基于UPLC-Q-Orbitrap HRMS和网络药理学分析胆黄连的泻肝胆实火机制

目的:基于UPLC-Q-Orbitrap HRMS和网络药理学阐明胆黄连泻肝胆实火的物质基础、作用机制及炮制原理。方法:采用UPLC-Q-Orbitrap HRMS技术鉴定胆黄连的化学成分,流动相0. 1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)梯度洗脱(0～20 min,5%～80%B;20～30 min,80%～95%B;30～30. 1 min,95%～5%B;30. 1～35 min,5%B),流速0. 2 mL·min-1,电喷雾离子源(ESI),正、负离子模式扫描,扫描范围m/z 100～1 500。在此基础上,选择肝胆实火的临床表现和病因作为媒介,利用在线数据库对胆黄连泻肝胆实火的潜在药效物质基础、作用靶点和作用特征进行预测分析。从炮制后新增活性成分的作用特点入手,运用网络药理学探究胆汁制黄连的炮制原理。结果:分析并鉴定了胆黄连中19种成分,其中6种为炮制后新增的胆酸类成分。药物本身的生物碱类成分巴马汀、甲基黄连碱、表小檗碱、小檗碱、小檗红碱、黄连碱、药根碱和新增的胆酸类成分甘氨猪去氧胆酸、牛磺猪去氧胆酸、猪去氧胆酸、甘氨鹅去氧胆酸、牛磺鹅去氧胆酸是胆黄连潜在的药效物质基础。预测筛选出与胆黄连泻肝胆实火作用相关靶点66个。胆汁赋予的胆酸类成分与黄连的生物碱成分有16个共同作用靶点和多条相同的信号通路,且肝胆实火的多个病灶为胆酸类成分的靶器官。胆黄连通过作用于白蛋白(ALB),半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3),丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14),糖皮质激素受体(NR3C1)等靶点和白细胞介素-17(IL-17)信号通路,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路,MAPK信号通路等通路发挥对肝胆实火证的治疗作用。结论:胆黄连呈现了多成分、多靶点、多途径泻肝胆实火的作用特点,且炮制辅料胆汁和炮制药物黄连具有协同作用,胆汁可增强药物在病灶的作用强度,印证了黄连经胆汁制后泻肝胆实火作用增强的炮制理论。     

基于UHPLC-Q-Orbitrap HRMS结合整合网络药理学的藤黄健骨胶囊化学成分识别及作用机制初步研究

目的系统研究藤黄健骨胶囊的主要化学成分,并探讨其发挥药效的主要作用机制,为其药效物质研究提供一定的参考依据。方法采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)对藤黄健骨胶囊的主要化学成分进行全面分析,根据化合物的一级、二级质谱信息,并与对照品或参考文献进行比对,以实现对药物的化学信息进行快速识别。在此基础上,采用BAT-MAN-TCM数据库对鉴定得到的化学成分进行靶点预测,进一步通过DAVID数据库进行KEGG通路注释分析和GO富集分析,初步筛选出药物的主要药效物质,并探讨其作用机制。结果从藤黄健骨胶囊中共鉴定出34种化学成分,"成分-靶点"网络分析表明药物中的重要成分山柰酚、大豆苷元、熊果酸、刺芒柄花素和豆甾醇等可作用于Bcl-2、BAX、AKt、PPARG、PTGS1、PTGS2、TNF、IL6、F7及IL1B等关键靶点,结果分析表明破骨细胞分化信号通路、NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、肾细胞信号通路以及血小板激活等可能是其发挥壮骨健骨、补肾活血和解痉止痛治疗作用的主要途径。结论采用UHPLC-Q-Orbitrap H...     

UHPLC-Q-Orbitrap HRMS鉴定墨旱莲中的化学成分

目的:应用超高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)对墨旱莲的化学成分进行快速分析鉴别.方法:以60％甲醇作为提取剂制备供试液,采用AccucoreTM C18(2.1mm×100mm,1.9μm)色谱柱分离,以乙腈-0.1％甲酸溶液为流动相进行梯度洗脱,流速0.2 m...     

