lncRNA与miRNA相互作用对疾病的影响

长链非编码RNA(lncRNA)与微小RNA(miRNA)之间存在相互调控关系。lncRNA可作为一种竞争性内源性RNA(ceRNA)与miRNA相互作用,参与靶基因的表达调控,反之,miRNA可通过RNA诱导沉默复合物(RISC)调控lncRNA发挥生物学功能,两者共同参与多种疾病的发生。     

构建编码基因-非编码RNA调控网络挖掘前列腺癌潜在致病因子

目的 基于前列腺癌的编码基因-非编码RNA调控网络识别潜在的生物标记物.方法 利用前列腺癌的lncRNA、miRNA和mRNA表达谱数据及它们与转录因子之间的靶向关系,构建编码基因-非编码RNA三维调控网络,挖掘ceRNA子网,识别潜在竞争性的lncRNA并筛选前列腺癌潜在的致病因子.结果 从ceRNA子网中识别出4个lncRNA竞争性的结合了5个miRNA间接调控了63个基因的表达,功能预测这些lncRNA参与了激素调节;基于网络拓扑属性,挖掘出一个包含了16个lncRNAs、2个miRNAs、4个mRNAs的生物标记物.结论 多种调控因子如TF、lncRNA、miRNA、mRNA共同作用影响前列腺癌的发生发展,其中有些lncRNA作为ceRNA来发挥基因表达调控的作用.     

消化系统恶性肿瘤中ceRNA的研究进展

消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,其发生、发展机制尚不清楚是影响肿瘤治疗的重要原因。研究表明RNA在消化系统肿瘤的转录后调控机制中发挥重要的作用,lncRNA、mRNA、假基因转录物、环状RNA等各类RNA分子,仅需相同的miRNA应答元件,就可竞争性结合相同的miRNA调控靶基因,从而调节各自的表达。这些RNA分子互为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)。该文着重探讨ceRNA假说及其在消化系统恶性肿瘤中的研究进展,并展望其研究前景。     

非编码RNA在肿瘤中对自噬的调控

非编码RNA（ncRNA）是不参与蛋白质编码的RNA的总称,包括微小RNA（miRNA）、siRNA、piRNA、长链非编码RNA（lncRNA）、转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）等。其在蛋白质转录与后转录过程中有重要的调节作用。自噬是细胞在异常环境中维持生存的一种方式。大量研究表明自噬与肿瘤也存在着密切的关系,而自噬对于肿瘤的影响具有“两面性”。许多研究探讨了非编码RNA在肿瘤细胞中对于自噬过程的调控．文章综述了miRNA与lncRNA这两种研究深入的非编码RNA。     

lncRNA-CCAT1与消化道肿瘤关系的研究进展

结肠癌相关转录因子1(CCAT1)是结直肠癌组织中新近发现的一种异常高表达的长链非编码RNA(lncRNA),具有促进肿瘤细胞增殖及侵袭转移等作用。CCAT1通过内源竞争等机制与微小RNA(miRNA)或蛋白相互作用参与调控机体的诸多生理病理过程,尤其是消化道肿瘤的形成与发展,它有望成为有价值的肿瘤标志物和治疗靶点。     

长链非编码RNA MEG3对肿瘤细胞调控作用的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200 nt的不编码蛋白的RNA分子。lncRNA最初被认为是转录噪音,在近年的研究中发现越来越多功能性的lncRNA,其重要性才渐渐被阐述。母系表达基因3(materally expressed gene 3,MEG3)是一种由母系印记基因编码的lncRNA,在对其功能的研究中发现MEG3几乎参与了所有的生理和病理过程,其在多种肿瘤中表现出抑制作用。本文就lnc RNA MEG3对肿瘤细胞调控的作用机制作一综述。     

长链非编码RNA与结直肠癌

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非蛋白编码RNA分子,能同时与DNA、RNA和蛋白质分子相互作用,通过转录和转录后调控等多种作用机制在结直肠癌中发挥促癌或抑癌的双重作用。lncRNA表达异常或突变在结直肠癌的发生、发展、侵袭和转移过程中扮演着重要角色,且与患者预后密切相关。lncRNA有望为成为结直肠癌新的诊断和治疗靶点。     

长链非编码RNA的功能及与心血管病的研究进展

真核基因组经转录产生了上万种无或少有蛋白编码能力的长链非编码RNA（longnon—codingRNA,lncRNA）。lncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的功能性RNA分子,它们参与表遗传学的调控,转录及转录后的修饰等,还有一部分lncRNA是小RNA产生的前体。虽然lncRNAs的功能和作用机制尚不完全清楚,但是已有一些研究显示lncRNAs参与心血管疾病的发展,其表达水平的改变可能成为一种新的诊断标志。此文就lncRNA的功能及其在心血管病方面的最新研究进展作一综述。     

