胶质母细胞瘤染色体13q上肿瘤抑制基因存在的可能性

目的寻找胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)13号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失 (LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因(TSG)提供线索和依据。方法应用聚合酶链反应(PCR)方法,采用 荧光标记的引物和377型DNA序列自动分析仪,分析了20例GBM13号染色体上14个微卫星多态性标记的 LOH。结果在60％GBM的13号染色体上观察到LOH,在45.8％可提供信息位点存在LOH。其中13q的 LOH率明显高于13p,13q和13p的LOH率分别为60％、27％。在13q上的下列位点上检测到较高的LOH率 (＞50％)13q14.1-14.3上D13S153,13q12-14.2上的D13S217-D13S263,13q21.2-32上的D13S156-D13S265。 结论13号染色体可能在GBM的分子发病机制中发挥着重要作用,在13q14.1-14.3上的D13S153位点、13q 12-14.2上的D13S217-D13S263和13q21.2-32上的D13S156-D13S265间区域可能存在多个与GBM相关的肿瘤 抑制基因,可能包括RB1以及不同于RB1的其他肿瘤抑制基因。     

胶质母细胞瘤1号染色体杂合性丢失的初步研究

目的寻找胶质母细胞瘤(GBM)1号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失(LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法应用聚合酶链反应(PCR)方法,采用荧光标记的引物和377型DNA自动序列分析仪,分析了21例GBM1号染色体上31个微卫星多态性标记的LOH。结果在52%(11/21例)GBM的1号染色体上观察到了LOH,在20%(94/463)可提供信息位点存在LOH。其中1p的LOH率高于1q,1p和1q的LOH率分别为43%(9/21)、33%(7/21)。1p上各微卫星位点的LOH率均小于30%。在1q的下列位点上检测到了较高LOH率1q24-1q25上的D1s218(31.6%)、1q32.3-1q43上的D1s2785(31.6%)-D1s2842(37.5%)。结论染色体1p在GBM的分子发病机制中并不重要,而染色体1q上遗传物质的分子遗传学变化可能在GBM的发生发展中起着重要作用,染色体1q24-1q25上的D1s218和1q32.3-1q43上的D1s2785-D1s2842位点间区域可能存在与GBM有关的肿瘤抑制基因。     

人肝细胞癌4号染色体高频率杂合子丢失的研究

目的 为克了生新的肝细胞（HCC）相关肿瘤抑制基因的供位点依据。方法 使用4号染色体的12个微卫星DNA多态性标志,分析了48例原发性HCC的杂合子丢失（LOH）。结果 44％（21／48）和63％3（30／48）的肿瘤组织中至少有1个位点的LOH分别发生在4p和4q。丢失图排列鉴定了两个独立的共同丢失片段（CDR）。第1个定位在4q22-q25的CDR位于D4S392和D4S1625位点之间;第2个定位在4q27-q31的CDR位于D4S1625和D4S1652位点之间。结论 至少有两个肿瘤抑制位点存在于4q.     

Genome-wide allelotype study of primary glioblastoma multiforme

Objective To investigate the molecular genetic pathogenesis of primary glioblastoma multiforme (GBM) and identify which chromosomes or chromosomal regions of the entire genome may harbor tumor suppressor genes (TSGs) associated with GBM.Methods A high-resolution allelotype study of 21 cases of primary GBM was performed by PCR-based loss of heterozygosity （LOH）analysis. Three hundred and eighty-two fluorescent dye-labeled microsatellite markers covering all 22 autosomes were applied. The mean genetic distance between two flanking markers was about 10 cM.Results LOH was observed on all 39 nonacrocentric autosomal arms examined in this study. The LOH frequencies of 10q, 10p, 9p, 17p and 13q were the highest (>50%). Furthermore, high LOH frequencies were detected in the regions containing known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB; the LOH frequencies on 14q, 3q, 22q, 11p, 9q, 19q were also high (>40.5%). Our study observed the following commonly deleted regions: 9p22-23, 10p12.2-14, 10q21.3, 13q12.1-14.1, 13q14.3-31, 17p11.2-12, 17p13, 3q25.2-26.2, 11p12-13, 14q13-31, 14q32.1, 14q11.1-13, 22q13.3, 4q35, 4q31.1-31.2, 6q27 and 6q21-23.3. Conclusions The molecular pathogenesis of GBM is very complicated and associated with a variety of genetic abnormalities on many chromosomal arms. The most closely related chromosomal arms to the pathogenesis of GBM are 10q, 10p, 9p, 17p and 13q. Besides the well-known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB, multiple unknown TSGs associated with GBM may be present on the commonly deleted regions detected in the present study.     

