6号染色体短臂MHCⅡ类抗原区基因多态性与精神分裂症的关系

目的探讨6号染色体短臂MHCⅡ类抗原区基因多态性与精神分裂症的关系。方法采用聚合酶链反应和限制性内切酶片段长度多态性方法检测位于6号染色体短臂MHCⅡ类抗原区基因上的5个单核苷酸多态性位点,对106个精神分裂症患者核心家系的等位基因和基因型进行传递不平衡和单倍型相对风险分析,同时对多位点构成的单倍型系统进行分析。结果rs1049060位点的C、G等位基因频数分布在病例组和对照组之间差异呈显著性(P<0.05);rs701831、rs707954、rs1047992和rs129190位点的等位基因和基因型频数分布在病例组和对照组之间差异均未见显著性(P>0.05)。rs1049060-rs129190、rs701831-rs707954、rs1047992-rs1049060-rs129190、rs701831-rs707954-rs1047992和rs701831-rs707954-rs1047992-rs1049060单倍型系统与精神分裂症相关联(P<0.05)。结论在人类MHCⅡ类基因区可能存在两个与精神分裂症相关的等位基因。     

人类染色体22q11精神分裂症易感基因的筛查研究

目的 在人类22q11区域内筛查与精神分裂症相关的易感基因。方法 由中国汉族精神分裂症患者和他们的健康父母组成的100个核心家系作为研究对象。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法对22q11区域内分别位于腭心面综合征中缺失的犰狳重复基因(ARVCF)上的m165655(A/G碱基改变)、rs165815(C/T碱基改变)和LOC128979(EST序列)位点上的rs756656(A/C碱基改变)3个单核苷酸多态性(SNP)进行检测。用连锁不平衡方法分析基因型数据,连锁不平衡方法包括单体型相对风险分析(HRR),传递不平衡检验(TDT)和单倍型传递分析。结果 3个SNP基因型频率分布都符合Hardy-Weinberg平衡;HRR和TDT分析结果都显示rs165815与精神分裂症有关联(P<0.05),而rs165655和rs756656与精神分裂症无关联;单倍型传递分析结果显示,父母传递给患病子女的rs165655-rs165815单倍体和rs756656-rs165655-rs165815单倍体的频率偏离50％,差异具有统计学意义(P<0.01)。结论 对于中国汉族精神分裂症患者而言,ARVCF基因本身或其附近的基因可能与精神分裂症的易感性有关联。     

汉族人群PIP3-E基因多态性与精神分裂症关系

目的探讨中国北方汉族人群PIP3-E基因多态性与精神分裂症的关系。方法采用PCR和限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）方法，在102个精神分裂症患者核心家系中检测PIP3-E基因上的4个单核苷酸多态性（SNPs），对结果进行传递不平衡检验（TDT）和单倍体相对风险（HRR）分析，并进行SNP与临床症状的关联性分析。结果PIP3-E基因上的4个SNP基因型在患者组和父母组的频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡；TDT分析结果表明，杂合子父母双亲传递给患病子女的不同等位基因均未偏离50％（P〉0．05）；HRR分析结果表明，各位点等位基因在病例组和对照组中的频数分布差异均无统计学意义（P〉0．05）；rs2236257位点等位基因与关系妄想、自责自罪妄想以及思维连贯性障碍3种临床症状相关联，其基因型与关系妄想、自责自罪妄想相关联（P〈0．05）。结论PIP3-E基因可能不是精神分裂症的易感基因。     

PCYT1B基因多态性与精神分裂症的关系

目的探讨PCYT1B基因多态性与中国北方汉族人群精神分裂症的关系。方法以261个由精神分裂症患者及其健康父母双亲组成的核心家系为研究对象，采用聚合酶链式反应一限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）的方法对以上样本进行PCYT1B基因型检测，应用SPSS 12．0统计学软件进行数据管理及分析。结果女性患者组和母亲组中基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律（P〉0．05）；单倍型相对风险分析（HHRR）结果显示，传递和未传递的等位基因c、T的频数分布无统计学意义（X^2=0．892，P〉0．05）；传递不平衡检验（TDT）分析结果表明，杂合子母亲的两个不同等位基因传递概率没有偏离50％（Y。=0．916，P〉0．05）。结论PCYT1B基因可能不是精神分裂症的易感基因。     

