基于网络药理学探讨赤芍-牡丹皮药对治疗异常子宫出血的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨赤芍-牡丹皮药对治疗异常子宫出血的作用机制.方法:检索中药系统药理学平台选取赤芍-牡丹皮药对的有效元素和作用靶点;通过检索人类基因信息数据库选取异常子宫出血的疾病靶点;应用R语言筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape软件构建药物-化合物-作用靶点-疾病互作网络;运用STRING平台构...     

基于网络药理学探讨赤芍治疗黄疸的作用机制

目的:基于网络药理学探讨赤芍治疗黄疸的作用机制。方法:利用TSMSP数据库筛选赤芍的有效成分。多个数据库联合挖掘药物预测靶点和黄疸的治疗靶点,分析两个靶点集合并找出交集靶点。通过Cytoscape绘制药物有效成分-潜在治疗靶点网络图,采用String数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape软件MCODE插件进行模块化分析,并运用R软件及clusterProfiler对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出赤芍14个有效成分及对应靶点228个,黄疸相关靶点2155个,交集靶点59个。PPI网络共包含55个节点,187条连接,靶点NR1H4处于核心位置。这些靶点主要涉及脂质定位、类固醇代谢过程、脂质运输等生物学过程,主要参与了胆汁分泌、ATP结合盒式转运蛋白、PPAR信号通路等生物通路。结论:赤芍主要通过调节胆汁分泌和转运、提高药物代谢酶含量等方面治疗黄疸,运用赤芍治疗胆汁淤积性黄疸或药物性肝损伤、炎症引起的肝细胞性黄疸可能取得较好疗效。     

基于网络药理学研究赤芍防治肝癌的作用机制

目的:通过网络药理学预测赤芍防治肝癌的作用机制。方法:通过 TCMSP 数据库(https://tcmspw. com/tcmspsearch.php)检索赤芍的化学成分，通过 STD 数据库以及 SEA 数据库预测赤芍的作用靶点。通过 OMIM 数据库(http://www.omim.org/)、DrugBank 数据库(https://www.drugbank.ca/)以及 TTD 数据库(http:// d b . i d r b l a b . n e t / t t d / ) 搜 集 肝 癌 疾 病 相 关 靶 点 ，筛 选 获 得 赤 芍 成 分 作 用 靶 点 与 肝 癌 疾 病 相 关 靶 点 交 集 ，利 用 S t r i n g 平台搜集相关靶点蛋白，借助 DAVID 数据库进行 Gene Ontology 注释分析，并通过 Cytoscape 3.2.1 软件构建蛋 白 - 蛋白相互作用网络，拓扑分析得到核心靶点，进一步分析赤芍防治肝癌作用机制。结果:从中药赤芍中筛选 得到 28 个化合物成分以及 442 个作用靶点，与 148 个肝癌相关靶点取交集得到 23 个共同靶点，靶点映射获得 22 个活性成分，蛋白 - 蛋白相互作用网络有 193 个节点，722 条边，经拓扑学指标筛选得到 95 个节点，439 条边， 核心靶点有 21 个。GO 注释得到 561 条生物过程，85 条细胞组分以及 130 条分子功能的信息。结论:网络药理 学直观地显示了赤芍防治肝癌具有多成分、多靶点、多通路的特点，为后续开发治疗肝癌的药物提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨赤芍治疗肺动脉高压的活性成分及作用机制

