SARS病情的动态变化

此前曾认为,导致此次SARS全球流行的元凶——SARS冠状病毒(SARS— CoV)是一种已知的人的冠状病毒的突变,从而获得了新的致病力;或是一种动物 冠状病毒的突变具有了感染人的能力;或是两种人类冠状病毒或人与动物冠状病 毒的重组。 然而,2003年5月15日新英格兰医学杂志(N ENGL J MED)于网上发表 了Katnryn V.Holmes撰写的题目为“SARS相关的冠状病”的研究文章,对SARS 患者血中病毒抗体进行了检测及研究。研究结果显示,这个抗体与已知的任何一种抗体均不同,提示SARS—CoV对人类是一个全新的病毒。 SARS—CoV的核苷酸序列已被科学家们测定出来,人们发现它的基因组成与已知的冠状病毒的序列完全不同。SARS—CoV的基因组序列不包括编码HE的基因,也没有从其他病毒或宿主细胞获得的大的基因片段。因此,人们推测SARS—CoV既不是已知病毒的突变,也不是已知病毒的基因重组。它是一个全新的冠状病毒,有可能寄生于其他动物,在某种条件下获得了感染人的能力。只有在SARS疫情最初暴发的区域检测野生及家养动物的血清才能鉴别它的最初宿主。比较来自SARS患者和自然宿主的病毒间的差异,有可能揭示病毒如何变迁转而感染人类。当病毒以人类为宿主后,是否还具有感染其初宿主的能力?若病毒丧失了这个能力,人类彻底清除这个病     

SARS冠状病毒的生物学性状及实验室检测方法研究进展

严重急性呼吸道综合征(Severe Acute Respritory Syndrome,SARS,即非典型肺炎 ) 在全球二十多个国家和地区爆发,是进入新世纪以来的一次危胁人类健康的重大灾害. 在各国医学专家的共同努力下,很快将引起SARS的病原体锁定为变异的冠状病毒--SARS冠状病毒 (SARS Coronavirus, SARS CoV )这是一种全新的病毒,充分认识其生物学特性对于我们防治和攻克SARS有十分重要的意义.本文介绍了最近国内外对SARS CoV生物学性状和实验室检测方面的研究现状及进展,希望为SARS的防治和研究提供参考.     

逆向进化：SARS CoV非自然起源之关键

我们已从临床、流行病学和分子进化之反常等几个方面阐明了（SARS CoV的非自然起源。本文将全面深入描述SARS CoV系统发育中发生的逆向进化这一关键过程。逆向进化定义为“再获得祖先状态”,常发生在生存景观或环境的,受化使生物不适应甚至无法生存时。SARS CoV的逆向进化主要表现：①2003～2004年广州爆发SARS CoV与2002～2003年流行早期病毒之亲缘较晚期更近以及流行中SARS CoV阳性选择压逐渐下降;②在不同宿主不同流行阶段,均可发现SARS CoV受体结合位点重要氨基酸（尤其487、479二位）和SARS CoV ORF8特征性29-nt的逆向进化;③2003～2004年广州爆发病例的SARS CoV中ORF 1a基因nt.6295突变,导致SUD出现一个终止密码子,使其基因发生回复变化,不能适应人类宿主。由于SARS CoV：①离祖先病毒株仅约4年多时问,敞无法在人类亲缘关系很近的动物体内做适应试验;②迅即进入人类全新之环境,易保持祖先的永久遗传变异;③流行中阳性选择压不断降低,为逆向进化创造条件。故进人人群一年后毒力和传播力明显下降,不久即在人类和自然界消失,这是其最佳归宿。所以,其起源、进化和消失过程假设如下：蝠株（亲代3）→基因改造株1（亲代2）→基因改造株2（亲代1）→2002～2003年狸株→2002～2003年人株→2003～2004年狸株→2003～2004年人株→？→？→消失。因事关人类健康,再次吁请卫生部正式向WHO申请组织专家委员会,实证自然界和人群中已尤SARS CoV,并予宣布。     

新型冠状病毒肺炎的研究进展

自2019年12月起,中国湖北省暴发了一系列原因不明的肺炎病例,科学家分离出一种新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS CoV 2）,这种病毒感染已经在中国和全球多个国家流行,引起了全球关注。这是继严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS CoV）后发现的第三种冠状病毒,目前诸多学者对其进行大量的研究,本文对SARS CoV 2的病原学、流行病学特点、临床表现、影像学检查、实验室检查、诊断及治疗等进行综述。     

