分子信标荧光定量PCR快速检测结核分枝杆菌方法的初步研究

目的建立分子信标荧光定量PCR快速检测结核杆菌方法,为临床结核病的诊断提供特异性强、灵敏度高、可标准化、自动化的检测方法。方法根据GenBank数据库公布的结核分枝杆菌IS6110基因的保守序列,设计引物与分子信标探针,建立结核分枝杆菌荧光定量PCR检测方法;以10种细菌作对照分析该方法的特异性与灵敏度;应用已建立的方法检测结核分枝杆菌,评价其应用价值。结果所建立的分子信标荧光定量PCR检测10种细菌,只有结核分枝杆菌有荧光信号,与其他细菌无交叉反应,4拷贝/PCR反应体系的结核分枝杆菌都能有效检出。对100株结核分枝杆菌的检测结果为阳性,单一检测时间仅需2h。结论分子信标荧光定量PCR检测方法快速、灵敏度高、特异性强,可用于快速诊断结核病,为结核病的诊断与治疗提供新的检测手段。     

LAMP方法检测霍乱弧菌的研究

目的建立一种快速检测霍乱弧菌的方法。方法利用霍乱弧菌的hlyA基因设计特异性引物,建立LAMP检测方法,以及优化反应体系,并进行LAMP的特异性和灵敏度实验,同时与普通PCR和荧光定量PCR进行比较。结果成功建立霍乱弧菌的LAMP检测方法,得到最优的反应体系,在特异性实验中,霍乱弧菌均呈阳性,而副溶血弧菌、溶藻孤菌、最小孤菌、1梅氏孤菌等均为阴性;在灵敏度实验中,霍乱弧菌的最低检测限为6.2pg／tube,是普通PCR的1000倍。比荧光定量PCR低一个数量级。结论LAMP方法具有很高的特异性和灵敏度,可用于霍乱孤菌的检测。     

快速检测耐甲氧西林葡萄球菌方法的应用评价

目的：对耐甲氧西林葡萄球菌(MRS)两种快速检测方法的可靠性和临床实用性进行评估。方法：临床分离的215株葡萄球菌中，120株MRS同时采用mecA基因探针快速分析、PBP2a快速检测和甲氧西林琼脂筛选平板．并与mecA基因的PCR分析比较。结果：mecA基因探针快速分析鉴定MRS的灵敏度为97．7％，特异性为100％；PBP2a快速检测的灵敏度为97．7％，特异性为100％．甲氧西林琼脂筛选平板的灵敏度为97．7％．特异性为85％。结论：两种快速检测方法都具有灵敏度高，特异性强，简单易行的特点，是常规实验室检测MRS可靠的分析方法。PBP2a分析方法因其不需特殊设备、更快速而将有更好的临床应用前景。     

多重PCR快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌

目的建立多重PCR方法,快速鉴定金黄色葡萄球菌并同时检测耐甲氧西林葡萄球菌（MRS）的mecA基因。与PBP2a乳胶凝集法及头孢西丁纸片扩散法进行比较。方法以nuc基因以及mecA基因合成2对引物,采用多重PCR扩增法,在279bp和310bp处出现扩增条带,表示检出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。结果 171株临床分离菌的mecA基因检出率为52.63%;nuc基因扩增结果与常规检测结果的符合率为100%;以PBP2a乳胶凝集法为＂金标准＂,PCR法和头孢西丁纸片扩散法的敏感性均为100%,特异性分别为98.78%和92.68%。3种方法结果差异无统计学意义（P〉0.05）。Kappa值均大于0.90。结论此多重PCR法能准确鉴定金葡菌,并可同步检测MRS,可作为临床实验室检测MRS的可靠方法。     

TagMan PCR快速检测食品中空肠弯曲菌

目的:利用荧光定量PCR技术,建立食品中空肠弯曲菌污染的快速检测方法.方法:以空肠弯曲菌的hipO基因为靶序列,设计引物和探针,优化引物、探针浓度比和Mg2+浓度,对反应体系进行评价.并初步应用于样品的检测.结果:所建反应体系特异性、敏感性和稳定性良好.定量检测低限15cfu/ml.结论:建立了适用于食品中空肠弯曲菌污染快速检测的荧光定量PCR方法.     

