蛋白质组学技术在胃癌诊断中的应用及临床意义

目的应用SELDI蛋白质芯片检测胃癌患者血清蛋白质指纹图谱，筛选候选肿瘤标志物以建立诊断模型，并探讨其诊断早期胃癌的临床意义。方法表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱（SEL-DI-TOF-Ms）技术及其配套蛋白质芯片检测40例胃癌患者和30例健康人的血清蛋白质组图谱，运用判别分析处理数据筛选标志物并建立诊断模型。结果8592m／z、13725m/z,8678m/z等3个蛋白质峰组合所构建的诊断模型能达到鉴别胃癌患者和健康人的最佳诊断效果，灵敏度为90％（36／40），特异性为86．5％（26／30）。结论SELDI蛋白质芯片技术在胃癌的诊断尤其是早期诊断、术前分期及候选肿瘤标志物筛选等方面具有一定价值，值得进一步研究。     

应用SELDI-TOF-MS技术建立胃癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型

目的 应用SELDI蛋白质芯片检测胃癌患者血清蛋白质指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物以建立诊断模型,并探讨其诊断早期胃癌的临床意义.方法 表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SEL-DI-TOF-MS)技术及其配套蛋白质芯片检测40例胃癌患者和30例健康人的血清蛋白质组图谱,运用判别分析处理数据筛选标志物并建立诊断模型.结果 8592m/z、13725m/z、8678m/z等3个蛋白质峰组合所构建的诊断模型能达到鉴别胃癌患者和健康人的最佳诊断效果,灵敏度为90%(36/40),特异性为86.5%(26/30).结论 该方法 在胃癌的诊断尤其是早期诊断、术前分期及候选肿瘤标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步研究.     

SELDI-TOF-MS技术对胃炎诊断的应用

目的采用蛋白质剖析技术同时解析和分析多种蛋白质，从而找出更好的生物标记物，用于检测胃炎。方法用SELDI—TOF—MS技术及配套蛋白质芯片检测30例慢性胃炎和64例非胃炎疾病患者的血清蛋白质指纹图谱，建立诊断模型。结果2个蛋白质峰[5084和8691质荷比（m／z））组合构建的诊断模型鉴别慢性胃炎和健康志愿者，灵敏度为96．66％（29／30），特异性为93．55％（29／31）。2个蛋白质峰（5910和6440m/z合的诊断模型鉴别胃炎和胃癌患者的灵敏度为96．6％（29／30），特异性为90．9％（30／33）。结论SELDI—TOF—MS在慢性胃炎的诊断尤其是早期诊断及候选标志物筛选等方面具有一定价值，值得进一步深入研究。     

SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究

目的：利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF—MS）技术及蛋白质芯片检测结直肠癌病人血清蛋白质指纹图谱,初步探讨其用于结直肠癌诊断的临床价值。方法：利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术及弱阳离子交换表面CM10蛋白芯片监测70例结直肠癌患者和48例良性病变对照及25例正常对照的血清蛋白质谱。分为训练集（40例患者40例对照）和验证集（30例患者和33例对照）,前者用于筛选结直肠癌的差异蛋白标志物并建立人工神经网络（ANN）诊断模型,后者用于诊断效度的盲法验证。结果：结直肠癌患者和对照组血清蛋白指纹图谱共有148个明显表达差异的蛋白峰,筛选质荷比（m／z）为2957、2974、2982、3016、3282、5928、5948、6647、6661的9个蛋白质峰作为标志蛋白（P〈0．01）建立人工神经网络诊断模型,利用该模型对结直肠癌进行盲法预测,结果表明该诊断模型检测结直肠癌的灵敏度为94．2％,特异度为91．3％。结论：应用蛋白芯片技术检测到对结直肠癌有鉴别意义的血清蛋白标志物,可能为结直肠癌的早期诊断提供了新的手段。     

SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术建立胃癌血清特异性标志物诊断分类树研究

目的:观察胃癌手术前后血清蛋白质谱的变化,筛选能够快速诊断胃癌的特异性标志物。方法:采用IMAC#3蛋白质芯片和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术,对46例胃癌患者和40例正常人的血清蛋白质谱进行分析。结果:胃癌术前血清与正常人血清蛋白质谱有14个蛋白质表达量有明显差异。以热休克蛋白27、葡萄糖调节蛋白、抑制素、蛋白质二硫化物异构酶A 3这4个蛋白质所组成的模板,可将胃癌与正常人正确分组,利用该模板建立胃癌诊断的分类树模型用于诊断胃癌的灵敏度95.7%,特异性92.5%,术后血清蛋白质谱中,原表达上调的蛋白质明显下调。结论:SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术为建立蛋白质模板用以诊断胃癌提供了可靠的技术平台。     

