基因芯片与线性探针技术检测涂阳肺结核患者痰标本MTB耐药性的价值

目的 评价基因芯片技术与线性探针技术(GenoType MTBDRplus)快速检测MTB耐药性的临床应用价值。方法 选取西安市胸科医院2017年4月至2018年8月住院治疗的493例涂阳肺结核患者作为研究对象,收集其痰标本,痰标本量均不少于2ml。每例患者用同一份痰标本分别进行基因芯片检测、线性探针检测和BACTEC MGIT 960液体培养(简称“MGIT 960液体培养”),同时对培养阳性且鉴定为MTB的临床分离株进行MGIT 960液体药物敏感性试验(简称“药敏试验”)。以MGIT 960液体药敏试验结果为参照标准,分析基因芯片技术及线性探针技术检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平和异烟肼耐药性的效能。结果 454例研究对象同时具有3种药敏试验检测结果。以MGIT 960液体药敏试验结果为参照标准,基因芯片法和线性探针法检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平耐药性的敏感度、特异度、Kappa值分别为89.0%(65/73)、96.1%(366/381)、0.82和90.4%(66/73)、96.1%(366/381)、0.83;检测涂阳肺结核患者痰标本MTB异烟肼耐药性的敏感度、特异度、Kappa值分别为80.2%(93/116)、96.7%(327/338)、0.80和81.9%(95/116)、97.0%(328/338)、0.82。454例涂阳肺结核患者痰标本中,453例应用2种分子生物学检测方法检测MTB利福平耐药性结果相同,符合率为99.8%;445例应用2种分子生物学方法检测MTB异烟肼耐药性结果相同,符合率为98.0%。结论 基因芯片技术和线性探针技术(GenoType MTBDRplus)检测涂阳肺结核患者痰标本MTB利福平和异烟肼耐药性与MGIT 960液体药敏试验具有较高的一致性,二者均可为临床提供快速、特异的耐药检测结果。     

GeneXpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌对利福平耐药假阳性与标本低水平荷菌量的关系

目的对GeneXpert MTB/RIF检测(简称"GeneXpert检测")结核分枝杆菌(MTB)及其对利福平耐药性的临床应用进行综合评价,并探讨GeneXpert检测MTB对利福平耐药假阳性与临床标本低水平荷菌量的关系。方法收集2016年4月至2017年9月在西安市胸科医院就诊的2707例疑似肺结核患者的临床标本,其中痰标本1945例,肺泡灌洗液标本762例,同时进行GeneXpert检测、BACTEC MGIT 960液体培养(简称"MGIT 960法")及药物敏感性试验(简称"药敏试验"),并将GeneXpert检测MTB对利福平耐药的标本进行GenoType MTBDRplus检测(简称"MTBDRplus检测")。结果GeneXpert检测临床标本的阳性率为39. 8%(1077/2707),对利福平是否耐药不确定者有7例,荷菌量水平均为"极低"。以MGIT 960药敏试验结果为标准,GeneXpert检测MTB对利福平耐药的敏感度和特异度分别为89. 4%(135/151)和94. 7%(721/761)。两种检测方法判断MTB对利福平耐药不一致的结果共56例,其中GeneXpert检测MTB对利福平耐药而MGIT 960药敏试验检测为敏感的40例患者中,处于"极低"、"低"、"中等"和"高"4个菌量水平的患者分别为10例、6例、14例和10例。以MGIT960药敏试验检测结果为标准,4个菌量级别中,GeneXpert检测MTB对利福平耐药的假阳性率分别为58.8%(10/17)、16.7%(6/36)、19.2%(14/73)和20.4%(10/49),差异有统计学意义(χ~2=13.981,P<0.05)。对40例患者进行MTBDRplus检测,结果显示,标本荷菌量水平为"低"、"中等"和"高"的30例标本均为对利福平耐药,与GeneXpert检测结果完全一致。标本荷菌量水平为"极低"的10例标本中,有2例MTBDRplus检测阴性,8例阳性;检测阳性的8例中有5例对利福平敏感,3例对利福平耐药。结论GeneXpert技术检测MTB是否对利福平耐药具有较高的敏感度和特异度,但在检测样本荷菌量极低时,可能会出现假耐药的情况。     

