广东省2016-2021年四类哨点监测人群HIV-1亚型分布及变化

目的 研究2016-2021年广东省MSM、性病门诊男性就诊者（STD）、吸毒者（DUS）、暗娼（FSW）四类哨点监测人群HIV-1亚型分布及变化情况,探讨哨点监测同时开展分子流行病学监测的可行性。方法 运用巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因片段,鉴定基因亚型,并比较不同年份的HIV-1亚型变化。结果 共计纳入分析814人。HIV-1主要流行亚型为CRF07＿BC(43.2%,352/814)、CRF01＿AE(27.5%,224/814)和CRF55＿01B(14.9%,121/814),其他亚型占14.4%(117/814),其中CRF01＿AE总体呈下降趋势,从2016年的33.9%下降到2021年的16.7%（χ2趋势=4.579,P=0.032）;CRF07＿BC和CRF55＿01B在2016至2021年的趋势变化差异无统计学意义,但其构成比出现增加;存在一定比例CRF01＿AE和CRF07＿BC的新型重组毒株。结论 2016-2021年广东省四类哨点监测人群HIV-1亚型分布以CRF07＿BC、CRF01＿AE和CRF55＿01B为主,亚型复杂多样。CRF01＿AE亚型...     

贵阳市266例新发现HIV/AIDS患者抗病毒治疗前HIV-1耐药及亚型特征

目的 分析贵阳市2021年5月至2022年5月未接受ART的HIV/AIDS患者的病毒基因亚型分布和耐药情况。方法 采集2021年5月至2022年5月贵阳市新确诊的HIV/AIDS患者全血标本279份,进行HIV-1基因型耐药检测。将提取后的核酸经过反转录后,以巢式PCR扩增HIV-1 Pol区基因并进行Sanger测序,使用斯坦福大学HIVdb Program耐药数据库等工具对序列信息进行分析。结果 PIs区和RT区扩增成功266例,可检测出亚型的样本为265例,其中6名患者IN区未扩增。共检出9种亚型,以B/C重组亚型和CRF01＿AE亚型为主,分别为109例和80例,其余CRF07＿BC亚型21例,CRF08＿BC亚型19例,B亚型13例,A亚型12例,CRF55＿01B亚型5例,C亚型4例,B+CRF01＿AE亚型2例。不同病毒亚型耐药率不同（χ2=19.15,P=0.01）。ART前患者总体耐药率为9.40%,PIs耐药率为0.75%,NRTIs耐药率为2.63%,NNRTIs耐药率为7.52%,INSTIs耐药率为0.38%。结论 贵阳市HIV/AIDS患者ART前耐药问题...     

浦东新区中老年人群HIV-1分子流行特征分析

目的 了解上海市浦东新区近年来中老年人群中未经抗病毒治疗的新确诊感染者HIV-1分子流行特征及耐药情况,为艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法 对2018-2021年期间浦东新区确诊实验室HIV-1抗体首次确诊阳性的50岁及以上患者开展面对面访谈,并同步收集血浆标本,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HIV-pol基因,进行基因亚型及耐药位点分析。结果 获216份HIV-pol区基因全序列片段,HIV-1基因亚型主要有CRF07＿BC(46.30%)、CRF01＿AE(31.02%)、CRF08＿BC(6.48%)、CRF55＿01B(1.39%)、B(4.63%)、C(5.09%)、URFs(4.17%);感染途径主要为同性性传播(41.20%,89/216)、异性性传播(57.87%,125/216),其中流行株CRF01＿AE的同性和异性性传播占比均为49.25%(33/67)、CRF07＿BC同性和异性性传播分别占比45.00%(45/100)、54.00%(54/100),不同性传播途径的病毒亚型分布差异有统计学意义(χ²=18.022,P=0...     

