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相似文献
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1.
目的 探讨自发性高血压大鼠延髓microRNA(miRNA)差异表达谱及其靶基因生物信息学分析。 方法 采用自发性高血压大鼠模型(SHR组),同周龄SD大鼠为对照组(Control组)。利用miRNA芯片检测大鼠延髓中miRNAs差异表达谱。 结果 与对照组比较,SHR组尾动脉收缩压显著升高(P<0.0001);SHR组延髓组织miRNAs有显著差异表达谱,16个miRNAs表达上调和7个miRNAs表达下调(1.5-fold change cutoff, P<0.05)。qRT-PCR验证结果显示,与对照组比较,SHR组延髓miR-153、miR-193及miR-301a表达显著下降,与芯片结果一致。生物信息学分析显示,差异表达miRNAs可能调控2775个靶基因(target score≥83)。这些靶基因主要富集在12个信号通路,包括磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphatidylinositide3-kinase,PI3K)通路等。 结论 自发性高血压大鼠延髓组织中miR-153、miR-193及miR-301a明显下调,且生物信息学分析提示PI3K通路介导神经炎症可能作为高血压中枢相关差异表达miRNAs调控靶基因介导的主要致病通路。  相似文献   

2.
目的探讨miR-17-5p对卵巢癌SKOV3细胞增殖的影响及可能机制。方法将卵巢癌SKOV3细胞分为miR-17-5p模拟物组、miR-17-5p阴性对照组及空白对照组,将miR-17-5p模拟物转染至miR-17-5p模拟物组细胞,阴性对照组细胞转染无关序列,空白对照组细胞不作任何处理,采用real time PCR方法验证其转染效率,用MTT方法检测转染后各组SKOV3细胞的增殖能力变化。采用双荧光素酶报告基因验证P21是否为miR-17-5p的靶基因,real-time PCR与Western blot实验分别检测各组细胞P21m RNA和蛋白表达水平。结果与对照组相比,miR-17-5p模拟物组SKOV3细胞miR-17-5p表达水平显著升高,但细胞增殖能力显著降低。双荧光素酶报告基因分析结果显示,P21为miR-17-5p的靶基因;过表达miR-17-5p后,P21m RNA及蛋白表达水平显著降低(P0.01)。结论 miR-17-5p抑制卵巢癌SKOV3细胞的增殖可能与下调P21的表达相关。  相似文献   

3.
目的明确衰老相关microRNA与恒河猴增龄的相关性。方法将猴群参照人类增龄划分为幼年、成年、老年和长寿,提取外周血白细胞的总RNA;用real-time PCR检测外周血白细胞中的microRNA及VEGFA、GHR、TBP、INSR、CLOCK、IKBKB、PIK3R1、LRP2、SSTR3、IGF1R、BCL2、PPM1D、IRS1、MAPK8、ADCY5、APP、NFE2L1、BDNF和PEX5的表达;利用microRNA靶基因预测网站miRwalk、TargetSan、miRecords、miRDB预测miR-16-5p的靶基因,并与人类衰老基因库(http://genomics.senescence.info/)对接。结果在增龄过程中,恒河猴外周血白细胞中miR-16-5p的表达量随年龄增长而增加(P0.001);多个网站对miR-16-5p靶基因预测得到539个潜在的靶基因,与人类衰老基因组库对接后有19个基因重合;有10个基因的mRNA在恒河猴增龄过程中存在差异表达,其中, IKBKB、PIK3R1、IRS1的表达随着年龄的增加逐渐下降。结论在自然衰老恒河猴的外周血白细胞中,miR-16-5p及其靶基因IKBKB、PIK3R1、IRS1能作为外周血衰老候选标志物。  相似文献   

