携带人内皮抑素基因的重组腺病毒构建及表达*☆

目的：内皮抑素是目前发现的作用最强的内皮细胞抑制因子，但内皮抑素蛋白极不稳定，难以制备及应用，故需要借助基因治疗发挥其抑制血管生成的作用。实验利用AdEasy-1系统构建并鉴定人内皮抑素重组腺病毒，并在人血脐静脉内皮细胞中表达出内皮抑素蛋白。 方法：实验于2006-03/10在中山大学生命科学院完成。以Pshuttle-Endostatin质粒为模板，应用特异引物，通过聚合酶链反应扩增纯化得到Endostatin基因片断，经测序鉴定后，酶切插入穿梭质粒pAdTrack-CMV中，再与骨架质粒AdEasy-1在大肠杆菌BJ5183中进行同源重组，重组质粒经筛选、提取、纯化后，经酶切及测序鉴定正确，再大量扩增为腺病毒载体，线性化后利用脂质体2000转染AAV293细胞包装并扩增，得到的病毒液纯化扩增后，感染人脐静脉内皮细胞，反转录-聚合酶链反应检测感染细胞中目的基因的表达，蛋白免疫印迹检测感染细胞中蛋白的表达。 结果：获得的Endostatin基因片段经酶切及测序鉴定正确，重组腺病毒质粒经酶切及测序鉴定正确，成功转染AAV293细胞，包装并扩增出病毒液，纯化后测滴度为2.06×1010 pfu/mL，进一步感染人脐静脉内皮细胞，在其中检测到目的基因及蛋白表达。 结论：人内皮抑素重组腺病毒pAd-Endo构建成功，且可在人脐静脉内皮细胞中表达出相应的目的基因及蛋白。     

大鼠黏结蛋白聚糖1基因重组腺病毒载体的构建及感染效率☆

背景：重组腺病毒质粒的构建方法主要有体外连接法和同源重组法。同源重组法有操作复杂、耗时长、效率低、纯化难的缺点。体外连接法又不可避免非特异性的基因重组及基因突变。 目的：应用改良体外连接法构建携带黏结蛋白聚糖1基因的重组腺病毒载体，测定其在心肌成纤维细胞中的感染效率。 设计、时间及地点：单一样本实验，于2007-08/2008-02在中山大学附属第二医院林百欣实验中心完成。 材料：穿梭载体pShuttle-CMV（含绿色荧光报告基因）和腺病毒骨架质粒pAdxsi购自诺赛基因组研究中心有限公司。 方法：核苷酸序列鉴定pCMV-Sport6.1-Sdc1质粒；用KpnⅠ + XhoⅠ从质粒pCMV-Sport6.1-Sdc1切出黏结蛋白聚糖1基因片段，亚克隆至pShuttle-CMV中，形成重组穿梭质粒。用I-CeuI + I-SceI双酶切出重组穿梭质粒中CMV-Sdc1片段，亚克隆至腺病毒基因组质粒中，得到重组腺病毒质粒。将重组腺病毒质粒转染293细胞包装获得重组腺病毒AdCMVSdc1，转化体外培养的心肌成纤维细胞。 主要观察指标：用DNA测序、酶切及聚合酶链反应法鉴定重组质粒和病毒，并测定重组腺病毒的滴度和感染效率。 结果：①核苷酸序列分析表明，pCMV-Sport6.1-Sdc1质粒正确携带大鼠黏结蛋白聚糖1 cDNA；黏结蛋白聚糖1基因被克隆于载体pShuttle-CMV上，以KpnⅠ + XhoⅠ双酶切可回收3 kb的克隆片段和5.1 kb的载体片段；重组腺病毒质粒用XhoⅠ酶切得到7个片段而空载体仅得到6个片段。②重组腺病毒质粒在293细胞中包装后产生的重组腺病毒对293细胞有致病作用；提取病毒DNA行聚合酶链反应鉴定可扩增出1.13 kb的特异性片段；用病毒上清多次重复感染293细胞扩增重组腺病毒后，病毒滴度检测达2.0×1011 PFU/mL。③用纯化浓缩后的重组腺病毒以感染复数为100感染心肌成纤维细胞，24 h后所有细胞均表达绿色荧光。 结论：成功构建了携带大鼠黏结蛋白聚糖1基因的重组腺病毒载体，经纯化浓缩后具有较高的滴度，能有效转染心肌成纤维细胞。     

