“非典”之凶是如何命名的

我国科学家在 2 0 0 3年 4月 15日 11时 ,成功的完成了对冠状病毒的基因组序列测定。军事医学科学院微生物研究所与中国科学院北京基因组研究所测定结果显示 :该病毒的长度约为 3万个碱基对。在短短几周的时间 ,科学家们完成了识别、命名和破译病毒基因序列的任务。“非典”原来是一种新型的冠状病毒 ,同普通感冒病毒是一个家族 ,但与普通感冒病毒相差很大 ,科学家是怎样找到它和命名的呢 ?美国《时代》周刊发表题为“逐个细胞到追踪一种致命病毒”的文章 ,介绍中国香港大学的研究工作。科研组负责人马利克·佩里斯博士证明 :从“非典”病人…     

SARS相关冠状病毒的基因组序列分析

20 0 3年 5月 1日《科学》杂志报道了 Marra等学者分离到 SARS相关冠状病毒 Tor2分离株基因组 ,并完成了该基因组2 9 75 1个碱基的测序。结果显示该病毒与其他已知的冠状病毒 (包括 2种人类冠状病毒 HCo V OC4 3和 HCo V 2 2 9E)仅中度相关。对推断出的病毒蛋白进行种系分析 ,提示该病毒与其他已知的 3种冠状病毒群并不十分相似。研究者认为 ,SARS相关冠状病毒 Tor2分离株基因组基因测序工作有助于对 SARS感染患者及可能的动物宿主的诊断 ,并有助于抗病毒药物及疫苗的研究。SARS相关冠状病毒的基因组序列分析@曹卫红…     

严重急性呼吸综合征患者血清特异性抗体变化规律的长期追踪研究

严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)是2003年从严重急性呼吸综合征患者中分离出的一种新的冠状病毒.该病毒在较短时间内感染了8 000多例患者,导致700例患者死亡.SARS-CoV是正链RNA病毒,基因组由29 727个核苷酸组成,含11个开放阅读框架,与其他冠状病毒的基因组结构相似,系统研究抗-SARS-CoV产生及其转归规律,对于SARS冠状病毒的防治具有重要意义.本研究从2003年开始,连续4年追踪研究了广州市41例SARS患者抗体的变化规律.     

江西省赣州市两株冠状病毒的全基因组遗传特征分析

目的 分析江西省赣州市2株亚洲鼩鼱携带冠状病毒的全基因组遗传特征。方法 用反转录-聚合酶链式反应及RACE方法从亚洲鼩鼱粪便中扩增其全基因组;利用MegAlign软件进行序列同源性分析;利用phyML软件构建系统发育树。结果 全基因组的同源性分析表明毒株GZ01、GZ02与已知的亚洲鼩鼱携带冠状病毒的序列具有很高的同源性（88.6%~92.1%）。系统发育分析表明毒株GZ01、GZ02与上述序列有最近的亲缘关系。结论 赣州市亚洲鼩鼱携带属冠状病毒,与已知的毒株为同一种冠状病毒,系统发育分析发现亚洲鼩鼱在冠状病毒的起源与进化过程中起着重要作用。     

与严重急性呼吸综合征相关的新冠状病毒的特征有哪些?

答 :与严重急性呼吸综合征 (SARS)疾病相关的是一种新的冠状病毒 (SARS CoV )。经测序证实该病毒基因长度为2 9 72 7bp ,有 11个开放阅读架 (ORFs) ,基因组结构与其他冠状病毒的结构相似。但SARS CoV病毒种系进化分析和序列比较分析显示 ,该病毒与任何以往已确定特征的冠状病毒关系不密切 ,且该病毒的有限区域的复制酶 (rep)基因序列与其他冠状病毒明显不同。世界卫生组织组织的多中心研究确认 ,SARS与其他人类冠状病毒不同的另一方面是 ,只能从Vero细胞中分离出SARS CoV。通常可从呼吸道标本中检测到SARS CoVRNA ,在SARS…     