基于UPLC-Q-Orbitrap-MS和网络药理学的覆盆子治疗2型糖尿病作用机制研究

目的 采用超高效液相色谱串联四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Orbitrap-MS)分析覆盆子化学成分,并结合网络药理学和分子对接方法预测其治疗2型糖尿病的有效成分和靶点,探讨其潜在的作用机制。方法 采用Waters CORTECS C18色谱柱,以0.1%甲酸水-甲醇为流动相进行梯度洗脱,全扫描/数据依赖二级质谱扫描(Full MS-ddMS2)模式分析,根据碎片信息,通过参考文献和对照品比对方法对覆盆子成分进行鉴定;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对覆盆子活性成分及靶点进行筛选及补充,采用GeneCards、OMIM和DrugBank数据库检索2型糖尿病相关靶点,合并取交集,结合STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,应用Cytoscape软件实现“成分-疾病-靶点”网络的可视化,并通过DAVID数据库进行基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集富集分析,预测其可能的作用机制;采用分子对接法验证覆盆子主要活性成分与核心靶点的相互作用。结果 共鉴定出了36种化合物,通过数据库筛选8个活性成分和103个“药物-疾病”共同靶...     

柠檬苦素在大鼠体内代谢产物与代谢途径的UHPLC-Q-Orbitrap HRMS分析

目的：采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)分析鉴定柠檬苦素在大鼠体内的代谢产物,探究柠檬苦素单剂量灌胃给药后在大鼠体内原型成分和代谢产物分布的性别差异性,并推测代谢途径。方法：采用Thermo Scientific Accucore^TM C₁₈色谱柱(3mm×100mm,2.6μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-0.1%甲酸乙腈溶液(B)为流动相进行梯度洗脱(0～1min,5%B;1～6min,5%～20%B;6～18min,20%～50%B;18～23min,50%～80%B;23～25min,80%～95%B;25～30min,95%B),流速0.3mL·min^-1,柱温30℃。在电喷雾离子源(ESI)正离子模式及扫描范围m/z 100～1 500条件下采集生物样品的质谱数据。收集并制备灌胃给药后的血浆、组织(心、肝、脾、肺、肾、胃和小肠)、尿液及粪便样品,对其中柠檬苦素原型成分及代谢产物进行鉴定。结果：雌、雄大鼠的粪便、胃、小肠及雌鼠的心、肝、脾、肺和肾...     

基于UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和网络药理学研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制

目的 研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制。方法 利用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法（UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS）,结合文献与对照品比对鉴定银甲片的化学成分。将化学成分和盆腔炎疾病的交集靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;通过DAVID数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用Cytoscape 3.9.1软件构建药材-成分-靶点-通路可视化图;利用Maestro 11.9软件进行分子对接。结果 从银甲片中共鉴定58个化学成分,包含黄酮类、有机酸类、萜类、生物碱类。PPI分析得到类固醇受体辅激活因子（SRC）、热休克蛋白90α家族A类成员1（HSP90AA1）、磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1（PIK3R1）、信号转导和转录激活因子3（STAT3）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）5个核心靶点;KEGG结果显示银甲片主要通过磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）、MAPK等通路发挥作用。分子对接结果表明,木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素等成分与SRC、HSP90AA1、PIK3R1等5个核心靶点的对接构象稳定。结论 银甲片可能通过木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素、芹菜素等活性成分调控PI3K-Akt、MAPK等通路发挥治疗盆腔炎作用。     

基于UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和网络药理学探讨益气祛风方治疗糖尿病肾病作用机制

[目的] 借助超高效液相色谱-四级杆静电场轨道阱质谱仪（UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS）技术结合网络药理学和分子对接技术，分析益气祛风方防治糖尿病肾病（DN）的物质基础和作用机制。[方法] 采用UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS鉴定益气祛风方的主要化学成分，采用网络药理学方法构建“主要成分-核心靶点-信号通路”网络，进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。[结果] 从益气祛风方共鉴定出115个化学成分，获得40个核心靶点，主要涉及磷脂酰肌醇-3激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、脂质及动脉硬化、糖基化终产物及受体（AGE-RAGE）信号通路、趋化因子信号通路及低氧诱导因子（HIF）1信号通路等。分子对接结果表明生松素、荠苧黄酮、槲皮素、N-乙酰多巴胺二聚体-1、N-乙酰多巴胺二聚体-2等成分与部分核心靶点有较好的结合活性。[结论] 本研究初步鉴定了益气祛风方治疗DN潜在的有效成分并预测了其作用靶点，为进一步研究中医“从风论治”法和益气祛风方治疗糖尿病肾病的作用机制提供了新的思路。     

