环介导等温扩增技术用于寄生虫检测的研究进展

寄生虫病在我国分布广泛,严重危害着人们的身体健康.环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种新的核酸扩增技术,具有敏感性高、特异性强和简便快速等优点,可用于寄生虫的快速诊断.该文就LAMP检测寄生虫的研究现状进行综述.     

环介导恒温扩增(LAMP)技术及其在寄生虫检测中的应用

近年来开发出一种新的恒温核酸扩增方法,即环介导恒温扩增(loop-mediated isithermal amplification,LAMP)法.LAMP技术具有简便、快速、高效、特异性强等优点,尤其适用于人类和动物疾病的检测.该文简要介绍了LAMP技术的原理,并对其在检测寄生虫如锥虫、疟原虫、巴贝虫、隐孢子虫和水生动物孢子虫等方面的应用进行综述.     

LAMP法应用于寄生虫感染检测的研究进展

环介导等温扩增(LAMP)技术是近年来发展迅速的一种敏感、特异、方便快捷的核酸扩增技术。与传统PCR方法相比,LAMP技术属于等温扩增,无需昂贵的热循环仪,并且由于LAMP反应中产生大量的副产物-白色焦磷酸镁沉淀,扩增产物可不经过电泳,无需开盖直接通过肉眼观察即可判定结果,在反应前、后加入染色剂效果更佳。LAMP技术敏感性高、特异性强、操作简便,能够满足现场和条件较差的基层实验室进行快速检测的需求。近年来LAMP技术在寄生虫感染检测中应用广泛,本文对其研究进展进行了综述。     

环介导等温扩增技术(LAMP)检测棘球绦虫感染犬粪DNA的研究Ⅱ

目的 为有效地控制预防流行区犬科动物的棘球绦虫感染情况,建立一种快速检测棘球绦虫感染犬的粪便DNA检测方法—环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification. LAMP)。方法 针对细粒棘球绦虫线粒体DNA ND2基因6个位点特异性的设计4条LAMP引物,利用LAMP法和普通PCR方法同时检测棘球绦虫、肥胖带绦虫以及犬肠道内的其它寄生虫DNA来验证LAMP方法的特异性;将转入ND2基因片段的质粒作为标准阳性对照,并做梯度稀释后同时用 LAMP 和 PCR 方法进行检测比较两者的敏感性。此外,将采集的46份犬粪便标本提取DNA,分别运用LAMP和犬尸体剖检进行感染犬的初步检测评估。结果 E.g mtDNA ND2基因的LAMP引物能够鉴别多房棘球绦虫和细粒棘球绦虫这两个相近的种属,并不与其它待检寄生虫发生交叉反应,且最低检测限度为4×10¹拷贝(灵敏度比普通PCR高出10³倍)。在初步对46份犬粪便DNA检测结果中 ND2 LAMP 引物显示出较好的灵敏度和特异度,χ²检验结果该方法与犬尸体剖检方法的诊断效果无统计学差异。结论 本研究初步建立了LAMP技术检测细粒棘球绦虫感染犬的新方法,在各项特异度、灵敏度和样本检测中展现出较好的效果。该方法不需要昂贵的仪器设备和繁琐的电泳分析过程,有望成为流行区和基层兽医站细粒棘球绦虫感染犬检测的新方法。     

环介导等温扩增技术及其在病原生物检测中的应用

环介导等温扩增(LAMP)技术是近年来发展起来的一种新型核酸扩增技术,具有操作简便、快速、特异性高、灵敏性高等特点,自2000年开发以来,在短短的十几年内被广泛应用于细菌、病毒和寄生虫等病原生物的检测,在即时检验和基层实验室推广中有重要意义。     

环介导等温扩增技术及其在病原生物检测中的应用北大核心CSCD

环介导等温扩增(LAMP)技术是近年来发展起来的一种新型核酸扩增技术,具有操作简便、快速、特异性高、灵敏性高等特点,自2000年开发以来,在短短的十几年内被广泛应用于细菌、病毒和寄生虫等病原生物的检测,在即时检验和基层实验室推广中有重要意义。     

