大肠埃希菌O157：H7Tir基因的生物信息学分析

目的扩增和测序肠出血型大肠埃希菌O157：H7 tir打基因,利用生物信息学预测分析其结构和功能特征．以探讨Tir作为疫苗候选抗原的可能性。方法利用PCR技术扩增fir基因并测序,应用生物信息学网站在线分析工具和vectorNTISUite软件分析Tir蛋白结构和生物学功能,预测B细胞抗原表位。结果该基因全长1674bp,编码558个氨基酸,蛋白质总体亲水性高,有稳定的理化性质。含有3个结构和功能域,两段穿膜结构,多个磷酸化位点,预测20个B细胞线性表位。结论Tir毒力因子是很有前景的疫苗候选抗原,为肠出血型大肠埃希菌O157：H7的疫苗研究提供了理论依据。     

肠出血型大肠埃希菌O157:H7Tir的表达、纯化及不同免疫途径对其免疫效价的影响

目的 克隆、表达和纯化肠出血型大肠埃希菌(enterohaemorrhagic E.coli,EHEC)O157:H7转位紧密黏附素受体蛋白(Tir),观察不同免疫途径对其免疫效价的影响,为EHEC O157:H7亚单位疫苗的研究提供了实验资料.方法 扩增tir基因,克隆到pET-30a(+)载体上,转化至大肠埃希菌BL21/DE3,诱导表达目的 蛋白,通过Ni-IDA亲和层析进行纯化;将重组蛋白Tir免疫小鼠,检测血清和粪便提取物中抗体效价.结果 双酶切和测序鉴定结果均显示重组质粒pET-30a (+)-tir构建成功.SDS-PAGE结果表明,目的 蛋白Tir在大肠埃希菌BL21(DB3)中得到表达.皮下免疫和鼻腔免疫小鼠,血清中均能检测到高效价的IgG类抗体,鼻腔免疫组小鼠血清和粪便lgA类抗体效价明显高于皮下免疫组.结论 Tir蛋白具有一定的免疫原性.

Abstract：

Objective To clone and express translocation intimin receptor(Tir)of enterohemorrhagic Escherichia coli(EHEC)O157:H7,and to analyze the effect of different routes on the induction of immunity to the recombinant protein.Methods The tir eucoding genes were amplified from EHEC O157:H7 strain guangzhou 246 genome,and genes were cloned into the vector pET-30a(+).The pET-30a(+)tir recombinant was transformed into E.coli BL21.and expression was induced bv IPTG.The expressed product was analyzed by SDS-PAGE and purified by Ni-IDA affinity chromatography.The immunized mice sera and fecal against the recombinant protein was detected.Resuits The length of the tir is 1677 bp,with the initiation codon ATG and the termination codon TAA.Double enzyme digestion and DNA sequencing confirmed that the recombinant expression plasmid pET-30a(+)-tir was constructed.The recombinant protein was expressed in Escherichia coli expression system,and was purified by Ni-IDA affinity chromatography.The mice were able to produce a high serum IgG antibody titer after both subeutaneous and intranasal immunizations.Meanwhile,the intranasal immunization induced serum and fecal IgA antibody titer was significantly higher than that of the subcutaneous immunization group.Conclusion Tir molecule is potential vaccine candidate for preventing EHEC disease.     

大肠埃希菌O157∶H7的pO157-cured突变株构建

目的建立从肠出血性大肠埃希菌O157∶H7中去除pO157的方法,构建pO157-cured突变株(O157Cu).方法分别将mini-R100系质粒pKP2368和mini-F系质粒pIndigoBAC-5通过电穿孔转化入O157∶H7 Sakai、EDL933、85-170、China2364、Arami505和Mida2684菌株中,筛选转化子,进行质粒图谱分析,PCR检测转化子中pKP2368和pIndigoBAC-5基因;并扩增pO157中的复制不相容区incB、incC和incD序列,DNA测序验证PCR结果.结果采用mini-F系质粒pIndigoBAC-5转化,菌株Sakai、EDL933、China2364、Arami505、Mida2684的pO157丢失率(分别为94.44%、52.08%、91.67%、96.67%和63.33%)明显高于采用mini-R100系质粒pKP2368转化时其pO157丢失率(分别为15.22%、9.26%、0、0、0),差异有显著性(P值分别为0.001);对于菌株85-170,无论采用pKP2368还是采用pIndigoBAC-5转化,其pO157丢失率均为0.菌株Sakai、China2364、Arami505、Mida2684的pO157中均含有incB、incC和incD序列,EDL933的pO157中含有incC和incD序列,而85-170的pO157中只含有incC序列.结论用携带与pO157相同活性复制子的R100系质粒pKP2368构建pO157-cured突变株,结果并不理想;但携带RepFIA区、含有incB、incC和incD序列的mini-F系质粒pIndigoBAC-5却适用于构建多种菌株的pO157-cured突变株,成功率高、重复性好.pO157中所含mini-F序列incB、incC和incD的存在情况可能与pO157丢失率有关.     

