基于网络药理学探究苏黄泻浊丸抗肾间质纤维化及其调控铁死亡的作用机制

目的：基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化（Renal Interstitial Fibrosis,RIF）及调控铁死亡的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成分及RIF关联靶标,借助Cytoscape 3.6.0软件构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF靶标网络,结合STRING数据库构建方药与RIF关联靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用FerrDb数据库获取铁死亡调控基因,最终获取公共靶标基因,构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF、铁死亡共同靶标网络,结合STRING数据库构建共同靶蛋白相互作用网络;利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果：筛选出药物活性成分102个,与RIF关联的靶基因177个,经基因本体论（GO）、KEGG分析,苏黄泻浊丸治疗RIF的生物过程与RNA聚合酶Ⅱ促进转录的正调控、转录因子活性、序列特异性DNA结合等有关,通过调节脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素（Inter...     

基于网络药理学方法探索葛根-丹参药对治疗冠心病心绞痛的作用机制

目的 基于网络药理学探索葛根-丹参药对治疗冠心病心绞痛的作用机制.方法 借助多个在线数据库筛选并预测葛根-丹参药对活性成分及治疗治冠心病心绞痛的作用靶标.借助STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络;通过Uniprot数据库获取靶标蛋白的基因名称,利用DAVID在线工具进行潜在基因的GO分析及KEGG富集通路...     

基于网络药理学探讨新伤丸治疗膝骨性关节炎的分子作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨新伤丸治疗膝骨性关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的潜在分子作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索新伤丸中16个药味中含有的活性成分,筛选有效活性成分及其潜在作用靶点;运用GeneCards数据库获取与KOA相关的靶标基因,采用Cyt...     

基于网络药理学和细胞实验探究心脉康片治疗动脉粥样硬化心血管病的作用机制

目的:运用网络药理学和细胞实验验证方法研究心脉康片治疗动脉粥样硬化心血管病的潜在药理学作用机制.方法:使用BATMAN-TCM数据库检索心脉康片的组成药物并筛选得到药物活性成分与潜在作用靶标;在GeneCards,人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)检索与动脉粥样硬化相关的疾病靶标;取药物与疾病靶标交集映射获得治疗靶标...     

基于网络药理学研究人参、川芎药对有效成分抗动脉粥样硬化的作用机制

目的探讨人参、川芎药对有效成分抗动脉粥样硬化的作用机制。方法通过PubMed、CNKI、中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP数据库检索人参总皂苷、川芎嗪化学成分,构建化学成分数据库。通过BATMAN-TCM平台预测成分靶标,并预测疾病靶标,利用Cytoscape 3. 6. 1软件进行核心靶标筛选、GO基因及KEGG通路富集分析,构建药物成分-作用靶标-代谢通路网络图,探讨其抗动脉粥样硬化的作用机制。结果本研究收集化学成分17个,筛选成分-靶标PPI网络有464个节点,214832条连接。药物-疾病核心靶标17个,GO基因富集分析提示涉及生物过程、分子功能2个方面,KEGG通路富集分析潜在调控通路有PPAR通路、脂肪细胞因子信号通路及胆汁酸分泌,且发掘靶标、通路中多个与肥胖相交叉,其中PPARγ/PGC-1α/UCP1信号通路能够通过促进白色脂肪棕色化发挥抗动脉粥样硬化作用。结论人参、川芎有效成分可能通过PPARγ/PGC-1α/UCP1信号通路促进白色脂肪棕色化,改善动脉粥样硬化。     

血府逐瘀丸对动脉粥样硬化血瘀征象及危险因素影响的研究

目的：观察血府逐瘀丸对动脉粥样硬化血瘀征象和危险因素的影响。方法：将５７例患者随机分为血府逐瘀丸组（３０例）和阿斯匹林组（２７例），分别给予血府逐瘀丸口服，每次６ｇ，每日３次。小剂量阿斯匹林每桨４０ｍｇ，每日１次，治疗１个月。结果：血府逐瘀丸能够改善动脉粥样硬化患者的血瘀证候（Ｐ〈０．０１），降低体内脉粥样硬化危险因素－－高血胆固醇（Ｐ〈０．０５）、氧化低密度脂蛋白（Ｐ〈０．０５）和血浆内α－颗粒     

