Probasin启动子的克隆及其在不同肿瘤细胞系中的表达活性

目的: 构建Probasin(PB)启动子调控的pGL3表达载体, 比较两种不同组成形式的Probasin启动子的组织特异性和活性。方法：提取大鼠前列腺组织DNA，通过PCR得到Probasin启动子（426，+28bp）序列，并通过交叠PCR得到改造的ARR2PB序列，分别插入pGL3Basic表达载体,同时构建CMV     

NGAL 基因5’侧翼区启动子区的克隆与鉴定

目的对NGAL(neutrophil gelatinase-associated lipocalin)基因5′侧翼区的转录调控启动子区进行分段定位鉴定.方法将NGAL基因5'侧翼区-416～ 84和-152～ 84两个区段分别克隆至专门用于研究启动子的报告基因表达载体pGL3-Enhancer(pGLE)中,构建表达载体pGLE -416和pGLE -152; 然后将pGLE -152和pGLE -416分别与pRL-TK载体共转染HeLa细胞、EC109细胞和Vero细胞,通过检测相对荧光素酶活力,确认这些NGAL基因片段中是否含有启动子元件.结果与pGLE相比,pGLE -152在上述三种细胞中的相对荧光强度均明显增强(P<0.05),且在不同的细胞中增强的幅度明显不同.结论 NGAL基因的启动子位于-152～ 84区段内,启动子的强弱具有细胞特异性,这可能与增强子的协同作用相关联.     

小鼠Egr-1基因启动子的克隆及其辐射诱导基因表达

目的：研究克隆小鼠Ｅｇｒ－１基因启动子及其辐射诱导基因表达特征。方法：用合成的一对引物,以ＢＡＬＢ／ｃ小鼠基因组为模板,扩增出４４９ｂｐ大小含６个ＣＣ（Ａ／Ｔ）６ＧＧ基序的序列,通过亚克隆技术分别将其插入ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔⅡ测序载体和ｐＨＧＦＰ－Ｓ６５Ｔ报告载体中,利用测序载体对克隆的ＤＮＡ序列进行分析。报告质粒载体经Ｌｉ－ｐｏｆｅｃＴＡＭＩＮＥ脂质体介导转染ＣＯＳ－７细胞后给予γ射线照射或Ｈ     

食管癌细胞Ezrin基因转录调控区克隆及其启动子活性的鉴定

目的:克隆食管癌侵袭转移相关基因Ezrin的转录调控区序列,进行启动子活性鉴定及初步的生物信息学分析。方法:利用在线程序对Ezrin基因可能的转录调控区进行GC含量和CpG岛分析以及转录因子结合位点预测;采用PCR法从食管癌细胞基因组DNA中克隆Ezrin基因-1759/ 134和-726/ 134区段,构建萤火虫荧光素酶报告基因表达质粒pGLB-hE(-1759/ 134)和pGLB-hE(-726/ 134),检测所克隆片段的启动子活性。结果:Ezrin基因5′侧翼区为高GC含量区,存在CpG岛,无典型的TATA盒,然而转录因子Sp1结合位点却无处不在。与对照质粒pGLB相比,重组质粒pGLB-hE(-726/ 134)具有较强的荧光素酶活性,pGLB-hE(-1759/ 134)的荧光素酶活性约是pGLB-hE(-726/ 134)的2倍。结论:Ezrin基因的-726/ 134区段具有启动子活性,含有Ezrin基因的核心启动子区和调节性启动子区;-1759/-726区段具有增强启动子活性的作用,含有Ezrin基因增强子元件区。     

NGAL 基因5’侧翼区启动子区的克隆与鉴定

 目的 对NGAL(neutrophil gelatimse-associated lipocalin)基因5’侧翼区的转录调控启动子区进行分段定位鉴定。方法 将NGAL基因5’侧翼区-416～+84和-152～+84两个区段分别克隆至专门用于研究启动子的报告基因表达载体pGL3-Enhancer(pGLE)中，构建表达载体pGLE-416和pGLE-152；然后将pGLE-152和pGLE-416分别与pRL-TK载体共转染HeLa细胞、EC109细胞和Vero细胞，通过检测相对荧光素酶活力，确认这些NGAL基因片段中是否含有启动子元件。结果 与pGLE相比，pGLE-152在上述三种细胞中的相对荧光强度均明显增强(P<0．05)，且在不同的细胞中增强的幅度明显不同。结论 NGAL基因的启动子位于-152～+84区段内，启动子的强弱具有细胞特异性，这可能与增强子的协同作用相关联。     

