Escherichia coli O157:H7 in feral swine near spinach fields and cattle, central California coast

We investigated involvement of feral swine in contamination of agricultural fields and surface waterways with Escherichia coli O157:H7 after a nationwide outbreak traced to bagged spinach from California. Isolates from feral swine, cattle, surface water, sediment, and soil at 1 ranch were matched to the outbreak strain.     

Escherichia coli O104 Associated with Human Diarrhea, South Africa, 2004-2011

To determine the origin of >4,000 suspected diarrheagenic Escherichia coli strains isolated during 2004-2011 in South Africa, we identified 7 isolates as serotype O104; 5 as enteroaggregative E. coli O104:H4, and 2 as enteropathogenic E. coli O104:non-H4. Pulsed-field gel electrophoresis showed that these isolates were unrelated to the 2011 E. coli O104:H4 outbreak strain from Germany.     

上海市2012－2013年4种致泻性大肠埃希菌监测

目的 基于临床医院开展4种致泻性大肠埃希菌(DEC)人群监测,探讨公共卫生实验室对临床实验室需求的直接技术指导的实践模式。方法 设立哨点医院,以标准化方法筛选和鉴定DEC菌型;构建DEC流行特征基线;对疑似暴发病例开展基于实验室和流行病学调查。结果 2012－2013年选择上海地区4家哨点医院检测7 204份腹泻标本确认的712例DEC感染病例,阳性率为9.9%。其中肠致病性大肠埃希菌(EPEC)感染351例;肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)感染292例;肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)感染32例;产志贺样毒素大肠埃希菌(STEC/EHEC)感染6例;DEC混合感染31例。EPEC感染以1～5岁儿童最多见,菌型均为aEPEC;ETEC流行峰值在8月,阳性率>20%,感染病例2012年聚集于1～28日龄和2013年的20～60岁人群(P< 0.05),菌型以耐热肠毒素(ST)型最多(59.6%),其次为不耐热肠毒素(LT)型(27.8%)和ST/LT型(12.6%);2013年儿童感染EIEC病例明显增加(P< 0.01);未监测到EHEC O157 : H7,但确认2例EHEC O26 : H11(eae-hlyA-stx1a)儿童病例;调查确认2012年上海地区15例新生儿ETEC聚集性感染病例与四川省自贡市新生儿病例属于同一克隆(STh-CS21-CFA/I-ClyA-EatA-ST2332- SHNL0005)。结论 上海地区DEC型谱特征已发生改变,ETEC对新生儿院内感染和食源性感染性腹泻构成潜在暴发风险,需加强实验室主动监测。     

肠道致病菌暴发事件中分子分型技术的应用

目的探讨建立快速敏感的肠道病原菌的诊断分型方法。方法2002年7月用脉冲场电泳胶（PFGE）与噬菌体分型实验方法对发生在日本静冈县的4起暴发事件中29株宋内志贺菌（Shigella.sonnei）分离株与1999年口本静冈县某区现场分离的12株肠出血性大肠埃希菌（enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC）O157：H7菌株进行分型。结果4起事件中Shigetta．sonnei的PFGE结果显示,同起事件的DNA条带几乎一致;2起EHEC O157：H7暴发事件中,同起事件的PFGE条纹几乎一致,而3株散发菌株的PFGE条纹各异;12株EHEC O157：H7噬菌体分型结果也显示了比较好的分型力。结论PFGE具有分型能力强、重复性好等特点,能直观地判断肠道致病菌的亲缘关系,及时查明暴发流行的传染源,从而有效控制疫情的蔓延。     

襄樊市大肠埃希菌的感染现状及耐药性分析

目的 探讨襄樊市大肠埃希菌(ECO)的感染现状及耐药性,为临床医师合理使用抗菌药物提供治疗依据.方法 回顾性调查医院379份大肠埃希菌医院感染病历的临床资料;细菌鉴定采用法国生物梅里埃公司生产的VITEK 32全自动细菌分析系统和GNI板条进行;药物敏感试验采用K-B法,结果判读依据美国临床实验室标准化研究所(CLSI)2007年标准,数据处理采用WHONET5.3-5.4统计分析.结果 大肠埃希菌产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)率为40.1%,药敏结果显示,ECO对常用抗菌药物产生了不同的耐药性,其中,对氨苄西林耐药率最高,达92.9%,对亚胺培南和美罗培南敏感率最高,为100.0%.结论 襄樊市大肠埃希菌的耐药问题已非常严重,各级医院应重视耐药菌的监测工作,预防医院感染暴发流行.     

