胶质母细胞瘤染色体13q上肿瘤抑制基因存在的可能性

目的寻找胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)13号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失 (LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因(TSG)提供线索和依据。方法应用聚合酶链反应(PCR)方法,采用 荧光标记的引物和377型DNA序列自动分析仪,分析了20例GBM13号染色体上14个微卫星多态性标记的 LOH。结果在60％GBM的13号染色体上观察到LOH,在45.8％可提供信息位点存在LOH。其中13q的 LOH率明显高于13p,13q和13p的LOH率分别为60％、27％。在13q上的下列位点上检测到较高的LOH率 (＞50％)13q14.1-14.3上D13S153,13q12-14.2上的D13S217-D13S263,13q21.2-32上的D13S156-D13S265。 结论13号染色体可能在GBM的分子发病机制中发挥着重要作用,在13q14.1-14.3上的D13S153位点、13q 12-14.2上的D13S217-D13S263和13q21.2-32上的D13S156-D13S265间区域可能存在多个与GBM相关的肿瘤 抑制基因,可能包括RB1以及不同于RB1的其他肿瘤抑制基因。     

Chromosome 14q may harbor multiple tumor suppressor genes in primary glioblastom a multiformec

目的：评价染色体14q的（杂合性）丢失是否与原发性多形性胶质母细胞瘤的发生发展有关,并确定14q上可能存在的共同杂合性丢失区域。方法：应用聚合酶链反应（PCR）为基础的微卫星分析方法,采用14个荧光标记的多态性（微卫星）标记,检测了20例原发性多形性胶质母细胞瘤（GBM）染色体14q的杂合性丢失（LOH）状况。结果：50％（10/20例）GBM在染色体14q上至少有一个微卫星标记存在LOH,其中5个病例的所有被检测标记都表现为LOH或不能提供信息。在位于14q32.1的D14S65位点、14q23-31的D14S63-D14S74位点间区域检测到的LOH率最高,分别为57.1％、46.7％-47.1％。在本研究中的所有位点,均未检测到微卫星不稳定。结论：染色体14q上的等位基因丢失可能在GBM发病机制中起着重要作用,14q32.1上的D14S65位点、14q23-31上的D14S63-D14S74位点间区域可能存在与GBM相关的多个肿瘤抑制基因。     

胶质母细胞瘤染色体lp36杂合性缺失的初步研究

日的探讨1p36上可能存在的与胶质母细胞瘤(GBM)发生有关的肿瘤抑制基因的缺失区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据.方法 运用聚合酶链反应(PCR)技术为基础的杂合性缺失分析(LOH)法对12例胶质母细胞瘤染色体1p36上12个微卫星多态标记序列作了较详细研究.结果 12例胶质母细胞瘤至少有一个位点出现杂合性缺失者11例,总缺失率为91.7%(11/12),其中以D1S214-D1S2666位点间区域LOH的频率最高.结论 胶质母细胞瘤染色体1p36发生高频率杂合性缺失,提示位点D1S214-D1S2666缺失区域间可能存在着与GBM发生有关的抑癌基因.     

胶质母细胞瘤8号、22号染色体等位基因杂合性丢失的研究

目的：寻找胶质母细胞瘤（GBM）8号，22号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失（LOH）区域。为发展和定位肿瘤抑制基因（TSG）提供线索和依据。方法：应用聚合酶链反应（PCR）方法，采用荧光标记的引物和377型DNA序列自动分析仪，分别分析了21例GBM8号，22号染色体上14个，7个微卫星多态性标记的LOH。结果：本组病例8号染色体LOH率为23．8％，在16．3％能提供信息位点检测到LOH，8P的LOH率明显高于8q，分别为23．8％，14．3％，8q上所有位点的LOH率都在15％以上，以8p22-23上D8S550和D8S549的LOH率较高，分别是27．8％，30．0％，染色体22q的LOH率为47．6％，在30．0％可提供信息位点存在LOH，以22q13.2-13.3上D22S274的LOH率最高（41．2％），结论：8号，22号染色体等位基因杂合性丢失可能在GBM的分子发病机制中发挥着重要作用。在8p22-23上D8S550和D8S549位点间区域以及22q13.2-13.3上D22S274位点所在区域可能存在多个与GBM相关的肿瘤抑制基因。     