重组腺病毒载体Ad5-hBDNF-EGFP的构建与鉴定*☆

背景：基因治疗是目前脊髓损伤治疗的方向，目的基因和载体是基因治疗的关键。 目的：构建携带增强型绿色荧光蛋白基因(Enhanced green fluorescence protein, EGFP)标志人脑源性神经营养因子(human brain-derived neurotrophic factor，hBDNF)基因重组腺病毒载体。 设计、时间及地点：单一样本观察，实验于2007-09/2008-06在福建医科大学附属第一医院完成。 材料：感受态大肠杆菌DH-5α购自美国Stratagene公司；pDC316-hBDNF、载体质粒pDC316-mCMV-EGFP、腺病毒骨架质粒pBHGlox_E1,3Cre、腺病毒包装系统AdMax和包装细胞株293购自加拿大Mixcrobix-Biosystems公司。 方法：以pDC316-hBDNF为模板，聚合酶链反应扩增酶切获得hBDNF基因片段，连接到带有EGFP标记基因的载体质粒pDC316-mCMV-EGFP上，构建穿梭质粒pDC316-hBDNF-mCMV-EGFP。利用AdMax包装系统，穿梭质粒与骨架质粒pBHGlox_E1，3Cre共转染293包装细胞, 同源重组产生复制缺陷型重组腺病毒载体Ad5-hBDNF-EGFP，反复感染293细胞扩增病毒后，离子交换法纯化病毒，并测定病毒颗粒数及滴度。 主要观察指标：①hBDNF基因原始质粒聚合酶链反应鉴定。②穿梭质粒pDC316-hBDNF-mCMV-EGFP的构建及鉴定。③重组腺病毒Ad5-hBDNF-EGFP的包装、扩增及纯化。④毒种目的基因的聚合酶链反应鉴定。⑤纯化病毒的滴度测定结果。 结果：经聚合酶链反应鉴定、限制性酶切分析及序列测定，证明已正确构建重组穿梭质粒pDC316-hBDNF-mCMV-EGFP和重组腺病毒载体Ad5-hBDNF-EGFP；扩增纯化后，测得重组腺病毒颗粒数为2.4×1011VP / mL，A260/A280值约为2.0，滴度为0.8×1010 CCID50/ mL。 结论：已成功构建重组腺病毒载体Ad5-hBDNF-EGFP，为hBDNF基因功能及基因治疗的进一步研究奠定实验基础。     

构建人热休克蛋白70基因重组腺病毒载体及鉴定

背景：腺病毒载体作为低毒高效的基因载体已被广泛应用,但是人热休克蛋白70基因腺病毒载体较为少见。 目的：构建重组人热休克蛋白70基因的腺病毒载体,鉴定外源基因在真核细胞中的良好表达。 方法：采用AdMax腺病毒系统将外源基因人热休克蛋白70基因重组入腺病毒载体中,转染人胚肾293细胞并重组包装出毒,检测外源基因的表达和病毒滴度。 结果与结论：观察转染后的人胚肾293细胞出现明显细胞病变效应后,收获并纯化重组病毒;荧光显微镜观察绿色荧光蛋白表达情况良好,Western blot检测人热休克蛋白70蛋白表达良好,收获病毒的滴度为1×1011 efu/mL,证明实验已成功构建携带人热休克蛋白70基因的重组腺病毒载体。     