4.
目的 应用miRNA芯片技术筛选压应力下人软骨终板细胞中差异表达的miRNAs,研究与压应力相关的miR-22并进行生物信息学分析,探讨其对靶基因MMP-1的调控。方法 将6个月意外流产胎儿软骨终板进行软骨终板细胞的分离、培养。将第2代软骨细胞按实验要求种板培养并随机分为加压组与对照组。加压组施加周期性压力(5 MPa,6 h×5 d),使用TRIzol法提取各组RNA,miRNA芯片检测miRNA表达情况,然后用Realtime PCR(RT-PCR)对差异表达miR-22进行验证。通过靶基因预测软件预测MMP-1与miR-22基因的关系,miR-22 mimics脂质体转染Hela细胞后通过RT-PCR进一步验证。结果 芯片扫描结果显示加压组miR-22下调明显。RT-PCR检测显示压应力下人软骨终板细胞miR-22表达显著降低。miR-22 mimics转染目标细胞48 h后,miR-22的表达显著增高,同时MMP-1基因表达显著降低。结论 压应力下miR-22异常表达,miR-22可靶向负调控与软骨终板细胞退变相关的MMP-1基因。  相似文献   

5.
罗雅妮  熊轶 《解剖学研究》2023,(2):143-148+152
目的 探讨中重度哮喘生物标志物和致病机制,为更有效的中重度哮喘治疗和控制提供线索。方法 采用microRNA芯片检测中重度哮喘患者与轻度哮喘患者血清中的差异表达microRNA。通过miRanda,TargetScan,RNAhybrid和miRTarbase数据库对microRNA的靶基因进行预测,并使用GO功能聚类分析和KEGG信号通路富集分析对microRNA的靶基因进行功能解析。使用qRT-PCR检验慢性哮喘小鼠肺组织中microRNA的含量。结果 与轻度哮喘患者相比,miR-4746-3p、miR-6798-5p和miR-762等在中重度哮喘患者血清中上调,而miR-26a-5p、miR-377-3p和miR-410-3p等下调。与轻度哮喘相比,慢性炎症调控、脂质吸收、储存、分解代谢功能及PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路、TOR复合体等细胞增殖相关通路在中重度哮喘中显著富集。此外,慢性哮喘模型鼠呈现出与重度哮喘患者类似的病理表型如炎性细胞浸润与气道重塑,且miR-377-3p和miR-410-3p在慢性哮喘小鼠肺组织中也显著下调。结论 我们的研究提供了中重度哮喘可能的...  相似文献   

6.
目的: 筛选T细胞活化相关的microRNA并预测其靶分子,通过双荧光素酶实验鉴定这些microRNA的靶分子方法: 利用Exiqon miRNA基因表达谱芯片,以活化的Jurkat细胞(用CD3抗体和CD28抗体双信号活化)为实验组,未活化Jurkat细胞为对照组,分析了二者miRNA表达谱的差异,找出表达水平显著改变的miRNA,并通过实时定量PCR的方法对芯片结果进行验证;构建miRNA的真核表达载体;利用生物信息学方法预测miRNA的靶分子,构建含靶分子3′UTR的荧光素酶报告基因质粒;分别将miRNA基因真核表达质粒与含有靶分子的荧光素酶报告基因质粒共转染HEK293细胞,进行荧光素酶实验来鉴定miRNA的靶分子结果: Exiqon miRNA基因表达谱芯片显示: Jurkat细胞活化后,miR-202*、 miR-33b、 miR-568和miR-576的表达明显下调;实时定量PCR验证结果与芯片结果一致;酶切鉴定与序列测定证实miR-568的真核表达载体构建成功;利用miRanda软件预测miR-568的靶分子,筛选出与T细胞活化密切相关的分子;双荧光素酶实验显示miR-568对NFAT5有比较明显的抑制作用结论: T细胞活化后,miR-202*、 miR-33b、 miR-568和miR-576表达明显下调;NFAT5可能是miR-568作用的一个靶分子  相似文献   

7.
目的应用非标记microRNA芯片筛选在早产胎盘组织中差异表达的miRNA,并分析其相关的靶基因。方法收集早产儿16例为病例组,同期健康足月产儿18例为对照组,取胎盘组织。通过非标记miRNA芯片技术构建早产胎盘组织miRNA表达谱,采用荧光实时定量PCR进行验证,并分析差异表达miRNAs的靶基因。结果 miRNA芯片结果显示44种miRNAs在早产胎盘组织和对照组胎盘组织中差异表达,其中下调表达的11种,上调表达的33种,荧光实时定量PCR验证出miR-493-3p显著下调,mi R-4632-5p显著上调,与芯片结果一致。经软件分析,miRNA靶基因有IL16、SH2D2A、CCNG2、PHB、WNT1、CCDC92、GIT1和ST7L等相关靶基因。结论早产胎盘组织中存在差异表达的miRNAs,提示这些差异表达的miRNAs在早产的发生中有重要的调控作用。  相似文献   