基于UPLC-Q-Orbitrap HRMS的川佛手化学成分分析

目的:应用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Orbitrap HRMS)技术,分析鉴定中药川佛手中的化学成分。方法:采用Thermo Scientific Accucore~(TM)C_(18)色谱柱(3 mm×100 mm,2.6μm),流动相0.1%甲酸水溶液-0.1%甲酸乙腈溶液梯度洗脱,流速0.3 m L·min~(-1),柱温30℃。高分辨质谱采用电喷雾离子源(ESI),正离子模式扫描,扫描方式为全扫描/数据依赖二级扫描(Full MS/dd-MS~2)。数据运用Compound Discoverer 3.0软件分析,根据化合物的精确相对分子质量、色谱保留时间、特征离子碎片信息,结合mz Cloud网络数据库、中药成分高分辨质谱数据库(OTCML)、文献信息和相关对照品进行鉴定。结果:从川佛手中共鉴定了54个化学成分,包括黄酮类16个,香豆素类17个,柠檬苦素类3个,核苷及其碱基类6个,有机酸类2个,芳香醛类3个,氨基酸类1个,其他类成分6个。结论:该法可全面、准确地分析鉴定川佛手中的主要化学成分,研究结果为阐明川佛手的药效物质基础、优选质量控制指标提供了方法学参考和理论依据,对进一步开发利用川佛手资源具有指导意义。     

基于UHPLC-Q-Orbitrap HRMS比较古今不同加工方法对百合煎液化学成分的影响

目的：比较古今不同加工方法对百合煎液化学成分的影响,为该药材的产地加工、饮片炮制及临床应用提供依据。方法：采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法（UHPLC-Q-Orbitrap HRMS）,利用准分子离子、特征碎片离子等信息,并参考相关文献和数据库信息进行化合物结构鉴定;利用主成分分析（PCA）和正交偏最小二乘法-判别分析（OPLS-DA）筛选主要差异成分,通过高效液相色谱法对差异成分进行定量研究,比较百合不同加工品煎液中化学成分种类和含量的区别。结果：从百合不同加工品煎液及鲜百合水浸液、烫煮液中共鉴别出24个成分,其中17个酚类、5个皂苷类、2个生物碱类;与鲜百合煎液比较,烫煮干百合煎液中王百合苷A、对香豆酸、秋水仙碱等成分含量减少,蒸制干百合煎液中王百合苷C含量降低,水浸鲜百合煎液中王百合苷A、王百合苷C成分含量减少;与烫煮干百合煎液比较,鲜百合煎液与水浸鲜百合煎液中成分的整体含量要高,蒸制干百合煎液除王百合苷C的含量略低外,其他成分含量要高于烫煮干百合煎液。结论：不同加工过程会对百合煎液化学成分的种类及含量产生一定影响,烫煮法加工鲜百合有利于百合的保存,但会造成百...     

UHPLC-Q-Orbitrap HRMS法分析精制冠心软胶囊化学成分

目的建立一种对中药制剂精制冠心软胶囊中复杂化学成分快速、高效的鉴定分析方法,为系统研究其化学组成提供基础数据。方法应用超高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)技术对精制冠心软胶囊中的化学成分进行鉴定分析。通过多级离子碎片信息与对照品比对,结合文献数据进行准确定性。结果共鉴定出精制冠心软胶囊中43种化学成分,主要包括黄酮类、苯酞类、有机酸类、醌类及其他等。结论本方法可系统、准确、高效鉴定精制冠心软胶囊中化学组成,为其物质基础和质量控制研究提供科学理论依据。     

