统计学方法在生物信息学分析中的应用

介绍序列相似性分析、基因表达分析、基因转录调控网络分析和序列结构与模式识别分析中统计学方法的应用情况,为科研人员系统学习生物分析技术提供理论依据。     

放射科信息管理系统的研究与开发

目的实现用计算机代替传统的登记簿进行放射科信息管理.方法使用VisualBasic开发平台设计交互界面和编写操作数据库代码,用Access数据库管理系统建立数据库.结果设计出界面友好、代码简单、功能强大的信息管理系统.结论该系统操作简单、管理数据高效、安全,管理的信息容量大.     

生物基因与蛋白质序列比对算法的图形硬件加速研究

[目的]探索准确、高效、低成本、通用性并存的生物序列比对方法。[方法]将点阵图算法、启发式算法等各种序列比对算法中准确性最高的动态规划算法予以在计算机中实现,并通过流模型将其映射到图形硬件上以实现算法加速,通过数据库比对搜索实例进行比对时间和每秒百万次格点更新(MCUPS)性能值评测。[结果]与目前最快的启发式算法相比,该加速算法比对平均加速为18倍,最高加速可达28倍。[结论]该加速算法在保证比对准确性的同时,能较大地提高比对速度。     

Struts框架技术在医院信息系统开发中的应用

基于JSP技术开发的HIs系统应用程序经常将数据库层代码、页面显示代码以及控制流代码混在一起,实际上,这种混合开发方式会使大型医院信息系统的开发和系统后期维护变得异常困难,而通过分层的思想开发应用系统可以有效解决这些问题。在HIS应用程序开发过程中采用MVC三层架构可以实现对系统的分层开发,MVC三层架构的逻辑层实现业务逻辑代码部分,视图层实现页面设计代码部分,控制层实现流程控制代码部分。Struts为实现基于MVC架构的web应用程序开发提供了一个优秀的框架,利用Struts框架开发的应用程序具有程序结构清晰、后期维护工作量少、开发效率高等优点,特别适合应用于大型HIS系统的开发。     

基于GIS的石家庄市媒介生物信息管理系统的开发及应用

目的建立基于地理信息系统(GIS)的石家庄市媒介生物信息管理系统,提高媒介生物信息的管理水平,为进一步研究媒介及媒介生物性疾病打下基础。方法在Windows 2003操作平台下,利用Visual studio 2008、SQL Server2000、mapinfo等工具进行GIS系统的二次集成和开发,利用ASP.NET的高效、安全等特性开发石家庄市媒介生物信息管理系统。结果建立了石家庄市重要媒介生物本底数据库、专家知识数据库,构建了媒介生物监测数据网络直报平台。结论建立了基于GIS的媒介生物信息管理系统,达到了对有基层人员远程教育的目的,实现了石家庄市重要媒介生物相关信息的数字化管理、信息资源的网络共享以及监测数据的可视化,为进一步研究自然疫源地及媒介生物性传染病的发生和变化提供依据。     

COM/COM+技术在中国实验动物信息网Web设计中的应用

本介绍在中国实验动物信息网络web网站应用新的技术COM／COM 来改进和优化现有的设计.使用COM为核心的组件技术提供的开发平台，对现有的ASP设计代码进行优化设计，实现系统的可扩展性，使应用软件和系统软件能随着功能扩展、版本迁移和顺利升级，无须重编程序代码，更换底层支撑软件：本以使用COM技术开发自定义数据访问组件以及该组件在ASP开发、YB、VC 环境中应用为实例，阐述COM在中国实验动物信息网络建设中的作用和意义。     

实时电阻抗断层成像系统的成像算法及软件系统实现

电阻抗断层成像技术是目前国际上广泛研究的一种新的医学成像手段.本文主要介绍国内自主开发的一套实时电阻抗断层成像实验系统的核心算法及软件实现,并用这一系统进行了初步成像实验.     

