抗病毒治疗后低病毒血症患者HIV-1基因型耐药特征分析

目的 分析北京佑安医院ART后发生低病毒血症（LLV）的HIV/AIDS患者病毒亚型及耐药特征。方法收集2020年1月至2021年6月期间在北京佑安医院性病艾滋病门诊常规接受ART≥6个月且发生LLV的HIV/AIDS患者随访3个月后的外周静脉血,通过对分离的血浆进行超速离心后提取HIV RNA,利用反转录-巢式荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）技术扩增pol基因区,测序成功后进行基因亚型和耐药突变分析。结果 共筛查了10 693例患者,LLV患者225例,LLV发生率2.1%。纳入研究期间成功留血液样本的患者134例,成功收集73份VL在50～999拷贝/mL的血浆样本。扩增得到51条序列,扩增成功率69.9%。51条序列来自41例患者,CRF01＿AE亚型最常见（43.9%,18/41）,其次为CRF07＿BC亚型（19.5%,8/41）,B亚型（19.5%,8/41）和C亚型（7.3%,3/41）。19例患者发现了耐药突变,整体耐药突变率为46.3%(19/41)。其中,以NNRTIs相关耐药突变为主,占36.6%(15/41),最常见的耐药突变位点为V106I/M和V179D...     

凉山地区低病毒血症患者HIV-1 RNA和HIV-1 DNA基因型耐药特点分析

目的 分析凉山地区低病毒血症患者HIV-1 RNA和HIV-1 DNA基因型耐药的特点。方法 采集2021年5月至2022年1月在四川省凉山彝族自治州某县接受ART 6个月以上且连续两次HIV-1 RNA在50至1 000 copies/mL的HIV/AIDS患者的全血标本。分离血浆和血细胞,对血浆标本进行HIV-1 RNA基因型耐药检测,对血细胞标本进行HIV-1 DNA基因型耐药检测。比较HIV-1 RNA和HIV-1 DNA基因型耐药的特点。结果 26例研究对象中,男性12例（46.2%）,女性14例（53.8%）;年龄中位数为31.5岁;HIV-1感染途径以异性性行为为主（61.5%）;ART时间中位数为3.9年;治疗方案以2种NRTIs+1种NNRTIs为主（80.8%）。22例HIV-1 DNA样本的pol区基因扩增成功,8例HIV-1 RNA样本的pol区基因扩增成功,HIV-1 DNA的pol区基因扩增成功率高于HIV-1 RNA的pol区基因扩增成功率,且差异有统计学意义（χ2=15.442,P <0.05）。在HIV-1 RNA和HIV-1 DNA样本中,M1...     

昆明市434例HIV感染者治疗前耐药及基因亚型特征分析

<正>ART的开展使得HIV感染者病死率下降,但部分患者出现耐药突变,这可能导致耐药毒株传播。本文对2018年8月至2021年3月期间到昆明市第三人民医院就诊,ART前的HIV感染者耐药情况进行分析,结果报告如下。1对象与方法1.1对象入选标准：1）年龄≥18岁;2）HIV确认试验阳性;3）无ART史。排除标准：拒绝HIV耐药检测。本研究经昆明市第三人民医院伦理委员会批准。所有研究对象均签署了知情同意书。     

黑龙江省2018年新发现HIV-1感染者毒株亚型分子簇及耐药情况

目的 分析黑龙江省HIV-1感染者的毒株亚型构成、分子簇形成和耐药株流行情况.方法 对2018年1-6月期间新诊断的、尚未进行抗病毒治疗的黑龙江省HIV-1感染者,采集血样、提取病毒RNA,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)/巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因,测序后进行生物信息学分析.结果 获得157例H...     

甘肃省HIV-1毒株基因序列测定和亚型分析

目的对甘肃省流行的艾滋病病毒（HIV）开展分子流行病学调查.方法用套式聚合酶链反应对23份甘肃省HIV-1感染者外周血淋巴细胞中前病毒脱氧核糖核酸（DNA）的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果甘肃省流行的HIV-1分属B＇亚型（6例）、C亚型（1例）、CRF-BC亚型（16例）.其中CRF-BC亚型（70%）为主要流行毒株.结论甘肃省HIV-1流行亚型以重组毒株CRF-BC为主,在吸毒人群中广为流行;加强对高危人群监控,是遏制艾滋病在甘肃省蔓延的重中之重.     

