胃癌组织中miRNA-375基因高甲基化及其表达的研究

  目的   探讨胃癌组织中微小RNA-375(miRNA-375)基因表达与基因甲基化调控的相关性。   方法   2011年3月至8月在天津医科大学总医院通过胃镜检查收集90例新鲜组织活检标本, 分为2组, 胃癌组54例, 非癌对照组36例。应用实时荧光定量反转录PCR检测miRNA-375基因表达, 甲基化特异性PCR检测miRNA-375基因启动子区CpG岛甲基化。   结果   胃癌组miR NA-375基因表达下调, 与非癌对照组相比差异有统计学意义(P < 0.05);胃癌组和非癌对照组miRNA-375基因启动子区高甲基化阳性率分别为62.96%(34/54)和22.22%(8/36), 差异有统计学意义(χ2=14.405, P < 0.05)。中高分化胃癌组织中miRNA-375基因表达高于低分化组, 差异有统计学意义(t=2.634, P=0.011);miRNA-375基因启动子区甲基化阳性率中高分化组与低分化组分别为44.44%(8/18)和72.22%(26/36), 差异有统计学意义(χ2=3.971, P=0.046)。   结论   癌组织中存在miRNA-375基因异常低表达及启动子区的高甲基化, miRNA-375基因高甲基化可能抑制miRNA-375基因表达, 在胃癌发生发展中发挥重要作用。      

人胃癌组织中C—myc癌基因甲基化及其表达的研究

目的：研究胃癌及正常胃粘膜ｃ－ｍｙｃ基因外显子ⅢＣＣＧＧ位点的甲基化状态及其ｍＲＮＡ表达及ＳＡＢＣ法检测胃癌４５例、胃溃疡１４例、不典型增生１０例ｐ６７表达。结果：胃癌ｃ－ｍｙｃ基因外显子ⅢＣＣＧＧ位点比其相应正常胃粘膜呈高度去甲基化，ｍＲＮＡ表达升高（ｐ〈０．００１），ＤＮＡ去甲基化与ｍＲＮＡ表达存在相关性（ｐ〈０．０２５），ｐ６７在胃癌、不典型增生、胃溃疡表达率分别为８４．４４％（３８／４５）     

胃癌miRNAs表达谱及胃癌组织miR-21表达临床意义探讨

目的:筛选胃癌miRNAs表达谱,探讨miR-21在胃癌组织中的表达情况及其临床病理意义.方法:收集手术切除新鲜胃癌标本共65例,包括胃癌组织及相应胃正常上皮组织,随机选取其中6例,应用miRNA芯片技术研究胃癌的miRNAs表达谱.采用实时定量PCR验证芯片结果并检测miR-21在65例胃癌组织标本及相应胃正常上皮组织的表达水平,探讨其表达与胃癌临床病理参数间的关系.结果:与胃正常上皮组织相比,胃癌组织中表达上调超过2倍的miRNAs有7个(miR-374b*、miRPlus-E1212、miR-338-5p、miR-297、miR-21、miR-135b和miR-18a),表达下调超过2倍的miRNAs有9个(miR-29b-2*、miR-1260、miRPlus-E1241、miR-S1-5p、miR-148a、miR-29c、miR-647、miR-196b×和ebv-miR-BART5).46例(70.8％)胃癌组织中miR-21表达水平明显高于胃正常上皮组织,且与肿瘤的分化程度(x2=6.257,P=0.012)、浸润深度(x =5.705,P=0.017)和有无淋巴结转移(x2=7.107,P=0.008)有关.结论:筛选出的差异表达miRNAs可能参与胃癌的发病;miR-21与胃癌生物学行为密切相关,可能成为胃癌诊断和治疗的潜在生物学指标.     

