PCR／SSCP技术在检测HLA基因点突变中的应用

聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ／ＳＳＣＰ）是根据核苷酸序列不同的单链ＤＮＡ，可形成不同构象，从而在不含变性剂的聚丙烯酰胺凝胶中泳动速度不同的原理，分离鉴定等长ＤＮＡ单链的方法，本文应用ＰＣＲ／ＳＳＣＰ方法检测了６０例无亲属关系个体白细胞抗原Ⅱ类基因（ＨＬＡ－ＤＱＡ１）５－上游调控区的等位基因多态性，并以ＰＣＲ直接测序证明每种ＳＳＣＰ带型都与不同位置单个碱基取代相关联。     

中国湖北汉族重症肌无力与HLA-Ⅱ类等位基因的关联

目的和方法：探讨中国湖北汉族重症肌无力（ＭＧ）患者与ＨＬＡ－Ⅱ类等位基因的关联。利用ＰＣＲ／ＳＳＰ和ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术对湖北地区９１例ＭＧ患者进行ＨＬＡ－Ⅱ类（ＨＬＡ－ＤＲＢ１、ＤＱＢ１和ＤＰＢ１）基因型别分析,民１６８例正常个体比较。结果：患者组（１）：ＨＬＡ－ＤＲＢ１＊０９０１、ＤＱＢ１＊０３０３和ＤＰＢ１＊０５０１等位基因频率明显高于对照组,ＲＲ值分别为４．１２、３．０４和３．０１,Ｐ〈０     

上海地区多发性硬化症与HLAⅡ类基因和抗原处理相？…

探讨上海人群中ＨＬＡⅡ类基因和抗原处理相关基因与多发性硬化症的相关性。方法,用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ和ＰＣＲ－ＳＳＯ技术对２１名上海地区无血缘关系的ＭＳ患者和８９名正常人作ＨＬＡⅡ类（ＨＬＡ－ＤＲＢ１,－ＤＱＡ１和－ＤＱＢ１）和抗原处理相关基因（ＴＡＰ１,ＴＡＰ２和ＬＭＰ２）分型。结果患者组ＤＲＢ１＊０４０５、Ｔ 克＊０５０２（Ｐ＝０．００２５）等位基因ＤＲＢ１＊０４０５－ＤＱＡ１＊０３０１－ＤＱＢ１＊     

HLA—DR,DQ基因多态性与系统性红斑狼疮相关性的研究

应用聚合酶链反应结合顺序特异的寡核苷酸探针杂交（ＰＣＲ／ＳＳＯＰＨ）方法对江苏籍汉族ＳＬＥ患者和健康对照组ＨＬＡ－ＤＲＢ１、ＤＱＡ１：ＤＱＢ１基因作寡核苷酸分型。结果发现患者组中ＤＲＢ１＊１５０１、ＤＱＡ１＊０１０２等位基因频率及ＨＬＡ－ＤＲＢ１＊１５０１、－ＤＱＡ１＊０１０２、－ＤＱＢ１＊０６０２单倍型频率均明显高于正常对照组；相反，ＤＲＢ１＊０４（ＤＲ４）、ＤＱＡ１＊０６０１频率则明显低于正常对照组。所有ＤＱＢ１等位基因频率在两组间无显著差异，而ＤＱＡ１＊０１０２仅存在于ＤＲ２阳性的个体之中，推测汉族ＳＬＥ的易感基因可能靠近ＤＲ位点，且与单倍型ＨＬＡ－ＤＲＢ１＊１５０１、－ＤＱＡ１＊０１０２、－ＤＱＢ１＊０６０２紧密连锁，该单倍型可作为汉族ＳＬＥ易感的遗传标记。相反ＤＲ４，ＤＱＡ１＊０６０１则对ＳＬＥ发病可能有一定的保护性。     

PCR/SSP结合PCR/SSCP分析湖南汉族HLA-DQA1等位基因多态性

为准确阐明湖南汉族群体ＨＬＡ－ＤＱＡ１遗传多态性,采用ＰＣＲ／ＳＳＰ方法,并联合应用可同时区分ＨＬＡ－ＤＱＡ１＊０１０１～０６０１等位基因的银染ＰＣＲ／ＳＳＣＰ技术对６０例随机选择的湖南汉族健康者作ＨＬＡ－ＤＱＡ１等位基因分型。结果表明,湖南汉族存在...     