环介导等温扩增技术及其在寄生虫学研究中的应用

环介导等温扩增(LAMP)技术是利用2对特殊设计的引物,一种具有链置换活性的DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效地扩增DNA的新技术,扩增产物为一系列反向重复的靶序列构成的茎环结构和多环花椰菜样结构的DNA片段混合物,电泳图谱呈阶梯式带状分布,反应伴有白色的副产物焦磷酸镁沉淀产生,可通过肉眼定性判断反应结果。作为一种新的核酸扩增技术,已被应用于疟疾、血吸虫等寄生虫的研究中。LAMP方法敏感、特异,简便,在寄生虫学研究中有广阔的应用前景。     

基于cox2基因的细粒棘球绦虫环介导等温扩增检测方法的初步建立

目的建立一种安全、快速、高效的细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的诊断方法——环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)。方法根据细粒棘球绦虫线粒体细胞色素c氧化酶亚基2(cytochrome c oxidase subunit 2,cox2)基因序列,设计4条LAMP引物,建立LAMP检测方法,采用LAMP法和常规PCR法检测细粒棘球绦虫、泡状带绦虫(Cysticercus tenuicollis)、扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)、羊曲子宫绦虫(Thysaniezia ovilla)、中点无卵黄腺绦虫(Avitellina centripunctata)、鞭毛线虫(flagella nematodes)、肝片吸虫(Fasciola hepatica)、多房棘球绦虫(E.multilocularis)和捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)等9种寄生虫的DNA以验证LAMP法的特异性;分别用LAMP法和常规PCR法检测梯度稀释的含cox2基因片段的细粒棘球绦虫标准质粒后,比较两者的敏感性。采用LAMP、PCR和夹心ELISA法检测50份犬粪样,计算细粒棘球绦虫cox2基因的阳性率,评价所建立的LAMP法检测效果。结果LAMP法的特异性验证结果表明,仅在以细粒棘球绦虫DNA为模板的反应体系中出现特异性产物。LAMP法在细粒棘球绦虫标准质粒浓度为16.09 ag/μl时仍可见梯状条带,而常规PCR法仅可检测到浓度为16.9 fg/μl以上的质粒,LAMP法灵敏性是常规PCR法的1 000倍。对50份犬粪中细粒棘球绦虫DNA的检测结果显示,PCR、LAMP和夹心ELISA法检测结果相同,阳性率为8.0%(4/50)。结论基于细粒棘球绦虫线粒体cox2基因的LAMP检测方法操作方便、特异性较强、敏感性较高,适于细粒棘球绦虫感染犬的快速检测。     

环介导等温扩增技术在致病菌检测中的应用

环介导等温扩增（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）技术是近10年来发展起来的具有简便、快速、灵敏度高、特异性强等优点的新的恒温核酸扩增技术,已被应用于致病菌检测的研究。LAMP技术需针对靶基因的6个区域设计4种特异性引物,并采用链置换型DNA聚合酶,操作步骤少,不需要聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术复杂的设备。本文就LAMP技术在致病菌检测中的应用作一综述。     

应用环介导等温扩增技术检测弓形虫

目的 用环介导等温扩增（LAMP）技术检测弓形虫。 方法　 用酚-氯仿法提取弓形虫速殖子基因组 DNA,设计两对扩增弓形虫 B1基因的 LAMP 引物。以间日疟原虫、恶性疟原虫、卡氏肺孢子虫、日本血吸虫及小鼠白细胞作对照,进行LAMP反应,产物经 SYBR Green I显色及电泳后观察结果,绿色判为阳性,棕色判为阴性。将弓形虫速殖子经倍比稀释为（2～3）×106个/ml至（2～3）×10-1个/ml 等8个浓度,进行LAMP反应,验证该方法的敏感性。 结果 LAMP反应结果显示,弓形虫速殖子检测管经显色后呈绿色,对照组均呈棕色。弓形虫的LAMP产物经电泳后呈LAMP特征性梯状条带,对照组均无扩增产物。LAMP技术可检测到的弓形虫速殖子最低浓度为2～3个/ml。 结论 LAMP技术在弓形虫检测中显示出较好的特异性与敏感性。     

