橘皮汤降逆止呕作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学研究橘皮汤治疗呕吐的作用机制。方法利用TCMSP数据库、DTPS靶点预测系统,以及Genecard、DisGeNET、TTD疾病数据库,筛选橘皮汤治疗呕吐的活性成分及其靶点,并借助Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络;应用STRING平台构建靶蛋白相互作用(PPI)网络;通过BioGPS数据库对潜在靶点进行组织器官定位分析;利用DAVID平台和Omicshare数据库对潜在靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析。结果共获得橙皮素、川陈皮素、柠檬烯、辛弗林、6-姜酚、姜烯、姜酮等24个橘皮汤活性成分,以及5-羟色胺受体、胆碱能受体、组胺受体、多巴胺受体、GABA受体等158个止呕靶点;涉及神经元的组成、神经元投射、原生质膜的组成、突触膜、突触膜固有成分、突触后膜固有成分等生物过程及细胞组成;主要调控多巴胺能神经突触、5-羟色胺能神经突触、胆碱能突触、GABA能神经突触等信号通路。结论橘皮汤能够多成分、多靶点、多器官、多通路降逆止呕,从对症和对因两个方面协同作用。     

基于网络药理学的复方苁蓉益智胶囊治疗血管性痴呆的分子机制研究

目的：对复方苁蓉益智胶囊(Compound Desert Cistanche Intelligence-improving Capsule)治疗血管性痴呆(VaD)的药理作用机制进行探讨。方法：基于网络药理学和分子对接的方法,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取复方苁蓉益智胶囊中各药物的活性成分,并通过SwissTarget Prediction数据库预测药物活性成分的作用靶点;通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank数据库获取血管性痴呆的疾病靶点。通过STRING 11.0数据库和Cytoscape 3.8.2构建蛋白质相互作用(PPI)网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块及核心网络;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.8.2构建“药物-活性成分-靶点-通路”网络图,采用分子对接技术对PPI网络及“药物-活性成分-靶点-通路”网络图结果进行验证。结果：筛选出35个主要活性成分,涉及134个靶点,其中主要活性成分包括亚美罂粟碱(Armepav...     

β-细辛醚治疗帕金森病抑郁的网络药理学作用机制分析

目的基于网络药理学分析β-细辛醚治疗帕金森病抑郁（DPD）的作用机制。方法利用TCMSP、 Swiss Target Prediciton 和PharmMapper 数据库检索得到β-细辛醚的作用靶点,通过Genecard 数据库和OMIM 数据库检索DPD 的疾病相关靶点,并通过UniProt 数据库进行标准化。构建β-细辛醚和DPD 的共有靶点韦恩 图,对共有靶点进行蛋白互作（PPI）网络分析,以获取关键靶点信息;对共有靶点进行GO 功能及KEGG 通路 富集分析;建立“药物-疾病-靶点-通路”网络,展示β-细辛醚治疗DPD 过程中疾病-靶点-通路的关系。 结果共得到β-细辛醚和DPD 的共有靶点64 个, 包括ALB、c-FOS、EGFR、JUN、CASP3、PTGS2、 IGF1、ESR1、APP 等多个关键靶点。共有靶点涉及学习或记忆、突触后膜的内在成分、神经递质受体活性、 突触后神经递质受体活动等与突触间神经递质及其受体密切相关的生物过程、分子功能及细胞组成,以及 5-HT 能神经突触、DA 能神经突触和神经活性配体受体相互作用等信号通路。结论β-细辛醚可能通过对 c-FOS、JUN、ALB、EGFR、CASP3、MAP2K1、MAPK14 等靶点及相关通路的作用,进而影响5-HT 能神经 突触和DA 能神经突触的损伤修复,发挥治疗DPD 的作用。     