SARS冠状病毒RNA聚合酶编码区分析

SARS冠状病毒(SARS coronavirus ,SARS CoV)和同家族的其他冠状病毒一样,是一类单链的正义RNA病毒 ( single-stranded, (+)sense RNA virus).与其他种类的病毒(如负义RNA 病毒)相比,这类病毒有两个最重要的特征:(1)在其成熟的病毒颗粒中并没有RNA聚合酶(viral RNA polymerase)存在,即病毒复制、转录所需的病毒特有的RNA聚合酶,是在侵入宿主细胞之后才合成的. 而且,只是在病毒的扩增阶段,保留在宿主细胞内行使功能,并不参与病毒颗粒的组装.     

SARS冠状病毒推定结构蛋白序列分析

2003年4月16日WHO正式宣布,蔓延全球的严重急性呼吸综合征 (Severe Acute Respiratory Syndrome ,SARS)的病原体是一类新的未知冠状病毒.并命名为SARS冠状病毒(SARS coronav irus, SARS CoV).     

现在自然界和人群中已不存在非典病毒

非典(SARS)流行至今已近10年,虽被进行了全面广泛深入的研究,但其起源和贮存宿主仍不明确。我们发现SARS的流行自然史和迄今世界上的传染病均不相符,其原因是非典病毒(SARS CoV)经"非寻常进化"方式,很可能是"非自然"方式进入人群。对几乎所有的SARS CoV基因变异、进化、跨种传播等既往研究,我们进行重新审视并综合分析,发现以往研究多从微观和一个侧面思考问题,而本文则从全新之视角,结合流行病学和生物进化理论,首次阐明:SARS CoV经历了逆向进化;自然界根本不存在SARS CoV的直接祖先和贮存宿主,故其流行后即从人群和动物界消失。因此建议卫生部正式向WHO等有关国际机构申请组织专家委员会,实证自然界和人群中已无SARS CoV,并予宣布。     

严重急性呼吸综合征相关冠状病毒的发现及其研究进程

严重急性呼吸综合征(SARS)暴发流行，引发了一场全球性通力合作、激烈竞争的攻关研究。2003年3月，中国香港及美国、加拿大和德国的科学家相继从SARS患者标本中发现并分离到一种SARS相关冠状病毒(SARS—CoV)，并得到世界卫生组织(WHO)的确认。之后，2003年4、5月间，美国、德国、中国香港、加拿大、荷兰的学者分别将他们对SARS病原体的研究成果发表于Sciece、NEJM、Luncet、Nature等国际权威学术期刊上，先后报告了SARS—CoV全基因组结构、基因组序列分析、SARS—CoV分子模型构建等，为进一步建立SARS诊断、治疗及疫苗研究等奠定了基础。分析这一迅速取得大量成果的研究进程，认真反思、深刻总结，将会使我们有很多收益。     

Bat SARS coronavirus HKU3-1病毒株基因组及蛋白质的生物信息学分析

目的比较中国菊头蝠SARS冠状病毒(Bat SARS coronavirus)与人类及果子狸体内分离出来的SARS-Cov,分析它们是否存在一定的相似性。方法本文分析了Bat SARS coronavirus与已知冠状病毒Human SARS-CoV和civet SARS-CoV的系统进化关系,绘制了Bat SARS coronavirusHKU3-1的全基因序列图,同时预测了S蛋白和N蛋白的三维模型。结果对Bat SARS coronavirus HKU3-1的序列分析表明中国菊头蝠SARS-CoV与人和果子狸SARS-CoV非常相近。系统进化分析法显示Bat-SARS-CoV与SARS-CoV形成一个不同的群,称为group 2b CoV,与已知的group 2 CoV存在一定的距离。结论Bat SARS coronavirus HKU3-1不太可能是从人SARS-CoV传播过来的。另外,Bat SARS coronavirus与civet SARS-CoV可能具有共同的祖先,使得中国菊头蝠SARS病毒株同样具有感染人体的危险。     

