LC-IT-TOF-MS~n快速鉴别沉香中2-(2-苯乙基)色酮类成分

目的:基于LC-MS技术对沉香中2-(2-苯乙基)色酮类成分进行快速鉴别与分析。方法:通过LC-IT-TOF-MS~n对31个对照品进行多级质谱采集,确定2-(2-苯乙基)色酮类成分的裂解规律,利用其裂解规律对沉香中的色酮类成分进行分析。结果:在沉香药材中发现了4个三元氧环四氢色酮,18个四羟基四氢色酮,4个氯代四氢色酮和51个简单2-(2-苯乙基)色酮。结论:本研究采用的方法快速高效,可为沉香中2-(2-苯乙基)色酮类成分的分析和鉴定提供基础。     

基于网络药理学探讨大柴胡汤对2型糖尿病的治疗作用机制＊

目的 运用网络药理学的方法探讨大柴胡汤治疗2型糖尿病的作用机制，对作用靶点和信号通路进行预测和筛选。方法 首先在SymMap中医药生物信息学平台获取大柴胡汤的潜在作用靶点信息，在CTD疾病数据库获取2型糖尿病的潜在治疗靶点，将两者取交集即得筛选出的药物疾病靶点；使用STRING构建靶点的PPI网络；运用CluGO工具对靶点进行GO功能和KEGG信号通路富集分析，并筛选大柴胡汤治疗糖尿病的活性化学成分。结果 获取大柴胡汤靶点476个，其中与2型糖尿病相关联的靶点有41个，主要参与了葡萄糖跨膜转运、调节胰岛素分泌、葡萄糖稳态、胰岛素受体信号通路的调节等生物过程；还参与调控了胰岛素抵抗、青少年的成年人型糖尿病、2型糖尿病、胰岛素信号通路等相关通路。结论 通过网络药理学分析显示，大柴胡汤对2型糖尿病的治疗作用可能与直接参与调节胰岛素的分泌相关作用途径有关。     

基于网络药理学的藤茶黄酮类成分体内潜在作用靶点及可能干预疾病研究

目的:基于网络药理学探讨藤茶黄酮类成分体内的潜在作用靶点及可能干预的疾病。方法:通过文献检索建立藤茶化学成分数据库,运用吸收、分布、代谢、排泄(ADME)筛选藤茶中黄酮类成分;采用PubChem数据库收集藤茶黄酮类成分的潜在作用靶点;采用Metascape数据库对疾病类型、生物过程、通路进行富集分析;运用Cyoscape 3.6.1软件构建“成分-靶点-疾病”网络,预测藤茶黄酮类成分可能干预的疾病。结果:建立藤茶化学成分数据库,收集到136种化合物,运用ADME最终筛选到8个黄酮类成分,对应430个潜在作用靶点。对藤茶黄酮类成分体内潜在的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果显示,其潜在作用靶点涉及调节蛋白激酶活性、氧化应激、炎症等信号通路等。“成分-靶点”“靶点-疾病”等网络图显示,肿瘤坏死因子(TNF)、前列腺素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、白细胞介素-1β(IL-1β)、雌激素受体1(ESR1)、蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白P53(TP53)为藤茶黄酮类成分发挥作用的主要靶点蛋白。结论:藤茶黄酮类成分协同发挥药理作用,体现出藤茶“多成分-多靶点”的特点,可能对肿瘤、神经精神类疾病、肝损伤、代谢类疾病有干预作用。同时发现藤茶对抑郁症、阿尔茨海默病等神经精神类疾病的作用研究较少,值得深入研究与开发。     