半夏白术天麻汤治疗癫痫作用机制的网络药理学研究

目的:运用网络药理学技术探讨半夏白术天麻汤治疗癫痫的作用机制。方法:分别在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库及TCMID数据库中检索并整合得到半夏白术天麻汤的活性成分及活性成分作用的靶点。在OMIM数据库和GeneCards数据库中检索并整合得到癫痫的相关靶点。通过Venny软件映射得到半夏白术天麻汤治疗癫痫的潜在靶点。通过Cytoscape 3.6. 1软件构建成分-靶点关系网络,通过STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心治疗靶点。基于R语言软件对半夏白术天麻汤治疗癫痫的潜在靶点进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并且构建KEGG关系网络。结果:共筛选出半夏白术天麻汤活性成分130个,半夏白术天麻汤治疗癫痫的潜在靶点258个,其中核心靶点5个,包括β_2肾上腺素受体(ADRB2)、钙调蛋白1 (CALM1)、雌激素受体1 (ESR1)、一氧化氮合酶2 (NOS2)、丝裂原活化蛋白激酶14 (MAPK14)。且靶点之间具有直接或间接的相互作用关系。其涉及的GO生物学主要包括γ-氨基丁酸(GABA)能突触、神经递质受体的活动、GABA-A受体活动、GABA受体活动、苯二氮卓受体活动等。其主要涉及的KEGG通路包括白细胞介素-17 (IL-17)信号通路、5-羟色胺能突触等。结论:半夏白术天麻汤通过多成分、多靶点、多途径对癫痫发挥作用。     

基于GC-MS技术和网络药理学探讨益智仁挥发油治疗阿尔茨海默病的作用机制

基于GC-MS技术和网络药理学方法研究益智仁挥发油治疗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)的物质基础和作用机制。利用GC-MS技术分析益智仁挥发油成分,通过中药系统药理学分析数据库(TCMSP)获取成分靶点,再通过DrugBank、STITCH、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)等数据库查询AD的相关靶点。在Venny图取交集靶点,STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选核心作用靶点。基于DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用Cytoscape 3.8.1软件构建“成分-靶点-通路”网络,筛选益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分,结合已有的益智仁挥发油治疗AD的药理学研究预测其机制。结果显示,GC-MS分析所得的益智仁挥发油成分经筛选后得到6个活性成分,TCMSP数据库中检索到6个活性成分对应的17个靶点,DrugBank等数据库检索到3 448个AD靶点。“成分-靶点-通路”网络和PPI网络显示益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分有4种,核心靶点有4个;GO富集分析得到34个条目(P0.05),包含生物过程18条、细胞组成9条和分子功能7条;KEGG通路富集到5个条目(P0.05),这些通路主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号通路、胆碱能突触、5-羟色胺能突触等,表明益智仁挥发油可能通过调节钙平衡、胆碱能平衡、调节磷酸化等途径协同治疗AD。该研究为益智仁挥发油治疗AD的深入研究提供了参考和指导。     

复方苁蓉益智胶囊联合奥拉西坦治疗老年阿尔茨海默病的临床疗效

目的：分析复方苁蓉益智胶囊联合奥拉西坦治疗老年阿尔茨海默病的临床疗效。方法：选取2018年1月至2021年9月北京市隆福医院收治的148例老年阿尔茨海默病患者作为研究对象,采用随机数字表法简单随机化分为对照组和观察组,每组74例。对照组采用奥拉西坦胶囊进行治疗,观察组在对照组的基础上联合复方苁蓉益智胶囊治疗,均治疗3个月。比较2组患者临床疗效、氧化应激指标、炎症介质、病情严重程度、胆碱能神经递质水平、血液流变学指标及简易精神状态量表（MMSE）评分。结果：治疗后,观察组总有效率高于对照组（P<0.05）。与治疗前比较,治疗后2组患者血清超氧化物歧化酶（SOD）、乙酰胆碱（ACh）、胆碱酯酶（AChE）水平、MMSE及画钟试验评分、即刻记忆、回忆、注意力及计算力、地点定向力、时间定向力、语言评分升高,观察组高于对照组（均P<0.05）;2组患者血清丙二醛（MDA）、白细胞介素-1β（IL-1β）、核因子κB水平及临床痴呆量表（CDR）评分、全血高切黏度、全血低切黏度、红细胞聚集指数降低,观察组低于对照组（均P<0.05）。结论：复方苁蓉益智胶囊联合奥拉西坦可有效减轻老年阿尔茨海默病患者机体炎症反应和氧化应激反应,缓解患者病情进展,调节神经递质水平和血液流变学,改善其认知功能,具有较好的治疗效果。     