传染性非典型肺炎实验室检测的进展

2002年11月份开始,在我国广东地区流行一种以发热,肺部感染为特征的疾病,该病被称为传染性非典型肺炎,国际上称为急性呼吸系统综合症(AcutesevereRespiratorysyndrome,简称SARS)。传染性非典型肺炎是一种新型传染病,WHO在4月16日宣布是由一种人类从未发现过的冠状病毒科的新型病毒(Coronavirus,又称SARS病毒)引起的。国内外科学家已经完成了SARS病毒基因组序列测定,该病毒由2万9千多个核苷酸组成,并且在很短的时间内已经建立了SARS的病毒分离,血清学诊断和RT-PCR等实验室的检测。1SARS病毒的分离培养病毒分离培养是诊断病毒感…     

低温消毒技术在新型冠状病毒感染疫情防控中的应用与探讨

国务院发布的《新型冠状病毒肺炎防控方案(第八版)》中明确指出,“新型冠状病毒对紫外线和热敏感,乙醚、75%乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和氯仿等脂溶剂均可有效灭活病毒。”“主要传播途径为经呼吸道飞沫和密切接触传播,接触病毒污染的物品也可造成感染”[1]。我国研究人员通过对2020年6月北京疫情相关病例、环境和食品等样品的核酸测序和病毒基因组序列分析,结合全面的流行病学调查和大数据分析,揭示了该疫情可能源于冷链食品污染,提出冷链运输可能是新型冠状病毒(SARS-CoV-2)传播的新途径[2]。从事冷链食品生产经营活动的人员一旦感染SARS-CoV-2,并在感染后未及时调离工作岗位,继续从事食品生产、装卸、运输、贮存及销售等工作,病毒就有可能会通过感染者污染食品及其包装材料表面;并且随着冷链食品扩散,如果相关防控工作不到位,就存在导致相关的接触者感染和病毒传播的潜在风险[3]。     

新型冠状病毒亚基因组RNA的产生及其检测方法

新型冠状病毒引起的新型冠状病毒感染(COVID-19)在全球范围广泛流行, 对人类健康和世界经济造成了严重影响。新型冠状病毒是单股正链RNA病毒, 可由复制转录复合物的不连续转录产生亚基因组RNA。这种不连续转录由转录调控序列调控, 通过切换基因组RNA上的模板产生。目前检测亚基因组RNA的方法主要有二代测序技术、纳米孔测序技术、逆转录液滴数字聚合酶链反应和逆转录实时定量聚合酶链反应技术等。病毒进入感染细胞进行复制时才会产生亚基因组RNA, 因此亚基因组RNA是较好的反映病毒复制的标志物。     

“武大”发现SARS冠状病毒致命点

经过近六年努力,武汉大学科研人员近日发现了SARS冠状病毒致命点,是一组叫“非结构蛋白nsp14”的基因编码。研究人员表示,此次重要发现可为筛选抗击SARS病毒药物奠定基础,进而研发成小分子药物。     

SARS诊断的鉴别思考

此病来势凶猛、波及较广，医务工作先后提出病原的“衣原体说”、“副粘液病毒说”，直到2003-04-16，WHO根据包括中国大陆和香港、加拿大、美国在内的11个国家和地区的13个实验室通力合作的研究结果宣布：SARS病因是一种新的冠状病毒，称为SARS相关冠状病毒(SARS associated corona virus，SARS-COV)。新冠状病毒电镜下病毒颗粒直经80～140nm，周围有鼓槌状冠状突起，突起之间歇较宽，病毒外形呈日冕状，表现出冠状病毒的典型特征。     

2019新型冠状病毒核酸检测的研究状况与应用探讨

2019新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV),从2019年底武汉病毒性肺炎病例中被发现,2020年1月12日被世界卫生组织命名。2019-nCoV是一种以前从未在人体中被发现的冠状病毒新毒株,其基因组大小和结构与其他的冠状病毒相似,但在进化树上与人SARS冠状病毒关系较远。2019-nCoV基因组大约由29 000个核苷酸组成,有12个开放读码框(ORF),属于一种全新的β属冠状病毒。该文针对2019-nCoV的生物学特性、基因结构以及分子生物学检测进行综述,并对实验室检测规范及其质量控制给予建议。     

