBP-1c mRNA表达水平明显升高(P<0.01),apoB100mRNA表达水平明显降低(P<0.05);与IR组比较,Ex-4组细胞中ACC、FAS和SREBP-1c mRNA表达水平降低(P<0.05),apoB100 mRNA表达水平升高(P<0.01)。结论:Ex-4可通过调节人肝癌HepG2细胞脂类代谢相关因子的表达进而改善IR。  相似文献   

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