SELDI蛋白芯片技术筛选肿瘤标记物的研究进展

在肿瘤诊断学方面 ,近年来出现的SELDI TOF MS蛋白芯片技术 ,对促进临床医学中新的肿瘤标记物的筛选提高了很大的一步 ,该项技术应用基因芯片的设计理念 ,把层析、质谱等项技术合理应用于蛋白芯片的检测 ,优点是能简便、快速从各种体液及组织中找出新的肿瘤标记物 ,获得蛋白质分子信息量大 ,有广阔的应用前景     

蛋白质组学在肿瘤研究中的应用

肿瘤是机体正常细胞在多因素、多基因作用下,经过多个步骤发生转化,失去原有的生长分化调节而异常增生的结果。因此,肿瘤细胞与其起源的正常细胞相比,蛋白质既有相同也有不同点。应用蛋白质组学研究技术可以比较患有同一肿瘤的不同个体的肿瘤组织(或细胞)之间,或者同一个体肿瘤细胞与正常起源细胞之间蛋白质在表达数量、表达位置和修饰状态上的差异,可以发现肿瘤发生过程中蛋白质变化的规律,筛选和确定肿瘤特异性标记物,对肿瘤发病机制的探讨以及在其诊断和有效治疗均具有重要的意义。     

蛋白质组学在肿瘤研究中的应用

肿瘤是机体正常细胞在多因素、多基因作用下，经过多个步骤发生转化，失去原有的生长分化调节而异常增生的结果。因此，肿瘤细胞与其起源的正常细胞相比，蛋白质既有相同也有不同点。应用蛋白质组学研究技术可以比较患有同一肿瘤的不同个体的肿瘤组织(或细胞)之间，或者同一个体肿瘤细胞与正常起源细胞之间蛋白质在表达数量、表达位置和修饰状态上的差异，可以发现肿瘤发生过程中蛋白质变化的规律，筛选和确定肿瘤特异性标记物，对肿瘤发病机制的探讨以及在其诊断和有效治疗均具有重要的意义.     

蛋白质组学技术在宫颈癌研究中的应用进展

蛋白质组学技术已广泛应用于肿瘤的发生机制、肿瘤特异性标志物的筛选和鉴定、疗效评价等方面的研究,也应用于宫颈癌的早期诊断、临床分期、筛选治疗靶点等方面的探索,从蛋白质组水平揭示了宫颈癌蛋白质表达谱的变化,为宫颈癌诊断和治疗的发展提供了可靠的理论依据.     

硅纳米线生物传感器与肿瘤标记物的检测

背景：肿瘤标记物检测对于原发肿瘤的早期诊断、肿瘤高危人群的筛选、良性和恶性肿瘤的鉴别、肿瘤发展程度的判断、肿瘤治疗效果的评价及肿瘤预后和复发的预测等方面具有重要意义。 目的：介绍硅纳米线生物传感器的检测原理和标记物检测实例,为硅纳米线生物传感器最终应用于肿瘤标记物临床提供理论支持。 方法：由第一作者检索PubMed数据库、中国知网数据库和谷歌学术搜索数据库等2003至2013年有关肿瘤标记物、硅纳米线生物传感器检测应用等方面的文章。 结果与结论：硅纳米线生物传感器具有超高的敏感度、无需二次标记等优势,已被应用于前列腺癌肿瘤标记物、乳腺癌肿瘤标记物、结直肠癌肿瘤标记物、原发性肝癌肿瘤标记物等的检测,展现了良好的应用前景,获得了十分理想的检测限。但由于德拜长度等因素的影响,目前大多数应用只能停留在对标准品溶液的检测,缺乏对临床肿瘤患者血清的检测数据。     

