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相似文献
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1.
目的 通过对24位点可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats, VNTR)和日本12位点VNTR(日本JATA12位点)的应用,探索适合辽宁省基因分型的相关位点,初步建立本省的VNTR分型体系。方法 采用实验菌株为省级保存的2011—2013年采集自辽宁省14个市的75株菌株。以PCR为基础选取不同位点的引物28对(其中标准24位点与日本JATA12位点中共有的位点有8对)对相应目的片段进行扩增,最后用琼脂糖凝胶电泳进行检测。结果 日本JATA12位点不适用于辽宁省的菌株,12 位点中的VNTR2074、VNTR3336和Qub15位点通过多次改变PCR条件进行实践仍未得出准确的条带(杂带过多或无目的条带)。标准的24位点中的全部24个位点均可通过实验得出清晰的条带,说明标准24位点的方法可以用于建立辽宁省结核分枝杆菌MIRU-VNTR基因分型体系。75株结核分枝杆菌临床分离株的24个VNTR位点检测结果显示这些菌株均有明显的多态性,24个VNTR 位点的 Hunter-Gaston 指数从 0到 0.75,其中分辨力最高的位点是 MIRU26,分辨力最低的位点是 MIRU2。结论 辽宁省与日本虽同为北京基因型的主要流行地区,但辽宁省流行的北京基因型结核分枝杆菌的基因与日本流行的北京基因型结核分枝杆菌存在着不同的特点。24位点MIRU-VNTR基因分型体系适用于本省,目前已初步建立我省VNTR基因分型位点体系,我们将通过进一步的实验精简位点,最终建立最适用于本省的精准VNTR基因分型体系。  相似文献   

2.
目的 了解海南地区结核分枝杆菌不同基因型流行特征,探讨基因分型用于评价本地区结核病控制中的应用价值。方法 本研究选取海南医学院第二附属医院自2013-2016年所有培养阳性结核分枝杆菌484株,采用SNP和Gao等推荐的12位点可变数目串联重复序列(variable number tandem repeat, VNTR)进行基因分型。结果 2013-2016年期间,484株结核分枝杆菌菌株中,北京基因型菌株279株,占57.6%,非北京基因型菌株205株,占42.4%,北京基因型菌株中包括91株(32.6%)古代北京基因型和188株(67.4%)现代北京基因型。北京基因型所占比例在四年间无显著变化,从2013年的59.6%到2016年的57.6%。采用3个高变VNTR位点基因分型后,成簇菌株数为0。结论 海南地区结核分枝杆菌存在明显的VNTR基因多态性,主要流行株仍以北京基因型为主,北京基因型所占比例在四年期间无显著性变化,且菌株成簇率较低,提示近期传播率低。  相似文献   

3.
目的 探讨以多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析方法行多重耐药铜绿假单胞菌分子分型的效果。方法 选择2015年5月至2017年5月分离自本院13个病区的多重耐药铜绿假单胞菌78株,提取菌株DNA。在铜绿假单胞菌基因组中随机选择8个位点,以VNTR扩增物扩增菌株DNA,产物毛细管电泳。对扩增产物相对分子质量及菌株在不同位点的VNTR重复数进行计算,并实施聚类分析及同源性分析。结果 8个VNTR位点重复基序大小为7~128 bp,多态性指数为0.47~0.89,分布较为均匀;VNTR分析法将78株多重耐药铜绿假单胞菌分为5个群;6例患者不同分离株在8个位点重复数均一致。结论 在铜绿假单胞菌基因分型及溯源研究中VNTR分析法的应用价值高,可为控制院内感染提供依据及技术方法,需引起关注。  相似文献   

