基于网络药理学探讨秦七风湿方治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨秦七风湿方(QQFSF)治疗类风湿性关节炎(RA)的物质基础及其作用机制.方法:通过中医百科全书数据库(ETCM)检索QQFSF中珠子参、秦艽、山茱萸3味中药的成分和靶点;从NCBI、Geencards数据库中检索RA的相关靶点,将QQFSF治疗RA的靶点通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络...     

基于网络药理学-分子对接探讨益气养阴通络方抗类风湿关节炎的作用机制

[目的]采用网络药理学与分子对接探究益气养阴通络方干预类风湿关节炎（RA）的作用机制。[方法]通过中药系统药理学数据库及分析平台（TCMSP）、本草组鉴（HERB）和文献查阅获得复方活性成分与靶点,采用Genecards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）等数据库获得疾病靶点,然后采用数据库计算出益气养阴通络复方成分与疾病的交集靶点。对交集靶点施行功能和通路富集分析,选取益气养阴通络方核心药物靶点与关键化合物施行分子对接。[结果]网络药理学共筛选出益气养阴通络方的83种活性成分和779个潜在靶点,RA相关靶点5 393个,交集靶点465个,其中交集核心靶点9个（分别为SRC、STAT3、MAPK3、MAPK1、HSP90AA1、PIK3R1、GRB2、AKT1、PIK3CA）。富集得出PI3K-AKT、癌症相关及神经活性配体-受体相互作用等通路,其中PI3K-AKT信号通路可能是复方干预RA的关键通路之一。对接计算表明,益气养阴通络方的11种主要活性成分与关键靶点SRC、STAT3、PIK3R1、AKT1均有较稳定的结合,其中与AKT的结合可能最大。[结论]益气养阴通络方通过多成分-...     

清热活血汤治疗类风湿性关节炎临床研究

目的：观察清热活血汤治疗类风湿性关节炎的临床疗效。方法：选取类风湿性关节炎患者35例,所有患者均用清热活血汤进行调理和治疗,并随症加减。结果：35例患者经治疗,痊愈19例,显效14例,总有效率为94．3％;治疗后双手平均握力为（11.3±1．8）kg,平均晨僵时间为（0．4±0,1）h,患者平均疼痛指数为（3．8±1．5）,平均肿胀指数为（4．4±1．9）,数据结果与治疗前相比,差异均有统计学意义（P〈0．05）。结论：清热活血汤治疗类风湿性关节炎具有较好的临床疗效。     

基于网络药理学探讨丹参饮治疗冠心病的作用机制

目的:采用网络药理学方法解析丹参饮治疗冠心病的药理机制。方法:使用中药系统药理学分析平台(TCMSP),检索丹参、檀香、砂仁3味中药的有效成分和作用靶点。使用DisGeNET数据库检索冠心病靶基因。利用Cytoscape软件构建丹参饮化合物-冠心病靶点网络和靶点-通路网络。通过DAVID数据库进行生物功能和信号通路富集分析,预测丹参饮治疗冠心病的作用机制。结果:通过数据库筛选出丹参饮活性成分76个,相应靶基因156个,冠心病靶基因912个,丹参饮治疗冠心病靶点53个,核心作用靶点16个,相互作用节点96个,相互作用关系边838条,涉及生物过程84个,分子功能23个,信号通路11条。结论:丹参饮可能通过多靶点、多信号通路协同治疗冠心病。     