应用AdEasy腺病毒载体系统构建鼠白细胞介素10基因重组腺病毒★

目的：AdEasy系统可在原核细胞E.coli BJ5183中完成穿梭质粒与骨架质粒之间的高效同源重组，经抗生素培养板筛选重组体，然后转染293细胞获得重组病毒，极大简化了载体的构建过程。实验利用AdEasy腺病毒载体系统构建鼠白细胞介素10基因重组腺病毒。 方法：实验于2006-08/2007-05在青岛大学医学院病毒学实验室完成。①实验材料：清洁级SD大鼠5只，实验过程中对动物的处置符合动物伦理学标准。腺病毒穿梭质粒pAdTrack-CMV，骨架质粒pAdeasy-1，大肠杆菌BJ5183和DH10B，人胚肾293细胞均由青岛大学医学院微生物教研室罗兵教授惠赠。②实验方法：从脂多糖刺激培养的大鼠脾细胞中提取细胞总RNA，应用反转录多聚酶链反应技术扩增白细胞介素10 cDNA，定向亚克隆至pAdtrack-CMV中构建腺病毒穿梭质粒pAdtrack-CMV-IL-10，酶切线性化后转化到含腺病毒骨架质粒pAdEasy的BJ5183大肠杆菌中，获得重组腺病毒质粒pAd-IL-10，Lipofectamin包装转染293细胞，获得重组腺病毒vAd-IL-10，荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白的表达。将293细胞接种于96孔板中，每孔1×104个细胞，浓缩后的病毒贮存液按不同比例稀释加至培养板中，测定重组腺病毒滴度。用重组腺病毒vAd-IL-10感染293细胞3 d后，以TRIzol一步法提取细胞总RNA，所获RNA加入DNaseⅠ消化处理可能污染的DNA后，PCR产物行琼脂糖电泳检测白细胞介素10 mRNA的表达。 结果：①重组腺病毒的包装及滴度测定：经限制性内切酶转染293细胞16 h后，荧光显微镜观察到细胞中有GFP荧光，可间接反映目的基因的表达。将病毒上清反复感染293细胞扩增重组腺病毒，通常传至第4~5代于接种病毒后24~48 h，几乎可观察到所有细胞出现荧光，此时收获病毒，重组病毒命名为vAd-IL-10。vAd-IL-10滴度为5.5×108 pfu/mL，vAd-GFP滴度为9.0×108 pfu/mL。②目的基因RT-PCR产物的鉴定：提取重组腺病毒感染293细胞总RNA，RT-PCR扩增后琼脂糖电泳显示特异性580 bp预计大小的片段，表明该重组腺病毒可在293细胞中有效转录。 结论：利用AdEasy腺病毒载体系统成功构建了携带白细胞介素10基因的重组腺病毒载体，并制备出高滴度的重组腺病毒vAd-IL-10，可在293细胞中有效转录。     

重组人骨形态发生蛋白2腺病毒载体的构建与鉴定*

背景：目前报道的重组腺病毒构建方法较复杂,构建周期长,导致重组腺病毒构建的成功率较低。GatewayTM技术是基于λ噬菌体的位点特异性高效重组系统,其构建重组病毒载体具有快捷高效的特点。 目的：构建含人骨形态发生蛋白2 基因的重组腺病毒载体,为应用骨形态发生蛋白2 基因治疗的研究奠定基础。 设计、时间及地点：单一样本观察,实验于2008-02/06在深圳市第二人民医院中心实验室完成。 材料：pOTB7-BMP-2 质粒、HEK293为ATTC产品;BLOCK-iTTM Adenovirus Expression System为Invitrogen产品;大肠杆菌DH5α为Biontex产品。 方法：用聚合酶链反应方法扩增骨形态发生蛋白2 目的基因,并插入载体pMD19-T Simple Vector中进行测序分析。将骨形态发生蛋白2 基因亚克隆到穿梭载体pEC3.1(+)中,构建pEC3.1-BMP-2 穿梭质粒,再将其中的表达盒通过重组克隆到pAd/BLOCK-iT™-DEST腺病毒载体中,线性化后转293 细胞进行包装获得重组腺病毒rAd-BMP2。 主要观察指标：①目的基因骨形态发生蛋白2 的聚合酶链反应扩增。②重组质粒TS-BMP2 的构建。③重组pEC3.1-BMP2 的构建。④重组pAd-BMP2 的构建。⑤重组腺病毒的制备与鉴定。 结果：正确扩增长约1.2 kb的骨形态发生蛋白2 cDNA,并成功地构建其腺病毒载体,经线性化的pAd-BMP2 DNA转染HEK293细胞,包装、扩增后得到人骨形态发生蛋白2 重组腺病毒(rAd-BMP2),其滴度约为1×1010 PFU/mL,该滴度可满足进一步的骨形态发生蛋白2 成骨作用的研究。 结论：成功地构建重组人骨形态发生蛋白2 腺病毒载体。     