传染性非典型肺炎

近期流行的传染性非典型肺炎 (非典 )与既往非典相比 ,表现出一些新的特征。此次的传染性非典是由意大利著名传染病专家卡罗·乌尔巴尼首先在越南提出 ,随后世界卫生组织 (WHO)建议称其为“严重急性呼吸道综合征” (SevereAcuteRespiratorySyndrome ,SARS) ,是历年传染性非典中传染性最强、病情较重的一种。从SARS的病原看 ,先后有试验材料及临床表现提示为衣原体、流感病毒、副黏液病毒 ,目前认为是冠状病毒的可能性较大。国内外有关机构正在积极展开多方面研究 ,近期的防治经验表明 ,如能得到及时的支持性治疗和对症治疗 ,绝大多数…     

一起海陆边境城市新型冠状病毒肺炎疫情暴发溯源调查

目的 分析2021年12月广西海陆边境城市（D市）一起新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）疫情暴发的流行特征及溯源过程,为今后类似疫情应急处置及科学溯源提供科学依据。方法 按照《新型冠状病毒感染的肺炎病例流行病学调查方案（第八版）》对病例开展流行病学调查,用实时荧光定量(RT-PCR)法对标本进行新冠病毒核酸检测,阳性标本进行新冠病毒全基因组二代测序和系统发育分析。采用R4.1.3统计软件进行数据统计分析。结果 本次疫情累计感染病例20例,波及6个家庭,平均潜伏期（4.6±2.2） d。获得19例病例新冠病毒基因组有效序列,与武汉参考株（NC＿045512）序列相比,本起疫情病例新冠病毒基因组序列存在35～36个核苷酸突变位点,属于德尔塔（VOC/Delta）变异株（AY.57进化分支）,新冠病毒刺突（S）蛋白均存在相同的11个氨基酸突变位点,与全球新冠病毒基因组数据库（GISAID）中邻国上传的2条新冠病毒基因组序列高度同源。结论 本起疫情是一起由渔民外出作业接触邻国境外人员感染导致本地社区传播,今后应加强边境村民管理和边境流行株监测,尽早发现并处置疫情。     

利用MS2噬菌体包膜蛋白与RNA的特异性相互作用构建临床检测用病毒样颗粒

MS2噬菌体是单链正链RNA病毒，为26nm长的20面体，共有3569个核苷酸，包含有3个基因，编码成熟酶蛋白、包膜蛋白、复制酶蛋白和裂解蛋白等4种蛋白质分子。噬菌体由180个包膜蛋白单体、一分子成熟酶蛋白和一分子基因组RNA组成。在MS2噬菌体包膜蛋白的研究中发现包膜蛋白与噬菌体复制酶5’端由19个碱基（19mer）组成的茎环结构RNA序列有特异性相互作用，这种作用可引发噬菌体外壳的组装，同时，将噬菌体基因组RNA包装到包膜内。国外研究人员发现在包装位点后引入非噬菌体基因序列也可以引发包装。本研究拟利用MS2包膜蛋白与RNA的相互作用来观察RNA序列对包装的影响以及基于两者相互作用构建病毒样颗粒在临床分子检测中的应用。     

病毒学专家:“隔离”是防治非典的有效方法

中新网杭州4月25日电:“根据以往对付新发现病毒的经验,我们认为严格的隔离措施是防治非典最有效的办法。”中国科学院院士、病毒学专家毛江森日前在接受新华社记者采访时表示,由于非典是由新出现的冠状病毒引起的,短期内难以找到特效的预防方法,因此严格执行“早报告、早隔离”的措施显得尤为重要。毛江森院士是我国著名的病毒学专家,从事病毒学研究40余年。1991年,经过长达15年的系统研究,毛江森院士成功培育出安全有效的甲肝减毒活疫苗毒种,并研制出甲肝疫苗,这一成果为我国有效控制甲肝流行作出了巨大的贡献。     