人类白细胞抗原DRB1基因多态性与三氯乙烯药疹样皮炎易感性的关系

目的研究人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)基因多态性与三氯乙烯药疹样皮炎易感性的关系。方法应用聚合酶链反应产物直接测序方法,比较112例三氯乙烯药疹样皮炎病例和142例健康三氯乙烯接触工人HLA-DRB1基因第2外显子氨基酸密码子多态性及等位基因频率分布,并计算相对危险度(OR)及其95%可信区间(95%CI)。结果病例组与接触对照组HLA-DRB1等位基因频率差异有显著性,病例组DRB1*1501、*1202和*04等位基因频率显著高于对照组(分别为18.8%vs7.7%,OR=2.748,95%CI=1.587～4.761;12.5%vs6.0%,OR=2.244,95%CI=1.195～4.214;17.4%vs11.3%,OR=1.660,95%CI=1.002～2.750),而DRB1*0301、*0901、*13和*1502等位基因频率显著低于对照组(分别为0.4%vs4.6%,OR=0.093,95%CI0.012～0.720;7.6%vs13.7%,OR=0.516,95%CI=0.283～0.939;1.3%vs6.7%,OR=0.189,95%CI=0.055～0.648;2.7%vs8.5%,OR=0.298,95%CI=0.120～0.743);病例组与接触对照组间12个位点(密码子9、11、12、13、26、28、30、33、37、70、71、74)氨基酸密码子多态性分布频率差异有显著性。结论HLA-DRB1基因多态性可能是导致三氯乙烯药疹样皮炎个体易感性差异的原因之一。     

XRCC1基因多态性与辐射致染色体损伤易感性的关系

目的研究DNA修复基因XRCC1多态性与辐射致染色体损伤易感性的关系。方法选择染色体异常的放射人员(224名)作为病例组。同时按1∶1配对选择无染色体损伤的放射人员为对照(224名)。以多聚酶链反应-限制性长度多态性分析(PCR-RFLP)技术检测XRCC1基因,比较不同基因型与染色体损伤易感性的关系。结果病例组XRCC126304CT和TT基因型频率为40.63%和13.84%,分别高于对照组的32.59%和8.04%(P<0.05);携带XRCC126304CT和TT基因型个体发生辐射致染色体损伤的风险分别是携带26304CC基因型个体的1.63倍(OR=1.63,95%CI1.09～2.43)和2.25倍(OR=2.25,95%CI1.19～4.24)。XRCC126304T等位基因频率病例组(34.15%)高于对照组(24.33%),差异有显著性(P<0.01)。XRCC1G27466A、G28152A和G36189A基因型频率和等位基因频率在两组中的分布差异均无显著性(P>0.05)。结论XRCC1C26304T基因多态性与辐射致染色体畸变有关联。未发现XRCC1G27466A、G28152A和G36189A基因多态性与辐射致染色体畸变有关。     

XRCC1基因多态性与辐射致染色体损伤的关系

目的探讨XRCC1基因的多态性与辐射致染色体损伤程度的关系,从基因水平探讨辐射损伤的修复机制。方法选择从事放射线工作工龄>1 a、出现染色体损伤的人员(224名)作为病例组,根据染色体畸变类型和细胞畸变率将病例分为轻度和重度损伤组,采用1∶1配对设计,从放射人员健康检查中选择与病例组同性别、同民族、年龄相差≤5岁、与病例组在同一工作岗位、工龄相差≤1 a无染色体损伤和血象异常的人员为对照组。盐析法提取基因组DNA,采用多聚酶链反应—限制性片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP)检测基因型。结果XRCC1226304、27466、28152、36189位点各基因型及等位基因频率在轻度损伤组与对照组分布比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。重度损伤组携带26304位点T等位基因的频率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01),携带26304CT/TT基因型的放射线工作者发生染色体重度损伤的风险是携带其他基因型个体的1.89倍,其他3个位点的等位基因和基因型频率两组分布比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论XRCC126304位点T等位基因为染色体损伤的危险因素,携带26304CT/TT基因型的放射线接触者易发生染色体损伤且损伤程度重。该研究未发现XRCC127466、28152、36189位点基因多态性与辐射导致的染色体损伤程度有关联。     

焦炉工XRCC1基因多态性与淋巴细胞染色体损伤易感性的关系

目的研究焦炉工XRCC1基因多态性与外周血淋巴细胞染色体损伤易感性的关系。方法选取141名焦炉工和66名医护人员作为研究对象。以尿中1羟基芘浓度评价多环芳烃暴露内剂量,采用双核淋巴细胞微核的方法评价个体染色体损伤水平,聚合酶链反应限制性片段长度多态性的方法分析XRCC1基因4个单体型标签单核苷酸多态性位点(C26304T、G27466A、G28152A和G36189A),Clark运算法则确定个体XRCC1基因的单体型等位基因和单体型对,协方差分析校正年龄、性别、环氧化物水化酶基因型组合和尿1羟基芘水平,比较具有不同XRCC1基因型或单体型对个体外周血淋巴细胞微核率的差异。结果焦炉工尿1羟基芘为12.0μmol/mol肌酐(95%CI值为10.4～13.9μmol/mol肌酐),微核率为(0.95±0.66)%;对照组的尿1羟基芘为0.7μmol/mol肌酐(95%CI值为0.6～1.3μmol/mol肌酐),微核率为(0.40±0.36)%,差异有统计学意义,P<0.01。焦炉工的XRCC1基因CGGG单体型与外周血淋巴细胞染色体损伤水平降低有关联,TGGG和CGAG单体型与染色体损伤水平显著性增加有关联。结论焦炉工XRCC1基因多态性可影响其染色体损伤的易感性,基于XRCC1单体型的关联研究比基于单个单核苷酸多态性的研究更为敏感。     

