他汀类药物对血同型半胱氨酸水平影响的meta分析

目的探讨他汀类降脂治疗对血同型半胱氨酸水平的影响及其临床意义。方法 计算机检索PubMed、EMBASE、Cochrane图书馆、Medline、CNKI、中国生物医学文献数据库和维普中文科技期刊等数据库,检索时间从建库至2013年所有他汀类药物对血同型半胱氨酸(homocysteine, Hcy)影响的随机对照试验(RCTs),由2名评价员独立筛选、评价文献和提取数据;应用系统评价软件R语言meta包对纳入研究进行加权定量合并,计算标准化均数差(standard mean difference, SMD)和95% CI,并绘制漏斗图来明确有无发表性偏倚。结果 共纳入26篇文献,32个研究,共计患者2451例。他汀类药物对Hcy影响的Meta分析结果显示: 与对照组相比,治疗组(在前者基础上加用他汀类药物)他汀类药物具有明显降Hcy作用(SWD=1.41,95%CI: 1.04～1.78,P<0.001);对不同他汀类药物进行亚组meta分析,提示各亚组效应与总效应方向一致。结论 他汀类药物能有效地降低患者的Hcy水平。     

糖尿病与前列腺增生的相关性分析

目的:分析糖尿病(DM)与前列腺增生(BPH)的相关性.方法:从Pubmed、Sciencedirect Online、Wiley Online library数据库以及手工检索出2018年6月30日之前以英语发表的关于DM及BPH相关性的研究.使用STATA软件进行Meta分析,随机效应模型用于计算混合比值比(OR)...     

麻醉方式与术后谵妄、术后认知功能障碍关系的Meta分析

目的:采用系统的文献回顾与Meta分析方法评价全身麻醉与局部麻醉对患者术后谵妄和术后认知功能障碍发生情况的影响。方法:以相应关键词系统搜索万方和维普中文数据库,同时检索MEDLINE,EMBASE,PsycINFO以及ISI Web of Knowledge英文数据库。对纳入的文献逐个进行评价,使用STATA 12.0进行meta分析。结果:共纳入16项研究。结果显示:全麻与局麻对于术后谵妄、术后认知功能障碍的效应合并值分别为:OR=0.85(95%CI=0.66,1.04),OR=1.38(95%CI=0.88,1.88)。全身麻醉可能会减少术后谵妄的发生,但增加术后认知功能障碍发生的风险。亚组分析表明骨科,泌尿科,心血管科和普外科效应合并OR和95%置信区间无明显差异。结论:此meta分析证明术后谵妄、术后认知功能障碍的发生和麻醉方式无关。     

基于双硫死亡的心肌缺血再灌注损伤相关风险基因筛选及分析

目的：筛选基于双硫死亡的心肌缺血再灌注损伤（myocardial ischemia reperfusion injury,MIRI）相关风险基因及探索其可能的作用途径。方法：用R语言limma分析并筛选MIRI相关风险基因24 h组与Control组之间的差异表达基因。基于GO和KEGG数据库利用R语言cluterProfiler包对其进行功能富集分析。根据双硫死亡基因集以及GSE160516的表达数据,利用R语言GSVA包中的ssgsea法对其进行富集分析,并利用Venn图获得心肌缺血再灌注中双硫死亡相关基因的表达。用R语言psych包中的corr.test计算双硫死亡相关基因与凋亡因子、线粒体、铁死亡及炎症等相关基因的相关性,并绘制热图。利用R语言Mfuzz包来进行不同时间点心肌缺血再灌注转录组数据的表达模式聚类分析并利用Venn图获取时序性差异表达的双硫死亡基因。结果：本研究共筛选出17个差异表达双硫死亡相关基因,经过双硫死亡相关基因与炎症、凋亡、铁死亡、线粒体基因相关性分析,以及双硫死亡相关基因与心肌缺血再灌注时序性分析的差异表达基因筛选,最终得到双硫死亡相关基因Flna、My...     

超声IOTA ADNEX模型对卵巢附件肿块诊断准确性的系统评价和Meta分析

目的 通过系统回顾和Meta分析评估IOTA ADNEX模型对卵巢附件肿块的诊断准确性.方法 使用Pubmed、Embase、Web of Science、Clinical Trials、中国知网和万方数据库进行文献检索,相关文献截止至2021年8月15日.根据纳入和排除标准筛选文献,并运用STATA16.0及RevM...     