位于高扩增区域chr20q13.31的lncRNA NKILA在疾病中的研究进展

肿瘤细胞基因组发生的异常扩增通常与患者预后紧密联系, 扩增事件的发生常常伴随转录组RNA的表达水平改变, 长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)作为转录组中占比较大的一类RNA, 其基因组扩增导致的lncRNA过表达已被证实可通过多种生物学过程促进肿瘤的恶性进展。一个定位于肿瘤中常见的扩增区域chr20q13.31的lncRNA, 核转录因子κB(nuclear factor-kappa B, NF-κB)互作的长非编码RNA(NF-κB interacting lncRNA, NKILA)在不同疾病中发挥不同作用, 既能作为保护因子也能促进疾病恶化。本文着重阐述了位于常见高扩增区域的lncRNA NKILA在疾病中的研究进展。     

长链非编码RNA与口腔癌研究进展

口腔癌(oral cancer)是口腔外科常见的恶性肿瘤,易发生转移且预后不容乐观,长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类内源性的长度大于200个核苷酸、缺少特异完整的开放阅读框,不具有蛋白质编码功能的转录本,最初认为并没有生物学功能,但随着生物学技术的发展,发现其能够在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面上调控基因的表达,从而影响机体生长、发育、衰老和死亡等重要的生命活动以及疾病的发生和发展。近年来的研究显示口腔癌的发生、发展、侵袭、转移和预后与lncRNA的表达水平密切相关。因此本文对lncRNA在口腔癌中的研究进展进行论述,并探讨lncRNA与口腔癌发生、发展之间的关系,旨在进一步阐述lncRNA与OSCC的关系并为寻找口腔癌肿瘤标志物提供新的方向,为口腔癌患者提供新的治疗策略。     

长链非编码RNA在神经系统中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是真核细胞中存在着一些非编码RNA,lncRNA通过参与转录调控、RNA的剪切和修饰、mRNA的稳定和翻译调控、蛋白质的稳定和转运、染色体的形成和结构等细胞重要功能来调控胚胎发育、组织分化、器官形成等基本的生命活动,lncRNA有可能成为癌症及神经系统等疾病中新的生物标志物和药物治疗的靶点。本文从lncRNA的概况、lncRNA在神经系统及神经系统疾病中的作用等方面对近年来lncRNA在神经系统中的研究进展进行总结归纳,以期为进一步的研究提供参考。     

长链非编码RNA CCAT2在肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA(LncRNA)是继微小RNA(miRNA)之后非编码RNA(ncRNA)研究的热点.LncRNA在基因组中普遍转录,由于其在转录调控、转录后调控和表观遗传调控中的不同功能,使其正在成为肿瘤发生研究的新热点.结肠癌-相关转录本2(CCAT2)作为一种长链非编码RNA首先在大肠癌中被发现并命名,后被证实在其他多种肿瘤如乳腺癌、卵巢癌、胃癌、非小细胞肺癌、子宫颈癌、食管鳞状细胞癌的发生发展中存在异常表达,说明C C A T 2可以作为肿瘤标记物广泛应用.     

基于生物学信息分析及推测PCGEM1在前列腺癌中的表达分子调控网络

非编码 RNA,包括以 miRNA、siRNA 和 piRNA 等为代表的短小 RNA 和长链非编码 RNA（long non-coding RNA,lncRNA）。长链非编码 RNA,有别于其他小分子非编码 RNA,是目前非编码 RNA 研究的热点。随着研究的不断推进,人们发现 lncRNA 与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等都有着密切的联系[1]。miRNA 是一类长度为21~25个核苷酸（nt）的单链 RNA,属于非编码蛋白 RNA,广泛存在于生物界,miRNA 调节人类1/3基因的表达,miRNA 是一类新发现的基因调节剂,可以在转录水平或转录后水平调节基因的表达,在肿瘤的发生与发展中扮演着“癌基因”与“抑癌基因”的角色[2]。前列腺癌基因表达标记1（prostate cancer gene expression marker 1, PCGEM1）全长1643 nt,在前列腺组织及前列腺癌组织中呈特异表达的长链非编码 RNA,但其表达调控网络目前未知[3],本文旨在运用生物学软件对其进行生物学信息分析,为下一步实验验证其表达分子调控网络机制提供线索。     

头颈部鳞癌中TP53基因的调控网络分析

目的挖掘隐藏在头颈部鳞癌中抑癌基因TP53表达异常的机制。方法从TCGA数据库中选取279例头颈部鳞癌样本的测序数据,利用cbioportal获得TP53基因在头颈部鳞癌中的表达情况及其对患者生存的影响,并筛选样本中与TP53存在共表达关系的基因。利用String和DAVID数据库,建立TP53的共表达网络并分析网络功能,通过lncRNA2target和Star Base数据库,筛选出能够调控TP53的短链非编码RNA(microRNA),长链非编码RNA(lncRNA)和竞争性内源性RNA(ceRNA),利用Cytoscape软件建立TP53相关基因调控网络。结果 279例头颈部鳞癌样本中共有77%的样本出现TP53表达异常,且TP53表达异常患者的生存率显著低于TP53正常表达的患者。此外,筛选出TP53基因的共表达基因288个,(Spearman分数和Pearson分数0.3)功能分析结果显示共表达基因的功能主要为转录调控、细胞凋亡、增殖过程和免疫应答等功能。TP53基因调控网络揭示has-miR-186-5p和has-miR-202-3p等43个microRNA能够靶向调控TP53基因;此外,MEG1、TUG1和MALAT1等6个lncRNA,PHC2、FZD4和TUB等56个mRNA能够通过ceRNA作用调控TP53。结论通过生物信息学方法和基因数据库建立的TP53相关基因调控网络揭示可能调控抑癌基因TP53的若干microRNA、lncRNA和ceRNA,可以为头颈部鳞癌中TP53的作用机制和以TP53为靶点的分子治疗提供新的切入点。     

