基于网络药理学角度探讨当归四逆汤对子宫内膜异位症的干预机制

目的 基于网络药理学探讨当归四逆汤治疗子宫内膜异位症（EMS）的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选当归四逆汤有效活性成分及潜在靶点，在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找EMS相关靶点基因取当归四逆汤靶点基因与EMS相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“当归四逆汤活性成分-潜在靶点-EMS”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作（PPI）网络图。对潜在靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 数据库筛选的得到当归四逆汤有效活性成分151个，与EMS相关潜在作用靶基因71个，KEGG富集通路分析主要包括化学致癌受体激活，脂质和动脉粥样硬化通路等。结论 当归四逆汤具有多活性成分，能通过多靶点，多通路发挥EMS保护作用。     

土茯苓复方治疗口腔鳞状细胞癌的作用机制研究

目的 基于网络药理学研究土茯苓复方治疗口腔鳞状细胞癌（OSCC）的活性成分及其潜在靶点和可能的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台和通用蛋白质资源数据库检索并筛选得到土茯苓复方的主要活性成分及其作用靶标。通过癌症基因组图谱数据库获得OSCC表达谱和临床资料，分析OSCC与正常组织间的差异表达基因，并通过Gene-cards和OMIM数据库收集OSCC相关基因，对药物作用靶标和疾病相关基因取交集获得潜在治疗靶点。利用STRING数据库和Cytoscape3.9.1软件构建蛋白质互作网络图和“OSCC靶点-药物活性成分”网络模型。对潜在治疗靶点进行基因本体分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析，并评估关键作用靶点与OSCC患者预后的关系。最后用Autodock_vina和Pymol软件进行最关键作用靶点和有效成分的分子对接。结果共获得土茯苓复方治疗OSCC的潜在治疗靶点141个。土茯苓复方主要通过丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、丝苏氨酸特异性蛋白激酶（AKT）1、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）、血管内皮生长因子A基因（VEGFA）、IL-1β、表皮生长因子受体（EGFR）等多个靶标，涉及包括TNF、IL-17、缺氧诱导因子-1α（HIF-1α）、NF-κB在内的多条信号通路发挥治疗作用。大多数治疗靶标与OSCC患者预后显著相关，其中与总生存期显著相关的靶标有9个，与无进展生存期显著相关的靶标有7个。分子对接结果显示柚皮素与MAPK3，β-胡萝卜素、山奈酚与CASP3结合能力较强。结论土茯苓复方中包括柚皮素、β-胡萝卜素和山奈酚在内的8个主要活性成分，可通过MAPK3、AKT1和CASP3等多条信号通路作用于OSCC的141个靶点，有助于OSCC治疗药物的研发。     

基于网络药理学和分子对接研究金丹健肝胶囊治疗肝纤维化的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接技术阐明金丹健肝胶囊治疗肝纤维化可能的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台（http://tcmspw.com/tcmsp.php）和HERB数据库（http://herb.ac.cn）检索金丹健肝胶囊活性成分和靶点，通过DisGeNET、药物靶点数据库（Therapeutic Target Database, TTD）筛选肝纤维化疾病靶点；将金丹健肝胶囊活性成分的药物靶点与疾病靶点匹配，所得共同靶点导入STRING数据库平台构建蛋白质相互作用（protein protein interaction, PPI）网络；利用Cytoscape3.9.1软件CytoNCA工具进行拓扑分析，筛选关键靶点；应用Cytoscape3.9.1软件构建“中药-关键活性成分-关键靶点”网络图；通过DAVID平台（https://david.ncifcrf.gov）对关键靶点进行KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析；采用LeDock软件对活性成分与靶点进行分子对接验证。结果 筛选获得金丹健肝胶囊180个...     