河南省艾滋病病毒感染者HIV毒株膜蛋白基因序列研究

对河南省部分地区ＨＩＶ－１感染者提取外周血单核细胞（ＰＢＭＣ）ＤＮＡ,经套式ＰＣＲ扩增ｅｎｖ基因片断,对Ｃ２－Ｖ３区３５０－４５０核苷酸序更进行测定和分析,结果表明所采样品均属ＨＩＶ－１Ｂ亚型,与业型的基因离散率在２０％以上,与流行于云南省的ＨＩＶ属Ｂ亚型,并与云南省的流行株密切相关,其在河南省的流行时间在３年左右。     

辽宁省2004-2011年抗病毒治疗人群HIV-1亚型分布及耐药分析

高效抗反转录病毒治疗（High-active antiretro-viral therapy,HAART）艾滋病的效果受多种因素的影响,其中艾滋病病毒（Human immunodeficiencyvirus,HIV）的耐药性是导致HAART失败的主要原因之一。辽宁省自2008年开展HIV病毒载量和基因型耐药检测以来,截至2011年底,累计对389例治疗年以上的病人进行了病毒载量检测,     

深圳市HIV—1B亚型感染毒株env基因序列测定和分析

应用巢式－ＰＣＲ方法，对深圳检出的２份ＨＩＶ－１感染者的外击血单核细胞样本进行扩增，获得ＨＩＶ－１膜蛋白基因核酸片段，并对其Ｃ２－Ｖ３区及邻区３５０￣４５０个核苷酸序列进行测定和分析。     

广西凭祥市和宾阳县HIV-1流行毒株gag基因的序列测定和亚型分析

目的了解广西壮族自治区凭祥市和宾阳县吸毒人群中流行的艾滋病病毒1型(HIV-1)毒株的亚型及各种亚型的分布特点。方法对HIV-1阳性的10例吸毒人员和1例受血者进行流行病学调查,采集外周静脉抗凝血,提取前病毒DNA进行体外扩增,并对获得的gag区基因的核酸片段进行测序和分析。结果宾阳县的6份样品为CRF08-BC重组株,凭祥市的4份样品均为CRF01-AF重组株,一份输血引起的样品为B’亚型。结论在凭祥市和宾阳县吸毒人群中流行的是不同的HIV-1重组株,而且在同一地区的亚型之间进化比较接近。以上资料表明,CRF08-BC和CRF01-AE在这两地区的静脉吸毒者中成为主要的流行株。     

重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

目的对重庆市流行的艾滋病（AIDS）病毒1型（HIV-1）进行分子流行病学调查,为艾滋病预防控制策略的制定提供依据.方法用套式聚合酶链反应（nested-PCR）对31份重庆市HIV-1抗体阳性者外周血单个核细胞（PBMC）中前病毒DNA的膜蛋白基因的C2-V3区,及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果31份标本中有21份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为67.6%.经过基因离散率计算和系统树分析后证实：1份标本为CRF01-AE流行重组毒株,20份标本为HIV-1 BC重组毒株.结论目前重庆市HIV-1 BC重组病毒为优势流行株,为有效控制HIV流行,需要重点在吸毒人群中开展行为干预措施.     

广东口岸HIV流行毒株基因亚型分析

目的通过对广东口岸国际旅行人员中人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的亚型分析,监测出入境口岸HIV毒株的流行状况及其变化。方法从36例HIV-1抗体阳性样品中提取病毒RNA,逆转录后套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增HIVgag基因核心蛋白p17/p24片断,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考序列比对,确定基因型并进行系统进化树分析。结果36例样品gag区序列分析共发现8种HIV-1亚型和重组型,其中CRF BC重组型14例(38.9%)(CRF07 BC重组型13例,CRF08 BC重组型1例),CRF01AE重组型12例(33.3%),CRF02 AG重组型3例(8.3%),B亚型2例(5.6%),Al、C、G及J亚型各1例(2.8%),1例样品分型不明确。这些不同亚型的感染者来自包括中国在内的11个不同国家和地区。结论广东口岸国际旅行人员中HIV-1亚型和重组型种类复杂多样,通过监测国际旅行人员中HIV感染者基因型分布及其变异,发现和鉴定新型毒株,对于艾滋病的预防和控制十分重要。     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析北大核心