基于网络药理学探讨桂枝-白芍药对治疗类风湿性关节炎作用机制

目的：基于GEO 基因芯片、生物信息学及分子对接技术探讨桂枝-白芍药对治疗类风湿性关节炎（RA） 的作用机制。方法：通过GEO 数据库下载RA 的基因芯片数据集,利用R 软件筛选出差异表达靶点;通过TCMSP、PharmMapper 等数据库获取桂枝-白芍药对的化学成分、药物靶点,运用Cytoscape 3.9.1、R软件对药物-疾病交集靶点进行蛋白互作（PPI） 网络拓扑分析;应用clusterProfiler 等程序包对于交集靶点进行基因本体（GO）、京都基因和基因组（KEGG） 富集分析;使用AutoDock Vina 等软件进行分子对接初步验证。结果：共获得17 个药物化学成分,RA 靶点3 781 个、药物靶点410 个;筛选出药物-疾病交集靶点98 个。PPI 拓扑分析得出的核心靶点有基质金属蛋白酶-9 （MMP-9）、基质金属蛋白酶-2 （MMP-2）、过氧化氢酶（CAT）、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族A 成员1（SERPINA1）、组织蛋白酶B（CTSB） 等;桂枝-白芍药对治疗RA 主要化学化合物有二氢槲皮素、β-谷甾醇、（+） -儿茶素、芍药苷等。潜在作用靶点参与了胶原分解代谢过程、细胞外基质分解、炎症反应调节等生物过程,涉及通路有溶酶体、过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR） 信号通路、细胞色素P450 代谢等。分子对接显示,桂枝-白芍药对主要化学化合物与核心靶点间结合能有较高的结合活性。结论：桂枝-白芍治疗RA 多靶点、多成分、多途径的作用机制,为桂枝-白芍药对的后续研究提供了理论依据。     

乳香-没药治疗类风湿性关节炎的网络药理学和生物信息学分析

目的:研究乳香-没药药对治疗类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)的作用机制.方法:依托GEO、Gene-Cards、OMIM数据库挖掘RA相关基因并进行合并.通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索乳香-没药的有效化学成分和相关靶点,使用Cytoscape 3.8.0软件绘制"药...     

基于网络药理学探讨五苓散治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:采用网络药理学的方法,对五苓散(WLS)治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制进行研究探讨。方法:通过在中药系统药理学数据库(TCMSP)平台对五苓散进行活性成分筛选、在Drag Bank数据库进行靶点预测,应用Cytoscape3. 2. 1软件构建成分-靶点网络;在TTD,Drug Bank及Dis Genet数据库中进行检索,获取疾病靶点;构建韦恩图,得到五苓散治疗RA的作用靶点;并进行基因本体(GO)功能注释和东京基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;构建五苓散中药-成分-靶点-信号通路网络,使用Network Analyzer进行网络特征分析。结果:研究显示共挖掘到五苓散中52种成分及297个潜在靶点,RA疾病1 845个相关靶点,得到五苓散-疾病共同靶点49个,共同作用靶点主要富集于322个生物过程和31条信号通路上。结论:五苓散可能是通过调节前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2),转化生长因子-β1(TGF-β1),半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-3(Caspase-3),转录因子p65(RELA),孕激素受体(PGR)等靶点,调控癌症相关通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,白细胞介素17(IL-17)信号通路,核转录因子-κB(NF-κB)信号通路,Th17细胞分化等通路,从而抑制炎症反应、调节免疫功能及调控细胞凋亡来治疗类风湿关节炎。     

基于网络药理学和实验验证探讨山豆根治疗类风湿性关节炎的作用机制

基于网络药理学、分子对接以及实验验证探讨山豆根治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的作用机制。首先通过TCMSP和TCMID等数据库以及相关文献查找山豆根的主要化学成分;借助TCMSP和SwissTargetPrediction等数据库查找山豆根主要作用靶点;通过GeneCards、DrugBank、OMIM和TTD等数据库获取RA的主要靶点;选择Venny 2.1.0平台获取两者的交集靶点;通过Cytoscape 3.6.1软件构建“成分-靶点”网络;利用STRING平台和Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白互作网络;随后通过DAVID 6.8数据库进行生物过程富集分析和通路富集分析;利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证。最后构建胶原诱导型类风湿性关节炎小鼠模型,采用Western blot实验检测核心靶点蛋白表达。网络分析结果得到槲皮素(quercetin)、染料木素(genistein)、山柰酚(kaempferol)、大豆皂苷C(subprogenin C)和黄豆苷元(daidzein)等27个活性成分,信号转导和转录活化因...     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗类风湿关节炎的作用机制

