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目的:基于内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)碱基序列,运用DNA条形码鉴定技术对长白山地区药用植物龙胆进行鉴别研究,为龙胆药材的基原植物鉴定和药材的真伪鉴别提供参考。方法:采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)提取法提取龙胆叶片及药材的DNA,对其中特定ITS2碱基序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,检测后测序,并从GenBank下载同属植物序列,运用SeqMan软件对碱基序列拼接后,采用MEGA 7.0软件对数据进行分析处理及对比,计算Kimura 2-parameter (K2P)遗传距离,建立邻接(NJ)法,进行对比分析。结果:根据NJ聚类树可知,不同种龙胆属植物笔龙胆、三花龙胆、高山龙胆、坚龙胆都自为一支,区分明显,龙胆和条叶龙胆聚在一支未能区分开,同时结合变异位点及K2P遗传距离发现,条叶龙胆和龙胆应用ITS2碱基序列区分时种间差异十分小。吉林省长白山10个不同地区的龙胆种内几乎无差异,经Blast比对确定碱基序列的确为所需要鉴定的品种。结论:运用ITS2碱基序列的DNA分子条形码鉴别方法对龙胆植物及药材进行鉴别有效可行且成功率较高,可以用于龙胆属种间及种内鉴别。 相似文献
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目的:通过构建黄芩核糖体DNA内转录间隔区2(ITS2)条形码数据库,建立黄芩种子DNA条形码鉴定新方法,保障黄芩种子基原准确。方法:收集黄芩对照药材、基原植物、生药材、公共数据库及其常见代用品的ITS2序列,构建黄芩DNA条形码数据库;收集62份市售黄芩种子样品,每份种子获取3~4条ITS2序列,基于BLAST方法、遗传距离法和邻接(NJ)系统发育树法进行物种鉴定。结果:共获得101条黄芩及其代用品的ITS2序列。黄芩的种内序列变异小于种间序列变异,黄芩、甘肃黄芩和粘毛黄芩在NJ系统发育树上分别聚为独立的支,可相互区分。共获得195条黄芩种子的ITS2序列,DNA条形码鉴定结果表明193条为黄芩序列,2条为真菌序列。结论:黄芩ITS2条形码数据库稳定可靠,可满足黄芩种子DNA条形码鉴定的需求。DNA条形码技术可用于黄芩种子的物种鉴定。 相似文献
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目的:调查俄罗斯高加索、阿尔泰野外地区药用植物的分布现状,明确该地区药用植物的种类、功效信息,深入挖掘一带一路沿线国家地区的药用植物新资源、新功效。方法:在野外搜寻并采集药用植物制成蜡叶标本运回国,提取腊叶标本的植物总DNA,使用内转录间隔区(ITS)序列通用引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,PCR产物送双向测序,测序结果经软件进行拼接,根据美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库BLAST所获相似度最高物种的同属ITS序列,经DNAman软件对待鉴定物种的ITS序列和同属ITS序列进行相似度分析,利用MEGA 7软件作进化树,采用Kimura-2参数遗传距离,采用邻接法构建邻接法(NJ)系统树,发育树各分支的置信度用自举检验法检验,共进行2 000次循环,根据聚类结果进行鉴定。在此基础上对俄罗斯高加索、阿勒泰野外地区的重点药用植物进行归纳与分析。结果:经过NCBI数据库BLAST比对,各标本ITS序列与NCBI数据库上登录序列聚为一支,与外类群明显分开,结合植物标本性状特征,确定了待鉴定标本的种属分类。该次野外收集的标本中共鉴定出51种植物,覆盖17科44属,有明确功效记载的植物共有29种。查阅俄罗斯联邦国家药品目录和《中国药典》,分析国内常用药用植物,总结出20种中俄常见药材其在当地具有不同药用功效。该研究对扩大中药用药范围和临床经验具有重要的借鉴意义,也为当地加强物种保护和开发利用野生药用植物资源提供了依据。 相似文献
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目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力。方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率。结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析。各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psbA-trnH、ITS、ITS2、rbcL。ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小。Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小。NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开。结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合。本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据。 相似文献
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目的 常用生药柴胡正品为柴胡属植物柴胡及狭叶柴胡的干燥根。当前,同属多种植物也做柴胡内转录间隔区使用。仅凭生药性状及显微特征难以进行真伪鉴别。在本实验中,笔者针对6种不同柴胡属植物来源的柴胡生药,基于其内转录间隔区(ITS1)区多态性研制了用于其鉴别的DNA芯片。方法 将设计的特异性寡核苷酸探针点印于基质上制备芯片;从待检测样品中提取基因组DNA,扩增ITS1片段,并以荧光标记后,与芯片杂交。结果 在与其相应的探针位置即可出现信号;每种不同来源的柴胡有其特异的杂交谱图。结论 研制的DNA芯片可为柴胡类生药的鉴定提供可靠便利的途径。
