槲皮素抑制人前列腺癌PC-3细胞增殖及与Wnt/β-catenin信号通路的机制

目的:观察槲皮素对人前列腺癌PC-3细胞增殖和Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)信号通路的调控作用,探讨其抗前列腺癌的可能机制。方法:体外培养PC-3细胞,以不同终浓度槲皮素进行处理,设空白组。采用噻唑蓝比色法(MTT)观察槲皮素对PC-3细胞增殖抑制作用,计算半数抑制浓度(IC50);采用流式细胞仪检测槲皮素对PC-3细胞凋亡的影响;采用免疫印迹法(Western blot)和逆转录-PCR(RT-PCR)分析检测槲皮素对β-catenin和下游靶基因细胞周期素D1(Cyclin D1),原癌基因(c-Myc)蛋白表达和转录水平;采用免疫荧光分析检测槲皮素对β-catenin表达的影响;利用荧光酶报告基因分析检测槲皮素对Wnt/β-catenin信号通路的影响。结果:与空白组比较,槲皮素对PC-3细胞增殖具有明显抑制作用(P0.05),并诱导PC-3细胞凋亡(P0.05)。与空白组比较,槲皮素可显著抑制PC-3细胞β-catenin的蛋白表达和转录活性,从而阻断Wnt/β-catenin信号通路的传导,抑制下游靶基因的表达水平(P0.05,P0.01)。结论:槲皮素可显著抑制PC-3细胞增殖,其机制可能与抑制Wnt/β-catenin信号通路有关。     

黄芪甲苷通过调控ET-1对糖氧剥夺致损伤星形胶质细胞中 NLRP3通路的影响北大核心

目的:研究黄芪甲苷通过调控内皮素(ET-1)影响星形胶质细胞中NLRP3通路的作用机制。方法:糖氧剥夺构建星形胶质细胞损伤模型,用qRT-PCR检测细胞中ET-1 mRNA表达,鉴定造模成功与否。CCK-8法筛选黄芪甲苷对模型细胞干预的最佳作用浓度(30μmol/L)和时间(24 h)。细胞分为5组:正常对照组、模型组、心钠肽(ET-1抑制剂)组、黄芪甲苷组、联合组。CCK-8检测各组细胞的增殖能力;流式细胞术检测细胞凋亡情况;qRT-PCR检测Bax、Bcl-2、Caspase-3 mRNA表达;ELISA检测炎症因子TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-18水平;Western Blot检测NLRP3通路蛋白NLRP3、Caspase-1表达。结果:与正常对照组比较,模型组细胞增殖能力及Bcl-2蛋白表达显著降低,细胞凋亡率、炎症因子水平及Bax、Caspase-3 mRNA表达和NLRP3、Caspase-1蛋白表达显著升高(P<0.05)。与模型组比较,各给药组细胞增殖能力及Bcl-2蛋白表达显著升高,细胞凋亡率、炎症因子水平及Bax、Caspase-3 mRNA表达和NLRP3、Caspase-1蛋白表达显著降低(P<0.05),其中联合组的效果最显著。结论:黄芪甲苷可通过抑制ET-1表达进而抑制NLRP3信号通路来保护缺血性星形胶质细胞损伤。     

忍冬藤提取物诱导骨肉瘤细胞凋亡的作用及机制研究

目的研究忍冬藤Lonicerajaponica提取物对骨肉瘤细胞增殖和凋亡的作用及机制。方法采用超高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术(UPLC-Q-TOF/MS)表征忍冬藤提取物的化学成分;采用MTT法检测忍冬藤提取物对人骨肉瘤细胞HOS、143B以及人肾皮质近曲小管上皮细胞HK-2存活率的影响;采用荧光显微镜观察忍冬藤提取物对HOS、143B细胞凋亡的影响;采用Annexin V/PI双染法检测忍冬藤提取物对HOS细胞凋亡的影响;采用JC-1染色法检测忍冬藤提取物对HOS细胞线粒体膜电位的影响;采用Westernblotting法检测忍冬藤提取物对HOS细胞B细胞淋巴瘤2相关X蛋白(bcl-2associated X,Bax)、B细胞淋巴瘤2(B cell lymphoma-2,Bcl-2)、活化的半胱氨酸蛋白酶-3(cleaved Caspase-3)、活化的多聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(cleavedpolyADP-ribosepolymerases,cleavedPARP)、cleavedCaspase-9和细胞色素C(cytochrome-c,Cyt-C)蛋白表达的影响。结果忍冬藤提取物中鉴定出有机酸类、三萜皂苷类、黄酮类、环烯醚萜类和氨基酸类5种类型的36种化学成分。忍冬藤提取物抑制HOS和143B细胞存活率,显著诱导HOS细胞凋亡(P0.01),Caspase-3抑制剂Z-VAD-FMK显著抑制忍冬藤提取物诱导的HOS细胞凋亡(P0.05、0.01);忍冬藤提取物显著提高HOS细胞Caspase-3活性(P0.01),显著改变HOS细胞线粒体膜电位(P0.05、0.01),显著上调HOS细胞Bax、cleaved Caspase-3、cleaved PARP、cleaved Caspase-9、Cyt-C和Bax/Bcl-2蛋白表达水平(P0.05、0.01),显著下调Bcl-2蛋白表达水平(P0.05、0.01)。结论忍冬藤提取物能够抑制骨肉瘤细胞增殖,并通过线粒体凋亡途径诱导细胞凋亡,其机制可能与下调Bcl-2蛋白表达,上调Bax、cleaved Caspase-3、cleaved PARP、cleaved Caspase-9和Cyt-C蛋白表达,激活Caspase级联反应有关。     