基于网络药理学探讨麝香治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制＊

目的 从网络药理学角度探讨麝香治疗脑缺血再灌注损伤的分子机制，并采用动物实验验证。方法 借助TCMID及上海化学专用数据库检索麝香有效成分，利用Swiss Target Prediction数据库预测各成分作用靶点。通过UniProt、GeneCards数据库查询靶点对应的基因，运用Cytoscape V3.6.1构建成分-靶点网络，通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析，预测其作用机制。建立MCAO/R大鼠模型，灌胃麝香及麝香酮治疗后mNSS行为学评分，伊文思蓝法检测血脑屏障通透性，TTC染色检测脑梗塞率，HE染色检测神经元坏死率，荧光定量PCR检测CHRM2、GABBR2、GRM7、HSP90AA1 mRNA 表达。结果 获得麝香大环化合物、甾族化合物及多种氨基酸共17种有效成分，筛选出与脑缺血再灌注损伤交集的靶点107个，并得到神经递质受体活性，血清素受体活性，谷氨酸受体活性等140条生物学过程，KEGG通路富集得到神经活性配体-受体相互作用，谷氨酸能突触等103条信号通路。动物实验结果表明，与假手术组相比，模型组行为学评分、血脑屏障通透性、脑梗塞率、神经元坏死率及CHRM2 mRNA 表达明显升高（P<0.01），GABBR2、GRM7、HSP90AA1 mRNA表达明显降低（P<0.01）。与模型组相比，麝香组与麝香酮组行为学评分、血脑屏障通透性、脑梗塞率、神经元坏死率及CHRM2 mRNA表达均明显降低（P<0.05），麝香组GABBR2、GRM7 mRNA表达明显升高（P<0.01），麝香酮组GABBR2、HSP90AA1 mRNA 表达明显升高（P<0.01）。结论 麝香治疗脑缺血再灌注损伤的机制主要集中在对脑神经递质及受体活性的调节，推测这可能是麝香“醒神开窍”功效的科学内涵，麝香酮可能是该功效的主要活性物质。     

基于网络药理学的青蒿-川芎配伍治疗脑型疟作用分析

目的:基于网络药理学的方法探讨青蒿、川芎组合抗脑型疟配伍用药的合理性及其作用机制.方法 :通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SymMap检索青蒿、川芎的所有化学成分并筛选作用靶点,构建成分靶点的蛋白质-蛋白质的相互作用(PPI)网络.通过GeneCards,DisGeNET数据库收集脑疟相关靶基因.将药...     

基于网络药理学的“桔梗-甘草”药对作用机制分析

目的:探讨桔梗-甘草药对的功效物质基础和配伍机制。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中寻找与这两味中药相关的所有化学成分。选择口服利用度(OB)≥50%,类药性(DL)≥0.18作为化合物分子的筛选条件。通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)寻找与候选化合物相关的潜在靶点,进而构建药物靶点相互作用的网络图和靶点疾病相互作用网络图。结果:通过OB,DL条件筛选,得出43个候选活性分子,相应靶点有98个,相关疾病有224种。其度值前三的候选化合物分子分别是柚皮素(48),芒柄花黄素(41),shinpterocarpin(36);度值前三的靶点蛋白为PTGS2(32),PPAR-γ(21),ERS1(18);度值较高的相关疾病依次是非特异性癌症、炎症、痛症、乳癌、阿尔茨海默症等。结论:研究结果初步验证了该药对的基本药理学作用和相关机制,并为进一步深入探讨作用机制奠定了良好基础。     

基于斑马鱼模型结合网络药理学探究重楼肝毒性机制

目的：重楼在《中华人民共和国药典》中记载为小毒,但其毒性机制尚未阐明。随着人们对中药安全性问题的重视,重楼的临床使用安全性及其机制也待明确,本文旨在阐明重楼提取物的肝毒性机制。方法：通过斑马鱼模式生物进行急性毒性验证,采用4 dpf斑马鱼暴露于重楼提取物中,24 h后吖啶橙染色,组织病理切片证明其肝脏毒性。通过网络药理学及分子对接技术预测重楼肝毒性靶点,并采用实时聚合酶链反应(RT-PCR)验证网络预测靶点及通路。结果：实验结果表明,重楼提取物暴露处理4 dpf斑马鱼24 h,吖啶橙染色重楼水提物组及醇提物组在肝脏部分均会出现黄绿色荧光点,组织病理切片显示肝细胞排列紊乱松散,出现细胞凋亡、空泡等现象,表明重楼具有肝脏毒性。网络药理学结果预测重楼肝毒性可能与细胞增殖的肉瘤基因(Ras)信号通路,能量代谢和信号转导相关的磷酸化磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子(STAT)信号通路相关,血管内皮生长因子A(VEGFA)、血小板衍生生长因子受体(PDGFRB)、鼠双微基因2(MDM2...     