文章采用网络药理学方法探讨玉屏风散治疗类风湿关节炎(RA)的作用及其作用机制。以TCMSP查询并筛选玉屏风散的成分及靶标,通过DAVID查询玉屏风散可能治疗疾病的类型,通过TTD、Drugbank、Polysearch等多个数据库查询治疗RA的相关靶标,依据多个相互作用数据库的数据,构建玉屏风散体内对抗RA的蛋白相互作用网络,通路富集分析玉屏风散治疗RA的可能通路。相关结果采用Cytoscape 3.3.0进行可视化研究。疾病分析结果表明玉屏风散可治疗RA和一些过敏及炎症相关疾病,玉屏风散靶标与TTD数据库中RA靶标的映射表明玉屏风散对目前治疗RA的靶标中的19.4%有调控作用,玉屏风散对抗RA体内蛋白质反应网络结果表明玉屏风散主要可通过RELA、TP53、IKBKB、JUN等蛋白治疗RA。通路富集表明玉屏风散可通过MAPK、T细胞受体信号通路等发挥抗炎及免疫调节作用治疗RA。可见,玉屏风散对RA可发挥治疗作用,其主要机制为调控RELA、TP53、IKBKB、JUN等蛋白通过MAPK、T细胞受体等信号通路从抗炎和免疫调节方面来治疗RA。     

基于网络药理学探讨土茯苓治疗痛风的作用机制

目的运用网络药理学预测土茯苓抗痛风有效成分的作用靶点及通路。方法通过TCMSP数据库和Drugbank数据库获取土茯苓有效成分及作用靶点,并运用Cytoscape软件构建靶点间相互作用网络并进行交联分析,筛选出土茯苓治疗痛风的有效成分及作用靶点,采用MAS3.0生物分子功能系统获取通路的相关信息并制成靶点通路网络模型。结果预测得到土茯苓治疗痛风的有效成分11个和有效靶点39个,并推断其作用机制可能与脂肪细胞因子信号通路、ERbB信号通路,Toll样受体信号通路等有关,且MAPK1、RELA、PTGS2等靶点基因可能起着关键性的作用。结论基于网络药理学探讨了土茯苓治疗痛风多成分-多靶点-多通路的作用特点,为进一步开展土茯苓治疗痛风作用机制研究提供了新的思路和方法。     

应用网络药理学探究壮医清毒伸筋方治疗类风湿关节炎的作用机制

目的：网络药理学探究壮医清毒伸筋方治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)获取清毒伸筋方与RA交集靶点。网络可视化和分析软件(Cytoscape)获取主要活性成分,归一化相互匹配法(NCC)计算核心靶点。对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,用分子对接分析主要活性成分与核心靶点的结合力。构建胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠模型验证主要蛋白浓度。结果：获得145种活性成分和238个药靶点,交集靶点151个。富集分析提示交集靶点涉及19个GO富集分析条目和晚期糖基化终末产物(AGEs)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等75条信号通路。主要活性成分为槲皮素、柄花黄素、豆甾醇、木犀草素、β-谷甾醇;分子对接结果显示它们与前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)等蛋白具有良好的结合性。动物实验验证,清毒伸筋方有效减轻CIA大鼠关节肿胀程度,显著降低血清MMP9、AKT1和PTGS2浓度。结论：清毒伸筋方发挥多成分、多靶点、多通路特点作用于RA的炎症级联反应。     

基于网络药理学及分子对接研究益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制

目的:运用网络药理学及分子对接预测益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取益气养阴清热方6味中药的化学成分和作用靶点.通过Gene-Cards数据库获取治疗2型糖尿病相关靶点;利用R软件获取有效成分与疾病相关靶点之交集;利用Cytos...     