灵芝三萜通过Wnt/β-catenin信号通路对肝癌细胞增殖和凋亡的影响

目的 灵芝三萜通过Wnt/β-catenin信号通路对肝癌细胞增殖和凋亡的影响.方法 灵芝三萜(10、50、100 μg/mL)作用HepG2人肝癌细胞24、48、72 h,MTT和流式细胞仪检测细胞增殖和凋亡.100 μg/mL灵芝三萜作用HepG2细胞24、48、72 h,Western blot检测c-myc、cyclinD1、caspase-3、caspase-8、β-catenin、p-GSK-3β蛋白表达.分别以20 μmol/L XAV-939、20 mmol/L LiCl及100 μg/mL灵芝三萜联合20 mmol/L LiCl干预HepG2细胞,MTT和流式细胞仪分别检测细胞增殖和凋亡.结果 灵芝三萜(10、50、100 μg/mL)抑制HepG2细胞增殖(P<0.05),诱导细胞凋亡(P<0.05).100 μg/mL灵芝三萜作用HepG2细胞24、48、72 h,细胞caspase-3、caspase-8蛋白表达上调(P<0.05),而c-myc、cyclinD1、β-catenin、p-GSK-3β蛋白表达下调(P<0.05).20 μmol/L XAV-939干预能抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡(P<0.05),20 mmol/L LiCl则能在一定程度上减弱灵芝三萜对HepG2细胞增殖的抑制和细胞凋亡的诱导作用(P<0.05).结论 灵芝三萜能够通过Wnt/[β-catenin信号通路调节c-myc、cyclinD1、caspase-3、caspase-8蛋白表达,抑制肝癌细胞增殖并诱导细胞凋亡.     

黄芪注射液对肺癌细胞凋亡及PI3K/AKT信号通路的影响

目的:探讨黄芪注射液对肺癌细胞凋亡及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B (PI3K/AKT)信号通路的影响。方法:取对数生长期、状态良好的A549细胞,随机分为对照组、实验1组、实验2组。对照组用常规培养基培养干预,在此基础上,实验1组用100 mg/mL的黄芪注射液干预,实验2组用200 mg/mL的黄芪注射液干预。采用MTT法检测细胞增殖,双染法检测细胞凋亡指数,Transwell实验检测细胞迁移,Western-blot检测PI3K/AKT蛋白表达,流式细胞仪检测细胞周期。结果:处理24 h、48 h后,与对照组比较,实验1组与实验2组细胞增殖指数、迁移距离及PI3K、AKT蛋白相对表达水平降低(P<0.05),细胞凋亡指数升高(P<0.05);与实验1组比较,实验2组细胞增殖指数、迁移距离及PI3K、AKT蛋白相对表达水平更低(P<0.05),细胞凋亡指数更高(P<0.05)。处理48 h后,与对照组比较,实验1组与实验2组GO/G1期比例降低(P<0.05),S期、G2/M期比例升高(P<0.05);与实验1组比较,实验2组GO/G1期比例更低...     

