基于网络药理学分析生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的:通过网络药理学研究方法探讨生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:通过中药药理数据库和分析平台(TCMSP)检索药物的活性成分和靶点;在GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变相关靶点;利用Venny工具找出疾病与药物的交集靶点;通过Sting数据库对交集靶点进行分析;结果导入Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑异构分析;筛选出核心靶点并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图。将交集靶点录入Metascape进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,得到潜在作用通路。结果:(1)药物活性成分及靶点:通过TCMSP数据库筛选出生蒲黄-墨旱莲活性成分17个、作用靶点222个。(2)疾病靶点:经GeneCards、DrugBank、OMIM数据库筛选去重后获得相关的疾病靶点4 005个,将药物靶点与疾病靶点交集后共获得108个共有靶点。(3)核心靶点:通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/T...     

基于网络药理学和分子对接探讨黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接探讨黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,为创新药物开发和作用机制研究提供依据。方法 利用成分靶点数据库（SwissTargetPrediction）和靶点数据库平台（Targetnet）筛选出黄芪甲苷的潜在靶点,在人类基因数据库（GeneCards）、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）和药物靶标数据库（TTD）中检索糖尿病视网膜病变的相关靶点。将黄芪甲苷潜在靶点和糖尿病视网膜病变相关靶点进行重合,交集靶点即为黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变可能的作用靶点。随后进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络建立、基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。在此基础上,运用实验研究对发现的结合力最强的关键靶点信号传导通路进行了验证。结果 黄芪甲苷的作用靶点和糖尿病视网膜病变的交集靶点共56个,经过PPI网络分析获得排名前5位的关键靶点为蛋白激酶B1（Akt1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、表皮生长因子受体（EGFR）、非受体酪氨酸蛋白激酶（Src）、信号转导和转录激活因子3（STAT3）。分子对接分析验证显示,黄芪甲苷与上述5个关键靶标受体的亲和力较强。实验研究表明,黄芪甲苷通过Akt/Nrf2/HO-1和Akt/糖原合成酶激酶-3β（GSK-3β）信号通路的调控,抑制了高糖引起的视网膜色素上皮细胞的损伤。结论 黄芪甲苷的潜在靶点与糖尿病视网膜病变的相关靶点高度相关,表明黄芪甲苷具有多靶点、多途径治疗糖尿病视网膜病变的潜在作用。     

基于网络药理学探讨艾柱燃烧产物保护视网膜损伤的机制

目的 基于网络药理学探讨艾柱燃烧产物保护视网膜损伤的机制.方法 从前期研究中得到艾柱燃烧产物的化学成分,并借助PubChem数据库进行作用靶点的检索和筛选,从而建立艾柱燃烧产物-活性成分-靶点网络.通过OMIM数据库检索和筛选后获得视网膜损伤相关靶点,Cytoscape 3.8.0软件构建艾柱燃烧产物活性成分与视网膜损...     

基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的：基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的干预机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索枸杞子、菊花的活性成分及相关靶点。利用Cytoscape 3.9.1绘制“药对-活性成分-作用靶点”网络图，并进行拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的主要活性成分。利用GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库及药物靶标数据库检索DR相关靶点。将活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny 2.1在线平台，绘制韦恩图，交集靶点即为枸杞子-菊花药对治疗DR的潜在靶点。将潜在靶点上传至STRING数据库构建PPI网络关系，导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化，PPI网络拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的核心靶点。将核心靶点输入Metascape在线平台进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析及京都基因与基因组百...     

抗白内障天然药物的研究:密蒙花体外对醛糖还原酶活性的影响

醛糖还原酶在糖尿病并发症(白内障、角膜病和视网膜病)的病因学中发挥重要作用。抑制该酶可有效地缓解实验动物的糖尿病并发症。本文研究了密蒙花、菊花、菟丝子、千里光、谷精草、楮实子、青葙子、决明子和木贼9种生药对未纯化大鼠晶状体醛糖还原酶的抑制作用。结果见附表。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨黄连-葛根药对“异病同治”糖尿病视网膜病变和糖尿病肾病作用机制