lncRNA-TUG1作为竞争性内源RNA在心血管疾病中的研究进展

<正>长链非编码RNA(long no-coding RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的RNA分子,虽然本身并不具备直接编码蛋白质的作用,却可通过参与多种生物过程,包括细胞增殖、分化、凋亡等介导疾病的发生^[1]。lncRNA-牛磺酸上调基因1(taurine upregulated gene 1, TUG1)被认为与人类疾病进展密切^[2]。此外,过表达lncRNA-TUG1是心血管疾病后心脏预后不良的生物标志物[3]。竞争性内源RNA(completing endogenous RNA,ceRNA)主要由lncRNA、环状RNA、     

长链非编码RNA调控椎间盘退变的研究进展

椎间盘退变(IDD)是导致腰痛的主要原因,目前在细胞和分子水平寻找IDD的机制得到了较多关注。已有研究报道长链非编码RNA(lncRNA)影响IDD的病理过程。本文综述了lncRNA对髓核细胞增殖、凋亡、衰老、自噬等方面的调控,总结了调控椎间盘内细胞增殖、凋亡和ECM合成与降解的lncRNA及相关靶基因或通路。值得注意的是,有的lncRNA不充当竞争内源性RNA(ceRNA),而是直接结合稳定相关微小RNA(miRNA),增强其miRNA表达从而调控IDD。此外,目前的研究主要报道的是lncRNA对椎间盘内髓核的调控,未来可进一步探究lncRNA对软骨终板和纤维环的调控,为lncRNA调控IDD提供更多的理论支持和依据。     

长链非编码RNA在癫痫中的作用及研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是人类基因组中不能编码蛋白质,分子长度大于200nt的RNA,lncRNA是非编码RNA(nc RNA)中的一种,占nc RNA的80%,仅以分子的形式发挥作用,在过去的研究中lncRNA被认为是不重要的"噪音",但是近年来对lncRNA的功能研究显示其同样具有重要作用,lncRNA能在转录、转录后和表观遗传学上进行调控,参与个体发育中重要的生理和病理生命发育过程,lncRNA异常的表达对人类多种疾病的发生有密切的关系,本综述就癫痫发生发展密切相关的lncRNA进行阐述。     

miRNA与lncRNA的相互调控作用在肿瘤中的研究进展

miRNA是一类具有介导基因转录后表达调控功能的非编码小分子RNA,lncRNA是碱基数大于200个核苷酸的非翻译转录本,通过基因印迹、染色质重塑、细胞周期调控等多种机制发挥其生物学功能。miRNA与lncRNA之间存在着相互调控关系,对肿瘤的发生发展以及治疗具有重要作用。     

长链非编码RNA及其在免疫系统中的研究

长链非编码RNA(lncRNA)一直被认为是“暗物质”而未受到人们的重视,直至2007年,斯坦福大学的研究者报道了同源异型基因转录反义RNA (HOTAIR)作为一种lncRNA可与蛋白复合体polycomb相互作用,并抑制同源异型基因(HOX)的转录,参与生物体生长发育的调节过程.自此之后,lncRNA受到了广泛的关注.lncRNA可以在表观遗传学水平、转录水平、转录后水平调节包括基因印迹、细胞定向分化、细胞增殖、细胞周期、肿瘤、神经退行性疾病、免疫细胞的发育与分化以及机体免疫反应的调节等多种病理生理过程.因而研究lncRNA的定义、分类及其发挥功能的机制具有重要意义.     

长链非编码RNA LOXL1-AS1在人类恶性肿瘤中的作用及其分子调控机制

长链非编码RNA(lncRNA)广泛参与生物体的各种生理与病理过程。lncRNA作为肿瘤致癌因子或抑癌因子参与恶性肿瘤的多种生物过程，与恶性肿瘤的发生、发展密切相关。赖氨酰氧化酶样蛋白1-反义RNA1(LOXL1-AS1)是近年来发现的一种lncRNA,其在多种恶性肿瘤中表达上调，并与肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移、患者预后等病理特征相关。LOXL1-AS1通过与多种微小RNA竞争性结合，调节下游靶基因的表达及调控相关信号通路发挥促癌作用。该文通过总结LOXL1-AS1参与多种人类恶性肿瘤的生物学过程，不同的分子调控机制影响肿瘤细胞增殖、转移、侵袭和凋亡等恶性生物学行为，探讨潜在的临床意义和应用前景，以期为恶性肿瘤的临床诊断、治疗和筛选预后标志物提供理论基础和参考依据。