甘肃省部分地区2020-2021年新报告HIV/AIDS患者治前耐药及分子传播网络特征分析

目的 分析甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者分子传播网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 反转录和巢式PCR扩增样本pol区基因并测序,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点,Hyphy和Cytoscape 3.9.1软件生成分子网络,Logistic回归模型对入网率的影响因素进行分析。结果 收集甘肃省部分地区2020-2021年新报告病例血浆样本331份,成功获得pol区基因序列303条,共发现11种亚型和流行重组型,主要为CRF07＿BC(58.1%)、CRF01＿AE(21.1%)、B(6.9%)和CRF55＿01B (5.3%)。治疗前耐药率为4.0%,NNRTI类耐药率最高为3.3%,主要耐药位点是K103 N/S (1.7%)。分子网络最适基因距离为1.2%,在此基因距离时共形成33个分子簇,91条序列入网,入网率为30.0%。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,CRF07＿BC（与CRF01＿AE相比）、河西地区（与陇东南地区相比）更容易...     

重庆市472名MSM中新发现HIV-1感染者分子传播网络特征

目的 分析2019-2021年重庆市MSM新发现472例HIV-1感染者分子网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 收集重庆市疾病预防控制中心性病门诊2019-2021年新报告的MSM感染者血浆样本,扩增pol区基因并测序,构建该人群HIV-1传播分子网络,采用χ2检验进行成簇相关因素分析。结果从580例感染者中,共获得pol区基因序列472条。472例感染者分别属于9种基因亚型,主要亚型为CRF07＿BC(344,72.88%)和CRF01＿AE(96,20.34%),其他亚型包括CRF55＿01B(18,3.81%)、B(4,0.85%)、CRF08＿BC(6,1.27%)等。在基因距离0.8%时,共产生32个分子簇,入网率27.33%(129/472),以CRF07＿BC入网最高,占82.95%(107/129)。结论MSM中新报告HIV-1感染者病毒基因呈现多样性,并存在传播活跃者。应对传播活跃者实施精准干预,以降低该人群的新发感染率。     

浦东新区MSM HIV-1分子流行病学的研究

目的了解上海市浦东新区近年来男男性行为人群(MSM)中,未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗体阳性者,其HIV-1亚型分布和原发性耐药特征,监测该地区MSM HIV-1毒株的最新流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法选取2011年至2014年4月份期间确认的MSM HIV-1感染者血浆标本70份,应用巢式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因,并对扩增产物进行测序,用Mega 6.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据系统进化树分析确定基因亚型及其特征以及耐药情况。结果获62份pol区基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE与B重组亚型)和B四种亚型。分布显示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。离散率显示:CRF01-AE亚型的平均离散率为(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亚型的平均离散率也为(2.1±0.2)%(n=19),B亚型的平均离散率为(5.7±0.6)%(n=3),01B重组亚型的平均离散率为(6.3±.0.6)%(n=4)。耐药特征:62例中有7例分别产生了对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中2例产生了低度耐药,4例具有潜在的耐药特点。结论上海市浦东新区2011年至2014年4月间,MSM新确证HIV-1感染者中,基因亚型呈多元化趋势,以CRF01-AE和CRF07-BC为主,并已形成了浦东新区范围内的局部流行趋势,新的01B重组毒株已在浦东新区开始出现;HIV-1原发耐药株的传播尚处于低度流行水平,密切监视其流行趋势已显十分必要。     

淮安市新报告HIV-1感染者的分子传播网络特征研究

目的 了解淮安市新报告人感染HIV-1毒株的流行特征、亚型及分子传播网络特征。方法 采集淮安籍HIV-1确证阳性感染者血液标本,利用巢式(RT-)PCR方法扩增pol基因片段,测序并构建分子传播网络。结果 淮安市新报告人感染的HIV-1基因亚型有9种,分别为CRF01＿AE (38.5%,47/122)、CRF07＿BC (38.5%,47/122)、CRF67＿01B (8.2%,10/122)、CRF68＿01B (4.9%,6/122)、B (3.3%,4/122)、CRF08＿BC (3.3%,4/122)、CRF55＿01B (1.6%,2/122)、CRF85＿BC (0.8%,1/122)和CRF52＿01B (0.8%,1/122)。60条pol基因序列形成10个分子传播簇,入网率为49.2%,其中最大的分子传播网络由CRF07＿BC基因型构成。logistic回归分析显示已婚有配偶(与丧偶相比,OR=0.242,95%CI:0.006-0.972)、同性传播(与异性传播相比,OR=2.113,95%CI:1.020-4.377)、基因型CRF07＿BC (与其他重组型...     