萝卜硫素通过Traf6/TAK1信号通路介导人胃癌细胞凋亡的机制研究

[目的]探讨萝卜硫素对人胃癌(HGC27)细胞增殖、凋亡的影响,并观察其可能作用的机制。[方法]将对数生长期的HGC27细胞分为空白对照组、15μg/m L萝卜硫素、30μg/m L萝卜硫素及60μg/m L萝卜硫素,用不同浓度药物处理细胞后,采用CCK8法检测各组细胞的增殖情况,流式细胞术检测各组细胞的凋亡率,免疫印迹技术检测细胞中凋亡蛋白及肿瘤坏死因子受体相关分子6(Traf6)/转化生长因子-β活化激酶1(TAK1)信号通路蛋白表达量。[结果]与空白对照组相比,不同浓度萝卜硫素组细胞增殖抑制率及凋亡率明显升高(P0.05);促凋亡蛋白半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)表达水平显著升高,而抗凋亡蛋白B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)水平则显著降低(P0.05);Traf6、p-TAK1蛋白表达量相对于空白对照组显著升高(P0.05)。[结论]萝卜硫素可以抑制人胃癌细胞的增殖,促进细胞的凋亡,Traf6/TAK1信号通路可能参与了萝卜硫素对肿瘤细胞的抑制作用。     

基于转录组测序探讨白花蛇舌草-半枝莲提取物抗结直肠癌作用机制

目的：基于转录组测序探讨白花蛇舌草-半枝莲（HD-SB） 提取物对结直肠癌的作用机制。方法：采用不同浓度（0、0.25、0.5、1、2、4 mg/mL） 白花蛇舌草（HD） 提取物、半枝莲（SB） 提取物、HD-SB提取物处理3 种不同结直肠癌细胞系（HT-29、HCT-116、SW620） 24 h,采用CCK8 检测细胞活力。选择未处理的SW620 细胞（对照组） 和1 mg/mL HD-SB 处理24 h 的SW620 细胞（HD-SB 组） 进行转录组测序,实时PCR 检测靶向无翅型MMTV 整合位点家族（WNT） 通路5 个关键基因［无翅型MMTV 整合位点家族成员11（WNT11）、无翅型MMTV 整合位点家族成员2B（WNT2B）、卷曲同源物2（FZD2）、低密度脂蛋白受体相关蛋白6（LRP6）、磷脂酶C-β4（PLCβ4）］表达。结果：与HD 提取物、SB 提取物相比,1、2、4 mg/mL 这3 个浓度HD-SB 提取物处理HT-29、SW620 细胞后,活力显著下降（P＜0.05）。转录组测序发现,与对照组比较,HD-SB 组1 522 个差异基因发生显著变化（P＜0.05）,其中有203 个基因表达显著上调（P＜0.05）,1 319 个基因表达显著下调（P＜0.05）。GO 富集分析显示,mRNA 中的差异基因主要与细胞组分、细胞表达调控、免疫反应的调控等功能相关;KEGG 分析显示,差异基因参与的通路主要有代谢相关信号通路、癌症相关通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK） 信号通路、WNT 信号通路等。与对照组比较,HD-SB 组WNT 通路的WNT11、WNT2B、FZD2、LRP6、PLCβ4 5 个关键基因表达均显著下调（P＜0.05）。结论：HD-SB 提取物可抑制结直肠癌SW620 细胞增殖,其机制可能与抑制WNT 通路活化有关。     

重楼醇提取物通过 JAK/STAT 信号通路对神经胶质瘤 U251 细胞增殖及凋亡影响的研究

目的:探讨重楼醇提取物通过酪氨酸激酶/信号转导子和转录激活子(JAK/STAT)信号通路对人神经胶质瘤U251细胞增殖及凋亡的影响。方法:用重楼醇提取物溶液干预人神经胶质瘤细胞U251细胞,然后采用MTT法检测重楼醇提取物对U251细胞生长增殖的影响。使用AnnexinⅤ-FITC/PI染色检测重楼醇提取物对U251细胞周期及凋亡的影响。Western blot及RT-PCR法检测重楼醇提取物对U251细胞磷酸化酪氨酸激酶2 (p-JAK2)、磷酸化信号传导及转录激活因子3 (p-STAT3)、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)蛋白及JAK2、STAT3、Cyclin D1、Bcl-2 mRNA表达的影响。结果:与空白组比较,重楼醇提取物各剂量组细胞抑制率、24 h后细胞凋亡率显著增加(P0.05),且随着剂量的增加而增加(P0.05,P0.01); p-JAK2、p-STAT3、Cyclin D1及Bcl-2蛋白及JAK2、STAT3、Cyclin D1、Bcl-2 mRNA表达量均显著降低(P0.05),且均随着剂量的增加而降低(P0.05,P0.01)。结论:重楼醇提取物可明显抑制人神经胶质瘤U251细胞的增殖,促进其凋亡,且其作用机制可能与重楼醇提取物阻滞JAK/STAT信号通路的信号传导,抑制通路蛋白及mRNA合成有关。     

