一种优化IPv6源路由拓扑探测的方法

IPv6网络普遍支持源路由的特性及源路由探测具有发现交叉链路的能力,因而成为近年来网络拓扑发现领域研究的焦点.但源路由探测冗余避免和种子节点选取这两个核心问题至今没有得到合理的解决.提出了一种优化IPv6源路由拓扑探测的方法,该方法利用分布式拓扑探测方式获取的基本拓扑信息为源路由种子节点的选取和探测冗余避免创造了有利的前提条件,从而显著提高了IPv6源路由拓扑探测的执行效率.通过对CERNET2网络的实际测试结果体现了该方法在提高覆盖率和探测冗余避免两个主要方面都具有优势.     

路由级Internet宏拓扑结构的谱密度分析

针对路由级Internet宏拓扑结构进行了谱密度分布分析与无符号拉普拉斯谱(SLS)分布分析.首先通过对拓扑结构各异的5种采样拓扑图,分别进行谱密度-特征值分布分析,发现5组分析结果表现出高度的一致性,证明了Internet拓扑结构的自相似性,也证明了采样拓扑可以再现局部Internet拓扑结构特征.然后通过采样拓扑图的谱密度-特征值分布函数与ER图、BA无尺度网络拓扑图进行比较,发现三者具有明显区别,得出谱密度-特征值分布函数可作为分辨图谱拓扑结构有效方法的结论.最后通过4组3000点采样拓扑进行SLS分布分析,发现尽管4组3000点采样路由与连接互不相同,但SLS谱分布却非常相似,4组采样拓扑在特征值λ=1处重数均较高,重数次高的特征值都群聚在λ=2处.在特征值从2～103变化过程中表现出较明显的幂律分布特性,其幂指数值保持在3.2813至3.8013之间,特征指数接近.该结论为Internet宏观拓扑结构建模研究提供了量化判据,是Internet拓扑建模研究的重要内容.     

基于多源网络断层扫描的拓扑推断技术研究

网络断层扫描(NT)技术可以在内部节点不配合的情况下推断网络逻辑拓扑.多源NT比单源NT可以获取更多的拓扑和链路性能信息.四种2-by-2结构的逻辑拓扑的推断是多源NT的核心问题.基于四种2-by-2结构特点的分析,将问题转换为判定两条路径是否有共享链路的问题,并提出一种新的三明治探测技术,以端到端延时或者丢包率是否变化作为依据,解决了四种2-by-2结构的拓扑推断问题.仿真结果表明,此技术具有很高的正确性和有效性.     

大规模IPv6网络拓扑发现探测目标点的构建和选取

探测目标点的数量及分布位置对网络拓扑发现的覆盖率和探测效率有直接的影响,因此成为网络拓扑发现研究领域一直关注的焦点.本文针对目前大规模网络拓扑发现目标点相关研究现状,提出了两种目标点集合构建方法,在对目标点冗余分析的基础上提出了相应的探测目标点选取方法.最后通过对CERNET-2骨干网络的实际测试,说明了本文提出的这些方法可以推广至国家级规模的IPv6网络拓扑发现应用中.     

基于信任度的网格虚拟组织访问控制模型

针对现有网格虚拟组织访问控制模型欠缺描述上下文约束的能力、资源端管理负担沉重以及未能刻画成员间的真实信任关系等不足,给出一种基于信任度的网格虚拟组织访问控制模型TwBAC(Trustworthiness-based Access Control model),该模型能够刻画带有上下文的访问控制策略;对资源实体进行抽象,减轻管理负担;应用信任度刻画虚拟组织成员之间的信任关系,并有效控制委托深度.此外,采用分布式管理模型AdTwBAC实现"虚拟组织成员域管理自治",并结合具体应用实例进行了说明.     