大鼠β-防御素rBD-1基因在皮肤和肾脏固有表达

设计大鼠β－防御素ｒＢＤ－１ｃＤＮＡ序列一对特异引物：Ｒ１５′→３′ＡＣＴＣＴＧＧＡＣＣＣＴＧＡＣＴＴＴＣＡＣＣＧ;Ｒ２５′→３′ＣＣＣＴＴＧＣＴＴＧＴＣＣＴＴＴＡＴＧＴＣＣ。根据大鼠β－ａｃｔｉｎｃＤＮＡ序列设计一对阳性对照特异引物：Ｂ１５′→３′ＡＧＣＴＧＡＧＡＧＧＧＡＡＡＴＣＧＴＧＣＧ;Ｂ２５′→３′ＧＴＧＣＣＡＣＣＡＧＡＣＡＧＣＡＣＴＧＴＧ。引物由Ｇｉｂｃｏ公司合成。从Ｗｉｓｔａｒ大鼠皮肤、肾脏、气管、子宫颈、膀胱、小肠、脾脏、骨骼肌、骨髓及腮腺组织中提取总ＲＮＡ,行ＲＴ－ＰＣＲ扩增…     

用于研究DLA－DRB1基因分型的寡核苷酸引物对的选择

我们用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法研究ＤＬＡⅡ类基因。为寻找合适的引物，用四对不同的引物：ＤＬＡ－ＤＲ－ＳＰ／Ｓｔｏｐ，ＤＬＡ－ＤＲ－ＳＰ／Ｐ３，ＨＬＡ－ＤＲＢ－ＧＨ４６／５０及ＨＤＡ－ＤＲＢ－ＡＭＰ－Ａ／Ｂ进行了一系列扩增。只有引物对ＨＬＡ－ＤＲＢ－ＡＭＰ－Ａ／Ｂ获得了满意的结果。其类似核苷酸序列在ＤＬＡ－ＤＲＢｃＤＮＡ的核苷酸序列内被发现，特异性也为Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ杂交分析所证实。内切酶ＨａｅⅢ和ＨｉｎｆⅠ酶解后显示出ＤＬＡ－ＤⅡ类基因高度的多态性和等位基因特异的多态性带型。揭示该引物对是目前用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法研究ＤＬＡ－ＤＲＢ１基因较理想的、实用的引物。     

I型糖尿病患者的HLA—DR—DQ基因单体型分析

应用ＨＬＡ－ＤＲＢ，ＤＱＢ１序列特异性引物ＰＣＲ扩增方法，鉴定８１例ＩＤＤＭ患者，７个家系和８４例正常对照汉族人群的ＤＲＢ基因多态性及ＩＤＤＭ的ＨＬＡ－ＤＲ－ＤＱ基因单体型。结果表明：（１）ＩＤＤＭ患者ＤＲＢ１＊０３，ＤＲＢ１＊０９等位基因频率明显高于对照组，其频率分别为８．６４％ｖ．ｓ３．０％和２８．４％ｖ．ｓ１６．１（Ｐ〈０．０５）。（２）患者中ＤＲＢ１－ＤＲＢ３／ＤＲＢ１－ＤＲＢ４基因型频率     

原发性IgA肾炎与HLA-DQB1等位基因遗传多态性的研究

应用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法对５１例经肾穿刺证实ＩｇＡ肾病虱和９６名健康对照人员进行了ＨＬＡ－ＤＱＢ１等位基因分型。结果显示ＩｇＡＮ患者组中ＤＱＢ１＾＊０３０２基因频率明显高于正常对照组；ＩｇＡＮ患者组中ＤＲ４，ＤＱＢ１＾０３０３均为阳性的表型频率也明显高于对照组，而ＤＲ４阳性，ＤＱＢ１＾０３０２阴性的表型频率在两组中无差异。     