基于网络药理学探讨甘松-延胡索组方治疗房颤的作用机制

目的:通过网络药理学预测甘松-延胡索组方治疗房颤的作用靶点及信号通路,进一步探讨潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选甘松-延胡索组方的活性成分并预测其作用靶点,构建活性成分-预测靶点网络。通过人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM),治疗靶点数据库(TTD),基因组注释数据库(Genecards)检索房颤的潜在靶点,采用蛋白质相互作用网络数据库(STRING 11. 0)获取房颤靶点蛋白相互作用的网络,通过Cytoscape 3. 7. 1软件对数据进行可视化分析,构建房颤靶点的蛋白互作网络。将甘松-延胡索组方的预测靶点映射至房颤靶点集合上,其交集靶点即为甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点。然后运用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库对甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点进行生物功能及信号通路富集分析。再通过Cytoscape 3. 7. 1软件构建甘松-延胡索组方治疗房颤的活性成分-潜在靶点-信号通路网络。结果:筛选出51个甘松-延胡索组方的活性成分,预测出甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点18个,主要通过白细胞介素-6(IL-6),钠通道蛋白亚型5α(SCN5A),肿瘤坏死因子(TNF),内皮源性一氧化氮合酶(NOS3),电压依赖性钾通道亚型H2(KCNH2),胶原α1(I)链(COL1A1),维甲酸受体RXR-α(RXRA),组织因子(F3),α1B肾上腺素能受体(ADRA1B)等靶蛋白,以及环磷酸酸鸟苷(cGMP)/蛋白激酶G(PKG)信号通路,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路,癌症中的转录失调,钙信号通路,心肌细胞中的肾上腺素信号等信号通路发挥治疗房颤的作用。结论:甘松-延胡索组方是基于多成分、多靶点、多通路治疗房颤,为后续开展实验研究以进一步阐释其作用机制提供了科学依据。     

基于网络药理学研究消肿止痛合剂治疗皮瓣缺血再灌注损伤的作用机制＊

目的 基于网络药理学方法探究消肿止痛合剂对皮瓣缺血再灌注损伤（Ischemia/Reperfusion，I/R）的作用机制。方法 通过TCMSP在线数据库分析平台获取消肿止痛合剂的潜在活性成分及作用靶点，利用GeneCards、TTD、OMIM、GAD数据库检索与皮瓣I/R相关靶点，将上述二者共有的靶点输入STRING数据库，获取PPI网络；通过Cytoscape 3.2.1软件中CytoNCA插件筛选潜在核心靶点，并构建“活性成分-核心靶点-疾病”网络；对关键节点进行基因本体（GO）和通路富集（KEGG）分析；将SD大鼠随机分为假手术组、模型组、消肿组，分别在给药5天，10天，15天，20天统计皮瓣成活率，同时在给药7天后透明硫酸纸描绘皮瓣成活情况，采集标本应用HE染色技术进行组织病理形态观察，应用Western Blot方法对关键靶点进行验证。结果 通过TCMSP数据库共检索出消肿止痛合剂药物主要有效成分所对应的靶点进行去重后，共获得238个潜在作用靶点，筛选得到消肿止痛合剂治疗皮瓣I/R的潜在靶点94个。GO功能富集分析发现消肿止痛合剂对防治皮瓣I/R主要与氧化应激反应、细胞对化学应激的反应、细胞对氧化应激的反应等相关。KEGG通路富集分析发现消肿止痛合剂防治皮瓣I/R主要与脂质、动脉粥样硬化与流体剪应力等相关。应用Western Blot技术验证排名靠前的PTGS2、PPARG、IL1B、AKT1、CXCL8五个关键核心靶点，结果提示消肿止痛合剂可减低皮瓣组织中PTGS2、IL1B、AKT1、CXCL8的蛋白表达。HE染色观察发现，消肿组大鼠皮瓣水肿明显减轻，组织间隙炎症细胞浸润减少。结论 消肿止痛合剂通过多成分、多靶点、多途径的作用方式，从氧化应激反应、细胞对化学应激的反应、细胞对氧化应激的反应等方面发挥防治皮瓣I/R的作用，为后续深入研究提供理论基础。     

