微管相关蛋白1轻链3β在胃癌组织的表达及其临床意义

目的基于单细胞测序技术解析微管相关蛋白1轻链3β(LC3B)在胃癌中的表达及其与患者预后的关系。方法选用3对胃癌及配对的癌旁组织样本行单细胞转录组测序(scRNA-seq)。CellTypist对过滤后的单细胞表达数据进行亚群分类, 使用Wilcoxon rank-sum对测序数据进行拟时序分析, 探究不同细胞簇中LC3B的差异表达。通过癌症基因组图谱(TCGA)及免疫组织化学技术(IHC)分析LC3B在胃癌组织中的表达。采用单因素和多因素Cox比例风险回归模型确定影响胃癌患者预后的独立因素。实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术分析胃癌细胞中LC3B的表达水平, 采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、克隆形成、Transwell检测LC3B表达改变后, 胃癌细胞增殖、迁移、侵袭能力的变化。两组间比较采用两独立样本t检验。结果 scRNA-seq分析结果显示, LC3B在胃癌组织中的表达量高于癌旁组织(2.001±2.706比1.010±1.634, t=44.094, P<0.01)且LC3B在内皮细胞、单核细胞中表达量高于其余细胞亚群(3.610±3.294, 3.21...     

赖氨酰氧化酶与血管内皮生长因子在胃癌中的表达及在浸润转移中的作用

目的 探讨赖氨酰氧化酶(LOX)与血管内皮生长因子(VEGF)在胃癌及癌旁组织中的表达,探讨其与胃癌发生的关系.方法 收集2009年9月至2013年1月手术切除的新鲜胃癌及相应的癌旁组织(距离胃癌组织5cm)各65例,采用Western blot方法检测组织中的LOX、VEGF蛋白在胃癌及癌旁组织中的表达,采用Spearman等级相关分析方法分析LOX与VEGF在胃癌中表达之间的相互关系.结果 LOX在65例胃癌组织中的相对表达量为0.4178±0.1135,在癌旁组织中的相对表达量为0.2174 ±0.1524,胃癌组织中的LOX表达水平明显高于癌旁组,差异有统计学意义(P＜0.05);VEGF在65例胃癌组织中0.4793 ±0.1019,在癌旁组织中的相对表达量为0.2116±0.1146,胃癌组中的VEGF表达水平明显高于癌旁组,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 在胃癌组织,LOX与VEGF的表达水平明显高于癌旁组织.LOX与VEGF在胃癌的发生及发展中发挥重要作用.     

颗粒酶B在胃癌组织的表达及其临床意义

目的基于对研究组早期测序数据的分析, 通过免疫组织化学和苏木精-伊红(HE)染色观察颗粒酶B(GrB)在胃癌组织中的表达。探讨GrB的表达与免疫标志物的相关性。方法分析2013年1月至2017年12月在机构评审委员会批准的浙江省肿瘤医院确诊的153例胃癌患者的临床和病理资料。使用SPSS 22.0(IBM)和GraphPad Prism 9进行统计和数据分析。生存资料的分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。采用免疫组织化学和HE染色方法, 检测GrB在胃癌患者肿瘤组织和配对癌旁组织中的表达, 并进一步分析GC患者肿瘤组织中GrB表达水平与CD3、CD4、CD8的相关性。结果 153例患者中, 男108例, 女45例。诊断时的中位年龄为61岁(范围:28～86岁)。胃肿瘤以腺癌为主。Kaplan-Meier生存曲线显示, 5年生存率为46.1%。此外, 胃癌患者肿瘤组织中GrB高表达的5年生存率分别为51.7%和35.9%。胃癌患者癌旁组织中GrB高表达和低表达率分别为41.4%和49.0%。与癌旁组织比较, 肿瘤组织中GrB的表达明显增加, 差异有统计学意义(χ2=...     