构建人HCN4基因重组腺病毒载体及其对大鼠骨髓间充质干细胞的感染效率

背景：超极化激活及环化核苷酸门控阳离子通道(hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated cation channel, HCN)基因由于具有不增加诱发心律失常的风险、能够接受自主神经系统调节等优势,成为目前最受关注的生物起搏备选基因。 目的：构建携带人HCN4基因的重组腺病毒载体,并测定其对大鼠骨髓间充质干细胞的感染效率。 设计、时间及地点：细胞-基因学体外实验,于2008-02/09在中山大学附属第二医院林百欣实验中心完成。 材料：SD大鼠10只,由中山大学实验动物中心提供。携带目的基因人HCN4 cDNA的质粒pcDNA3.1-HCN4、人胚肾293细胞、大肠杆菌DH5α由中山大学附属第二医院林百欣实验中心保存。腺病毒穿梭质粒pShuttle-CMV、骨架质粒pAdxsi购自北京诺赛基因组研究中心有限公司。 方法：质粒pcDNA3.1-HCN4用Hind Ⅲ+Xba Ⅰ双酶切后回收HCN4片段,亚克隆至pShuttle-CMV中,得到重组穿梭质粒;I-Ceu Ⅰ+I-Sce Ⅰ双酶切处理pShuttle-CMV-HCN4,回收CMV-HCN4片段,亚克隆至腺病毒骨架载体pAdxsi,得到重组腺病毒质粒;重组腺病毒质粒酶切线性化后,应用脂质体法转染293细胞进行包装扩增,得到重组腺病毒AdHCN4;应用AdHCN4转染大鼠骨髓间充质干细胞。 主要观察指标：重组腺病毒质粒载体的鉴定,重组腺病毒的鉴定及滴度测定,重组腺病毒的感染效率。 结果：构建的重组穿梭质粒pShuttle-CMV-HCN4用Hind Ⅲ+Xho Ⅰ双酶切,得到大小为3 600 bp(HCN4)和5 100 bp (pShuttle-CMV)两个片段,DNA测序结果证实人HCN4基因的全长序列已正确插入到pShuttle-CMV穿梭质粒中;重组腺病毒质粒pAdxsi-CMV-HCN4用XhoⅠ酶切得到7个片段,而作为对照的空腺病毒质粒只得到6个片段;重组腺病毒质粒在293细胞中包装后产生的重组腺病毒对293细胞有致病作用;重组腺病毒AdHCN4 PCR鉴定可见657 bp的阳性扩增条带;经多次重复感染后,病毒滴度检测达2.5×1011PFU/mL。成功转染AdHCN4的大鼠骨髓间充质干细胞可表达绿色荧光蛋白,当病毒感染复数值为800,转染效率最高,达90%。 结论：实验成功构建携带人HCN4基因的重组腺病毒载体,并可在体外有效转染大鼠骨髓间充质干细胞。     

大鼠蛋白酪氨酸磷酸酶1B基因靶向RNA干扰重组腺病毒的构建

背景：研究者们早已发现蛋白酪氨酸磷酸酶1B（protein tyrosine phosphatase，PTP1B）可负性调节胰岛素信号转导，但目前制约PTP1B功能研究的重要环节是缺乏有效的工具。 目的：拟构建PTP1B基因靶向RNA干扰重组腺病毒。 设计、时间及地点：体外细胞学基因转染实验，于2007-05/12在解放军第二军医大学长海医院中心实验室完成。 材料：293细胞由中科院上海细胞研究所提供，真核表达质粒psiRNA-PTP1B由上海吉凯生物公司合成，AdEasy-1菌、穿梭载体pAdTrack、大肠杆菌DH5α由本室保存，重组腺病毒PCR鉴定引物由上海生工生物公司设计合成。 方法：由生物公司合成针对大鼠PTP1B mRNA的特异性siRNA真核表达质粒psiRNA-PTP1B，双酶切得到siRNA-PTP1B表达片段，插入pAdTrack载体上，获得转移质粒pAdTrack-siRNA-PTP1B。后者经线性化后，转化含有腺病毒骨架质粒pAdEasy-1的大肠杆菌BJ5183进行同源重组，PacⅠ酶切鉴定，筛选出正确重组腺病毒质粒pAdEasy-siRNA-PTP1B，酶切线性化后转染293细胞包装成重组病毒颗粒。通过反复感染扩增病毒，采用氯化铯密度梯度离心法纯化重组腺病毒。 主要观察指标：荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达，鉴定重组腺病毒穿梭载体及重组腺病毒是否构建成功。 结果：PacⅠ酶切鉴定证实重组腺病毒质粒pAd-siRNA-PTP1B构建成功，转染293细胞后有绿色荧光蛋白表达。PCR鉴定表明重组腺病毒中含有siRNA-PTP1B片断，成功构建了携带PTP1B干扰RNA的重组腺病毒Ad-siRNA-PTP1B，293细胞扩增纯化后，获得约3.6×109 efu/mL滴度的重组腺病毒。 结论：应用AdEasy-1系统可以高效快速制备表达PTP1B干扰RNA的重组腺病毒。     