浙江省肠出血性大肠杆菌O_(157)∶H_7动物宿主带菌情况调查

目的了解浙江省肠出血性大肠杆菌O157∶H7在动物宿主中的带菌情况。方法采集浙江省2006-2008年监测点的动物粪便进行病原菌培养和毒力基因及耐药性检测。结果共采集动物粪便3915份,检出肠出血性大肠杆菌O157∶H7阳性20份,带菌率为0.51%,其中以羊和牛的带菌率最高,分别为1.46%和1.43%,散养动物带菌率高于圈养动物(χ2=5.771,P=0.016)。阳性菌株stx2、hly和eaeA3种毒力基因均呈阳性,stxl均呈阴性。对红霉素和利福平耐药,耐药率达90%以上,对其他受试抗生素敏感。结论浙江省动物宿主有一定的带菌率,且菌株具有毒力基因,散养动物的带菌率高于圈养动物,应进一步加强监测,防止O157∶H7引起人群的爆发流行。     

产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌的目标性监测与分析

目的 了解临床产超广谱β-内酰胺酶( ESBLs)大肠埃希菌的分离和耐药性,探索产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌感染病例的监控措施.方法 对2010年医院临床分离的病原菌进行目标性监测,统计出产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌的株数以及耐药性,并对临床产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌感染病例实施监控.结果 全年共分离出大肠埃希菌1879株,产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌的菌株构成比为31.2％;对抗菌药物耐药率较高;全院未发生产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌的暴发和流行.结论 产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌分离株数较多,耐药率较高,应该加强临床合理使用抗菌药物的管理,对产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌感染病例实施监控,预防和减少多药耐药菌的产生,控制医院感染.     

多重实时PCR检测沙门菌、志贺菌和致泻性大肠埃希菌

目的 建立多重实时荧光PCR检测沙门菌侵袭蛋白A基因（invA）、肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）不耐热肠毒素基因（elt）、志贺菌和肠侵袭性大肠埃希菌侵袭力基因（ipaH）的方法。方法 优化多重实时荧光PCR的反应条件,检测系列10倍稀释的阳性菌DNA提取物。90份腹泻患者粪便样品经缓冲蛋白胨水（buffered peptone water,BP）增菌6h后进行多重实时荧光PCR检测,并对阳性标本进行菌株分离和鉴定。结果 多重实时PCR方法最低可以检测到10CFU／μl的福氏2aF301株、10。CFU／μl的鼠伤寒沙门菌和ETEC44815株。检测腹泻患者粪便样品,elt基因阳性率为14．4％（13／90）,ipaH基因阳性率为5．6％（5／90）;并从阳性样品中分离到3株elt基因阳性大肠埃希菌和4株ipaH基因阳性大肠埃希菌。整个检测过程可在10h内完成,其中包括BP增菌6h。结论 建立了同时检测invA、elt、ipaH毒力基因的多重实时荧光PCR方法,具有高度的特异性,可用于沙门菌、肠产毒性大肠埃希菌、志贺菌和肠侵袭性大肠埃希菌菌株的毒力基因鉴定及临床腹泻粪便标本的快速筛检。     

一株未知黏附基因型的尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株的基因分析

目的 比较尿道致病性大肠埃希菌UPECA030株papG和papA基因与相关序列的差异.以明确UPECA030 papA基因变异情况及与papG的组合形式,确定是否为未知基因型.方法 采用基因克隆测序方法,分别对UPEC4030株papG和papA基因进行序列分析,并与相关序列进行比较.结果 UPECA030 papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽.与10个基因型UPEC papA核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性比较,分别为36.11%～77.95%和22.20%～78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPEC4030 papa相应位置上的序列同源性只有10.00%～66.67%,表明该菌株papA确实为未知的基因型.UPECA030菌株papG全基因片段由1100个碱基组成,编码337个氨基酸的多肽,其核苷酸及推导的氨基酸序列与Ⅱ型抛papG代表株UPEC IA2相比较,同源性分别为99.00%和99.11%,表明UPEC4030 papA属于Ⅱ型.结论 UPECA030 papA为未知的摹因型,其papG属于Ⅱ型.     

肠出血性大肠杆菌O104:H4病原学及其检测方法研究进展

2011年5月以来,德国暴发了由肠出血性大肠杆菌O104:H4感染引起的疫情,世界多个国家相继报告有此类病例发生,这是首次报告由肠出血性大肠杆菌O104:H4感染引起疾病的暴发流行。截至2011年6月24日,已造成3920例感染和48例死亡[1]。该病患者以血水样腹泻、呕吐起病,部分病例并发溶血性尿毒综合征,导致多器官受损,甚至死亡。疫情发生后,世界各国相关学者立即开展其病原学特性研究,同时迅速研制出实验室检测方法和试剂,为该病的及时诊断、治疗和疫情控制发挥了很大作用。本文介绍了肠出血性大肠杆菌O104:H4病原学及其检测方法的研究进展。     