4.
目的 研究中国流行的结核分枝杆菌谱系2的遗传结构和地理分布,为制定结核病防控策略提供科学依据。方法 采用标准15位点分枝杆菌散在重复单位-数目可变串联重复序列(variable number tandem repeats,VNTR)技术对来自全国31省市抽样调查的2 900株结核分枝杆菌谱系2进行基因分型。基于上述菌株15-VNTR数据,采用贝叶斯聚类法STRUCTURE进行群体遗传结构分析;构建邻接(Neighbor-Joining,NJ)树和最小生成树(Minimum Spanning Trees,MST)进行群体遗传分化分析。运用主成分分析(principal component analysis,PCA)验证。结果 STRUCTURE分析显示谱系2可分为4个亚群;MST拓扑结构提示亚群2位于奠基者位置,较古老;其他亚群(亚群1、3、4)位于分枝位置,较现代。亚群2主要分布于西南地区和东北三省;亚群1,3,4主要分布于我国东中部地区,推测由于人口的迁徙,造成菌株间遗传距离较近,由东北地区向东中部地区传播。主成分分析显示4群菌株分化不明显。结论 结核分枝杆菌谱系2可分为4个亚群,各亚群的遗传地理分布不同,上述结果对制定我国精准结核病防控策略将产生积极影响。  相似文献   

5.
目的 探究转化生长因子β1(transforming growth factor β1, TGF -β1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与结核病易感性的关系,为结核病的诊断和治疗提供更多的参考依据。方法 通过病例-对照(case-control)研究方法,以深圳市第三人民医院1 533例确诊的活动性结核病患者作为病例组(男980例,女553例),选取同期在该院体检的1 445例人员作为健康对照组。通过飞行时间质谱仪(TOF-MS)检测TGF-β1基因6个SNP位点rs2317130、rs17516265、rs8110090、rs3087453、rs2278422、rs1800469基因型,通过比较两组间SNP等位基因频率差异,初步筛选出与结核病易感性相关联的SNP位点。用结核分枝杆菌标准株H37Rv刺激不同基因型的健康人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMCs),ELISA检测上清中TGF-β1含量,进一步验证TGF-β1基因SNP位点与结核易感性的关系。结果 在6个SNP位点中发现仅 rs2317130 C>T 位点等位基因频率在活动性结核组和对照组中差异有统计学(P<0.05),结核病患者rs2317130 C>T位点C等位基因频率显著增高(OR=1.14;95%CI=1.03~1.26;P<0.01),其他5个SNP等位基因频率在两组之间差异无统计学意义(P>0.05)。此外,ELISA实验结果表明,rs2317130 SNP位点CC纯合子基因型的患者TGF-β1表达量显著高于其他基因型(CT杂合子和TT纯合子基因型),TGF-β1表达量上调可加速结核病发展,进一步证实rs2317130位点C等位基因为结核易感基因。结论 TGF-β1基因rs2317130 C>T位点与结核易感性相关,其C等位基因为结核易感基因,即携带C等位基因人群患结核风险升高。  相似文献   

6.
目的分析厦门市结核分枝杆菌的分子流行病学特征,为肺结核病控制提供科学的分子流行病学等信息。方法选择15个可变数目串联重复位点(Variable number tandem repeats,VNTR)位点,对来源于厦门市的临床分离菌株DNA进行检测,检测结果使用BioNumerics(Version4.5)软件进行聚类分析。结果82株结核分枝杆菌被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ等6大基因群,以Ⅰ群为主,包含63(76.8%)个株菌;流动人口结核分枝杆菌基因群为Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ,常驻人口为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ;流动人口与常驻人口的结核分枝杆菌VNTR基因型存在一定差异,但均以Ⅰ群为主。Ⅰ群菌株耐药性与其他基因群的耐药性差异无统计学意义(P〉0.05)。结论初步证实厦门市结核分枝杆菌菌株存在明显的基因多态性,流动人口与常驻人口流行株均以Ⅰ群流行为主,应加强此类菌株流行的监控。  相似文献   