MDR1启动子/荧光素酶质粒的构建及其在朊蛋白高表达胃癌细胞中的活性检测

目的：构建含MDR1基因启动子的荧光素酶报告基因质粒,并检测其在朊蛋白高表达胃癌细胞系中的活性表达。方法：PCR克隆人MDR1基因启动子片段,通过亚克隆将启动子分别插入到pMD18-T载体和荧光素酶报告基因pGL3-Enhancer载体中,建立含MDR1启动子的荧光素酶报告基因质粒pGL-MDR1,并经测序及酶切确定扩增序列;脂质体基因转染法将pGL-MDR1转染入朊蛋白高表达胃癌细胞系SGC7901-PrP,并测定其荧光素酶活性。结果：PCR克隆出MDR1启动子经DNA测序证实序列正确,pGL-MDR1转染入朊蛋白高表达胃癌细胞系的荧光素酶活性,较转染入pcDNA3.1空载体细胞系相比升高3-5倍。结论：成功构建含MDR1启动子的荧光素酶报告基因质粒;上调朊蛋白表达可激活MDR1的转录活性。     

MLAA-22基因上游调控区的分离及启动子活性分析

目的:分离MLAA-22 基因上游转录调控区序列,进行启动子活性鉴定。方法:人工合成MLAA-22 基因上游转录调控区序列MLAA-22（-999～+1)和MLAA-22（-1999～+1)两个区段,将两个区段插入到双荧光素酶报告基因表达载体psiCHECK-2的BglⅡ/NheI限制性内切酶位点中,构建双荧光素酶报告基因表达质粒,将重组质粒分别命名为psiCHECK-2-MLAA-22（-999～+1)和psiCHECK-2-MLAA-22（-1999～+1）;采用双荧光素酶报告基因系统检测所分离区段的启动子活性。结果:MLAA-22（-999～+1)和MLAA-22（-1999～+1）两个区段均具有较强的相对荧光素酶活性,并且MLAA-22（-999～+1)区段的相对荧光素酶活性明显高于MLAA-22（-1999～+1）区段。结论:MLAA-22 基因上游转录调控区（-999～+1）区段将是今后我们进行MLAA-22 基因上游转录调控区启动子活性研究的重点区域。     

MDR1启动子/荧光素酶质粒的构建及其在朊蛋白高表达胃癌细胞中的活性检测

目的:构建含MDR1基因启动子的荧光素酶报告基因质粒,并检测其在朊蛋白高表达胃癌细胞系中的活性表达。方法:PCR克隆人MDRl基因启动子片段,通过亚克隆将启动子分别插入到pMD18-T载体和荧光素酶报告基因pGL3-Enhancer载体中,建立含MDR1启动子的荧光素酶报告基因质粒pGL-MDR1,并经测序及酶切确定扩增序列;脂质体基因转染法将pGL-MDR1转染入朊蛋白高表达胃癌细胞系SGC7901-PrP,并测定其荧光素酶活性。结果:PCR克隆出MDR1启动子经DNA测序证实序列正确,pGL-MDR1转染入朊蛋白高表达胃癌细胞系的荧光素酶活性,较转染入pcDNA3.1空载体细胞系相比升高3~5倍。结论:成功构建含MDRl启动子的荧光素酶报告基因质粒;上调朊蛋白表达可激活MDR1的转录活性。     

小鼠Doc-1R基因的克隆及其表达

背景与目的：Doc-1R基因是1999年克隆的一种新的基因,已有的研究表明Doc-1R基因可能是一种潜在的抑癌基因。为了进一步研究此基因的功能,我们首先克隆了小鼠的Doc-1R基因,并对此基因的表达进行了初步的研究。方法;根据小鼠的Doc-1R基因cDNA序列,设计合成了基因组特异引物,应用巢式PCR对小鼠基因组步移文库进行扩增。对测序结果进行序列分析及剪接位点的鉴定。另外应用RT－PCR的方法研究了Doc-1R基因在小鼠肝,脾,胰,肾,肺,肠,心,脑,骨,肌肉,膀胱,卵巢,睾丸等13种组织的表达。结果：经二次基因组步移获得了小鼠Doc-1R基因组全长序列。基因组全长2787bp,含4个外显子和3个内含子,外显子与内含子接头符合GT／AG法则。RT－PCR结果表明,Doc-1R基因在小鼠13种组织和器官中均有表达。结论：成功克隆了小鼠Doc-1R基因,为进一步研究此基因的功能奠定了基础。RT－PCR表达结果提示此基因可能是对维持组织器官的功能具有重要的作用的管家基因。     

