miRNA-155在癫痫病人中的表达及其机制研究

目的检测癫痫病人的脑组织标本中miR-155的表达水平,并分析miR-155与癫痫发病的关联。方法收集癫痫病人、脑出血微创手术病人的脑组织标本各55例,用qRT-PCR检测其中miR-155和GABRA1的表达水平,并分析miR-155与GABRA1表达的关联。制作大鼠癫痫电点燃模型,用qRT-PCR检测其中miR-155和GABRA1的表达水平,并分析miR-155与GABRA1表达的关联。用Targetscan分析GABRA1是否为miR-155的靶基因,并分别将GABRA1的3'-UTR和突变的3'-UTR构建到psicheck2S质粒载体上,将构建的质粒分别转染到HepG2细胞中,并加入miR-155 mimic,通过检测荧光素酶活性判断GABRA1是否与miR-155相互结合。结果癫痫病人脑组织中miR-155和GABRA1的表达显著上调(P < 0.01),而且miR-155的表达水平与GABRA1的表达水平呈正相关(P < 0.01);癫痫电点燃模型大鼠脑组织中miR-155和GABRA1的表达显著上调(P < 0.01),且miR-155的表达水平与GABRA1的表达水平呈正相关(P < 0.01)。转染了GABRA1的3'-UTR的HepG2细胞荧光素酶活性显著高于转染突变型3'-UTR的HepG2细胞(P < 0.01)。结论miRNA155在癫痫病人脑组织表达上调,可能通过调节GABRA1的表达而参与癫痫病理生理过程。     

miR-192负性调控人肝癌细胞株HepG2中RB1基因的表达

目的 探讨miR-192对人肝癌细胞株HepG2中RB1基因表达的调节作用.方法 运用生物信息学方法对miR-192进行靶基因预测并分析其潜在靶基因RB1;将含有miR-192结合位点的RB1 mRNA 3′端非编码区(3′UTR)片段和在miR-192结合位点进行突变的RB1 3′UTR突变片段克隆至报告基因载体pMIR-Report luciferase vector,重组质粒分别命名为pMIR-RB1和pMIR-RB1-mut;将重组质粒、Beta-gal内参质粒和microRNA共转染HepG2细胞,双荧光素酶报告基因系统检测各实验组中细胞荧光素酶的表达;SYBR Green荧光定量PCR和Western blot分别在mRNA和蛋白水平检测miR-192对内源性RB1表达的调节作用.结果 生物信息学分析筛选出89个miR-192的潜在靶基因,RB1基因是其中之一;测序验证重组质粒pMIR-RB1和pMIR-RB1-mut构建成功;过表达miR-192时,共转染pMIR-RB1质粒的细胞相对荧光素酶活性(4.80±0.36)较相应过表达miR-NC组(7.90±0.91)明显降低(P＜0.05),而共转染pMIR-Luc或pMIR-RB1-mut质粒的细胞相对荧光素酶活性[pMIR-Luc:(7.68±1.04);pMIR-RB1-mut:(7.56±0.99)]较相应过表达miR-NC组[pMIR-Luc:(7.86±0.73);pMIR-RB1-mut:(7.82±1.05)]无显著差异;上调miR-192水平显著降低HepG2细胞中内源性RB1 mRNA[(0.56±0.10)vs (1.05±0.13)]和蛋白(47% vs 100%)的表达.结论 RB1基因是miR-192的一个靶基因,在HepG2细胞中,miR-192通过直接结合RB1 mRNA 3′UTR而负性调控RB1基因表达.     