腺病毒表达载体pAdEasy-1/pAdTrack-CMV-Shh-N的构建及表达

目的构建携带Son ic hedgehog氨基端(Shh-N)基因的腺病毒表达系统并在包装细胞中制备相关病毒颗粒,以用于中枢神经系统疾病的基因治疗。方法应用多聚酶链式反应(PCR)技术扩增Shh-N,然后克隆至含巨细胞病毒(CMV)启动子的真核表达载体pAdTrack-CMV,在细菌中与缺陷型腺病毒基因组pAdEasy-1进行重组,构建pAdEasy-1/pAdTrack-CMV-Shh-N,然后转染包装细胞293细胞系。结果成功获得Shh-N片段并构建了缺陷型腺病毒表达载体pAdEasy-1/pAdTrack-CMV-Shh-N,经限制性酶切后证实该表达载体含Shh-N基因,在293细胞中小规模扩增病毒后,经PCR检测证实病毒颗粒中存在Shh-N基因。结论获得了携带Shh-N的腺病毒颗粒,可将之用于基因修饰神经细胞,进行促细胞存活和定向分化诱导研究,为自身干细胞和外源性细胞移植治疗中枢神经系统疾病的临床应用提供理论和实验基础。     

Transduced Schwann cells promote axon growth and myelination after spinal cord injury

We sought to directly compare growth and myelination of local and supraspinal axons by implanting into the injured spinal cord Schwann cells (SCs) transduced ex vivo with adenoviral (AdV) or lentiviral (LV) vectors encoding a bifunctional neurotrophin molecule (D15A). D15A mimics actions of both neurotrophin-3 and brain-derived neurotrophic factor. Transduced SCs were injected into the injury center 1 week after a moderate thoracic (T8) adult rat spinal cord contusion. D15A expression and bioactivity in vitro; D15A levels in vivo; and graft volume, SC number, implant axon number and cortico-, reticulo-, raphe-, coerulo-spinal and sensory axon growth were determined for both types of vectors employed to transduce SCs. ELISAs revealed that D15A-secreting SC implants contained significantly higher levels of neurotrophin than non-transduced SC and AdV/GFP and LV/GFP SC controls early after implantation. At 6 weeks post-implantation, D15A-secreting SC grafts exhibited 5-fold increases in graft volume, SC number and myelinated axon counts and a 3-fold increase in myelinated to unmyelinated (ensheathed) axon ratios. The total number of axons within grafts of LV/GFP/D15A SCs was estimated to be over 70,000. Also 5-HT, DbetaH, and CGRP axon length was increased up to 5-fold within D15A grafts. In sum, despite qualitative differences using the two vectors, increased neurotrophin secretion by the implanted D15A SCs led to the presence of a significantly increased number of axons in the contusion site. These results demonstrate the therapeutic potential for utilizing neurotrophin-transduced SCs to repair the injured spinal cord.     

The Population Vector, an unbiased estimator for non-uniformly distributed neural maps

The Population Vector as a measure for the interpretation of neuronal activity in terms of sensory or motor events has been reliably used in the past for the case of uniformly distributed neuronal maps. In this study we will address the problem of the interpretation of neuronal activity in terms of the Population Vector for non-uniformly distributed maps. Based on mathematical analyses and on numerical computer simulations we demonstrate that, under some assumptions, the Population Vector also provides a proper estimate for neural maps with non-uniformly distributed neuronal response properties (i.e., the bias in the estimate, if present, is small). The main assumption is that the size of the receptive fields is not constant but that it is related to the density of receptive field properties. The confidence level of the results is expressed by the variance of the estimate in the limit of a large number of neurons.     