COMMD7在脑低级别胶质瘤发生发展中作用机制的生物信息学分析

目的：通过生物信息学方法分析COMM域包含蛋白质7 (COMMD7)的表达水平与脑低级别胶质瘤（LGG）患者预后之间的关系,以期寻找脑LGG新的潜在生物标志物,并建立预后预测模型,为患者预后预测及个性化治疗提供依据。方法：从UCSC基因组数据库下载523个脑LGG样本和1 152正常样本的数据。采用Mann-Whitney U检验分析COMMD7在脑LGG样本和正常样本中的表达差异,并采用人类蛋白图谱（HPA）数据库进行验证。使用R语言的DESeq软件包对COMMD7低表达组和COMMD7高表达组脑LGG样本进行差异表达基因（DEGs）鉴定,采用R语言的pROC软件包进行受试者工作特征（ROC）曲线分析,采用单因素和多因素Cox回归分析COMMD7表达与脑LGG患者临床病理特征的关系及对脑LGG患者1、3和5年生存率的影响,采用R语言的ggplot2软件包构建森林图,采用R语言的RMS软件包和Survival软件包构建列线图和Calibration预测模型,采用比例风险回归模型分析COMMD7用于区分脑LGG样本和正常样本的诊断价值。采用GEPIA数据库及Oncolnc数据库进一步验证...     

对氧磷酶1基因Q192R多态性和缺血性脑卒中关系的系统评价

目的:使用系统评价方法评价对氧磷酶1基因Q192R多态性与缺血性脑卒中的关系。方法:广泛检索了中英文数据库以发现合格研究,使用随机或固定效应模型计算合并比值比(OR值),使用Q检验评估研究之间异质性,使用Egger's(埃格)检验和漏斗图评估发表偏倚。结果:总共23个研究纳入Meta分析,发现在所有人群中,对氧磷酶1基因Q192R多态性R等位基因或RR基因型增加了缺血性卒中发病风险(192 R等位基因:OR:1.21,95%CI:1.08～1.35,P=0.0009;192 RR基因型:OR:1.25,95%CI:1.06～1.49,P=0.009)。结论:现有的证据表明,Q192 R多态性(主要是R等位基因和RR基因型)增加了缺血性卒中的发病风险,该结论需大样本进一步研究验证。     

附加轮廓线漏斗图的绘制在R软件中的实现

目的介绍附加轮廓线漏斗图在R软件中的实现及应用。方法对实例中的数据采用R软件“meta”扩展包的funnel（ ）和trimfill（ ）函数绘制附加轮廓线漏斗图,并判断缺失研究分布的区域。结果通过观察附加轮廓线漏斗图,可以发现存在不对称,缺失数据分布在无统计学显著性区域,表明存在发表偏倚。结论附加轮廓线漏斗图可以用来帮助判断漏斗图不对称是发表偏倚还是其他原因导致。     

实施基本药物制度对抗菌药物使用影响的Meta分析

目的系统评价实施基本药物制度对抗菌药物使用的影响。方法检索中国学术文献总库、维普期刊全文数据库两大中文数据库,全面收集有关基本药物制度实施前后抗菌药物使用情况的研究,运用RveMan 4.2软件对纳入文献进行Meta分析,并对结果进行敏感性分析,用倒漏斗图进行发表偏倚分析。结果本研究共纳入符合要求的文献16篇,随机效应模型的Meta分析得出,合并效应值OR值为0.74,其95%CI为(0.57,0.94),P<0.05;倒漏斗图提示发表偏倚较小。结论可以初步认为基本药物制度的实施在一定程度上减少了抗菌药物的滥用。     

R软件metamisc程序包在Meta分析中的应用

R是当前国际最受欢迎的软件之一,在Meta分析方面应用广泛且功能强大。metamisc程序包是Thomas Debray等基于经典统计学方法研发的用于实现诊断准确性资料Meta分析的程序包,该程序包具备实现汇总敏感度和特异度、亚组分析、回归分析等功能。本文结合实例对R软件metamisc程序包实现诊断准确性数据Meta分析的方法进行详细介绍。     

Stata在Meta分析中的应用

Stata是一个功能强大而又小巧玲珑的统计分析软件，其Meta分析功能十分全面。本文结合3个实例介绍了Stata软件对二分类变量、连续性变量和生存分析等所涉及的Stata命令及输出结果。和Review Manager相比．Stata可更个性化、更高效专业地完成Meta分析，且更易于为高影响力杂志所认同。     

