紫外线照射对DNA修复基因RAD24转录的影响

目的：紫外损伤对ＤＮＡ修复基因ＲＡＤ２４转录的影响。方法：以酿酒酵母ＨＹ６８４为实验对象，用波长２５４ｎｍ紫外线分别在０、３７、５０和７０Ｊ／ｍ２等强度下照射不同时间，提取总ＲＮＡ，应用Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交方法检测ＲＡＤ２４基因转录水平的变化。结果：３７Ｊ／ｍ２及５０Ｊ／ｍ２分别照射２０～１２０ｍｉｎ明显提高ＲＡＤ２４基因转录水平。结论：低剂量紫外线照射可提高ＲＡＤ２４基因转录水平，该基因的表达具有损伤诱导性。     

紫外线照射对DNA修复基因RAD24转录的影响

目的：紫外损伤对ＤＮＡ修复基因ＲＡＤ２４转录的影响，方法：以酿酒酵母ＨＹ６８４为实验对象，用波长２５４ｎｍ紫外线分别在０，３７，５０和７０Ｊ／ｍ＾２等强度下照射下不同时间，提取总ＲＮＡ，应用Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交方法检测ＲＡＤ２４基因转录水平的变化，结果：３７Ｊ／ｍ＾２及５０Ｊ／ｍ＾２分别照射２０～１２０ｍｉｎ明显提高ＲＡＤ２４基因转录水平。结论；低剂量紫外线照射可提高ＲＡＤ２４基因转录水平，该基因     

急性白血病RAD50基因多态性研究

目的研究温州地区急性白血病与RAD50基因多态性的关系。方法选取2018年6月～2019年6月来我院血液科就诊治疗的温州地区急性白血病100例患者为研究对象,并将其纳入急性白血病组(n=100)。100名体检正常者为对照组。采用PCR技术确定两组RAD50第4号内含子(rs17166050)基因分型(GA型、GG型),比较健康对照组与急性白血病组基因型频率。结果健康对照组与急性白血病组的RAD50(rs17166050)基因型GA型和GG型出现的频率比较差异有统计学意义(P0.05)。结论温州地区急性白血病与RAD50第4号内含子(rs17166050)的G等位基因的易感性相关。     

RAD18基因与肿瘤治疗的研究进展

人类对肿瘤发病机制的认识经历了一个漫长的进程,从过去单一的物理致癌、化学致癌、病毒致癌、突变致癌系统上升到多步骤、多因素综合致癌理论,其中癌基因、抑癌基因、DNA损伤修复基因的活性在此过程中起到了关键的作用。RAD18是一种DNA损伤激活的E3泛素连接酶,在肿瘤细胞的DNA损伤修复中起重要作用。RAD18在多种肿瘤细胞中表达水平升高明显,在放化疗产生抵抗的肿瘤细胞中表达进一步升高,提示RAD18与肿瘤的发生相关,并可作为克服耐药性的一个潜在靶点。     

RAD50基因与支气管哮喘的相关性研究

哮喘是一种常见的免疫性呼吸系统疾病,发病机理复杂,具有遗传易感性,研究基因与哮喘风险的关系一直备受青睐,RAD50作为新型基因,几年来发现与哮喘相关,可以通过引起Th2型细胞分泌的炎症因子等促使哮喘的发生,因此研究RAD50和哮喘的关系具有非常重要的意义,本文将对RAD50基因的分子结构、功能作用及其与支气管哮喘关系作如下综述。     

Klotho基因敲除小鼠听觉功能分析

目的探究Klotho基因对小鼠听觉功能的影响。方法 PCR鉴定WT和Klotho-/-CBA小鼠基因型,出生20天后记录个体形态学表型及体重指标,并进行ABR测试听觉功能。结果 klotho基因敲除小鼠基因组可检测到约900bp特征DNA片段,野生型小鼠特征条带为500bp,杂合子小鼠兼有两种特征片段;此外klotho基因敲除小鼠个体瘦小,且出生后25天时已出现ABR反射异常现象,表现为老年性聋。结论 Klotho蛋白与老年性聋存在一种潜在的制约性平衡关系,并在保护听觉功能方面扮演重要角色。     