独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎的网络药理学机制及实验验证

【目的】应用网络药理学及分子对接技术探讨独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制，并通过体外实验进行验证。【方法】检索TCMSP、中国药典、BATMAN-TCM数据库获取独活、牛膝的活性成分，筛选去重后应用TCMSP数据库确定作用靶点，运用GeneCards和OMIM数据库筛选KOA相关的靶点。采用Cytoscape构建药物活性成分-KOA-靶点网络模型并进行分析；运用STRING数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络，通过R 4.0.2软件对交集靶点进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集；运用AutoDockTools对前5位的核心靶点进行分子对接。进而通过体外细胞实验验证有效成分槲皮素对核心靶点的调控作用。【结果】通过筛选得到14个有效活性成分、171个活性成分靶点、2 040个KOA靶点和99个交集靶点。GO分析结果显示独活-牛膝药对治疗KOA关键靶点的生物功能主要涉及炎症反应、细胞代谢、调节蛋白激酶及磷酸酶活性等。KEGG通路主要富集到肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示独活...     

矮地茶治疗骨质疏松症的网络药理学分析及实验研究

目的 基于网络药理学及体外实验探究矮地茶治疗骨质疏松症（osteoporosis, OP）的作用机制。方法 使用TCMSP、GeneCards数据库筛选矮地茶治疗骨质疏松症的有效成分及关键靶点（疾病靶点与药物活性成分靶点的交集）;使用Cytoscape3.7.1软件构建“中药-活性成分-交集靶点-疾病”网络;使用STRING数据库构建关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）网络;通过DAVID数据库对关键靶点进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。体外实验使用矮地茶醇提物干预成骨诱导的ST-2细胞,通过碱性磷酸酶染色（alkaline phosphatase, ALP）、RT-qPCR、Western blot等检测其对成骨分化的影响并验证网络药理学信号通路预测结果。结果 共获得槲皮苷、山柰酚、射干醇A、丹皮酚、肉桂醛等193个矮地茶主要活性成分;预测出82个矮地茶与OP的关键靶点,这些关键靶点主要参与调控雌激素信号通路、凋亡、Wnt/β-catenin信号通路等。体外实验显示,矮地茶能有效提高ST-2细胞成骨转录因子表达（P&...     

基于网络药理学及实验验证探讨养阴活胃合剂治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制

目的 基于网络药理学预测养阴活胃合剂治疗慢性萎缩性胃炎（chronic atrophic gastritis, CAG）的活性成分及潜在靶点,通过动物实验进行验证PI3K-Akt、信号通路,为临床应用提供科学依据。方法 通过中医药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）、SymMap数据库筛选得到中药的有效活性成分,同时从GeneCard、OMIM和DisGeNET数据库对CAG的靶点进行检索及筛选;预测其活性成分与疾病靶点,使用Cytoscape 3.7.1软件构建网络图,对该网络进行拓扑分析筛选节点,利用STRING数据库分析核心靶点蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）网络,利用DAVID数据库对核心靶点基因进行GO和KEGG富集分析,探讨养阴活胃合剂治疗CAG的作用机制。实验验证：选用SPF级SD雄性大鼠,采用随机分配法分为空白组及造模组,利用N-甲基-N′-硝基-N-亚硝基胍（N-methyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidine, MNNG）及饥饱失常法等方法进行造模,造模成功后随机分为模型组、维酶素组以...     

GC-MS、UPLC-Q-TOF-MS/MS结合网络药理学探讨地锦草药效物质基础及其抗炎作用机制

目的 采用色谱联用技术分析地锦草主要成分,并联合网络药理学预测其抗炎作用的潜在靶点和信号通路,阐明地锦草治疗炎症的作用机制。方法 通过GC-MS、UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析地锦草的化学成分,借助中药系统药理数据库和分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology, TCMSP）、地锦草相关文献筛选地锦草活性成分;采用SwissTargetPrediction数据库预测靶点,采用GeneCards、DrugBank、DisGeNET数据库获取地锦草相关治疗靶点,将成分靶点和疾病靶点取交集,获得交集靶点;凭借STRING 11.5数据库和Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）网络,并筛选核心靶点。采用DAVID 6.8进行GO注释和KEGG通路富集分析,构建“化合物-靶点-通路”网络。结果 GC-MS、UPLC-QTOF-MS/MS分别鉴定出50、76种成分,筛选出地锦草抗炎的12个活性成分及214个成分靶点;根据数据库筛选得到...     

