云南汉族ATP2B1基因标签SNPs与原发性高血压的关系

目的探讨Ⅰ型细胞膜钙离子转运酶(ATP2B1)基因标签单核苷酸多态(SNPs)与云南汉族原发性高血压(EH)的相关性。方法用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法,检测1020例云南汉族人(EH组和对照组各510例)ATP2B1基因12个标签SNPs(rs10506974、rs10506975、rs2854371、rs957525、rs3741895、rs2681472、rs2070759、rs12423192、rs1050395、rs11105357、rs11105358和rs7975689)和ATP2B1基因附近区域的rs17249754位点的多态性。结果 rs17249754位点基因型和等位基因频率在EH组和对照组间的分布均具有显著性差异(P0.01),Logistic回归分析发现,rs17249754位点AA基因型和A等位基因使EH患病风险显著性降低(OR=0.60,95%CI 0.40~0.89,校正P0.05;OR=0.73,95%CI 0.60~0.88,校正P0.01)。结论 ATP2B1基因附近区域rs17249754位点与云南汉族人群EH相关,rs17249754 A等位基因可能是降低云南汉族EH风险的保护因子。     

VEGF基因单核苷酸多态性与中国北方汉族人SLE易感性的相关性研究

目的:研究血管内皮生长因子(VEGF)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国北方汉族人系统性红斑狼疮(SLE)易感性的相关性。方法:应用Sequenom飞行时间质谱技术检测44例SLE患者和100例正常对照者外周血VEGF基因的SNPs,选择6个VEGF基因的SNP位点:rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035和rs833070进行基因分型,用SPSS 11.5软件对数据资料进行统计分析。结果:SLE患者VEGF多态性位点rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035的基因型频率及等位基因频率与正常对照组比较差异无统计学意义(P0.05);VEGFrs833070 A等位基因频率明显高于对照组(31.2%vs20%,χ2=4.547,P=0.033,OR=1.818,95%CI 1.045-3.162)。rs833070 G等位基因在SLE组中关节炎与无关节炎组中频率有显著差异(56%vs80.4%,χ2=5.613,P=0.018,OR=0.336,95%CI 0.134-0.843),rs833070 GG基因型频率明显低于无关节炎组(GGvsAG+AA:28%vs65.2%,χ2=6.684,P=0.010,OR=0.207,95%CI 0.061-0.705),而VEGF rs833070位点基因型、等位基因型的频率与患者血清中ds-DNA抗体、抗Sm抗体、狼疮性肾炎、间质性肺疾病的发生无相关性(P0.05)。结论:VEGF基因SNP点rs833070与北方汉族人SLE发病易感性相关,rs833070位点A等位基因可能增加了SLE患病的易感性,而rs833070 GG基因型及G等位基因型可能是SLE合伴关节炎的保护性基因。     

CDKAL1基因rs4712523多态性与内蒙古地区汉族人群2型糖尿病相关

目的 研究内蒙古地区汉族人群CDKAL1基因rs4712523单核苷酸多态性(SNP)的等位基因和基因型频率分布与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 采用等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR),对382例内蒙古地区汉族人(其中T2DM组192例,对照组190例)rs4712523进行基因分型.结果 T2DM组中rs4712523的G等位基因频率和GG基因型频率分别为47.4％和6.3％,均显著高于对照组的35.3％和3.2％(P＜0.05).G等位基因携带者患T2DM的风险是A等位基因的1.654倍(OR=1.654,95％ CI=1.237-2.212).结论 CDKAL1基因rs4712523多态性位点的G等位基因可能是内蒙古地区汉族人T2 DM的易感基因之一.     