临床试验模拟中虚拟患者的概念和模型与案例

虚拟患者是临床试验模拟中通过建模与模拟产生的受试者,用于预测评估干预措施的安全性和有效性,从而提供临床试验不同阶段发展的趋向性并预测成功率,避免资源的浪费,同时模拟的结果也可作为证据支撑临床决策。历经20年的发展,虚拟患者的构建和应用不断完善,获得了国际社会广泛的关注与认可。本文通过整理现阶段虚拟患者研究的相关文献,在总结构建虚拟患者的模型及分类的基础上,以临床试验模拟中不同生理学层级上的虚拟患者为例,探讨其构建的目的、应用及局限性,旨在帮助研究者更好地了解该技术及其在药物研发领域的价值和意义。     

非协作方式下IPv6接入网络拓扑发现

本文致力于提高非协作方式下IPv6接入网络拓扑发现的覆盖率,首先建立了描述IPv6接入网络的前缀聚合树模型(PATM,Prefix Aggregation Tree Model),然后提出了基于PATM模型的网络拓扑发现方法.最后给出了对华东某高校IPv6校园网的拓扑发现测试结果.通过对测试数据进行的分析和对比,验证了基于PATM模型的拓扑发现方法的有效性.     

Discovery of Ligands for ADP-Ribosyltransferases via Docking-Based Virtual Screening

The diphtheria toxin-like ADP-ribosyltransferases (ARTDs) are an enzyme family that catalyzes the transfer of ADP-ribose units onto substrate proteins by using nicotinamide adenine dinucleotide (NAD(+)) as a cosubstrate. They have a documented role in chromatin remodelling and DNA repair, and inhibitors of ARTD1 and 2 (PARP1 and 2) are currently in clinical trials for the treatment of cancer. The detailed function of most other ARTDs is still unknown. By using virtual screening, we identified small ligands of ARTD7 (PARP15/BAL3) and ARTD8 (PARP14/BAL2). Thermal-shift assays confirmed that 16 compounds, belonging to eight structural classes, bound to ARTD7/ARTD8. Affinity measurements with isothermal titration calorimetry for two isomers of the most promising hit compound confirmed binding in the low micromolar range to ARTD8. Crystal structures showed anchoring of the hits in the nicotinamide pocket. These results form a starting point in the development of chemical tools for the study of the role and function of ARTD7 and ARTD8.     

Structure-Based Virtual Screening for Drug Discovery: a Problem-Centric Review

Structure-based virtual screening (SBVS) has been widely applied in early-stage drug discovery. From a problem-centric perspective, we reviewed the recent advances and applications in SBVS with a special focus on docking-based virtual screening. We emphasized the researchers' practical efforts in real projects by understanding the ligand-target binding interactions as a premise. We also highlighted the recent progress in developing target-biased scoring functions by optimizing current generic scoring functions toward certain target classes, as well as in developing novel ones by means of machine learning techniques.     

圆分布双跳无线传感器网络网络配置及拓扑发现修复算法与仿真

无线传感器网络在从战场到环境监测的许多领域都表现得越来越重要.本文首先给出了一类圆分布双跳无线传感器网络,并提出其安全性要求和模型.对于其面临的威胁,在权衡网络资源局限性的基础上,提出了相应解决方案,包括拓扑发现算法、网络配置协议和网络修复算法(TDNSR).仿真结果表明:和SPIN算法相比,TDNSR能迅速实现网络拓扑发现和配置并修复,能有效减少资源开销.     

公用IPv6网络承载服务SLA监测研究

分析了NGI中网络承载服务sIA(NSLA)的应用需求,针时NSLA可能的应用场合及IPv6特点定义了适用于NSLA的QoS参数:IP分组传送延迟(IPTD)、IP分组延迟变化(IPDV)、IP分组传送失败率(IPFR)和IP分组吞吐能力(IPTC),其中IPTC能有效刻画公用IP网段集维持业务流量模式的能力.分组识别和时钟同步是IPv6网络NSLA监测的两个关键问题.文中给出了分组识别的解决思路;为降低对同步的要求、支持较低成本的NSLA监测,除IFFD外其余参数均可容忍出入测量点之间存在有限的时钟不同步.此外,综合应用特点、用户感知、IPv6协议等因素,讨论了面向应用NSLA的QoS参数设定.最后设计了一个包括采集器、前端机、分析机、原始数据库和结果库等部件的NSLA监测系统,采用ON-OFF系统抽样方式被动监听自然流量,在各部件的协作下可实现各QoS参数的测量.