胃癌中微小RNA与DNA甲基化调控的关系

 微小RNA（miRNA）是一类长度约22个核苷酸的非编码单链小分子RNA,在各种生理病理过程中发挥了重要作用,其表达失调和肿瘤的发生发展有密切联系。DNA甲基化在人类基因组中属于表观遗传学调控的范畴,无论DNA的超甲基化或低甲基化都与胃癌等多种肿瘤的发生发展有关。     

胃癌DAPK基因甲基化的初步研究

目的：探讨死亡相关蛋白激酶（death-associated protein kinase,DAPK）基因甲基化与胃癌的关系。方法：采用甲基化特异性PCR（methylation specific PCR,MSP）检测38例配对胃癌组织、癌旁正常组织和转移淋巴结中DAPK基因甲基化的情况。结果：81．6％（31／38）的胃癌组织中存在异常甲基化,而相应的癌旁正常组织和转移淋巴结中该基因的甲基化率分别为42．1％（16／38）和70．2％（27／38）。癌组织和转移淋巴结中DAPK基因甲基化的发生率显著高于癌旁正常组织。癌旁正常组织中,该基因甲基化与年龄相关,P=0．020。但与肿瘤大体类型、分化程度及浸润深度等临床病理特征无关。结论：DAPK基因异常甲基化是胃发生发展过程中的频发事件,通过检测胃黏膜组织及转移淋巴结中该基因的甲基化情况,可能会对胃癌的诊断及判断淋巴结的微转移提供一定的参考价值,并有望成为胃癌新的基因治疗靶点。     

DNA甲基化与胃癌的相关性

在胃癌的发展过程中常发现肿瘤相关基因的异常甲基化存在,其中包括全基因组的低甲基化和某些抑癌基因的高甲基化.另外,DNA甲基化水平似乎还与胃癌的预后密切相关.近年来为揭示DNA甲基化与胃癌的相关性进行了大量研究.     

胃癌组织中p16基因甲基化状态及临床意义

[目的]探讨胃癌患者癌组织、癌旁组织以及对照正常胃黏膜组织中p16基因的甲基化状态,及其与临床病理参数及预后的关系。[方法]应用甲基化特异性实时荧光聚合酶链反应技术检测92例胃癌患者癌组织及配对癌旁组织中p16基因启动子区5′-CpG岛甲基化状态,分析p16基因异常甲基化与患者临床病理特征以及预后之间的关系。[结果]胃腺癌患者癌组织中检测到p16基因甲基化79例(85.9%),癌旁组织11例(12.0%),胃炎患者组织10例(20.8%),健康人未检测到甲基化。p16基因甲基化与肿瘤大小、分化程度、是否淋巴管侵犯、T分期、有无淋巴结转移、有无远处转移、临床分期有关(P<0.05)。p16基因甲基化影响患者预后,但不是胃癌患者无病生存的独立预后因子。[结论]胃腺癌患者p16基因甲基化与肿瘤的生物学行为有关,提示肿瘤进展,恶性程度高,预后欠佳。     

胃癌组织中PCDH8基因甲基化及Dnmt1表达的关系

目的 探讨PCDH8（protocadherin 8）基因在人胃癌组织中的甲基化状态及其与甲基转移酶1（Dnmt1）表达之间的关系,分析其与胃癌发生、发展的关系。方法 取60例手术切除的胃癌组织及其相应癌旁正常胃黏膜组织（距癌组织5 cm以上）,以甲基化特异性聚合酶链式反应（methylationspecific PCR,MSP）检测60例胃癌组织及其癌旁正常胃黏膜组织中PCDH8基因启动子区甲基化的状态;以免疫组化SP法分别检测PCDH8基因蛋白及Dnmt1蛋白的表达水平。结果 胃癌组织中PCDH8甲基化率为55.0%（33/60）,癌旁正常胃黏膜组织中PCDH8的甲基化率为3.3%（2/60）,两者比较差异有统计学意义（χ2=38.76,P〈0.001）,PCDH8甲基化的发生率与患者年龄、性别及TNM分期等差异均无统计学意义（P均〉0.05）,而与有无淋巴结转移的差异有统计学意义（χ2=17.47,P〈0.001）。PCDH8蛋白在癌旁正常胃黏膜组织中的表达（90.0%）明显高于胃癌组织（11.7%）（χ2=73.65,P〈0.001）,Dnmt1蛋白在胃癌组织中的阳性表达率（73.3%）明显高于癌旁正常胃黏膜组织的表达率（5.0%）（χ2=58.79,P〈0.001）。胃癌组织中PCDH8蛋白与Dnmt1蛋白的表达呈负相关（r=-0.544,P〈0.001）。结论PCDH8基因甲基化及Dnmt1的高表达可能参与了胃癌的发生和发展。     