散发性结直肠癌3号染色体等位基因杂合缺失

目的 了解散发性结直肠癌（SCRC）3号染色体等位基因杂合缺失（LOH）发生情况。探讨其与临床病理特征间的关系,并对3号染色体上可能的SCRC相关基因进行初步定位。方法 用覆盖3号染色体的13个微卫星标记对83例散发性结直肠癌进行LOH扫描分析。结果 3号染色体至少有两个位点发生LOH者占39%（29/74）,3p所选4个位点中至少有一个发生LOH者占37%（27/74）,3q所选9个位点中至少有一个发生LOH者占53%（39/74）。整条染色体上以D3S1300（3q14.2)位点LOH率最高,达54%（23/43）。3qLOH在远端结直肠癌较近端高发,3q及D3S1300LOH阳性肿瘤多表现为浸润型生长和局部侵犯,并多发于大于50岁的老年患者。结论 3号染色体存在散在分布及区域性高频等位基因LOH,并与SCRC临床病理资料相关,提示其上SCRC相关基因的存在。高频LOH位点D3S1300的发现,提示3p14.2附近区域的FHIT基因可能作为肿瘤抑制基因在结直肠癌的发生发展中发挥作用。     

Chromosome 6q deletion mapping in human ovarian tumor, a common deletion region between D6S1649 and D6S311

Objective： To explore the loss of heterozygosity（LOH） on chromosome 6q in ovarian cancer, and localize a minimum area in deletion region. Methods： 93 ovarian tumors were analyzed for LOH studies with 10 microsatellite markers spanning chromosome 6q. To further localize a minimum area in deletion region. Nineteen microsatellite markers were used to refined a minimum area. Results： Forty three tumors （46%） were demonstrated allelic losses, which spanned less than two megabase areas, franked by a distal marker D6S311 and a proximal marker D6S1649, and likely harbored ovarian tumor suppressor gene （s）. With analysis of density of LOH, increased DNA copy number at loci of 6q was demonstrated between D6S1649 and D6S311. Conclusion： It is possible that duplication after the allelic loss might be a main mechanism that leads to carcinogenesis in ovarian tumor. The refinement of these candidate tumor suppressor genes loci might facilitate future loss of heterozygosity studies and enable the isolation of candidate genes from this region.     

原发性肝癌全基因组杂合性缺失的研究

目的 研究肝癌全基因组等位基因杂合性缺失（ＬＯＨ）及其临床意义。方法 采用３８２对微卫星标志,对６５例肝癌２２条常染色体等位基因ＬＯＨ进行检测。结果 全组平均杂合子６８．１％。ＬＯＨ〉３０％的有１ｑ、３ｑ、４ｑ、８ｐ、１３ｑ、１６ｑ和１７ｐ。ＨＢｓＡｇ阳性者Ｄ４Ｓ２９６４ ＬＯＨ（６６％）较ＨＢｓＡｇ阴性者（３０％）高（Ｐ〈０．０５）;Ｄ３Ｓ３６８１和Ｄ１７Ｓ９３８ ＬＯＨ者术后复发率（９１％、８     

视网膜母细胞瘤中基因杂合缺失现象的研究

目的：由于Rb1基因的失活可能不是引发视网膜母细胞瘤（RB）的唯一因素。因此，此项课题中我们通过探索第13号染色体上基因杂合缺失（LOH）现象发生的机率以及通过家系分析确定标记位点缺失的遗传学源，试图探明其它可能参与RB发生发展的基因存在的位点，并试图寻找和确定具有诊断及预后价值的LOH检测指标。方法：16个RB患者成对的肿瘤与其相应血清标本在13号染色体上14个微卫星标记处通过荧光PCR进行扩增，分别测定LOH；并通过对患者家庭进行分析确定标记位点缺失的遗传学来源。结果：16个RB患者上，12个在13号染色体上一个或一个以上位点发生LOH，其中三个位点，D13S265，D13S263和D13S153（位于Rb1基因内），LOH发生机率最高，分别是8个，8个和9个，12个LOH阳性标本中有10个标记位点的缺失被确定发生在父系来源的染色体中，LOH阳性及阴性组肿瘤的发生时间分别为504d和1086d。结论：在位点D13S263（13q14.1-14.2)和D13S265（13q31-32)处可能含有某些未知基因参与RB的发生发展，在我们的实验群体中标记位点缺失大多选择性地发生在父系来源的染色体中，此外，LOH阳性组的患者RB确诊时间早于LOH阴性组，其中D13S263和D13S265两个位点的LOH现象可能对RB的早期诊断具有一定提示作用。     

High frequency loss of heterozygosity in the region of the DBH locus in bladder cancer

