几个单核苷酸多态在布依族、苗族和汉族个体preproEGF基因中的分布分析

目的比较分析单核苷酸多态在布依族、苗族和汉族个体preproEGF基因第20、21外显子及其内含子中的分布状况。方法 设计合成11条引物分别以布依族、苗族和汉族各个体的基因组DNA为模板进行大片段PCR扩增;DNA测序各PCR扩增产物;以GenBank资料库相应的核酸序列为参照分析比较布依族、苗族、汉族个体和外国人种的单核苷酸多态分布。结果布依、苗和汉族个体基因组样本的PCR扩增均得到一条长约4.5kb的DNA片段,其长度复盖preproEGF基因的第20、21外显子及第20内含子;与汉族个体相比较,布依族个体DNA测序结果显示有两个单核苷酸多态位点存在,一个位于preproEGF基因序列的第84329bp(T/C),另一个位于第83634bp(T/-);而苗族个体则仅存在一段长约20bp的套峰区,其中可见两个明确的套峰,分别位于第84583bp(N)和84597bp(N);与GenBank的DNA序列对比分析发现布依族个体的(T/C)多态位点在资料库中虽已报道见于其它民族群体,但在布依民族则未见报道。结论本研究首次证实了在布依族个体第20内含子区段存在一个单核苷酸多态位点84329bp(T/C);另一个多...     

人preproEGF的mRNA／cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究

目的探明单核苷酸多态（SNPs）在人表皮生长因子前体蛋白（prepr0EGF）mRNA／cDNA序列中的分布状况。方法凭借美国生物信息中心（NCBI）平台和单核苷酸多态资料库（dbSNP）检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA／eDNA序列中的分布位点和生物信息学特征。结果分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNA／cDNA序列中的SNPs总计有106个,其中84个同位SNPs大多数以外显子6～8、11～12、16～19和22。23为间隔并集中归位于第1～5、10、13～15、20～21、24外显子序列中,另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3’端非编码序列中,但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中。结论SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA／eDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值。     

长爪沙鼠ApoE基因SNPs遗传多态性的研究

目的　为了评价ApoE基因在Z:ZCLA长爪沙鼠封闭群中的遗传多样性。方法 利用PCR-SSCP技术对前期已筛选到的三个SNP（single nucleotide polymorphism）位点在普通级和清洁级两个封闭群共444只动物中进行了ApoE等位基因的基因频率,基因型频率,杂合度、多态信息量等参数进行了检测与计算。结果　检测结果表明97、781和1774三个SNP位点平均等位基因为2个,遗传方式基本符合孟德尔定律;期望杂合度分别是0.063,0.501,0.499,全群平均为0.354;PIC分别是0.061,0375,0.374,全群平均0.270。　结论　ApoE基因频率和基因型分布可能与长爪沙鼠的长期封闭和选种方式造成一定程度的遗传漂变相关。     

长爪沙鼠ApoE基因SNPs的遗传多态性

目的评价ApoE基因在Z:ZCLA长爪沙鼠封闭群中的遗传多样性。方法利用PCR-SSCP技术对前期已筛选到的三个SNP(single nucleotide polymorphism)位点在普通环境和生物净化后、屏障环境饲养的两个封闭群共444只动物中进行了ApoE等位基因的基因频率,基因型频率,杂合度、多态信息量等参数进行了检测与计算。结果检测结果表明97、781和1774三个SNP位点平均等位基因为2个,遗传方式基本符合孟德尔定律;期望杂合度分别是0.063、0.501、0.499,全群平均为0.354;PIC分别是0.061、0375、0.374,全群平均0.270。结论 ApoE基因频率和基因型分布可能与长爪沙鼠的长期封闭和选种方式造成一定程度的遗传漂变相关。     

采用生物信息学策略对鼻咽癌相关抗原基因NPC—A—7组织分布的初步分析

目的 应用生物信息学的方法分析鼻咽癌相关抗原基因NPC—A—7的组织分布情况，以推测鼻咽癌相关抗原基因NPC—A—7的生物学功能与特性。方法 应用美国国家生物信息中心(NCBI)中的核酸数据库、EST数据库、Unigen数据库、Source资源和相应软件分析。结果 鼻咽癌相关抗原基因NPC—A—7定位于19p13．11，广泛表达于许多肿瘤组织，特别是在脂肪肉瘤、转移性卵巢癌、鼻咽癌、乳腺癌等肿瘤组织中明显高表达，而在皮肤、子宫颈、胃等正常组织中不表达。结论 鼻咽癌相关抗原基因NPC—A—7编码的抗原可能与人类多种肿瘤的发生发展密切相关。     

SNPs检测方法在不同种族遗传差异分析的应用

作为人类可遗传变异中最常见形式,人类基因组单核苷酸多态性（SNPs）代表了种族间的遗传差异。随着SNPs检测技术的快速发展,专家们在SNPs的种族遗传差异的意义及其应用研究中取得了很大进展。本文对SNPs的检测方法及其在种族遗传差异分析方面的应用作简要综述。     