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目的:探索建立适用于鉴定药用植物三尖杉及其同属易混物种的DNA条形码鉴定体系,以保障其用药安全。方法:提取三尖杉属3个物种(三尖杉、粗榧和篦子三尖杉)共22份样本的基因组DNA、扩增ITS2和psbA-trnH 序列并测序,通过CodonCode Aligner V4.2对测序峰图进行校对拼接。应用MEGA 5.1计算种内和种间Kimura 2-Paramter(K2P)遗传距离,构建邻接(Neighbor-Joining, NJ)系统聚类树。结果:基于ITS2序列分析,三尖杉的种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离;基于psbA-trnH 序列分析,三尖杉的种内和种间遗传距离有重合。结论:应用ITS2序列,可以实现对三尖杉及其易混物种的鉴别,为三尖杉药材的安全使用提供鉴定依据。 相似文献
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目的:结合ITS2、psb A-trn H和matk序列对兰科虾脊兰属植物进行物种区分鉴定研究,并确立能准确鉴别虾脊兰属植物的序列或者序列组合。方法:采用试剂盒法对已收集的6种虾脊兰属植物进行总DNA的提取,通过扩增及测序,运用codencode V4.2软件对所得序列进行拼接与剪切,使用MEGA5.0对ITS2、psb A-trn H和matk序列3种序列分别进行比对分析,计算种内及种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,构建Neighbor-joining(NJ)系统聚类树。结果:实验共得到序列56条(包含Gen Bank序列17条),ITS2序列和mat K序列其种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,而该属psb Atrn H序列种内遗传距离范围和种间遗传距离范围有重合。结论:ITS2序列和mat K序列可以作为虾脊兰属部分植物的鉴定序列,而psb A-trn H序列不能用于虾脊兰属植物的鉴定。 相似文献
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目的:对中药材远志及其混伪品进行分子鉴定,保障药材质量及用药安全。方法:对46份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其psbA-trnH序列并双向测序,应用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图校对拼接,去除低质量区和引物区,得到psbA-trnH序列,用MEGA 6.0对序列进行比对分析,基于K2P遗传距离构建系统聚类树。结果:通过相似性搜索法能准确鉴别远志及其混伪品,远志两个基原的种内最大K2P距离分别为0.004和0,均小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离(0.010 和0.005),基于psbA-trnH序列的系统发育树可将远志药材及其混伪品明显区分开。结论:psbA-trnH序列能有效鉴别远志药材及其混伪品,为中药材的质量控制提供新方法。 相似文献
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Identification of Traditional Chinese Medicine Rubiae Radix et and Its Adulterants Using DNA Barcodes 下载免费PDF全文
??OBJECTIVE To identify traditional Chinese medicine Rubiae Radix et Rhizoma and its adulterants using DNA barcodes. METHODS A total of 317 sequences of psbA-trnH, matK and rbcL from 13 species were analized. The intra- and inter-specific K2P genetic distances and neighbor-joining tree were calculated using MEGA5.1 program. RESULTS The DNAs were successfully extracted from 76 original plant samples. The amplification rates of psbA-trnH, matK and rbcL were 100%, 96%, and 99%, respectively. The adulterants could be identified from R. cordifolia by the single marker and the two combinations except for those adulterants in the Rubia genus. Fortunately, R. cordifolia could be identified from all the adulterants by psbA-trnH+matK+rbcL combination marker. The intra- and inter-specific K2P genetic distances of psbA-trnH+matK+rbcL were 0-0.001 4 and 0.000 7-0.630 3. R. cordifolia could be identified from all the adulterants by the psbA-trnH+matK+rbcL combination using NJ tree method. Among the 30 unidentified samples of Rubiae Radix et Rhizoma which were collected from medicinal herb markets, all three markers, including psbA-trnH, matK and rbcL, could be amplified from 22 samples. The 11 samples of Rubiae Radix et Rhizoma clustered with R. cordifolia and the others were divided into three clusters by the psbA-trnH+matK+rbcL combination using NJ tree method. CONCLUSION psbA-trnH+matK+rbcL combination can be used as DNA barcode to identify R. cordifolia from adulterants. 相似文献