基于网络药理学探讨芎芷地龙汤治疗偏头痛的作用机制

目的:分析芎芷地龙汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的作用靶点及信号通路.方法:通过TCMSP平台收集芎芷地龙汤活性成分并进行ADME筛选,收集活性成分潜在靶点;通过GeneCards数据库收集偏头痛的相关疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建"药物-靶点-疾病"网络并进行分析,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析.结果:共筛选出芎芷地龙汤85个潜在活性成分和145个潜在治疗靶点;芎芷地龙汤治疗偏头痛关键靶点为JUN、TNF、MAPK1、AKT1、RELA等;可能参与的通路有Pathway in cancer通路、HIF-1信号、TNF信号通路、TLR信号通路、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、T细胞受体信号通路等.结论:槲皮素、β-谷甾醇等是芎芷地龙汤中的主要活性成分;TNF、MAPK1、AKT1等基因可能在治疗偏头痛时参与调控;芎芷地龙汤主要通过调节氧化应激反应、低氧反应、炎性因子释放、神经递质传递、血管张力等机制治疗偏头痛.     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的作用机理

目的探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的可能作用机制。方法采用网络药理学研究方法,应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库,对当归芍药散和阿尔茨海默病进行靶标预测。采用STRING在线数据库,对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络,并在Cytoscape 3. 6. 1软件中进行可视化处理。在Unitprot数据库查询靶标蛋白的基因名,使用DAVID工具对查到的基因进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析,探讨潜在靶标可能具有的生物学功能及通路。结果从当归芍药散中筛选出38个化合物,涉及治疗阿尔茨海默病的9个靶点,网络分析结果表明靶点该方可能通过胆碱能突触传递、乙酰胆碱受体信号通路、神经系统发育、信号转导等生物过程,并结合G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、过氧化物酶活性、细胞外配体门控离子信号通路、淀粉样β结合蛋白等分子功能发挥作用;其作用机制主要与胆碱能突触通路、神经配体-受体相互作用通路、钙信号通路、尼古丁成瘾相关的信号通路、PI3KAkt信号通路等有关。结论当归芍药散治疗阿尔茨海默病具有多靶点、多通路的特点。     

蛭蛇通络胶囊治疗缺血性脑卒中潜在有效成分及作用机制的研究

应用网络药理学和分子对接技术探讨蛭蛇通络胶囊治疗缺血性脑卒中的潜在有效成分和作用机制。利用TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库并结合文献查找蛭蛇通络胶囊各味中药化学成分,同时使用BATMAN-TCM数据库进行成分-靶点预测。在OMIM数据库和GeneCards数据库中以“cerebral stroke”“ischemic stroke”“cerebral ischemic stroke”等为关键词搜索缺血性脑卒中相关靶点,绘制中药化学成分靶点与缺血性脑卒中靶点的韦恩图。将共同靶点导入STRING数据库中构建靶点相互作用网络图,利用Cytoscape软件进行可视化处理,筛选出核心靶点。使用DVIAD数据库对靶点进行GO和KEGG富集分析。结果获得蛭蛇通络胶囊共193个潜在化学成分,985个药物靶点,6 035个疾病靶点。经Venny映射后,治疗缺血性脑卒中的潜在靶点共631个,筛选核心靶点44个,对应的有效潜在活性成分55个。GO富集分析条目主要涉及缺氧反应、ERK1和ERK2级联的正调节等。KEGG通路富集分析主要涉及胆碱能突触、cAMP信号通路和钙信号通路等。分子对接显示,TP53、EGFR、IL6、INS、TNF、SRC与其相对应的活性成分均有较好的结合能力。构建脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激小鼠巨噬细胞株RAW264.7损伤致炎模型,酶联免疫吸附实验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)表明蛭蛇通络胶囊可降低上清液中炎症因子IL-1α、IL-1β、IL-6、TNF-α含量。结果表明蛭蛇通络胶囊可通过拮抗炎症而发挥治疗缺血性脑卒中的作用。     