芩百清肺浓缩丸对肺炎支原体肺炎作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学方法探讨芩百清肺浓缩丸治疗肺炎支原体肺炎(MPP)的作用机制。方法通过检索文献数据库获得芩百清肺浓缩丸的入血活性成分;利用反向分子对接服务器PharmMapper获得入血活性成分的潜在靶标;通过生物信息数据库Genecards获取MMP相关基因,与芩百清肺浓缩丸潜在靶标映射取交集得到靶标基因;使用Cytoscape软件的Network Analyzer程序分析并构建芩百清肺浓缩丸入血成分与作用靶标的关系网络;运用STRING软件构建靶蛋白的相互作用(PPI)网络;通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库对获得的靶蛋白进行相关通路分析。结果共获得O-甲基绿原酸、黄芩苷、花生四烯酸、金刚大碱、香叶木素等28个芩百清肺浓缩丸入血活性成分;预测得到GSTP1、CDK2、HSP90AA1、LCK、F2等117个作用靶标;PPI网络中ALB、PI3KCG、EGFR、MAPK1、MAPK8、AKT1、HSP90AA1等靶标连接度最高;通过影响B细胞受体、T细胞受体、Toll样受体、TNF、NF-κB、PI3K-Akt以及MAPK等免疫、炎症通路发挥治疗MPP的作用。结论芩百清肺浓缩丸可能主要通过调节免疫功能、抑制炎症反应来发挥对MPP的治疗作用。     

基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制

目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点;从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标,同时利用Venny 2.1在线网络获取交集基因;运用Cytoscape (Version3.7.2)和STRING数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而运用cytoHubba插件鉴定出核心靶标。最后,运用Metascape数据库进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17(JUN)、p53肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3 (STAT3)、促分裂素原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、前列腺内过氧化物合成酶2 (PTGS2)、促分裂素原活化蛋白激酶1 (MAPK...     

基于生物信息学探究桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的作用机制

目的：利用生物信息学技术探究桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的分子机制。方法：通过基因表达综合（GEO）数据库检索子宫肌瘤相关芯片,利用R语言分析得到差异表达基因。借助疾病数据库对子宫肌瘤已知靶基因进行检索。运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选桂枝茯苓丸的主要有效成分及作用靶基因,3组靶基因映射出关键靶点,通过基因功能注释数据库（DAVID）对关键靶基因进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：筛选到桂枝茯苓丸有效成分11个,对应靶点121个;GEO数据库获得差异表达基因187个,检索到子宫肌瘤相关靶标271个;3组靶标最终获得映射靶基因20个,关键靶基因9个。桂枝茯苓丸主要通过ESR1、EGFR、SRC等核心靶基因调控类固醇结合、锌离子结合等生物过程及雌激素通路、催乳素通路、GnRH通路等多个信号通路干预子宫肌瘤发生发展过程。结论：应用生物信息学具有较高的置信度和参考价值,提供了桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的新方向与新思路。     

寿胎丸治疗先兆流产作用机制的网络药理学分析

目的:运用网络药理学技术,探讨寿胎丸治疗先兆流产的作用机制。方法:运用BATMAN-TCM数据库、GeneCards数据库分别获得寿胎丸的作用成分靶标及先兆流产的靶标,将两者取交集后得到寿胎丸-先兆流产的交集基因,将交集基因导入String构建蛋白相互作用网络,并将结果进行网络可视化展示。同时采用R语言软件对交集基因进行GO基因功能注释和KEGG通路分析。结果:寿胎丸治疗先兆流产的核心靶点有30个,包括AGT、PIK3CA、ANXA1、F2等,20余条信号通络与先兆流产相关,包括神经活性配体-受体相互作用通路、流体剪切力与动脉粥样硬化通络、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、补体及凝血级联反应、TNF信号通路等。结论:寿胎丸可能通过作用于激素调节、免疫调节及炎症反应相关的靶点和通路治疗先兆流产,维持妊娠;该研究初步揭示了寿胎丸治疗先兆流产的作用机制,为中医药多靶点、多通路治疗疾病提供现代医学的证据,为后续的试验研究提供方向和研究思路。     

归肾丸治疗多囊卵巢综合征的网络药理学作用机制

目的通过网络药理学研究方法和分子对接技术预测归肾丸治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的作用机制。 方法利用TCMSP 数据库,收集归肾丸有效成分并预测其作用靶标,通过GeneCards 与OMIM 数据库筛选出 多囊卵巢综合征的靶标,运用R 软件获取疾病交集靶标,绘制韦恩图。运用Cytoscape 软件构建归肾丸治疗多 囊卵巢综合征的“药物-成分-靶标-疾病”网络,通过STRING 数据库构建靶标蛋白相关作用网络并进行关键 靶标的GO 功能富集分析及KEGG 通路富集分析。通过Autodock Vina 软件对药物有效成分与疾病靶标进行分 子对接验证。结果筛选得到归肾丸治疗多囊卵巢综合征的78 个有效成分和78 个药物-疾病共同靶标,并推 断其作用机制可能与介导PI3K-Akt、HIF-1 及TNF 等124 条信号通路相关。槲皮素、山柰酚、豆甾醇等有效 成分与PTGS1、ESR1、PGR 等靶标对接结果良好。结论归肾丸有效成分可能通过抗炎性反应、改善胰岛素 抵抗、促进卵泡发育、控制血糖稳态、调节脂质代谢、调节激素水平等药理作用来治疗多囊卵巢综合征。     