基于网络药理学方法探索中药治疗代谢综合征的活性成分及作用机制＊

目的 探索高频中药治疗代谢综合征的核心作用靶点、主要活性成分及作用机制。方法 以黄芪、茯苓、丹参、泽泻、山楂、半夏、大黄、白术、黄连、川芎为关键词分别检索TCMSP数据库，按照OB照SP、，DL照SP、丹的条件筛选，获得高频中药的化学成分及其作用靶点；通过DrugBank 、Pharmgkb、CTD、TTD数据库检索MS的疾病靶标；将预测到的成分及MS的疾病靶标运用Cytoscape软件进行MS靶点-中药成分的网络构建,筛选核心靶点及主要活性成分，DAVID数据库行KEGG通路富集。结果 ①高频中药成分可能作用于PPARG、ESR、eNOS、ADRB2、PTGS1、PTGS2、AR等7个核心靶点蛋白，通过调节脂质代谢、调节血压水平、减轻胰岛素抵抗等达到治疗MS的效果。②高频中药治疗MS的主要活性成分为黄酮类及醌类化合物。③高频中药可能通过调控上游通路胰岛素抵抗通路，下游通路涉及PPAR、雌激素、TNF等信号通路及花生四烯酸代谢、脂肪细胞的脂解等作用达到治疗MS的作用。结论 高频中药治疗代谢综合征呈现出多成分、多靶点、多通路的作用特点，其主要活性成分可通过调节脂质代谢、调节血压水平、减重及减轻胰岛素抵抗等参与对代谢综合征不同危险因素的调控，进而影响代谢综合征的发展。     

基于网络药理学的佛手干预2型糖尿病潜在靶点机制研究

目的 基于网络药理学方法研究佛手干预2型糖尿病（type 2 diabetes mellitus，T2DM）的潜在作用靶点。方法 利用TTD数据库、Drugbank数据库、OMIM数据库和DisGeNET数据库筛选T2DM相关基因，借助 TCMSP 数据库筛选佛手有效化学成分作为候选药效成分，通过 COXPRESdb 数据库及 STRING 筛选关键蛋白，运用 Cytoscape 3.7.1软件构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络，使用 DAVID 6.8数据库进行基因本体（gene ontology，GO）功能富集分析和KEGG通路富集分析，通过Vina将佛手候选药效成分与关键蛋白进行分子对接。结果 ①筛选得到181个疾病靶点候选基因、佛手6种有效成分、药效成分和疾病相关的25个关键蛋白，构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络；②GO功能富集分析得到 GO条目 57个（P ≤ 0.05），其中生物过程条目43个，分子功能条目10个，KEGG通路富集得到10条通路（P ≤ 0.05）；③选取10个关键蛋白与佛手6个药效成分进行分子对接，结果显示其结合稳定。结论 通过网络药理学研究发现，佛手通过6种有效成分，影响25个潜在靶点、10条相关通路，调节胆固醇生物合成和胰岛素分泌功能干预T2DM，为佛手作为“调肝启枢化浊”法主要药味治疗糖脂代谢病提供了依据，为其进一步的临床应用和深入研究开发提供了思路和线索。     

基于网络药理学预测五眼果活性成分、作用靶点及疾病谱

目的 运用网络药理学方法预测五眼果活性成分、作用靶点及可能干预的疾病。方法 通过文献检索五眼果果核的活性成分，利用Chemdraw绘制化学结构，并运用SwissADME筛选有效活性成分，经TCMSP、Swiss Target Prediction预测活性成分的潜在作用靶点，使用STRING平台构建靶点相互作用(PPI)网络，在Metascape数据库对潜在作用靶点进行GO及KEGG通路富集分析，利用DAVID数据库进行疾病分析，然后运用Cytoscape 3.8.0软件构建“成分-靶点”“成分-靶点-疾病”网络，提取核心成分并预测可能干预的疾病。结果 共得到15个有效成分对应167个靶点。以“成分-靶点-疾病”网络及PPI网络分析结果显示，鞣花酸、柚皮素、β-谷甾醇、没食子酸、棕榈油酸、原儿茶酸可能是发挥药效的主要物质基础；相关度较高的靶点为AKT1、TP53、MAPK3、CASP3、SRC等。GO和KEGG富集分析结果表明，其潜在靶点具有抗炎、抗氧化、调节蛋白激酶、脂质代谢过程的作用，并且对癌症、代谢性疾病、肾脏疾病、精神疾病、呼吸系统疾病等影响较大。结论 该研究初步揭示了五眼果果核...     