胶质母细胞瘤染色体1p36杂合性缺失的初步研究

目的探讨1p36上可能存在的与胶质母细胞瘤（GBM）发生有关的肿瘤抑制基因的缺失区域，为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法运用聚合酶链反应（PCR）技术为基础的杂合性缺失分析（LOH）法对12例胶质母细胞瘤染色体1p36上12个微卫星多态标记序列作了较详细研究。结果12例胶质母细胞瘤至少有一个位点出现杂合性缺失者11例，总缺失率为91．7％（11／12），其中以D1S214-D1S2666位点间区域LOH的频率最高。结论胶质母细胞瘤染色体1p36发生高频率杂合性缺失，提示位点D1S14-D1S2666缺失区域间可能存在着与GBM发生有关的抑癌基因。     

宫颈鳞癌和食管鳞癌共同相关的抑癌基因的研究

目的 比较食管鳞癌和宫颈鳞癌组织中9号染色体相同区域相同位点等位基因杂合性缺失(LOH)率,探索与二者共同相关的抑癌基因.方法 采用显微切割、PCR、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、AgNO3,染色等技术,检测45例食管鳞癌和46例宫颈鳞癌组织中的9号染色体上7个微卫星位点的LOH.结果 食管鳞癌总LOH率为25.8%(55/213),7个微卫星位点的LOH率从大到小依次为D9S753(42.9%)、D9S303(38.5%)、D9S171(35.7%)、D9S162(36.4%)、D9S242(16.7%)、D9S1748(16.7%)、D9S43(0).宫颈鳞癌中总LOH率为25.2%(54/214),7个微卫星位点的LOH率从大到小依次为D9S171(40.7%)、D9S43(33.3%)、D9S162(3114%)、D9S242(23.7%)、D9s303(17.2%)、D9s753(16.7%)、D9S1748(12.9%).结论 食管鳞癌和官颈鳞癌中存在相同的高频率的LOH位点,9号染色体上可能存在与二者发生发展共同相关的抑癌基因.     

散发性结直肠癌3号染色体等位基因杂合缺失

目的 了解散发性结直肠癌（SCRC）3号染色体等位基因杂合缺失（LOH）发生情况。探讨其与临床病理特征间的关系,并对3号染色体上可能的SCRC相关基因进行初步定位。方法 用覆盖3号染色体的13个微卫星标记对83例散发性结直肠癌进行LOH扫描分析。结果 3号染色体至少有两个位点发生LOH者占39%（29/74）,3p所选4个位点中至少有一个发生LOH者占37%（27/74）,3q所选9个位点中至少有一个发生LOH者占53%（39/74）。整条染色体上以D3S1300（3q14.2)位点LOH率最高,达54%（23/43）。3qLOH在远端结直肠癌较近端高发,3q及D3S1300LOH阳性肿瘤多表现为浸润型生长和局部侵犯,并多发于大于50岁的老年患者。结论 3号染色体存在散在分布及区域性高频等位基因LOH,并与SCRC临床病理资料相关,提示其上SCRC相关基因的存在。高频LOH位点D3S1300的发现,提示3p14.2附近区域的FHIT基因可能作为肿瘤抑制基因在结直肠癌的发生发展中发挥作用。     

急性白血病9号染色体微卫星复制错误的研究

目的 研究急性白血病(AL)9号染色体微卫星复制错误(RER)现象,探讨微卫星在白血病发病过程中的作用和用于检测染色体微小缺失的意义.方法 选取AL病人53例,其中急性髓细胞白血病(AML)33例,急性淋巴细胞白血病(ALL)20例.在9号染色体共选择5个微卫星位点,对骨髓细胞DNA及作为对照的自身口腔黏膜细胞DNA进行多重PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,观察微卫星不稳定性(MSI)和杂合性缺失(LOH)的发生情况.结果 53例AL中,共36例发生了至少1个位点的MSI,AML中有15例发生了MSI,10例发生了LOH;ALL中有5例发生了MSI, 4例发生了LOH.其中位于9p21上的D9Sl62、D9S1748、D9S171 微卫星位点LOH发生率分别为0(0/53)、5.7%(3/53)和7.5%(4/53), MSI发生率分别为15.1%(8/53)、7.6%(4/53)和11.3%(6/53);位于9q34上的D9S61和D9S67位点在AL中LOH发生率分别为11.3%(6/53)和5.6%(3/53),MSI发生率分别为5.6%(3/53)和9.4%(5/53).其中D9S61位点LOH均发生于AML,发生率为18.1%,显著高于ALL,差异有显著性(P=0.046).至少发生2个位点MSI即RER 的有6例,占11.3%.结论 AL 较高的RER 表达率提示,广泛的MSI与AL的发生发展有关;AML在D9S61上检测出较高的LOH提示,该区域可能存在与AML发生有关的基因改变;微卫星标记技术为研究AL一种新的、有价值的方法.     