FHIT基因与宫颈癌的关系研究进展

3号染色体短臂一直是许多研究关注的热点，因为它可能是肿瘤抑制基因位点。1996年发生在3p族中一个重要的事件是在一家族性肾癌中观察到与交叉移位（3；8）（p14．2；q24）有关的基因被克隆出来。该基因被命名为脆性组氨酸三联体（fragile histidine triad，FHIT），它编码二核苷酸5’，5＇＇＇-P1，P3三磷酸水解酶。     

DNA修复基因XRCC1和XRCC3多态性与慢性苯中毒易感性的关系

目的探讨DNA修复基因XRCC1、XRCC3多态性与慢性苯中毒遗传易感性的关联及其与慢性苯中毒潜伏期的关系。方法采用病例-对照研究方法,以确诊并已脱离苯作业的80名慢性苯中毒患者为病例组,以同期接苯的62名苯作业工人为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析技术,检测XRCC1基因C26304T(Arg194Trp)、G27466A(Arg280His)、G28152A (Arg399Gln)、G36189A(Gln632Gln),位点和XRCC3基因C18067T(Thr241Met)位点的多态性,并采用生存分析方法对慢性苯中毒的潜伏期进行分析。结果携带XRCC3 18067C／T基因型的个体发生慢性苯中毒的危险性低于携带XRCC3 18067C／C基因型的个体(OR=0．233,95％CI:0．085～0．639,P=0．0046);携带XRCC1 27466G／G基因型的个体发生慢性苯中毒的潜伏期比携带27466G／A或A／A基因型的个体长6年。结论在相同的苯作业暴露环境下,携带XRCC3 18067T变异等位基因的个体发生慢性苯中毒的危险性降低;在慢性苯中毒患者中,携带XRCC1 27466 G／G基因型的个体发生慢性苯中毒的潜伏期较长。     

Lack of an association human dioxin detoxification gene polymorphisms with endometriosis in Japanese women: results of a pilot study

Objectives

Endometriosis is a chronic disease caused by the presence of endometrial tissue in ectopic locations outside the uterus. Chronic exposure to the environmental pollutant dioxin has been correlated with an increased incidence in the development of endometriosis in non-human primates. We have therefore examined whether there is an association between the polymorphisms of ten dioxin detoxification genes and endometriosis in Japanese women.

Methods

This was a pilot study in which 100 patients with endometriosis and 143 controls were enrolled. The prevalence of five microsatellite and 28 single nucleotide polymorphism markers within ten dioxin detoxification genes (AhR, AHRR, ARNT, CYP1A1, CYP2E1, EPHX1, GSTM1, GSTP1, GSTT1, NAT2) was examined.

Results

Taking into account that this analysis was a preliminary study due to its small sample size and genetic power, the results did not show any statistically significant difference between the cases and controls for any of the allele and genotype frequency distributions examined. In addition, no significant associations between the allele/genotype of all polymorphisms and the stage (I–II or III–IV) of endometriosis were observed.

Conclusion

Based on the findings of this pilot study, we conclude the polymorphisms of the ten dioxin detoxification genes analyzed did not contribute to the etiology of endometriosis among our patients.

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.1007/s12199-012-0281-y) contains supplementary material, which is available to authorized users.     

精神分裂症与亲核素β基因多态性关系

目的探讨亲核素β(KPNBs)中KPNB1和KPNB2基因与精神分裂症的关系。方法采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,收集中国吉林省汉族精神分裂症患者及其健康父母双亲组成的233个核心家系成员,分别检测位于KPNB1和KPNB2基因上的2个单核苷酸多态性(SNPs)rs11871606和rs266443。利用拟合优度χ²检验分析等位基因和基因型分布频率是否符合哈迪-温伯格定律(Hardy-WeinbergLaw),应用遗传统计学软件(UNPHASED)进行2个SNPs的传递不平衡检验(TDT)以及双位点联合作用分析。结果患者组与其父母组比较,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443等位基因和基因型频率的分布差异均无统计学意义(P>0.05),符合Hardy-Weinberg平衡定律;TDT结果提示,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443与精神分裂症无连锁及关联。双位点联合作用分析结果显示,rs11871606与rs266443两位点未显示联合作用(P>0.05)。结论KPNB1基因rs11871606位点及KPNB2基因rs266443位点多态性可能与精神分裂症无关,但不能排除KPNB1基因及KPNB2基因其他SNPs与精神分裂症相关联。     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