中国广东汉族群体HLAⅡ类基因多态性的研究

为探讨中国广东汉族群体ＨＬＡⅡ类基因多态性，采用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法，随机选择１０２名广东籍汉族人进行了ＨＬＡⅡ类基因的ＤＮＡ分型。测定了包括ＨＬＡ－ＤＲＢ１，ＤＲＢ３，ＤＲＢ５，ＤＱＡ１，ＤＱＢ１和ＤＰＢ１等６个基因座位的等位基因。结果：共检出２３种ＤＲＢ１，３种ＤＲＢ３，４种ＤＲＢ５，８种ＤＱＡ１，１２种ＤＱＢ１和１２种ＤＰＢ１基因。该人群的ＨＬＡⅡ类等位基因多态性的典型性表现在ＨＬＡ－ＤＲＢ＊１２０２的不寻常优势和ＤＲＢ１＊０２单倍型的结构的高度复杂性。还发现了很高频率的一个近年才被正式命名的ＤＰ新型：ＨＬＡ－ＤＰＢ１＊２１０１，并且此型具有极不寻常的ＤＲＢ１＊１２０２－ＤＰＢ１＊２１０１的连锁不平衡。为分子流行病学研究提供了资料。     

北方汉族HLA-DRB1、DQB1基因多态性的研究

目的从基因水平了解北方汉族ＨＬＡ－ＤＲＢ１、ＤＱＢ１多态性分布,获得更完整、更准确的遗传学数据。方法应用ＰＣＲ－ＳＳＰ方法对１０７名北方汉族健康人进行了ＨＬＡ－ＤＲＢ１、ＤＱＢ１等位基因分型。结果鉴定了１４个ＤＲＢ１等位基因,９个ＤＱＢ１等位基因,包括了ＤＲ、ＤＱ位点的全部血清学特异性。结论提供了一套比较完整准确的ＤＲＢ１、ＤＱＢ１等位基因的基因频率和连锁不平衡参数。对群体遗传和疾病关联的研究具有重要的意义。     

抗磷脂抗体阳性SLE患者HLA DRB1、DQA1、DQB1基因单倍型研究

本文采用ＰＣＲ ＲＦＬＰ技术对抗磷脂抗体阳性（ＡＰＡ＋）ＳＬＥ患者ＨＬＡ ＤＲＢ１、ＤＱＡ１ 和ＤＱＢ１ 基因进行分型研究, 同时以上海地区汉族随机人群作对照, 发现这类病人的ＤＲＢ１＊ ０８０３ ＤＱＡ１＊ ０１０３ ＤＱＢ１ ＊０６０１ 单倍型频率显著增高（ Ｐ＜ ０－０１） 相对危险率为４－４５, 说明该疾病与此单倍型存在着很强的关联。     

中国南方汉族人群HLA—DQA1位点多态性与系统性红斑狼疮易感…

应用多聚酶链反应／序列特异寡核苷酸探针杂交（ＰＣＲ／ＳＳＯＰＨ）方法，探讨了我国东南沿海汉族人群ＨＬＡ－ＤＱＡ１等位基因多态性与系统性红斑狼疮（ＳＬＥ）的易感性关系，对５０例ＳＬＥ患者和６７例健康人对照血样本分析，表明ＳＬＥ患者具有显著高的ＤＱＡ１＊０１０２等位基因频率，ＯＲ＝４６．０４，Ｐ＜０．００１，可能是一易感等位基因，而ＤＱＡ１＊０５０１在病例与对照中呈相反结果，ＯＲ＝０．０４２，Ｐ＝０。     