基于网络药理学探讨黄芩治疗痤疮的作用机制

目的 采用网络药理学方法研究黄芩治疗痤疮的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索黄芩的活性成分和靶标,采用GeneCards和在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库筛选痤疮的潜在靶点;通过Cytoscape3.7.1软件绘制黄芩治疗痤疮的“成分-靶点-通路-疾病”网络图,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并对关键靶点进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 从黄芩中筛选出与痤疮有关的活性成分29个,通过干预36个靶点、247条通路治疗痤疮;富集分析显著的生物功能主要为核受体活性、转录因子活性,直接配体调节的序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、四吡咯结合等。KEGG信号通路结果显示,黄芩治疗痤疮的关键基因显著富集在白细胞介素-7(IL-7)信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、松弛素信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。结论 黄芩主要通过多成分、多靶点、多通路的作用治疗痤疮,而非通过单一机制...     

基于网络药理学探讨积雪草治疗病理性瘢痕的靶点和作用机制

目的通过网络药理学方法,预测积雪草治疗病理性瘢痕（PS）的作用靶点并探讨其作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选出积雪草的活性成分和药物靶点,在GeneCards（https://www.genecards.org/）数据库获取PS疾病靶点,对积雪草药物靶点和PS疾病靶点进行韦恩图分析,以共同靶点作为积雪草治疗PS的作用靶点。通过String网站构建蛋白质相互作用（PPI）网络,用Cytoscape3.7.1软件绘制PPI网络图,并筛选其关键蛋白模块及关键（Hub）基因;在DAVID数据库对关键模块的Hub基因进行基因本体论（GO）功能注释和KEGG通路富集分析。结果筛选出槲皮素和谷甾醇2个活性成分,155个药物靶点,4571个PS疾病靶点;取交集后得到130个积雪草治疗PS的作用靶点。经Cytoscape软件分析后,得到丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、IL-6、TNF、IL-10、基质金属蛋白酶9（MMP-9）、转化生长因子β1（TGF-β1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、IL-1B、表皮生长因子（EGF）、MMP-2、MMP-1等Hub基因,涉及TNF信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等。结论积雪草可通过调控TNF信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等,改善PS患者的炎症反应、缺氧状态及成纤维细胞增殖平衡,具有多中心、多靶点、多途径的作用特点。     

应用网络药理学结合分子对接技术探讨四神煎对膝骨关节炎和类风湿性关节炎的“异病同治”机制

【目的】基于“异病同治”的中医经典理论,运用网络药理学及分子对接技术探讨四神煎治疗膝骨关节炎（KOA）和类风湿性关节炎（RA）的关键分子机制。【方法】利用中药成分数据库检索四神煎中黄芪、牛膝、远志、石斛、金银花的化学成分,运用SwissTargetPrediction数据库预测对应靶点,通过Cytoscape软件构建四神煎-有效活性成分-靶点互作网络。在疾病数据库中获取KOA、RA相关疾病靶点,应用R语言软件及STRING平台筛选活性成分与疾病的共同靶点并构建蛋白质-蛋白质互作（PPI）网络。利用Cytoscape软件构建疾病-方药-成分-靶点互作网络,通过R语言进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。借助AutoDockTools软件进行分子对接构象展示,以评价生物信息分析预测的可靠性。【结果】（1）共筛选出四神煎活性成分67种,得到药物靶点230个;（2）共获得KOA疾病靶点2 110个,RA疾病靶点5 058个,2种疾病与中药化学成分共有潜在作用靶点106个,其中关键靶点为MAPK8、MAPK14、EGFR、CCND1、IL6;(3)GO、K...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气活血方治疗糖尿病肾病的作用机制

探讨运用网络药理学与分子对接技术,分析自拟益气活血方治疗糖尿病肾病（DN）的有效成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过多个公共数据库获得益气活血方中活性成分的潜在靶点及DN的疾病靶点,并获得交集靶点,对交集靶点进行GO和KEGG分析,蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析与网络构建;利用Autodock vina软件对重要成分及关键靶点进行分子对接。结果 网络药理学分析获得有效活性成分78个、成分靶点223个、疾病靶点1002个、交集靶点81个、关键靶点15个。富集的 KEGG 通路有胰岛素抵抗、 PI3K-Akt 信号通路等。分子对接结果显示山柰酚、木樨草酸等成分对大部分靶点具有亲和力。结论 益气活血方可能通过调节炎症与细胞自噬、促进ECM蛋白的降解、调节外周组织对胰岛素的敏感性及胰腺β细胞的增殖和凋亡等作用机制达到治疗DN的作用     