精馏分离序列综合邻域结构的研究

为了有效解决精馏分离序列优化综合问题，研究邻域(超级)结构是成功实现寻优算法的前提。由于精馏分离序列与二叉树之间具有同构性，在数据结构上精馏分离序列可以抽象为二叉树，进而采用图论方法对其进行研究。本文运用组合数学理论深入研究了精馏分离序列综合问题．简明分析了有序剖分问题的计算复杂性；通过二叉树相邻切分点变换机制，实现了对精馏分离序列的随机搜索；提炼出后序遍历相邻变换的等价规则，从而构造出高效演化邻域结构。     

人工神经网络在药物制剂研究中的应用

人工神经网络模拟人脑生物神经网络系统处理信息的方式,是通过经验而不是通过设计好的程序进行学习、训练,这些构成了人工神经网络具有模式识别、预测、评价和优化决策等能力的基础.本文就神经网络近年来在药剂学的处方设计及优化、制备工艺及体内体外相关性评价等方面的应用做一综述.     

基于DNA的纳米材料在肿瘤治疗领域的研究进展

肿瘤治疗药物通常存在水溶性差、靶向性低、稳定性差、不易被肿瘤细胞摄取等不足,开发一种理想的药物递送载体仍是肿瘤治疗领域亟待解决的重要问题。由于具有良好的序列可编程性、生物相容性和生物可降解性,基于DNA的纳米材料已被广泛用作肿瘤治疗的药物递送载体。大量研究表明,DNA纳米材料可以有效装载肿瘤治疗药物,实现肿瘤组织靶向递送、高效细胞摄取与刺激响应性药物释放。本文从DNA纳米技术的历史与发展入手,例举DNA纳米材料作为药物递送载体在化疗、基因治疗、免疫治疗和光动力疗法中的应用进展,并对其未来发展进行展望,以期为该领域其他研究工作者提供参考。     

基于三维下颌骨平均模型的颌骨标志点自动确定方法

目的：探索一种高效、自动确定三维下颌骨数据解剖标志点的方法,并对该方法的定点效果进行初步评价。方法：选取40例颅颌面三维形态正常患者的CT数据(其中30例用来建立三维下颌骨平均模型,10例作为测试本研究方法确定下颌骨标志点效果的测试数据),将数据导入到Mimics软件中进行下颌骨三维重建。在这40例三维重建后的下颌骨数据中,选取与中国人下颌骨特征均值更为接近的30例,在MATLAB软件中基于普氏分析(Procrustes analysis)算法对此30例下颌骨数据进行尺寸归一化处理,并在Geomagic Wrap软件中,构建上述30例下颌骨数据的三维平均形状模型,通过对称化处理、曲率采样、索引标记等过程,构建出具有18 996个类标志点和19个下颌骨解剖标志点索引的三维下颌骨结构化模板。应用开源非刚性配准算法程序Meshmonk,将上述构建的三维下颌骨模板通过非刚性变形与患者三维下颌骨数据进行匹配,获得患者三维下颌骨数据的19个解剖标志点位置。与口腔专家手动标注的标志点位置误差(定点误差)进行比较,评价本方法的准确性。结果：将本研究方法应用于10例无显著下颌骨形态畸形患者数据,19个标...     

电阻抗断层成像中Newton─Raphson重构算法的计算机模拟研究

基于最优阻抗重构算法修正的Ｎｅｗｔｏｎ－Ｒａｐｈｓｏｎ算法，开发了一套ＭｉｃｒｏｓｏｆｔＷｉｎｄｏｗｓ３．１的应用程序，实现修正的Ｎ－Ｒ重构算法的计算机模拟．通过深入的理论研究和细致的实验结果分析，对该算法性能作了全面的评价，并对其作了进一步改善     