胃癌组织RASAL1基因启动子甲基化及临床意义研究

目的:研究胃癌组织中RASAL1基因启动子的甲基化状态并分析其与临床病理资料的关系,初步探讨RASAL1基因启动子甲基化在胃癌发生发展中的意义。方法:取40例胃癌患者手术标本,使用甲基化特异性PCR(MSP)技术分别检测胃癌组织及相应癌旁组织中RASAL1基因启动子的甲基化状态,并分析其与胃癌临床病理特征的关系。结果:胃癌组织和癌旁组织中RASAL1基因启动子甲基化率分别为70%(28/40)和30%(12/40),胃癌组织中RASAL1基因启动子的甲基化发生率明显高于癌旁组织,P<0.01。胃癌组织中RASAL1基因启动子的甲基化率与性别(P=0.622)、年龄(P=0.168)无明显相关;但与分化程度(P=0.006)、肿瘤大小(P=0.043)、侵袭深度(P=0.015)和淋巴结转移相关(P=0.010);在肿瘤体积大、分化程度差、侵袭深度较深和有淋巴结转移的胃癌组织中,RASAL1基因启动子甲基化率明显增高。结论:胃癌组织中RASAL1基因启动子区域甲基化发生率高,且与分化程度及进展阶段相关,提示RASAL1基因启动子的异常甲基化可能参与了胃癌的发生发展过程。     

卵巢癌组织中Vasohibin基因表达与启动子区域甲基化的关系

目的探讨卵巢上皮性肿瘤中Vaso-hibin基因mRNA表达与临床特征及其启动子甲基化的关系。方法用RT-PCR检测10例良性卵巢上皮性肿瘤、8例交界性卵巢上皮性肿瘤及30例卵巢癌组织中VasohibinmRNA表达;用甲基化特异聚合酶链反应方法(MSP)检测Vasohibin启动子甲基化。结果各组标本中都有VasohibinmRNA表达,3组Vasohib-in表达的相对值良性卵巢上皮性肿瘤为0.65±0.11,交界性卵巢上皮性肿瘤为0.47±0.13,卵巢癌为0.34±0.14。卵巢癌组织中Vasohibin的表达量较交界性卵巢上皮性肿瘤组织显著降低,t=2.479,P=0.029;交界性卵巢上皮性肿瘤组织的表达量较良性卵巢上皮性肿瘤显著下降,t=3.198,P=0.006。在卵巢癌组织中,Vasohibin的表达与不同临床分期、不同分化程度以及有无淋巴结转移无关。良性卵巢上皮性肿瘤中未发现Vasohibin基因启动子甲基化;交界性卵巢上皮性肿瘤中2例发生启动子甲基化,卵巢癌中11例发生启动子甲基化,甲基化率36.7%。卵巢癌中启动子甲基化组织较未甲基化组织VasohibinmRNA表达显著降低,t=4.671,P=0.000。结论Vasohibin与卵巢癌发生存在明显相关性。Vasohibin启动子甲基化与其mRNA表达抑制密切相关,可能是Vasohibin在卵巢癌中低表达的最主要因素之一。     

DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌关系研究进展

目的：总结DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌关系的研究现状。方法：应用PubMed及万方数据知识服务平台检索系统,以“胃癌、DNA甲基化、Eu钙黏蛋白基因和CpG岛”等为关键词,检索1979-01-2013-05的相关文献,共检索到英文文献2093篇,中文文献672篇。纳入标准：1）关键词包括胃癌及DNA甲基化;2）文中包括E-钙黏蛋白基因启动子区CpG岛甲基化。剔除标准：1）非E-钙黏蛋白基因启动子区CpG岛的甲基化;2）关键词有E-钙黏蛋白但文中无甲基化描述。符合纳入标准的中文文献56篇,英文文献43篇,根据剔除标准剔除中文文献46篇,英文文献23篇,最后纳入分析30篇文献。结果：DNA甲基化在基因表达、调控过程中发挥重要作用,其功能紊乱在恶性肿瘤形成过程中具有重要作用,与胃癌的发生密切相关。E-cadherin基因能抑制肿瘤细胞的浸润和转移,E-cadherin基因启动子区CpG岛甲基化是胃肠道肿瘤E-cadherin基因失活的主要原因,可引起E-cadherin表达下降或缺失,与胃癌的发生、浸润、转移和预后密切相关。结论：DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌的形成、浸润和转移等关系密切,但其要成为胃癌防治的靶点仍需进一步研究。     

MicroRNA-21靶向PDCD4对胃癌细胞增殖及凋亡的影响

目的探讨MicroRNA-21对胃癌细胞中PDCD4表达、细胞增殖与凋亡的影响。方法将MGC-803人胃癌细胞分为5组,分别为空白对照组(不转染)、阴性对照组(转染不相关siRNA)、mir 21组(转染miRNA-21质粒)、mir 21 Inhibitor组(转染miRNA-21抑制物)、PDCD4 siRNA组(转染PDCD4 siRNA)。分别于转染后36、48、72小时收集细胞,采用实时定量PCR及细胞爬片免疫组织化学检测细胞中PDCD4基因及蛋白水平,运用MTS法检测细胞增殖情况,流式细胞仪检测细胞凋亡。结果与空白、阴性对照组比较,mir 21组PDCD4表达量下降,细胞增殖能力增强(均P<0.05);mir 21 Inhibitor组PDCD4表达量增多(P<0.05),细胞增殖受到抑制(P<0.01),细胞总凋亡比例增高(P<0.05);PDCD4 siRNA组PDCD4表达几乎完全被抑制,细胞增殖能力增强(均P<0.01),36小时时细胞总凋亡比例减少(P<0.05)。而阴性和空白对照组比较,细胞PDCD4表达量、细胞增殖与凋亡都无明显差异(P>0.05)。结论 MicroRNA-21能靶向调控PDCD4,抑制胃癌细胞MicroRNA-21的表达后可上调PDCD4表达,发挥抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡的作用。     

肺癌患者外周血血浆中p16基因异常甲基化的检测

目的 分析肺癌患者外周血血浆中p16基因启动子区异常甲基化发生情况,探讨血浆中p16基因异常改变作为肺癌临床辅助诊断分子生物学标志物的可能性。方法 利用半巢式甲基化特异性PCR技术,检测了137例肺癌患者血浆和112例相对应肿瘤组织DNA p16基因的异常甲基化情况。结果 在血浆和肿瘤组织中的p16基因甲基化检出率分别为75．2％和80．4％;其中鳞癌、腺癌、腺鳞癌和小细胞肺癌患者血浆标本的阳性率分别为77．9％,65．1％,75．1％和91．7％。血浆DNAp16基因甲基化仅在肿瘤组织存在同样甲基化的病例中被检出。血浆和肿瘤组织中,p16基因的甲基化异常改变与肿瘤的分期、分型无明显相关性。结论 分析血浆DNA的p16基因异常甲基化有可能成为辅助肺癌诊断的有效方法之一。     

