辽宁省流行的人类免疫缺陷病毒1基因亚型调查

目的：了解辽宁省人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus-1,HIV-1)各亚型的流行情况,方法：采集1997年6月至2000年12月间辽宁省检出的16例HIV-1感染者的全血标本,提取核酸后用巢式－聚合酶链反应（nested-PCR)技术扩增HIV-1env基因区,用异源双链泳 动分析法（heteroduplex mobility assay,HMA进行HIV-1亚型的分析,结果：辽宁省目前已有HIV-1A、B'、C和E亚型流行。经性途径感染占全部HIV感染的31．25％,分别为泰国B（B'）亚型和A亚型,以B'为主;经注射吸毒感染占全部HIV感染31．25％,分别为C亚型和E亚型,以C亚型为主,其中1名吸毒者为B或E亚型;经输供血途径感染占全部HIV感染的31．25％,主要为泰国B'亚型,也可见C亚型,垂直传播1名为A亚型。结论：辽宁省已有多种亚型HIV-1毒株流行,有效地控制艾滋病经性乱,吸毒和输供血途径传播的问题已迫在眉睫。     

1131例宫颈糜烂流行病学因素分析

为了解已婚妇女宫颈糜烂的患病特点 ,自 2 0 0 2年 2～ 10月对湖南省永州市部分县区及厂矿年龄在 2 0～ 6 0岁的已婚妇女进行了宫颈糜烂流行病学调查分析。1.患病情况 :对 40 18名已婚妇女进行宫颈刮片细胞学检查 ,必要时作阴道镜检查及活体组织检查。诊断标准依据全国高等医药院校第 5版《妇产科学》教材[1] ,确诊为宫颈糜烂者 1131例 ,患病率为 2 8.15 %,其中轻度糜烂者 834例、中度糜烂者 2 49例、重度糜烂者为 48例 ,患病率分别为73 .74%、2 2 .0 2 %和 4.2 4%。2 .年龄分布 :年龄按 2 0～ 2 9岁、30～ 39岁、40～ 49岁、5 0～ 5 9岁分…     

异源双链泳动分析法在人类免疫缺陷病毒1基因亚型分析中的应用

目的 运用异源双链泳动分析法（HMA）进行人类免疫缺陷病毒1（human immunodeficiency virus-1,HIV-1)基因亚型分析。了解福建省HIV-1亚型的流行情况。方法 收集细胞培养中HIV-1感染的外周血单个核细胞（PBMC），聚合酶链反应（PCR）扩增HIV-1膜蛋白基因（env)区的核酸片段，与标准亚型的对照质粒的PCR产物进行杂交，形成异源双链二聚体，根据其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的泳动率确定其亚型，并进一步对标本进行序列测定和系统树分析，结果 15份标本中，80.00%为E亚型，6.67%为B亚型，2份不能确定其亚型，比较异源双链泳动法和序列测定法的结果，显示两种分析方法对HIV-1病毒基因分型有较高的一致性，其亚型一致率为86.67%。结论 福建省流行的HIV-1毒株以E亚型为主，亚型分析5法具有快速，简便，经济和高特异性的特点，可用作对HIV流行毒株进行长期监测的重要手段。     

福建省HIV-1病毒基因亚型分布的研究

目的 了解福建省HIV1各亚型的流行情况,帮助分析其传染来源和判断流行趋势.方法 采集福建省检出的13例HIV1感染者的外周血单核细胞(PBMCs),提取核酸后用套式聚合酶链反应技术进行扩增HIV1膜蛋白(env)基因C2V3区目的核酸片段,应用异源双链泳动分析法(HMA)进行HIV1亚型的分析.结果 13份标本PCR扩增均阳性,亚型分析结果表明福建省存在HIV1B亚型和E亚型.结论 HIV1B亚型和E亚型可能是福建省流行的主要亚型,主要经性途径由境外传入,且经性传播途径在人群中流行.异源双链泳动分析法可作为HIV1分子流行病学分析的筛选技术推广应用.     

广西HIV-1首次流行的分子流行病学分析

目的　广西自1996年4月起在静脉吸毒者和卖血者中发现HIV感染者,为了解其传染来源和判断其流行趋势,对广西流行的HIV进行分子流行病学分析。方法　选取HIV抗体阳性血清标本44份,分别采用多肽酶免疫法(PEIA)和经逆转录PCR扩增作cDNA序列分析,分别确定其HIV-1基因亚型并加以比较。结果　结果表明广西存在4种HIV-1M组基因亚型,即B’(泰国B亚型)、C、D、E亚型。在静脉吸毒人群和性混乱者中存在HIV-1E亚型流行和C亚型感染者;而在卖血者中发现HIV-1B’和D亚型感染。结论　HIV-1D亚型感染和E亚型流行已在国内出现,E亚型病毒已由东南亚传入流行并将在我国南部形成新的流行区域。提出血清学分型方法可作为HIV-1基因亚型分析的筛选技术推广应用。     

