山西省乙型肝炎病毒基因型别的初步研究

目的 初步确定流行于山西地区的乙肝病毒的基因型的基本情况。方法 采集山西地区乙型肝炎表面抗原阳性的血清，利用PCR扩增得到HBV的S基因和C基因；用MEGA3软件对其进行核苷酸序列分析，构建系统发生树，分析基因型。结果 约93％样本的HBVS基因和C基因序列均位于HBV系统发生树的基因型C，近7％的样本其S基因和C基因序列位于系统发生树的基因型B。结论 流行于山西地区的乙肝病毒多数为基因型C，少数为基因型B，未发现基因重组现象。     

我国藏族居民乙型肝炎病毒基因型的初步研究

目的　初步确定流行于西藏和青海藏族居民中乙型肝炎病毒(HBV)基因型的基本情况,为制定肝炎防治策略提供依据。方法　利用PCR扩增西藏和青海藏族居民HBVS基因和C基因测序,并用MEGA3软件进行核苷酸序列的同源性比较及构建系统发生树,分析基因型。结果　绝大多数样本HBV的S基因序列聚集于系统发生树中的基因型D ,所有样本HBV的C基因序列聚集于系统发生树中的基因型C结论　西藏和青海HBV基因型绝大多数为C D重组基因型。     

新疆地区居民乙肝病毒基因型的初步研究

目的 初步确定新疆地区乙肝患者乙肝病毒基因型的基本情况.方法 对在新疆地区采集的2000余份血清中检测得到200份HBsAg阳性的血清,利用巢氏PCR法扩增其S基因并测序,用MEGA3软件将测序结果与GenBank中的HBV标准序列进行分析,构建并绘制系统发生树,分析基因型.结果 在200份样本中.127例(63.5%)成功检出基因型,其中B基因型10例(7.8%),C基因型58例(45.7%),D基因型59例(46.5%).结论 新疆地区HBV基因型以C、D型为主,少量为B型.     

云南省乙型肝炎病毒基因型和血清型的流行状况分析

目的 了解云南省人群中流行的乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)基因型和血清型分布情况.方法 从参加健康体检的人群中筛查HBsAg阳性的血清标本,利用巢式PCR扩增HBV S基因片段,并对扩增产物进行序列测定.从GenBank中查获A～I基因型共27株HBV参考序列,构建HBV S基因系统发生树,以此确定其样本的基因型及血清型,并对结果进行统计分析.结果 从2216名体检人员血清标本中筛查出 39份HBsAg阳性的样本,HBV的S基因序列分型结果表明有4种基因型:C型占76.9%,B型占15.4%;D型占5.1%;I型占2.5%.血清分型结果为:adw2型占71.8%;adrq+型占17.9%;ayt型占10.3%.所有adw2血清型标本均为C基因型.HBsAg、HBeAg双阳性标本中75%为C基因型/adw2血清亚型.结论 云南省HBV感染人群中HBV基因型的分布以C型为主,血清型以adw2型为主.     

云南省乙型肝炎病毒基因型和血清型的流行状况分析

目的 了解云南省人群中流行的乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)基因型和血清型分布情况.方法 从参加健康体检的人群中筛查HBsAg阳性的血清标本,利用巢式PCR扩增HBV S基因片段,并对扩增产物进行序列测定.从GenBank中查获A～I基因型共27株HBV参考序列,构建HBV S基因系统发生树,以此确定其样本的基因型及血清型,并对结果进行统计分析.结果 从2216名体检人员血清标本中筛查出 39份HBsAg阳性的样本,HBV的S基因序列分型结果表明有4种基因型:C型占76.9%,B型占15.4%;D型占5.1%;I型占2.5%.血清分型结果为:adw2型占71.8%;adrq+型占17.9%;ayt型占10.3%.所有adw2血清型标本均为C基因型.HBsAg、HBeAg双阳性标本中75%为C基因型/adw2血清亚型.结论 云南省HBV感染人群中HBV基因型的分布以C型为主,血清型以adw2型为主.     

广州地区小儿无症状乙肝病毒携带者的基因型研究

目的扩增HBV DNA S基因,建立HBV DNA的分型方法,研究广州地区小儿无症状乙肝病毒携带者(AsC)的基因型. 方法利用PCR-RFLP基因分型方法,扩增HBV DNA S基因,以限制性内切酶AvaII、MboI酶切分型. 结果 60份AsC血清样本,B型37份(62.7%),C型20份(33.3%),B、C混合型2份(3.3%),未分型1份(1.7%),经序列分析证明为C型,C型共35%. 结论 PCR-RELP分型方法经济实用,分型率达98.3%,广州地区小儿乙肝病毒的基因型以B型和C型为主,其中携带者中B型占优势.     