基于网络药理学和分子对接研究参松养心胶囊治疗心房颤动的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接技术研究参松养心胶囊治疗心房颤动（AF）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中医药百科全书数据库（ETCM）检索参松养心胶囊的活性成分及作用靶点;利用人类基因数据库（GeneCards）、治疗性靶点数据库（TTD）、在线人类孟德尔遗传（OMIM）、遗传药理学和药物基因组学数据库（PhramGKB）、疾病相关基因数据库（DISGeNET）、综合性药物数据库（DrugBank）检索得到AF疾病靶点;使用R软件绘制药物活性成分-疾病靶点韦恩图得到参松养心胶囊治疗AF的潜在靶点;利用R语言对潜在靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析;通过Cytoscape软件构建药物活性成分-疾病靶点网络图,通过筛选得到关键靶点及药物活性成分,运用AutoDock Vina软件进行分子对接;运用PyMOL软件对分子对接结果进行可视化。结果：得到参松养心胶囊的活性成分190个、其对应靶点262个,同时检索得到3 577个与AF疾病相关靶点,二者交集靶点171个,共涉及GO功能2 549个,KEGG信号通路183条;蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）最终筛选出关键靶蛋白MAPK1、MAPK8、MAPK14、JUN、STAT、FOS、TNF,将其与反向筛选的10个药物活性成分一一进行分子对接,其中有39对成分-靶点对接活性较高。其中隐丹参酮、木犀草素、山柰酚与MAPK1对接结果最佳。本研究表明参松养心胶囊是通过多成分、多靶点、多通路对AF起到治疗作用,同时笔者发现参松养心胶囊主要通过MAPK1影响心房电结构重构、调节代谢、抑制炎症反应、调节细胞凋亡等途径治疗AF。     

巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学方法探讨巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆的潜在分子作用机制。方法利用中 药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP 数据库）收集巴戟天、淫羊藿的化学成分,根据口服生物利用度、类 药性、血脑屏障透过率等参数以及结合文献报道筛选其活性成分并预测其作用靶点;通过GeneCard、TTD、 DiGSeE 等数据库筛选出老年痴呆症相关的疾病靶点,并与活性成分作用靶点取交集即为药物与疾病的共同作 用靶点;采用Cytoscape 3.7.1 软件构建巴戟天-淫羊藿药对活性成分-共同作用靶点的可视化网络;基于 STRING 数据库,构建巴戟天-淫羊藿药对防治老年性痴呆靶点（共同作用靶点）的蛋白互作网络,根据拓扑学 参数分析筛选出核心靶点;对共同作用靶点进行GO 功能富集分析和KEGG 信号通路富集分析,构建巴戟天- 淫羊藿药对治疗老年痴呆症的“活性成分-共同作用靶点-信号通路”网络。结果共筛选出活性成分27 个, 获得“巴戟天-淫羊藿”药对与老年痴呆症的共同作用靶点129 个;核心靶点涉及GAPDH、VEGFA、STAT3、 SRC、EGFR、JUN、MAPK8 等;GO 富集分析得到生物学过程相关条目388 条、分子功能相关条目131 条及细 胞组分相关条目117 条（P＜0.01）;KEGG 通路富集分析得到128 条信号通路（P＜0.01）,其中筛选得到与老年 痴呆相关的信号通路9 条。结论巴戟天-淫羊藿药对防治老年痴呆症具有多成分、多靶点、多通路的作用特 点,其作用机制可能与神经活性配体-受体相互作用、内分泌抵抗、5-羟色胺能突触、胆碱能突触、多巴胺能 神经突触等信号通路相关。     

基于血清药物化学和网络药理学的藏族药七十味珍珠丸安全性评价

采用血清药物化学和网络药理学探讨七十味珍珠丸入血活性成分抑制复方中佐太组分肝肾毒性的相关机制,为七十味珍珠丸的临床安全应用提供依据。通过色谱串联质谱(HPLC-MS/MS)鉴定小鼠七十味珍珠丸含药血清中的小分子化合物。综合运用TCMSP、HERB、PubChem、GeneCards、SuperPred等多个数据库,检索七十味珍珠丸入血活性成分,预测其作用靶点,并与数据库检索到的汞毒性肝肾损伤相关靶点交集比对,筛选出七十味珍珠丸抑制佐太组分潜在汞毒性的作用靶点。采用Cytoscape软件构建七十味珍珠丸入血活性成分-靶点网络,使用STRING数据库构建交集靶点蛋白蛋白互作(PPI)网络,通过DAVID数据库对靶点基因进行GO功能与KEGG通路富集分析,构建活性成分-靶点-通路网络,并筛选出关键成分和靶点进行分子对接验证。结果显示,七十味珍珠丸含药血清中共鉴定出活性成分44种,其中13种可能是原型药物成分,作用于肝肾汞毒性的潜在靶点70个。通过PPI网络拓扑分析,得到12个关键靶点基因(HSP90AA1、MAPK3、STAT3、EGFR、MAPK1、APP、MMP9、NOS3、PRKCA、...     