目的运用网络药理学方法探究黄连-葛根药对治疗糖尿病视网膜病变(DR)和DN的作用机制。方法应用TCMSP、UniProt数据库检索黄连-葛根活性成分及对应靶点, 应用GeneCards、OMIM数据库检索DR和DN靶点基因, 运用在线工具Venny获得交集靶点, 利用Cytoscape 3.8.2软件构建"成分-靶点"网络, 采用STRING数据库构建PPI网络, 并通过DAVID数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析, 并进行分子对接验证。结果获得黄连-葛根药对活性成分18个, 疾病-药物交集靶点74个。GO功能富集分析发现, 交集靶点主要富集于炎症反应及凋亡等生物过程, 涉及到细胞外间隙、质膜、细胞质等细胞组分, 且与蛋白质结合、ATP结合、酶结合等分子功能有关。KEGG通路富集分析发现, 交集靶点可能与TNF信号通路、Toll样受体信号通路、PI3K-Akt信号通路等机制相关。分子对接结果显示, 核心成分与核心靶点具有较好的结合能。结论黄连-葛根可能通过TNF、IL6、TP53等靶点, 调控TNF信号通路、Toll样受体信号通路和PI3K/Akt信号通路, 发挥抑制细胞凋亡、氧...     

中药及其活性成分治疗糖尿病视网膜病变研究进展

糖尿病视网膜病变是糖尿病常见的并发症,也是导致糖尿病患者失明的重要原因。中药治疗糖尿病视网膜病变疗效明确,具有多靶点、多层面的优势。本文主要介绍了中药及其活性成分在治疗糖尿病视网膜病变中的应用。     

麻黄-葛根药对治疗糖尿病周围神经病变的药理作用

目的:利用中药整合药理学平台及分子对接研究探讨麻黄-葛根药治疗糖尿病周围神经病变的分子机制.方法:首先在疾病靶点筛选数据库和中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索获取与糖尿病周围神经病变(DPN)相关的靶标基因及麻黄、葛根的活性成分;然后使用Excel查重获得药物与疾病的共同靶点,使用Cytoscape绘制蛋...     

基于网络药理学的复方丹参滴丸治疗糖尿病视网膜病变的作用机制研究

目的通过网络药理学方法预测复方丹参滴丸治疗糖尿病视网膜病变的多成分、多靶点、多途径的作用机制。方法基于中药系统药理(TCMSP)数据库,以口服利用度(OB),类药性(DL)筛选复方丹参滴丸中的活性成分。依据反向药效团匹配(PharmMapper)方法预测复方丹参滴丸活性成分靶点;通过GeneCards数据库中与糖尿病视网膜病变相关靶基因对比筛选,通过STRING数据库结合Cytoscape软件绘制蛋白相互作用(PPI)网络并进行网络拓扑学分析,然后借助生物信息学数据库(Metascape)及DAVID数据库对靶点进行GO生物学过程、分子功能、细胞组分分析和KEGG通路分析,Cytoscape3.7.2软件构建并分析复方丹参滴丸"活性成分-靶点-通路"网络。结果发现复方丹参滴丸共有50个活性成分和429个靶点,DR共有821个已知的治疗靶点,将药物靶点与疾病靶点映射后共获得98个共有靶点。PPI蛋白互作网络分析发现ALB、AKT1、MMP9、MAPK1等可能是复方丹参滴丸治疗DR的核心靶点。GO富集分析确定了60个条目,KEGG通路富集分析确定了108条相关信号通路,主要有PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、Rap1信号通路、MAPK信号通路、FoxO信号通路、VEGF信号通路以及HIF-1信号通路等。结论复方丹参滴丸对治疗DR具有多途径、多靶点作用的特点。其可能是通过影响细胞代谢、抗炎、免疫调节、促进血管新生、改善无氧代谢等途径发挥治疗作用,为进一步阐释复方丹参滴丸治疗DR的药理机制提供了理论依据。     

中药治疗糖尿病性视网膜病变36例

目的：探讨糖网明目汤治疗糖尿病性视网膜病变的疗效。方法：应用自拟糖网明 目汤（生黄芪、玄参、丹参、草决明、青葙子、当归等）治疗本病３６例,结果：总有 效率为９７．２％。提示：本方法对本病有益气养阴,滋补肝肾,活血明目的功效。     