基于锦灯笼对白血病作用机制的网络药理学和分子对接技术的生物信息学分析

目的 基于网络药理学探讨锦灯笼（PCF）在白血病发生发展过程的作用,阐明其生物活性成分主要作用靶点和信号通路相关机制。 方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库以“锦灯笼”为关键词检索其生物活性成分及对应的潜在靶点,并采用蛋白质数据库（PDB）和小分子药物靶点预测在线平台（Swiss Target Prediction）网站对其潜在靶点进行评估预测。采用GeneCards、OMIM和DrugBank数据库以“Leukemia”为关键词对相关靶点进行检索。利用Draw Veen Diagram在线软件将PCF生物活性成分靶点与白血病靶点交集,得到的交集靶点即为PCF作用于白血病的靶点;利用基因/蛋白相互作用检索搜查工具（STRING）数据库获取交集靶点蛋白的蛋白-蛋白互作（PPI）网络信息并进行可视化处理;采用注释可视化和集成发现数据库（DAVID）对交集基因进行基因本体（GO）生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析筛选核心靶点和核心活性成分,采用 AutoDock 和PyMol软件进行分子对接验证。 结果 对TCMSP数据库检索结果进行筛选后得到6个PCF活性成分,收集PCF与白血病的共同靶点29个。GO富集分析主要涉及造血或淋巴器官的发育、蛋白代谢调控和细胞凋亡等生物进程;KEGG信号通路富集分析主要包括癌症通路、肿瘤坏死因子 （TNF）和T细胞受体 （TCR） 等信号通路。拓扑网络分析得到蛋白激酶B1 （AKT1）、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3 （Caspase-3） 等10个核心靶点,结合KEGG信号通路筛选出核心活性成分谷甾醇和禾本甾醇。分子对接,PCF活性成分谷甾醇与原癌基因 JUN及禾本甾醇与AKT1和Caspase-3对接能均<－6.0 kcal·mol^－1,表明对接较好。 结论 PCF的主要活性成分谷甾醇和禾本甾醇可能通过调控JUN、AKT1和Caspase-3等基因参与癌症通路和TCR等信号通路,进而影响白血病的发生发展。     

基于网络药理学探讨二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用机制

目的：运用网络药理学的研究方法,分析二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用靶点和机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选二仙汤的有效活性成分及其作用靶点,利用GeneCards数据库检索乳腺增生症的相关靶点。映射疾病靶点与药物靶点,通过String数据库预测两者间关键靶点的相互作用,构建“药物-有效成分-作用靶点”网络图,并对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,分析二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用机制。结果：共获得85个二仙汤有效成分,215个有效成分靶点,4 775个乳腺增生症靶点,有效成分与疾病交集靶点175个,蛋白质相互作用（PPI）核心网络包含10个靶点,并得出排名前10位的GO富集结果和排名前20位的KEGG富集结果。结论：二仙汤通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等多个活性成分作用于ESR1、TP53、AKT1等靶点,直接或间接通过调控PI3K-AKT、MAPK等多条信号通路调节雌激素的活性,发挥治疗乳腺增生症的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨瓜蒌皮注射液治疗冠心病的作用机制

[目的]通过网络药理学及分子对接的方法,探究瓜蒌皮注射液治疗冠心病的分子机制。[方法]首先通过查阅文献汇总瓜蒌皮注射液中的主要化学成分,通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、SwissADME数据库筛选其活性成分并预测其作用靶点,与在GeneCards数据库、OMIM数据库中获取的冠心病的相关靶点交集获得核心靶点;其次通过String数据库构建靶点蛋白互作网络,转换格式导入Cytoscape3.7.2软件构建蛋白互作网络和“相关活性成分-潜在作用靶点”网络并分析关键靶点蛋白与活性成分;然后通过Metascape数据库对靶点基因进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;最后通过AutoDock Vina软件将活性成分与核心靶点进行分子对接来对网络药理学预测的准确性进行虚拟验证。[结果]研究获得瓜蒌皮注射液治疗冠心病的可能相关活性成分10个,核心靶点7个。瓜蒌皮注射液的活性成分可能通过调控蛋白激酶B抗体（AKT1）、表皮生长因子受体（EGFR）、非受体酪氨酸激酶（SRC）、热休克蛋白90AA1(HSP90AA1)、半胱氨酸蛋白酶3(CA...     