FcRL3基因单核苷酸多态性与中国汉族强直性脊柱炎相关性研究

目的 探讨Fc受体样基因3(FcRL3)部分单核苷酸多态性(SNP)在中国汉族强直性脊柱炎(AS)发病中的作用.方法 选取AS患者160例,健康对照组170例.用Mass-ArrayTM SNP检测仪对FcRL3基因上的SNP位点:FcRL3-1(rs0158440)、FcRL3-2(rs2225828)、FcRL3-3(rs7528684)、FcRL3-4(rs11284799)、FcRL3-5(rs945635)、FcRL3-6(rs3761959)、FcRL3-7(rs2210913)、FcRL3-8(rs2282284)、FcRL3-9(rs2282283)SNP进行检测.单倍型构建采用PHASEv2.1软件完成.结果 在AS组中FcRL3-1-1651C、FcRL3-3-169C、FcRL3-6 Intron3A、FcRL3-7 Intron3A等位基因频率病例组高于对照组;FcRL3-2-641C、FcRI3-4-110A、FcRL3-9 Intron15A等位基因频率病例组低于对照组;FcRL3-6、FcRL3-5和FcRL3-8SNP等位基因两组比较差异无统计学意义.AS组中单倍型FcRL3-1→9 CTCGCAAAA、CCCGGGGAA、CCCGCAAAC、CTCGCAAAC频率明显高于对照组;FcRL3-1→9 CCTGGGGAA和TCCACAAGA频率明显低于对照组.结论 FcRL3基因与中国汉族AS的易感性相关.     

强直性脊柱炎与IL-23R基因多态性关联的Meta分析

探讨IL-23R基因多态性与中国人群强直性脊柱炎的相关性。系统检索PubMed、FMJS、CNKI及万方数据库有关IL-23R基因多态性与强直性脊柱炎相关的病例对照研究,应用ReveMan 5.2软件进行Meta分析。本研究共纳入IL-23R基因多态性与强直性脊柱炎相关文献9篇。Meta分析结果显示:IL-23Rrs1004819(OR=1.02,95%CI:0.90~1.14)、rs11209032(OR=0.91,95%CI:0.74~1.11)、rs1343151(OR=0.80,95%CI:0.59~1.08)和rs10889677(OR=0.95,95%CI:0.83~1.09)与强直性脊柱炎无显著关联,rs10489629(OR=0.78,95%CI:0.64~0.95)是强直性脊柱炎的保护性因素。可见部分IL-23R基因多态性与中国人群AS易感性无关联,需要进一步探索与中国人群AS易感性相关的其他基因位点。     

新疆柯尔克孜族过氧化物酶体增殖物激活受体基因单核苷酸多态性

目的:分析柯尔克孜族健康人群过氧化物酶体增殖物激活受体基因(PPARG)的31个单核苷酸多态性(SNP)位点的遗传多态性;方法:利用Hap Map软件筛选31个SNPs位点,利用质谱检测技术进行多态性检测并根据质谱峰图判读样本目标位点基因型,利用χ~2检验确定筛选的SNP位点是否符合Hardy-Weinberg平衡定律并分析柯尔克孜族与其他民族间基因型和等位基因频率差异。结果:在31个SNP位点中,23个位点的最小等位基因频率MAF≥0.05具有多态性;在23个SNPs中rs1175540、rs17036242、rs2881654、rs2959273、rs2972162、rs4135275、rs709151、rs9310401、rs1801282位点在柯尔克孜族和维吾尔族人群间基因型和等位基因分布频率差异均有统计学意义;rs2292101、rs3856806、rs7626560位点在柯尔克孜族和北京汉族人群、犹他州居民、伊巴丹尼日利亚人群间基因型频率差异有统计学意义;rs3856806、rs4135275、rs6782475、rs7626560位点在柯尔克孜族和北京汉族人群、犹他州居民、伊巴丹尼日利亚人群间等位基因频率差异有统计学意义。结论:PPARG基因23个SNP位点多态性在新疆柯尔克孜人群和不同种族问差异具有统计学意义,这种差异可能是导致某些疾病在不同种族间的发现率和临床表现存在显著不同的因素之一。     

性激素结合球蛋白基因单核苷酸多态性在宁夏回、汉族人群中的分布特征

目的:探讨性激素结合球蛋白(SHBG)基因rs1799941、rs6257、rs6259和rs727428位点在宁夏回、汉族人群中及不同种族间的分布特征。方法:采用Taqman探针法分析宁夏回、汉族群体SHBG rs1799941、rs6257、rs6259和rs727428 4个SNP位点等位基因频率及基因型频率的分布特征。结果:宁夏回、汉族人群SHBG基因4个多态性位点基因型频率及等位基因频率差异无统计学意义。宁夏人群SHBG基因rs1799941、rs727428和rs6259位点基因型频率分布与人类基因组计划扫描所得欧洲人群及非洲人群比较,差异均有统计学意义,而与北京人群比较,差异无统计学意义。rs6257位点基因型频率分布与文献查询所得欧洲人群及土耳其人群比较差异均有统计学意义,而与中国南方人群比较差异无统计学意义。结论:SHBG基因rs1799941、rs6257、rs6259和rs727428 4个SNP位点等位基因及基因型频率在宁夏回、汉族及不同性别之间均无差异;但在不同种族间具有差异。     