血管内皮生长因子基因多态性与2型糖尿病视网膜病变相关性的Meta分析

目的利用Meta分析探讨血管内皮生长因子1(Vascular endothelial growth factor,VEGF)基因多态性与2型糖尿病视网膜病变的相关性。方法电子检索CNKI、万方及Pub Med数据库,收集有关VEGF936C/T及VEGF 460C/T基因多态性与2型糖尿病视网膜病变的病例对照研究。检索时间为建库至2013年9月。采用Rev Man5.0软件进行Meta分析。结果共纳入9个研究,其中5个研究的是VEGF 936C/T多态性与2型糖尿病视网膜病变的关系,4个研究的是VEGF 460C/T与2型糖尿病视网膜病变的关系。Meta分析结果显示:具有VEGF 460TT基因型[OR=0.31,95%CI(0.19,0.50),P<0.01],CT基因型[OR=0.67,95%CI(0.46,0.98),P=0.04]及TT+CT基因型[OR=0.43,95%CI(0.27,0.69),P=0.0005]的人群发生2型糖尿病视网膜病变的风险明显低于具有基因型CC的人群,另外VEGF 460T等位基因携带者2型糖尿病视网膜病变发病风险低于等位基因C携带者[OR=0.67,95%CI(0.55,0.81),P<0.01]。而VEGF 936C/T多态性在病例组和对照组分析差异无统计学意义(P>0.05)。结论 VEGF 460C/T基因多态性与2型糖尿病视网膜病变发病相关,VEGF 460C/T基因可能是2型糖尿病视网膜病变的遗传保护因素。     

基于网络药理学探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法:根据中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选桃红四物汤药物活性成分和靶点。根据Gene Cards、OMIM数据库筛选糖尿病周围神经病变(DPN)靶点基因,构建韦恩图,得到桃红四物汤治疗DPN的作用靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-疾病网络。应用R软件进行基因本体(GO)功能注释和东京基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出桃红四物汤43种有效成分,212个作用靶点,4662个DPN相关靶点,桃红四物汤干预DPN主要涉及150个靶点基因。富集出生物过程155条、信号通路166条。结论:桃红四物汤可能通过调节AKT1、JUN、MAPK1等靶点,调控AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路等多种途径治疗DPN。     

基于网络药理学的丹参治疗视网膜静脉阻塞作用机制研究

目的:探讨丹参治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索丹参的有效化学成分,并收集其对应的作用靶点;使用GeneCards数据库检索与RVO相关的靶点;采用ClusterProfiler R软件绘制交集靶点的韦恩图;采用STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-活性成分-疾病-靶蛋白"相互作用网络;采用ClusterProfiler R软件对靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:得到丹参有效成分41个、药物靶点70个、RVO靶点1705个,最终获得丹参治疗RVO的潜在作用靶点46个,KEGG通路76条。结论:丹参可能通过调控炎症反应、血管生成、凝血过程和细胞凋亡等对RVO发挥治疗作用。     

桃仁-红花药对治疗糖尿病周围神经病变的机制

目的：探索桃仁-红花药对治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法：对桃仁、红花两味中药主要化学成分和作用的靶点进行检索,通过GeneCards、DrugBank、TTD3个数据库找出糖尿病周围神经病变相关靶点。取药物与疾病的交集靶点绘制韦恩图。利用Cytoscape构建药物成分-靶点-疾病网络,在STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并筛选出核心靶点,运用微生信绘图网站进行基因本体论（GO）富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：得到桃仁-红花药对治疗糖尿病周围神经病变的有效化合物成分36个,靶点214个,交集靶点156个。GO分析结果：生物学功能82条,生物学过程5 410条,细胞学组分515条。KEGG结果显示：共有264条信号通路发挥对糖尿病周围神经病变的治疗作用。结论：本研究探讨桃仁-红花药对治疗糖尿病周围神经病变的作用机制,为后续研究提供新的理论依据。     

基于网络药理学探讨败酱草治疗大肠癌的作用机制

目的:基于网络药理学的方法分析败酱草治疗大肠癌的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台检索败酱草的有效活性成分及作用靶点,通过人类疾病数据库OMIM、TTD及DrugBank检索大肠癌疾病的作用靶点,两者取交集,将筛选后的靶点导入Cytoscape 3.8.0软件,构建药物-成分-作用靶点网络.将药物疾病共...     