基于网络药理学的五苓散治疗慢性心力衰竭的机制研究

目的通过网络药理学方法探讨五苓散(WLS)治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法运用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)与文献挖掘获取五苓散的有效活性成分和对应的作用靶点,从而建立单味药-活性成分-靶点网络;在GeneCards、OMIM数据库获得CHF的靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件构建药物活性成分-CHF-靶点网络模型并进行分析;运用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络(PPI),借助DAVID在线工具对关键靶点进行基因本体功能注释(GO)和东京基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并用Surflex软件进行分子对接。结果通过筛选得到50个活性成分,29个潜在靶点,8243个CHF靶点,27个五苓散-CHF共同靶点。网络分析结果表明,五苓散治疗CHF的关键靶点包括CASP3、RELA、AR、ESR1、CHRM1、CASP8等,生物过程主要涉及信号转导、神经系统发育、RNA聚合酶II启动子的转录起始、对雌二醇的反应、胆碱能突触传递等,KEGG富集主要涉及调节神经活性配体-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、胆碱能突触等。分子对接结果显示五苓散中(+)-儿茶素、花旗松素等关键化合物与CASP8、CHRM1、NR3C1等关键靶点有较好的结合能力。结论从网络药理学角度初步揭示了五苓散治疗CHF的物质基础和作用机制,为五苓散的临床应用提供了一定的理论依据。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨中药复方射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接技术研究射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘药效成分的可能靶点,为其临床应用及科研提供理论依据。方法 在TCMSP数据库中查询9味组方药物的有效活性成分靶点;在Gene Cards、OMIM、PharmGkb、TTD和Drug Bank数据库中查询咳嗽变异性哮喘的疾病相关基因;将药物靶点与疾病相关基因取交集并用Cytoscape构建中药复方调控网络;查找网络核心基因后用R语言进行GO及KEGG富集分析;使用Vina对蛋白受体和小分子配体进行对接。结果 本研究共筛选出254个药物靶点;筛选到网络核心基因9个,分别为TNF、MAPK14、AKT1、ESR1、STAT1、MAPK1、EGFR、TP53和MAPK3;GO富集分析氧化应激反应富集最明显;KEGG富集分析主要涉及流体剪切力与动脉粥样硬化通路;分子对接发现槲皮素与TNF和AKT1基因具有较好的结合性。结论 本研究体现了中药复方射干麻黄汤多成分、多靶点及多途径的作用特点,为射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘作用机制提供新思路和新靶点。     

基于网络药理学及分子对接探讨脑脉泰胶囊治疗脑梗死的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术分析脑脉泰胶囊治疗脑梗死（Cerebral infarction,CI）的潜在作用机制。方法 通过TCMSP、TCMIP数据库检索、筛选脑脉泰胶囊的活性成分及其作用靶点,通过DrugBank、OMIM、PharmGkb、TTD、DisGeNET数据库筛选脑梗死疾病相关靶点,获取二者的交集靶点,作为脑脉泰胶囊治疗脑梗死的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-潜在作用靶点”网络,并分析网络中的关键活性成分;将交集靶点导入STRING数据库中进行蛋白互作（PPI）网络分析,筛选出潜在核心靶点;同时使用R 4.0.3软件对交集靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 共筛选得到140个活性成分及111个潜在作用靶点（交集靶点）;获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、白藜芦醇等关键活性成分;筛选得到IL6、TNF、CXCL8、PTGS2、STAT3、JUN、MAPK1等核心靶点;潜在作用靶点主要富集在IL-17、TNF、HIF-1、MAPK...     

基于网络药理学和分子对接探讨蒙药三味檀香汤治疗缺血性心脏病的作用机制＊

目的 基于网络药理学与分子对接技术研究蒙药三味檀香汤治疗缺血性心脏病的作用机制，并分析关键活性成分在缺血性心脏关键靶点中的分子调控机制。方法 通过TCMSP数据库获取三味檀香汤的活性成分及其作用靶点，与Gene Cards等数据库获取的疾病靶点取交集，筛选出三味檀香汤对缺血性心脏病的治疗作用靶点，利用Cytoscape软件对“三味檀香汤-缺血性心脏病”的“活性成分-作用靶点”网络进行可视化处理；再利用String数据库构建蛋白互作网络，并筛选出关键靶点，然后在关键活性成分和关键靶点间进行分子对接验证；同时通过DAVID数据库对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析。最后探讨“关键活性成分-关键靶点-信号通路”间的关系。结果 ①得到活性成分20个，治疗靶点175个；②槲皮素、木犀草素、柚皮素、山柰酚、异鼠李素为三味檀香汤的关键活性成分；③MAPK3、MAPK1、JUN、RELA、AKT1为蛋白互作网络中的关键靶点；④关键活性成分和关键靶点间具有良好的结合活性；⑤DAVID富集分析主要涵盖细胞对活性氧的反应、细胞对氧化应激的反应、老化等生物学过程，涉及B细胞受体、AGE-RAGE及Toll样受体等信号通路。⑥三味檀香汤通过多个靶点、多种信号通路治疗缺血性心脏病。结论 本文研究采用网络药理学分析了三味檀香汤治疗缺血性心脏病的潜在作用机制，可为进一步研究其药效物质基础及作用靶点提供参考。     