Pathogen diagnosis of children sepsis by LAMP technology

ObjectiveTo explore a rapid diagnostic method in neonatal sepsis and bacterial meningitis.MethodsThe primers were designed and synthesized based on 16S rRNA gene of Staphylococcus aureus. Four specimens of Staphylococcus aureus, 16 specimens of coagulase-negative Staphylococci, 2 specimens of Enterococci, 3 specimens of Streptococcus, 1 specimen of Micrococcus, 3 specimens of Escherichia coli, 4 specimens of Klebsiella pneumoniae, 3 specimens of Pseudomonas aeruginosa, 2 specimens of Enterobacter cloacae, and 5 specimens of Acinetobacter were tested by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay. A total of 118 clinical specimens of sepsis and non-sepsis were collected and detected with both LAMP assay and blood culture.ResultsBy designing primers specific for Staphylococcus aureus, specimens containing different kinds of pathogens were carried out by LAMP assay, and our data showed LAMP technology for the specific detection of Staphylococcus aureus in samples was successfully established. All clinical specimens of sepsis and non-sepsis were tested by both blood cultures and LAMP, and our data showed that compared wit blood culture method, the LAMP technology showed significantly high detection rate (P <0.01).ConclusionsAs a quick and easy detection of Staphylococcus aureus, the LAMP technology was successfully established, laid the foundation for the diagnosis and treatment of children Staphylococcus aureus sepsis, and showed great promotion and application value.     

环介导等温扩增技术及其应用

环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是一种新型的体外核酸扩增技术,在等温条件下,利用一种具有自动链置换活性的Bst DNA聚合酶和一组特异性引物,对靶DNA序列进行快速扩增,1 h左右可合成109～1010拷贝的靶DNA序列.LAMP技术具有简便、快速、扩增效率和特异性高等特点,近年来该技术广泛应用于病原菌、病毒等病原体的快速分子检测.该文详细介绍LAMP的原理、引物设计及其在微生物分子检测方面的应用.     

LAMP技术在动物病毒病原检测中的应用进展

环介导等温扩增技术(LAMP)是一种具有简单、快速、特异性强和扩增效率高的核酸检测技术,目前已在食品、卫生及疾病预防控制检验等领域得到了诸多应用。本文主要介绍了LAMP技术在实验及临床过程中检测肝炎病毒、流感病毒、HIV-1、狂犬病毒、乙脑病毒、冠状病毒、登革病毒等病毒病原感染的应用进展。     

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for malarial parasites of humans: Would it come to clinical reality as a point-of-care test?

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel molecular method that accelerates and facilitates DNA amplification and detection under isothermal conditions. It represents a revolution in molecular biology by reducing the high cost, turnaround time and technicality of polymerase chain reaction and other amplification methods. It has been applied for the diagnosis of a variety of viral, bacterial, parasitic and other diseases in the biomedical field. LAMP has been involved in studies concerning the diagnosis of malaria which is still a major cause of morbidity and mortality in different parts of the world. For the success attained with this technology to diagnose human malaria, is it time to think that LAMP-based point-of-care diagnostics come to application to support the diagnosis of clinical malaria cases? The present review deals with the use of LAMP in the diagnosis of malaria and related investigations to make a view on what has been investigated and highlights the future perspectives regarding the possible applications of LAMP in diagnosis of the disease.     

Detection of Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum DNA in human saliva and urine: Loop-mediated isothermal amplification for malaria diagnosis

This study investigated loop-mediated isothermal amplification (LAMP) detection of Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax in urine and saliva of malaria patients. From May to November 2011, 108 febrile patients referred to health centers in Sistan and Baluchestan Province of south-eastern Iran participated in the study. Saliva, urine, and blood samples were analyzed with nested PCR and LAMP targeting the species-specific nucleotide sequence of small subunit ribosomal RNA gene (18S rRNA) of P. falciparum and P. vivax and evaluated for diagnostic accuracy by comparison to blood nested PCR assay. When nested PCR of blood is used as standard, microscopy and nested PCR of saliva and urine samples showed sensitivity of 97.2%, 89.4% and 71% and specificity of 100%, 97.3% and 100%, respectively. LAMP sensitivity of blood, saliva, and urine was 95.8%, 47% and 29%, respectively, whereas LAMP specificity of these samples was 100%. Microscopy and nested PCR of saliva and LAMP of blood were comparable to nested PCR of blood (к = 0.95, 0.83, and 0.94, respectively), but agreement for nested PCR of urine was moderate (к = 0.64) and poor to fair for saliva LAMP and urine LAMP (к = 0.38 and 0.23, respectively). LAMP assay showed low sensitivity for detection of Plasmodium DNA in human saliva and urine compared to results with blood and to nested PCR of blood, saliva, and urine. However, considering the advantages of LAMP technology and of saliva and urine sampling, further research into the method is worthwhile. LAMP protocol and precise preparation protocols need to be defined and optimized for template DNA of saliva and urine.     