人DNA修复基因HR24L/HRAD17校正酵母细胞减数分裂缺陷表型

啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)DNA修复基因RAD24在进化上具有高度保守性, 非洲粟酒酵母(Schizosaccaromyces pombe)的同源物则是RAD17.我们分离了啤酒酵母RAD24基因温度敏感突变株rad24L,进而用遗传互补法克隆出人类同源基因HR24L (北京医科大学学报,1999,31:269) .继我们报道之后,美国哈佛大学学者通过分析基因组信息,比较与非洲粟酒酵母RAD17同源片段,利用PCR方法扩增出人类RAD17同源cDNA,然后筛选文库获得人类RAD17(HRAD17)基因(Cancer Research, 1999,59:2023-2028),序列测定结果表明与我们克隆的HR24L是同一个基因.该基因编码的产物不仅参与DNA损伤切除修复和重组修复,而且还参与细胞周期检定点调控.鉴于细胞周期检定点调控是体细胞进行有丝分裂(mitosis)和生殖细胞进行减数分裂(meiosis)共有的周期性事件,因此,我们用遗传学方法分离酵母细胞减数分裂突变株,用功能互补法研究人HR24L基因的互补作用.     

前列腺癌染色体8q21-24区域基因异常表达及意义

目的:探讨前列腺癌染色体8q21-24区域异常表达基因与前列腺癌的关系。方法:表达谱芯片检测3对前列腺癌-癌旁组织差异表达的基因,实时荧光定量PCR(Q-PCR)检测及验证8q候选基因在3个前列腺癌细胞系(LNCap、PC3、Du145)及18个前列腺癌组织之中的表达及扩增情况。结果:基因芯片结果显示前列腺癌组织中PAG1、E2F5、CTHRC1、TMEM65、FAM49B、MYC表达上调,Q-PCR证实E2F5、MYC基因在前列腺癌组织中呈现高表达并且基因拷贝数增加。结论:E2F5和MYC基因可能参与了前列腺癌的发生和发展,有望成为前列腺癌的分子生物学诊断靶点。     

泛素结合酶基因生物信息学与功能分析

目的：生物信息学的发展为通过在线软件预测新基因的相关信息提供了众多有重要价值的参考信息。文中利用生物信息学方法预测泛素结合酶2S（ ubiquitin-conjugating enzyme 2S, UBE2S）生物学功能。方法以人肝癌HepG2细胞为材料,从构建的cDNA文库基因组中筛选和克隆了UBE2S基因。利用NCBI的BLAST在线分析工具分别对GenBank的非冗余核酸数据库和非冗余蛋白质数据库序列进行比对分析;采用NCBI ORF finder在线分析工具预测开放阅读框;利用ExPASy在线工具ProtParam统计基因中各种氨基酸含量,并预测理论分子量和等电点;应用ProtScale程序进行蛋白质的疏水性分析;蛋白质亚细胞定位采用在线工具（ nibb．ac．jp／form．html）预测,通过NCBI数据库GenBank分析蛋白质保守结构域;采用Protfun在线工具预测UBE2S的功能分类;采用同源模型服务软件SWISS-MODEL预测UBE2S的三维结构;采用MEGA5．05软件进行系统进化树的构建。结果 UBE2S基因编码241个氨基酸,预测相对分子质量为23770,理论等电点为8．81。跨膜结构域分析表明,UBE2S蛋白不含跨膜位点;亚细胞定位预测,UBE2S蛋白具有生长因子、离心通道、结构蛋白功能的概率为8．904、0．313和0．291。同源性比较分析结果表明,其碱基序列与已经报道的其他12个物种的相似率为90％～97％,且符合种属之间的进化关系。结论 UBE2S蛋白结构和功能的分析不仅丰富了其家族基因信息,还将为后续肝癌发生发展的分子机制实验研究奠定基础。     