蛋白质指纹图谱技术在实验诊断与临床医学中的研究进展

蛋白质指纹图谱技术是近五年发展起来的实验室诊断新技术,它具有操作较简便、多样本检测、检测快速、灵敏性和特异性高等优点,是实验室诊断技术革命性的进展。蛋白质指纹图谱技术在医学领域中,主要用于多种疾病,如肿瘤的早期检测,对肿瘤早期检测的敏感性和特异性均在80%左右。以蛋白质指纹图谱技术为基础的免疫组质谱检测是在一个抗体组上同时捕获多个生物标志,并对捕获的变异或修饰的生物标志进行质谱精确分析。蛋白质指纹图谱技术及免疫组质谱检测技术特别对评估传统肿瘤标记物阴性的恶性肿瘤有意义。而且具有在分子或基因水平早期诊断的特点。蛋白质指纹图谱技术是一项发展前景非常好的诊断技术,具有广阔的临床应用前景。     

甲状腺乳头状癌的蛋白质组学研究

目的 对甲状腺乳头状癌(PTC)的蛋白质组进行研究,并与正常组织对比,寻找其中差异显著的蛋白.方法 应用蛋白质组学技术,提取10例PTC与周围正常甲状腺组织(NT)的蛋白质样品进行双向电泳分离及对比,应用Image Master软件对电泳图谱进行分析;将选出的差异性蛋白质点进行质谱鉴定和数据库查询.结果 得到了PTC及NT的双向电泳图谱;通过软件分析、对比,从中初步选取4个差异蛋白质点进行质谱鉴定,确认为4种相应的蛋白质:其中脂皮质蛋白(annexinⅠ)、peroxiredoxin Ⅰ、线粒体顺乌头酸酶(mitochondrial aconitase)在PTC中表达上升,碳酸酐酶Ⅰ(carbonic anhydrase Ⅰ)在PTC中表达下降.结论 蛋白质组学为PTC的研究提供了新的发展方向,在寻找肿瘤的特异性蛋白标记物、进一步探究肿瘤的发病机制以及寻找治疗肿瘤的分子靶点等方面发挥作用.     

SELEX与适配体在蛋白质研究中的应用

指数富集的配基系统进化(SELEX)是一种从大容量寡核苷酸文库中经反复分离扩增步骤得到针对靶分子的高亲和力高特异性核酸配基—适配体的体外筛选技术。SELEX技术自1990年发展至今,已涌现出多种筛选模式和分离方法。筛选特异结合蛋白质的SELEX技术发展直接影响和指导了适配体在蛋白质功能调控方面的应用。文章综述了多种SELEX技术在筛选蛋白质方面的发展近况,适配体在蛋白质功能研究中的应用,筛选过程中关键性因素的确定及适配体的前后期修饰。     

人肺腺癌细胞系与支气管上皮细胞系差异蛋白质组学研究

目的:通过对肺腺癌细胞系A549细胞和正常上皮细胞系HBE蛋白组成差异的分析,寻找与肺癌发生、发展相关的差异蛋白,为进一步阐明肺癌发病机制提供更多有价值的信息;为诊断或者预后提供候选分子标记物。方法:运用固相pH梯度双向电泳和基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI/TOF/TOF/MS)分析技术筛选出A549细胞和支气管上皮细胞系HBE间表达水平显著差异的蛋白,并且利用免疫印迹方法对筛选的标记物蛋白进行验证。结果:筛选出21个差异蛋白,涉及到细胞的代谢、蛋白质修饰、细胞运动,通道蛋白和信号转导调控等方面。鉴定并且验证在A549细胞中显著高表达热休克蛋白27(HSPB1)。结论:肺腺癌细胞系与正常支气管上皮细胞系蛋白质表达存在显著差异,其中肺腺癌中高表达HSPB1可能在肺腺癌癌变过程中发挥重要作用,本结果为进一步寻找肺腺癌癌变蛋白标志物奠定了基础。     