基于网络药理学研究白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制＊

本研究探讨了中药白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制。在TCMSP、ETCM数据库中基于药代动力学特征筛选白及活性成分,Genecards数据库中收集肺癌靶标,利用Swiss target prediction在线工具预测成分作用靶标。经Cytoscape3.7.0软件及其STRING插件构建“活性成分-作用靶标”、“蛋白质-蛋白质相互作用”网络图,取交集得到白及和肺癌的共同靶标;将共同靶标导入Metascape中进行基因本体和KEGG通路富集分析,利用Cytoscape3.7.0软件构建“成分-潜在靶标互作-信号通路”网络。共获得25个潜在活性成分、20个潜在靶标和5条潜在通路,共确定了16个GO条目。白及治疗肺癌可能与跨膜受体蛋白酪氨酸激酶和一氧化氮合酶调节活性有关;参与了毒性反应、共生过程、肌肉细胞增殖、线粒体膜电位调节、横纹肌组织发育的正向调节等过程。白及可能通过ESR1、PTGS2、ALB、HSP90AA1、HER2、EGFR、ESR2等靶标作用于表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药、PI3K-Akt信号通路、癌症中的转录失调过程等通路,从而发挥治疗肺癌作用。     

沉香中2-(2-苯乙基)色酮类成分及其胃保护活性

目的 研究沉香Aquilariae Lignum Resinatum的2-（2-苯乙基）色酮类成分及其胃黏膜上皮细胞保护活性。方法 采用硅胶和ODS等多种色谱技术对沉香中2-（2-苯乙基）色酮进行分离纯化,结合波谱数据及其理化性质对化合物进行结构鉴定;采用牛磺胆酸诱导人胃黏膜上皮细胞GES-1损伤模型对分离得到的单体化合物进行胃黏膜保护活性筛选。结果 从沉香醋酸乙酯萃取部位中分离得到5个化合物,分别鉴定为（5R,6S,7S）-5,6,7-三羟基-2-苯乙基-5,6,7,8-四氢-4H-色烯-4-酮（1）、（6S,7S,8S）-6,7,8-三羟基-2-（3-羟基-4-甲氧基）-5,6,7,8-四氢-4H-色烯-4-酮（2）、oxidoagarochromone C（3）、rel-（1αR,2R,3R,7βR）-1α,2,3,7β-tetrahydro-2,3-dihydroxy-5-[2-（4-methoxyphenyl） ethyl]-7H-oxireno[f] [1]benzopyran-7-one（4）、沉香色酮J（5）。化合物3～5 在20 μmol/L浓度时,相对模型组细胞存活率分别提高（27.17±4.38）%、（16.02±2.95）%和（14.84±2.86）%。结论 化合物1 为新化合物,命名为四氢色酮N,通过计算电子圆二色谱（electronic circular dichroism,ECD）确定了其绝对构型。化合物3～5 能显著改善牛磺胆酸诱导的人胃黏膜上皮细胞GES-1损伤,表现出一定的胃黏膜上皮细胞保护活性。     