8.
目的探讨miR-21是否能够通过靶向抑制FasL基因调控人骨肉瘤MG-63细胞的增殖。方法利用荧光素酶报告基因实验验证FasL基因是否为miR-21的靶基因,应用阳离子脂质体Lipofectamine~(TM)2000将miR-21 mimics或inhibitor转染至MG-63细胞,利用real-time PCR和Western blotting分析转染后MG-63细胞FasL m RNA和蛋白表达的变化,通过MTT法分析转染后MG-63细胞增殖水平变化。结果荧光素酶报告基因实验证实FasL基因为miR-21的靶基因。与对照组相比,转染miR-21 mimics后,MG-63细胞FasL mRNA与蛋白的表达均显著降低,增殖能力明显升高(P0.01);与对照组相比,转染miR-21 inhibitor后,MG-63细胞FasL mRNA与蛋白的表达均显著升高,增殖能力明显降低,P0.01。结论 miR-21可能通过靶向FasL基因促进人骨肉瘤MG-63细胞增殖。  相似文献   

9.
目的探讨miR-181b-5p在食管癌患者外周血中表达水平的变化,评价其在食管癌患者的诊断和预后评估的临床意义。方法收集34例食管癌患者和26名健康志愿者全血标本,分为食管癌组和正常对照组;对白细胞总RNA的miRNA芯片结果进行分析;筛选单一miRNA候选指标并用RT-q PCR法进行验证。结果与正常对照组相,比食管癌组miR-181b-5p表达水平下调。结论 miR-181b-5p在食管癌中表达下调,可能与食管癌的发生、发展相关。  相似文献   

10.
目的筛选新疆地区维吾尔族人群原发性高血压(EH)患者与健康者血浆中microRNA差异表达谱,为进一步探究microRNA与新疆维吾尔族人群原发性高血压发病的关系提供依据。方法选取4例维吾尔族原发性高血压患者和4名维吾尔族健康人的全血,用Agilent Human miRNA芯片检测血浆microRNA表达谱。对差异表达的microRNA进行聚类分析、靶基因预测、靶基因注释等生物信息学分析。另外选取独立验证样本(15例维吾尔族原发性高血压患者及15名维吾尔族健康人),对差异表达的microRNA进行q PCR验证。结果实验组与对照组相比,筛选获得257个差异表达microRNA,其中161个上调表达,97下调表达。通过Target Scan、PITA、microRNAorg数据库对差异表达microRNA进行靶基因预测,对3个数据库预测到的靶基因取交集,获得6 580个microRNA调控的靶基因系。最终筛选得到表达上调最多和下调最多的两个microRNA,hsa-miR-1183和hsa-miR-30e-5p。结论原发性高血压患者有着独特的microRNA表达谱,筛选获得的差异表达microRNA,可能是原发性高血压早期诊断的生物标志物和潜在的治疗靶点,同时对于后续研究原发性高血压的发病机制具有提示作用。  相似文献   

11.
目的:探讨微小RNA-21(micro RNA-21,miR-21)对人正常结肠上皮细胞系NCM460中紧密连接相关蛋白——闭合蛋白(occludin)表达的影响,并分析其可能的靶基因。方法:利用miR-21过表达慢病毒建立miR-21过表达NCM460细胞系,q PCR检测miR-21表达水平,Western blot检测occludin表达情况。生物信息学方法预测miR-21的靶基因,根据评分和文献检索选择相应靶基因ROCK1进行进一步研究,利用miR-21 mimic和inhibitor转染NCM460细胞,同时检测miR-21以及ROCK1的表达水平;采用双萤光素酶报告基因实验验证ROCK1是miR-21的靶基因。结果:在NCM460细胞中过表达miR-21后可上调紧密连接相关蛋白occludin的表达。生物信息学分析预测ROCK1可能为miR-21的靶基因。在NCM460细胞中过表达miR-21可下调ROCK1的m RNA和蛋白水平,抑制miR-21可上调ROCK1的m RNA和蛋白水平。萤光素酶报告基因验证ROCK1为miR-21的靶基因。结论:在NCM460细胞中,miR-21能上调肠屏障功能相关蛋白occludin的表达。ROCK1是miR-21的靶基因,miR-21可能通过靶调控ROCK1促进occludin的表达。  相似文献   