7.
目的:探讨河南省尉氏县结核分枝杆菌的可变数目串联重复序列(VNTR)基因型流行特征和耐药情况。方法:河南省尉氏县结核病防治机构分离培养的257株结核分枝杆菌,采用比例法药敏试验检测其耐药情况。应用RD105缺失基因检测法鉴定北京家族基因型菌株,7个结核分枝杆菌VNTR基因位点对结核分枝杆菌进行分型,并对其分型结果进行聚类分析。结果:北京家族基因型占90.7%(233/257);VNTR基因型显示明显的多态性。230个基因型聚类分析主要分为4个基因群(Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群和Ⅳ群),其中Ⅲ群包含152基因型(59.1%),为优势基因型;耐多药结核分枝杆菌占8.9%(23/257),任意耐药占24.5%(63/257),北京家族基因型与非北京家族基因型菌株以及主要流行(Ⅲ)群与非主要流行群中耐药株分布比较,差异无统计学意义(χ2=2.412、1.954,P>0.05)。结论:河南省尉氏县北京家族基因型结核分枝杆菌为主导流行型;7位点VNTR基因分型存在4个基因群,主要流行群为Ⅲ群;耐药形势仍不容乐观。  相似文献   

8.
目的:利用多位点可变数目串联重复序列(MLVA)分型技术,了解近期吉林省结核分枝杆菌临床分离株基因型分布情况。方法:收集分离自吉林省2011-2012年不同市县来源患者标本的结核分枝杆菌分离株,提取基因组DNA,对12个数目可变串联重复序列(VNTR)位点进行扩增和产物电泳分析,使用Totalab软件对电泳条带进行数据化分析,使用BioNumerics(6.0)软件获得聚类分析结果。结果:对110株结核分枝杆菌临床分离株的12个VNTR位点进行检测,结果显示这些菌株有明显的多态性。12个VNTR位点中Hunter-Gaston指数能达到0.5以上的VNTR位点有9个,位点分辨能力最高的是MIRU26,最低的是MIRU20。基于12个位点的聚类分析,110株分离株可分为6个基因型群,其中分布最多是5群,占34%;其次是1群,占15%。分布最多的5群主要流行于吉林省通化市和松原市等地区。结论:吉林省流行的菌株存在着明显的遗传多态性;不同市县分布的主要基因型群存在差异,表明吉林省内不同地区结核分枝杆菌基因型的流行趋势不同。  相似文献   

9.
目的:通过多位点可变数目串联重复序列(MLVA)分型,了解甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株基因型情况。方法:选择标化的15个VNTR位点,对临床分离菌株DNA进行检测,DNA指纹图谱使用BioNumerics4.5软件进行统计分析,得出聚类分析结果。结果:228株结核分枝杆菌被分为4大基因群,7个主要基因型,分别包含13(5.7%)、3(1.3%)、7(3.1%)、1(0.4%)、171(75.0%)、31(13.6%)、2(0.9%)个菌株;在株水平基因分型上,93(40.8%)株为独立基因型;其余菌株基因型分别包含2~10株结核分枝杆菌,共构成132个基因簇。结论:甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株存在丰富的基因多态性,MLVA方法具有较高的基因分型能力,可以满足结核分枝杆菌株水平DNA分型的需要。甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株主要为北京家族基因型菌株。  相似文献   

10.
目的 探讨深圳市结核分枝杆菌对利福平、异烟肼耐药变化趋势,为结核病防控策略调整提供依据。方法 对2002—2017年深圳市登记的所有涂阳肺结核病患者进行痰检,对罗氏培养阳性菌株进行菌型鉴定和耐药检测,采用Joinpoint regression program软件计算年度变化百分比并进行趋势检验。结果 共检测19 098株结核分枝杆菌菌株,其中单耐异烟肼726株,单耐利福平954株,同时耐异烟肼、利福平812株。2002—2011年深圳市结核分枝杆菌异烟肼耐药率以每年3.81%的平均速率下降(P=0.04);2012—2014年以每年5.34%的平均速率上升(P=0.62);2015—2017年以每年20.82%的平均速率再次下降(P=0.18);2002—2004年深圳市结核分枝杆菌利福平耐药率以每年23.89%的平均速率下降(P=0.13);2005—2015年以每年0.99%的平均速率波动(P=0.15);2016—2017年以每年46.50%的平均速率下降(P=0.01);2002—2010年深圳市结核分枝杆菌同时对异烟肼、利福平耐药率以每年4.16%的平均速率下降(P=0.17);2011—2015年以每年平均2.24%的平均速率上升(P=0.47);2016—2017年以每年14.26%的平均速率上升,呈加快趋势(P=0.69)。结论 深圳市结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药率均呈阶段性变化,其中对异烟肼、利福平单耐药率在波动中呈下降趋势,而耐多药结核分枝杆菌检出率近年来在波动中呈上升趋势,且以传播导致的耐药为主,应该调整防控策略,把重点转移至加强结核病患者的主动发现,做好传染源的隔离,特别是痰检阳性耐多药结核病患者。  相似文献   