环介导等温扩增技术在检测细菌性肺炎常见致病菌中的应用

目的 应用环介导等温扩增(LAMP)方法对肺炎患者痰液常见致病菌进行核酸检测,研究LAMP方法在细菌性肺炎病原学诊断中的价值.方法 抽提75例肺炎患者痰液细菌DNA,根据肺炎常见8种致病细菌设计引物,应用LAMP技术扩增DNA,实时检测样本荧光信号,对定量结果应用不同界值进行定性分析,并分别与痰培养结果进行比较.结果 ...     

环介导等温扩增法检测人粪样中美洲钩虫的方法建立

目的建立一种快速、高效的环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)检测粪样中美洲钩虫虫卵。方法根据美洲钩虫ITS基因序列,设计4条LAMP引物,建立LAMP检测法。利用LAMP法检测日本血吸虫、肝吸虫、鞭虫、猪蛔虫、蛲虫的DNA样本以验证LAMP方法的特异度。以美洲钩虫成虫DNA样本,倍比稀释以评价LAMP法的DNA最低检出量。现场采集55份人粪DNA样本,采用改良加藤法、LAMP法和普通PCR方法同时检测,评价LAMP法的敏感性和特异性。结果 LAMP法可特异性扩增美洲钩虫DNA样本。LAMP法可检测最低DNA浓度为1.2 fg/mL。通过现场样本对LAMP进行评价,LAMP法敏感性相对于改良加藤法和PCR法分别是95.24%和100%。特异性分别是97.06%和100%。结论建立起以虫卵为检测材料的检测美洲钩虫病的LAMP法,为美洲钩虫病提供特异、敏感、高效的检测方法。     

环介导等温扩增技术检测牛源隐孢子虫的研究

目的 用环介导等温扩增技术检测牛源隐孢子虫.方法 提取牛粪中隐孢子虫卵囊DNA.根据隐孢子虫18S rRNA序列及环介导等温扩增(100p-mediated isothermal amplification,LAMP)技术的原理,设计4条隐孢子虫特异引物,利用LAMP检测牛粪中隐孢子虫卵囊DNA和蓝氏贾第鞭毛虫DNA,以正常牛粪DNA为阴性对照.LAMP产物经SYBR Green I显色及电泳后观察结果,绿色判为阳性,棕色判为阴性,对LAMP产物进行电泳分析,观察其特征条带的情况.结果隐孢子虫卵囊DNA检测管经显色后时不再呈绿色,阴性对照及蓝氏贾第鞭毛虫DNA呈棕色.隐孢子虫LAMP产物经电泳后呈LAMP特征性梯状条带,阴性对照及蓝氏贾第鞭毛虫DNA无扩增产物.结论 LAMP方法敏感、特异、简便,可用于检测牛粪中的隐孢子虫.     

环介导等温扩增技术检测牛源隐孢子虫的研究

目的 用环介导等温扩增技术检测牛源隐孢子虫.方法 提取牛粪中隐孢子虫卵囊DNA.根据隐孢子虫18S rRNA序列及环介导等温扩增(100p-mediated isothermal amplification,LAMP)技术的原理,设计4条隐孢子虫特异引物,利用LAMP检测牛粪中隐孢子虫卵囊DNA和蓝氏贾第鞭毛虫DNA,以正常牛粪DNA为阴性对照.LAMP产物经SYBR Green I显色及电泳后观察结果,绿色判为阳性,棕色判为阴性,对LAMP产物进行电泳分析,观察其特征条带的情况.结果隐孢子虫卵囊DNA检测管经显色后时不再呈绿色,阴性对照及蓝氏贾第鞭毛虫DNA呈棕色.隐孢子虫LAMP产物经电泳后呈LAMP特征性梯状条带,阴性对照及蓝氏贾第鞭毛虫DNA无扩增产物.结论 LAMP方法敏感、特异、简便,可用于检测牛粪中的隐孢子虫.