严重急性呼吸综合征发病机制研究现状

严重急性呼吸综合征 (severacuterespiratorysyndrome ,SARS) ,在我国现称为传染性非典型肺炎 ,是一种新的呼吸道传染病 ,目前已明确其病原体是一种变异的冠状病毒 ,命名为SARS冠状病毒 (SARScoronavirus ,SARS CoV) [1 ] ,SARS的发病机制尚未明了。本文就其发病机制现状作一介绍。一、病毒作用机制人冠状病毒 (humancoronavirus)是一种单链正链RNA病毒 ,已知有HCV 2 2 9E和HCV OC4 3亚型。其作用机制不甚明了 ,但根据Yeager[2 ] 的研究可推测SARS病毒有可能通过其表面蛋白与泡上皮等细胞上相应的受体结合进入细胞内而致病…     

新型冠状病毒肺炎疫情形式下医院普通病房管理探讨

2019 年12月,中国湖北武汉地区部分医院 陆续发现不明原因肺炎病例,实验室对病例呼吸道标本病毒全基因组序列分析证实,导致这些不明原 因肺炎发生的病原体为一种新型冠状病毒,世界卫 生组织（World Health Organization,WHO）正式将 其命名为“2019 新型冠状病毒”（2019 novel coronavirus,2019-nCoV）[1]。本次新型冠状病毒肺炎传染性强、传播快,随着疫情的发展,国家疾病控制中心已将其纳入国家乙类传染病范畴,并采取甲类传染病防控措施。医院是个相对开放的场所,特别是设置发热门诊的医院,传染源相对高密度,医院普通病房也成为了高风险地区,普通病房医护人员工作压力也随之增加,医护人员不仅要面临沉重的工作负荷,还要面临被感染的风险。因此我院院感科、护理部、医务处等多团队协作,严格病房管理,对2019 新型冠状病毒层层防护。     

新型冠状病毒的流行现状与研究进展

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)对整个世界乃至人类健康体系造成了巨大影响,目前对SARS-CoV-2甚至冠状病毒的了解还不够充分。1流行病学冠状病毒是一类包膜RNA病毒,冠状病毒的系统分类为冠状病毒科,属于冠状病毒属。由于冠状病毒有广泛宿主特征,以及其自身的复杂基因组进化结构,在生物进化的过程中很容易发生重组和遗传变异,呈现出生物遗传上的多样性。新亚型和新的冠状病毒不断结合存在,使该冠状疾毒至少能够同时发生一种跨越亲属型的感染,预防和早期治疗困难较大[1]。     

SARS实验室诊断的进展

SARS的病原体是一种新型的冠状病毒，称为SARS冠状病毒。SARS冠状病毒是属于巢状病毒Nidovirales目、冠状病毒科、冠状病毒属。它是单股正链RNA病毒，全基因组长29751个碱基，平均GC含量为41％；其5’端有帽状结构，3’端有polyA结构；若按每个开放读框(open reading frame，0RF)编码蛋白产物大于40个氨基酸来计算，共有14个0RFs；经同源性比较分析，其中有5个ORFs可以在基因库中检索到冠状病毒的同源性基因，它们分别是编码复制酶(Rep)、刺突蛋白(S)、包膜蛋白(E)、膜糖蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)的基因。除此之外，还存在一些结构与功能未知的开放读框编码蛋白，它们与SARS冠状病毒的生物学功能和致病机理密切相关。     

SARS实验室诊断的进展

SARS的病原体是一种新型的冠状病毒 ,称为SARS冠状病毒。SARS冠状病毒是属于巢状病毒Nidovirales目、冠状病毒科、冠状病毒属。它是单股正链RNA病毒 ,全基因组长 2 975 1个碱基 ,平均GC含量为 4 1% ;其 5′端有帽状结构 ,3′端有polyA结构 ;若按每个开放读框 (openreadingframe ,ORF)编码蛋白产物大于 4 0个氨基酸来计算 ,共有 14个ORFs;经同源性比较分析 ,其中有 5个ORFs可以在基因库中检索到冠状病毒的同源性基因 ,它们分别是编码复制酶(Rep)、刺突蛋白 (S)、包膜蛋白 (E)、膜糖蛋白 (M)和核衣壳蛋白 (N)的基因。除此之外 ,…