江浙沪地区汉人HLA－DQA1基因对重症肌无力的遗传易感性研究

采用一种新的多聚酶链反应－限制性片段长度多态性（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）基因分型法，研究了江浙沪地区中国汉人重症肌无力（ｍｙａｓｔｈｅｎｉａｇｒａｖｉｓ，ＭＧ）４５例和对照组９８例的ＨＬＡ－ＤＱＡ１等位基因。发现ＭＧ的胸腺瘤型和非胸腺瘤型ＤＱＡ１基因遗传背景有所不同，ＨＬＡ－ＤＱＡ１＊０３０１基因参与非胸腺瘤型ＭＧ（尤其是男性组）的遗传易感作用（ＲＲ＝３．６３，Ｐ＜０．０５），家系分析支持群体研究结果。推测了中国汉人ＭＧ可能的ＨＬＡ易感单体型：ＤＱＡ１＊０３０１ＤＱＢ１＊０３０３－ＤＲＢ１＊０９０１和ＤＱＡ１＊０３０１－ＤＱＢ１＊０３０３－ＤＲＢ１＊０４０６．结果从基因分型的角度统一了关于华人ＭＧ与ＨＬＡ相关抗原提法不一致的报道，并揭示了ＭＧ的其它ＨＬＡⅡ系统易感基因ＤＱＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０９０１及ＤＲＢ１＊０４０６或ＤＢＲ＊０４０５存在的极大可能性。为进一步分析ＭＧ的遗传易感机理提供了重要依据。     

家族性热性惊厥与HLA—D区基因关联性的研究

为探讨家族性热性惊厥与ＨＬＡ－Ｄ区基因的关系，应用限制性片段长度多态性方法，对５０个简单型热性惊厥（ｆｅｂｒｉｌｅｃｏｎｖｕｌｓｉｏｎｓ，ＦＣ）患儿及家系成员进行了人类白细胞抗原（ＨＬＡ）ＤＲ、ＤＱ区等位基因分型，并以１０１例健康人做对照。结果显示，ＨＬＡ－ＤＲ、ＤＱ区各等位基因在ＦＣ患者及有ＦＣ史亲属组中的频率较健康对照组无明显增高；而ＨＬＡ－ＤＲβ９（ＨＬＡＤＲＢ１＊０９０１）及ＤＱβ３ａ（ＤＱＢ１＊０３０２－０３０３，０４０１－０４０２）等位基因的表型频率较健康对照组明显降低。家系中无ＦＣ史亲属组中ＨＬＡ各等位基因的分布与健康对照组无差异。结果提示，ＨＬＡ－ＤＲ、ＤＱ基因区域内未发现与ＦＣ易感性有关的等位基因型。作为健康人群中频率最高的等位基因型。ＨＬＡ－ＤＲβ９和ＤＱβ３ａ等位基因可能具有某种生物学优势，在抵抗ＦＣ发病中起一定作用。     

新疆维族人群HLA—DR—DQ单倍型研究

为了解ＨＬＡ第２类基因（ＨＬＡ－ＤＲ－ＤＱ，－ＤＰ位点）在中国人群中的分布情况，应用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法对新疆的主要民族维吾尔族人９２例进行了ＨＬＡ－ＤＲＢ１、ＤＲＢ３、ＤＲＢ５和ＤＱＡ１、ＤＱＢ１五位点等位基因进行了分析，计算了它们在该人群中的分布频率，推导了ＤＲ－ＤＱ五位点单倍型的结构及分布。通过与世界各主要人种和中国北方汉族的比较，证明维族在中华民族有共同基因背景的基础上，还表现出与西方人种有一定程度的血缘交流。为研究古丝绸之路人口迁移对中国维族遗传特征的影响提供了资料。     