微孔板法与GeneXpert MTB/RIF技术检测结核分枝杆菌对利福平耐药性的价值

目的探讨微孔板法和GeneXpertMTB/RIF(简称"GeneXpert")技术检测MTB对利福平(RFP)耐药性的价值。方法收集陕西省结核病防治院2017年收住入院和门诊诊治的疑似结核病患者6893例,按照临床诊断标准确诊为结核病患者6086例,同时使用BACTEC MGIT 960液体培养(简称"MGIT 960法")和GeneXpert技术检测上述确诊患者的425份临床标本;其中,痰标本217份、肺泡灌洗液标本170份、肺外标本(包括胸腹腔积液、脓液,脑脊液等)38份;排除3例报告错误或无法判读、2例培养结果污染的标本,有效标本份数为420份。对其中GeneXpert技术和MGIT 960液体培养均为阳性的372株临床分离株同时进行微孔板法、GeneXpert技术和MGIT 960耐药性检测,其中痰标本191例、肺泡灌洗液标本158例、肺外标本(包括胸腹腔积液、脓液及脑脊液等)23例,以MGIT 960检测结果为标准,分析微孔板法和GeneXpert技术检测结核分枝杆菌对RFP耐药性的诊断价值。结果GeneXpert技术、微孔板法和MGIT 960法对RFP耐药性检测总的阳性率分别为18.8%(70/372)、16. 7%(62/372)、16. 7%(62/372)。以MGIT 960法检测结果为标准,微孔板法和GeneXpert法对利福平耐药性检测的敏感度、特异度、符合率、Kappa值分别为91. 9%(57/62)、98. 4%(305/310)、97. 3%(362/372)、0. 8,96. 8%(60/62)、96. 8%(300/310)、96. 8%(360/372)、0. 8;微孔板法和GeneXpert法对痰液、肺泡灌洗液、肺外标本利福平耐药性检测的敏感度、特异度、符合率、Kappa值分别为96. 7%(29/30)、98.1%(158/161)、97. 9%(187/191)、0. 9,93.3%(28/30)、96.3%(155/161)、95. 8%(183/191)、0.9, 91. 7%(22/24)、98. 5%(132/134)、97. 5%(154/158)、0.9和100.0%(24/24)、97.0%(130/134)、97. 5%(154/158)、0.9,75.0%(6/8)、100.0%(15/15)、91. 3%(21/23)、0.8,100.0%(8/8)、100.0%(15/15)、100.0%(23/23)、1.0。结论以MGIT 960检测结果为标准,微孔板法和GeneXpert技术对利福平耐药性检测总的阳性率和不同标本对利福平耐药性检测的阳性率均具有较好的一致性。     

荧光PCR探针熔解曲线技术检测涂阳患者痰标本中结核分枝杆菌耐药性的价值

目的 评估荧光PCR探针熔解曲线(MeltPro)技术检测涂阳患者痰标本中MTB耐药性的效能。方法 收集2016年9月至2018年8月西安市胸科医院500例痰涂片阳性患者的痰标本,分别进行痰涂片镜检、GeneXpert MTB /RIF检测、BACTEC MGIT 960(简称“MGIT 960”)液体培养、表型药物敏感性试验(简称“药敏试验”),并应用MeltPro法检测痰标本中MTB菌株对利福平、异烟肼、二线注射类和氟喹诺酮类等抗结核药物的耐药性,并以表型药敏试验为标准,评价MeltPro法的检测效能。结果 以表型药敏试验结果为标准,MeltPro法检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为98.7%(76/77)和94.2%(343/364),检测对异烟肼耐药性的敏感度和特异度分别为82.3%(102/124)和96.2%(304/316),检测对阿米卡星耐药性的敏感度和特异度分别为8/9和99.5%(432/434),检测对卷曲霉素耐药性的敏感度和特异度分别为6/7和99.1%(432/436),检测对左氧氟沙星耐药性的敏感度和特异度分别为90.6%(48/53)和99.2%(386/389),检测对莫西沙星耐药性的敏感度和特异度分别为88.1%(37/42)和96.5%(386/400)。以表型药敏试验结果为标准,GeneXpert MTB/RIF检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为94.8%(73/77)和94.0%(342/364)。GeneXpert-MTB/RIF和MeltPro法与表型药敏试验结果一致性均较好(Kappa值分别为0.81和0.84),但MeltPro法检测效能与表型药敏试验检测结果的一致性更高。结论 MeltPro法检测涂阳患者痰标本中MTB菌株对利福平、异烟肼,以及二线注射类和氟喹诺酮类抗结核药物耐药性有较好的效能。     