目的 采用网络药理学研究赤芍治疗肺动脉高压的潜在作用靶点及信号通路。方法 检索TCMSP数据库得到赤芍的有效成分及作用靶点,肺动脉高压相关疾病靶点主要通过检索TTD、GeneCards和OMIM等数据库获得。通过绘制韦恩图获取赤芍和肺动脉高压的交集靶点,交集靶点蛋白相互作用网络（PPI）利用STRING数据库构建。利用DAVID数据库在线工具对赤芍和肺动脉高压的交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 获得赤芍有效活性成分共29个,包括鞣花酸、芍药苷、黄芩素和黄芩苷等,通过PPI图得到IL-6、AKT1、TNF、TP53、VEGFA等关键蛋白。富集分析显示,参与的通路主要集中在HIF-1信号通路、Toll-受体信号通路、NF-kB信号通路、和TNF信号通路等。结论 赤芍治疗肺动脉高压可能通过调节IL-6、AKT1、TNF、VEGFA和MMP9等关键蛋白,干预HIF-1信号通路、Toll-受体信号通路、NF-kB信号通路和TNF信号通路等来发挥作用,确切机制仍需要进一步的实验验证。     

牡丹皮、赤芍配伍对活血化瘀疗效及有效成分的影响

目的 探讨牡丹皮、赤芍配伍对家兔血小板聚集、凝血酶时间、血栓溶解、全血凝块溶解的影响。并考察两药配伍对没食子酸、芍药苷、丹皮酚的影响。方法 比浊法测定血小板聚集抑制率和凝血酶时间,重量法测定血栓溶解率和全血凝块溶解率,HPLC法测定主要成分的含量。结果 对照组的家兔体外血小板最大聚集率为42.62%,血浆凝血酶时间13.45?s,给予不同药液后,各组血小板最大聚集率均下降（P?<0.05）,血浆凝血酶时间均上升（P?<0.05）,其中,合煎组药效最好,其体外血小板聚集率为20.77%,凝血酶时间为21.01?s。同时24?h内,两药合煎与单煎再混合的血栓溶解率及全血凝块溶解率高于单煎牡丹皮及单煎赤芍。HPLC分析结果显示,两药合煎后与单煎再混合比较,芍药苷含量增加（P?<0.05）、没食子酸含量几乎持平,差异无统计学意义（P?>0.05）。结论 牡丹皮、赤芍合煎,能够促进有效成分的溶出,提高活血化瘀疗效,具有配伍合理性,为临床合理用药提供科学依据。     

基于数据挖掘及网络药理学探讨治疗系统性红斑狼疮经验

目的 探讨系统性红斑狼疮（systemic lupuseryth ematosus,SLE）的临床用药规律以及核心药对的潜在作用机制。方法 收集2018年2月至2022年1月浙江中医药大学附属第二医院风湿免疫科,建立处方数据库,进行频数分析及关联规则分析挖掘核心治疗药对,并利用网络药理学方法对核心药对机制进行分析。结果 共有116例医案纳入研究,关联分析后发现生地黄-牡丹皮-赤芍是治疗SLE的核心药对;应用网络药理学方法筛选该药对后共获得115个药物-疾病共同靶点;hub基因网络发现STAT3、MAPK1、AKT1和白细胞介素-6（interleukin 6,IL-6）可能是核心药对治疗SLE的关键疗效靶点。结论 SLE关键病位在肝,病机以“热毒、阴虚、血瘀”为主,治疗上以调肝、清热、滋阴、祛瘀为要,并以生地黄-牡丹皮-赤芍为核心治疗药对,该药对的关键疗效靶点可能是STAT3、MAPK1、AKT1和IL-6通路。     