SARS相关病毒基因组序列的研究

严重急性呼吸道综合征(severe acute respiratory syndrome，SARS)是由SARS相关病毒(SARS—CoV)引起的一种新的烈性呼吸道传染病。SARS—CoV是一种新的冠状病毒，基因组结构符合典型的冠状病毒特征，编码基因从5′端起分别为：RNA依赖的RNA聚合酶、突起蛋白、包膜蛋白、膜蛋白，3′端为核衣壳蛋白。对14株SARS—CoV的4个变异点分析，可将14株病毒分成两个基因型，即第9404、19084、22222、27827位的T：T：T：T／C：G：C：C两型。对SARS—CoV的基因组的全面了解不仅为疾病的发病机理研究提供主要线索，而且将为SARS的诊断、预防和治疗提供帮助。     

SARS的实验室诊断研究现状

研究表明SARS病毒是变异的冠状病毒(SARS CoV) ,其毒力远远强于其他已知的家族成员,病毒学诊断对SARS的确诊具有决定性意义[1] 。SARS CoV基因测序的完成为该病毒的扩增引物的设计提供了条件,也对SARS的诊断及药物研究具有重要意义。来源于患者的标本具有足够的基因信息,对它进行病毒纯培养,可获得大量SARS冠状病毒,用于PCR研究,产生丰富的病毒基因资料[2 ] 。SARS的实验室诊断主要有病毒的分离培养、抗体检测、PCR和基因芯片检测等方法[2 ,3] 。目前实验室诊断方法尚不完善,临床实用仍有距离,本文仅对SARS诊断比较成熟的…     

SARS冠状病毒可能编码蛋白质的三级结构预测

在本研究组稍早的工作中[1],我们已经基于基因组序列和蛋白质初步分析,完成了SARS冠状病毒(SARS Coronavirus, SARS CoV)所有推测蛋白质(putative protein)的二级结构分析 .     

人冠状病毒SARS-CoV、229E和OC43核衣壳(N)蛋白单克隆抗体的制备及3株人冠状病毒N蛋白的抗原相关性观察

目的 通过制备和鉴定人冠状病毒SARS．CoV、229E和OC43核衣壳（N）蛋白单克隆抗体〈mAb）,观察3株人冠状病毒的N蛋白抗原相关性。方法 分别用基因重组SARS．CoV、229E和OC43N蛋白免疫BALB／c小鼠,制备mAb,并采用ELISA间接法、免疫印迹和免疫荧光进行筛选和鉴定．同时用mAb分析3株人冠状病毒N蛋白之间的免疫交叉反应。结果 获得多株抗SARS．CoV、229E和OC43N蛋白mAb杂交瘤细胞株。ELISA间接法、免疫印迹和免疫荧光结果均显示,所有的mAb仅与各自病毒的N蛋白特异性反应。而在3株人冠状病毒N蛋白抗原之间不产生免疫交叉反应。结论 获得的特异性抗人冠状病毒N蛋白mAb为进一步研究3株人冠状病毒的抗原决定簇相关性奠定了基础。     

传染性非典型肺炎(SARS)诊疗方案

传染性非典型肺炎是由SARS冠状病毒(SARS—CoV)引起的一种具有明显传染性、可累及多个脏器系统的特殊肺炎，世界卫生组织(WHO)将其命名为严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome，SARS)。临床上以发热、乏力、头痛、肌肉关节酸痛等全身症状和干咳、胸闷、呼吸困难等呼吸道症状为主要表现，部分病例可     

冠状病毒Spike蛋白及其针对性治疗研究进展

冠状病毒（coronavirus,CoV）是可以感染人类及动物的正链RNA病毒,其包含的最大RNA基因组长度为32 kb,可分为4类：α、β、γ和δ。冠状病毒颗粒包含4个标准结构蛋白：包膜蛋白（E）、膜蛋白（M）、核衣壳蛋白（N）和刺突蛋白（S）。S蛋白既包含受体结合域（receptor?binding domain,RBD）,又包含融合相关结构域,使其成为CoV进入过程中的关键蛋白。本文主要阐述S蛋白的主要结构、结构域以及该蛋白在病毒入侵宿主细胞过程中的自身水解切割、构象变化等相关特点,并就该蛋白的相关中和抗体以及CoV尤其是新型冠状病毒（SARS?CoV?2）灭活疫苗、亚单位疫苗RNA疫苗等研究现状进行介绍。     