应用实时荧光PCR技术快速检测B群链球菌

目的 建立一种能够快速、准确、特异的检测B群链球菌的实时荧光PCR检测技术。方法 以B群链球菌cfb基因的保守区为靶区域设计特异引物和TaqMan荧光探针,然后优化反应条件和反应体系,建立检测B群链球菌的实时荧光PCR方法,通过检测实验菌株,对照菌株以及模拟血液,尿液标本对该方法的特异性、敏感性以及灵敏度进行评价。结果 实验结果表明实时荧光PCR方法检测7株B群链球菌均为阳性,其他对照实验菌株均为阴性,且当菌液浓度为 20cfu//ml时,也能获得阳性结果,说明荧光定量PCR法敏感性、特异性以及灵敏度均较高。对模拟尿液标本进行检测时,其敏感性为90%,特异性为100%,检测下限约为2cfu/反应体系。由于标本类型和处理方式的不同,对模拟血液标本进行检测时,其检测灵敏度约为100cfu/mL,低于模拟尿液标本的检测灵敏度。结论 建立的荧光定量PCR技术方法为GBS的快速诊断以及更加准确有效的进行抗生素预防提供了依据,也为在新生儿中进行早发型GBS感染的快速准确诊断提供了新的思路。     

TaqManPCR快速检测食品中空肠弯曲菌

目的：利用荧光定量PCR技术,建立食品中空肠弯曲菌污染的快速检测方法。方法：以空肠弯曲菌的hipO基因为靶序列,设计引物和探针,优化引物、探针浓度比和Mg2＋浓度,对反应体系进行评价。并初步应用于样品的检测。结果：所建反应体系特异性、敏感性和稳定性良好。定量检测低限15efu／ml。结论：建立了适用于食品中空肠弯曲菌污染快速检测的荧光定量PCR方法。     

猴免疫缺陷病毒(SIV)实时荧光定量PCR检测方法的建立

目的建立快速、敏感、特异的猴免疫缺陷病毒(SIV)TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法,对SIV病毒核酸进行定量检测。方法 RT-PCR扩增SIVmac251保守gag基因序列796 bp片段,进行TA克隆,构建标准品质粒pMD-SIVgag。通过对SIV定量外标准品的定量分析,优化反应体系,检测TaqMan探针实时荧光定量PCR方法的灵敏度、特异性和重复性。结果所建立的SIV QPCR检测方法,质粒DNA模板在107～102拷贝之间表现较好线性和相关性,标准曲线所得斜率为-3.26,相关系数为0.999。检测灵敏度达到200拷贝,方法重复性测试,检测25份临床样品CV%均小于1%。结论建立的SIV QPCR检测方法特异性、敏感性高,稳定性好,可用于定量测定猴免疫缺陷病毒(SIV)核酸拷贝量。     

荧光定量PCR检测食品中副溶血性弧菌方法的建立

目的：建立一种荧光定量PCR方法检测副溶血性弧菌,为食品安全监测、临床诊断提供快速、准确的检测方法。方法：选取副溶血性弧菌不耐热溶血毒素基因作为检测的靶片段设计引物及探针,通过体系优化建立检测副溶血性弧菌的荧光定量PCR检测方法。同时评价其特异性、灵敏度、重复性。并对临床收集的样本进行检测。结果：所建立的荧光定量PCR方法特异性高,可准确、特异的检测副溶血性弧菌,灵敏度为10cfu/mL;20份市售食品样本检测结果显示12例副溶血性弧菌阳性,结果符合常规培养检测结果。结论：所建立的荧光定量PCR方法具有快速、结果可靠、灵敏度高等特点,可用于食物污染物调查、临床检验等多个方面中副溶血性弧菌的检测。     

荧光定量PCR技术在临床肺结核防治中的应用

目的 建立荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法,评估其在肺结核的临床诊断和疗效评估中的应用价值.方法 针对结核分枝杆菌保守序列IS6110基因设计引物和探针,建立荧光定量PCR方法.分别以荧光定量PCR、集菌培养和染色镜检法检测疑似肺结核和确诊病人随访的痰标本,比较各方法在结核病诊断以及治疗效果评估中的作用.结果 荧光定量PCR的检测灵敏度为4 Copies/反应,远高于抗酸染色法和集菌培养法.荧光定量PCR法与集菌培养法和抗酸染色法对临床样本的检出率分别为64.29%,35.12%和12.5%.病人治疗效果的随访检测结果显示,结核分枝杆菌的数量呈持续减少的趋势.结论 荧光定量PCR方法具有快速、敏感和特异性高的特点,可以快速、及时获取病人服药后的治疗效果,为医生的后续督导治疗提供依据,具有重要的临床意义.     