Ｂｌａｄｄｅｒｃａｒｃｉｎｏｍａｉｓｔｈｅｆｏｕｒｔｈｍｏｓｔｃｏｍｍｏｎｃａｎｃｅｒｗｉｔｈａｒｉｓｉｎｇｉｎｃｉｄｅｎｃｅａｎｄｔｈｅｌｅａｄｉｎｇｃａｕｓｅｏｆｄｅａｔｈｉｎｍｅｎ Ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｅｌｙ 70 %ｏｆｎｅｗｔｕｍｏｒｓａｒｅｓｕｐｅｒｆｉｃｉａｌ,ａｎｄｈａｖｅａｇｏｏｄｐｒｏｇｎｏｓｉｓ Ｔｈｅｒｅｍａｉｎｉｎｇ 30 %ａｒｅｍｕｓｃｌｅ ｉｎｖａｓｉｖｅｗｉｔｈａｐｏｏｒｐｒｏｇｎｏｓｉｓ 1 　Ａｎｕｍｂｅｒｏｆｃｙｔｏｇｅｎｅｔｉｃａｎｄｍｏｌｅｃｕｌａｒａｎａｌｙｓｅｓｈ…     

胃癌染色体1q21等位基因杂合性缺失的精细定位

目的 精细定位胃癌染色体1q21等位基因杂合性缺失及其常见缺失区域,并初步探讨1q21等位基因杂合性缺失在胃癌发生发展中的作用.方法 采用1q21区域7个高密度微卫星多态性标志结合PCR技术.精细分析了30例配对新鲜胃癌手术标本中胃癌染色体等位基因杂合性缺失的情况,利用X2检验和四格表确切概率法初步探讨了1q21等位基因杂合性缺失与胃癌临床特征的关系.结果 30例胃癌标本中,有18例存在等位基因杂合性缺失,占60%(18/30),7个微卫星位点D1S514、D1S2696、D1S498、D1S305、D1S2624、D1S2635和D1S2707的杂合性缺失频率分别为13.3%、10%、20%、23.3%、33.3%、40%和23.3%.常见高频率杂合性缺失区域位于D1S2624-D1S2707之间,即共同缺失区在D1S2635附近;胃癌染色体1q21等位基因杂合性缺失与病人的年龄、性别、胃癌原发灶的部位、癌细胞分化程度及临床分期比较差异没有湿著性意义(P>0.05);但是,胃癌染色体1q21等位基因杂合性缺失与胃癌有无淋巴结转移比较差异有显著性意义(P<0.05).结论 胃癌细胞染色体1q21存在较高频率的等位基因杂合性缺失,D1S2635附近可能存在与胃癌发生密切相关的肿瘤抑制基因.     

人肺腺癌染色体8p21～p22杂合性缺失精细作图

目的　在染色体 8p2 1 8p2 2界定发生于中国人肺腺癌的杂合性缺失 (LOH)的最小区域 ,为定位克隆肺腺癌相关抑癌基因提供线索。方法　利用 32例肺腺癌患者肿瘤组织检测位于 8p2 1～p2 2的 17个微卫星多态性标记的LOH频率 ,并且探讨各位点LOH与病理分级和临床分期的关系。结果　在 32例肺腺癌患者组织中有 31例 (96 6 7% )存在至少 1个位点的LOH ;主要集中于 3个区域 :位于 8p2 2的D8S2 5 4～ 2 6 1、D8S182 7～ 1731以及D8S1135。所检测位点中仅D8S2 6 1位点的LOH发生频率与肺腺癌分期呈正相关 (P <0 0 5 )。结论　 8p2 2区域可能存在位于D8S2 5 4～ 2 6 1,D8S1135和D8S182 7～ 1731的、与中国人肺腺癌相关的抑癌基因     

Detailed deletion mapping of loss of heterozygosity on 9p13-23 in laryngeal squamous cell carcinoma by microsatellite analysis