安徽省阜阳市新报告HIV感染者耐药及分子传播网络研究

目的 分析安徽省阜阳市2020-2021年新报告HIV感染者主要亚型毒株的分子流行特征及传播网络情况,为当地制订有效的干预措施提供依据。方法 2020年1月至2021年12月共收集阜阳市新报告感染HIV-1血液样本589份,扩增pol基因和测序,运用美国斯坦福大学耐药数据库进行耐药突变分析,构建系统进化树,提取传播网络并分析其特征,对研究对象进入网络的相关因素进行分析。结果 成功扩增获得589名HIV感染者的pol区基因序列,主要的亚型为CRF07＿BC(34.8%),B(30.4%)和CRF01＿AE(22.4%),新报告感染者总体耐药率为8.6%。三个主要亚型分别以0.5%作为基因距离阈值构建了分子传播网络,入网率分别为B(41.3%)、CRF07＿BC(34.6%)和CRF01＿AE(20.5%)。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,年龄>50岁（与<30岁相比,a OR=2.419,95%CI:1.189～4.921）、CRF07＿BC（与CRF01＿AE相比,a OR=1.875,95%CI:1.085～3.242）、B亚型（与CRF...     

德宏州ART后HIV低病毒血症毒株基因亚型和耐药分析

目的 探究接受抗病毒治疗的HIV/AIDS低病毒血症患者耐药情况和影响因素,基因亚型与耐药位点突变情况。方法 纳入病毒载量50-999copies/mL的HIV/AIDS患者,巢式PCR扩增HIV-1的pol基因后进行耐药检测,根据世界卫生组织耐药标准和斯坦福大学耐药数据库判定耐药、确定突变位点以及毒株对ART药物的敏感性,Logistic回归分析耐药影响因素。结果 896例低病毒血症患者中65.6%(588例)pol基因扩增成功。总耐药率为24.7%(145/588),NNRITs耐药率最高,为21.3%(125/588),部分患者存在多重耐药。588例HIV/AIDS低病毒血症患者中HIV-1毒株BC重组亚型占25.2%(148人),B亚型占24.5%(144人),C亚型占23.5%(138人),CRF 01＿AE亚型占14.3%(84人)。Logistic回归分析发现,耐药与HIV-1病毒亚型有关。B亚型耐药率最高,为43.1%(62/144),CRFs、C亚型、URFs耐药率分别为22.7%(32/141)、18.8%(26/138)、15.2%(25/165)。所有亚型中K1...     

重庆市医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人HIV-1遗传分化和耐药突变研究

目的调查重庆市医疗机构中艾滋病病毒(HIV)1型(HIV-1)感染者/艾滋病(AIDS)病人中的HIV-1基因亚型、群体动力学及耐药性。方法收集2013年12月至2016年4月重庆多家医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人血浆,通过提取核糖核酸(RNA)、反转录、巢式聚合酶链式反应(PCR),系统发育学和群体遗传学的方法,扩增及分析HIV基因组pol区序列,并检测耐药相关突变。结果共收集657份HIV-1感染者/AIDS病人静脉血样本,扩增及测序得到256份有效的pol基因片段,HIV基因亚型分析显示,重庆医疗机构中流行的HIV-1毒株以CRF07_BC(43.8%,112份)、CRF01_AE(34.8%,89份)为主要基因型;随后依次为CRF08_BC(8.2%,21份)、B(3.5%,9份)、CRF55_01B(2.7%,7份)、CRF68_01B(0.4%,1份)和CRF86_BC(0.4%,1份)。检出耐药基因突变者94例(占36.7%),无耐药基因突变者162例(占63.3%)。不同基因亚型间,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变位点差异无统计学意义(P0.05)。对优势群体CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC的群体遗传学分析,证实重庆市医疗机构中的HIV-1部分基因型群体正在经历扩张。结论重庆市医疗机构中HIV-1病毒基因突变和重组普遍存在。HIV-1CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC基因亚型正在经历缓慢扩张的过程。需持续研究和监控重庆地区HIV-1在感染者中的遗传分化及耐药进展。     