大肠埃希菌O157：H7的pO157-cured突变株构建

目的建立从肠出血性大肠埃希菌O157：H7中去除pO157的方法，构建pO157-cured突变株(O157Cu)。方法分别将mini-R100系质粒pKtE368和mini-F系质粒pIndigoBAC-5通过电穿孔转化入O157：H7 Sakai、EDL933、85-170、China2364、Arami505和Mida2684菌株中，筛选转化子，进行质粒图谱分析，PCR检测转化子中pKP2368和pIndigoBAC-5基因；并扩增pO157中的复制不相容区incB、incC和incD序列，DNA测序验证PCR结果。结果采用mini-F系质粒pIndigoBAC-5转化，菌株Sakai、EDL933、China2364、Arami505、Mida2684的pO157丢失率(分别为94．44％、52．08％、91．67％、96．67％和63．33％)明显高于采用mini-R100系质粒pKP2368转化时其pO157丢失率(分别为15．22％、9．26％、0、0、0)，差异有显著性(P值分别为0．001)；对于菌株85-170，无论采用pKP2368还是采用pIndigoBAC-5转化，其pO157丢失率均为0。菌株Sakai、ChinaS64、AmnkS05、Mida2684的pO157中均含有incB、incC和incD序列，EDL933的pO157中含有／ncC和／ncD序列，而85．170的pO157中只含有incC序列。结论用携带与pO157相同活性复制子的R100系质粒pKP2368构建pO157-cired突变株，结果并不理想；但携带RepFIA区、含有incB、incC和incD序列的mini-F系质粒pIndigoBAC-5却适用于构建多种菌株的pO157-cured突变株，成功率高、重复性好。pO157中所含mini-F序列incB、incC和incD的存在情况可能与pO157丢失率有关。     

肠出血性大肠埃希菌O157:H7 espA基因的克隆与表达

目的 通过DNA重组技术表达肠出血性大肠杆菌（EHEC）O157：H7的EspA蛋白，并分析其免疫学性质。方法 采用PCR技术从EHEC O157：H7基因组中扩增espA基因，T／A法克隆，连接至pET-28a（＋）载体上，转化宿主细胞E．coli BL21（DE3），IPTG诱导表达，亲和层析法纯化目的蛋白，SDS-PAGE测定其相对分子质量，同时分析其N端氨基酸序列，免疫家兔鉴定其抗原性。结果 重组espA基因片段的测序结果与GenBank上基因序列只有1个碱基不同，一致性为99．83％，所编码的氨基酸序列没有改变。重组EspA蛋白在工程菌中以包涵体的形式表达，表达量约30％。免疫家兔所得抗体滴度为1：32。结论构建高效表达EspA蛋白的重组载体pET-28a（＋）-espA，表达的蛋白具有良好的免疫原性，为进一步制备亚单位疫苗奠定基础。     

电子基因芯片DNA等温扩增技术检测大肠埃希菌O157:H7方法建立

<正>Nanogene公司研制的电子基因芯片利用电子场、热循环或化学技术等吸引带负电的DNA、RNA或其他生物分子和探针结合到芯片特定位点上进行杂交检测[1]。Nanogene电子芯片具有精确性和严谨性,对生物分子的电子吸引力大     