人类生存蛋白启动子的克隆及其在淋巴瘤细胞中的转录活性研究

  目的　克隆人类生存蛋白（Survivin）核心启动子,研究Survivin启动子在人类淋巴瘤细胞Ramos和健康人肝脏细胞Chang Liver中的转录活性。方法　以人类肠基因组DNA为模板,PCR扩增Survivin启动子987 bp片段,将其通过酶切位点连入pGL3-Basic载体构建pGL3-Survivin荧光素酶报告基因载体,通过脂质体转染法转染Ramos和Chang Liver 细胞,通过检测荧光素酶表达水平,比较Survivin启动子在这两种细胞中的转录活性。结果　成功克隆出987 bp的Survivin启动子;双酶切、PCR检测和DNA测序证实pGL3-Survivin载体构建成功;荧光素酶活性检查显示：Survivin启动子在Ramos细胞中的转录活性为阳性对照CMV启动子活性的4.5 %,明显高于在Chang Liver细胞中的0.19 %,在淋巴瘤细胞中具有较高特异性,且在淋巴瘤细胞中的活性明显高于阴性对照pGL3-Basic的0.086 %。结论　Survivin启动子在淋巴瘤细胞中具有较高的特异性,可以作为淋巴瘤细胞基因转染的肿瘤特异性启动子使用。     

Functional characterization of the HOXB13 promoter region

Homeobox (HOX) genes are crucial regulators of cell growth and differentiation. These genes initiate and control gene expression cascades that drive development. More recently, the absent or aberrant expression of HOX genes has been implicated in cancer development. Despite the observance of these expression changes, the regulation of the HOX genes in adult tissues and how these genes become deregulated in cancerous tissues still needs much investigation. We characterized the promoter region of the HOXB13 gene. A 3 kb region upstream of the HOXB13 gene, which included the 5'UTR, increased reporter gene expression in LNCaP cells by approximately 99 fold over the promoterless control construct. A highly conserved 179 base pair fragment containing only the 5'UTR of the HOXB13 gene constituted a minimal promoter in the LNCaP cell line. Strong promoter activity was seen in the presence or absence of testosterone, although testosterone exposure did decrease expression in LNCaP cells by 50%. In an androgen insensitive cell line Du145, no sensitivity to testosterone was detected and a consistent low basal level of expression was observed. Since HOXB13 expression is highly tissue specific, we investigated the ability of the promoter to drive expression in tissues other than prostate. We observed highest expression in LNCaP cells with low levels of expression in lung, retinoblastoma, and colon cancer cells and higher expression in MCF7 breast cancer cells.     

WT1基因在白血病患者中的表达及临床意义

 目的 探讨WT1基因在白血病患者中的表达及其临床意义。方法 运用RT-PCR方法检测 WT1基因在50例白血病患者中的表达。结果 急性髓细胞白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL）WT1表达阳性率分别为77.3 %（17／22）和54.5 %（6／11）。慢性粒细胞白血病（CML）慢性期WT1表达均阴性,急变期55.6 %（5／9）表达阳性。WT1阳性患者化疗缓解率低于阴性患者（分别为31.3 %和69.2 %,P <0.05）。结论 WT1在白血病患者中高表达,可作为临床评估预后、检测微小残留病（MRD）的标志。     