基于单细胞组学预测肝内胆管癌根治性切除患者预后的研究

目的基于单细胞组学分析肝内胆管癌(ICC)根治性切除术后患者的生存获益。方法本研究为回顾性病例系列研究。整合基因表达综合数据库中4个数据集的ICC单细胞测序结果, 共获得46例患者根治性切除样本, 探索ICC微环境的特征。同时分析附有生存数据的EMBI数据库共100例ICC组织芯片数据, 通过ssGSEA算法计算芯片数据每个样本中各个上皮细胞亚群的浸润丰度, 探索与患者较差预后相关的关键上皮细胞亚群, 并研究该亚群关键标志(marker)基因的临床价值。通过单因素与多因素 Cox 比例风险模型筛选预后相关marker基因, 使用目标基因构建 Cox比例风险模型并绘制列线图, 使用Kaplan-Meier 生存分析验证评分与患者预后的关系, 通过受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线及决策曲线(DCA)对模型预测效能进行评估。结果上皮细胞亚群几乎仅在肿瘤组织中浸润。表达MT2A的上皮细胞亚群与患者更差的预后相关且浸润丰度很高, 以该亚群浸润为特征的患者被定义为抗氧化型。经单因素与多因素Cox比例风险模型筛选该亚群的marker基因, 其中filp1l、nakbia、peg10、serpi...     

microRNA-21在不同分期胃癌中的表达及意义

目的测定micro RNA-21(mi RNA-21)在不同分期胃癌中的表达量并探讨其临床价值。方法采用实时定量PCR技术,检测2015年1月至2016年1月期间于上海交通大学医学院附属新华医院及崇明分院普外科行手术治疗且经病理证实的50例胃癌患者的癌组织、癌旁正常胃组织和血清以及50例非胃癌患者血清中mi RNA-21的相对表达量。结果胃癌组织中mi RNA-21的相对表达量明显高于癌旁正常胃组织(P0.05),且其在TNM分期为Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期的胃癌患者癌组织中的相对表达量分别为2.17(1.48~2.90)、4.08(2.30~4.86)、8.64(5.82~18.20),3期间的相对表达量比较差异有统计学意义(P0.05)。胃癌患者血清中mi RNA-21的相对表达量明显高于非胃癌患者血清中的相对表达量(P0.05),其在Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期的胃癌患者血清中的相对表达量分别为31.00(24.60~37.15)、39.10(28.90~39.80)、44.15(38.95~56.68),3期间的相对表达量比较差异有统计学意义(P0.05)。胃癌患者血清和胃癌组织中mi RNA-21的相对表达量呈正相关(r=0.86,P0.05)。结论胃癌患者的血清和胃癌组织中mi RNA-21高表达与其TNM分期有着潜在的联系,其可能成为术前预测胃癌TNM分期的潜在指标。     

MsrA在胃癌组织中的表达及意义

目的：探讨MsrA在胃癌组织及癌旁正常胃黏膜组织中的表达及意义。 方法：采用免疫组织化学法和实时荧光定量RT-PCR法检测57例胃癌组织与癌旁正常胃黏膜组织中MsrA的表达。 结果：胃癌组织中MsrA的表达率及表达强度均低于癌旁正常胃黏膜组织（P<0.001）;胃癌组织MsrA mRNA相对量的中位数为3.757,癌旁正常胃黏膜组织中MsrA mRNA相对量的中位数为5.240,胃癌组织中MsrA mRNA的表达水平低于癌旁正常胃黏膜组织（P=0.016）。 结论：胃癌组织中MsrA的表达水平较正常组织下调。

     

基于TCGA数据库分析SCAMP3在肝细胞癌的表达及预后情况

目的分析载体膜蛋白3(SCAMP3)在肝细胞癌中的表达和对预后的影响以及基因集富集分析。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析SCAMP3表达和预后。收集2021年1月期间丽水市中心医院4例肝细胞癌患者的癌组织及癌旁组织检测SCAMP3的表达。基于TCGA数据, 单因素和多因素Cox回归分析SCAMP3表示与肝细胞癌患者预后关系。利用基因集富集分析探索SCAMP3的生物学作用。结果 TCGA数据库中, 肝细胞癌组织中SCAMP3表达高于正常肝组织, 差异有统计学意义(Z=-8.38, P<0.001)。基于SCAMP3表达的中位数将患者分为低表达组(n=185)和高表达组(n=185), SCAMP3高表达患者总体生存率更低。手术切除的4例肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织, 癌组织中SCAMP3 mRNA、蛋白相对表达均高于癌旁组织, 差异均有统计学意义(t=8.55、6.24, 均P<0.001)。多因素Cox回归分析, SCAMP3表达越高, 死亡风险越高(HR=1.466, 95%CI:1.143～1.881, P<0.001)。基因集富集分析在SCAMP3高...     