miR-34a靶向调控NOTCH1基因对SW480细胞增殖的影响

目的 探讨miR-34a靶向调控NOTCH1基因表达而对结肠癌SW480细胞增殖的影响.方法 通过生物信息学预测,NOTCH1为miR-34a特异性靶基因.构建含miR-34a结合位点的NOTCH1基因3 '-UTR域荧光素酶报告载体.通过荧光素酶报告载体系统检测miR-34a与NOTCH1的3’-UTR相互作用对荧光素酶活性的影响;免疫印迹技术检测miR-34a对NOTCH1蛋白表达的影响.采用MTT法及流式细胞检测转染miR-34a对SW480细胞增殖的影响.结果 经过酶切及基因测序鉴定,NOTCH1基因3'-UTR序列的双荧光素酶报告重组质粒构建成功;荧光素酶结果显示在SW480细胞中加入miR-34a的类似物和重组载体,荧光素酶的活性是只加入空载体的SW480组53.4％ (P=0.003 8);而在HEK293细胞中加入miR-34a的抑制物和重组载体,荧光素酶的活性是只加入空载体的HEK293组145％(P=0.002 1),说明miR-34a有与NOTCH1的3’-UTR位点相结合.免疫印迹结果显示在SW480细胞中加入miR-34a的类似物,NOTCH1蛋白的表达水平是未处理SW480组下降53.6％(P＜0.05);而在HEK293细胞中加入miR-34a的抑制物,NOTCH1蛋白的表达水平较未处理HEK293组升高78.9％ (P =0.03),说明miR-34a负性调控NOTCHl蛋白的表达.miR-34a过表达的SW480细胞较未处理的SW480的生长速度明显减慢(P＜0.05),且阻滞在G0～G1期,说明miR-34a过表达后能抑制SW480细胞增殖.结论 miR-34a负性靶向调控NOTCH1基因的表达而抑制SW480细胞的增殖.     

miR-27a-3p靶向调控Yes相关蛋白1促进人牙髓干细胞成骨分化

目的 探讨miR-27a-3p靶向调控Yes相关蛋白1(YAP1)基因对人牙髓干细胞(hDPSCs)成骨分化的影响.方法 体外分离培养hDPSCs细胞,将miR-27a-3p模拟物(miR-27a-3p mimics,过表达组)、miR-27a-3p抑制剂(miR-27a-3p inhibitor,敲低组)、miR-NC(对照组)分别转染至hDP-SCs细胞中,检测miR-27a-3p表达水平的改变对YAP1表达的影响.采用TargetScan数据库检索miR-27a-3p的靶基因.应用双荧光素酶报告基因实验验证miR-27a-3p和YAP1的靶向关系.将miR-27a-3p mimics、miR-NC转染到hDPSCs特定时间后收集细胞,应用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)、Western blot等检测经典的成骨标志物骨形态发生蛋白-2(BMP-2)、成骨转录因子-2(RUNX2)、骨桥蛋白(OPN)、YAP1 mRNA和蛋白表达水平.应用MTT比色法验证miR-27a-3p和YAP1对细胞增殖活性的影响.结果 过表达组hDPSCs细胞中miR-27a-3p的表达水平较对照组显著上调(P＜0.05),YAP1 mRNA和蛋白的表达水平下调(P＜0.05).而敲低组miR-27a-3p的表达水平较对照组明显下降(P＜0.05),YAP1 mRNA和蛋白的表达水平增高(P＜0.05).生物信息学分析表明,miR-27a-3p作用于YAP1的3'UTR区,双荧光素酶报告基因实验验证了YAP1是miR-27a-3p的靶基因.qRT-PCR、Western blot检测显示,与对照组相比,miR-27a-3p过表达时hDPSCs中BMP-2、RUNX2、OPN mRNA和蛋白的表达水平上调(P＜0.05).MTT检测显示,miR-27a-3p过表达可明显上调hDPSCs增殖率(P＜0.05),而YAP1过表达则会降低hDPSCs的增殖率(P＜0.05).结论 miR-27a-3p可能通过靶向调控YAP1促进hDPSCs成骨分化.     