DNA修复基因XPC单核苷酸多态性与膀胱癌易感性的meta分析

【目的】用Meta分析的方法探讨DNA修复基因XPC单核苷酸多态性与膀胱癌的易感性。【方法】计算机检索Pubmed数据库、Embase数据库、中国生物医学文献数据库（CBM）收集关于DNA修复基因XPCAla499Val及Lys939Gln单核苷酸多态性与膀胱癌易感性的病例对照研究进行Meta分析,以野生基因型为参照,病例组及对照组XPC499Val、939Gln等位基因分布的比值比（OR）为效应指标,应用Meta分析软件Stata9．0对各研究原始数据进行统计处理及异质性检验,计算合并OR值及95％CI。【结果】按照纳入标准,最终进人Meta分析的文献共有7篇。Meta分析结果显示,XPC499Val／Val突变纯合子的个体发生膀胱癌的风险要高于对照组（合并OR=1．31;95％CI：1．06～1．62）。而XPC939Gin／Gin与膀胱癌之间无显著相关性。【结论】XPCAla499Val多态性与膀胱癌易感性之间存在相关,即携带突变型基因纯合子499Val／Val的个体发生膀胱癌的危险性较高。     

累积Meta分析在Stata中的实现

累积Meta分析是指在研究领域中按时间次序及时地进行新的Meta分析的过程。应用Stata的metacum命令可以轻松地实现累积Meta分析,以网络数据为例,详细介绍Stata进行累积Meta分析的具体操作过程。     

survivin蛋白在乳腺癌中表达水平及与cerbB-2关系的Meta分析

目的系统评价存活蛋白(survivin)表达水平在乳腺癌(breast cancer)中表达水平及与人表皮生长因子受体2(cerbB-2)关系。方法计算机检索Cochrane Libtary(2011年第1期),PubMed、CNKI等数据库,并辅以手工检索,按照纳入与排除标准选择病例对照试验,评价质量及提取资料后采用Stata 11.0软件对数据库进行系统评价。结果共纳入16项研究,其中1330例乳腺癌患者,325例正常对照。Meta分析结果显示:survivin在乳腺癌组及正常对照组[比值比(odds ratio,OR)=51.34,95%可信区间(confidence interval,CI)=29.85-88.30]的表达差异具有统计学意义(P<0.05)。进一步生存分析显示,survivin阳性表达的乳腺癌患者5年生存率明显低于阴性者(OR=8.25,95%CI=1.89-35.96,P<0.05)。Spearman等级相关分析显示,survivin与cerbB-2蛋白阳性率在乳腺癌中表达具有相关性(r=0.275,P<0.05)。结论 survivin在乳腺癌中高表达,降低了乳腺癌患者5年生存率,同时survivin与cerbB-2在乳腺癌表达也有一定的相关性。     

多不饱和脂肪酸预防心房颤动复发的荟萃分析

目的: 系统评价多不饱和脂肪酸（polyunsaturated fatty acids,PUFA）预防房颤复发的有效性。方法: 检索Medline、EMBASE、Elsevier、Cochrane等数据库,收集PUFA预防房颤复发的随机对照试验（RCT）,2位研究人员独立检索和评价文献,应用RevMan 5.0和Stata 10.0进行数据统计学处理。结果： 6项RCT研究共包括1 839例患者纳入该荟萃分析。结果提示PUFA治疗并不能预防阵发性房颤及持续性房颤复律后复发（RR=0.96,95%CI为0.75~1.22,P=0.74）,亚组分析发现,复律及随访前PUFA治疗至少28 d 的亚组中,PUFA能明显减少随访过程中房颤的复发（RR=0.720,95%CI为0.622~0.835,P<0.01）。结论： 荟萃分析结果显示PUFA治疗不能降低房颤复发率。     

非参数剪补法在Stata中的实现

剪补法旨在识别和校正由发表偏倚引起的漏斗图不对称性。以文献中的数据为例,介绍非参数剪补法在Stata中的实现过程。     

Stata在中医完全随机实验设计中的应用

目的:应用Stata统计软件进行完全随机实验设计。方法:应用Stata软件中的命令完成。结果:采用Stata中的swor、group、replace命令进行完全随机实验设计中的等概率与不等概率的分组,对比手工分组与excel分组。结论:Stata软件好学易用,操作简单,可重复性高。     

无对照二分类资料的Meta分析方法及Stata实现

目的介绍无对照二分类资料Meta分析方法及在Stata软件中的操作步骤。方法首先介绍3种数据类型无对照二分类资料Meta分析的原理及方法,再用Stata软件对3个实例数据进行Meta分析。结果无对照二分类资料Meta分析的关键是选择服从正态分布或可转化为正态分布的指标。3个实例数据经正态转换后进行Meta分析,结果与原文一致。结论Stata软件可实现无对照二分类资料（含患病率、发病密度和比值）的Meta分析,操作简单,实用性强。     

高迁移率族蛋白B1水平与系统性血管炎相关性的Meta分析

目的 系统评价高迁移率族蛋白B1(high mobility group box 1,HMGB1)与系统性血管炎(systemic vasculitis,SV)的相关性,为评估HMGB1对SV诊断及疾病评估的临床价值提供依据.方法 计算机检索PubMed、Medline、Web ofscience、Corchrane ...