原发性干燥综合征合并肺间质病变患者血清特异性标志物的筛选

目的:用纳米磁珠与基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术检测原发性干燥综合征(primary Sjgren’s syndrome,pSS)合并肺间质病变(interstitial lung disease,ILD)患者血清蛋白质组,筛选候选蛋白标志物并建立诊断模型,初步探讨所建立的诊断模型在pSS-ILD诊断中的临床意义。方法:采用弱阳离子(WCX)纳米磁性微球捕获69例pSS患者血清中的蛋白质,所获蛋白质经PBSⅡ-C蛋白质芯片阅读仪绘制蛋白指纹图谱,经Ciphergen ProteinChip和Biomarker Wizard软件分析之后,再用Biomarker Patterns软件识别,最终筛选出pSS-ILD的特异性蛋白标志物,并优化组合建立诊断模型。结果:在pSS-ILD患者和对照组之间共找到7个差异蛋白峰(P<0.05),其中质荷比(m/z)为3 778.3、3 318.3和2 236.6的3个蛋白峰用于建立pSS-ILD诊断模型,该模型对pSS-ILD诊断的敏感性为93.1%,特异性为87.5%。经双盲实验验证,该模型对pSS-ILD诊断的敏感性为84%,特异性为85.7%。结论:应用WCX纳米磁性微球联合MALDI-TOF-MS技术可检出pSS-ILD患者血清中的特异性蛋白标志物,并建立敏感性和特异性均较好的pSS-ILD诊断模型。     

MB-WCX联合SELDI-TOF-MS在胃癌诊断中的应用

目的 研究WCX纳米磁珠联合表面增强激光解析电离化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)对胃癌及其癌前病变诊断的意义。方法 应用纳米磁珠联合SELDI-TOF-MS对26例胃癌、35例癌前病变患者(萎缩性胃炎15例,胃溃疡20例)及30例正常人血清标本进行分析,Swiss蛋白数据库搜索鉴定差异蛋白,建立诊断模型。结果 与健康对照相比较,质荷比为2741.2、7963.6和15904.3的蛋白质分子随病变程度表达上调,质荷比为13732.6的蛋白质在癌前病变组无统计学差异,但在胃癌患者中下调。质荷比2741.2、7963.6、15904.3及13732.6的蛋白质组成的诊断模型可以准确鉴别胃癌与正常对照,敏感性为92.3%,特异性为96.7%。结论 WCX纳米磁珠联合SELDI-TOF-MS是筛选胃癌早期诊断标志物的有效手段,2741.2、7963.6、15904.3及13732.6的蛋白质组成的诊断模型有可能成为潜在的胃癌早期诊断标志物。     

应用血清蛋白组学指纹识别技术诊断胃癌

背景与目的:目前仍然缺少精确的胃癌血清生物学标志物,作者应用表面-增强激光解吸附/电离蛋白质芯片技术,试图寻找对胃癌具有潜在诊断意义的血清标志物。方法:该研究分为3个阶段:①使用胃癌患者与对照者的血清寻找潜在的诊断标志物;②建立一个诊断模型;③使用不同队列的胃癌患者和对照者对诊断模型进行独立确认。使用两种蛋白质芯片矩阵,负载铜离子的IM AC30矩阵和CM10(弱阳离子交换)矩阵,对血清蛋白质/多肽进行分析。结果:在该研究中,31个表面-增强激光解吸附/电离蛋白组学特征的峰强度在胃癌患者中明显升高。质量/电荷(m/z)值分别为509…     

胃癌血清蛋白指纹人工神经网络诊断模型的研究

目的建立胃癌人工神经网络蛋白分子诊断模型,寻找胃癌早期诊断的新方法。方法采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及配套芯片CM10和Biomarker Wizard 3.1软件筛选胃癌差异表达蛋白,通过人工神经网络(ANN)建立并验证胃癌的SELDI分子诊断模型。结果共建立3个胃癌诊断模型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),分别为胃癌的诊断、筛查、鉴别诊断模型。选其中由5个差异表达蛋白(质荷比为2502、2544、3085、8574、8740)组成的胃癌人工神经网络诊断模型Ⅰ作为胃癌人工神经网络诊断模型,对胃癌的诊断灵敏度为95.0%,特异度为98.33%,阳性预测值为95.0%,阴性预测值为98.33%,诊断准确度为97.5%。结论 SELDI-TOF-MS技术对胃癌的早期诊断具有一定的价值,值得进一步的研究。     

表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱技术在神经管缺陷胎儿母亲血清、尿液和羊水蛋白质标志物筛查中的研究

目的 探讨利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术结合分类与回归树分析(classification and regression tree analysis,CART)在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清和尿液蛋白质标志物的应用.方法 孕母血清样本31例,尿液样本35例和羊水样本20例用于检测.采用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据.SELDI数据结果采用分类与回归树分析(CART)建立血清和尿液诊断模型,用于区分神经管缺陷组与正常对照组.结果 与正常组比较,神经管畸形组血清中有8种蛋白质高表达,4种蛋白质低表达;尿液中有4种蛋白质高表达,1种蛋白质低表达;羊水中有6种蛋白质高表达,1种蛋白质低表达.4种蛋白质峰用于建立决策分类树诊断模型,血清诊断灵敏度88.20%,特异度100%;尿液诊断灵敏度80.00%,特异度93.33%.结论 血清和尿液蛋白质谱的高灵敏度和特异度提示表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱结合分类与回归树分析能够筛选神经管缺陷胎儿和正常对照.     