胞浆型磷脂酶A2家族基因多态性与精神分裂症的关联性研究

目的 探讨中国北方汉族人群胞浆型磷脂酶A2(cPLA2)家族基因多态性与精神分裂症的遗传关联性.方法 采用聚合酶链反应(PCR)和连接酶检测反应(LDR)方法,在201个精神分裂症患者核心家系中检测cPLA2家族基因上的10个单核苷酸多态性(SNPs),对结果进行单倍型相对风险分析(HRR)、传递不平衡分析(TDT)、单倍型分析和多位点联合分析.结果 各位点在精神分裂症病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡.HRR和TDT分析表明,检测的10个SNPs位点与精神分裂症无关联性(P＞0.05).单倍型分析结果显示,由同一染色体上各位点组成的单倍型与精神分裂症均无关联性(P＞0.05).多位点联合作用分析显示,rs2162886与rsl668589,rs891014与rsl668589,rs2307279与rs7542180位点的联合作用与精神分裂症相关联(χ²=6.913,P=0.032;χ²=8.393,P=0.015;χ²=8.447,P=0.038).结论 cPLA2家族基因中存在多个与精神分裂症关联的易感位点.     

PLA2G4C基因多态性与精神分裂症的遗传相关性

目的探讨中国北方汉族人群PLA2G4C基因多态性与精神分裂症的遗传相关性.方法采用聚合酶链反应（PCR）和限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）方法,在240个精神分裂症患者核心家系中检测PLA2G4C基因上的6个单核苷酸多态性（SNPs）,对结果进行单倍型相对风险（HRR）分析和传递不平衡分析（TDT）.结果在所检测的6个SNPs中,只有rs1366432和rs1549637位点在北方汉族人群中具有高度的多态性.rs1366432和rs1549637位点在精神分裂症病例组和对照组中基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡.HRR和TDT分析表明,rs1549637位点与精神分裂症关联具有显著性（X^2=5.364,P＜0.05;X^2=5.633,P＜0.05）,而rs1366432位点与精神分裂症不存在遗传相关性（X^2=0.027,P＞0.05;X^2=0.007,P＞0.05）.结论PLA2G4C基因可能是精神分裂症的易感基因.     

Association between SNPs in miRNA-machinery genes and chronic hepatitis B in the Chinese Han population

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA-machinery genes can influence their generation and maturation, then expression and structure. To explore the relationship between three SNPs (rs3757 in DGCR8, rs636832 in AGO1, rs7813 in GEMIN4) in miRNA-machinery genes and chronic hepatitis B, we genotyped the SNPs by high resolution melting method (HRM) in a case-control study of 332 unrelated chronic hepatitis B patients and 352 unrelated healthy controls in Western China. Interestingly, the rs636832 was significantly associated with the susceptibility of CHB (genotype: AA/GA/GG: p = 0.010; allele: A/G: OR = 0.727, 95% CI = 0.575–0.920, p = 0.008). The minor allele A of rs636832 was significantly associated with a decreased risk of CHB. Additionally, the dominant model AG + GG vs. AA showed a risk of 1.442-fold (p = 0.018) with CHB. Further exploration for the association between rs636832 and HBV-DNA load in 329 cases showed no significant difference (genotype: p = 0.321; allele: p = 0.148). Neither did the association between rs636832 and the status of HBsAg and HbeAg (HBsAg: genotype p = 0.337, allele p = 0.436; HBeAg: genotype p = 0.861, allele p = 0.822). Our study first provided the evidence that rs636832 in AGO1 was associated with chronic HBV infection susceptibility in Chinese Han population. Further epidemiological and functional studies in larger populations are warranted to verify our results.     

蛋白激酶C-α基因rs228883多态性与哮喘易感性的关系

目的通过对华东地区哮喘患者和正常人群中蛋白激酶C-α(PRKCA)基因rs228883多态性分布检测,探讨rs228883位点与哮喘易感性的关系。方法对221例哮喘患者和197名的正常对照者,利用Sequenom Iplex系统检测PRKCArs228883位点的多态性后进行统计学分析。结果哮喘与正常组rs228883各基因型的分布差异有统计学意义(P<0.05);在遗传模型上,rs228883更符合超显性模型(P=0.025);与CC+TT相比,rs228883的CT杂合基因型增加了哮喘的发病风险(OR=1.60,95%CI:1.06～2.41,P=0.025)。结论 PRKCA基因多态性位点rs228883可能与哮喘发病相关,杂合基因型CT增加了哮喘发病的危险。