胃癌上皮-间充质转化过程中微小RNA-579-3p/含锌指和BTB域4通路的作用及其机制

目的探讨微小RNA-579-3p(miR-579-3p)/含锌指和BTB域4(ZBTB4)通路在胃癌上皮-间充质转化(EMT)中的作用机制。方法生物信息学筛选胃癌与癌旁组织差异表达的微小RNA(miRNA);实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测50例患者胃癌和癌旁癌旁组织中miR-579-3p、ZBTB4表达;检测胃上皮细胞株GES-1和胃癌细胞株HGC27、AGS、MKN45中miR-579-3p的表达, 分析miR-579-3p与临床病理特征的关系。生物信息学分析miR-579-3p靶基因。双荧光素酶报告基因验证miR-579-3p与ZBTB4的调控关系。应用miR-579-3p抑制物(inhibitor)干扰HGC27细胞株miR-579-3p表达, 细胞计数试剂盒(CCK-8)法、划痕实验、Transwell小室实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力;RT-qPCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测mRNA和蛋白表达水平。采用t检验、χ2检验分析数据。结果生物信息学筛选后RT-qPCR检测结果发现miR-579-3p在胃癌组织中表达显著高于癌旁组织(3.259...     

驱动蛋白超家族23和八聚体结合转录因子4在胃癌组织的表达及其临床意义

目的探讨驱动蛋白超家族23(KIF23)以及八聚体结合转录因子4(OCT4)在胃癌组织的表达, 及其与临床病理因素之间的关系。方法选取2018年11月至2022年11月大庆龙南医院(齐齐哈尔医学院第五附属医院)和吉林大学第一医院病理归档资料完整的101例胃癌组织标本和对应癌旁组织标本, 应用免疫组织化学方法检测上述组织中KIF23和OCT4表达水平, 结合临床资料采用χ2检验分析KIF23和OCT4与胃癌临床病理特征之间的关系。结果 KIF23在胃癌组织表达率为77.23%(78/101), 明显高于对应癌旁组织KIF2表达率[11.88%(12/101)], 两者比较差异有统计学意义(χ2=91.283, P<0.01)。KIF23表达水平与胃癌TNM分期(TNM stage, tumor node metastasis stage)、组织学分化程度、淋巴结转移明显相关(χ2=5.602、0.060、6.550, P<0.05), KIF23表达水平与胃癌年龄、性别无相关(χ2=0.004、0.120, P>0.05)。OCT4在胃癌组织表达率为69.31%(70/...     

LncRNA RP5-919F19在胃癌组织中的表达及其与胃癌侵袭转移的相关性

目的研究长非编码RNA(long non-coding RNA, Lnc RNA)RP5-919F19在胃癌组织中的表达及与胃癌侵袭转移的相关性。方法收集临沂市中心医院2020年1月到2022年1月手术取下的非肿瘤胃黏膜(距癌组织3 cm以上)和胃腺癌组织。应用TRIzol试剂盒提取细胞和组织总RNA, 应用反转录试剂盒将RNA反转录为cDNA, 应用实时定量PCR试剂盒进行定量分析。应用SGC-7901和AGS人胃癌细胞, 构建RP5-919F19敲减和过表达模型, 应用CCK-8实验确认细胞增殖能力, 应用Transwell侵袭实验确认胃癌细胞的侵袭能力。结果对79例胃癌组织和癌旁正常组织中RP5-919F19表达检测, 发现RP5-919F19在胃癌组织中的相对表达量为1.51±0.05, 明显高于癌旁正常组织的0.82±0.04(P<0.05)。对不同病理情况患者的RP5-919F19水平进行对比分析, 分析结果显示患者不同TNM分期、是否出现远处转移、淋巴结转移和不同浸润深度患者的RP5-919F19表达差异存在统计学意义(P<0.05), 不同肿瘤大小、年龄和性...     