11.
目的 验证碱性苯酚和卫可消毒剂对结核分枝杆菌的杀菌能力,以寻求结核菌实验室最佳消毒效果。方法 悬液定量杀灭试验测定5、10、20 min,浓度为1∶85、1∶128、1∶256的碱性苯酚消毒剂和浓度为1∶66、1∶100、1∶133、1∶200、1∶400的卫可消毒剂对结核分枝杆菌的杀菌能力。各试验重复3次。结果 1∶85碱性苯酚消毒剂消毒 5 min可以完全杀灭结核分枝杆菌,但是消毒10、20 min不能完全杀灭结核分枝杆菌;1∶128消毒5 min内不能完全杀灭结核分枝杆菌,消毒10 min和20 min可以完全杀灭结核分枝杆菌;1∶256碱性苯酚消毒剂消毒5、10、20 min均不能完全杀灭结核分枝杆菌;而1∶66、1∶100、1∶133、1∶200和1∶400的卫可消毒剂消毒5、10、20 min均不能完全杀灭结核分枝杆菌。结论 浓度为1∶128的碱性苯酚消毒剂作用10 min可以有效杀灭结核分枝杆菌,可以作为结核实验室消毒剂;卫可消毒剂虽为广谱消毒剂但对结核分枝杆菌不敏感,杀灭效率差,不可作为结核实验室消毒剂。  相似文献   

12.
目的比较某矿区尘肺结核与单纯肺结核分离株的基因型差异。方法42株结核分枝杆菌分离自某矿区的尘肺结核和肺结核患者,其中尘肺结核16株,单纯肺结核26株。采用MIRu技术和BioNumerics3.0聚类分析软件进行基因分型和成簇性分析。结果12个MIRU位点多态性分型结果表明,尘肺结核与单纯肺结核分离株在第26、40MIRU位点的基因多态性较高,聚类分析结果证实两者的分离株具有不同的成簇性特征。结论提示煤工尘肺结核患者中流行的结核杆菌可能具有独立性。  相似文献   

13.
目的: 提出外侧半月板腘肌腱区损伤的关节镜下分型,并评估关节镜下缝合钩全内缝合治疗外侧半月板腘肌腱区损伤的疗效。方法: 选取2014年4月至2017年10月因外侧半月板腘肌腱区损伤接受关节镜手术的患者146例,不包括盘状半月板患者,其中男性81例,女性65例,年龄19~44岁,平均(34.7±3.7)岁。左膝54例,右膝92例。合并有前交叉韧带损伤107例,内侧副韧带损伤39例,内侧半月板损伤48例。术前Lysholm 评分(57.7±9.2)分,国际膝关节文献委员会(International Knee Documentation Committee, IKDC))膝关节评分(54.1±8.9)分。关节镜术中依据外侧半月板腘肌腱区损伤的范围及程度进行分型,并对该区域损伤采用关节镜下缝合钩全内缝合治疗。合并前交叉韧带损伤患者,以自体腘绳肌腱作为移植物进行关节镜下前交叉韧带单束重建,内侧副韧带Ⅲ级损伤采用带线锚钉缝合治疗,内侧半月板损伤采用全内缝合修复手术。结果: 在146例外侧半月板腘肌腱区损伤的患者中,86例外侧半月板腘肌腱区撕裂未累及腘肌腱裂孔(Ⅰ型,58.9%);36例前和/或后腘半月板纤维束撕裂(Ⅱ型,24.7%); 24例撕裂累及腘肌腱裂孔(Ⅲ型,16.4%)。对于Ⅰ型,又分为三种亚型,包括Ⅰa型:纵向撕裂(n=53,61.6%),Ⅰb型:水平撕裂(n=27,31.4%),Ⅰc型:放射状撕裂(n=6,7.0%);对于Ⅱ型,也有三种亚型,包括Ⅱa型:前腘半月板纤维束撕裂(n=5,13.9%),Ⅱb型:后腘半月板纤维束撕裂(n=20,55.6%),Ⅱc型:前后腘半月板纤维束撕裂(n=11,30.6%);对于Ⅲ型,有两种亚型,包括Ⅲa型:水平撕裂(n=9,37.5%),Ⅲb型:放射状撕裂(n=15,62.5%)。所有患者平均随访(15.3±2.6)个月,在最后一次随访中,Lysholm 评分(84.6±14.3)分,IKDC评分(83.2±12.8)分,与术前评分相比均有显著改善(P<0.01)。结论: 关节镜下外侧半月板腘肌腱区损伤可分为三种类型,能较好地概括此区域损伤的特点;关节镜下缝合钩全内缝合治疗该区域损伤,可避免缝合腘肌腱或缩窄腘肌腱裂孔,有较好的临床疗效。  相似文献   