HIV-1基因亚型分型:异源双链泳动分析法

应用套式ＰＣＲ（ｎｅｓｔｅｄＰＣＲ）对２４份ＨＩＶ感染者外周血单核细胞（ＰＢＭＣ）样品进行扩增，从样品中获得了ＨＩＶ１膜蛋白（ｅｎｖ）基因的核酸片段，然后与已知各标准亚型的对照质粒的相同片段ＰＣＲ产物进行杂交，使样品ＤＮＡ与质粒ＤＮＡ同源部位配对形成异源双链体，根据其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的泳动率可确定其亚型。并将这种异源双链泳动分析法（ｈｅｔｅｒｏｄｕｐｌｅｘｍｏｂｉｌｉｔｙａｓａｙ，ＨＭＡ）的结果与ＤＮＡ序列测定结果比较。实验证明，ＨＭＡ是一种快速、简便、特异和可靠的ＨＩＶ亚型的分析方法     

辽宁省2008-2010年HIV-1基因亚型分布特征及流行病学分析

HIV-1毒株的感染力较强,是目前HIV流行的主要病毒株和重点研究对象[1].HW-1分为M(main)、O(outlier)和N(non-M-non-O)3个组.其中M组又分为A～K亚型.近年又证实了至少16种各种亚型的重组型CRF 01至CRF016.本研究对59例HIV-1感染者血浆样本进行基因扩增和序列分析并收集相关流行病学资料,结果报道如下. 1.材料与方法: (1)样本来源:选取2008-2011年经病毒载量检测,载量＞1000 copy/ml的59例样本进行HIV蛋白酶(PR)和反转录酶(RT)基因区的扩增和测序.     

福建省艾滋病感染的流行病学和病毒亚型 之间相互关系的研究

目的通过分子流行病学调查,明确福建省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)流行毒株亚型与艾滋病(AIDS)流行的关系.方法通过艾滋病监测网络发现全省HIV/AIDS病例,应用核苷酸序列分析技术确定HIV-1亚型,结合流行病学资料分析福建省AIDS的流行状况.结果截至2000年底,全省累计发现188例HIV感染者,其中AIDS59例(已死亡53例).经异性性接触感染占65.4%,经血途径感染占9.0%,境外感染占44.1%,其中在东南亚等国家感染约占83.1%,境内感染占39.9%.41例HIV/AIDS病例的HIV-1亚型分析表明福建省存在A、B、C和E4种亚型,E亚型占75.6%(31/41),均为经异性性接触途径感染;B亚型17.1%(7/41),主要经血途径感染.A和C亚型分别为1和2例.E亚型基因离散率为(12.245±3.894)%,B亚型基因离散率为(10.762±2.707)%.表明福建省E亚型流行株的来源复杂,与感染地点、时间有关.结论福建省AIDS流行速度正在加快,病毒感染者主要经异性性接触途径感染,HIV-1流行毒株主要为E亚型.     

湖北省采供血HIV-1感染者分子流行病学分析

目的分析湖北省经采供血感染人类免疫缺陷病毒（HIV-1）流行株的亚型特点和流行规律。方法2005年采集湖北省HIV-1感染者抗凝外周血22份,分离外周血单个核细胞（peripheral blood mononuclear cells,PBM-Cs）,提取前病毒DNA,用巢式PCR方法（nested polymerase chain reaction,nested-PCR）扩增HIV-1病毒gag至pol约3kb的核酸序列,并进行序列测定。应用BioEdit软件对序列排列、比对后,使用Clustal X系统进化树分析,确定亚型,并应用Simplot软件进行重组分析。结果通过巢式PCR扩增以序列测定得到17份样品的序列,根据gag-pol基因序列,与HIV-1亚型国际参考株比较,通过系统进行分析,确定湖北省的17个HIV-1毒株与邻近省份河南省的流行株B′亚型十分接近,均属于泰国B′亚型,并且未发现重组株的存在。结论湖北省经采供血感染的HIV-1流行株属于B′亚型,与河南省有偿献血员流行的HIV-1 B′亚型密切相关。     

高危人群HIV感染状况的流行病学分析

为了解高危环境人群的 HIV感染状况 ,于 1992～ 1995年对卖淫妇女 ( 55人 )、归国劳务人员 ( 159人 )、职业献血员 ( 88人 )、性病 ( STD)患者 ( 88人 )、HIV感染者的配偶 ( 3人 )和子女 ( 3人 )共计 396人进行了抗 - HIV检测和流行病学调查。抗 - HIV采用 Western blot法 ,阳性结果送山东省艾滋病检测中心复核确诊。4年共发现 6名 HIV感染者 ,其中男、女献血员各 1名 ,归国劳务人员 4名 (均为男性 ) ,其他人群未检出抗 - HIV阳性者。     