12.
目的探讨微小RNA21(miR-21)对博莱霉素诱导的大鼠肺纤维化的影响及相关机制。方法收集特发性肺纤维化(IPF)患者及正常人的外周血各20份,采用荧光实时定量PCR检测miR-21表达。将45只SD大鼠随机分为对照组、miR-21激动剂(miR-21agomir)和miR-21拮抗剂(miR-21antagomir)组,每组15只。经气管内注入博莱霉素A5建立肺纤维化模型后,分别给予生理盐水、miR21 agomir、miR21 antagomir尾静脉注射,第28天处死所有大鼠。取出肺组织,行HE和Masson染色,通过荧光实时定量PCR和Western blot法分别检测含1型血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶(ADAMTS-1)、1型胶原蛋白(Col1)、Col3 mRNA与蛋白表达,分离血清,ELISA检测血清1型前胶原蛋白羧基端前肽(P1CP)和3型前胶原蛋白氨基端前肽(P3NP)的含量。结果 IPF患者外周血miR-21表达水平明显高于正常人。miR-21 agomir组大鼠肺泡炎和肺纤维化程度明显重于对照组,而miR-21 antagomir组大鼠肺泡炎和肺纤维化程度显著轻于对照组。与对照组相比,miR-21 agomir组ADAMTS-1mRNA与蛋白表达水平降低,Col1、Col3的mRNA与蛋白表达水平及血清P1CP、P3NP水平均增加。但miR-21 antagomir组ADAMTS-1 mRNA与蛋白表达水平较对照组升高,Col1、Col3的mRNA与蛋白表达水平及血清P1CP、P3NP含量较对照组减少。结论 miR-21促进博莱霉素诱导的大鼠肺纤维化进展,其机制可能与下调ADAMTS-1表达及随后增加肺组织Col1、Col3含量有关。  相似文献   

13.
目的通过检测急性缺血性脑卒中患者与健康对照人群外周血中miR-122及miR-409表达水平,探讨两者在急性缺血性脑卒中诊断和预后判断中的作用。方法 GEO数据库下载GSE55937表达谱数据,应用GEO2R在线工具筛选差异microRNA。收集132例急性缺血性脑卒中患者及103例健康人群外周血,采用RT-PCR法检测外周血中miR-122和miR-409表达水平,并对miR-122和miR-409行ROC曲线分析,分析两者与急性缺血性脑卒中的发病关系。将急性缺血性脑卒中患者分为预后不佳组(MRS 3-6)和预后良好组(MRS 0-2),分析两microRNA在两组之间的表达差异。结果急性缺血性脑卒中患者外周血中miR-122表达水平较正常对照组外周血明显升高(1.89±0.18 vs 1.42±0.19,P0.01),而miR-409表达水平较正常对照组外周血明显降低(0.73±0.12vs1.45±0.20,P0.01)。miR-122及miR-409 ROC曲线下面积分别为0.781、0.798。预后不佳组对比预后良好组的miR-122表达(2.00±0.34 vs 1.40±0.53,P0.05)明显上调,而miR-409则下调(0.64±0.19 vs 1.52±0.46,P0.01)。结论外周血miR-122和miR-409异常表达可能与急性缺血性脑卒中相关,对急性缺血性脑卒中患者的临床诊断和预后判断具有潜在的应用价值。  相似文献   