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型（HIV-1）新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主（86.9%,153/176）;其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例（2.8%,5/176）出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂（PI）,3例针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）,另有2例针对核苷类抑制剂（NRTIs）发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

九江市HIV-1流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的了解九江市艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亚型分布情况。方法对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得gag基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株4株,B亚型和A/E重组亚型HIV-1毒株各1株。结论HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。     

CRF01_AE CRF07_BC和B''''亚型HIV-1 pol基因及耐药特征分析

目的 研究中国部分地区新发现未经抗病毒治疗的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者的耐药情况,及不同亚型毒株pol基因的多态性对耐药突变产生的影响.方法 选取2005-2006年湖南、云南、四川和新疆4省(自治区,下同)当年确认的部分样本,进行核酸扩增及测序,利用系统进化及重组分析的方法确定亚型;根据美国斯坦福大学HIV-1耐药数据库,分析不同亚型毒株蛋白酶基因和逆转录酶基因的多态性和耐药突变情况;利用荷兰乌得勒支大学Vijver等人使用的一种遗传障碍定量方法,计算并比较不同亚型间耐药突变产生的遗传障碍.结果 共得到84份样本PR基因区(1-99氨基酸)和RT基因区(1-272氨基酸)的序列,亚型分析显示:84份样本中B'亚型13份,01AE重组亚型27份,07BC重组亚型44份,其中18份样本在蛋白酶基因区的第10位和第71位存在次要耐药突变;来自云南省和湖南省的3份样本中,存在逆转录酶抑制剂相关耐药突变,分别是A62V、V179D和G190A.三种亚型在逆转录酶基因区的2个非核苷类抑制剂相关耐药突变位点V106M和V108I的遗传障碍存在差异,有显著的统计学意义(P＜0.001).结论 4个地区未冶疗感染者中耐药发生的水平较低.遗传障碍的比较,CRF01AE、CRF07BC与B'亚型病人经治疗后主要耐药突变的发展模式应基本一致.     

HIV耐药的临床和基础研究进展

文章主要关注以下方面内容:艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)持续存在、储存和消除等方面的策略研究;HIV-1侵入抑制剂的耐药研究(包括通过对比使用CCR5拮抗剂治疗前的基因型和表现型来确定HIV-1的核心接受位点);反转录酶抑制剂在聚合酶领域的耐药研究(包括乙型肝炎病毒和HIV-1对拉米夫定的耐药,HIV-1 B和C亚型在K65Rw位点突变);反转录酶抑制剂在联结和RNase H领域的耐药研究[包括突变在对依非韦仑和etravirine(一种新药)应答方面的作用];对丙型肝炎病毒和HIV-1蛋白酶抑制剂的耐药研究;对整合酶抑制剂雷特格韦(Raltegravir)的耐药研究;全球耐药流行情况(包括对资源匮乏地区二线抗病毒药物耐药反应的预测模型);少数耐药变异株的作用(包括这些变异株在预防艾滋病母婴传播中的作用)。     

陕西省HIV—1流行株膜蛋白基因C2—V3区序列特征和亚型分析

目的 了解陕西省HIV－1毒株的流行情况和亚型特征。方法 用套式聚合酶链反应（Nested-PCR)对6份采集于陕西省经确认为HIV－1感染者或艾滋病病人外周血淋巴细胞（PBMC）提取核酸,从6份样品中获得了HIV－1膜蛋白（ENV）基因的核酸片段进行扩增,并测定和分析了C2－V3及其邻区共312个核苷酸序列。结果 6份血样,2份中HIV－1A亚型毒株感染（SHX7、SHX8）;4份为HIV－1B’亚型（泰国B’亚型）毒株感染（SHX1、SHX5、SHX6、SHX9）。SHX1、SHX5、SHX6、SHX9彼此问基因离散率为5．62％,SHX7与来自卢旺达的U08794之间的基因离散率仅为2．41％。结论 陕西省目前存在HIV－1A、B’两种亚型的毒株,HIV－1 B’亚型由邻近地区传入,HIV－1A亚型为非常人接触传入。     