中国汉族人群BSG基因SNPs发掘与连锁不平衡分析

目的：探讨健康中国汉族人群中basigin（BSG）基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）发生情况。方法：随机收集48例健康、无亲缘关系的中国汉族人外周血液并提取基因组DNA,设计引物对所有个体BSG基因的启动子区、外显子区和外显子内含子交界区的序列进行PCR扩增和正反向测序,通过判读测序峰图,明确SNPs的发生情况及其频率;通过Hardy-Weinberg平衡分析、单倍型推测和连锁不平衡分析,确定BSG基因位点的单倍型标~SNPs（haplotype tag SNPs,htSNPs）;中性理论检验查明该基因位点SNPs频率分布是否符合选择中性。结果：共发现19个SNPs,其中包括2个新发现的SNPs;所有SNPs位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。该基因位点共推测出4种常见单倍型域,确定9个SNPs为htSNPs。中性理论检验结果提示健康中国汉族人群BSG基因的SNPs分布符合中性进化假说。结论：首次对中国健康汉族人群BSG基因的SNPs进行了发掘,确定了其9个单倍型标签SNPs,为在汉族人群中研究该基因的遗传多态性与疾病易感性或药物反应性个体差异奠定了基础。     

江西地区汉族人群HLA-DR基因多态性的分布特征

HLA基因复合体是迄今所知的最为复杂的人类遗传多态性系统。HLA抗原传统的检测方法是血清学和细胞学分型，由于HLA抗原的高度同源性，致使交叉反应组内的抗原难以分辩，本文采用HLA-SSP方法检测江西地区人群的HLA基因分型，分析其中HLA-DR抗原特异性的分布特点。     

RhoA蛋白在人胃癌细胞株SGC-7901核内的分布

目的：研究RhoA蛋白在人胃癌细胞株SGC-7901细胞核内的分布。方法：采用免疫荧光,免疫组化以及Western Blotting检测不同方法提取的蛋白样品,观察RhoA蛋白在人胃癌细胞株SGC-7901核内的分布情况。结果：以上方法的结果均显示RhoA蛋白在SGC-7901的细胞核内有分布。结论：在人胃癌细胞株SGC-7901中,RhoA蛋白不仅分布在细胞质和细胞膜,在细胞核内也有分布。     

人癌细胞在裸小鼠肺内转移的局部解剖学分布

将两个高转移性人肺腺癌细胞系分别经腹腔、静脉和皮下接种于裸小鼠。其肺转移癌可按局部解剖学分为5型。各型出现的频度与接种途径及癌细胞系的不同有关。提示了转移性癌细胞在靶器官内的分布具有组织空间的偏向性,以及生长环境可修饰肿瘤细胞的生物学特性。     

汉族和布依族个体preproEGF基因DNA序列中3个新的单核苷酸多态性研究

目的 探测鉴定汉族和布依族个体表皮生长因子前体基因(preproEGF)第20、21外显子及其内含子DNA序列区段中的单核苷酸多态.方法 设计合成11条引物分别以布依族和汉族个体的基因组DNA为模板进行大片段PCR扩增和产物的DNA测序;以GenBank资料库相应的核酸序列为参照分析比较布依族、汉族个体和外国人种的...     

布依族XRCC1基因单核苷酸多态性及其组合型分析

目的 分析布依族人群DNA修复基因XRCC1 C26304T、G27466A与G28152A单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征。方法 获取自然人群个体布依族192例血白细胞基因组DNA，利用PCR扩增限制性酶切法（PCR—RFLP）检测XRCC1 C26304T、G27466A与G28152ASNPs。结果 XRCC1 C26304TSNPs基因型分布CC、CT、TT分别为64．6％、28．6％、6．8％，C、T等位基因频率分别为78．7％、21．3％。XRCC1G27466ASNPs基因型分布GG、GA、从分别为85．9％、12．5％、1．6％，G、A等位基因频率分别为91．7％、8．3％。XRCC1G28152ASNPs基因型分布GG、GA、从分别为55．2％、37．0％、7．8％，G、A等位基因频率分别为73．7％、26．3％。本研究发现XRCC1基因C26304T和G28152A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC＋GG60例（31．2％）；C26304T和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC＋GG98例（51．0％）；G28152A和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为GG＋GG88例（45．8％）。结论 本研究揭示了布依族人群XRCC1基因3位点的单核苷酸多态性、基因型及其组合分布特征，为进一步研究该基因SNPs与其生理功能和疾病的关系提供基础资料。     