石榴皮活性成分治疗痤疮作用机制的网络药理学预测及实验研究＊

目的 采用网络药理学及实验验证的方法，探索皮类中药石榴皮治疗痤疮的作用机制。方法 利用网络药理学技术筛选石榴皮治疗痤疮的活性成分和作用靶点，采用String数据库对活性成分靶点与痤疮疾病靶点进行蛋白互作网络分析，并通过David数据库对其结果进行KEGG通路富集分析。基于以上结果，采用Cytoscape3.6.1软件构建石榴皮治疗痤疮的“成分-靶点-通路”网络关系图。通过动物实验，观察石榴皮多酚乳膏对金黄地鼠皮脂腺斑面积及PI3K蛋白表达情况的影响。结果 本研究共获得药效成分31个，药物靶点193个，痤疮靶点1371个，药效成分与疾病的交集靶点79个。石榴皮治疗痤疮的主要成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素等；核心靶点为Akt1、IL-6、VEGFA和PTSG2；关键信号通路可能包括PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、T细胞受体信号通路、FoxO信号通路等。体内实验证实，石榴皮能够降低金黄地鼠皮脂腺斑PI3K蛋白表达水平，抗皮脂腺斑增生。结论 本研究预测了石榴皮治疗痤疮可能的作用机制，为“以皮治皮”理论在中医皮肤科的应用提供现代理论依据。     

附子多成分作用靶点预测及网络药理学研究

目的:以常用中药附子为例,探索以中药化学成分预测其作用靶点,并构建中药多成分-多靶点网络.方法:根据1 401个美国FDA批准上市药物的分子结构及其相应靶点数据,采用随机森林法建立靶点预测模型;进而依据附子所含化学成分预测其作用靶点,并据此构建附子多成分-多靶点网络.结果:以附子的22个化学成分预测出多个作用靶点,预测结果得到文献数据印证.所建网络模型中每个化合物的平均靶点数为16.3,平均每个靶点与4.77个化合物相关联,反映出中药“多成分、多靶点”特点.结论:本方法可用于发现中药的某些潜在作用靶点.     

基于网络药理学方法预测银杏叶治疗心脑血管类疾病的有效成分及其潜在靶点

目的:采用网络药理学方法,研究银杏叶"成分-靶点-心脑血管相关疾病"复杂网络,预测银杏叶治疗心脑血管类疾病的有效成分及其潜在靶点。方法:建立药物分子-靶点相互作用的随机森林预测模型,对银杏叶化学成分进行靶点预测,然后构建和分析银杏叶"成分-靶点-心脑血管相关疾病"复杂网络。结果:对银杏叶的34个化学成分预测出多个作用靶点,结果得到了文献验证;进一步网络分析的结果初步揭示了银杏叶治疗心脑血管类疾病的有效成分和潜在靶点。结论:本方法可用于研究中药的物质基础和分子作用机制。     

基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制。方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析;构建生物网络并进行拓扑分析。结果:通过筛选得到白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等10个关键靶标,富集的通路有IL-17信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1信号通路等66条,功能信息共得到446条,包括参与炎症反应、调控细胞增殖与细胞凋亡等。结论:淫羊藿中的活性成分靶标及作用通路在对抗炎症反应、逆转气道重塑方面均表现出显著富集,与治疗哮喘的作用机制相符合,在哮喘防治方面具有广阔的发展前景。     

基于反向分子对接和网络药理学预测木兰花碱抗肿瘤的潜在作用机制＊

目的 利用网络药理学分析方法，基于生物信息大数据分析，以研究木兰花碱抗肿瘤的潜在的分子机制。方法 采用PharmMapper服务器挖掘木兰花碱潜在的抗肿瘤靶蛋白，通过对潜在靶蛋白参与的生物过程及KEGG通路分析，了解木兰花碱抗肿瘤的可能机制，用Cytoscape软件构建木兰花碱的“化合物-靶点-通路-疾病”相互关联网络。结果 分析结果数据，预测木兰花碱可与238个人源靶蛋白通过多种方式匹配而发挥作用，其中有75个通过20条信号通路参与肿瘤的生物过程。分别是40个靶点参与肿瘤通路，23个靶点参与多聚糖肿瘤通路，15个靶点前列腺癌通路，有13个靶点参与病毒致癌机理，有12个靶点参与化学致癌机理、胰腺癌通路、转录失调的肿瘤通路，10个靶点参与结直肠癌通路、黑色素瘤通路、非小细胞肺癌通路、肾细胞癌通路，9个靶点参与膀胱癌通路、中心碳代谢通路、子宫内膜癌通路、小细胞肺癌通路、慢性髓性白血病通路，8个靶点参与胆碱代谢通路、胶质瘤通路、急性髓性白血病通路，7个靶点参与甲状腺癌通路。主要参与凋亡调控、RNA转录调控、组织代谢、信号转导调控等生物过程中，通过FoxO signaling pathway、Ras signaling pathway、Metabolic pathways、PPAR signaling pathway等信号通路参与抗肿瘤的作用。结论 通过对木兰花碱治疗肿瘤潜在靶点的挖掘，我们推测，其可用于治疗胰腺癌、前列腺癌等多种肿瘤，为后期木兰花碱进一步深入研究提供研究方向及理论支持。     