基于网络药理学研究“当归-鸡血藤”药对治疗肾性贫血的作用机制

目的 基于网络药理学研究“当归-鸡血藤”药对治疗肾性贫血的活性成分、潜在靶点及可能作用机制。方法利用TCMSP数据库和Uniprot数据库检索并筛选得到“当归-鸡血藤”药对主要活性成分及其作用靶标。通过Drugbank、Genecards及OMIM数据库收集肾性贫血相关靶标,对肾性贫血药物靶标和相关基因取交集,运用STRING数据库构建蛋白质互作（PPI）网络图,利用Cytoscape 3.6.0软件构建“药物-活性成分-靶点”网络模型。使用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析并可视化,并用Autodock＿vina和Pymol软件对蛋白和活性成分进行分子对接。结果 获得“当归-鸡血藤”药对中24个活性成分,相关潜在靶点140个,肾性贫血相关靶点992个,交集靶点44个;其主要作用于MAPK1、TP53、TNF、CASP3等多个靶标,涉及包括HIF-1、PI3K/Akt、TNF在内的99条信号通路发挥治疗肾性贫血作用。分子对接结果显示木犀草素与TP53、STAT3等关键靶点有较好的结合能力。结论 从网络药理学的角度对“当归...     

基于网络药理学探讨丹栀逍遥散治疗多囊卵巢综合征 的物质基础及作用机制*

目的通过网络药理学方法，预测丹栀逍遥散各药物活性成分对多囊卵巢综合征的作用靶点，探讨丹栀逍遥散（DZXYP）治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选出丹栀逍遥散中各药物的主要活性成分，并使用PubChem数据库和 SwissTarget Prediction预测相关作用靶点。利用GeneCards挖掘已知的PCOS基因靶点。结合药物的预测靶点及疾病靶点导入String数据库构建药物--疾病靶点蛋白互作网络，最后采用 DAVID数据库和Cytoscape对关键节点进行生物功能及代谢通路分析。结果 丹栀逍遥散8味药共筛选出142个活性成分，预测出483个相关靶点；经过数据检索得到PCOS相关靶点3 619个，与药物有140个交集。对核心靶点共富集出286个生物学过程（BP）、81个分子功能（MF）和34个细胞成分（CC），以及83条KEGG通路。结论 丹栀逍遥散可能是通过对多个靶点作用，调控磷脂酰肌醇3激酶 /蛋白激酶B（PI3K/Akt）、卵巢类固醇激素合成、胰岛素抵抗（IR）等多个信号通路，改善PCOS的炎症状态、恢复胰岛素敏感性以及降低雄激素的合成起到治疗PCOS的作用，为丹栀逍遥散的作用机制提供了新的阐释以及为进一步开展其药理研究提供新思路。     

基于网络药理学探究苁蓉益肾颗粒调治骨质疏松的分子机制及初步验证

目的：通过网络药理学探究苁蓉益肾颗粒调治骨质疏松的有效靶点及信号通路，探讨其潜在的分子机制。方法：首先，通过体外细胞实验验证苁蓉益肾颗粒是否可以在体外抑制破骨细胞的分化。其次，基于TCMSP中医药数据库筛选苁蓉益肾颗粒的活性成分及其作用靶点，利用GeneCards数据库获得骨质疏松的相关靶点，并在UniProt数据库中对靶点信息进行规范。再次，取两者的交集得到苁蓉益肾颗粒治疗骨质疏松的靶基因。最后，利用STRING 11.0数据库对药物和疾病的靶基因进行蛋白相互作用（PPI）分析，构建网络图，并上传至Cytoscape 3.9.1软件制作PPI网络图，使用MCODE分析其潜在蛋白质功能模块；利用Metascape数据库对核心靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果：细胞实验结果表明，苁蓉益肾颗粒可以在体外抑制破骨细胞的生成。苁蓉益肾颗粒有69种活性成分，对应靶点220个，骨质疏松相关疾病靶点有1 167个。其中，苁蓉益肾颗粒治疗骨质疏松的主要活性成分有槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、异鼠李素和芝麻素等，核心靶点为NCOA2、PTGS2、PTGS1、HSP90AB1和PIK3CG等。K...     