基于网络药理学及分子对接研究益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制

脾、胃、肝、肾是人体代谢生理的重要脏腑,脾胃之受纳运化、肝之疏泄、肾之气化共同参与营养物质的合成、分解、转化,完成体内物质的利用与更新。在饮食、情志、遗传及体质因素影响下,脾胃肝肾系统失调,会导致肥胖、2型糖尿病、高尿酸血症、代谢综合征等代谢性疾病。从脾胃肝肾论治代谢性疾病,强调在健脾、清胃、疏肝、益肾等基础治法上,关注不同疾病的关键脏腑和辨证特点,以期对代谢性疾病的治疗提供新思路。     

基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤的作用机制

目的:基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制.方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出通窍活血汤潜在活性成分及靶点,采用GeneCard与OMIM数据库获得颅脑损伤疾病靶点,得到通窍活血汤的中药与TBI的交集靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件绘制活性成分靶点...     

基于网络药理学和分子对接探讨活血温通方治疗冠心病的作用机制＊

目的 基于网络药理学和分子对接的方法探究活血温通方治疗冠心病的作用机制。方法 通过TCMSP平台检索活血温通方药物靶点，通过GeneCards数据库检索冠心病疾病靶点，使用Cytoscape软件绘制“活血温通方-冠心病网络图”，通过STRING数据库绘制蛋白质互作网络图，利用DAVID数据库进行基因富集分析，利用Autodock vina软件进行分子对接。结果 检索得到活血温通方药物靶点158个，疾病靶点3095个。核心成分为木犀草素、丹参酮IIA、β-谷甾醇、7-甲氧基-2甲基异黄酮、刺芒柄花素、黄芩素等，核心靶点为TP53、IL6、VEGFA、MYC、MAPK1、EGFR等。KEGG通路富集分析得到103个条目，涉及PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路。分子对接结果显示核心成分与核心蛋白具有较好的结合能。结论 活血温通方治疗冠心病是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果，其机制可能涉及抑制细胞凋亡、减轻炎症、促进血管新生等方面。     

基于网络药理学与分子对接探讨土茯苓治疗银屑病的作用机制

目的：采用网络药理学方法,探索中药土茯苓治疗寻常型银屑病的“成分-靶点-通路”的调控网络,探讨其作用机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)结合文献报道,筛选土茯苓的活性成分及作用靶点。通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)数据库、PharmGkb数据库及DrugBank数据库筛选出寻常型银屑病的相关疾病靶点。运用R语言将药物成分匹配疾病靶点,通过复杂可视化网络平台Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-关键靶点-疾病”网络。采用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络数据库(STRING)构建靶蛋白PPI网络,找出关键基因,对成分-疾病的交集基因进行基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：网络分析显示,15个活性成分共涉及有效靶点325个,86条作用通路,预测出12个活性成分、114个靶点蛋白和20条关键通路与寻常银屑病相关。分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有较好的结合能。结论：土茯苓可能通过作用于IL-17信号通路及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等相关靶点起...     

基于网络药理学和药理实验的活血祛湿方治疗脂肪肝作用机制研究

目的：分析活血祛湿方的有效活性成分及其治疗脂肪肝的分子机制。方法：分别通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库查找活血祛湿方中10味中药的有效活性成分及其靶点蛋白和人类脂肪肝相关的作用靶点,构建有效活性成分-疾病靶点的网络图;通过String数据库进行构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析;最后使用分子对接技术和药理实验对有效活性成分和靶点进行验证。结果：经过筛选,活血祛湿方中的槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素以及异鼠李素等多个关键活性成分,可能通过作用在信号转导与转录激活因子3、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、细胞肿瘤抗原p53、转录因子AP-1等核心基因表达的蛋白上参与脂肪肝的治疗。KEGG富集分析所涉及的信号通路包括白细胞介素-17(IL-17)、前列腺癌、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、非酒精性脂肪肝、促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)信号通路等。结论：活血祛湿方可通过多成分、多靶点、多通路的复杂作用机制发挥抗炎和应对氧化应激的作用,进而...