新疆维吾尔族妇女子宫颈癌DBC1基因启动子甲基化分析

背景与目的：近年来,表观遗传学研究已经成为癌症研究的一个新方向。大量研究结果显示,表观遗传修饰的异常改变与癌症有着十分密切的联系,全基因组范围内的表观遗传修饰改变已经成为癌症的新标志。该研究旨在探讨膀胱癌缺失基因1(deleted in bladder cancer 1,DBC1)启动子甲基化与新疆维吾尔族妇女子宫颈癌的关系及与人类乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染的相关性,分析其能否作为高敏感性及特异性的工具用于子宫颈癌筛选。方法：用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对43例正常子宫颈组织、35例子宫颈上皮内瘤样变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)组织以及54例子宫颈癌组织进行HPV16、HPV18感染的检测;运用甲基化特异性PCR方法检测上述组织DBC1基因启动子甲基化状况;采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)方法检测10例甲基化阴性的正常子宫颈组织和10例甲基化阳性的子宫颈癌组织中DBC1基因mRNA表达情况。结果：正常子宫颈组织、CIN组织及子宫颈癌组织中HPV16的感染率分别为18.6%、34.3%和68.5%;HPV18的感染率分别为2.3%、8.6%和16.7%;DBC1基因发生甲基化率分别为23.3%、40.0%和87.0%;在79例高级别宫颈损伤及子宫颈癌样本中,其中50例HPV16/18感染阳性,29例HPV16/18感染阴性;阳性组中DBC1基因发生甲基化率88.0%,阴性组甲基化率为55.2%(P<0.05);10例甲基化阳性子宫颈癌组织中DBC1基因mRNA表达水平明显低于10例甲基化阴性正常子宫颈组织(P<0.05)。结论：DBC1基因甲基化可能作为新疆维吾尔族妇女子宫颈癌的分子标志物,结合HPV16/18感染检测有助于子宫颈癌的诊断。     

NY-ESO-1基因在人食管癌中的表达及其基因克隆

背景与目的：NY-ESO-1是从食管癌cDNA文库中筛选到的肿瘤抗原,但是该基因在食管癌组织中的表达情况尚未见报道。本文研究NY-ESO-1基因在食管癌中的表达率,以便于确定食管癌患者是否可以使用以NY-ESO-1抗原为基础的疫苗治疗。方法：采用RT-PCR方法检测了NY-ESO-1基因在30例食管癌组织和相应癌旁正常组织中的表达;采用分子克隆的方法从食管癌组织中克隆了NY-ESO-1cDNA。结果：NY-ESO-1基因在食管癌组织中的表达率为50%（15/30）,在30例相应癌旁正常组织中未见表达;克隆的NY-ESO-1cDNA序列与GenBank报道一致。结论：NY-ESO-1基因在食管癌中高频率表达,NY-ESO-1抗原可以被具有HLA-1类分子限制性CTL识别。     

KAI1基因在喉鳞癌中的表达及其临床意义

目的探讨KAI1基因在喉鳞状细胞癌中的表达及其临床意义。方法取40例喉鳞癌及9例正常对照喉组织,应用半定量的RT PCR方法,检测KAI1基因mRNA的表达。结果正常喉黏膜KAI1基因mRNA的中、低表达率和阴性率均为33.3%(3/9);无淋巴结转移组喉癌高、中、低表达率和阴性率分别为40.0%(10/25)、28.0%(7/25)、20.0%(5/25)和12.0%(3/25);淋巴结转移组喉癌中、低表达率和阴性率分别为20.0%(3/15)、26.7%(4/15)和53.3%(8/15),无淋巴结转移组喉癌与正常喉组织比较,KAI1mRNA表达升高差异有统计学意义(P<0.05),有淋巴结转移与无淋巴结转移组喉癌比较,KAI1基因mRNA表达下降差异有统计学意义(P<0.05)。病理高分化喉癌KAI1基因mRNA高、中、低表达率分别为50.0%(5/10)、30.0%(3/10)和20.0%(2/10);病理低分化喉癌其高、中、低表达率和阴性率分别为8.3%(1/12)、16.7%(2/12)、16.7%(2/12)和58.3%(7/12);高分化与低分化比较,KAI1基因mRNA表达差异有统计学意义(P<0.05)。结论KAI1基因mRNA表达下降可能与喉鳞状细胞癌的病理低分化和淋巴结转移有关。     