基于STAT3通路探讨沉默星形胶质上调基因-1对人胆囊癌GBC-SD细胞增殖及凋亡的影响

目的探讨沉默星形胶质细胞上调基因-1(AEG-1)对人胆囊癌GBC-SD细胞增殖、凋亡及STAT3信号通路的影响。方法实验分为空白对照组(仅有空质粒,无任何阴性或阳性干扰序列)、阴性对照组(携带AEG-1阴性序列)、RNA干扰组(携带AEG-1基因干扰序列),将人GBC-SD细胞接种于培养板内,按要求进行质粒载体转染细胞操作,采用qPCR法检测各组AEG-1 mRNA表达水平,采用Western blot法检测STAT3、p-STAT3和AEG-1蛋白表达水平,采用MTT法检测各组GBC-SD细胞增殖情况,采用Hoechst 33342染色法检测各组GBC-SD细胞凋亡情况,采用ELISA法检测各组GBC-SD细胞分泌基质金属蛋白酶-2(MMP-2)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)水平。结果与空白对照组和阴性对照组比较,RNA干扰组AEG-1 mRNA及蛋白表达水平和p-STAT3蛋白表达水平均明显降低,GBC-SD细胞增殖明显下降,凋亡率明显增高,MMP-2和MMP-9水平明显降低,差异均有统计学意义(P均0.05)。结论沉默AEG-1可以通过STAT3信号通路抑制人GBC-SD细胞的增殖和诱导其凋亡。     

硝唑尼特对骨肉瘤的影响及机制研究

目的 以网络药理学为基础,探讨硝唑尼特(nitazoxanide,NTZ)对骨肉瘤的影响及作用机制。方法 利用化合物靶点预测数据库,筛选NTZ在骨肉瘤治疗中的潜在靶点,构建蛋白互作网络,并在Cytoscape软件中对蛋白互作网络进行可视化分析,通过计算度值,将排名前20的基因视为关键靶基因。借助David数据库对潜在靶点进行富集分析,预测药物潜在作用途径。通过体外实验验证NTZ的抗骨肉瘤的作用,设置NTZ处理组0,10,20,30,40 μmol·L^-1和0.05%DMSO对照组分别作用于骨肉瘤细胞143B细胞,结晶紫、MTT实验检测NTZ对骨肉瘤143B细胞增殖的影响;划痕和Transwell侵袭实验观察迁移侵袭能力;流式细胞术和Hoechst 33258检测细胞凋亡;蛋白印迹法(Western blot)检测细胞蛋白水平的变化。结果 NTZ作用于骨肉瘤的潜在靶点共有78个;Gene Ontology(GO)富集分析涉及306个条目,京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)分析得到80个条目,涉及肿瘤通路、细胞周期信号通路、受体酪氨酸蛋白激酶(ErbB)信号通路等。实验结果表明,NTZ抑制骨肉瘤细胞增殖和迁移侵袭,诱导凋亡,细胞外调节蛋白激酶(ERK1/2)信号通路关键分子ERK1/2的磷酸化显著抑制。结论 NTZ对骨肉瘤的作用涉及多靶点、多过程,能调节ERK1/2信号通路,有效抑制骨肉瘤。     

Poncirin downregulates ATP‐binding cassette transporters to enhance cisplatin sensitivity in cisplatin‐resistant osteosarcoma cells

Poncirin, a flavanone glycoside with bitter taste extracted from dried immature fruit of Poncirus trifoliate, exhibits multiple biological activities including anti‐tumor activity. Our study aimed to determine the effect and potential mechanism of poncirin on cisplatin resistance in osteosarcoma (OS) cells. CCK‐8, flow cytometry analysis, and caspase‐3/7 activity assays were used to evaluate cisplatin sensitivity. The expression changes of multidrug resistance 1 (MDR1), multidrug resistance‐associated protein (MRP1), breast cancer resistance protein (BCRP), and phosphatidylinositol 3 kinase (PI3K)/protein kinase B (Akt) pathway‐related proteins were detected by RT‐qPCR or western blot analyses. Results showed that poncirin exposure enhanced cisplatin sensitivity, promoted apoptosis, and increased caspase‐3/7 activity in cisplatin‐resistant OS cells. Poncirin decreased the expression levels of MDR1, MRP1, and BCRP, and inhibited the PI3K/Akt signaling in OS cells. Rescue experiments suggested that activation of the PI3K/Akt signaling by 740Y‐P abolished poncirin‐induced expression reduction of MDR1, MRP1, and BCRP, and attenuated the facilitative effects of poncirin on cisplatin sensitivity and apoptosis in cisplatin‐resistant OS cells. In summary, poncirin suppressed cisplatin resistance in cisplatin‐resistant OS cells by downregulating the expression of MDR1, MRP1, and BCRP through inhibiting the PI3K/Akt pathway.     