14.
目的:探讨周围神经损伤时,微小RNA-21(microRNA-21,miR-21)与雪旺细胞(SC)凋亡的关系及相关分子机制。方法:采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)检测动物模型中miR-21以及人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源基因(phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome 10,PTEN)的表达情况;通过将miR-21类似物(miR-21-mimic)、miR-21抑制物(miR-21-inhibitor)和阴性对照miRNA(negative control miRNA,NC-miRNA)转染入RSC96细胞中,构建出过表达miR-21的雪旺细胞株(MI-SC)、抑制miR-21表达的雪旺细胞株(IN-SC)及表达对照miRNA的雪旺细胞株(NC-SC);采用流式细胞仪检测3组细胞的凋亡情况;real-time PCR检测3组细胞中miR-21以及PTEN的表达情况;Western blot检测3组细胞中PTEN及凋亡相关蛋白激活型caspase-3(cleaved caspase-3)的表达情况。结果:神经损伤组miR-21的表达量与对照组相比明显升高,神经损伤组PTEN mRNA的表达水平与对照组相比明显降低;与NC-SC相比,上调miR-21组细胞的凋亡比例减少,PTEN mRNA及蛋白的表达水平降低,cleaved caspase-3的表达水平降低,下调miR-21组细胞的凋亡比例增加,PTEN mRNA及蛋白的表达水平升高,cleaved caspase-3的表达水平升高(P0.05)。结论:miR-21可能通过下调PTEN的表达抑制雪旺细胞的凋亡,从而可能在周围神经的损伤修复中发挥作用。  相似文献   

15.
肝脏内源性microRNA调控乙型肝炎病毒基因的表达与复制   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的探讨肝脏内源性microRNA对乙型肝炎病毒(HBV)复制与基因表达的影响。方法通过miRNA靶点分析软件寻找与HBV序列之间相关联的肝脏内源性microRNA,体外化学合成相应的microRNA分子,将合成寡核苷酸及对照与1.3倍HBV全基因组真核表达质粒pUC18-HBV1.3采用Lipofectamine2000共转染HepG2细胞,转染48h后收集细胞培养上清;通过ELISA检测HBsAg、HBeAg的表达水平;Western印迹检测HBcAg的表达水平;Trizol抽提转染细胞RNA,逆转录后用荧光定量PCR检测HBVmRNA的水平;提取细胞基因组DNA,Southern印迹检测HBV的复制中间体。经以上检测从HBV蛋白表达、转录和复制水平评价相应的microRNA作用效应。结果生物信息学方法提示miR-16和miR-122存在与HBV基因组作用的可能结合位点。经试验初步证实miR-16可下调HBV蛋白的表达及HBVDNA水平;miR-122可下调HBsAg、HBeAg的表达,上调HBVmRNA的水平。结论肝脏内源性microRNA可以调节HBV的复制与基因表达。  相似文献   

16.
目的:检测microRNA-218(miR-218)在人急性淋巴细胞白血病T淋巴细胞(CCRF-CEM)中的表达情况和其对细胞生物学特性的影响,并观察miR-218对靶基因c-kit表达的影响,为人白血病治疗提供新方法和新策略。方法:利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)检测miR-218在正常人外周血T淋巴细胞和CCRF-CEM中的表达情况。在CCRF-CEM细胞中转染miR-218 mimic后48 h,qRT-PCR检测CCRF-CEM细胞中miR-218表达变化;MTT检测miR-218对CCRF-CEM细胞活力的影响。流式细胞仪分析miR-218对细胞CCRF-CEM的细胞周期和凋亡的影响。利用荧光报告酶系统检验c-kit是miR-218调控靶基因,并采用Western blot方法检测miR-218对CCRF-CEM细胞中KIT蛋白表达的影响。结果:qRT-PCR检测结果显示:与正常人外周血T淋巴细胞相比,miR-218在CCRF-CEM细胞系中的表达显著下降(P0.01)。与对照组相比,在CCRF-CEM中转染miR-218 mimic 48 h后,细胞中miR-218的表达显著上升(P0.01)。MTT结果显示:在CCRF-CEM细胞中过表达miR-218后,细胞活力显著下降(P0.05)。流式细胞仪分析结果显示:过表达miR-218后,miR-218mimic转染组细胞的S期细胞比例明显下降(P0.01);细胞的凋亡显著增加(P0.01)。荧光素酶报告基因系统检测结果显示:与对照组相比,转染miR-218 mimic组的相对荧光素酶活力显著降低(P0.01)。Western blot检测结果显示:与对照组相比,在CCRF-CEM中转染miR-218 mimic 48 h后,细胞中KIT蛋白的表达显著下降(P0.01)。结论:miR-218在人急性淋巴细胞白血病T淋巴细胞(CCRF-CEM)中表达下调,miR-218可负性调节KIT蛋白的表达,并抑制CCRF-CEM细胞增殖,促进凋亡。增强miR-218表达的治疗策略有望使白血病患者受益。  相似文献   