基于网络药理学探讨血府逐瘀汤中川芎-赤芍药对调节血管新生的分子机制

目的:分析血府逐瘀汤关键药对川芎-赤芍调节血管新生的物质基础和作用机制。方法:从TCMSP数据库及Drug Bank数据库挖掘川芎-赤芍的成分及其对应靶蛋白,从GeneCards数据库获取“血管新生”相关基因;利用Omicshare数据库中的Venn功能获取川芎-赤芍干预血管新生的靶点后,借助Cytoscape(3.8.2)软件构建“活性成分—川芎-赤芍调节血管新生靶蛋白”网络关系图,在String数据库构建“川芎-赤芍调节血管新生靶蛋白—人类蛋白”互作网络,并筛选核心靶点;所得靶点的基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析在Omicshare网站进行。借助AutoDock vina软件对核心靶点和关键活性成分进行分子对接。结果:获得川芎-赤芍活性成分20种,相关靶蛋白117种,川芎-赤芍调节血管新生靶蛋白72个,其中,关键活性成分为黄芩素、鞣花酸、β-谷甾醇、豆甾醇、杨梅酮、(+)-儿茶素、阿魏酸、川芎嗪等,关键靶蛋白为蛋白激酶Bα(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、P53肿瘤蛋白(TP53)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、环加氧酶2(PTGS2)、热休克蛋白90αA1(HSP90AA1)、c-fos原癌基因蛋白(FOS)等。GO结果提示,该药对在细胞增殖、生长、生物粘附、细胞聚集等方面影响血管新生;通路富集结果显示,AGE-RAGE通路、IL-17通路、流体剪应力与动脉粥样硬化信号通路等是药物作用的主要通路。分子对接提示核心靶点与关键化合物具有良好的结合能力。结论:血府逐瘀汤中的川芎-赤芍药对通过多靶点、多途径对血管新生起调节作用,为血府逐瘀汤干预血管新生的进一步研究及临床应用提供一定理论依据。     

基于网络药理学探讨白术-茯苓配伍治疗代谢综合征的作用机制

目的:基于网络药理学探讨白术-茯苓治疗代谢综合征(metabolic syndrome,MS)的作用机制.方法:结合中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和文献检索,筛选白术-茯苓药对的活性成分.通过PharmMapper数据库预测各成分作用靶点,并使用Universal Protein(UniProt)数据库规范靶点名称.从人类基因数据库(GeneCards)、治疗靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、Dis-GeNET三个数据库中筛选MS相关靶点后,与白术-茯苓各成分作用靶点合并取交集得到白术-茯苓治疗MS的潜在靶点,导入Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络.通过String平台和Cytoscape软件构建蛋白质互相作用网络,并用插件CytoHubba筛选核心靶点.用R软件对白术-茯苓治疗MS的潜在靶点进行基因本体(gene ontol-ogy,GO)分子功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析.结果:筛选得到白术-茯苓活性成分26种,治疗MS的重要成分为茯苓新酸A、14-乙酰基-12-千里光酰基-8-顺式白术三醇、茯苓新酸B、7,9(11)-去氢茯苓酸、茯苓新酸C等;潜在治疗靶点47个,核心靶点包括血清白蛋白(albumin,ALB)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶 1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、雌激素受体1(estrogen receptor,ESR1)、MAPK8、MAPK14等;分子功能主要涉及调节类固醇激素受体活性、类固醇结合、核受体活性等;信号通路主要涉及雌激素信号通路、晚期糖基化终产物及其受体(advanced gly-cation end product-receptor,AGE-RAGE)信号通路、叉头转录因子(forkhead box 0,FoxO)信号通路、受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine-protein kinase,ErbB)信号通路、白细胞介素-17(interleukin17,IL-17)信号通路等.结论:白术-茯苓药对可通过多成分、多靶点、多途径发挥对MS的治疗作用,为实验研究提供一定理论参考.     

赤芍总苷治疗缺血性脑血管病作用及其机制

在以往工作的基础上,系统观察了赤芍总苷(Total paeony glycoside,TPG)对血液系统功能的影响,并通过建立整体和体外脑缺血样损伤等模型,从不同研究层次全面分析赤芍总苷治疗缺血性脑血管病作用及其机制。 1 TPG整体给药对血液流变学系统的影响应用多项血液流变学检测方法和小鼠体内血栓形成模型来研究TPG对微循环、血液粘度、血小板聚集、血栓形成和内外源性凝血系统功能的影响。结果表明,小鼠一次性分别灌服TPG 40 min后,耳廓微循环检测即发现小鼠耳廓微循环中毛细血管开放数量增加,微动脉和微静脉口径增大。     