壶腹周围肿瘤染色体9p21缺失图谱的构建

目的:进一步限定壶腹周围肿瘤染色体9p21区域的缺失范围.方法:选择染色体9p21区域5个微卫星多态性标记,通过聚合酶链反应、聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法,检测35例壶腹周围肿瘤及其外周血杂合性丢失(LOH)状况.结果:50%(4/8)胰腺癌有至少一个微卫星位点的LOH,其中D9S974(37.5%)和D9S942(28.6%)丢失频率较高,并且有连续性丢失现象.62.5%(5/8)壶腹癌在部分或全部位点出现LOH,其中D9S942(42.9%)丢失频率最高,其次为IFNA(37.5%)和D9S171(37.5%).14.2%(1/7)胰岛素瘤有一个位点LOH.结论:壶腹周围肿瘤染色体9p21最小共同缺失区位于D9S974和D9S942位点之间,其中可能存在一个新的涉及该肿瘤发生的相关抑癌基因.     

头颈部鳞癌微卫生多态标记的分析

目的 探讨中国人头颈部鳞状细胞癌（SCCHN）多染色体上等位基因的杂合性丢失（LOH）和微卫星不稳定（MI）的频率。方法 采用聚合酶链反应结合二核苷酸酸的重复序列多态性方法,选取6对染色体（3p,4q,7q,9p,17p和18q）上18个微卫星位点对30例SCCHN手术配对组织进行分析。结果 30例SCCHN组织中有12例（40％）组织至少有一个微卫生位点发生LOH,多数位点LOH的频率谱普遍比已报道的文献低。有7个位点（D7S480、D7S522、D9S162、D9S168、D9S304、D9S171和D17S520）具有统计学意义（P＜0．05）,然而这些位点的LOH与肿瘤病理学类型、肿瘤大小及转移性无显著相关性。此外,MI仅在4例患者中发现,没有1例患者符合MI的判定标准,即需两个或两个以上的微卫星多态位点的异常。结论 主要发生在D7S480、D7S522、D9S162、D9S168、D9S304、D9S171和D17S520位点的LOH可能存在与部分SCCHN有关的潜在的肿瘤抑制基因,而微卫星不稳定性与SCCHN发生的关系不大。     

人肝细胞癌4号染色体高频率杂合子丢失的研究

目的 为克了生新的肝细胞（HCC）相关肿瘤抑制基因的供位点依据。方法 使用4号染色体的12个微卫星DNA多态性标志,分析了48例原发性HCC的杂合子丢失（LOH）。结果 44％（21／48）和63％3（30／48）的肿瘤组织中至少有1个位点的LOH分别发生在4p和4q。丢失图排列鉴定了两个独立的共同丢失片段（CDR）。第1个定位在4q22-q25的CDR位于D4S392和D4S1625位点之间;第2个定位在4q27-q31的CDR位于D4S1625和D4S1652位点之间。结论 至少有两个肿瘤抑制位点存在于4q.     

原发性肝癌全基因组杂合性缺失的研究

目的 研究肝癌全基因组等位基因杂合性缺失（ＬＯＨ）及其临床意义。方法 采用３８２对微卫星标志,对６５例肝癌２２条常染色体等位基因ＬＯＨ进行检测。结果 全组平均杂合子６８．１％。ＬＯＨ〉３０％的有１ｑ、３ｑ、４ｑ、８ｐ、１３ｑ、１６ｑ和１７ｐ。ＨＢｓＡｇ阳性者Ｄ４Ｓ２９６４ ＬＯＨ（６６％）较ＨＢｓＡｇ阴性者（３０％）高（Ｐ〈０．０５）;Ｄ３Ｓ３６８１和Ｄ１７Ｓ９３８ ＬＯＨ者术后复发率（９１％、８     

胃癌患者6号染色体长臂遗传不稳定性

目的研究中国人胃癌6号染色体长臂微卫星不稳定性（microsatellite instability,MSI）和杂合性缺失（loss of heterozygosity,LOH）状况及与临床病理特征之间的联系。方法采用PCR-SSLP-银染方法对27例胃癌组织及其相应正常组织6号染色体长臂（6q）不同位置的4个位点进行MSI和LOH检测。结果27例信息个体中16例检测到一个或多个位点MSI,平均MSI频率59．2％;11例不具MSI的信息个体中7例存在1个或更多位点LOH,平均频率63．6％。MSI和LOH频发位点均为D6S434（6q16．3-q21）和D6S404（6q16．3-q23）。MSI和LOH在高分化胃癌和低分化胃癌各个时期均有发生．但高分化胃癌中高水平MSI（MSI-H）发生有增高趋势。结论MSI和LOH发生率与年龄、性别、组织分化程度、病理分期及发病部位等临床指标虽然无明显相关,但6q等位基因缺失关键区域与其它国家、地区相似,进一步证实6q上该区可能存在与胃癌相关的肿瘤抑制基因。     