双重实时荧光PCR检测肠出血型大肠埃希菌stx1和stx2基因方法的建立

目的建立一种检测肠出血型大肠埃希菌（EHEC）产毒基因stx1和stx2的TaqMan双重实时荧光PCR法。方法根据GenBank公布的EHECstx1和stx2基因序列进行比对后设计相应的PCR引物和TaqMan探针,探针报告基团分别使用FAM和HEX标记,淬灭基团使用BHQ1标记。建立双重实时荧光PCR反应体系并对反应条件进行优化,对方法的灵敏度、特异性及其重复性进行分析。结果建立了EHEC双重实时荧光PCR检测方法。菌液浓度为102～108cuf/ml时,均可观察到扩增曲线,且扩增曲线平滑;检测30份模拟临床样品,均检测到stx1和stx2基因,且均培养出EHEC,该方法灵敏度为100%;3次重复测定108、105、102cfu/ml3个高、中、低浓度的菌液DNA模板,得到其扩增曲线,计算各浓度的Ct值标准差及变异系数,均小于5%,在误差允许范围内。结论建立的双重实时荧光PCR法可快速、灵敏、特异、有效地检出EHEC。     

化学发光磁酶免疫法检测O157:H7大肠埃希菌

目的：建立灵敏稳定检测O157：H7大肠埃希菌的化学发光磁酶免疫法.方法：利用AMPPD-ALP化学发光体系,通过磁珠酶联免疫法对O157：H7大肠埃希菌进行检测.结果：其检测灵敏度达到850个,线性范围为1 000～50 000个,批间变异小于15%,批内变异小于20%,与人工计数培养检测相比相关系数达0.9807.结论：化学发光磁酶免疫分析法操作简便,检测精密度和灵敏度高,是一种很有发展前景的可靠方法.     

化学发光磁酶免疫法检测O157∶H7大肠埃希菌

目的建立灵敏稳定检测O157∶H7大肠埃希菌的化学发光磁酶免疫法。方法利用AMPPD-ALP化学发光体系,通过磁珠酶联免疫法对O157∶H7大肠埃希菌进行检测。结果其检测灵敏度达到850个,线性范围为1000~50000个,批间变异小于15%,批内变异小于20%,与人工计数培养检测相比相关系数达0.9807。结论化学发光磁酶免疫分析法操作简便,检测精密度和灵敏度高,是一种很有发展前景的可靠方法。     

肠出血性大肠埃希菌O157:H7 TCCP蛋白与宿主细胞IRTKS蛋白的相互作用

目的通过体外结合实验验证EHEC O157:H7内膜素受体偶联细胞骨架蛋白重复片段与人肠上皮细胞IRTKS蛋白SH3结构域之间的相互作用,并制备二者蛋白复合体,为利用晶体学方法研究其相互作用奠定基础。方法将IRTKS蛋白的SH3结构域cDNA序列克隆至pET30a表达质粒,转化BL21(DE3),诱导表达纯化SH3(IRTKS)蛋白;制备TCCP重复片段TC-CP(3R)蛋白;将SH3(IRTKS)与TCCP(3R)按照不同比例混合后,非变性丙烯酰胺凝胶电泳鉴定两者相互结合后产物;利用分子筛层析收集标准蛋白、TCCP(3R)、SH3(IRTKS)和TCCP(3R)-SH3(IRTKS)复合体的出峰体积,回归计算复合物的分子量,分析蛋白相互结合的比例。结果成功克隆表达了SH3(IRTKS)重组质粒;并制备了高纯度的SH3(IRTKS)和TCCP(3R)蛋白;非变性丙烯酰胺凝胶电泳结果证实TCCP(3R)与SH3(IRTKS)发生相互作用形成了蛋白质复合体;复合体的分子量约为33 000,二者相互结合的比例约为1:1。结论本研究为TCCP重复片段与SH3(IRTKS)相互作用提供了直接证据,同时复合体的制备,为利用晶体学研究两者的相互作用奠定了基础。     

Survey of O-islands in Escherichia coli O157 and Other Enteric Pathogens—O-islands of E. coli O157：H7