14.
结核分枝杆菌基因分型及其耐药性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的探讨四川地区结核患者结核分枝杆菌基因分型及其与耐药性关系。方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对124株结核分枝杆菌的6个可变重复位点进行检测,并应用Gel-Proanalyzer3.0软件和BioNumerics(Version3.0)软件对检测结果进行基因型分析,同时分析其基因型与耐药之间的关系。结果124株结核分枝杆菌共分为37个不同的VNTR类型,成簇基因型占74.19%(92/124),单一基因型占25.81%(32/124)。耐药菌株在成簇类型和单一类型的分布上存在统计学差异。结论四川地区结核患者的结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,成簇类型是主要流行菌株,应加强流行结核菌株的监控。  相似文献   

15.
目的 矽肺易被误诊,易合并肺结核(pulmonary tuberculosis, PTB),使病情更加复杂。本文探讨矽肺合并活动性肺结核的临床特征。方法 以2018年1月至2021年12月于首都医科大学附属北京胸科医院住院经病原学或病理学确诊的36例矽肺合并活动性肺结核患者为观察组,以同期收治的100例病原学确诊的单纯活动性肺结核患者为对照组,比较分析两组的临床资料。计数资料用百分比表示,组间比较采用χ2检验,非正态分布数据以M(P25,P75)表示。以P<0.05为差异有统计学意义。结果 观察组Ⅰ期矽肺7例(19.4%),Ⅱ期14例(38.9%),Ⅲ期15例(41.7%);结核病程≥12个月25例(69.4%,χ2=17.099),以咳嗽、咳痰、气短为主要症状32例(88.9%,χ2=16.722),胸部CT以结节病灶为主32例(88.9%,χ2=16.722),可见纵膈及肺门淋巴结肿大30例(83.3%,χ2=19.900),曾被误诊17例(47.2%,χ2=7.481),与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05);对27例观察组患者进行随访,1例治疗5个月时死亡,17例(65.4%)在治疗2个月内痰液分枝杆菌培养管(mycobacteria growth indicator tube, MGIT)液体培养阴转,5例(19.2%)在2个月至12个月阴转,4例(15.4%)超过12个月才阴转,与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 矽肺合并活动性肺结核患者以Ⅱ期和Ⅲ期矽肺为主,结核病程长,以咳嗽、咳痰、气短为主要症状,胸部CT显示肺部病灶以结节为主,多合并纵膈、肺门淋巴结肿大,易被误诊;同时,抗结核疗效差,对矽肺患者进行结核潜伏感染筛查非常必要。  相似文献   