山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素分析

目的 分析凉山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素，为制定针对性抗反转录病毒治疗（antiretroviral therapy, ART）方案，减少整体抗病毒治疗失败率提供理论依据。方法?选取2022年6—12月间，于凉山州某县医院就诊的拟启动ART的HIV-1感染者107例，完善治疗前耐药（pretreatment drug resistance, PDR）基因检测及HIV-1亚型检测，同时收集基线血CD4+ T细胞计数、HIV-1病毒载量及常规检查指标，分析PDR总体发生率及相关危险因素。结果?107例HIV-1感染者中基因扩增成功101例，成功率为94.4%。101例感染的HIV-1主要基因型为B+C亚型（48/101，47.5%）和CRF07_BC重组型（46/101，45.5%）。共检测出存在耐药基因突变者21例，PDR发生率为20.8%，实际耐药者11（耐药率10.9%）。核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变1例为A62V位点。非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变15例，主要突变位点为K103N、Y181C、V179D及V179VD等，分别造成依非韦仑、奈韦拉平、利匹韦林、依曲韦林等药物的不同程度耐药。还有6例为整合酶抑制剂耐药突变，突变位点包含E157Q、A128T及G163R。经单因素及多因素Logistic回归分析，汉族及B+C亚型与发生PDR突变具有相关性，其中汉族为风险因素，B+C亚型为保护性因素。结论?凉山州某县初始ART的HIV-1感染者中，存在较大比例的PDR基因突变，除了常见的核苷类及非核苷类逆转录酶抑制剂耐药外还出现了整合酶抑制剂的耐药突变，应该引起高度注意。     

石家庄市2015年新确诊HIV-1感染者流行毒株的亚型分布及原发性耐药分析北大核心CSCD

目的了解河北省石家庄市2015年新确诊1型艾滋病病毒（HIV-1）流行毒株的亚型分布和原发性耐药情况。方法 2015年石家庄市新报告HIV-1感染者433例,共收集到感染者血浆样本335份,经反转录巢式荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增,最终获得311份样本的HIV-1 pol基因片段并测序。对获得的核酸序列用Neighbor.Joining Tree方法构建进化树,以Boot strap值〉70%来判定HIV-1的基因亚型。同时将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药基因型分析。结果 311例HIV-1感染者以男性（93.9%）、本市户籍（83.0%）、汉族（96.1%）为主。性接触是最主要的感染途径（98.1%）,其中同性性传播占77.5%。311例pol基因序列片段亚型分布显示,CRF01_AE占51.4%（160例）,CRF07_BC为28.6%（89例）,B亚型为13.2%（41例）,未定型CRF01_B为4.2%（13例）,CRF08_BC为1.3%（4例）,CRF55_01B为0.6%（2例）,CRF59_01B为0.3%（1例）,CRF65_cpx为0.3%（1例）和CRF01_AE/B为4.2%（13例）。CRF01_AE、CRF07_BC和B是主要的亚型。HIV-1基因亚型分布在性别之间（χ~2=14.039,P=0.005）、不同的职业类型之间（χ~2=21.716,P=0.041）以及不同的传播途径之间（χ~2=20.971,P=0.028）有统计学差异。311例中,14例感染者具有耐药位点,原发耐药率为4.5%,其中蛋白酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率均为1.6%（各5例）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率为1.3%（4例）。结论石家庄市新报告的HIV-1感染者中,传播途径以同性性接触为主,病毒基因亚型以CRF01_AE为主,但具有多样化特点。原发耐药率为4.5%,处于低水平状态。     

239例治疗失败的HIV感染者HIV-1亚型及耐药分析

目的分析辽宁地区抗病毒治疗失败的艾滋病病毒(HIV)感染者HIV-1亚型特征及耐药情况。方法收集2018年接受抗病毒治疗满6个月且HIV-1病毒载量≥1 000拷贝/mL的治疗失败病例血浆样本239份,通过核酸提取、pol基因区扩增和测序,进行亚型分析及基因型耐药检测。结果 239份样本中,HIV-1亚型中CRF01_AE占75.7%,B亚型占10.9%,CRF07_BC占7.5%;有148例发现耐药位点突变,总耐药率为61.9%(148例);最常见的突变位点为G190、M184和K65,突变率分别为32.6%(78例)、30.1%(72例)和29.7%(71例);对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)及非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的耐药率分别为5.9%(14例)、49.0%(117例)和59.0%(141例)。结论辽宁地区治疗失败的感染者HIV-1基因亚型以CRF01_AE为主,耐药突变率处于中等水平,但已出现蛋白酶抑制剂类药物耐药情况,需加强耐药监测及抗病毒治疗管理,以防止耐药毒株传播。     