放疗质控信息管理系统的本地化部署和初步应用

目的介绍开源放疗质控信息管理系统(QA Track+系统)及其本地化部署流程和初步应用情况。方法基于质控服务器软硬件系统配置,制定满足本中心需求的本地化部署策略,利用防火墙设置和分级设置确保服务器与各网络信息交互时的数据安全,利用Python语言编制个性化的质控管理序列。回顾性分析2019年11月至2020年7月美国瓦里安公司EDGE加速器日检质控数据,并以图表形式展示分析周期内日检指标的分布情况。结果QA Track+开源软件平台具有软硬件兼容性好,质控序列可编辑性强,数据网络结构安全性强等特点。结论可用于放疗中心质控项目的记录、批量存储与分析,以及基于先验知识为输入项的加速器性能指标趋势预测与分析等工作,可为其他放疗中心开展相关质控工作提供数据参考和技术支持。     

基于电子病历的表型分析方法及应用综述

目的：对基于电子病历的表型分析流程、主要方法、应用现状进行总结梳理，为后续相关研究提供借鉴。方法：通过关键词检索、参考文献回溯等方法在PubMed数据库中检索并经人工筛选后获得53篇文献，在此基础上总结了表型分析的一般流程，对表型定义及表型算法开发、验证和共享进行了综述，最后归纳了表型分析在临床研究中的应用现状。结果：表型分析的数据来源丰富，包括开放医学资源、结构化和非结构化电子病历数据等，表型算法开发的方法逐渐从基于规则开发向无监督学习开发转变，但目前电子病历数据的利用仍有很多挑战和困难有待解决。结论：今后应继续致力于提高数据的可信度，增加数据来源和种类以提升表型算法的效果，同时还应加强表型分析相关研究的共享和传播、扩大表型分析在临床研究中的应用。     

基于双聚类算法探测引文分析的知识基础及研究前沿

基于双聚类算法对引文分析相关的高被引文献及其来源文献同时聚类,从高被引论文(知识基础)出发,依据聚类模块选择与高被引论文簇关系最为密切的来源文献代表研究前沿,总结引文分析的知识基础和研究前沿,从而了解专题发展脉络,为科学研究提供参考方向。     

文献管理软件功能向开放型科研社交网络拓展的趋势

文献管理软件可以帮助科研工作者高效地获取、管理、阅读、分析、引用文献。随着互联网及社交网络的快速发展,文献管理软件也从单一的个人管理工具逐步向网络的、智能的、共享的、协作的开放型科研社交网络方向发展。从文献管理软件的基本功能入手,结合文献调研,分析了科研社交网络的特点,探讨了文献管理软件向开放型科研社交网络拓展的趋向。     

基于人工嗅觉的呈香物质识别方法

研究了人工嗅觉在物质识别中的应用，概述了使用模式识别辨别物质气味的基本原理，详细介绍了人工嗅觉系统的硬件设计，算法和软件实现方法，最后使用本系统对不同香气物质进行了识别，取得了较好的结果。     

Barriers to Open Source Software Adoption in Quebec’s Health Care Organizations

We conducted in-depth interviews with 15 CIOs to identify the principal impediments to adoption of open source software in the Quebec health sector. We found that key factors for not adopting an open source solution were closely linked to the orientations of ministry level policy makers and a seeming lack of information on the part of operational level IT managers concerning commercially oriented open source providers. We use the case of recent changes in the structure of Quebec’s health care organizations and a change in the commercial policies of a key vendor to illustrate our conclusions regarding barriers to adoption of open source products.     

基于UML状态图的测试用例自动生成方法

随着UML建模在软件开发中的广泛应用,基于状态图的测试用例自动生成方法逐渐成为规格说明测试中的重要研究方向。在研究了现有测试用例生成方法的基础上,提出了采用函数最小化思想,依据边界测试准则生成测试数据,采用深度优先策略及记忆化搜索高效地生成测试用例。实验结果显示该方法能以较少的测试用例达到较高的路径覆盖率。