应用蛋白质组学分析结直肠癌促泌素和糖调节蛋白78蛋白变化及其意义

目的分析结直肠癌、配对正常黏膜组织差异表达蛋白质,寻找与结直肠癌发生、发展相关的分子标记物。方法固相pH梯度双向凝胶电泳分离结直肠癌患者配对癌及正常黏膜组织的总蛋白,液相色谱串联质谱鉴定差异表达蛋白质点。半定量逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）、Western blot及免疫组织化学（EnVision法）方法检测促泌素（SCGN）及糖调节蛋白78（GRP78）两个差异表达蛋白质及组织定位,并检测54例神经内分泌肿瘤SCGN的表达。结果比较结直肠癌、配对正常黏膜组织蛋白质表达图谱,共获得5倍以上差异蛋白质点35个,癌组织中表达上调15个、下调20个。质谱分析鉴定14个蛋白质。RT-PCR及Western blot证实结直肠癌组织SCGN低表达,免疫组织化学染色发现正常结直肠黏膜神经内分泌细胞及98％（53／54）的神经内分泌肿瘤SCGN阳性。GRP78蛋白在结直肠癌组织中的表达明显高于正常黏膜组织,但在mRNA水平上癌组织和正常组织之间差异无统计学意义。结论双向凝胶电泳结合质谱分析是筛选肿瘤异常表达蛋白质的有效手段,所获得的35个差异表达候选蛋白质可能与结直肠癌的发生、发展有关。SCGN是一个候选神经内分泌标记物,GRP78蛋白表达增高可能涉及翻译后修饰。     

蛋白质组学在肿瘤诊断及治疗中的进展

蛋白质组(proteom e)指的是由一个基因组表达的全部蛋白质,由马克.威尔金斯(M arc W ilk ins)于1994年首先提出,旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式,鉴定蛋白质的存在方式(修饰形式),研究其结构、功能、定量和相互作用等。蛋白质组学研究的技术主要有双向凝胶电泳技术(2-DE),质谱技术(MS),以及生物信息学技术。目前认为恶性肿瘤的发生是由环境与遗传因素相互作用而导致许多基因突变,从而导致蛋白质的表达、结构和功能改变。蛋白质组学在肿瘤高危人群的筛选,肿瘤标志物的鉴定,肿瘤细胞的蛋白质分子变化的分析,以及肿瘤的预防、…     

应用SELDI-TOF-MS技术分析VKC泪液的差异表达蛋白

目的:探讨用蛋白质芯片技术筛选春季卡他性结膜炎(vernal keratoconjunctivis,VKC)患者泪液中蛋白质表达谱,寻找泪液中的标志性蛋白。方法:采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surface-enhanced la-ser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),运用CM10蛋白质芯片检测66例VKC患者和62例正常对照组泪液中蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用Biomarker Wizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(support vector machines,SVM)方法建立并测试VKC患者泪液中的蛋白质指纹图谱模型。结果:在芯片上捕获到145种蛋白质,用质谱仪筛选出VKC患者与正常对照组相比的23种差异蛋白,从中再次筛选出3种蛋白质组成VKC的蛋白质谱最优化模型,VKC患者泪液中质荷比(m/z)分别为2024.3,6630.2和8598.9的3种蛋白质表达上调。模型经三倍交叉验证后用盲法测定,其敏感性和特异性分别为90.91%和93.55%,阳性预测值为93.75%。结论:蛋白质芯片技术可快速、有效地筛选出VKC患者泪液差异蛋白,结合SVM可建立一个由3种蛋白质组成的蛋白质指纹图谱模型,可对VKC做很好的诊断预测,对这3种蛋白质尤其是m/z为2024.8的蛋白质进行研究,有助于VKC病因学进展及诊断标记物的发现。     

定量蛋白质组学在系统性红斑狼疮疾病中的应用

定量蛋白质组学的目的是对复杂的混合体系中所有的蛋白质进行鉴定,并对蛋白质量的变化进行测定,是当前生物科学研究中的重要内容.近年来,以质谱为基础的定量蛋白质组学技术在分析蛋白质组或亚蛋白质组方面取得令人瞩目的成就.对寻找和发现疾病中的特异标记物,对疾病的预防、诊断及疗效的监测方面具有重要作用.当前定量蛋白质组学在系统性红...     