HIV-1整合酶耐药基因型检测方法的建立

目的随着整合酶抑制剂的使用,整合酶抑制剂耐药突变出现不可避免,为了更好地预防和控制艾滋病,根据中国1型艾滋病病毒(HIV-1)主要流行株建立HIV-1整合酶基因型耐药检测方法。方法根据国内HIV主要流行株(CRF01_AE、B、CRF07_BC、CRF08_BC、C)参考序列,用Oligo软件在整合酶保守区设计引物。挑选160例不同病毒亚型、病毒载量 1 000拷贝/mL的样本,进行巢式荧光定量聚合酶链反应核酸扩增和测序。拼接后的序列输入斯坦福大学耐药网站,进行耐药突变位点分析。结果成功扩增出HIV-1整合酶全长(288个氨基酸),160个样品157个扩增成功(成功率为98.1%)。3名操作人员对15个样本进行扩增和测序,核苷酸序列一致性为(99.83±0.05)%。结论根据中国HIV-1主要流行株建立了整合酶耐药基因型检测方法,有助于优化艾滋病病人抗病毒治疗,有助于HIV-1的防控。     

福建省MSM哨点监测HIV新近感染影响因素及分子流行特征研究

目的 了解福建省MSM人群HIV新近感染状况,探讨其分子流行特征和相关影响因素,为制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法 对福建省2019年MSM哨点监测人群HIV抗体阳性样本采用HIV-1限制性抗原亲和力酶联免疫法(简称LAg-Avidity EIA)进行新近感染检测,用多因素Logistic回归分析其影响因素,通过RT-PCR扩增pol和gag区,利用系统进化树和HIV db Program 软件对序列进行基因亚型和耐药突变分析。结果 福建省2019年哨点监测MSM人群863人,其中总的HIV抗体阳性率为12.17%(105/863), HIV新近感染率为11.97%;Logistic回归分析显示,样本来源和最近6个月内同性肛交安全套使用频率是新近感染的影响因素;基因亚型以CRF07_BC(47.61%)和CRF01_AE(38.10%)为主,其次为CRF55-01B(9.52%)、B亚型(4.76%);HIV-1耐药率为6.67%(1/15),其中15例对蛋白酶类抑制剂、核苷类逆转录抑制剂均敏感; 1例对非核苷类逆转录酶抑制剂efavirenz (EFV)和nevirapine (NVP)产生高度耐药, 1例为潜在耐药。结论 福建省2019年哨点监测MSM人群HIV新近感染率处于较高水平,多种亚型并存,发现原发耐药株传播,应加强对HIV新近感染者的分子流行特征变化趋势以及原发耐药传播的动态监测,及时调整防控策略,有效控制福建省艾滋病感染与传播。     

河北省治疗前人群HIV-1耐药毒株分子传播网络研究

目的 了解河北省抗病毒治疗前人群HIV-1耐药毒株流行与分子传播网络情况。方法 用in-house的方法扩增HIV-1 pol区基因序列,并利用TN93模型计算pol序列基因距离,构建HIV-1分子网络图。结果 研究发现17名HIV-1感染者出现耐药突变,耐药突变率为6.16%(17/276),其中,NNRTI类耐药率为4.35%(12/276),PI类耐药率为1.09%(3/276), NRTI类耐药率为0.36%(1/276),NNRTI类和PI类双重耐药率为0.36%(1/276);多因素Logistic回归分析显示年龄和亚型是HIV-1产生耐药的影响因素,虽然HIV-1耐药突变在CRF07_BC(2.44%)亚型中的分布明显低于CRF01_AE(8.03%)和B(3.70%)亚型,然而CRF07_BC序列构建的分子传播网络最多,传播速度最快。结论 河北省治疗前HIV-1耐药突变处于较高水平, 应制定措施实时监测未治疗人群中HIV-1耐药毒株流行情况。     