严重急性呼吸综合征病毒相关受体在不同器官组织微血管内皮细胞的表达

目的研究严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒（CoV）相关受体血管紧张素转换酶2（ACE2）和CD209L在人8种不同器官组织微血管内皮细胞上的表达,分析两种受体表达水平与SARS器官病变之间的相关性。方法应用反转录聚合酶链式反应（RT—PCR）、Western印迹、免疫细胞化学3种方法分析比较SARS—CoV相关受体,ACE2、CD209L在人8种不同器官组织微血管内皮细胞上的表达。结果人的各种器官组织的血管内皮细胞均表达SARS—CoV相关受体ACE2与CD209L,其中ACE2在肺微血管内皮细胞表达最高,在淋巴内皮细胞表达最低,而CD209L在淋巴内皮细胞表达相对较高。结论人的微血管内皮细胞是SARS-CoV作用的重要靶点,肺微血管内皮细胞和淋巴内皮细胞的损伤可能分别由两种不同的SARS—CoV受体介导。     

新型冠状病毒感染相关心脏损伤

新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS CoV 2）感染者通常以呼吸系统症状为典型表现。随着感染人数增加,研究发现合并心血管疾病的感染者预后较普通患者严重,部分患者出现病毒感染相关心脏损伤,可能与血管紧张素转换酶2（ACE2）介导SARS CoV 2感染有关。适当应用心肌保护药物可能有助于改善SARS CoV 2感染预后。     

新型冠状病毒肺炎并发的凝血障碍

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在短短的半年内肆虐全球,至今在全世界已有3568万人感染,126万人死亡。本病的病因为新型冠状病毒(SARS-CoV-2),病毒通过刺突糖蛋白(S蛋白)与宿主细胞血管紧张素转化酶2(ACE2)结合从而入侵细胞,其结合能力甚至超过SARS病毒。ACE2主要存在于呼吸道与胃肠道,也广泛分布于心脏、肾脏、睾丸、脑组织与脂肪组织等。     

中东呼吸综合征的研究现状

冠状病毒分布于全球,有多个亚型。以前出现的冠状病毒主要与轻微的上呼吸道感染有关,例如引起普通感冒的229E型和OC43型冠状病毒[1]。2002年秋季我国广东省发生的由新型冠状病毒引起的严重病毒性肺炎,即严重急性呼吸综合征( SARS),这种新型的冠状病毒被命名为SARS冠状病毒,其中间宿主为果子狸[2]。 SARS自中国迅速蔓延至全球30个国家。在1年时间里, SARS病例达8273例,其中774例死亡。 SARS疫情发生后10年,阿拉伯半岛出现由另一种新型冠状病毒引起的严重病毒性肺炎,即中东呼吸综合征( MERS)。2012年6月,沙特阿拉伯发现首个病例[3-4]。MERS病例大多数发生在阿拉伯半岛,即沙特阿拉伯、阿拉伯、阿联酋、卡塔尔、阿曼、约旦、科威特和黎巴嫩等国家。此外,与旅游相关MERS感染发生在欧洲(英国、意大利、希腊、荷兰、法国和德国),以及突尼斯、马来西亚、菲律宾、埃及等国,最近伊朗和美国也有相关报道。据世界卫生组织最新报道,截至2015年7月29日,实验室确诊病例为1382例,病死493例(病死率35.7%),中国发现1例输入性MERS病例[5]。单峰骆驼可能是 MERS冠状病毒( MERS-CoV)的宿主,而蝙蝠可能是 MERS-CoV 向人类传播的载体[6]。尽管SARS和MERS均由冠状病毒引起,但SARS以人与人之间高效传播与相对较低的病死率为特点,而MERS仅为有限的人传染人,但病死率较高[7]。     

SARS相关冠状病毒S2基因的克隆及其DNA疫苗的免疫效果

目的：构建抗原基因为SARS相关冠状病毒(severe acute resplratory syndrome coronavtrus，SARS—CoV)S2基因的DNA疫苗，将其接种小鼠后观察病毒特异性抗体产生情况。方法：将合成的S2基因片段克隆至真核表达载体，随之将质粒进行小鼠肌内接种免疫，定期检测血清中抗SARS—CoV的病毒特异性抗体水平。结果：疫苗接种后第2周就能检测出病毒特异性抗体，随着时间的延续，抗体水平逐步升高，而空质粒对照组未检测出明显的特异性抗体。结论：以S2为抗原基因的DNA疫苗能诱导SARS病毒特异性抗体。