精氨酸加压素基因rs66818855A/G和rs1078152C/T在广西健康人群中的分布

目的研究精氨酸加压素（AVP）基因单核苷酸多态性（SNP）位点rs66818855和rs1078152在广西健康人群中的分布,并对 比不同种族间AVP基因型及等位基因频率分布的差别。方法采用单碱基延伸的聚合酶链反应（PCR）技术和DNA测序法检测 303例广西人AVP基因多态性,分析广西人群这两个位点的基因型和等位基因的分布频率,并与人类基因组计划公布的欧洲 人、中国北京汉族人、日本人和非洲人的基因多态性分型数据比较,分析这5个人群人类的基因型及等位基因的分布频率。结 果在我国广西人群中存在AVP基因rs66818855和rs1078152多态性,分别有AA、AG、GG,CC、CT、TT三种基因型。与人类基 因组计划公布的欧洲人、非洲人、日本人和中国北京人的单核苷酸多态性分型数据进行比较,AVP基因rs66818855、rs1078152 位点基因型和等位基因频率在广西人群和欧洲人群的差异具有统计学意义（P均<0.01）;rs66818855位点等位基因频率与非洲 人相比差异具有统计学意义（P<0.05）。结论在广西地区人群中存在着AVP基因多态性。广西人群AVP基因多态性的分布与 其他种族人群比较存在有差异,这种差异也许是与AVP相关的疾病在不同地区人群间发病率不同的原因之一,对于群体遗传学 及人类学的研究可能起非常重要的作用。     

人表皮生长因子基因化学及酶促合成与克隆

作者利用DNA自动合成仪及酶促反应合成了全长175bp的人表皮生长因子基因,由计算机辅助进行基因序列、化学合成片段和酶切位点的设计,片段退火预测以及重复顺序和发夹结构的搜寻,所设计的基因具有多种克隆及表达途径。全基因先由DNA合成仪合成8个片段,经5端磷酸化及退火,再由DNA聚合酶合成4个缺口片段,用连接酶连接而形成,将基因插入pUC12质粒,转化JM103大肠杆菌,20ng的连接质粒转化后,在含X-gal及氨苄青霉索的营养琼脂平板上获得约200个白色克隆。随机选择7个克隆提取质粒作限制性内切酶鉴定,4个符合实验设计,取1个克隆作插入基因的DNA序列分析,结果与设计完全相符。     

Chemical and enzymatic synthesis and doning of human epidermal growth factor gene

The human epidermal growth factor gene was synthesized with DNA synthesizer andby enzymes.Computer assisted to design the gene sequence and the restriction enzyme sites,andto elhninate the repeated and self-complementary sequences.So that multiple doning and gene ex-pression were available for the designed gene sequence.The whole gene was formed by annealing8 chemically synthesized oligodeoxynucleotide fragments,enzymatically filling up the 4 twenty-basespaces and ligating the nicks,and was inserted into EcoR I and HInc Ⅱ sites ofplasmid pUC12.The recombinant plasmid was transformed into E.coli JM103 and 200 whitedones were obtained by X-gal and ampicilin screening.The positive clones were isolated andcharacterized by restriction enzyme analysis and DNA sequencing.     

骨保护素基因启动子单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的相关研究

目的探讨骨保护素基因启动子149、950T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的相关性。方法提取192例脊髓型颈椎病和192例性别年龄匹配的健康人外周血DNA,聚合酶链反应产物根据限制性内切酶作用后不同分解产物和等位基因来判断每例患者骨保护素的基因型。确定对照组、疾病组不同的基因型及等位基因,评价颈椎病严重度以JOA评分,同时采用颈椎MRI评价病变节段,采用χ2检验比较两组的基因型分布差异。采用两元回归分析来确定脊髓型颈椎病的独立风险因子。结果在疾病组和对照组之间,149T/C基因型分布及等位基因频率间差异存在统计学意义。对于950 T/C单核苷酸多态性,两组分布差异并无统计学意义。对于149T/C基因型,其JOA评分、颈椎MRI受累节段两者差异无统计学意义。Logistic回归分析结果 149 T/C SNP、平均桌面工作时间为脊髓型颈椎病发病的独立风险因素。结论骨保护素149 T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的发病有关,而与其严重度无关。950T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的发病无明确相关性。149 T/C SNP、平均桌面工作时间为脊髓型颈椎病发病的独立风险因素。     

PLUNC基因编码区单核苷酸多态位点G14595T与鼻咽癌的相关研究

目的检查腭、肺及鼻咽上皮克隆（PLUNC）基因编码区单核苷酸多态（SNP）位点G14595T与广东地区鼻咽癌易感性有无明显关联。方法用直接测序的方法检测基因编码区、调控区和侧翼区及部分内含子区,确定SNP位置和类型。用聚合酶链式反应一限制性酶切片段长度多态性（PER-RFLP）结合测序方法对编码区多态性位点G14595T在广东地区239例鼻咽癌患者和286例对照人群中进行相关性分析。结果通过测序共获取9个SNP;其中8个SNP位点之间均呈高度连锁不平衡;3个SNP位点可以作为htSNP;编码区多态位点G14595T在239例鼻咽癌患者和286例对照人群中等位基因型频率差别很小。结论PLUNC基因编码区多态位点G14595T在鼻咽癌患者和对照人群中等位基因型频率差别很小,这说明该位点与中国广东地区鼻咽癌易感性无明显关联。