血清蛋白质指纹图谱与非小细胞肺癌临床分期关系的研究

目的 检测非小细胞肺癌患者的血清蛋白质谱,探讨非小细胞肺癌血清蛋白质指纹图与临床分期的关系,为非小细胞肺癌预后判断、临床治疗决策选择提供依据。方法 共收集69例非小细胞肺癌患者血清,应用阳离子交换蛋白(CM10)芯片,通过表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测非小细胞肺癌患者血清蛋白质质谱,应用生物信息学方法分析血清蛋白质指纹图与非小细胞肺癌临床分期的关系。结果 比较28例Ⅰ～Ⅱ期与41例Ⅲ～Ⅳ期非小细胞肺癌蛋白指纹图,共筛选出68个有显著性差异的质荷比峰(m/z),最终筛选出2个潜在标志物5632m/z、13779m/z。5632m/z、13779m/z均在Ⅲ～Ⅳ期非小细胞肺癌中高表达,在Ⅰ～Ⅱ期非小细胞肺癌中低表达。将此标记物作为非小细胞肺癌分期模型,其正确指数为0.587,一致率为79.5%,Kappa=0.32。结论 SELDI-TOF-MS技术检测非小细胞肺癌患者血清蛋白质质谱,筛选出m/z位于5632、13779的蛋白质峰可能是非小细胞肺癌术前临床分期的标记物。     

采用血清蛋白指纹图谱技术筛选食管鳞状细胞癌特异相关性蛋白的研究

目的应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术检测食管鳞状细胞癌患者血清蛋白指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物并建立诊断模型,初步探讨所建的诊断模型在食管鳞癌诊断中的临床意义。方法144例经手术后病理证实的食管鳞状细胞癌患者和50例健康人血清,用SELDI—TOF—MS检测各血清标本获得血清蛋白指纹图谱。用Biomarker Wizard筛选差异峰。扩大样本量,采用SPSS12．0中ROC曲线分析入选差异峰用于食管癌诊断的灵敏度和特异性。结果在分子量1500～30000范围内,共检测到93个蛋白峰,其中10个差异峰有统计学意义（P〈0．01）。ROC曲线面积超过08的有2768、2745、3403、6638、5972、6440、3321和3978m/z差异峰。当差异峰3403m／z以3．0为临界值时,其敏感性和特异性分别为87．5％和94．0％;3978m/z以2．0为临界值时,其敏感性和特异性分别为8417％和72．0％。其诊断价值均超过CA724、CEA和CA242单独或联合检测。结论3978和3403m/z两个蛋白对区分食管鳞癌患者和健康人群具有较好的诊断价值。     

应用蛋白质芯片筛选汉族单纯性室间隔缺损血清标志蛋白

目的应用蛋白质芯片技术筛选汉族单纯性室间隔缺损（VSD）血清标志蛋白。方法用表面增强激光解吸／电离飞行时间质谱技术和CM10芯片检测21例汉族单纯性VSD患儿与33例儿科常见病患儿血清，用Ciphergen公司Biomark Wizard软件分析数据。结果有8个蛋白的差异具有统计学意义，其中质荷比6442．233、3322．694、6640．853、5122．828、8702．852、2746．566和8574．304等7个蛋白在VSD患儿血清中高表达，质荷比2823．419下调。结论蛋白质芯片技术是发现与筛选VSD血清标志蛋白的快速、有效的蛋白质组学工具。     

血清蛋白质指纹图谱筛选上皮性卵巢癌及预测肿瘤复发的应用研究

目的:建立人上皮性卵巢癌蛋白质组诊断模型,并盲法验证.方法:应用蛋白质芯片SELDI-TOF MS技术和生物信息学方法,比较40例上皮性卵巢癌患者手术前后、29例卵巢癌复发患者、22名健康人血清蛋白质谱,用45例包括良恶性卵巢病变患者和健康人的血清作肓筛验证.结果:卵巢癌和正常人血清比较,P＜0.01的差异蛋白峰有7个,用其中的质荷比4 162.69、5 804.26、6 749.37建立诊断模型,诊断的敏感度为98.3％,特异度为95.7％,阳性预测值为96.7％.卵巢癌术前、术后血清蛋白质谱比较,P＜0.01的差异蛋白峰有4个,术后化疗后复发与正常人血清差异蛋白质峰有5个,其中质荷比5 804.26蛋白峰术后下降、复发时升高.结论:应用SELDI方法建立人卵巢癌血清蛋白质谱诊断模型可用于卵巢癌的筛查,质荷比5 804.26蛋白峰有望成为卵巢癌疗效监测特异蛋白峰.     