Background This study was designed to investigate the hot spots of microsatellite loss of heterozygosity (LOH) on 9p13-23 in laryngeal squamous cell carcinoma and to find out the correlation between the incidence of microsatellite LOH and the clinicopathological parameters.Methods Tumor tissues were obtained from paraffin embedded sections with microdissection. Genomic DNA was extracted from tumor tissues and peripheral blood lymphocytes with the phenol-chloroform. Polymerase chain reaction (PCR) amplification and denaturing gel electrophoresis were carried out in a set of 42 squamous cell carcinoma (SCC) of larynx and corresponding peripheral blood lymphocytes using 13 highly polymorphic microsatellite markers on 9p13-23. The correlation was analyzed between microsatellite LOH at the high frequency on 9p13-23 and clinicopathological parameters in the patients with squamous cell carcinoma of larynx.Results Of the 42 laryngeal cancers, 41 (97.6%) showed LOH in at least one of the microsatellite markers tested on 9p13-23. The most frequently deleted marker was D9S162 in 17 of the 19 (89.5%) informative samples. The marker D9S171, which is located on 9p21, had LOH detected in 12 of the 15 informative cases (80.0%). LOH at the D9S1748 marker (closest to the p16 gene locus) was detected in 18 of the 36 informative cases (50.0%). Allelic deletion mapping revealed two minimal regions of LOH encompassing markers D9S161-D9S171 on 9p21 and IFNA-D9S162 on 9p22-23. Multiple LOH (≥4) on 9p21-23 was found more frequently in the patients under 60 years, with supraglottic SCC or cervical lymph node metastasis than those over 60 years, with glottic SCC or without cervical lymph node metastasis (P&lt;0.01 or 0.01, 0.05, respectively). On the contrary, there was no correlation between T stages or pathologic classification and the frequency of LOH on 9p21-23 in 42 SCC of Larynx.Conclusions These findings imply the presence of at least two putative tumor suppressor genes on 9p13-23 in laryngeal SCC. Multiple genetic alterations are probably implicated in supraglottic SCC with cervical lymph node metastasis in younger patients.     

尿脱落细胞6号染色体长臂的微卫星改变诊断膀胱肿瘤

目的：探讨尿脱落细胞6q的微卫星改变(MA)在膀胱肿瘤早期诊断中的应用价值，并研究6q的杂合性缺失(LOH)与膀胱肿瘤的关系．方法：应用6q21区域附近D6S404，D6S434微卫星标志，以PCR—SSLP—银染法对31例膀胱肿瘤的尿脱落细胞与肿瘤组织进行微卫星分析．结果：64．5％的肿瘤组织和58．1％的尿脱落细胞发生MA;10例非膀胱肿瘤对照未出现MA；检出率与肿瘤分期，分级无相关性；肿瘤组织D6S404 LOH发生率35．5％，D6S434 LOH发生率22．6％．结论：尿脱落细胞微卫星分析有早期诊断意义；6q21区域附近可能存在与膀胱肿瘤相关的肿瘤抑制基因．     

胃癌患者6号染色体长臂遗传不稳定性

目的研究中国人胃癌6号染色体长臂微卫星不稳定性（microsatellite instability,MSI）和杂合性缺失（loss of heterozygosity,LOH）状况及与临床病理特征之间的联系。方法采用PCR-SSLP-银染方法对27例胃癌组织及其相应正常组织6号染色体长臂（6q）不同位置的4个位点进行MSI和LOH检测。结果27例信息个体中16例检测到一个或多个位点MSI,平均MSI频率59．2％;11例不具MSI的信息个体中7例存在1个或更多位点LOH,平均频率63．6％。MSI和LOH频发位点均为D6S434（6q16．3-q21）和D6S404（6q16．3-q23）。MSI和LOH在高分化胃癌和低分化胃癌各个时期均有发生．但高分化胃癌中高水平MSI（MSI-H）发生有增高趋势。结论MSI和LOH发生率与年龄、性别、组织分化程度、病理分期及发病部位等临床指标虽然无明显相关,但6q等位基因缺失关键区域与其它国家、地区相似,进一步证实6q上该区可能存在与胃癌相关的肿瘤抑制基因。     

High frequency loss of heterozygosity on the long arms of chromosomes 13 and 14 in nasopharyngeal carcinoma in Southern China

目的：分析鼻咽癌（NPC）13号染色体长臂（13q）和14号染色体长臂（14q）上21个位点的等位基因杂合子丢失（LOH）,并分析这些位点的LOH与NPC临床病理及EBV感染的关系。方法：用聚合酶链反应（PCR）为基础的微卫星多态性分析技术结合基因扫描和基因绘图技术对60例NPC进行LOH分析。结果：13q染色体发生一个或多个位点LOH频率为78％,高频率LOH（大于30％）位点集中于13q12.3-q14.3和13q32附近。14q染色体发生至少一个位点LOH的频率为80％,高频率丢失位点集中于14q11-q13、1q421-q24和14q32附近。13q31-q32位点的LOH与低滴度血清EBV EA/IgA有关;14q染色体的LOH与NPC细胞的分化差有关。结论：华南地区鼻咽癌在13q和14q染色体发生高频率的LOH,这些缺失区可能存在多个在NPC发生发展过程中起重要作用的肿瘤抑制基因。     

Allele loss on chromosome 9q22.2-22.3 in sporadic basal cell carcinoma in Chinese

ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｒｏｌｅｏｆａｌｅｌｅｌｏｓｓｏｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ９ｉｎｔｈｅｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓｏｆｂａｓａｌｃｅｌｃａｒｃｉｎｏｍａ（ＢＣＣ）ｂｙｅｘａｍｉｎｉｎｇｔｈｅｌｏｓｓｏｆｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓ...     