福建省HIV-毒株耐药基因变异分析

目的了解福建省I型艾滋病病毒（HIV-1）的耐药基因变异情况。方法选取2005-2012年福建省抗病毒治疗1年以上、病毒载量高于1000拷贝／mL的HIV感染者／艾滋病病人标本,进行基因型耐药性检测。同时收集前期研究中的耐药性检测数据进行对比分析。结果共检测73例病毒学治疗失败病人标本,其中60例（82.19％）成功扩增序列,结合125份未接受抗病毒治疗者的样本,共获得185份样本进行耐药分析。未治疗组和治疗组对蛋白酶抑制剂（PI）的耐药发生率均较低,分别为1.60％（2／125）和8.33％（5／60）;未治疗组对反转录酶抑制剂（RTI）的耐药发生率为4.80％（6／125）;治疗组对RTI耐药发生率较高,为61.67％（37／60）,尤其是对NVP、EFV、3TC和FTC。最常见的耐药突变有M184V、D67N、K70R、K219Q、T215F、G190A、Y181C和K103N。结论福建省HIV-1感染者的总体原发性耐药突变率较低,病毒学治疗失败病人对PI耐药发生率仍处于低水平,但对RTI耐药发生率较高。     

福建省未经抗病毒治疗的HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的研究福建省未经抗逆转录病毒治疗的艾滋病病毒感染者伎滋病患者（HIV／AIDS患者）HIV的逆转录酶和蛋白酶耐药基因变异情况，为福建省开展HIV-1抗病毒治疗提供本底资料。方法采集福建省未经抗病毒治疗的HIV／AIDS病例的抗凝全血，分离血浆，用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）扩增HIV—lpol区序列并直接进行序列测定，提交Web站点http：／／hivdb．stanford．edu进行耐药突变分析。结果选取74份流行病学资料及序列资料完整的样本进入耐药基因分析，结果显示，蛋白酶基因的次要耐药突变广泛存在，以M36I、L63P、193L等多态性突变类型为主，未发现与蛋白酶抑制剂耐药相关的突变。逆转录酶区的耐药突变分布较为分散，发生率为20．27％（15．74）。依据耐药性解释，发现3例样本（4．05％）表现为对部分逆转录酶抑制剂的潜在或低度耐药。结论福建省未用药的HIV感染者中，耐药相关突变尚处于低流行状态，在开展抗病毒治疗后应当定期进行耐药性检测以期获得较好的效果。     

HIV耐药对低病毒载量的AIDS病人治疗预后的影响

目的探索艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)病毒载量<1 000拷贝/mL的病人的耐药情况,以及耐药对后期治疗效果的影响。方法从安徽、河南等7个地区选取97例病毒载量大于检测限,同时<1 000拷贝/mL的血浆样本,采用实验室自制(in house)方法扩增pol区的蛋白酶和反转录酶基因区,片段长度1.3kb,测得序列并经编辑后,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.Stanford.edu),分析耐药位点与耐药程度。结果在耐药毒株出现的初期,非核苷类反转录酶抑制剂是主要耐药药物,特别是对其中奈韦拉平(Nevirapine,NVP)的耐药是导致病人耐药的主要因素。在病毒载量>150拷贝/mL<1 000拷贝/mL的病人中,随着治疗时间延长,其耐药位点增加,耐药谱扩大(耐受药物种类与>1 000拷贝/mL的治疗失败病人相似)。结论在条件允许的情况下,应关注病毒反弹早期还处于低病毒载量的病人,其耐药检测结果可以有效预测后期的治疗失败和耐药发生。     

昆明市2006年注射吸毒者中HIV-1基因亚型分析

目的研究分析昆明市2006年注射吸毒者中艾滋病病毒-1型（HIV-1）的基因亚型流行情况,为更清楚地掌握昆明市HIV流行模式,制订抗病毒治疗方案和疫苗研发提供参考数据。方法采用“一对一”的问卷调查,收集基本人口学特征及HIV感染危险行为信息,采集血样,利用套式聚合酶链反应（Nested—PCR）对HIV前病毒的gag基因进行扩增,对扩增产物进行纯化、测序,通过构建系统进化树和在线比对来判定序列所属基因亚型。结果62名研究对象所感染HIV—lgag基因被成功扩增、测序、判定基因亚型。其中1人所感染的HIV-1为CRF01-AE重组型,其余均为CRF07BC重组型或CRF08-BC重组型。12名对象除注射海洛因外,还发生过商业性行为,感染CRF01-AE的对象就是发生过商业性行为的注射吸毒者。结论2006年发现的HIV-1阳性注射吸毒者中,CRF07-BC、CRF08-BC重组型毒株占据了绝对优势,同时存在CRF01-AE的流行。