17.
目的研究大鼠坐骨神经损伤以后短时间背根神经节组织中microRNA(miRNA)的表达变化。方法采用miRNA芯片检测神经损伤0 h(对照组)、3 h和9 h(实验组)背根神经节组织miRNA的表达情况,应用real time Taqman PCR对芯片结果进行验证。结果损伤3 h实验组与对照组比较发生上调和下调1.3倍以上的miRNA分别有4个和2个,损伤9h实验组与对照组比较发生上调和下调1.3倍以上的miRNA分别有7个和5个,real time Taqman PCR检测miR-188和miR-500的表达变化与芯片一致。结论大鼠坐骨神经损伤3h和9h后背根神经节组织中miRNA的表达谱发生改变。  相似文献   

18.
目的 研究肠道病毒71型(EV71)感染神经细胞的miRNA表达谱,探讨miRNA在病毒感染神经细胞中的可能作用.方法 建立EV71感染人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)模型,收集感染后48 h细胞.以Taqman低密度芯片检测miRNA表达谱,使用实时RT-PCR对芯片结果进行验证并在TargetScan和miRanda网站预测靶基因,采用GO和KEGG分析靶基因功能.结果 成功建立EV71感染SH-SY5Y细胞模型,通过低密度芯片筛选出215种显著升高的miRNA和25种显著下调的miRNA.经过RT-PCR验证,3种miRNA(MiR-10a*、miR-15b*和miR-195)显著下调,7种miRNA(miR-10a、miR-342-5p、miR-483-5p、Let-7b、miR-99a、miR-140-5p和miR-21)显著上调,与芯片结果相符.GO分析显示发展进程和信号调节条目最富集靶基因.KEGG路径分析显示靶基因在肿瘤路径、蛋白水解、Wnt信号传导、黑素形成、粘附连接、MAPK信号通道最富集.结论 EV71感染神经细胞48 h后miRNA表达谱发生改变,10种变化的miRNA靶基因预测在发展进程、信号传导及凋亡中起着重要的作用,可为后期机制研究提供参考.  相似文献   

19.
<正>microRNA在肿瘤细胞的发生、发展过程中均发挥着重要作用,包括控制其增殖与凋亡[1-2]。microRNA-21(miR-21)是具有自主转录单位的微小RNA[3],已有研究表明肿瘤组织miR-21的高表达与疾病的预后呈负相关[4]。为深入发掘miR-21其他的靶基因及其生物学作用,前期的研究中我们构建了可高表达miR-21小分子的重组腺病毒载体[5],本研  相似文献   

20.
目的 探讨外周血miR-200c水平对移植异基因造血干细胞后急性移植物抗宿主病(aGVHD)发生的预测作用。方法 选择2014年1月至2018年10月在昆明医科大学第一附属医院血液科行异基因造血干细胞移植(Allo-HSCT)的51例患者作为研究对象,根据移植后是否发生aGVHD原则分为实验组(发生aGVHD)33例、对照组(未发生aGVHD)18例。抽取肘部外周血5 mL,RT-qPCR检测两组miR-200c,分析两组miR-200c表达差异。结果 两组患者均移植成功,且恢复造血功能,恢复时间为18 d,其中33例发生aGVHD,18例未发生aGVHD,发生率为64.71%;实验组在移植前、移植后7、14、及72 d时,miR-200c表达均低于对照组(P<0.05);aGVHD发生后外周血中miR-200c显著低于发生前(P<0.001);与aGVHDⅠ度相比,aGVHDⅡ度患者外周血中miR-200c表达下调(P<0.05),与Ⅱ度相比,aGVHDⅢ度患者外周血中miR-200c表达下调(P<0.001);miR-200c高表达组患者2年总生存率高于低表...  相似文献   

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