基于网络药理学的肾气丸治疗糖尿病作用机制研究

目的运用网络药理学方法筛选肾气丸的活性成分及核心靶标,探讨肾气丸治疗糖尿病的作用机制。方法经中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献查询,筛选肾气丸的活性成分;通过TTD数据库和Swiss Target Prediction数据库筛选肾气丸活性化合物的作用靶点,建立靶点数据集;通过OMIM数据库和DrugBank数据库筛选糖尿病相关的靶标;PPI数据库构建肾气丸和糖尿病的交互靶标;用Cytoscape软件构建成分-靶点-疾病交互网络图,并通过ClueGO富集分析涉及的靶点基因功能及信号通路;应用Autodock软件进行核心靶标分子对接。结果筛选得到肾气丸100个活性成分,网络分析表明肾气丸活性成分涉及低密度脂蛋白受体相关蛋白6、胰岛素受体底物1、SHC转化蛋白1等靶点58个,靶点与调控基因的转录、细胞凋亡、细胞增殖、胰岛素受体等生物过程相关,通过调节胰岛素抵抗、TNF信号通路、2型糖尿病信号通路、胰岛素信号通路等通路来发挥其抗糖尿病作用。结论肾气丸治疗糖尿病具有多成分-多靶点-多途径的特点,为进一步研究肾气丸治疗糖尿病的作用及分子机制提供了新思路和新方向。     

基于网络药理学探讨胃肠安丸治疗肠易激综合征的分子机制

目的 基于网络药理学探讨胃肠安丸治疗肠易激综合征(IBS)的作用靶点及信号通路,阐述其潜在的作用机制.方法 利用TCMSP、BATMAN数据库结合文本挖掘方式筛选出胃肠安丸所含的活性成分,并运用Uniprot数据库搜索相应靶标的靶点基因;通过GeneCards数据库对IBS疾病靶点进行预测、筛选;利用Cytoscape...     

基于网络药理学探讨补骨丸治疗绝经后骨质疏松症的分子作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨补骨丸治疗绝经后骨质疏松症(Postmenopausal Osteoporosis,PMOP)的潜在分子作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索补骨丸中14味药中含有的活性成分,筛选有效活性成分及其潜在作用靶点;运用GeneCards数据库获取与PMOP相关的靶标...     

基于网络药理学探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理

目的通过网络药理学方法探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理。方法运用中药系统药理学成分分析平台(BAT-MAN)数据库获取补肾强督治偻方的作用靶标基因,于CTD数据库中获取强直性脊柱炎疾病相对应的靶标基因,将两者取交集后获取疾病-药物蛋白靶基因,运用网络可视化软件STRING构建蛋白质间相互作用网络,并将结果进行网络可视化展示,通过网络结构和节点间加权重联系的计算分析算法筛选出重要的关键基因。借助DAVID在线工具进行疾病-药物交集靶基因的基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析。最后在CTD数据库中获取关键基因于强直性脊柱炎的疾病治疗作用。结果补肾强督治偻方靶标基因与强直性脊柱炎疾病靶标基因的交集基因有705个。GO分析结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的生物功能主要包括基因表达的阳性调控、炎症反应、细胞增殖阳性调控等;信号通路富集结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的网络主要涉及肿瘤坏死因子信号通路、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等。获得关键基因23个,都与痛症、炎症性疾病及关节炎性疾病相关。结论补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎是多靶点、多通路、多选择的复杂机制过程,其机制多与抗炎和镇痛相关。     

基于网络药理学探讨板蓝根治疗银屑病作用机理

目的:通过网络药理学探讨板蓝根治疗银屑病的物质基础及作用机制。方法:利用中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)数据库筛选板蓝根活性化合物及其靶标基因;运用Dis Ge NET数据库获取银屑病相关靶向基因,将两者去交集后获得疾病-药物蛋白靶基因;使用String数据库疾病-药物蛋白靶基因进行蛋白互作分析,运用R语言筛选出核心基因;接着,通过Systems Dock网站,将核心基因进行"成分-靶标蛋白"的分子对接验证;最后,借助DAVID在线工具进行核心基因的基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析。结果:共收集到板蓝根26个活性化合物,2381个板蓝根靶标基因,691个银屑病靶标基因及124个药物-疾病交集靶基因;在此基础上挖掘出AKT1等20个核心基因,其富集在HIF-1信号通路、T细胞受体信号通路等15条核心通路上。结论:板蓝根通过多成分、多靶点、多通路治疗银屑病,其可能是通过HIF-1信号通路、T细胞受体信号通路等发挥对银屑病的治疗作用。     