双重实时荧光PCR快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌方法的建立

目的:建立一种能快速检测金黄色葡萄球菌,同时能快速鉴别是否具有耐甲氧西林基因的双重实时荧光PCR方法.方法:以金黄色葡萄球菌特异NUC基因的保守区为靶区域设计特异引物和TaqMan荧光探针,同时针对耐甲氧西林特异MecA基因设计另一对引物和探针;2条探针的5′端标记不同荧光报告基团(FAM和HEX),3′端标记荧光淬灭...     

耐甲氧西林葡萄球菌的多重PCR快速检测

目的 采用多重聚合酶链反应（PCR）检测耐甲氧西林葡萄球菌（MRS），并对我院葡萄球菌的耐药率进行调查。方法 对262株葡萄球菌（金黄色葡萄球菌86株，凝固酶阴性葡萄球菌176株）进行多重PCR扩增，并与琼脂稀释法作比较。对我院葡萄球菌的耐药率进行统计分析。结果 以mecA基因阳性判断MRS，灵敏度为100％，特异度为96．6％，阴性预测值为1.0％，阳性预测值为99．0％；以mecA基因和femA基因阳性判断耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA），灵敏度为100％，特异度为99．5％，阴性预测值为100％，阳性预测值为98．5％。我院葡萄球菌耐药率为78．6％，其中凝固酶阴性葡萄球菌耐药率为79．0％，金黄色葡萄球菌耐药率为78．0％。结论 多重PCR技术检测mecA基因能快速、敏感、准确地检测MRS，与femA基因联合检测能有效检测MRSA。MRS已成为日益严重的葡萄球菌感染问题。     

纸片法与MIC法检测MRS的比较

目的通过头孢西丁（FOX）纸片法与苯唑西林（OX）纸片法、肉汤稀释法（MIC）检测耐甲氧西林葡萄球菌（MRS）方法比较,对FOX纸片法的可靠性和临床实用性进行评估。方法用FOX与OX纸片扩散法与MIC法检测本院临床送检标本中分离的葡萄球菌共120株。结果3种方法检测46株金黄色葡萄球菌的MRS结果均为30株,符合率为100%;检测凝固酶阴性葡萄球菌MRSMIC法的结果特异性为50%,OX纸片法特异性为62.5%。结论3种方法检测金黄色葡萄球菌的MRS结果相符合;检测凝固酶阴性葡萄球菌MRS的结果MIC法和OX纸片法特异性均低,建议用FOX纸片法代替或更正对MRS的检测结果。     

PCR法检测葡萄球菌肠毒素A基因

目的 建立PCR方法快速检测葡萄球菌肠毒素A(Staphylococcal enterotoxin A,SEA)基因.方法 根据SEA基因的序列,设计PCR引物特异性扩增靶基因片段,对1株产SEA金黄色葡萄球菌和9株对照菌株进行PCR检测,评价其特异性和敏感性.另检测30株金黄色葡萄球菌SEA基因的携带情况.结果 建立PCR方法快速检测SEA基因,扩增产物长度为439bp.PCR反应体系中有29cfu的产SEA金黄色葡萄球菌即可检出SEA基因,30株分离的金黄色葡萄球菌中有10株携带有SEA基因.结论 PCR法可以快速、敏感地检测SEA基因,为金黄色葡萄球菌食物中毒诊断提供依据.     

16S-23S rRNA基因区间细菌鉴定实验研究

目的 :探讨 16 S- 2 3S r RNA基因区间对细菌鉴定的应用。方法 :以 16 S- 2 3S r RNA基因区间为靶序列设计引物 ,采用聚合酶链反应检测标准菌株及临床菌株 DNA。结果 :对 2 7株代表 2 7个菌种的标准菌株进行 PCR扩增 ,分别出现不同的 DNA图谱 ,该图谱能直接或经核酸内切酶处理后用于细菌分类 ,敏感性可达 2 .5 CFU/ml的细菌 ,与人外周血白细胞 DNA和真菌及病毒无交叉。 32株临床细菌标本均扩增出与相应标准菌株一致的图谱。结论 :16 S- 2 3S r RNA基因区间 PCR扩增技术检测细菌 ,具有敏感、特异、快速、准确的优点 ,为临床败血症病原的快速诊断提供了新的方法     