Chromosome 6q deletion mapping in human ovarian tumor, a common deletion region between D6S1649 and D6S311

Objective： To explore the loss of heterozygosity（LOH） on chromosome 6q in ovarian cancer, and localize a minimum area in deletion region. Methods： 93 ovarian tumors were analyzed for LOH studies with 10 microsatellite markers spanning chromosome 6q. To further localize a minimum area in deletion region. Nineteen microsatellite markers were used to refined a minimum area. Results： Forty three tumors （46%） were demonstrated allelic losses, which spanned less than two megabase areas, franked by a distal marker D6S311 and a proximal marker D6S1649, and likely harbored ovarian tumor suppressor gene （s）. With analysis of density of LOH, increased DNA copy number at loci of 6q was demonstrated between D6S1649 and D6S311. Conclusion： It is possible that duplication after the allelic loss might be a main mechanism that leads to carcinogenesis in ovarian tumor. The refinement of these candidate tumor suppressor genes loci might facilitate future loss of heterozygosity studies and enable the isolation of candidate genes from this region.     

中国儿童急性淋巴细胞性白血病6q21区域微缺失的研究

目的:分析染色体6q2 1的D6S4 4 9 D6S30 2区域等位基因杂合性缺失的情况,确定其在中国儿童急性淋巴细胞性白血病中发生的频率和最小缺失区域,为定位克隆ALL相关抑癌基因提供线索。方法:采用比以往报道更高密度的11个微卫星多态性标记位点,利用聚合酶链反应 变性凝胶电泳银染技术分析93例儿童急性淋巴细胞性白血病例等位基因LOH的情况。结果:93例患者中共有32例(34.4 % )存在至少一个位点的LOH。位点D6S170 9 D6S30 1以及位点D6S30 2是高频率缺失集中的区域,位于其中的D6S2 83位点附近是缺失率最高的地方(2 5 % )。D6S170 9 D6S30 1之间距离在GenethonMap上显示有2cM。结论:6S170 9 D6S30 1为本研究所找到的6q2 1上的最小缺失区域,当中可能存在与中国儿童急性淋巴细胞性白血病发病相关的一个或一个以上的候选抑癌基因     

原发性肝癌患者17号和16号染色体等位基因杂合性丢失的研究

目的 研究肝癌１７号和１６号染色体特定区域等位基因杂合性丢失（ＬＯＨ）发生情况,并探讨ＬＯＨ与肝癌的临床病理和乙型、丙型肝炎病毒感染的关系。方法 用聚合酶链反应、微卫星多态性分析技术检测１７号和１６号染色体ＬＯＨ。结果 １７号染色体６个位点在至少一个位点发生ＬＯＨ的有３１例（８２％）,其中Ｄ１７Ｓ５２０（１７ｐ１２－１３．３）和ＴＰ５３（１７ｐ１３．１）位点ＬＯＨ频率大于５０％;１７ｑ所选４个位点     

Genome-wide allelotype study of primary glioblastoma multiforme

Objective To investigate the molecular genetic pathogenesis of primary glioblastoma multiforme (GBM) and identify which chromosomes or chromosomal regions of the entire genome may harbor tumor suppressor genes (TSGs) associated with GBM.Methods A high-resolution allelotype study of 21 cases of primary GBM was performed by PCR-based loss of heterozygosity （LOH）analysis. Three hundred and eighty-two fluorescent dye-labeled microsatellite markers covering all 22 autosomes were applied. The mean genetic distance between two flanking markers was about 10 cM.Results LOH was observed on all 39 nonacrocentric autosomal arms examined in this study. The LOH frequencies of 10q, 10p, 9p, 17p and 13q were the highest (>50%). Furthermore, high LOH frequencies were detected in the regions containing known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB; the LOH frequencies on 14q, 3q, 22q, 11p, 9q, 19q were also high (>40.5%). Our study observed the following commonly deleted regions: 9p22-23, 10p12.2-14, 10q21.3, 13q12.1-14.1, 13q14.3-31, 17p11.2-12, 17p13, 3q25.2-26.2, 11p12-13, 14q13-31, 14q32.1, 14q11.1-13, 22q13.3, 4q35, 4q31.1-31.2, 6q27 and 6q21-23.3. Conclusions The molecular pathogenesis of GBM is very complicated and associated with a variety of genetic abnormalities on many chromosomal arms. The most closely related chromosomal arms to the pathogenesis of GBM are 10q, 10p, 9p, 17p and 13q. Besides the well-known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB, multiple unknown TSGs associated with GBM may be present on the commonly deleted regions detected in the present study.