基于网络药理学探讨麻黄-全蝎配伍治疗咳嗽变异性哮喘的作用机制

目的 基于网络药理学探讨麻黄-全蝎配伍治疗咳嗽变异性哮喘的有效活性成分,预测其治疗咳嗽变异性哮喘的作用靶点及机制。方法 使用TCMSP、TCMID数据库,Swiss Target Prediction网站检索麻黄、全蝎的活性成分及靶点,使用Genecards数据库获取与咳嗽变异性哮喘相关的基因。通过String网站和Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点”网络和蛋白互作网络(PPI网络),采用David数据库对麻黄-全蝎治病靶点进行GO功能生物过程富集分析(BP)和KEGG通路富集分析。结果 麻黄-全蝎作用于咳嗽变异性哮喘的有效成分有23个、靶点67个,关键成分有:木犀草素(luteolin)、槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)、胆甾醇(cholesterol)等;核心靶点涉及:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、表皮生长因子(EGFR)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(Src)、雌激素受体(ESR1)等;GO功能生物过程富集分析显示其主要涉及细胞凋亡、炎症反应、磷酸化等生物过程,KEGG通路...     

基于网络药理学的左归丸治疗骨质疏松作用机制探讨

目的:采用网络药理学方法探究左归丸对治疗骨质疏松的有效活性成分、作用靶点和潜在分子机制.方法:利用TC-MSP数据库预测左归丸活性成分,筛选潜在的活性成分及作用靶点,在GeneCards数据库检索出骨质疏松相关的疾病靶点基因,通过Drugbank和Uniprot数据库筛选后,得到左归丸—骨质疏松疾病交集基因.采用Cyt...     

基于网络药理学探讨女贞子治疗动脉粥样硬化的作用机制

[目的] 基于网络药理学和生物信息学方法分析女贞子治疗动脉粥样硬化的分子生物学机制。[方法] 基于TCMSP数据库与文献挖掘女贞子中化学成分; 利用PharmMapper网站预测女贞子化学成分靶点, 构建"成分-靶点"网络; 利用TTD、DisGeNET、DrugBank数据库筛选与AS疾病作用相关靶点。利用Cytoscape软件对化合物靶点和AS疾病靶点进行网络拓扑分析。利用STRING数据库对共有靶点构建PPI网络, 进行GO分析和KEGG分析。采用油红O染色和检测细胞内总胆固醇含量评价红景天苷和毛蕊花糖苷抗动脉粥样硬化活性。[结果] "成分-AS疾病靶点"网络显示14个活性成分和170个疾病靶点; 女贞子化学成分和动脉粥样硬化共同靶点9个; GO分析确定352个条目, KEGG通路富集结果确定了14条与AS相关的通路。细胞实验显示红景天苷和毛蕊花糖苷显著减少泡沫细胞的形成, 降低细胞内胆固醇含量。[结论] 女贞子中苯乙醇苷类化合物可能通过调节AMPK、PPAR信号通路调节胆固醇代谢发挥抗动脉粥样硬化作用。     

基于网络药理学探讨何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制

目的:基于网络药理学,探讨何首乌治疗动脉粥样硬化(AS)的作用靶点及通路,明确其作用机制。方法:搜索中医药数据库和文献,从中对何首乌有效成分及靶点蛋白进行筛选整合,在TCMSP数据库和Drugbank数据库中检索并获取何首乌有效成分及作用靶点,在Cytoscape软件中构建何首乌的化合物-靶点网络及其相应的蛋白质相互作用(PPI)网络,并在DAVID数据库中进行基因GO功能和KEGG通路富集分析。筛选出何首乌治疗动脉粥样硬化的有效成分及作用靶点,并绘制靶点通路网络模型。结果:预测得出治疗AS的药物活性成分8个和有效靶点109个,并推断奎硫醇、大黄酸、扁蓄苷等成分具有潜在治疗动脉粥样硬化的作用,如钙调蛋白、醛糖还原酶、胰蛋白酶等靶基因可能起着关键性的作用。结论:基于网络药理学探究了何首乌治疗动脉粥样硬化多活性成分-多作用靶点-多联系通路的特点,进行深入研究,以期为系统阐明何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制提供科学依据。     