肿瘤抑制基因Trim24

肝细胞癌（HCC）是一种比较常见的全球性癌症，可被许多不同的刺激因素诱导。Losson等在小鼠身上发现了一个肿瘤抑制基因Trim24，它可能通过调节视黄酸（RA）转录网络来特异性抑制HCC发生。     

RAD18基因在多种细胞及大鼠多种组织中的表达

ＲＡＤ１８基因是人类基因组计划研究的重要模式生物———啤酒酵母的复制后修复上位显性组的重要成员，其编码的产物ＲＡＤ１８蛋白与ＲＡＤ６蛋白在体内形成紧密的复合物。鉴于ＤＮＡ修复基因在进化上具有很强的保守性，为探讨ＲＡＤ１８基因在高等动物细胞中存在的意义...     

BRCA2基因与RAD51基因的常见多态位点与乳腺癌的关系研究

目的 研究BRCA2基因的N372H和RAD51基因的135G/C位点的多态性与乳腺癌的关系.方法 应用变性高效液相色谱和限制酶片段长度多态分析技术,在71例乳腺癌患者和85例正常女性中,对上述两个多态位点的基因频率和基因型频率进行调查和比较.结果 在乳腺癌患者中.BRCA2基因的N372H位点的基因型HH的频率显著高于正常对照组(9.9%vs 2.4%X2=4.010,p=0.045),但RAD51基因的135G/C位点的多态分布在两组人群中的差异无统计学意义.结论 BRCA2基因的N372H位点的基因型HH与乳腺癌相关,可能是中国人群乳腺癌的风险遗传因子.     

人iNOS基因启动子克隆鉴定及功能分析

目的 克隆鉴定人iNOS基因启动子序列,并进行功能分析.方法 利用生物信息学方法寻找iNOS潜在启动子区域,PCR克隆至报告载体pGL3-basic,双荧光素酶法检测启动子活性.结果 克隆得到人iNOS基因转录起始点上游1000bp区域,经检测具有启动子活性,可开启报告基因表达.结论克隆构建人iNOS基因启动子成功,可用于后继研究.     

蛋白激酶Cξ亚型基因内SNP功能分析

目的对中国北方汉族人群2型糖尿病易感基因蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)基因内的5个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphismSNP)标记在疾病发生中的作用进行分析。方法通过生物信息学比对及报告基因活性测定等方法分析PRKCZ基因内5个SNP位点对基因表达的影响。结果PRKCZ基因中rs427811和rs809912位点两种等位基因重组质粒报告基因活性存在明显差异,提示这两个位点可能影响PRKCZ基因表达。结论PRKCZ基因中两个SNP位点可能通过影响基因的表达水平而在中国人2型糖尿病发生中发挥作用。     

hsa-miR-126的靶基因预测及功能分析

目的 检测hsa-miR-126在各个组织器官中的表达情况,通过生物信息学预测hsa-miR-126的靶基因,进一步分析其可能功能,为研究hsa-miR-126的功能和机制奠定基础.方法 通过miRGator v3.0数据库查看hsa-miR-126在各个组织器官中的表达丰度情况;应用TargetScan、DIANA-microT-CDS及miRanda预测hsa-miR-126的靶基因;将预测所得靶基因和已证实的靶基因交集组成的基因集合分别进行功能富集分析（GO analysis）和信号转导通路富集分析,分析hsa-miR-126的可能功能.结果 hsa-miR-126在胃肠道,心脏,肾脏,肝胆系统,肺,干细胞,睾丸,胸腺,甲状腺,子宫中表达丰度较高;结合已被证实靶基因得到40个候选靶基因;靶基因主要参与细胞迁移调控以及腺体发育相关生物过程,涉及数个癌症通路和与癌症发生相关的信号通路,以及神经营养因子信号通路,ErbB信号通路,趋化因子信号通路和VEGF信号通路等.结论 hsa-miR-126预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肿瘤和血管性疾病密切相关,生物信息预测结果为今后的研究奠定了基础。     