真核表达载体pcDNA3.1(十)tPA的构建

目的构建一种无形成病毒及激活原癌基因可能的真核表达载体ｐｃＤＮＡ３．１（＋）ｔＰＡ,以探讨其对纤溶活性影响,方法用分子克隆方法,将人ｔＰＡｃＤＮＡ与真核表达载体ｐｃＤＮＡ３．１（＋）重组,并对重组质粒进行ＤＮＡ测序。结果重组质粒ｐｃＤＮＡ３．１（＋）ｔＰＡ经ＫｐｎⅠ和ＸｂａⅠ酶切后,出现了５．４ｋｂ与２．０ｋｂ两个片段;经ＰｓｔⅠ酶切后出现了７８ｂｐ,４１４ｂｐ,６２２ｂｐ,２．０ｋｂ及４．２ｋｂ五个片段;经ＥｃｏＲＩ酶切后,出现了４７２ｂｐ及６．９ｋｂ两个片段;测序结果证明为人全长ｔＰＡｃＤＮＡ。结论该新型表达质粒的构建为探讨基因防治脑梗死等血栓性疾病奠定了基础。     

壳聚糖季铵盐作为基因递送载体的初步研究**

背景：非病毒载体因其安全性好而在基因治疗领域赢得了广泛的关注,各种各样的非病毒载体处在不断的研究中,壳聚糖季铵盐作为一种新的生物材料,同样也具有作为基因递送载体的潜质。 目的：考察壳聚糖季铵盐体外基因转染活性,寻求一种新的非病毒基因载体递送系统。 设计、时间及单位：对比观察实验,于2008-04/12在浙江省医学科学院生物工程所完成。 材料：质粒pcDNA3.1-EGFP为浙江省医学科学院生物工程实验室保存。以3-氯-2-羟丙基三甲基氯化铵作为改性剂制备壳聚糖季铵盐,用复凝聚法制备载基因纳米粒。 方法：凝胶阻滞实验分析壳聚糖季铵盐包裹质粒的能力,DNase I的保护实验分析载基因纳米粒的抵抗核酸酶降解的能力,体外基因转染实验评价纳米粒的体外转染活性,用倒置荧光显微镜观察和流式细胞仪测定转染结果。通过考察转染液中有无牛血清和递送不同剂量的基因对转染效率的影响,寻求本递送系统较好的转染条件。另外,用MTT法测定壳聚糖季铵盐的细胞毒性。 主要观察指标：壳聚糖季铵盐和pcDNA 3.1-EGFP以何种比例结合形成的纳米粒、转染液中有无牛血清,质粒的量为多少时对人胚肾T细胞的转染效率是最高的;不同浓度的壳聚糖季铵盐对细胞生长的影响。 结果：壳聚糖季铵盐纳米粒能转入人胚肾T细胞,虽然转染效率略逊于聚乙烯亚胺,但是细胞毒性明显小于聚乙烯亚胺。壳聚糖季铵盐纳米粒转染细胞72 h后效率较高,经综合分析,当pcDNA质量为2 μg,壳聚糖季铵盐和pcDNA以质量比为5结合形成的纳米粒,在无血清条件下对人胚肾T细胞进行转染,转染效率是最高的。 结论：壳聚糖季铵盐纳米粒能将基因递送到细胞内,并且报告基因能在细胞内表达。因此,壳聚糖季铵盐用做基因递送的载体系统值得进一步的研究。     

A divide-and-combine method for large scale nonparallel support vector machines

Nonparallel Support Vector Machine (NPSVM) which is more flexible and has better generalization than typical SVM is widely used for classification. Although some methods and toolboxes like SMO and libsvm for NPSVM are used, NPSVM is hard to scale up when facing millions of samples. In this paper, we propose a divide-and-combine method for large scale nonparallel support vector machine (DCNPSVM). In the division step, DCNPSVM divide samples into smaller sub-samples aiming at solving smaller subproblems independently. We theoretically and experimentally prove that the objective function value, solutions, and support vectors solved by DCNPSVM are close to the objective function value, solutions, and support vectors of the whole NPSVM problem. In the combination step, the sub-solutions combined as initial iteration points are used to solve the whole problem by global coordinate descent which converges quickly. In order to balance the accuracy and efficiency, we adopt a multi-level structure which outperforms state-of-the-art methods. Moreover, our DCNPSVM can tackle unbalance problems efficiently by tuning the parameters. Experimental results on lots of large data sets show the effectiveness of our method in memory usage, classification accuracy and time consuming.     