16.
目的 了解苏州大学附属儿童医院儿童肺炎支原体亚型及临床特征。方法 采用多重巢式PCR方法对2019年3—11月于苏州大学附属儿童医院诊断为肺炎支原体感染的患儿的痰或肺泡灌洗液等样本进行肺炎支原体基因分型鉴定,回顾性分析不同亚型肺炎支原体感染患儿的临床特征。结果 129例样本中Ⅰ型105例,Ⅱ型23例,Ⅰ型Ⅱ型混合感染1例。Ⅰ型支原体肺炎合并其它病原感染率高于Ⅱ型支原体 (59.05% vs 43.47%, P<0.05)。去除合并感染的病例,Ⅰ型肺炎支原体感染患儿发热峰值(39.22±0.60) ℃高于Ⅱ型患儿(38.67±0.92) ℃(P<0.01),发热持续时间也长于Ⅱ型患儿[Ⅰ型(7.91±2.74) d,Ⅱ型(6.36±1.69) d,P<0.05];Ⅰ型肺炎支原体感染患儿的白细胞计数(7.54±2.41)×109/L、补体C4(0.38±0.11)g/L和NK细胞百分比(9.86±4.49)%均低于Ⅱ型患儿[分别为(8.98±2.20)×109/L、(0.45±0.13)g/L和(13.07±6.31)%,P均<0.05];Ⅱ型患儿胸腔积液发生率(30.77%)高于Ⅰ型(6.97%, P<0.001)。结论 多重巢式PCR法可对不同类型临床样本进行肺炎支原体分型,2019年苏州大学附属儿童医院儿童肺炎支原体感染以Ⅰ型为主,因不同型别的MP导致的临床症状有差异, MP分型可以有效地提示临床在治疗时有不同的侧重点。  相似文献   

17.
目的 比较和分析高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)载量和HR-HPV E6/E7 mRNA在宫颈癌和宫颈上皮内瘤变(CIN)的表达和差异,探讨二者的关联及其在宫颈癌变进程中的临床意义。方法 以339例HR-HPV持续感染者为研究对象,依病理组织学诊断分为宫颈癌和CINⅠ、CINⅡ、CINⅢ共4组,分别采用PCR荧光法、支链DNA技术定量检测宫颈刷检物中的HPV-DNA和HPV E6/E7 mRNA,对数据资料进行统计学分析。结果 (1)随宫颈病变严重程度的增加,HR-HPV DNA和HR-HPV E6/E7 mRNA的表达水平和阳性表达率均明显上升;(2)不同等级的宫颈病变中,HR-HPV DNA和HR-HPV E6/E7 mRNA的阳性表达率总体分布差异无统计学意义(P>0.05),两两比较显示,除CINⅡ组两指标检测阳性率差异无统计学意义(P>0.05),其余各组间差异有统计学意义(P<0.05);(3)4组患者HPV E6/E7 mRNA和HR-HPV DNA的总体表达水平差异均有统计学意义(P<0.05),两两比较显示:HPV E6/E7 mRNA在CINⅢ和宫颈癌之间差异无统计学意义(Z=-1.013,P=0.311),其余组别间差异有统计学意义(P<0.05)。HR-HPV DNA在CINⅠ和CINⅡ之间差异无统计学意义(Z=-1.376,P=0.169),CINⅢ和宫颈癌之间差异无统计学意义(Z=-0.991,P=0.322),其余组别间差异有统计学意义(P<0.05);(4)HPV E6/E7 mRNA和HR-HPV DNA间存在相关性(r=0.533,P<0.05),不同级别病变表现为在CINⅠ、CINⅡ呈明显正相关(r=0.412,0.804,均P<0.05),在CINⅢ和宫颈癌无相关性(P>0.05);(5)随着病毒载量的提高,高级别CIN和宫颈癌在宫颈病变整体构成的占比上升。结论 HR-HPV E6/E7 mRNA在CINⅠ阶段即开始表达,随着表达量激增,加速宫颈癌的发生,HR-HPV载量和HR-HPV E6/E7 mRNA存在显著相关性,病毒与宿主基因整合,干扰了HPV载量与病变严重程度的一致性。  相似文献   

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