FAT4表达水平与胃癌临床病理因素和远期生存率相关性分析

目的观察FAT4在胃癌中的表达水平,以及其与胃癌病理因素和远期生存率的关系。方法胃癌手术病人的新鲜组织标本30例,采用qRT-PCR和Western blotting检测胃癌组织及其配对癌旁组织FAT4表达水平和蛋白含量;收治满5年的胃癌手术病人的石蜡包埋组织样本160例,采用免疫组化检测胃癌标本FAT4表达,以及与胃癌临床因素和5年生存率的相关性。结果30例新鲜胃癌组织中FAT4 mRNA表达下调,胃癌组织中FAT4 mRNA表达水平低于癌旁组织(P0.05),胃癌组织中FAT4 mRNA蛋白含量低于癌旁组织(P0.05)。160例胃癌组织免疫细化检测FAT4的表达下调,其中FAT4表达阴性122例(76.25%),FAT4的阴性表达与肿瘤的大小、分化程度、TNM分期、肝转移无关(P0.05),与淋巴转移和远期生存率有关(P0.05),FAT4阴性表达病人5年总体生存率差(P0.05)。结论 FAT4在胃癌组织中呈低表达,其低表达与淋巴转移和不良预后密切相关。     

成髓细胞瘤转录因子第2亚型和甲状腺激素受体相互作用蛋白6在胃癌组织的表达及其临床意义

目的探讨成髓细胞瘤转录因子第2亚型(MYBL2)和甲状腺激素受体相互作用蛋白6(TRIP6)的表达与胃癌临床病理因素和预后之间的关系。方法选取大庆市龙南医院(齐齐哈尔医学院第五附属医院)和广东医科大学附属医院2018年11月至2022年11月病理资料完整的105例胃癌组织标本和对应癌旁组织标本, 应用免疫组织化学方法检测上述胃癌组织和对应癌旁组织中MYBL2和TRIP6表达水平, 采用χ2检验进行相关分析。结果胃癌组织中MYBL2表达率明显高于对应癌旁组织中MYBL2表达率[74.29%(78/105)比32.38%(34/105)], 差异有统计学意义(χ2=37.041, P<0.01)。MYBL2表达水平与胃癌患者TNM分期、淋巴结转移明显相关(χ2=6.881、5.735, P<0.05), MYBL2表达水平与胃癌患者年龄、组织学分化程度、性别无明显相关(χ2= 0.008、0.037、0.059, P>0.05)。胃癌组织中TRIP6表达率明显高于对应癌旁组织中TRIP6表达率[66.67%(70/105)比27.62%(29/105)], 差异有统计学意...     

Wnt7a蛋白在胃癌组织中的表达及其与预后的关系

目的:Wnt7a在胃癌组织中的表达及其与胃癌患者临床病理因素及预后的关系。方法:收集胃癌切除术组织样本135例,用Western blot和免疫组化染色检测Wnt7a蛋白在胃癌组织及癌旁组织中的表达。分析Wnt7a表达与胃癌患者临床病理因素以及与胃癌患者无瘤生存率及总生存率的关系。结果:Wnt7a在胃癌组织中的表达量高于癌旁组织,其在胃癌组织中的高表达率也明显高于癌旁组织(χ~2=30.5,P=0.000)。Wnt7a蛋白表达与患者性别、年龄、HP感染、分化程度和Lauren分型无关(P0.05),而与TNM分期、远处和淋巴结转移有关(P0.05)。Wnt7a高表达胃癌患者1、5年无瘤生存率及总生存率均明显低于Wnt7a低表达胃癌患者(均P0.01)。Wnt7a高表达(P=0.01)与远处转移(P=0.02)及为影响胃癌患者无瘤生存率的独立危险因素,而Wnt7a高表达(P=0.02)与TNM分期(P=0.03)、远处转移(P0.01)为影响胃癌患者总生存率的独立危险因素。结论:Wnt7a蛋白在胃癌组织中高表达,且与患者恶性病理特征显著相关。Wnt7a蛋白表达可作为胃癌患者术后生存预后评估的指标之一。     