肺癌组织细胞中CHFR基因表达水平及其启动子甲基化状态

目的：探讨CHFR（checkpoint with FHA and ring finger）基因表达水平及其启动子CpG岛甲基化状态与肺癌发生发展的关系。方法：实时定量PCR法检测CHFRmRNA在45例肺癌组织、23例癌旁组织与去甲基化剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷处理前后A549细胞株中的表达,同时用甲基化特异性PCR检测CHFR启动子CpG岛甲基化状态。结果：CHFRmRNA在癌旁组织中全部表达,在肺癌组织中表达缺失率为15．56％（7／45）,且表达量低于正常肺组织,F=9．156,P〈0．01;但在不同年龄、性别、肿瘤大小、恶性程度和肿瘤分类中的差异无统计学意义,P〉0．05。CHFR基因启动子在肺癌组织中发生甲基化的频率为22．22％（10／45）,在癌旁组织未发生甲基化,χ^2=5．992,P〈0．05。10例启动子区甲基化的肺癌标本中,7例同时伴有mRNA表达缺失。结论：CHFR启动子甲基化可在肺癌发生和发展中起一定作用。     

MicroRNA-30c相对表达量与胃癌预后相关性分析

目的研究hsa-miR-30c的相对表达量与胃癌患者病理因素的关系及对患者生存预后的影响。方法收集2009-03-01-2010-03-10内蒙古医科大学附属医院普外科住院胃癌患者的手术切除样本共计48例。在48例胃癌样本中应用逆转录实时定量聚合酶链反应,对成熟hsa-miR-30c进行了相对表达量的检测。Kaplan-Meier生存曲线进行预后分析。结果 hsa-miR-30c表达量与性别、年龄、Lauren分型、肿瘤分化程度、UICC分期、肿瘤侵袭深度、转移、部位及瘤组织大小情况无关,P均〉0.05。但在淋巴结受累组hsa-miR-30c表达明显下调,均值为0.32±0.18,而无淋巴结受累组为0.48±0.16,差异有统计学意义,P=0.01。hsa-miR-30c低表达组增加了淋巴结转移的风险,调整后的风险比OR=5.09,95%CI：1.19-23.72,P=0.03。生存分析表明,21例hsa-miR-30c低表达者中位生存时间（37±9.93）个月,低于27例hsa-miR-30c高表达组的（52±4.04）个月,差异有统计学意义,P=0.004,提示hsa-miR-30c低表达组预后不良。结论 hsa-miR-30c的相对表达水平与胃癌的患病风险及预后相关。hsa-miR-30c的相对表达量作为胃癌诊断与预后的新型标志还需要进一步的系统研究。     

MicroRNA-148b and microRNA-152 reactivate tumor suppressor genes through suppression of DNA methyltransferase-1 gene in pancreatic cancer cell lines

Overexpression of DNA methyltransferase 1 (DNMT-1) is observed mostly in pancreatic cancer and it can cause tumor suppressor genes silencing in this disease. Recent studies suggest that abnormal expressions of microRNAs (miRs) are involved in pathogenesis of different types of human cancers including pancreatic cancer. In this study we aimed to investigate the effect of miR-148b and -152 on reverting the tumorigenic phenotype of pancreatic cancer cell lines. In order to investigate whether miR-148b and -152 are involved in the regulation of DNMT-1, luciferase reporter assay was used and confirmed that the DNMT-1 mRNA could be a target for miR-148b and miR-152. Furthermore, overexpression of miR-148b and -152 in pancreatic cancer cell lines (MIA PaCa-2 and AsPC-1) decreased DNMT-1 expression (53% and 59% respectively), returned DNA methylation to normal patterns and induced re-expression of tumor suppressor genes, like BNIP3 (4.7- and 3.8-fold) and SPARC (5.3- and 2.9-fold) for miR-148b and -152 respectively. Moreover, the introduced miR-148b and -152 could inhibit the proliferation of MIA PaCa-2 (35% and 37% respectively) and AsPC-1 (39% and 40% respectively) cell lines. The apoptosis rates of MIA PaCa-1 after treatment with miR-148b and -152 were 10% and 8% respectively; while these rates in AsPC-1 were 16% and 11% respectively. Conclusively these findings mean that miRs that are targeting DNMT-1 and modifying methylation status of tumor suppressor genes such as BNIP3 and SPARC can be applied in killing the pancreatic cancer cells and decreasing the tumorigenicity of these cells.