基于网络药理学探究“黄芪-当归”治疗慢性再生障碍性贫血的作用机制

目的:基于网络药理学理念,探讨“黄芪-当归”治疗慢性再生障碍性贫血(CAA)的作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)与Pubchem数据库获取黄芪、当归的活性成分及其平面结构图与结构式,通过SwissTargetPrediction服务器和人类基因数据库(GeneCards)获取该药对治疗CAA的成分-疾病靶标及其Uniprot ID。根据成分-疾病靶标与活性成分的作用关系,筛选出有效成分,根据成分-疾病靶标之间的相互作用关系筛选出5个核心靶标,并利用systemsDock在线工具进行分子对接验证。通过DAVID6.8在线工具进行成分-疾病靶标的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出黄芪-当归活性成分共20个,可作用于144个靶标,主要是调控PI3K-Akt信号通路和VEGF信号通路。结论:“黄芪-当归”可能是通过改善造血微环境、促进红细胞生成、增加血管新生等多方面调节造血功能治疗CAA。     

泽泻汤治疗梅尼埃病作用机制的网络药理学探讨

目的:通过网络药理学方法探讨泽泻汤治疗梅尼埃病(Meniere Disease, MD)的作用机制。方法:利用SymMap、TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM等中医药数据库及TargetNet药物-靶点谱在线计算平台,获取泽泻汤有效成分及作用靶点;通过OMIM、Gene Cards、TTD、CTD等疾病基因数据库,获取MD相关靶标基因;利用STRING蛋白质数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape信息分析软件,获取关键靶标基因、构建中药-有效成分-靶标基因网络图;利用R软件进行信号通路分析。结果:泽泻汤中69种有效成分可作用于88个MD相关基因,以核受体(如糖皮质激素受体)为主要作用靶点,参与IL-17、肿瘤坏死因子(TNF)相关的核因子κB信号通路介导的炎症反应。结论:由核受体糖皮质激素受体-核因子κB介导的炎症反应通路,可能是泽泻汤减少MD炎症反应,缓解膜迷路水肿的重要作用途径之一。     

用血清药理学方法观察血府逐瘀浓缩丸对实验性动脉粥样硬化家兔主动脉平滑肌细胞增殖的影响

采用两种离体实验方法对比观察血府逐瘀浓缩丸对实验性动脉粥样硬化家兔主动脉平滑肌细胞（ＳＭＣ）增殖的影响。第一种采用给家兔灌服血府逐瘀浓缩丸后取其血清加至细胞培养基中进行实验即血清药理学方法；第二种直接加血府逐瘀煎剂浓缩液至培养基中。结果发现含血府逐瘀浓缩丸血清和血府逐瘀煎剂浓缩液均对ＳＭＣ增殖有抑制作用，并呈剂量依赖性，且煎剂浓缩液作用强于含药血清。表明血府逐瘀浓缩丸在体内外确均有抑制ＳＭＣ增殖作用，血府逐瘀浓缩丸确含抗ＳＭＣ增殖的有效成分，并且此成分口服有效。血府逐瘀煎剂浓缩液的抑制作用比含药血清强，可能与某些有效成分未能从消化道吸收或经体内代谢失活有关。     

用血清药理学方法观察血府逐瘀浓缩丸对实验性动脉粥样硬化家兔主动脉平滑肌细胞增殖的影响

采用两种离体实验方法对比观察血府逐瘀浓缩丸对实验性动脉粥样硬化家兔主动脉平滑肌细胞（ＳＭＣ）增殖的影响。第一种采用给家兔灌服血府逐瘀浓缩丸后取其血清加至细胞培养基中进行实验即血清药理学方法；第二种直接加血府逐瘀煎剂浓缩液至培养基中。结果发现含血府逐瘀浓缩丸血清和血府逐瘀煎剂浓缩液均对ＳＭＣ增殖有抑制作用，并呈剂量依赖性，且煎剂浓缩液作用强于含药血清。表明血府逐瘀浓缩丸在体内外确均有抑制ＳＭＣ增殖作用，血府逐瘀浓缩丸确含抗ＳＭＣ增殖的有效成分，并且此成分口服有效。血府逐瘀煎剂浓缩液的抑制作用比含药血清强，可能与某些有效成分未能从消化道吸收或经体内代谢失活有关。