应用SELDI-TOF-MS技术联合CT鉴别肾脏良恶性占位

目的 探讨表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在肾脏占位的良恶性鉴别诊断中的应用以及联合CT进行鉴别诊断的价值.方法 96例血清标本取自62例肾癌和34例肾脏良性占位患者,患者术前均接受过CT检查.应用SELDI-TOF-MS技术获得所有患者的金属亲和-铜离子(IMAC-Cu2+)蛋白芯片的表达图谱,随机采用42例肾癌和22例肾脏良性占位患者的血清蛋白质谱建立决策树诊断模型,并用其余患者进行双盲验证.结果 利用质荷比分别为4657.56、2955.95和3278.00的3个蛋白峰建立了1个决策树诊断模型,其敏感性为85.7%(36/42),特异性为90.9%(20/22),双盲法验证后的敏感性为75.0%(15/20),特异性为83.3%(10/12).而联合CT的诊断结果,建模组和验证组的诊断特异性和阳性预测值均可达100%.结论 利用质荷比分别为4657.56、2955.95和3278.00的3个蛋白峰所建立的诊断决策模型有助于鉴别肾脏占位的良恶性,联合临床CT诊断可明显提高诊断的效率.     

蛋白质指纹图谱技术在肺癌分子标志物研究中的应用

目的 分析肺癌与肺部良性疾病及正常人血浆蛋白质指纹图谱的变化,建立肺癌血浆标志物诊断模型。方法 应用蛋白质指纹图谱(SELDI-TOF-Ms)技术检测108例肺癌患者、40例肺部良性疾病患者和22例正常人血浆标本,采用层次聚类分析和主成分分析建立决策树模型,应用该模型盲筛21例肺部良性疾病和47例Ⅰ期肺癌。结果 筛选到23个差异蛋白峰（P<0.001）。盲筛分析显示决策树模型诊断敏感性和特异性分别为72.34%和71.43%,阳性预测值和阴性预测值分别为85.0%和78.95%,诊断正确性为72.06%。结论 应用SELDI-TOF-Ms技术初步建立的蛋白质模型为肺癌的早期诊断提供了新的技术平台。     

胃癌患者血清和组织中sIL-2R与sICAM-1水平的变化及意义

目的 :研究胃癌患者血清及组织中sIL 2R和sICAM 1变化的临床意义。方法 :采用双抗体夹心ELISA法 ,对 5 8例胃癌患者手术前后、32例胃良性疾病患者及 36例健康体检者血清sIL 2R和sICAM 1水平进行检测 ;并检测胃癌及胃良性疾病者活检组织中该两项指标的浓度。结果 :胃癌患者血清sIL 2R(U/L)和sICAM 1(mg/L)为911± 179,9.193± 4.198,分别明显高于胃良性疾病者 30 3± 2 0 ,0 .6 14± 0 .0 6 1和健康体检者 30 1± 15 ,0 .5 77± 0 .145(P均 <0 .0 0 1)。胃癌组织中sIL 2R和sICAM 1为 934± 197,9.76 4± 3.744明显高于胃良性疾病胃粘膜组织 311±2 0 ,0 .6 2 4± 0 .0 6 3(P均 <0 .0 0 1)。胃癌从Ⅰ～Ⅳ期上述两种成分在血清和组织中均逐渐增高 ,且各期之间进行比较P <0 .0 0 1;其中Ⅰ～Ⅲ期术后血清两种成分均明显下降P <0 .0 0 1;而Ⅳ期手术前后无明显变化 ;手术切除组术后两种成分亦明显降低 ,P <0 .0 0 1,而探查者或胃空肠吻合术者 ,术后两种成分反而增高。结论 :动态观察血清及组织sIL 2R和sICAM 1的变化可作为胃癌的诊断、手术方法的选择、疗效评价及预后监测有意义的参考指标。     

可手术胃癌血清HER-2/neu ECD水平与临床特征及疗效的研究

目的：探讨可手术胃癌患者血清HER-2/neu胞外域部分(ECD)水平与临床特征及疗效的关系。方法：收集江苏省连云港市第二人民医院2010年01月至2010年12月,可手术胃癌患者46例进入研究,术前、术后收集血清,同时获取15例正常人、22例胃良性病变患者血清为对照组。另外收集7例血清HER-2/neu ECD阳性患...