基于网络药理学探讨桂枝茯苓丸治疗糖尿病肾病的作用机制

目的：通过网络药理学的方法探讨桂枝茯苓丸治疗糖尿病肾病（Diabetic Nephropathy,DN）的信号通路及其可能的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）检索桂枝茯苓丸中桂枝、茯苓、牡丹、赤芍、桃仁5味中药的有效活性成分,并用Perl软件得出药物作用靶基因,应用Uniprot数据库将药物靶点规范为相应的基因名称;在Genecards数据库、人类孟德尔遗传数据库中输入“diabetic nephropathy”,获取DN的疾病靶点基因。通过R软件获取药物-疾病的交集作用靶点,采用Cytoscape 3.2.1软件绘制成分-靶点-疾病可视化网络图,利用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件得到靶点蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-protein Interaction,PPI）网络图,并进一步对关键靶点进行基因本体论（Gene Ontology,GO）功能富集分析、京都基因与...     

基于文献与网络药理学分析黄芪-地黄在气阴两虚糖证尿病中的作用机制

目的：通过数据挖掘和网络药理学的方法探讨治疗2型糖尿病气阴两虚证型的方剂，并筛选出关键药物，运用网络药理学的方法分析其作用机制。方法：使用专业检索式在知网和万方数据库中检索符合条件的治疗2型糖尿病气阴两虚证型的文献并提取方剂，使用中医传承计算平台（TCMSP）对方剂中的药物进行分析。筛选出关键药对黄芪-地黄后，通过TCMSP平台搜寻黄芪成分，文献收集地黄有效成分，并运用Pubchem数据获得地黄成分，SMILES导入到结构相似度预测靶点数据库Swiss Target Prediction预测靶点。并通过herb平台补充地黄有效靶点。运用Cytoscape 3.8.2软件进行网络拓扑学分析，构造“中药-成分-靶点”的网络图。运用GeneCards、OMIM平台获取疾病相关靶点，使用“VLOOKUP”函数匹配靶点基因名，筛选药物和疾病交集基因。应用Venny软件获取中药活性化合物作用靶点与糖尿病的交集靶点，通过String平台构建交集靶点之间蛋白互作关系。通过Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析。用AutoDock软件通过分子对接验证活性成分与核心靶点的结合能力。结果：...     

治疗3种糖尿病微血管并发症中药的用药规律比较

目的 比较治疗糖尿病肾病、糖尿病周围神经病变、糖尿病视网膜病变中药的用药规律。方法 基于数据挖掘，检索中国知网(CNKI)、万方(Wanfang)、维普(VIP)、中国生物医学文献数据库(CBM)相关文献，Microsoft Excel 2021软件进行用药频次、性味归经、功效分类分析，Cytoscape 3.7.2、IBM SPSS Modeler 18.0、SPSS Statistics 26.0软件分别进行核心处方、关联规则、聚类分析。结果 3种糖尿病微血管并发症使用频数排名前3位的中药分别为黄芪、茯苓、白术，黄芪、当归、鸡血藤，生地黄、丹参、黄芪，其中治疗糖尿病肾病的核心处方为参芪地黄汤加减方，配伍清热、活血化瘀、利水渗湿之品；治疗糖尿病周围神经病变的核心处方为黄芪桂枝五物汤、桃红四物汤等；治疗糖尿病视网膜病变的核心处方为二至丸、增液汤等。在二项关联中，治疗三者置信度最高的组合分别为茯苓→土茯苓、桂枝→通草、生地黄→天冬。在三项关联中，治疗三者置信度最高的组合分别为茯苓→土茯苓-大黄、茯苓→土茯苓-白术、白芍→生姜-当归、木贼→蝉蜕-赤芍。在聚类分析中，治疗三者的聚类功效组合分...     

穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的网络药理学作用机制

目的研究穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的网络药理学作用机制。方法利用PharmMapper、Genecards数据库预测和筛选出穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的潜在靶点,通过DAVID 6.8数据库对获得的靶点蛋白进行GO富集分析和KEGG通路注释,采用String 10.5数据库和Cytoscape 3.5.1软件绘制蛋白相互作用网络和"活性成分-靶点-信号通路"网络图。结果穿山龙27个活性成分可通过调控SRC、PIK3R1、STAT1、MAPK1、JAK2、IGF1、IL2等靶点,干预PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路、TLRS信号通路、JAK/STAT信号通路、PPAR信号通路等相关信号通路,从而参与炎症、免疫、氧化应激等过程来发挥治疗痛性糖尿病周围神经病变的作用。结论本研究结果初步预测了穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的主要活性成分、靶点和相关通路,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。