The genome of the enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 EDL933 contains 177 “O”-islands (OIs). Tostudy their potential contribution to the O157-specific pathogenicity, we surveyed the distribution of 22 OIs by PCR and DNA hybridization in 17 isolates of Shiga toxin producing (Stx-positive) E. coli O157:H7, and compared with their distribution in 21 isolates of Stx-negative E. coli O157 and 21 isolates of non-O157 enteric pathogens. Fourteen of 22 OIs were present innon-O157 entericpathogens analyzed. Eight of 22 OIs were found only in the 17 Shiga toxin- (Stx) positive E. coli O157:H7 isolates, but they were absent from the 21 Stx-negative E. coli O157: NM and O157 Hund isolates tested. Among the 8OIs, only OI43 or OI48 were exclusively detected in Stx-positive E. coli O157 : H7, absent from neither of Stx-negative E. coli O157 and non-O157 enteric pathogens, such as Salmonella, ShigeUa, Citrobacter, Vibrio cholera, enteropathogen-ic E. coli (EPEC), enteroadherent E. coli (EAEC), enteroinvasive E. coli (E1EC) and enterotoxingenic E. coli (ETEC). The OI43 and OI48 are 83 kb in size and identical in DNA sequences, which encode genes for urease, tellurite resistance and adherence. By analyzing their junction genes with PCR and DNA hybridization, we found that 21 Chinese isolates have OI48 only. However, for 7 Japanese patient isolates, 4 have OI43 and 3 have OI48; for American isolates, 2have both of O143 and OI48, 2 have OI48 only. These data confirmed the highly plasticity of the pathogenic E. coli genome. The unique presence of OI43/OI48 in Stx-positive E. coli 0157:H7 denotes its critical role in the pathogenicity specific to this pathogen.     

建立斑点金免疫渗滤法检测O157：H7型肠出血性大肠杆菌

肠出血性大肠杆菌（ＥＨＥＣ）被公认为是一种最重要的人类肠道致病菌。ＥＨＥＣＯ１５７:Ｈ７ 是产生Ｖｅｒｏ细胞毒素（ＶＴ）的常见血清型 ,除引起血性腹泻外 ,还可引起溶血性尿毒综合症（ＨＵＳ）和血栓性血小板减少性紫癜而危及生命。其临床症状易与肠套叠、溃疡性结肠炎及艰难梭菌感染所致的结肠炎混淆 ,且近年来 ,由其引起的感染性腹泻有明显上升的趋势。为此 ,建立一种快速、敏感、简便检测粪便标本中ＥＨＥＣＯ１５７:Ｈ７ 的方法是当务之急。１材料和方法１．１材料ＥＨＥＣＯ１５７:Ｈ７ 标准株和分离株（日本分离株６株 ,长春牛…     

大肠杆菌O157：H7 IntC300 B细胞抗原表位的综合预测

目的预测肠出血型大肠杆菌O157：H7 IntiminC端300氨基酸片段（IntC300）的B细胞抗原表位。方法采用计算机软件和网络服务器分析IntC300的亲水性、β-转角、柔韧性、表面可及性和抗原指数。判断其B细胞抗原表位。结果B细胞抗原表位可能在20—36、76—88、189—198、262—279和284—296残基或其附近。结论对EHEC O157：H7 IntC300 B细胞抗原表位的综合预测，为研究诊断性单克隆抗体及多肽疫苗提供了理论工具。     

肠出血性大肠埃希菌 espO基因敲除菌株的构建及其生物学功能初步研究

目的:检测 espO基因敲除对肠出血性大肠埃希菌(EHEC)生物学特性的影响。 方法:自杀质粒pCVD442-Δ espO介导的两步法构建 espO基因敲除菌株(Δ espO),pTrc99a质粒构建 espO基因回补突变株(CΔ esp...     

不同遗传谱系肠外大肠埃希菌毒力因子检测

目的 通过检测肠外致病性大肠埃希菌(ExPEC) 30种毒力因子了解其基因的检出情况及遗传谱系分型情况,并初步探讨两者关系,探究ExPEC的分子流行病学特点.方法 210株分离自血液、尿液及其他部位的菌株参与研究,采用多重PCR方法检测临床分离菌株毒力因子基因的存在情况并进行遗传谱系分型,比较菌株遗传谱系分型各组间毒力因子基因的检出情况是否有差异.结果 ExPEC中毒力基因fimH、fyuA、traT、iutA、kpsMTⅡ、PAI的检出率较高；遗传谱系分型表明4组百分比分别为24％、11％、29％和36％.在各组之间进行毒力因子基因检出情况比较显示,毒力因子中有8种仅与B2组联系密切,4种仅与D组联系密切,6种与B2组和D组均有关.结论 ExPEC遗传谱系分型主要属于B2组和D组,ExPEC毒力因子基因检出情况与菌株遗传谱系分型关系密切.     