Comparing Characteristics of Sporadic and Outbreak-Associated Foodborne Illnesses,United States, 2004–2011

Outbreak data have been used to estimate the proportion of illnesses attributable to different foods. Applying outbreak-based attribution estimates to nonoutbreak foodborne illnesses requires an assumption of similar exposure pathways for outbreak and sporadic illnesses. This assumption cannot be tested, but other comparisons can assess its veracity. Our study compares demographic, clinical, temporal, and geographic characteristics of outbreak and sporadic illnesses from Campylobacter, Escherichia coli O157, Listeria, and Salmonella bacteria ascertained by the Foodborne Diseases Active Surveillance Network (FoodNet). Differences among FoodNet sites in outbreak and sporadic illnesses might reflect differences in surveillance practices. For Campylobacter, Listeria, and Escherichia coli O157, outbreak and sporadic illnesses are similar for severity, sex, and age. For Salmonella, outbreak and sporadic illnesses are similar for severity and sex. Nevertheless, the percentage of outbreak illnesses in the youngest age category was lower. Therefore, we do not reject the assumption that outbreak and sporadic illnesses are similar.     

广西首次发现食品中集聚性大肠杆菌

目的：了解食品中肠集聚性大肠杆菌污染状况。方法：对127份食品标本进行EaggEC分离，用EaggEC特异性引物进行分子生物学鉴定，并进行小鼠毒力试验。结果：自田螺及生葱各分离出一株EaggEC，分别引起实验小鼠66.67％和33.33％死亡。结论：研究结果表明食品中存在EaggEC污染，从中分离到的EaggEC有较强的毒力。     

宁夏某农场一起生活饮用水污染事件调查

目的查明宁夏某农场一起生活饮用水污染事件波及范围、可能的危险因素,提出有针对性的预防控制措施建议。方法采用现场流行病学和环境卫生学调查与实验室检测相结合的方法,开展调查与水质检测,进行病因推断。结果2018年4月19日-27日共出现92例病例。病例主要临床表现为腹泻67例(占73%)、腹痛/腹胀49例(占53%)、呕吐19例(占24%)、恶心16例(17%)和发热2例(占2%),病程中位数为4 d;环境卫生学调查发现,东片区供水管网受到污水污染;8份水样理化指标均未出现超标;受污染的东片区5份水样微生物指标均出现不同程度超标,而未受污染的西片区3份水样各项指标均未超标。结论本次事件为村民使用了供水管网受生活污水污染后的自来水所导致,致病菌可能为大肠埃希菌。     

非典型致病性大肠埃希菌引起食物中毒病原学研究

目的:对一起食物中毒暴发流行的病原体进行分离鉴定和分子流行病学研究。方法:采集患者和厨工肛拭子、末梢水及物表涂抹拭子共90份。通过分离鉴定、生化试验和血清学试验,确定病原菌后采用实时荧光PCR方法分别检测病原菌毒力基因eaeAi、paHs、tl、ts、tx1与stx2存在情况。其中4株病原菌全基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,通过PFGE获得电泳图谱并进行同源性分析。结果:90份标本中22份样品分离出携带eaeA基因的EPEC。BioNumerics分析结果显示4株EPEC PFGE带型完全相同,表明来源于同一克隆株。结论:这起食物中毒是由带eaeA基因非典型EPEC引起的暴发流行。     

Timeliness of surveillance during outbreak of Shiga Toxin-producing Escherichia coli infection, Germany, 2011

In the context of a large outbreak of Shiga toxin-producing Escherichia coli O104:H4 in Germany, we quantified the timeliness of the German surveillance system for hemolytic uremic syndrome and Shiga toxin-producing E. coli notifiable diseases during 2003-2011. Although reporting occurred faster than required by law, potential for improvement exists at all levels of the information chain.     

肠出血性大肠埃希菌及其引起暴发的研究

大肠埃希菌属人肠道正常菌群.少数大肠埃希菌可使人致病,称致泻性大肠埃希菌.肠出血性大肠埃希菌( EHEC)是其中常见的一类,是重要的食源性疾病致病菌,常见血清型包括O157等.自1982年在美国引起首次暴发后,EHEC便在世界各国陆续引起暴发.此文针对EHEC的病原学特征、历年暴发及实验室鉴定等方面进行综述.     