2020年浙江省衢州市新诊断HIV/AIDS病例HIV-1基因型及耐药分析

目的 探讨衢州市2020年新报告HIV/AIDS病例HIV-1毒株基因亚型分布和原发性耐药情况。方法 收集2020年衢州市新诊断且未经治疗的HIV/AIDS样本,采用In-house法扩增pol基因并测序,构建系统进化树分析基因亚型。通过CPR6.0在线软件分析耐药情况。结果 从新报告的63例HIV/AIDS样本中,成功获取50例合格序列,主要亚型为CRF01＿AE(42%,21/50)和CRF07＿BC(26%,13/50),其余亚型包括CRF08＿BC(6例),B亚型(6例),CRF55＿01B(4例)。原发性耐药率占12.0%(6/50),NNRTI类耐药发生率为8.0%(4/50),NRTI类耐药发生率为4.0%(2/50),PI类耐药发生率为2.0%(1/50)。与耐药相关的亚型有CRF55＿01B、B亚型和CRF01＿AE,CRF55＿01B亚型原发性耐药率最高,达75.0%(3/4),且位点均在NNRTI的M46L,B’和CRF01＿AE亚型原发性耐药率分别为16.7%(1/6)和9.5%(2/21)。结论 衢州市新报告HIV/AIDS病例HIV-1遗传基因多样化,原发性...     

上海市虹口区HIV-1感染者分子流行病学研究

【目的】分析上海市虹口区新确认未治疗人类免疫缺陷病毒（HIV）-1感染者的HIV-1亚型分布特征,为虹口区建立HIV-1亚型数据库,探索获得性免疫缺陷综合征（AIDS）精准防治策略提供基础数据和思路。【方法】虹口区2016年新确认的HIV-1感染者的血浆样品119份,对HIV-1 RNA pol区基因进行反转录和基因扩增,扩增后进行DNA测序,在Los Alamos2022 HIV-1基因数据库网站上使用HIVBLAST工具进行HIV-1亚型分析,并结合流行病学资料进行分析。【结果】119份样品中,共获得89例pol区基因片段,以CRF07＿BC(38.2%)、CRF01＿AE(36.0%)为主,B亚型占13.5%,并发现新型重组亚型CRF55＿01B和独特重组亚型URF＿0107各2例（2.3%）。【结论】2016年,虹口区HIV-1感染者HIV-1流行亚型以CRF07＿BC和CRF01＿AE为主,新的重组亚型CRF55＿01B和独特重组亚型URF＿0107已在虹口区出现,密切监视其流行趋势十分必要。     

上海口岸2001—2005年HIV-1病原体变异分子流行病学研究

〔目的〕了解上海口岸2001—2005年艾滋病病毒I型感染者（HIV-1）毒株基因亚型分布、变异情况及流行特征。〔方法〕收集2001—2005年上海口岸51份HIV抗体检测确认阳性的血样标本,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应进行体外扩增,获得核心蛋白（gag）和包膜蛋白（env）区基因的核酸片段,测定其序列和进行亚型分析。〔结果〕37份标本扩增阳性,共检出8个亚型,包括B亚型11份;CRF01-AE10份;CRF02-AG5份;A亚型4份;C亚型4份;G亚型、B’,和CRF07_BC亚型各1份。上海口岸毒株亚型分布于五大洲15个国家和地区,主要流行CRF01-AE和B亚型,从2004年开始出现其它亚型逐渐增多趋势。〔结论〕上海口岸流行的HIV-1毒株复杂多样,出入境人员是我国HIV毒株输入的主要渠道,流行毒株以性接触传播为主,AE重组毒株具有较强的传播优势。     

山东省HIV异源双链泳动分析法分型体系研究

[目的]克隆山东省流行的HIV-1优势亚型的代表毒株的包膜蛋白基因,建立用于山东省HIV-1分型的异源双链泳动分析体系。[方法]2003年11~12月将与山东省HIV-1 B′/C、B′和A/E各亚型共享序列最接近的毒株用套式聚合酶链反应(PCR)技术扩增包膜(env)基因,克隆到p GEM-Teasy载体中,构建成用于异源双链泳动分析(HMA)分型的山东标准亚型质粒,并摸索各反应和电泳的最佳条件。[结果]共建立HMA的分型标准质粒11株,建立以标准质粒为分型标准、包含3套可供选择的片段扩增策略的HMA体系,与序列分析比较各亚型代表株的检出率(敏感性)分别达到了B′94%、B/′C 90%、A/E 90%。[结论]建立的HMA分型体系经济、方便、易掌握、结果可靠,值得推广。     