食管鳞癌中转录因子IRF4对miR-133b表达的调控作用研究

目的 食管鳞癌中miR-133b通过调控EGFR/ITGB4/FAK信号通路,发挥抑制肿瘤增殖、侵袭、转移的作用。但目前对于miR-133b的上游调控机制尚不完全清楚,故展开探索。 方法 采用生信分析预测参与调控miR-133b表达的上游转录因子;采用qRT-PCR、Western blotting验证转染IRF4过表达质粒对IRF4和miR-133b在转录和蛋白水平表达的影响;采用染色质免疫共沉淀技术确认IRF4与miR-133b的相互作用;双荧光素酶报告基因实验验证IRF4对miR-133b表达的调控作用机制。 结果 使用ConTra V3预测发现转录因子IRF4能够与miR-133b结合;qRT-PCR、Western blotting实验证实转染IRF4过表达质粒可显著上调IRF4在mRNA(t=-18.950,P=0.010)和蛋白水平的表达(t=-4.061,P=0.042),并促进miR-133b的表达(t=-8.681,P=0.005);染色质免疫共沉淀实验(引物1:t=-17.391,P=0.003;引物2:t=-14.421,P=0.004)和双荧光素酶报告基因实验(t=-22.112,P=0.010)证实转录因子IRF4可直接靶向作用于miR-133b。 结论 验证IRF4对miR-133b的直接靶向调控作用,有助于构建miR-133b的信号调控网络,为食管鳞癌的诊疗提供新靶点。      

miR-27-3P家族负向调控SCC-3细胞中ACLY的表达

目的 探讨miR-27-3P家族(miR-27a-3P和miR-27b-3P)对舌鳞癌细胞(SCC-3)中ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)表达的影响.方法 生物学信息预测并用荧光素酶实验验证miR-27-3P和ACLY的靶向关系;miR-27a/b-3P模拟物或抑制剂转染SCC-3细胞,qRT-PCR和Western blot检测ACLY mRNA和蛋白表达水平;qRT-PCR检测口腔鳞状细胞癌(OSCC)样本中miR-27a/b-3P、ACLY表达水平;通过敲低ACLY、敲低miR-27a/b-3P以及共同敲低ACLY和miR-27a/b-3P,检测SCC-3细胞的增殖活力.结果 miR-27a/b-3P与ACLY 3'-UTR 697～703位点碱基互补配对;上调或下调SCC-3细胞中miR-27a/b-3P的表达,ACLY表达水平则降低或升高;大多数OSCC中,ACLY呈高表达,miR-27a/b-3P低表达;敲低ACLY细胞增殖活力降低,敲低miR-27a/b-3P则升高,同时敲低细胞增殖活力仍降低,但高于单独敲低ACLY.结论 miR-27a/b-3P在大多数OSCC中低表达,负向调控ACLY的表达,可能通过靶向ACLY抑制肿瘤生长.     

miR-107对HepG2细胞增殖和细胞周期的影响

目的探讨miR-107对HepG2细胞增殖和细胞周期的影响,以及对CDK6蛋白表达的调控。方法将50 nmol/L的miR-107 mimics 或阴性对照序列由 Lipofectamine 2000转染入人肝癌细胞株 HepG2中;qRT-PCR 法检测转染后HepG2细胞内miR-107表达水平;四甲基偶氮唑蓝( MTT)法检测细胞增殖能力;流式细胞术分析转染后细胞周期的变化;Western blot法检测CDK6蛋白表达水平。结果转染后24 h,miR-107 mimics转染组细胞内miR-107表达水平较空白对照组明显升高(P<0.05);与空白对照组相比,miR-107 mimics转染组HepG2细胞增殖受抑制( P<0.05),处于G0/G1期的细胞增多( P <0.05), CDK6蛋白表达下调( P <0.05)。结论 miR-107能够抑制 HepG2细胞增殖并诱导HepG2细胞G0/G1期阻滞,这可能与其抑制 CDK6蛋白的表达有关。     