基于网络药理学探析黄精抗骨质疏松的机制及验证

目的 基于网络药理学及分子对接方法分析黄精抗骨质疏松（OP）的潜在机制,并通过实验进行验证。方法 利用中药系统药理学数据库（TCMSP）2.3进行条件检索,获取黄精的活性成分及其对应作用靶点,并在疾病相关的基因与突变位点数据库（DisGeNET）7.0获取骨质疏松的治疗靶标,两者交集即为黄精抗骨质疏松的潜在靶基因。并用Cytoscape 3.7.1构建“黄精-活性成分-潜在靶点”网络,借助STRING数据库11.0进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析,构建PPI网络。此外,采用Metascape数据库3.5分析其参与的基因本体（GO）富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。选取黄精重要活性成分与靶点通过AutoDock Vina 1.1.2 进行分子对接验证,最后借助小鼠胚胎成骨细胞前体细胞（MC3T3-E1）观察β-谷甾醇对成骨分化的影响。结果 黄精活性成分有12个,其作用靶点与骨质疏松治疗靶点相映射得到潜在靶点32个。Cytoscape 3.7.1拓扑分析得到黄芩素、β-谷甾醇等6个主要成分,蛋白激酶B1（Akt1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、JUN原癌基因（JUN）、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、原癌基因c-FOS（FOS）等关键靶点。GO和KEGG富集分析中,共获得995个GO条目,涉及活性氧调节,生长调节等181条信号通路。分子对接显示黄精中核心成分与各自的靶点表现出良好的对接活性。细胞实验结果显示β-谷甾醇在2.5,5 μmol·L^-1浓度时具有显著促进成骨分化的作用。结论 黄精可通过调节炎症、氧化应激、凋亡、代谢等作用,发挥治疗骨质疏松的效果,其中β-谷甾醇可促进MC3T3-E1细胞成骨分化。     

An Exploration in the Potential Substance Basis and Mechanism of Chuanxiong Rhizoma and Angelicae Dahuricae Radix on Analgesia Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

Objective: The objective was to study the potential substance basis and action mechanism of Chuanxiong Rhizoma(CX) and Angelicae Dahuricae Radix(AD) on analgesia through network pharmacology and molecular docking. Materials and Methods: The active components and targets of CX and AD and pain-related genes were retrieved through Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform(TCMSP) and GeneCards database. Then, the co-action targets were found, protein–protein interaction network was constructed by the String database. The Cytoscape 3.7.1 was used to construct "CX-AD-active components-pain" network. Further enrichment analysis of Gene Ontology(GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) was carried out to predict its mechanism of action, the top four active components in the network were docked with the targets. Results: There are 26 compounds, 45 targets in the network. Among them,(Z)-ligustilide and beta-sitosterol, respectively, have more potential targets in CX and AD, and prostaglandin-endoperoxide synthase(PTGS2), PTGS1 have more ligands. GO analysis shows that molecular functions of CX and AD mainly performed through the G protein-coupled amine receptor activity, adrenergic receptor activity, and catecholamine binding. KEGG analysis indicates that they could exert analgesic effect on the pathways of regulating neuroactive ligand-receptor interaction, serotonergic synapse, and cGMP-PKG signaling pathway. Molecular docking results show that the active compounds are highly compatible with the structure of the protein receptor, and they interact through the hydrogen bond and π–π bond between the ligand and the active site residues. Conclusions: Through network pharmacology and molecular docking, this study preliminarily revealed the main active components, targets, and potential regulation network of CX and AD, providing a reference for the subsequent experimental research.     

基于网络药理学的丹参治疗哮喘作用机制初探

目的 运用网络药理学方法探讨丹参治疗哮喘的作用靶点及通路。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取丹参活性成分及潜在靶点;应用OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank和DisGeNET数据库收集哮喘靶点,利用R语言获得丹参治疗哮喘的作用靶点,依据STRING 11.0数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;在Metascape平台进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）和基因本体（GO）分析,运用Cytoscape 3.5.1软件构建丹参治疗哮喘的成分-靶点-通路网络,并筛选核心靶点,采用MOE 2019软件对重要化合物进行分子对接验证。结果 筛选得到丹参治疗哮喘的59个化学成分、108个靶点及20条关键通路。其中,隐丹参酮主要通过肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体4（TLR4）等蛋白抑制核转录因子-κB（NF-κB）通路,减轻哮喘气道炎症;丹参酮Ⅱ_A主要通过核转录因子-κB抑制剂α（NFKBIA）等减弱TNF-α和NF-κB表达,抑制NF-κB通路,减轻炎症损伤;木犀草素主要通过蛋白激酶B1（Akt1）、白细胞介素-6（IL-6）和信号传导与转录激活因子3（STAT3）等介导磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-Akt和Janus激酶-信号转导子与转录激活因子（JAK-STAT）通路,通过缓解气道炎症、改善气道重塑和免疫调节治疗哮喘。分子对接显示,三者与疾病靶点生物亲和力高。结论 丹参可以通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗哮喘的作用。