四种初筛试验检测耐甲氧西林葡萄球菌的评价

目的评价四种初筛试验检测耐甲氧西林葡萄球菌(MRS)的价值。方法收集临床分离金黄色葡萄球菌100株、凝固酶阴性葡萄球菌51株,分别进行头孢西丁纸片、MHA中添加4%NaCl的头孢西丁纸片、MHA中添加2%NaCl的苯唑西林纸片、苯唑西林-盐琼脂,以PBP2a胶乳凝集作为MRS检测标准,按CLSI2006版标准操作和判读结果。结果对于金黄色葡萄球菌,头孢西丁纸片、MHA中添加4%NaCl的头孢西丁纸片、MHA中添加2%NaCl的苯唑西林纸片、苯唑西林-盐琼脂检测MRS灵敏度和特异性分别为96.3%和100.0%、85.2%和100.0%、77.8%和100.0%、92.6%和94.5%,其中2株苯唑西林-盐琼脂24h未生长但延长至48h生长,48h内敏感性100.0%;对于凝固酶阴性葡萄球菌,四种方法检测MRS灵敏度和特异性分别为97.8%和80.0%、95.6%和80.0%、95.6%和80.0%、100.0%和80.0%(P>0.05)。结论四种方法均能可靠检测MRS,头孢西丁纸片和苯唑西林-盐琼脂具有较高应用价值。     

单克隆抗体标志乳胶凝集试验快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌

目的探讨快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的实验方法。方法目标菌株采用SlidexMRSA Detection乳胶快速检测金黄色葡萄球菌(SA)菌株青霉素结合蛋白2 a(PBP2 a),确认MR-SA;设立SA耐苯唑西林筛选试验对照,两组不符合菌株经PCR方法检测M ecA基因确认。结果Sli-dexMRSA Detection乳胶快速检测247株SA的PBP2 a,阳性93株(37.65%);247株SA经苯唑西林筛选试验及PCR测定M ecA基因确定MRSA102株(41.30%),93株PBP2 a阳性菌株都为MRSA;PBP2 a阴性耐苯唑西林22株中,经PCR法检测M ceA基因,9株确认为MRSA,13株为甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)。乳胶凝集法快速检测SA的PBP2 a确定MRSA,敏感性91.2%,特异性100%,阳性预测值为1,阴性预测值0.94。结论单克隆抗体乳胶凝集法快速检测鉴定MRSA具有较高敏感性和特异性。     

葡萄球菌的耐药性分析

目的分析葡萄球菌（包括MRS和MSS株）的耐药性,为临床合理选择抗生素提供依据。方法药敏试验及耐甲氧西林葡萄球菌的检测均采用琼脂扩散法（K—B法）,操作及结果判断均按NCCLS（2002）标准执行。结果金黄色葡萄球菌与凝固酶阴性葡萄球菌的分离率分别占41．3％和72．1％;MRSA和MRSCON株的检出率分别为45．0％和75．0％;MRSA株对喹诺酮类的耐药性（21．0％-57．0％）明显低于MRSCON株（81．2％～89．6％）;除万古霉素、替考拉宁、呋喃妥因、阿米卡星和部分青霉素类外,MRSA和MRSCON株的耐药性显著高于MSSA和MSSCON株〈P〈0．05）;未发现耐万古霉素和替考拉宁菌株。结论由MRS菌株引起的严重感染首选万古霉素和替考拉宁治疗,发现耐万古霉素和替考拉宁菌株的实验室要根据NCCLS的有关规定修订药敏报告,并且及时切断传播途径,降低细菌的耐药性和医院感染。     

分子信标荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌方法建立及其临床应用

目的 建立结核分枝杆菌的分子信标荧光定量PCR检测方法 ,探讨该方法 检测结核分枝杆菌的临床应用价值.方法 针对结核分枝杆菌Ag85B DNA特异保守序列设计引物和分子信标探针,并构建标准品.采用分子信标荧光定量PCR法、抗酸染色法、集菌培养法检测158例肺结核患者痰液标本,比较3种方法 的检出率.结果 所建立方法 最低检测限度为2个基因拷贝/反应,在2×10~2～2×10~8基因拷贝/mL范围内,Ct值同DNA量的对数呈线性关系.该方法 检测5株非分枝杆菌和6株非结核分枝杆菌结果 均为阴性,检测结核分枝杆菌H37Rv出现75 bp特异条带.分子信标荧光定量PCR法、抗酸染色法、集菌培养法阳性检出率分别为60.13%、16.46%、31.01%,荧光定量PCR法检出率明显高于抗酸染色法和集菌培养法.结论 分子信标荧光定量PCR法具有较高的灵敏度和特异度,对结核病的诊断有一定的临床意义.