MiR-7下调LXRβ表达而抑制HepG2细胞脂质生成的作用

目的 初步探讨miR-7对LXRβ的抑制作用及其在肝细胞脂质生成中的作用.方法 生物信息学分析,预测LXRβ mRNA的3'-UTR上miR-7的可能结合位点.在人肝细胞系HepG2中转染miR-7,以Real-time PCR、Western blot检测LXRβ mRNA水平和蛋白水平表达的变化;构建LXRβ 3'-UTR报告基因质粒pMIR/LXRβ,Report assay检测报告基因荧光素酶活性;Real-time PCR检测miR-7对LXRβ激动剂诱导的脂质生成相关靶基因FAS、ACC的表达变化.结果 在人肝细胞中,miR-7能够显著抑制LXRβ的表达(P＜0.05),且miR-7能降低LXRβ重组质粒pMIR/LXRβ的荧光素酶活性(P＜0.05).同时抑制其激动剂对脂质代谢相关靶基因的诱导作用.结论 miR-7可通过结合在LXRβ 3'-UTR区域而抑制其表达,进而抑制FAS、ACC的表达而抑制脂质生成.     

miR-1246在肝癌血清中的表达及对肝癌HepG2细胞生物学功能的影响

  目的  探讨miR-1246在肝癌患者血清中的表达及其对HepG2细胞生物学功能的影响。  方法  应用荧光定量PCR检测miR-1246在正常对照者和肝癌患者血清中的表达;将miR-1246 mimics和NC mimics分别转染至HepG2细胞,采用Transwell小室法、划痕实验和细胞克隆形成实验检测miR-1246对HepG2细胞生物学功能的影响,荧光定量PCR检测NFE2L3、Vimentin、GAS1基因的表达改变。  结果  miR-1246在正常对照者和肝癌患者血清中的表达量分别为1.079(0.740,1.534)、0.132(0.068,0.324),差异有统计学意义(P < 0.001);miR-1246 mimics转染HepG2细胞后,HepG2细胞穿过基质胶的细胞数为128.000±9.900, 较NC mimics组(251.500±24.749)明显减少(P=0.023),划痕48 h后HepG2细胞相对迁移率为(24.833±3.351)%,较NC mimics组(31.859±7.194)%明显减慢(P=0.046),Vimentin、GAS1、NFE2L3基因相对表达量分别为0.318±0.213、0.479±0.157、0.755±0.044,较NC mimics组(1.000±0.000)表达均明显下调(P=0.046、0.043、0.030)。  结论  肝癌患者血清中miR-1246表达下调;miR-1246可能通过下调Vimentin、GAS1、NFE2L3基因抑制HepG2细胞的侵袭、迁移能力。      

miR-106b及EZH2对HepG2细胞生长的影响及机制

目的探讨miR-106b及核心亚基基因增强子的人同源基因2(EZH2)对HepG2细胞生长的影响及其作用机制。方法 qRT-PCR法检测不同肝癌细胞miR-106b的表达;用miR-106b抑制物(inhibitor)及模拟物(mimic)和siEZH2转染肝癌细胞,CCK8法检测细胞增殖,细胞凋亡用Annexin V-FITC/PI双染法和WB法检测凋亡蛋白-3(Caspase-3),生物信息学分析并用荧光素酶法证实miR-106b是否靶向结合EZH2。结果与永生化的肝细胞LO2相比,miR-106b在肝癌细胞中表达量增加;miR-106b mimic促进HepG2细胞增殖和抑制凋亡;miR-106b inhibitor能导致Caspase-3全长表达量减少和其活性片段表达量增加;siEZH2抑制HepG2细胞增殖和促进其凋亡,并且能导致Caspase-3全长表达量减少及其活性片段表达量增加。荧光素酶结果表明miR-106b并非直接靶向抑制EZH2,miR-106b促进EZH2的表达。结论抑制miR-106b和EZH2的表达都能有效抑制HepG2细胞增殖和促进其凋亡。