姜黄素对人骨肉瘤MG63细胞凋亡的影响

目的探讨姜黄素诱导人骨肉瘤细胞株MG63凋亡的机制。方法不同浓度(0、25、50和75μM)姜黄素作用MG63细胞24 h后,CCK8法检测细胞体外增殖,TUNEL染色法检测细胞凋亡,Western blotting检测AKT/Bax-Bcl-2/Caspase 3等内源性凋亡途径相关蛋白表达水平。结果 CCK8实验结果显示在0~75μM范围内,50μM以上浓度的姜黄素能显著抑制MG63增殖,诱导细胞凋亡、p-AKT蛋白水平明显降低,而Bax蛋白及剪切的Caspase 3蛋白水平则显著增高。结论姜黄素通过影响AKT/BaxBcl-2/Caspase 3途径诱导MG63细胞凋亡。     

同病异证H22肝癌小鼠肿瘤组织细胞凋亡通路基因差异表达的特征

目的:观察昆明种H22肝癌小鼠邪毒壅盛证与气虚证肿瘤组织细胞凋亡通路基因表达特征,探讨中医同病异证发生的物质基础。方法:采用小鼠计量化辨证方法,筛选出瘤早期邪毒壅盛证与气虚证同病异证H22肝癌小鼠,采用Affymetrix GeneChip Mouse Exon 1.0 ST Array检测肿瘤组织细胞凋亡通路相关基因表达的特征。结果:依据KEGG数据库细胞凋亡通路,筛选出芯片数据中匹配的33个基因,发现(1)TNF-α和IL-1依赖的细胞凋亡信号通路总体上不利于邪毒壅盛证小鼠肿瘤细胞的凋亡;(2)IL-3依赖的细胞凋亡信号通路总体上反似有利于邪毒壅盛证小鼠肿瘤细胞凋亡;而(3)线粒体介导的细胞凋亡信号通路,邪毒壅盛证小鼠一致表达下调,提示不利于其细胞凋亡。结论:邪毒壅盛肝癌小鼠肿瘤细胞恶性增殖程度高,可能与线粒体介导的细胞凋亡信号通路系列相关基因表达轻度抑制有关。     

基于PI3K/AKT通路研究升降通癃方对前列腺增生细胞的影响

目的:研究升降通癃方通过调节磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/丝氧酸-苏氨酸蛋白激酶(AKT)信号通路对前列腺增生细胞增殖和凋亡的影响。方法:培养人前列腺增生细胞(BPH-1),随机分为对照组、升降通癃方低、中、高浓度组、阳性组五组,分别给予各组需要的药物处理24 h后,通过四唑盐比色法(CCK8法)检测药物对BPH-1细胞增殖的影响;用细胞划痕实验测定BPH-1的水平迁移能力;通过流式细胞术(FCM)检测升降通癃方对BPH-1细胞细胞凋亡的影响;通过蛋白质印迹法(Western blot)检测药物对细胞中半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase-3)、Bcl-2关联X蛋白(Bax)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、丝氧酸-苏氨酸蛋白激酶(AKT)、重组人α晶状体球蛋白B(Cryab)蛋白表达的影响。结果:加入升降通癃方后,BPH-1的迁移能力明显受到抑制,升降通癃方高、中、低浓度组比较差异有统计学意义(均P<0.05);FCM检测结果显示,升降通癃方组低、中、高浓度组的细胞凋亡率明显高于对照组,差异具有统计学意义(均P<0.05)。Weste...     