基于网络药理学的雷公藤干预IgAN潜在靶点预测及作用机制分析＊

目的 基于网络药理学的理念，运用网络分析的技术，拟探讨雷公藤干预IgAN（immunoglobulin Anephropathy）的潜在靶点预测及其作用机制。方法 利用TCMSP平台收集雷公藤的重要活性成分及潜在相关靶点信息，分别从 GeneCards数据库、OMIM数据库中获取与IgAN相关联的靶点；采用STRING平台构建PPI作用网络，使用Cytoscape 3.7.0对药物-活性成分-潜在靶点-疾病网络进行构建；通过DAVID数据库对相关疾病-药物靶点基因进行GO生物功能富集分析和KEGG代谢通路分析。结果 检索出雷公藤成分共144个，筛选获得重要活性成分共29个；收集到潜在作用靶点基因122个。检索出IgAN相关靶点333个，基因功能GO富集分析及KEGG代谢通路富集结果显示，雷公藤中的9个有效成分干预26个疾病靶点，通过对20个生物过程、12个分子功能、13个细胞成分产生作用。得到通路共50条，通过可视化分析，取靠前的30条通路，其中6条通路可能与IgAN发生及发展密切相关。结论 该研究基于网络药理学方法，表明了雷公藤中药多成分、多靶点、多功能、多通路干预IgAN的作用，为后续临床及研究开展相应工作提供了较为可观的信息和理论依据。     

2-(2-Phenylethyl)chromones from Endophytic Fungal Strain Botryosphaeria rhodina A13 from Aquilaria sinensis

Objective To study the characteristic 2-(2-phenylethyl)chromone components of endophytic fungal strain of Aquilaria sinensis by solid culture. Methods The compounds were isolated by various chromatographic methods such as silica gel, reverse-phase silica gel, Sephadex-LH20 column chromatography as well as crystallization. Results Seven 2-(2-phenylethyl)chromone analogues were isolated from the solid culture of Botryosphaeria rhodina A13. Their structures were established by spectral data as well as physicochemical properties, and identified as 6-hydroxy-7-methoxy-2-(2-phenylethyl)chromone(1), 6,7-dimethoxy-2-(2-phenylethyl)chromone(2),(5S,6R,7S,8R)-2-(2-phenylethyl)-5,6,7,8-tetrahydrchromone(3), 6-hydroxy-2-(2-phenylethyl)chromone(4), 4′-hydroxy-2-(2-phenylethyl)chromone(5), 6-methoxy-2-phenethyl-4H-chromen-4-one(6), and 6-methoxy-2-(4′-methoxyphenethyl)-4H-chromen-4-one(7). Conclusion All of the compounds are isolated for the first time from the genus Botryosphaeria. This research opens up a new vista to produce the characteristic components of agarwood by endophytic fungi.     