应用酶联免疫吸附试验检测肠出血性大肠杆菌O157:H7

目的制备和纯化O157：H7抗原，免疫家兔和豚鼠，获得高效价的抗O157：H7免疫血清并进行纯化及酶标记。建立对O157：H7感染患者快速诊断方法，做到早期发现及时治疗，有效控制疫情的蔓延。方法ELISA双抗体夹心法检测O157：H7抗原。步骤：包被特异性抗体，加处理后的粪便等标本，然后加入抗O157：H7酶结合物，最后加入底物显色。结果本课题所研制的抗O157：H7酶结合物只对O157：H7呈阳性反应，而与其他相关细菌无交叉反应。结论应用酶联免疫吸附试验(即双抗体夹心法)对肠出血性大肠杆菌O157：H7抗原的检测较常规法实验程序简捷、快速、敏感。临床和现场验证结果表明，其方法具有灵敏度高，特异性强操作简单等特点，为肠出血性大肠杆菌O157：H7的鉴定及快速诊断提供了一种新的检测手段。     

上海闵行地区腹泻患者非O157型产志贺毒素大肠埃希菌感染特点及毒力基因评估

目的研究上海闵行地区腹泻患者非0157型产志贺毒素大肠埃希菌（非0157STEC）感染情况及其毒力基因分布特点。方法收集该地区三个监测哨点及复旦大学附属儿科医院腹泻门诊患者肛拭样本及临床资料,通过培养、分离、生化鉴定及血清凝集等金标准确认非0157STEC菌株。同时运用聚合酶链反应（PCR）方法检测毒力基因stxl、stx2、eae、hly、etpD、及katP。结果380例（儿童195例,成人185例）大肠埃希菌阳性的腹泻患者肛拭样本中,40例（儿童30例,成人10例）确认为非0157STEC阳性,儿童阳性率（15．4％）显著高于成人（5．4％）。全部40例非0157STEC分离株均显示stx2毒力基因阳性,而stxl及eae基因阳性率很低,未检测到hly、etpD、及katP毒力基因。结论上海闵行地区非0157STEC是引起人群尤其是儿童腹泻的主要病原体之一,其菌株均显示stx2毒力基因阳性。     

肠出血性大肠杆菌O157:H7特异性脂多糖抗原的制备

肠出血性大肠杆菌（Enterohemorrhagic Escherichia coil，EHEC）O157：H7是产Veto毒素的食源性肠道致病菌，可引起人类患血性腹泻、肾衰竭、尿毒综合征等症。本文应用热酚水法提取纯化了EHEC0157：H7脂多糖抗原及其O-特异性多糖（O-specific polysaocharide，O-SP）侧链。     

肠出血性大肠杆菌O157:H7外膜蛋白A敲除菌株的构建及其黏附作用研究

目的利用Red同源重组技术构建肠出血性大肠杆菌(EHEC)O157∶H7外膜蛋白A(ompA)基因敲除菌株,研究敲除菌株的黏附能力变化,阐明OmpA在细菌黏附以及致病中的作用。方法利用Red同源重组技术对EHEC O157∶H7 ompA基因进行敲除,同时构建EHEC O157:H7 ompA回复突变菌株,最后通过细胞试验对EHEC O157∶H7野生型菌株、敲除菌株及回复突变菌株的黏附能力进行比较。结果成功构建了EHEC O157:H7 ompA基因敲除菌株及其回复突变菌株。细胞试验结果表明,与野生型菌株相比,敲除菌株的黏附能力明显下降,而将ompA基因进行回复突变后其黏附能力又得到回复。结论 OmpA在EHEC O157∶H7黏附HeLa细胞过程中发挥重要作用,ompA基因敲除菌株的获得为进一步研究其功能提供了帮助。