靶向人端粒酶逆转录酶小片段干涉RNA表达载体的构建和表达

目的构建靶向人端粒酶逆转录酶（hTERT）的小片段RNA（siRNA）表达载体，为研究RNA干涉（RNAi）在哺乳动物细胞内抑制靶基因表达奠定基础。方法根据siRNA靶点设计的原则运用相关软件设计靶序列并合成其表达框，连接人质粒载体pRNAT-H1．1／Neo，转染293T细胞，荧光定量RT．PCR和Western blot法检测转染后293T细胞中hTERT表达。结果重组质粒经测序鉴定证明hTERTsiRNA转录模板完整、正确插入到pRNAT．H1．1／Neo质粒中，并筛选出一个抑制hTERT表达效率最高的序列，其hTERT表达仅达22．90％。结论利用基因重组和荧光定量PCR等技术能成功构建并筛选出一个抑制效率最好的靶向hTERT的siRNA表达载体，为以hTERT为靶点的肿瘤基因治疗的后续研究奠定基础。     

BDNF基因重组逆转录病毒表达载体pLEGFP-BDNF的构建与鉴定

目的构建脑源性神经营养因子(BDNF)基因重组逆转录病毒表达载体。方法根据 BDNF基因已知序列,设计合成一对引物并导入HindⅢ和BamH Ⅰ酶切位点;从大鼠海马组织提取总 RNA,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)获得编码BDNF的基因片段,与克隆载体pMD 18-T Simple连接构建pMDT-BDNF质粒;经HindⅢ、BamHⅠ双酶切,获得BDNF基因片断再克隆至逆转录病毒载体 pLEGFP-N1中构建重组质粒pLEGFP-BDNF。结果限制性内切酶酶切分析和PCR法鉴定表明为正确重组子,测序结果证实与已知序列吻合。结论构建的重组逆转录病毒表达载体 pLEGFP-BDNF含有序列正确的大鼠BDNF基因,可以作为今后治疗老年性痴呆动物模型转基因实验的基因来源。     

Vasculostatin慢病毒表达载体的构建

目的构建Vasculostatin慢病毒表达载体。方法通过基因合成方法获得Vasculostatin的完整序列,将此片段定向克隆到pL enti-CMV-EF1p-eG FP载体多克隆位点区,筛选重组质粒,采用磷酸钙方法将Lenti-CMV-Vasculostatin/EF1p-eG FP与载体pC MV-VSGS与pC MV-Gag-Pol共转染293T细胞,转染后收获上清离心纯化病毒并检测病毒滴度。结果成功构建Vasculostatin的慢病毒表达载体,检测病毒的滴度为2.5×107/ml。结论 Vasculostatin慢病毒表达载体为研究Vasculostatin对血管生成的抑制作用提供工具。     

Lentiviral transduction of microglial cells

Microglial cells are the resident immune cells of the central nervous system. Their function resembles that of tissue macrophages and, as such, they share many properties with both peripheral macrophages and monocytes. One striking similarity is the difficulty with which these cells can be genetically manipulated via transfection or transduction. We have sought to overcome this challenge and generate stably transduced microglial cell lines. Based on encouraging results from macrophages, we hypothesized that lentiviral vectors might provide a valuable tool in the transduction of microglial cells. Using a lentiviral-based vector system expressing enhanced green fluorescent protein (eGFP) under the control of the murine stem cell virus promoter (MSCV), we found that multiplicities of infection (MOIs) of 1, 10, and 100 transduce >70%, >88%, and >95% of the cells, respectively. From the pool of transduced cells, we established lines of N9 and BV-2 microglial cells with distinct fluorescence intensities. Using real time-polymerase chain reaction (PCR), we correlated the integrated eGFP copy numbers to eGFP fluorescence measured by flow cytometry. When mixed, up to three lines with different eGFP intensities could be separated by flow cytometry and fluorescence microscopy. Neither infection nor transgene expression influenced microglial activation as assessed by nitric oxide (NO) production, cytokine release, and surface antigen expression. Our findings that microglial cells are easily transduced by lentiviral based vectors will facilitate research depending on genetic manipulation and help generate transgenic cell lines. In addition, the availability of microglial cell lines with defined fluorescence properties could replace elaborate staining procedures for microglial identification in co-culture experiments.