三个城市部分HIV感染者抗病毒治疗前耐药状况调查

目的分析我国三个城市未接受抗病毒治疗(ART)的部分1型艾滋病病毒(HIV-1)感染者治疗前耐药(PDR)发生率及位点突变情况。方法收集2018年3-7月上海市公共卫生临床中心,南京市第二医院及云南省传染病专科医院未曾接受ART的HIV-1感染者血浆标本167例,采用巢式聚合酶链式反应扩增HIV-1高度保守序列pol基因中反转录酶/蛋白酶和整合酶区域,测序结果与美国斯坦福大学耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu)进行序列比对。结果 167例扩增基因中PDR发生率为4.8%。非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药发生率为2.4%,主要突变位点为K103N, Y181C。核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)耐药发生率为0.6%,主要突变位点为L210W。整合酶抑制剂(INSTIs)耐药发生率1.8%,主要突变位点为R263K。上海地区PDR总发生率为9.0%,南京地区为2.1%,本研究未检出昆明地区PDR发生。结论上海地区PDR发生率远高于其他两地区,应参考PDR结果为患者制定更精准的抗病毒治疗方案。     

CRF01_AE CRF07_BC和B''''亚型HIV-1 pol基因及耐药特征分析

目的 研究中国部分地区新发现未经抗病毒治疗的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者的耐药情况,及不同亚型毒株pol基因的多态性对耐药突变产生的影响.方法 选取2005-2006年湖南、云南、四川和新疆4省(自治区,下同)当年确认的部分样本,进行核酸扩增及测序,利用系统进化及重组分析的方法确定亚型;根据美国斯坦福大学HIV-1耐药数据库,分析不同亚型毒株蛋白酶基因和逆转录酶基因的多态性和耐药突变情况;利用荷兰乌得勒支大学Vijver等人使用的一种遗传障碍定量方法,计算并比较不同亚型间耐药突变产生的遗传障碍.结果 共得到84份样本PR基因区(1-99氨基酸)和RT基因区(1-272氨基酸)的序列,亚型分析显示:84份样本中B'亚型13份,01AE重组亚型27份,07BC重组亚型44份,其中18份样本在蛋白酶基因区的第10位和第71位存在次要耐药突变;来自云南省和湖南省的3份样本中,存在逆转录酶抑制剂相关耐药突变,分别是A62V、V179D和G190A.三种亚型在逆转录酶基因区的2个非核苷类抑制剂相关耐药突变位点V106M和V108I的遗传障碍存在差异,有显著的统计学意义(P＜0.001).结论 4个地区未冶疗感染者中耐药发生的水平较低.遗传障碍的比较,CRF01AE、CRF07BC与B'亚型病人经治疗后主要耐药突变的发展模式应基本一致.     

北京男男性行为者HIV-1基因多样性及相关因素研究

目的了解北京男男性行为者(MSM)1型艾滋病病毒(HIV-1)基因多样性情况及影响因素。方法对北京HIV阳性MSM采用横断面调查,通过建立的基于Illumina平台的二代测序技术(NGS),综合两个部分pol基因区片段和一个env基因区片段的结果进行亚型和系统进化分析。结果获得NGS结果的376例样本中,单一亚型样本313例(占83.2%),重组率和共感染率分别为8.2%(31例)和8.5%(32例)。313例单一亚型样本中CRF01_AE亚型188例(60.1%),CRF07_BC亚型86例(27.5%),B亚型32例(10.2%),C亚型3例(1.0%),CRF55_01B亚型4例(1.3%)。376例样本中,亚型内重组率为1.9%(7例),亚型间重组率为6.4%(24例);亚型内共感染率为1.3%(5例),亚型间共感染率为7.2%(27例)。多因素Logistic回归分析结果显示,与HIV-1基因多样性相关的影响因素是无工作(P=0.03),过去3个月使用新型毒品(P=0.03),和通过互联网寻找男性性伴侣的方式(P=0.01)。结论北京MSM的HIV感染者中有较高的HIV-1基因多样性,反映了HIV阳性MSM复杂的高危行为。