沉默维甲酸诱导蛋白14蛋白在胃癌组织芯片中的表达及其临床意义

目的探讨沉默维甲酸诱导蛋白14(RAI14)在胃癌组织的表达及临床意义。方法选择带有随访信息的胃癌组织芯片(HStmA180Su18), 采用用免疫组织化学二步法检测癌组织和癌旁组织中RAI14的表达水平, 用SPSS 21.0软件分析RAI14表达水平与临床病理特征及癌预后关系进行统计学分析。结果 RAI14主要在胞质中表达, 癌组织中RAI14表达量显著高于癌旁组织(9.59±2.78比3.03±1.54, P<0.01);RAI14表达水平与病理分化程度(rs=0.280, P<0.01)、肿瘤浸润深度(rs=0.353, P<0.01)、淋巴结转移(rs=0.514, P<0.01)、临床分期(rs=0.496, P<0.01)正相关。Kaplan-Meier生存率分析显示胃癌患者总生存率与RAI14表达负相关(χ2=55.984, df=2, P<0.01)。多因素COX回归分析显示RAI14高表达[比值比(OR)=1.223, 95%可信区间(CI):1.124～1.361, P<0.01]和临床分期(OR=3.118, 95%CI...     

miR-155和miR-30a在胃癌组织中的表达及临床意义

目的 探讨胃癌组织和癌旁组织miR-155和miR-30a的表达差异及其临床意义.方法 收集手术切除的胃癌标本52例,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应( RT-qPCR)检测癌及癌旁组织标本miR-155和miR-30a的表达水平,分析其与临床病理的关系.结果 miR-155在胃癌组织中表达量(0.84 ±2.27)显著高于其在配对癌旁组织中的表达值(0.28 ±0.56,P＜0.05);miR-155高表达与淋巴结转移有关(P＜0.05).miR-30a在胃癌组织中表达量(3.16±8.11)显著低于其在配对癌旁组织中的表达值(15.87±35.58,P＜0.05).miR-30a的低表达与肿瘤侵犯层次、淋巴结转移有关(P＜0.05).结论 miR-155和miR-30a与胃癌发生发展密切相关,可能成为胃癌的潜在诊断及治疗靶点.     

肾透明细胞癌组织浸润CD8＋T细胞中异质性胞核核糖核蛋白A2B1的表达及其临床意义

目的探讨异质性胞核核糖核蛋白A2B1(HNRNPA2B1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织浸润CD8+T细胞中表达分布特征及其临床意义。方法利用基因表达综合数据库(GEO)公共数据分析HNRNPA2B1在ccRCC组织浸润免疫细胞以及CD8+T细胞亚群中的表达分布;转录组测序技术(RNA-seq)差异分析高、低表达HNRNPA2B1 ccRCC患者高变免疫基因并富集相关通路。多标记免疫荧光染色(mIHC)检测223例ccRCC患者癌组织和癌旁正常组织浸润CD8+T细胞中HNRNPA2B1的表达分布特征, 采用R语言做统计分析, 经单因素Cox、最优子集回归和LASSO回归交叉验证筛选临床因素并纳入多因素Cox回归构建列线图预测模型。Wilcoxon检验用于组间差异显著性分析, 生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果 HNRNPA2B1在CD8+T细胞上高表达并参与抗原加工呈递、T细胞增殖调节等多个信号通路。肾透明细胞癌患者肿瘤组织浸润HNRNPA2B1+CD8+T细胞比率高于癌旁正常组织[1.26%(0%, 35.56%)比0.28%(0%, 13.35%)...     