基于转录组测序技术探讨复方蛇龙胶囊治疗膜性肾病大鼠潜在机制

目的:应用高通量转录组测序(RNA-seq)技术检测膜性肾病大鼠肾组织基因表达变化,分析复方蛇龙胶囊可能的作用机制。方法:采用改良Border法建立膜性肾病大鼠模型,设置模型组和复方蛇龙胶囊高、中、低剂量组(1.5、0.75、0.375 g/kg),每天灌胃1次,连续干预8周。采用RNA-seq技术检测复方蛇龙胶囊干预前后的差异表达基因,通过基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、蛋白质相互作用(PPI)及关键基因分析,筛选关键基因以及关键通路。结果:与模型组相比,复方蛇龙胶囊低、中、高剂量组共筛选出差异表达基因685个,其中535个上调基因,150个下调基因。GO富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞膜结构,参与物质跨膜运输、细胞粘附与迁移,调控跨膜转运蛋白活性,KEGG富集分析显示差异表达基因主要富集在PI3K/Akt和MAPK信号通路。蛋白质相互作用网络筛选出Egfr、Fn1、Rac3、Frk、Cdh1、Agt、Hspg2、Itga8、Akt3和Fgfr2共10个关键基因,GO功能富集分析显示关键基因主要富集在细胞膜表面及间质,参与跨胞外基质组织及粘附过程,调控激酶活性,KEGG富集分析结果显示关键基因主要富集在PI3K/Akt信号通路。结论:调控肾足细胞自噬与凋亡可能是复方蛇龙胶囊作用的重要机制,与PI3K/Akt信号通路相关基因表达有关。     

槲皮素对人骨肉瘤细胞U-2OS/MTX300增殖和凋亡的影响及其机制研究

目的:研究槲皮素(quercetin,Qu)对骨肉瘤细胞系U-2OS/MTX300增殖和凋亡的作用及其机制。方法:MTT法观察细胞增殖活性;Annexin V/PI染色检测凋亡;线粒体膜电位及细胞色素C的Western blot检测线粒体凋亡途径;持续活化Akt瞬时转染、Western blot检测Akt通路相关蛋白表达水平变化。结果:槲皮素可明显抑制耐甲氨蝶呤骨肉瘤细胞U-2OS/MTX300生长,并呈时间和剂量依赖性;Annexin V/PI可明显检测到细胞凋亡;进一步发现其作用机制是通过下调线粒体膜电位,促进细胞色素C向胞浆释放及抑制Akt磷酸化来实现。结论:槲皮素可显著抑制耐甲氨蝶呤骨肉瘤细胞系U-2OS/MTX300细胞增殖并诱导其凋亡,其机制与线粒体凋亡途径及抑制Akt活性有关。     

胃癌发病关键基因调控网络构建及其靶向治疗中药活性成分筛选研究

目的 通过生物信息学方法分析与胃癌发病密切相关的基因调控网络,探讨其在胃癌预后中的价值,并进一步挖掘靶向治疗胃癌的中药活性成分。方法 通过GEO数据库获取GSE103236胃癌芯片数据,对芯片数据进行均一化处理,分析胃癌组织与正常胃组织的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）;应用Metascape数据库对DEGs进行基因本体论（genetic ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析;通过String数据库构建DEGs蛋白交互作用网络;采用Cytohubba筛选关键基因,分析关键基因表达程度与患者的预后及免疫细胞浸润的相关性;运用CTD数据库筛选能靶向作用于关键DEGs的中药活性成分。结果 共获得45 015个胃癌组织与正常组织的DEGs,其中显著性DEGs 176个。它们与细胞周期过程调控、丝裂原活化蛋白激酶（mitogen activated protein kinases,MAPK）级联调控等生物过程密切相关,集中于细胞外区域、细胞外泌体等细胞组分,主要参与胰岛素样生长因子结合、Wnt蛋白结合等细胞功能。KEGG分析发现显著性DEGs主要参与环磷酸酰胺（cyclic adenosine monophosphate,cAMP）信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（phosphatidylinositide 3-kinases/protein kinase B,PI3K/Akt）信号通路、癌症转录失调、p53信号级联等信号通路。筛选出TIMP1、SPP1、APOE、APOB、FGA、FGG、CYR61、IGFBP1、CHGB、SCG3 10个关键基因。这些基因表达异常均与免疫细胞的大范围浸润存在极高的相关性,其中TIMP1、IGFBP1、CYR61、FGG、APOE、APOB 6个关键基因的异常表达显著影响患者的生存率。进一步挖掘出桦木酸、长春新碱、丹参酮等30个可能靶向治疗胃癌的中药活性成分。结论 筛选出10个与胃癌发病密切相关的核心基因,并分析了这些核心基因与胃癌患者预后及免疫细胞浸润的相关性;挖掘出30个可能用于胃癌靶向治疗的中药活性成分;研究结果可为胃癌生物标志物的筛选、胃癌的防治及预后分析提供思路和参考。