基于网络药理学探讨柴胡治疗动脉粥样硬化作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨柴胡治疗动脉粥样硬化的有效活性成分及靶点的作用机制.方法 该研究运用TCMSP数据库结合筛选条件确定柴胡的主要有效活性成分及其作用靶点,构建主要有效活性成分-靶点网络图.利用GeneCards数据库获取动脉粥样硬化疾病靶点,取柴胡和动脉粥样硬化的交集靶点,对交集靶点进行蛋白质互相作用网络分析...     

基于网络药理学探讨何首乌-丹参治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的应用网络药理学方法预测何首乌-丹参抗阿尔茨海默病(AD)的作用靶点及相关信号通路,挖掘其抗AD的作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)网站检索何首乌-丹参的活性成分及对应的作用靶点,再通过Drugbank数据库、Dis Ge NET数据库和TTD数据库获得AD的主要致病靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件构建药物活性成分-靶点网络图,利用STRING数据库构建蛋白与蛋白相互作用网络,然后运用生物信息学的方法对关键靶点进行基因功能分析和通路富集分析,最后采用MTT法、ELISA法、比色法和实时荧光定量PCR法对网络药理学主要预测的生物过程与信号通路进行验证。结果研究共筛选出何首乌-丹参药对的有效成分24个,对应靶点274个,与AD相关靶点共107个,相关信号通路前10条,GO分析相关度前20个靶点分子功能。细胞实验证实了何首乌-丹参能有效提高PC12细胞的细胞存活率及抑制PC12细胞的炎症反应和氧化应激反应,并促进Nrf2/HO-1信号通路的激活。结论何首乌-丹参主要是通过抗炎和抗氧化应激对AD产生重要的治疗作用,为后续临床治疗AD提供新的思路。     

基于网络药理学探讨猫爪草治疗肺癌的作用机制

目的 基于网络药理学探讨猫爪草治疗肺癌的作用机制.方法 采用TCMSP数据库对猫爪草的化学成分进行收集和筛选,通过Swiss target prediction平台预测活性成分的作用靶点,使用DisGeNet数据库和OMIM数据库查询肺癌相关靶点,并与药物靶点进行映射,获取共同靶点.采用String数据库获取共同靶点的...     

基于网络药理学探讨四妙勇安汤治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的运用网络药理学方法分析四妙勇安汤治疗动脉粥样硬化(AS)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、疗效药靶数据库(TTD)筛选金银花、玄参、当归、甘草4味中药的化学成分;利用人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、中草药化合物蛋白质靶标信息(HIT)和TTD数据库预测、筛选四妙勇安汤治疗AS的作用靶点;采用病种分值法(DIP)数据库构建4味中药化学成分与AS靶标之间的交互靶标,采用Cytoscape 3.5.1软件构建网络关系图,通过度中心度(degree centrality)和介数中心度(betweenness centrality)、接近中心度(closeness centrality)等网络拓扑特征对四妙勇安汤的"药材-化合物-靶点-疾病"进行网络评价,利用数据可视化(DAVID)数据库对其涉及的通路进行分析。结果四妙勇安汤共筛选得到191个活性成分,其中槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮为主要有效成分;涉及靶点165个,其中19个为直接靶点,为四妙勇安汤治疗AS的重要潜在靶点,最终预测出四妙勇安汤治疗AS的机制主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、钙离子信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路和环腺苷3’,5’-单磷酸(cAMP)信号通路等。结论初步明确了四妙勇安汤多组分、多靶点的作用特点,为进一步研究四妙勇安汤治疗AS的作用机制奠定基础。     

基于网络药理学探讨桃红四物汤治疗血脂异常作用机制

目的 基于网络药理学方法分析桃红四物汤治疗血脂异常的有效成分及机制.方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取桃仁、红花、川芎、当归、熟地、白...