国产沉香中1个新的2-(2-苯乙基)色酮

目的对国产沉香的小极性化学成分进行研究。方法运用硅胶、Sephadex LH-20、半制备高效液相等色谱方法进行分离纯化,并根据理化性质和波谱数据鉴定化合物的结构。结果从国产沉香的石油醚提取物中分离得到4个2-(2-苯乙基)色酮衍生物,分别鉴定为6-甲氧基-7-羟基-2-(2-苯乙基)色酮(1)、6,7-二甲氧基-2-(苯乙基)色酮(2)、6,7-二甲氧基-2-[2-(4′-甲氧基苯)乙基]色酮(3)、6-甲氧基-2-[2-(3′-甲氧基-4′-羟基苯)乙基]色酮(4)。结论化合物1为新化合物,命名为沉香酮J;化合物4为首次从国产沉香中分离得到。     

基于网络药理学探讨加味桃核承气汤治疗2型糖尿病的作用机制

目的:基于网络药理学方法研究加味桃核承气汤干预2型糖尿病的潜在作用靶点。方法:基于TCMSP数据库及Uniprot数据库筛选出加味桃核承气汤有效成分及靶点基因。通过Gene Cards数据库及OMIM数据库筛选出2型糖尿病的疾病靶点基因,并用Cytoscape软件构建"活性成分-靶点"相互作用网络图。将有效成分靶标与疾病靶标上传到STRING数据库,构建蛋白互作网络图(PPI),并计算其特征值,使用R语言对得到的PPI进行核心基因的筛选。最后,运用R语言对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:预测得到加味桃核承气汤治疗2型糖尿病的有效成分155个及共作有效靶点106个。有效成分中度值较高的为槲皮素(quercetin),山柰酚(kaempferol)及异鼠李素(isorhamnetin),作用靶点中度值较高的为雌激素受体(ESR1),过氧化物酶体增殖剂激活受体γ(PPARG)与雄激素受体(AR)。PPI网络中核心基因为表皮生长因子受体(EGFR)及ESR1等; GO富集分析显示会影响基因的转录、核受体活性及激素的受体结合、神经递质等; KEGG通路富集分析显示流体剪切应力和动脉粥样硬化通路为显著性最高的通路,其次为晚期糖基化终末产物及其受体通路。结论:通过网络药理学的方法预测加味桃核承气汤防治2型糖尿病的关键作用靶点及相关通路,结果提示此方剂具有多靶点、多通路等复杂机制,不仅表明加味桃核承气汤具有降糖的作用,而且其还具有抗炎、改善胰岛素抵抗、调节脂代谢等生物学功能。     

黄芩汤治疗溃疡性结肠炎分子作用机制的网络药理学研究

目的基于网络药理学探讨黄芩汤治疗溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选黄芩汤的潜在活性成分(OB≥30%,DL≥0.18),采用Swiss数据库预测其作用靶点;与Disgenet数据库获得的UC疾病靶点相映射,得到黄芩汤治疗UC的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建"黄芩汤-活性化合物-潜在作用靶点"网络和蛋白质相互作用网络,并使用David数据库对黄芩汤的作用靶点进行GO生物功能分析和KEGG通路富集分析。结果得到黄芩汤治疗UC关键靶点58个;甘草苷(Liquiritin)、甘草吡喃香豆酮(Licopyranocoumarin)、黄芩黄素(Baicalein)、黄连碱(Coptisine)、汉黄芩素(Wogonin)、鲨烯(Supraene)等可能是黄芩汤治疗UC的主要活性成分;其作用于ESR1、PTGS1、PTGS2、PTPN2、ABCG2等靶点,参与转录调控、低氧反应以及药物反应等生物过程,通过Ras-PI3K-Akt通路、Ras-PI3K-Akt-HIF-1α通路、NF-κB通路及MAPK-PI3K/AKT通路等发挥治疗UC的作用。结论黄酮类化合物在黄芩汤抗UC的作用机制中具有重要意义,调节炎症通路及干预炎症的发生发展可能是黄芩汤抗UC作用的重要机制。