中国人喉鳞癌染色体9p21.3-23区域LOH分析

目的：分析染色体9p21.3-23区域等位基因杂合性缺失（loss of heterozygosity,OLH)情况，确定其在中国人喉鳞癌中发生频率和最小缺失区域，为定位克隆喉鳞癌相关抑癌基因提供线索。方法：应用9个微卫星多态性标记对24例喉鳞癌组织及其对应的正常远端肺组织进行了同位素标记的聚合酶链反应和变性凝胶电泳，并探讨各位点LOH与病理分级和病理分期的关系。结果：24例喉鳞癌组织中，共有23例（95.83%)存在至少一个位点的LOH，丢失频率最高的位点位于9p22-23的D9S1782（100%）其次是位于9p22-23的D9S162（85.71%)。结论：在9p21.3-23区域可能存在两个或两个以上的与喉鳞癌发生相关的候选抑癌基因，分别位于9p22-23的D9S1782和D9S162附近。     

原发性肝癌患者17号和16号染色体等位基因杂合性丢失的研究

目的 研究肝癌１７号和１６号染色体特定区域等位基因杂合性丢失（ＬＯＨ）发生情况,并探讨ＬＯＨ与肝癌的临床病理和乙型、丙型肝炎病毒感染的关系。方法 用聚合酶链反应、微卫星多态性分析技术检测１７号和１６号染色体ＬＯＨ。结果 １７号染色体６个位点在至少一个位点发生ＬＯＨ的有３１例（８２％）,其中Ｄ１７Ｓ５２０（１７ｐ１２－１３．３）和ＴＰ５３（１７ｐ１３．１）位点ＬＯＨ频率大于５０％;１７ｑ所选４个位点     

胰岛素瘤频发MEN-1抑癌基因及22q的杂合缺失及其意义

目的探讨胰岛素瘤发病的可能机制,寻找鉴别胰岛素瘤良恶性的分子遗传学指标。方法40个胰岛素瘤肿瘤标本(8个恶性,32个良性)经显微切割获取肿瘤组织和正常对照组织,并提取相应的基因组DNA。用聚合酶链反应(PCR)检测MEN-1基因以及22号染色体长臂(22q)的杂合缺失(LOH)。结果40．0％的肿瘤发生MEN-1的LOH,75．0％的肿瘤发生22q的LOH。22q12(D22S929与D22S280之间)和22q13．3是LOH的2个频发区域,分别占30个22qLOH的37．0％(11／30)和47．0％(14／30)。在D22S280位点,有8个肿瘤标本发生D22S280LOH,但无一例发生MEN-1 LOH,而无D22S280 LOH的30个肿瘤标本中,有14个发生MEN-1 LOH(47．0％)(P=0．016)。在第2个频发区中,14个发生LOH的肿瘤有6个(43．0％)为恶性,26个无LOH肿瘤中有2个(8．0％)为恶性(P=0．0088)。结论在D22S280位点上发生LOH可能是一个与MEN-1基因无关的独立的胰岛素瘤致病因素。发生22q13．3 LOH可能与肿瘤恶性相关。     

中国南方食管鳞癌D5S107和D5S408杂合性丢失与微卫星不稳定性

 【目的】研究中国南方食管癌高发地区（潮汕地区）食管鳞癌5号染色体长臂（5q）部分微卫星标记的杂合性丢失（LOH）和微卫星不稳定（MSI），为食管鳞癌相关抑癌基因的定位提供依据。【方法】采用PCR银染技术，检测58例配对食管鳞状细胞癌标本多个微卫星标记（D5S107；SHGS31088；D5S816；D5S625和D5S408）的杂合性丢失和微卫星不稳定。【结果】SHGS31088，D5S816和D5S625杂合性丢失率和微卫星不稳定都较低；而D5S107和D5S408的杂合性丢失率分别为48.5%和34.3％，微卫星不稳定率分别为9.1％和5.7％。【结论】中国南方食管鳞癌D5S107和D5S408的杂合性丢失率较高，提示在D5S107和D5S408附近可能存在食管癌相关基因。5q区域5个微卫星标记的微卫星不稳定发生率都较低，提示微卫星不稳定在中国南方食管癌发生过程中可能不占主导地位。