应用nested-PCR对西安市乙肝病毒基因型的研究

目的:研究西安市乙肝患者HBV基因型分布状况,初步建立适用于临床的HBV基因分型的方法。方法:对收集的360例乙肝患者血清样本,针对乙肝病毒基因型(A-H)前S1到S基因的保守序列设计出12条内外引物,采用nested-PCR进行2轮扩增,第2轮产物使用30 g/L琼脂糖进行电泳,根据片断大小进行基因分型。结果:分型成功348例,其中HBV B基因型87例(24.2%);C型233例(64.7%);B+C混合型2例(0.56%),未检出A、D、E、F、G、H型。结论:nested-PCR适用于临床HBV基因分型常规检测,通过该方法的检测表明西安市HBV感染者以C基因型为主,B型次之,其余基因型分布较少。     

中国30个地区HBV基因型分布特点和临床意义

目的 了解中国乙型肝炎病毒感染者中HBV基因型的分布特点和临床意义.方法 应用型特异性引物聚合酶链反应法,对中国30个省市自治区共2922份HBV感染者血清标本进行基因型检测,同时检测相关病毒学及肝功能生化指标,分析基因型分布特点及临床意义.结果 2922例HBV感染者中,B、C、B/C、D基因型分别占15.9%、83.5%、0.41%、0.21%,未发现其他基因型.北方地区C基因型占绝大多数,南方地区浙江、江苏地区以C基因型为主,广东、湖南、湖北、江西以B基因型为主.B基因型较C基因型HBV感染者平均年龄小(P<0.001);C基因型HBV感染者HBeAg阳性率较B基因型高(P=0.023);B基因型HBV感染者乙型肝炎病毒载量较C基因型高(P=0.038);C基因型HBV感染者CHE、ALB较低,差异有统计学意义(P值分别为0.016).结论 中国HBV基因型以B、C基因型为主,仅少量的B/C和D基因型.北方地区以C基因型为主,南方地区C基因型明显减少,部分南方地区以B基因型为主.C基因型HBV感染者年龄较大、HBeAg阳性率高、HBV DNA载量低,病情较重.     

中国30个地区HBV基因型分布特点和临床意义

目的 了解中国乙型肝炎病毒感染者中HBV基因型的分布特点和临床意义.方法 应用型特异性引物聚合酶链反应法,对中国30个省市自治区共2922份HBV感染者血清标本进行基因型检测,同时检测相关病毒学及肝功能生化指标,分析基因型分布特点及临床意义.结果 2922例HBV感染者中,B、C、B/C、D基因型分别占15.9%、83.5%、0.41%、0.21%,未发现其他基因型.北方地区C基因型占绝大多数,南方地区浙江、江苏地区以C基因型为主,广东、湖南、湖北、江西以B基因型为主.B基因型较C基因型HBV感染者平均年龄小(P<0.001);C基因型HBV感染者HBeAg阳性率较B基因型高(P=0.023);B基因型HBV感染者乙型肝炎病毒载量较C基因型高(P=0.038);C基因型HBV感染者CHE、ALB较低,差异有统计学意义(P值分别为0.016).结论 中国HBV基因型以B、C基因型为主,仅少量的B/C和D基因型.北方地区以C基因型为主,南方地区C基因型明显减少,部分南方地区以B基因型为主.C基因型HBV感染者年龄较大、HBeAg阳性率高、HBV DNA载量低,病情较重.     

慢性乙型肝炎病毒基因型与YMDD变异关系

目的探讨慢性乙型肝炎病毒(HBV)基因型与YMDD变异的关系.方法选用200例HBV DNA、HbeAg阳性,血清ALT异常的HBV肝炎患者,服拉米夫定(100mg/d)24个月.用PCR(FQ-PCR)检测HBV DNA,分析乙肝病毒野生型YMDD及突变耐药型YIDD/YVDD,HBV基因分型.结果200例慢性乙肝病人C基因型占39%,B基因型占26%,D基因型占22%,B+C混合基因型占10%,其他占3%,包括1例出现YIDD耐药株.服拉米夫定12个月后,YMDD变异率为6%;24个月后,YMDD变异率为15%.结论乙肝病人HBV基因型以C型为主,次为B型及D型;服拉米夫定后大多数病人的DNA水平明显降低,拉米夫定治疗可加速病毒YMDD变异发生,且与服药时间呈正相关;YMDD突变与乙肝病毒的基因型无关.     

新疆居民HBV基因型的分布及其与临床表现关系的初步研究

目的 了解新疆地区乙肝患者HBV基因型的分布及其与临床表现的关系.方法 从2000余份血清中筛选出HBsAg阳性血清200份.利用巢式PCR法扩增血清中HBV DNA S基因进行测序并分型;统计分析基因型分布及与临床表现的关系.结果 新疆HBV有B、C、D三个基因型,其中B基因型10例（7.8%）,C基因型58例（45.7%）,D基因型59例（46.5%）.C基因型中汉族51例（87.9%）,D型中汉族27例（45.7%）,维吾尔族24例（40.7%）.结论 新疆地区HBV基因型以C、D型为主,少量为B型.C型以汉族为主,D型中汉族和维吾尔族占多数.C型与更严重的疾病及转归有关.     