垂体瘤转化基因在肾透明细胞癌中的表达及意义

目的探讨垂体瘤转化基因(PTTG)在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义。方法选取2019年1月至2020年12月在本院诊断为肾透明细胞癌的69例患者为研究对象。对患者手术标本的组织切片进行PTTG染色, 并收集患者的临床资料。根据PTTG在肿瘤组织中是否表达, 将患者分为PTTG阳性组(43例)和PTTG阴性组(26例)。通过GEPIA对癌症基因图谱(TCGA)数据库中肾透明细胞癌的基因表达数据进行分析, 包括PTTG在癌和癌旁组织、不同分期肿瘤中的表达水平, 并进行生存分析。结果 69例肿瘤组织中, 有43例组织的PTTG表达为阳性, 阳性率为62.32%, 26例PTTG表达阴性, 阴性率为37.68%。而69例癌旁组织中, 仅11例组织可见PTTG阳性表达, 阳性率为15.94%。肾透明细胞癌组织中的PTTG表达阳性率显著高于癌旁组织(χ2=29.294, P<0.001)。PTTG阳性组中的Fuhrman 3～4级(χ2=7.057, P=0.008)、TNM Ⅲ～Ⅳ期(χ2=8.918, P=0.003)和肿瘤长径>4 cm(χ2=3.907, P=0.048)的比...     

miR-490-3p在胃癌中的表达及其临床价值

目的 探讨miR-490-3p表达水平与胃癌临床病理特征和预后的关系。方法 通过实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测80例胃癌患者的癌组织与癌旁正常组织中miR-490-3p的相对表达量,分析其与临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier曲线、Cox比例风险回归模型进行预后分析。结果 miR-490-3p在癌组织中的相对表达量为(0.652±0.072),低于癌旁正常组织中的(1.259±0.069),差异有统计学意义(t=40.528,P<0.05);miR-490-3p表达与浸润深度、淋巴结转移及TMN分期显著相关(P<0.05);miR-490-3p低表达和高表达患者无进展生存期差异有统计学意义(23个月vs 30个月,χ²=8.583,P=0.03);miR-490-3p、淋巴结转移及TNM分期是胃癌预后的独立影响因素(HR=2.396、0.472、0.230,均P<0.05)。结论 mi R-490-3p表达降低可促进胃癌的增殖、分化和迁移,可成为胃癌诊断和预后的潜在分子标志物。     

FAT4在三阴性乳腺癌组织中的表达及其临床意义

背景与目的:三阴性乳腺癌(TNBC)因为缺乏有效的治疗靶点,临床治疗措施有限,预后极差。本研究旨在探讨脂肪非典型钙黏蛋白4(FAT4)在TNBC组织中的表达及其临床意义,以期为该病的治疗提供新的策略。方法:采用qRT-PCR和Western blot法检测10例TNBC患者新鲜癌组织及对应癌旁组织标本中FAT4 mRNA及蛋白质的表达;免疫组化法检测60例TNBC患者癌组织与癌旁组织石蜡标本中FAT4的表达,分析FAT4的表达水平与TNBC患者临床病理特征及预后的关系。结果:10例新鲜标本中,TNBC组织中FAT4 mRNA及蛋白的相对表达量均较癌旁组织明显降低(均P0.05),以癌旁组织为参考,TNBC组织中FAT4 mRNA相对表达量为0.482±0.092,蛋白相对表达量为0.437±0.082。60例石蜡标本分中,FAT4在TNBC组织中的阳性率明显低于癌旁组织(23.33% vs.71.67%,χ~2=28.104,P0.001);FAT4的表达与淋巴结状态(P=0.034)、肿瘤大小(P=0.001)、TNM分期(P=0.028)、组织学分级(P=0.023)和Ki-67指数(P=0.031)明显有关,而与年龄(P=0.744)和月经状态(P=0.933)无关;FAT4阳性表达患者的无病生存期(DFS)明显长于FAT4阴性表达患者(42.0个月vs.34.6个月,P=0.037);多因素Cox风险比例模型分析显示,FAT4高表达是TNBC患者DFS的独立保护因素(HR=0.52,95% CI=0.29～0.98,P=0.041)。结论:FAT4在TNBC组织中呈低表达,FAT4的低表达与TNBC患者的恶性生物学特征及不良预后密切相关。