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??OBJECTIVE To choose suitable barcodes for Draconis Sanguis and find the new method to identify Draconis Sanguis. METHODS The genomic DNAs from 41 samples were extracted. Draconis Sanguis samples were amplified and sequenced based on seven candidate DNA barcodes . The obtained sequences were assembled using the CodonCode Aligner V 4.2. The Kimura 2-Parameter (K2P) distances were calculated using MEGA 5.0. The neighbor-joining (NJ) phylogenetic trees were constructed. RESULTS Six out of the seven candidates were not able to be amplified, while P6 loop of trnL (UAA) intron could be used for identification. The length of the P6 loop of trnL(UAA) intron sequence of Daemonorops draco was 45 bp. The maximum K2P intra-specific genetic distances of Daemonorops draco were much smaller than the minimum inter-specific genetic distances between Daemonorops draco and its adulterants. The NJ tree showed that Draconis Sanguis differed from its adulterants obviously. CONCLUSION The P6 loop of trnL (UAA) intron can be used as DNA barcode for the identification of Draconis Sanguis. 相似文献
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中医药学与其他非正规医学比较研究 总被引:1,自引:0,他引:1
范为宇 《中国中医药信息杂志》2002,9(8):68-70
1 中医药学与印度医学的比较研究 作为世界上的人口第二大国,印度享有历史悠久的传统医学。印度传统医学由阿育吠陀学、尤纳尼医学、西达医学、瑜伽功所组成。印度传统医学的发展进程与中医学有许多相似之处。印度医学起源于公元前2500~600年,到公元8~12世纪,印度医学发展至顶峰,而随着穆斯林等外族入侵,印度医学逐渐衰落。17世纪后,英国殖民者将西方医学引入印度,使西医成为印度的官方医疗体系。但是,印度传统医学仍有着强大的生命力,80%以上的人口仍然依靠印度传统医学进行初级医疗保健。 与中国中医药从业人员数字相比,印度传… 相似文献
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DNA条形码技术给中药鉴定学发展带来新的机遇,中药材DNA条形码鉴定数据库及中草药DNA条形码生物鉴定体系的创建有利于推进中药鉴定标准化和国际化。中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则已纳入《中华人民共和国药典》2010版第三增补本,为中药材基原物种鉴定提供强有力的科技支撑,将在中药材及中成药流通监管、道地药材鉴别、保健食品和食品质量安全控制等领域发挥重要作用。将中药材DNA条形码分子鉴定法与中国药典规定的其他鉴别方法相结合,能够对药品质量进行综合评价与有效监控。 相似文献
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刘春辉 《世界科学技术-中医药现代化》2008,10(4):101-104
从中医药知识自身属性、特点及其发展中存在的问题,多方面考察了中医药传统知识法律保护的内在需求。作者认为传统知识保护的内在需求不明确,是实现传统知识法律保护的主要障碍,且内在需求影响着对保护措施的选择;中医药传统知识的法律保护大多数可以通过知识产权保护得到实现,探讨中医药传统知识的法律保护,首先应考虑运用知识产权保护机制。 相似文献
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从中医药知识自身属性、特点及其发展中存在的问题,多方面考察了中医药传统知识法律保护的内在需求。作者认为传统知识保护的内在需求不明确,是实现传统知识法律保护的主要障碍,且内在需求影响着对保护措施的选择;中医药传统知识的法律保护大多数可以通过知识产权保护得到实现,探讨中医药传统知识的法律保护,首先应考虑运用知识产权保护机制。 相似文献
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北方地区容易混用的中药品种 总被引:2,自引:0,他引:2
<正>中药饮片因地区用药习惯不同及同名异物或同物异名的药材,造成目前中药饮片市场相对混乱。不加以规范势必会造成疗效不稳定,甚至引起不良反应。 相似文献