Characterization of seven genotypes (A to E, G and H) of hepatitis B virus recovered from Japanese patients infected with human immunodeficiency virus type 1

To investigate the prevalence of hepatitis B virus (HBV) genotypes and characteristics of HBV isolates among Japanese patients infected with human immunodeficiency virus type 1 (HIV), serum samples collected between September 1990 and March 2002 from 471 HIV-infected patients (age, 38.8 +/- 11.4 [mean +/- standard deviation] years; male, 90%) were tested for hepatitis B surface antigen (HBsAg) and HBV DNA. Positivity for HBsAg and HBV DNA was seen in 42 patients (8.9%), 41 of whom had contracted HIV infection through sexual activity and 1 had hemophilia. Genotypes of HBV were determined by comparative and phylogenetic analyses of the S gene sequence (396 nucleotides [nt]). The distribution of HBV genotypes among the 42 HBV-viremic patients was: A (50%), B (5%), C (24%), D (5%), E (2%), H (10%), A plus D (2%), A plus G (2%). The hemophilia patient had HBV genotype D. Genotypes E, G, and H which had not been reported in Japan, were found in one patient each who had traveled to Zambia, the US, and South America, respectively. Genotypes A and D, which are rare in Japan, were found in patients who had no history of traveling abroad. The entire genome of the HB-JI411 (genotype E [3,212 nt]), HB-JI444G (genotype G [3,248 nt]), and HB-JI260 (genotype H [3,218 nt]) isolates had the highest identity of 98.3%, 99.9%, and 98.5%, respectively, with reported HBV isolates of the same genotype. Most Japanese patients coinfected with HIV and HBV had HBV genotypes that are found rarely or had not been reported in Japan.     

云南省乙型肝炎病毒基因型和血清型的流行状况分析

目的了解云南省人群中流行的乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus,HBV）基因型和血清型分布情况。方法从参加健康体检的人群中筛查HBsAg阳性的血清标本,利用巢式PCR扩增HBVS基因片段,并对扩增产物进行序列测定,从GenBank中查获A～I基因型共27株HBV参考序列,构建HBVS基因系统发生树,以此确定其样本的基因型及血清型,并对结果进行统计分析。结果从2216名体检人员血清标本中筛查出39份HBsAg阳性的样本,HBV的s基因序列分型结果表明有4种基因型：c型占76．9％,B型占15．4％;D型占5．1％;I型占2．5％。血清分型结果为：adw2型占71．8％;adrq‘型占17．9％;ayr型占10．3％。所有adw2血清型标本均为c基因型。HBsAg、HBeAg双阳性标本中75％为c基因型／adw2血清亚型。结论云南省HBV感染人群中HBV基因型的分布以C型为主,血清型以adw2型为主。     

沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分子流行病学研究

目的 研究沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分布和特点。方法 应用半巢式聚合酶链反应（PCR）扩增乙型肝炎病毒P基因，将PCR产物应用ABI377自动测序仪直接做核苷酸序列分析，并用DNA STAR软件进行种系发生分析及基因型鉴定。结果 HBV DNA标准株P基因片段可进行基因分型。在沈阳地区慢性HBV感染者中可检出基因型B、C和D，检出率分别为22％、50％和28％，基因型C分布与基因型B、D的差异有统计学意义，在慢性乙型肝炎患者和慢性HBV携带者间各基因型间分布比较中差异无统计学意义。结论 通过测定HBV DNAP基因序列片段可进行HBV DNA基因分型。沈阳地区乙型肝炎病毒基因型有基因型B、C和D型，其中基因型C为优势基因型。     

Genotypes and phylogenetic characterization of hepatitis B and delta viruses in Egypt

Hepatitis B virus (HBV) and hepatitis D virus (HDV) sequences among HBV carriers from Egypt have not been evaluated sufficiently. The genotypes of HBV isolated from 105 serum samples from Egyptian carriers were determined. Four complete genomes and 11 entire preS1/S2/S genes were sequenced and evaluated. All serum samples were classified into HBV genotype D using serologic and genetic methods. The length of four complete nucleotide sequences was 3,182 bp. In all 15 samples, the common 33 nucleotides (11 amino acids) deletions in the preS1 region specific for HBV genotype D were observed. In the phylogenetic analysis based on the complete nucleotide sequences, all samples were clustered with the HBV isolates reported from previously Western and Mediterranean countries with nucleotide homology ranging from 96.0-98.0%. Of 75 HBsAg positive samples, anti-HDV was found in 15 (20%), and HDV RNA was detected in 9 of 15 (60%). The proportion of the patients with liver disease was higher in HBV carriers of anti-HDV positive with HDV RNA than in HBV carriers of anti-HDV positive without HDV RNA (P < 0.05). In the phylogenetic analysis based on the sequences in nucleotide position 853-1267 of HDV, nine samples were classified into HDV genotype I with the nucleotide homology ranging from 88.3-92.1% (mean; 90.5%) and clustered with HDV strains reported previously from Ethiopia, Somalia, Egypt, and Lebanon. These results indicate that HBV genotype D and HDV genotype I are most prevalent in Egypt, and HDV co-infection in HBV carriers is related to severity of liver disease.