Ⅰ型糖尿病患者的HLA-DR-DQ基因单体型分析

应用ＨＬＡ－ＤＲＢ，ＤＱＢ１序列特异性引物ＰＣＲ扩增方法，鉴定８１例ＩＤＤＭ患者，７个家系和８４例正常对照汉族人群的ＤＲＢ基因多态性及ＩＤＤＭ的ＨＬＡ－ＤＲ－ＤＱ基因单体型。结果表明：（１）ＩＤＤＭ患者ＤＲＢ１＊０３，ＤＲＢ１＊０９等位基因频率明显高于对照组，其频率分别为８．６４％ｖ．ｓ３．０％和２８．４％ｖ．ｓ１６．１（Ｐ＜０．０５）。（２）患者中ＤＲＢ１－ＤＲＢ３／ＤＲＢ１－ＤＲＢ４基因型频率明显高于对照组，即１９．８％ｖ．ｓ６．７％（Ｐ＜０．０５）。（３）首次证明ＤＲＢ１＊１２等位基因与中国人ＩＤＤＭ正相关。上述结果提示不同种族ＨＬＡ－ＤＲ型别分布的差异，可能是不同种族人群ＩＤＤＭ发病率变化的分子基础。     

我国彝族另一新的DR15(2)等位基因的核苷酸序列分析

目的对在用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法作我国彝族群体样本ＨＬＡＤ区寡核苷酸分型中发现的１例ＤＲＢ１的杂合子进行等位基因序列分析。方法用ＤＲＢ基因类引物扩增该特殊的ＤＲＢ１杂合子细胞基因组的ＤＲＢ基因的第二外显子。扩增产物经纯化转染大肠杆菌ＪＭ１０１,克隆后再经酚／氯仿抽提后得到单链Ｍ１３ＤＮＡ。利用ＡＢＩ３７７测序仪自动测序。结果彝族这一特殊的ＤＲＢ１杂合子细胞的ＤＲＢ１基因阳性克隆,经序列分析证实了该ＤＲＢ１杂合子中一个等位基因确为ＤＲＢ１＊１２０２,与ＰＣＲ／ＳＳＯ分型一致;另一个新等位基因ＤＲＢ１＊１５Ｙ２（暂定）等位基因在第二外显子的４７位由编码苯丙氨酸的ＴＴＣ（ＤＲＢ１＊１５０２）变为编码酪氨酸的ＴＡＣ。结论在云南彝族样本中发现的ＤＲＢ１＊１５Ｙ２,其４７位由ＴＡＣ（酪氨酸）置换了相应于ＤＲＢ１＊１５０２的ＴＴＣ（苯丙氨酸）。在我国这样一个多民族国家中,就ＨＬＡ系统而言,可能还有更多新等位基因有待鉴定。这样有助于完善群体遗传资料     

用PCR—SSP方法研究广西壮族HIL—DQA1和B1基因多态性

目的 检测广西壮族ＨＬＡ－ＤＱＡ１，Ｂ１基因的多态性。方法 应用ＰＣＲ－ＳＳＰ方法对１４０名健康、无血缘关系广西壮族人的ＨＬＡ－ＤＱＡ１和ＤＱＢ１进行基因分型。结果 共检出７个ＤＱＡ１等位基因和１６个ＤＱＢ１等位基因。在检出的ＤＱＡ１等位基因中，０３０１的基因频率最高（３５％），０４０１的基因频率最低（１．１％）。在ＤＱＢ１等基因中，０６０１（２２．１％），０３０１（２０．７％），０５０１（１３．     

沈阳汉族人群HLA－DR、DQ、DP的DNA分型研究

使用ＰＣＲ／ＳＳＯ方法对９４名沈阳汉族健康人群进行了ＨＬＡ第Ⅱ类抗原等位基因的完全分型。共发现６６种等位基因，基中ＤＲＢ１２８种，ＤＲＢ３３种，ＤＲＢ５４种，ＤＱＡ１８种，ＤＱＢ１Ｉ３种，ＤＰＢ１１０种。分析了ＤＲ－ＤＱ连锁的五位点单倍型，共发现３８种，其中２１种是在白人为主的人群中已发现过的。本研究提出了中国东北人群ＨＬＡ第Ⅱ类抗原等位基因的遗传基本情况，可用于疾病研究的对照和其他中国人群资料的比较。