基于黄芩汤治疗结直肠癌作用机制的网络药理学和分子对接分析

目的：通过网络药理学和分子对接技术分析黄芩汤治疗结直肠癌（CRC）的潜在作用靶点,阐明其相关分子机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）构建黄芩汤活性成分和作用靶点数据集,通过GeneCards、人类在线孟德尔遗传（OMIM）、药物遗传学和药物基因组学知识库（PharmGKB）等数据库构建CRC疾病相关靶点数据集。利用R软件、Cytoscape软件和STRING数据库构建药物-疾病靶点交集、黄芩汤中药复方调控网络和蛋白-蛋白互作（PPI）网络。利用R软件和Metascape平台进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证,评估配受体结合情况。结果：筛选黄芩汤有效活性成分136个,黄芩汤治疗CRC的潜在靶点242个,核心靶点18个,基于信号通路分析获得CRC密切相关核心关键靶点5个,分别为蛋白激酶B1 (AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、原癌基因FOS、肿瘤蛋白P53 (TP53)和原癌基因MYC。GO功能富集分析,主要参与多种细胞应激反应的生物过程。KE...     

玉液汤调控自噬相关机制改善早期糖尿病肾病的机制探讨

目的：运用网络药理学的研究方法联合分子对接探讨玉液汤治疗糖尿病肾病的机制。方法：通过高通量基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）获取糖尿病肾病转录组基因表达情况,提取与自噬相关的基因。利用中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）工具筛选得出玉液汤的活性成分及相关靶点,将药物预测靶点与疾病靶点进行映射得到与自噬相关的玉液治疗糖尿病肾病的靶点。利用String(search tool for the retrival of interacting genes/proteins)数据库结合Cytoscape 3.7.2软件构建玉液汤治疗糖尿病肾病的“药物-有效活性成分-靶点”网络和蛋白质相互作用网络,使用Metascape对玉液汤治疗糖尿病肾病的作用靶点进行基因本体论（Gene Ontology,GO）生物学过程分析和京都基因和基因组数据库KEGG(Kyoto Encyclopedia of G...     

补肾化瘀方治疗宫腔粘连的潜在靶点及机制研究

目的 以网络药理学为主要研究思路，探讨补肾化瘀方治疗宫腔粘连的潜在靶点与可能机制，以期为后续进一步临床及实验验证提供可靠的理论依据。方法 借助TCMSP、TCMID、PubChem、TCMSP、Swiss Target Prediction数据库对补肾化瘀方的活性成分、作用靶点进行筛选，借助Disgenet、Genecards、OMIM数据库获得宫腔粘连疾病靶点，将两者导入Cytoscape 3.8.2软件筛选交集靶点并构建“药物–成分–靶点–疾病”网络图，获得补肾化瘀方治疗宫腔粘连的核心成分，并通过STRING数据库构建的蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）网络图推测核心基因。最后通过R语言对交集靶点进行基因本体论（gene ontology，GO）与京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析，推测可能作用机制。结果 共获得补肾化瘀方治疗宫腔粘连的活性成分116个，起治疗作用的核心基因可能为CXCL8、KDR、LCK、ITGAL。GO富集至上皮细胞增殖、修复等生物学过程。KEGG富集分析共涉及169条信号通路，以涉及炎症、免疫激活的相关通路为主。结论 补肾化瘀方治疗宫腔粘连具有多靶点和多通路的复杂过程，基于网络药理学推测补肾化瘀方主要通过调控免疫–炎症反应、细胞增殖、转化等途径治疗宫腔粘连。