河南省HIV-1 B/C亚型毒株的鉴定与分析

艾滋病病毒 (HIV)在我国的传播经历了传入期和播散期 ,自 1995年后进入快速增长期。 90年代初 ,我国一些地区出现了地下采血 (浆 )现象〔1〕,并于 1995年在部分市、县有偿献血员中发生HIV感染流行〔2〕。随着经济发展与人员往来的增加 ,将带来HIV - 1各亚型跨地区的交叉传播。不同的传播途径和传染来源形成了某些人群和地区的特异亚型分布。在河南省进行的流行病学调查表明 ,有偿献血员中HIV- 1流行株为B -Thai亚型〔3〕,而未见其它亚型报道。本文报告了在河南省发现的 1例HIV - 1B/C亚型感染者 ,并对其病毒基因特征进行了初步分析…     

未经抗病毒治疗的HIV感染孕产妇的毒株基因亚型和耐药分析

目的 了解云南、四川、广东、广西壮族自治区和新疆维吾尔自治区等五个地区人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染孕产妇体内毒株基因亚型及耐药情况.方法 选取2016年6月-2019年6月229例未接受抗逆转录病毒治疗(antiretroviral therapy treat...     

合肥市HIV/AIDS未治疗人群的耐药基因及亚型分析

目的了解合肥地区HIV/AIDS未治疗人群基因亚型和原发性耐药情况。方法应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 pol区聚合酶基因,经DNA测序后进行系统进化树分析和耐药性分析。结果收集79例合肥地区HIV/AIDS未治疗者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列65例,基因分型以CRF01-AE重组亚型最多39例（60.0%）;其次依次是CRF07-BC 21例（32.3%）、B亚型4例（6.2%）和CRF08-BC1例（1.5%）。1例蛋白酶抑制剂（PIs）主要耐药基因突变,2例反转录酶抑制剂（RTIs）耐药基因突变。总耐药突变率为4.6%（3/65）。结论当前合肥市主要的HIV-1流行亚型是CRF01-AE和CRF07-BC,HIV原发性耐药的发生率在国内处于较低水平。     

陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应（nested-PCR）扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件（Wisconsin公司）进行亚型分析。结果35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列。经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B’、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型。其中泰国B’亚型为主要流行株,占82.35%（28/34）,主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%（4/34）,主要来源于吸毒人群：CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员。该组样本B’亚型内的基因离散率为5.2%（n=23）;而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%（n=3）,彼此间显示出较近的传播关系。结论陕西省HIV-1流行株以泰国B’亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势。加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一。     

2014—2018年沈阳市HIV感染待确定样本检测结果分析

目的分析2014—2018年沈阳市各艾滋病筛查实验室上送的人类免疫缺陷病毒(HIV)抗体筛查阳性样本的确证检测情况,为艾滋病防治提供依据。方法按照《全国艾滋病检测技术规范(2009年修订版)》及《全国艾滋病检测技术规范(2015年修订版)》要求,对沈阳市HIV筛查实验室上送的5 090份样本进行免疫印迹确证试验。结果 5 090份HIV抗体筛查阳性样本中经确证试验4 194份(82.40%)为HIV-1抗体阳性,506份(9.94%)为HIV-1抗体阴性,390份(7.66%)为HIV-1抗体不确定。HIV抗体筛查阳性样本主要来源于疾病预防控制中心、医疗机构、采供血机构和妇幼保健机构,58.17%来源于医疗机构,36.46%来源于疾病预防控制中心。疾病预防控制中心送检样本阳性率最高(93.10%)。确证阳性的样本中男女性别比为14.82∶1。390例不确定样本中有125例进行了随访,确证为阳性101例(80.80%),阴性9例(7.20%),仍为不确定15例(12.00%)。结论艾滋病自愿咨询检测和医疗机构检测已成为发现HIV感染的主要方式,应进一步加强不确定病例的随访复查工作,做到早...     

北京市2006年HIV一1流行毒株的gag和env基因序列测定及亚型分析

目的监测2006年北京市北京户籍HIV感染者中HIV-1型流行病毒株的亚型分布特点和变化规律。方法采集北京市2006年新确认北京户籍HIV-1感染者的抗凝全血样品32份,分离血浆,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应方法扩增病毒gag和env基因,并进行序列测定和亚型分析。结果系统进化分析表明北京户籍HIV-1感染者样品分别属于5个亚型,分别为B亚型9份,泰国B亚型2份、C亚型2份,流行重组型CRF07 BC亚型5份,流行重组型CRF01．AE亚型4份。结论北京市居民中已存在多种HIV-1亚型和流行重组型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。