血管内皮细胞功能相关基因多态性与子痫前期的遗传易感性研究

目的探讨血管内皮细胞功能相关基因即内皮型一氧化氮合成酶(eNOS/NOS3)、血管内皮生长因子(VEGF)、胰岛素样生长因子(IGF1)基因的单核苷酸多态性(SNP)与子痫前期(PE)发病的相关性。方法选取2014年7月至2015年5月于南方医科大学附属深圳妇幼保健院分娩的汉族妇女442例,采用SNapshot技术对eNOS、VEGF、IGF基因5个位点进行检测,分析两组间基因型及等位基因频率的差异。结果 (1)深圳地区汉族妇女中暂未发现存在IGF1基因rs5742620位点、NOS3基因27bp-VNTR in intron 4位点的多态性。(2)PE组NOS3基因rs2070744位点AA基因型、A等位基因频率明显低于对照组(95.5%vs99.3%,P=0.007,OR=0.14,95%CI为0.03-0.73;97.4%vs99.7%,P=0.003,OR=0.13,95%CI为0.028-0.632)。(3)PE与对照组比较,NOS3基因rs1799983位点GG、GT、TT基因型及等位基因分布无显著差异;VEGF基因rs3025039位点GG、AG、AA基因型及等位基因分布无显著差异。结论 (1)NOS3基因rs2070744位点可能与深圳地区汉族妇女PE发生有关。(2)NOS3基因rs2070744位点AA基因型、A等位基因可能是本群体PE发病的保护因素。(3)IGF1基因rs5742620位点、NOS3基因27bp-VNTR in intron 4位点为本群体的罕见突变。     

PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨PD-1基因多态性与肺结核发病风险以及临床特征的相关性。方法采用PCRRFLP分析方法,检测262例肺结核患者和255例健康志愿者基因组DNA中PD-1基因SNP位点rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布情况,分析PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系;并收集了肺结核患者的临床资料,考察PD-1基因多态性与肺结核临床特征的相关性。结果对照组rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;rs2227981位点T等位基因(OR=2.721,95%CI:2.003~3.697,0.001)、rs2227982位点C等位基因(OR=1.614,95%CI:1.262~2.064,0.001)均与肺结核易感性相关;与rs2227981 CC基因型相比,携带PD-1 rs2227981 CT或TT基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=2.937,95%CI:2.018~4.274,0.001),且患者病灶范围较大(=0.009),痰菌阳性率较高(0.001);与rs2227982 TT基因型相比,携带rs2227982 TC或CC基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=1.706,95%CI:1.187~2.452,=0.004),且患者结核空洞的发生率较高(=0.021)。结论 PD-1基因rs2227981和rs2227982位点SNP多态性与肺结核易感性及临床特征相关。     

ETS1基因与中国北方汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究

目的 验证ETS1基因在北方汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发生中的作用.方法 应用病例-对照关联研究,在山东汉族人群中收集231例SLE患者和474名正常对照,采用Taqman探针对ETS1基因3’非翻译区区域单核苷酸多态位点rs1128334与rs4937333进行基因分型,并对数据进行统计学计算和单倍型分析.结果 rs1128334等位基因A在病例组中的频率显著高于对照组(42.8％ vs.29.1％,OR=1.824,95％CI:1.445～2.302,P＜0.01),rs4937333等位基因T在病例组中的频率显著高于对照组,差异具有统计学意义(47.6％ vs.38.1％,OR=1.478,95％CI:1.181～1.851,P＜0.01).两位点的单倍型分析显示单倍型A-T与SLE的发病风险显著相关(P＜0.05,OR=0.738,95％CI:0.564～0.964),而单倍型G-C可以显著降低SLE的发病风险(P＜0.01,OR=0.296,95％CI:0.232～0.378).结论 ETS1基因rs1128334和rs4937333位点与北方汉族人群系统性红斑狼疮相关.