蛋白质组学研究进展及其在肿瘤中的应用

随着人类全基因组测序工作的完成 ,对基因功能即基因表达产物蛋白的研究已经拉开了序幕。蛋白质组学研究直接定位于蛋白质水平 ,大规模地分析组织细胞的蛋白质表达水平、翻译后修饰以及蛋白质间相互作用 ,是后基因组计划的重要组成部分。肿瘤的发生涉及一系列复杂的分子事件 ,从蛋白质整体水平上研究肿瘤 ,可以进一步揭示肿瘤发病的分子机制 ,为肿瘤的诊断、治疗、药物的筛选带来新的思路和途径 ,为肿瘤的研究提供新的平台。本文就目前蛋白质组学研究中的主要技术体系、策略及其在肿瘤研究中的一些进展作一综述。     

肿瘤早期诊断分子标志物研究进展

早期诊断是肿瘤研究的重要方向之一。虽然在宫颈癌、乳腺癌等一些肿瘤中建立了早期筛查方法,但对于大部分肿瘤而言,尚没有敏感、特异的早期诊断方法。高通量分子生物学技术的建立,使研究者可以在全基因组、转录组、蛋白质组等水平筛选分子标志物,大大提高了筛选效率。已有研究筛选出了大量的肿瘤早期分子改变和候选早期分子标志物,未来将有更多敏感、特异的早期诊断分子标志物被发现并用于肿瘤早期筛查和诊断。     

肿瘤生物标志物筛选策略的思考

肿瘤特异性生物标志物检测是开展肿瘤早期诊断的有效途径之一。蛋白质组学技术在肿瘤早期诊断、病程及疗效监督等方面起着重要作用,尤其在肿瘤早期标志物及药物靶位的筛选方面,仍然存在一些亟待解决的问题。本文对利用蛋白质组学技术筛选生物标志物的研究现状进行评述。     

OCT4在生殖细胞肿瘤的诊断价值

原始生殖细胞具有多向分化的潜能,由其发生的肿瘤形态变化多样,种类较多,如精原细胞瘤、无性细胞瘤、生殖细胞瘤和胚胎性癌,然而这些生殖细胞来源的肿瘤容易与一些非生殖细胞来源的肿瘤相混淆。尽管目前已经发现了CD117（c—kit）、胎盘碱性磷酸酶（PLAP）、CD30和D2-40等一些生殖细胞肿瘤的标记物,但这些标记物并不是生殖细胞肿瘤特异性标记物。OCT4是近年来发现的一种在维持胚胎干细胞和原始生殖细胞的多潜能性方面具有重要作用的转录因子,一些学者发现该蛋白特异性表达于生殖细胞肿瘤中,成为一种新的生殖细胞肿瘤较为特异的标记物。本文就OCT4蛋白在生殖细胞肿瘤的诊断价值做一综述。     

长链非编码RNA低表达或表达缺失与恶性肿瘤发生的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的非编码RNA,其通过与DNA、RNA和蛋白质等分子相互作用,从表观遗传学、转录水平以及转录后水平等3个层面发挥重要调控作用.近年研究表明,lncRNAs在许多肿瘤的发生、发展过程中发挥着促癌或抑癌作用,部分lncRNAs因其特殊的生物学特性有希望成为新型肿瘤标记物和肿瘤治疗的新靶点.本文总结了近年来在肿瘤中低表达或呈表达缺失的lncRNAs,探讨其与肿瘤发生的相关机制,评价其在肿瘤诊断和治疗方面的临床应用前景.     

组织芯片技术在肿瘤分子标志物研究中的应用

肿瘤分子标志物在肿瘤诊断、侵袭、转移、疗效判断和预后预测等方面具有重要作用,而肿瘤标志物的筛选需检测其在成百上千例肿瘤的不同发展阶段、不同分化程度和其相应正常组织中的表达,分析其表达水平与肿瘤临床病理特征的关系。组织芯片技术为筛选肿瘤分子标志物提供了新的高通量工具,显著加速了基因组学和蛋白组学技术在肿瘤临床中的应用。     

肿瘤基因标志物在造血系统肿瘤诊断和分型中的应用

目前许多肿瘤基因标记物已被发现,在基因水平精确地对肿瘤进行诊断和分型是将来肿瘤诊断学发展的趋势.它已应用于日常的肿瘤诊断、筛选、治疗效果的判断及预后复发的判断.淋巴造血系统肿瘤常可检测到抗原受体基因克隆性重排和细胞染色体易位导致融合基因的异常表达.利用特异的基因标记,能使淋巴系统肿瘤得以准确分型.