蛋白激酶Cξ亚型基因为SNP功能分析

目的：对中国北方汉族人群2型糖尿病易感基因蛋白激酶Cξ亚型（PRKCZ）基因的5个单核苷酸多态性（single nucletide polymorhism,SNP)标记在疾病发生中的作用进行分析。方法：通过生物信息化比对及报告基因活测定等方法分析PRKCZ基因内5个SNP位点对基因表达的影响。结果：PRKCZ基因中rs427811和rs809912位点两种等基因重组质粒报告基因活性存在明显差异,提示这两个位点可能影响PRKCZ基因表达,结论：PRKCZ基因中两个SNP位点可能通过影响基因的表达水平而在中国人2型糖尿病发生中发挥作用。     

基于生物信息学筛选阿尔茨海默病核心基因及其功能分析

目的 筛选阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)核心基因并对其进行功能分析,为确定早期诊断标志物提供参考依据.方法 从公共数据平台NCBI-GEO DataSets中下载基因芯片数据集GSE5281,使用R/Bioconductor统计语言筛选出与AD相关的差异表达基因(DEGs);使用DAVID...     

DNA损伤修复基因RAD51基因单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌的相关性研究

目的：探讨DNA损伤修复基因RAD51基因多态性与食管鳞状细胞癌(以下简称鳞癌)遗传易感性、临床病理特征的关系,及其在食管癌预后中的临床价值。方法：采用病例对照研究设计,选择98例食管鳞癌患者为观察组和80例正常人为对照组。选取RAD51135 G/C基因多态性为研究位点,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法进行多态性检测,应用Logistic回归计算比值比(odds ratio,OR)及95%CI,比较不同基因型与食管鳞癌发病风险的关系、与食管鳞癌临床病理学特征的相关性、在食管鳞癌预后中的临床价值。结果：携带RAD51135 G/C多态患者中,基因型CC、GC 与野生基因型GG 相比,患食管鳞癌的危险度OR 和95%CI 分别是1.86(0.54～6.46)和0.93(0.50～1.72)。RAD51135基因纯合及杂合型基因型与淋巴结转移状态、远处转移及复发相关。结论：RAD51135基因单核苷酸多态与当地居民食管鳞癌遗传易感性无关;与食管鳞癌患者的淋巴结及远处转移可能相关;与食管鳞癌患者预后可能相关,对食管癌患者的预后可能有一定的临床价值。     

RAD18基因敲除增强肺腺癌细胞对顺铂的敏感性

目的:研究敲除E3泛素连接酶RAD18基因后,人肺腺癌A549细胞株和顺铂耐药A549(A549/DDP)细胞株FA/BRCA途径DNA修复功能的变化及其对顺铂敏感性的改变。方法:合成针对RAD18基因的siRNA(RAD18-siRNA),通过脂质体将其分别转染人A549和A549/DDP细胞株。蛋白质印迹法检测经顺铂处理的两种细胞株转染siRNA前后RAD18蛋白表达及FANCD2单泛素化水平;CCK-8法测定经顺铂处理的两种细胞株转染siRNA前后细胞增殖率的变化;免疫荧光测定胞核内FANCD2核聚小体的形成;Annexin V/PI流式细胞术测定转染前后细胞凋亡率。结果:与转染RAD18-siRNA前相比,转染后经顺铂处理的A549和A549/DDP细胞株RAD18表达均明显降低;FANCD2蛋白单泛素化水平下调和核聚小体形成减少;同时细胞增殖率明显降低,细胞凋亡率则明显增加。结论:应用RNA干扰技术敲除RAD18基因可通过抑制A549和A549/DDP细胞株FA/BRCA途径的DNA损伤修复功能,增加这两种细胞株对顺铂的敏感性。