Kiss-1基因在乳腺肿瘤组织中的表达及其临床意义

目的探讨Kiss-1 mRNA在乳腺肿瘤组织和正常腺体组织中的表达及其临床意义。方法采用逆转录聚合酶链式反应（RT．PCR）法检测70例乳腺癌、40例乳腺纤维腺瘤及肿瘤旁正常腺体中Kiss-1 mRNA的表达,采用配对t检验、成组t检验及方差分析比较各组间Kiss-1 mRNA的相对表达水平。结果Kiss-1 mRNA在乳腺癌组织及纤维腺瘤组织中的表达量分别为（0．952±0．576）、（0．587±0．496）,均高于正常腺体组织（t=7．917,P=0．00;t=2．656,P=0．011）,乳腺癌组织中的表达量高于纤维腺瘤组织（t=3．365,P=0．001）。有淋巴结转移的乳腺癌组织中Kiss-1 mRNA表达量为（0．662±0．530）,低于无淋巴结转移乳腺癌组织（1．124±0．537）（t=3．495,P=0．001）。结论Kiss-1 mRNA在乳腺肿瘤组织中相对高表达,可能成为潜在的乳腺肿瘤标志物;Kiss-1 mRNA低表达可能与乳腺癌淋巴结转移相关。     

Functional characterization of the GDEP promoter and three enhancer elements in retinoblastoma and prostate cell lines

GDEP (gene differentially expressed in prostate cancer aka. PCAN1), a newly discovered gene with remarkable tissue specificity, is a promising candidate for regulatory analysis because it exhibits a high level of expression that is limited to two tissues, the retina and the prostate. As these two tissues have different origins and disparate functions it is likely that the regulatory mechanisms responsible for expression are not shared in their entirety. In addition, both the retina and prostate are prime targets for gene therapy. To date there have been no functional studies of the GDEP promoter. Therefore to understand tissue-specific expression of GDEP we constructed promoter expression constructs. To further characterize functional regulatory regions within the GDEP gene, we investigated potential regulatory components for tissue-specific expression in the 40 kb intron of this gene. We have identified a 1.5 kb prostate-specific promoter from the proximal region of the GDEP gene. A smaller 0.5 kb promoter exhibited minimal activity in the retinoblastoma cell line Y79, but not in the prostate cells tested. In addition we have investigated three enhancer elements located in the 40 kb intron of the GDEP gene. We identified two enhancer elements that increase reporter gene expression in prostate cell line LNCaP and one additional enhancer element that increases expression in the Y79 cell line approximately 8-fold making it a strong retinal-specific enhancer.     

端粒酶基因hTRT在胃癌中的表达及其临床意义

目的 探讨胃癌中端粒酶基因hTRT mRNA表达与临床参数的关系，评价hTRT表达检测在胃癌诊断中的价值。方法 用原位杂交的方法检测端粒酶基因hTRT mRNA在胃癌、癌旁组织和胃良性病变中的表达和分布情况。结果 57例胃癌中hTRT基因表达阳性率为94.7%(54/57)；57例癌旁组织中hTRT基因表达阳性率为05（0／57）；69例胃良性病变中hTRT基因表达阳性率为2.9%(2/69)。胃癌组织中hTRT基因的表达与癌旁组织、胃良性病变比较差异有显著性（P均＜0.001)。胃癌组织中hTRT的表达与肿瘤分化程度、淋巴结转移相关（P均＜0.05)，但与肿瘤分期无相关性（P＞0.05)。hTRT表达的阳性分级与淋巴结转移相关（P＜0.01)。但与胃癌分化程度和分期无相关性（P均＞0.05)。结论 端粒酶基因hTRT表达检测在胃癌诊断中可能有一定的价值。     

基质金属蛋白酶组织抑制剂-1基因在卵巢肿瘤中的表达及突变的检测

目的:研究基质金属蛋白酶组织抑制剂1(tissueinhibitorsofmatreixmetalloproteinases,TIMP1)在卵巢肿瘤中的表达及突变情况。方法:RTPCR方法检测48例卵巢癌、21例良性卵巢肿瘤及22例正常卵巢组织中TIMP1mRNA的表达情况;利用人卵巢癌组织构建人TIMP1真核表达质粒并测序;聚合酶链反应单链构象多态性(PCRSSCP)分析技术检测卵巢恶性肿瘤、良性肿瘤和正常卵巢组织中TIMP1基因的突变。结果:TIMP1在各种卵巢组织中mRNA的表达并无差异;构建的真核表达质粒经测序含人TIMP1全长cDNA,于第6外显子处发生错义突变;卵巢恶性肿瘤中TIMP1基因的突变率为16.7%。结论:卵巢恶性肿瘤组织中有TIMP1基因突变存在;构建的TIMP1真核表达质粒,为下一步研究TIMP1在卵巢癌侵袭转移中的作用打下了物质基础。