衢州市2000-2009年肠出血性大肠埃希菌O157∶H7监测

目的了解浙江省衢州市肠出血性大肠埃希菌O157∶H7人的感染、食品污染以及动物和媒介昆虫带菌情况。方法在流行季节采集腹泻患者、动物粪便以及各类食品、苍蝇等样本,MEC肉汤增菌后,用特异性免疫磁珠集菌,以科玛嘉显色平板分离,纯化的菌株进行生化鉴定、血清分型及毒力基因检测。结果 2000-2009年,共检测样本12 292份,检出EHEC O157∶H7 19株,总检出率为0.15%。其中4种宿主动物粪便样本中检出18株,检出率分别为羊2.14%、牛1.29%、猪0.45%、鸭0.19%;食品中从生猪肉中检出1株,检出率0.17%;腹泻患者和苍蝇样本中均未检出。经毒力基因检测,其中16株stx2+hly+eaeA阳性,1株hly+eaeA阳性,其余2株不带毒力基因,带毒率89.47%。结论浙江省衢州市部分动物中产毒的EHEC O157∶H7带菌率较高,表明该地区存在暴发或流行的潜在危险,应加强综合监测。     

院外感染大肠埃希菌对10种抗菌药物的敏感性

目的对大肠埃希菌所致院外感染的临床状况和该菌对10种抗菌药物的敏感性进行观察和分析.方法菌株来自临床分离的送检标本,进行细菌药敏试验检查大肠埃希菌对10种抗菌药物的敏感性并进行临床状况调查,属院外感染者进入本研究,对敏感率差异进行χ2检验.结果共有148例患者入选,感染部位以泌尿生殖系统为最多,平均住院时间为21 d,明显长于同期其他患者的平均住院时间(17 d);敏感率最高的药物是亚胺培南/西司他丁,全部菌株对该药均敏感,无耐药菌株发现;耐药率最高的是环丙沙星,接近70%;头孢他啶和阿米卡星、氨曲南和头孢吡肟、庆大霉素和头孢呋辛、环丙沙星和左氧氟沙星、环丙沙星和哌拉西林之间的敏感率差异无显著的统计学意义,其他各药物间敏感率差异显著(P<0.01);患者临床首次使用的抗菌药物出现频率由高到低依次为头孢呋辛、头孢曲松、左氧氟沙星、亚胺培南/西司他丁、哌拉西林、阿米卡星.结论院外感染的大肠埃希菌对环丙沙星、哌拉西林、左氧氟沙星和庆大霉素明显耐药,对亚胺培南/西司他丁、阿米卡星和头孢他啶等敏感,临床首次选用的抗菌药物并非敏感率高的品种.     

碳青霉烯类抗生素敏感性下降尿道致病性大肠埃希菌的耐药性和同源性研究

目的：了解绍兴地区碳青霉烯类抗生素敏感性下降尿道致病性大肠埃希菌（UPEC）的耐药性和同源性。方法收集绍兴市人民医院2013年1月至2015年6月对碳青霉烯类抗生素敏感性下降的UPEC 53株,全自动微生物鉴定仪检测细菌对常见抗生素的最低抑菌浓度（MIC）。使用改良Hodge试验进行产碳青霉烯酶的表型确证,使用PCR方法进行肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶（KPC）的检测。通过肠杆菌基因间重复一致序列（ERIC）对菌株进行基因分型。结果 UPEC对除替加环素以外的抗菌药物均有较高的耐药率;53株细菌中,改良Hodge试验阳性44株（83.0%）,38株检出KPC-2酶（71.7%）;ERIC将菌株分为18个谱型。结论碳青霉烯类敏感性下降UPEC菌株对绝大多数抗菌药物均存在较高的耐药率,KPC是造成菌株对碳青霉烯类抗生素敏感性下降的主要原因,部分科室存在克隆株流行。     

分子生物学方法鉴定由自毙鼠分离的细菌

目的 对1株由自毙鼠分离的细菌（X175菌株）进行属、种及型的鉴定。方法 ①采用16S rDNA对X175菌株进行种属鉴定;②应用荧光PCR检测X175菌株是否存在致泻性大肠埃希菌常见毒素基因（stx1/stx2/eae、lt/st、aggR/ipaH）及大肠埃希菌O104、H4基因;③应用PCR检测X175菌株是否存在肠出血性大肠埃希菌（EHEC）O104∶H4的9个毒力基因。结果 ①经16S rDNA鉴定,X175菌株与大肠埃希菌埃希菌属的一些菌株相似度达99%,进化树显示X175菌株与大肠埃希菌O104∶H4菌株的亲缘关系较近;②大肠埃希菌O104基因和ipaH基因检测结果均为阳性,stx1/stx2/eae、lt/st、aggR、志贺菌/沙门菌、H4等基因检测结果均为阴性;③肠出血性大肠埃希菌O104∶H4九个毒力因子检测结果均为阴性。结论 X175菌株为大肠埃希菌O104弱毒型菌株,H抗原和其他一些特性还需进一步研究。