基于网络药理学左金丸治疗胃溃疡的机制

目的基于网络药理学研究左金丸治疗胃溃疡的机制。方法通过中药系统网络药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集左金丸中2味药材(吴茱萸、黄连)活性成分,利用Swiss Target Prediction数据库查找活性成分的靶点,与pharm GKB、CTD、Genecards数据库比对得到治疗胃溃疡的靶点,进行GO功能、KEGG通路富集分析, cytoscape构建中药-成分-靶点-通路网络图,Systems Dock Web Site进行分子对接。结果从吴茱萸、黄连中筛选出41种活性成分,检索出228个靶蛋白,与胃溃疡有关的靶点有30个。两者治疗胃溃疡可能涉及神经递质代谢、氧运输和代谢相关靶点,以及5-羟色胺突触、花生四烯酸代谢、癌症等相关途径。结论本研究反映了左金丸中吴茱萸、黄连多成分、多靶点、多途径的作用特点,为后续相关作用机制考察提供了方向。     

基于网络药理学和分子对接探讨姜黄、郁金药对治疗肝癌的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接方法探讨姜黄、郁金药对治疗肝癌的潜在靶点和作用机制。方法：通过公共数据库筛选姜黄、郁金药对的活性成分和作用靶点及肝癌的靶点,绘制药物活性成分的分子靶点和疾病靶点的交集,构建药对-疾病-有效成分-靶点的中药复方调控网络图及蛋白-蛋白互作网络图,进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析,通过分子对接对有效成分和关键靶点进行验证。基于TIMER数据库分析关键靶点与免疫细胞浸润的关系,通过GEPIA数据库分析关键靶点在肿瘤组织中的表达情况及对患者临床预后的影响。结果：最终筛选出姜黄、郁金药对有效成分6个,共同靶点70个,核心靶点柚皮素与MAPK3、CASP3、AKT1、CAT、ESR1和PTGS2有较强的亲和力。作用机制涉及多条通路,核心靶点与多个免疫细胞浸润丰度相关,其中MAPK3在肿瘤组织中的表达高于癌旁组织,ESR1则相反。生存曲线分析中MAPK3表达水平高者,预后相对较差;ESR1表达水平高者,预后相对较好。MAPK3为癌基因,ESR1为抑癌基因,对肝癌的临床预后具有潜在价值。结论：姜黄、郁金药对可通过诱导肿瘤细胞凋亡、抑制肿瘤血管生成、调节信号通路减少...     

基于网络药理学和分子对接探讨肉苁蓉苯乙醇总苷对肝细胞癌的潜在分子机制

目的：通过网络药理学及分子对接技术,探讨肉苁蓉苯乙醇总苷(CPhGs)治疗肝细胞癌(HCC)的潜在分子机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库及文献收集肉苁蓉苯乙醇总苷的活性成分及潜在作用靶点。通过TTD,GeneCards等数据库获得与HCC相关的疾病基因,得到药物靶点与疾病靶点的交集为肉苁蓉苯乙醇总苷治疗HCC的潜在作用靶点,将交集靶点导入蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选关键靶点。将关键靶点导入DAVID数据库,进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最终,利用Autodock vina软件对筛选出的蛋白与肉苁蓉苯乙醇总苷活性成分进行分子对接。结果：肉苁蓉苯乙醇总苷中有29种活性成分及410个靶基因,涉及PI3K-AKT信号通路、癌症信号通路、癌症蛋白聚糖通路、VEGF信号通路等以发挥治疗HCC的作用。分子对接结果显示,筛选的靶点受体蛋白与活性成分具有较好的结合活性。结论：肉苁蓉苯乙醇总苷可能通过多组分、多靶点和多途径的方式调节癌细胞、血管生成等相关靶标和途径,从而对HCC产生治疗作用。