GeneXpert MTB/RIF与线性探针技术检测骨关节结核及利福平耐药性的价值

目的探讨GeneXpert MTB/RIF(简称"GeneXpert")和线性探针技术检测骨关节结核及利福平耐药性的临床应用价值。方法选取2018年3-12月接受病灶清除手术或穿刺术的疑似骨关节结核患者172例,同时采用GeneXpert、线性探针技术及BACTEC MGIT 960对患者病灶标本进行检测。以临床综合诊断为参照标准,评价GeneXpert、线性探针技术及两种方法联合检测骨关节结核的效能。以BACTEC MGIT 960药物敏感性试验(DST)结果为参照标准,评价GeneXpert、线性探针技术及两种方法联合检测MTB对利福平耐药性的效能。结果 172例疑似骨关节结核患者经临床综合诊断,112例诊断为骨关节结核,60例为非骨关节结核。以临床综合诊断为参照标准,GeneXpert检测骨关节结核的敏感度和特异度分别为82. 14%(92/112)和96. 67%(58/60),与临床诊断结果一致性良好(Kappa=0. 74);线性探针技术检测的敏感度和特异度分别为69. 64%(78/112)和90. 00%(54/60),与临床诊断结果一致性一般(Kappa=0. 54);两种方法联合检验的敏感度和特异度分别为82. 14%(92/112)和90. 00%(54/60),与临床诊断结果一致性良好(Kappa=0. 68)。三种方法诊断骨关节结核的受试者工作特征曲线(简称"ROC曲线")下面积分别为0. 89、0. 80、0. 86,提示诊断价值均较好。以BACTEC MGIT 960DST结果为参照标准,GeneXpert检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为100. 00%(18/18)和92. 31%(24/26),与BACTEC MGIT 960 DST结果一致性较高(Kappa=0. 91),ROC曲线下面积为0. 96;线性探针技术检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为100.00%(18/18)和88.46%(23/26),与BACTEC MGIT 960 DST结果一致性较高(Kappa=0. 86),ROC曲线下面积为0. 94;两种方法联合检验结果与线性探针技术检测结果一致。结论 GeneXpert、线性探针技术能够快速、准确的检测骨关节结核及其耐药性,具有较好的临床应用价值。     

基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值

目的 探讨基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值。 方法 收集2017年6月至2018年6月厦门大学附属第一医院肺科门诊及住院的933例疑似肺结核患者初诊时采集的同一份晨痰标本,同时进行基因芯片法、GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)和BACTEC MGIT 960液体培养及其比例法药物敏感性试验(简称“MGIT 960及其比例法药敏试验”)3种方法进行结核分枝杆菌及其耐药性检测,对检测结果进行对比分析。 结果 933例患者的痰标本中,基因芯片法检测出阳性484例,GeneXpert检测出阳性462例,MGIT 960培养出阳性411例。三种检测方法均为阳性的标本有395例,采用Excel表通过完全随机的方式抽取232例进行耐药性检测,以比例法药敏试验结果为参考标准,基因芯片法检测出异烟肼耐药的敏感度为86.67%(26/30),特异度为96.53%(195/202),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.798(0.682~0.914);检测出利福平耐药的敏感度为93.75%(30/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为96.55%(224/232),Kappa值为0.862(0.768~0.956);GeneXpert检测出利福平耐药的敏感度为84.38%(27/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.803(0.691~0.915);基因芯片法与GeneXpert对利福平耐药检测的一致性为96.12%(223/232),Kappa值为0.847(0.749~0.945)。Kappa值均大于0.75,具有良好的一致性。 结论 以MGIT 960及其比例法药敏试验结果为标准,基因芯片法敏感度、特异度和一致性高,与GeneXpert也具有良好的一致性,有助于结核病的早期诊断及防控。     

新型胶颗粒芯片技术检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的研究

目的 评估一种新型胶颗粒芯片技术[TruArray胶颗粒芯片(Gel element arrays),简称为“TruArray芯片”]用于痰标本中结核分枝杆菌及利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药性的检测效能。 方法 选取2016年8月在首都医科大学附属北京胸科医院就诊的149例疑似肺结核患者痰标本,分别进行涂片镜检、BACTEC MGIT 960快速液体培养系统(简称“MGIT 960”)、TruArray芯片和GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)检测,对液体培养阳性菌株进行测序菌种鉴定、MGIT 960药物敏感性试验(简称“药敏试验”)和耐药相关基因测序,分析TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的检测效能。 结果 液体培养、GeneXpert和TruArray芯片对结核分枝杆菌的检出率分别为32.2%(48/149),53.7%(80/149)和57.0%(85/149),TruArray芯片和GeneXpert两种方法检出率差异无统计学意义(χ ²=0.34,P=0.560),但TruArray芯片检测阳性率高于液体培养(χ ²=18.59,P<0.01)。以MGIT 960试验结果为标准,TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.9%(47/48)和61.4%(62/101);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.5%(78/80)和88.4%(61/69)。以MGIT 960药敏试验结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为91.7%(11/12)和96.8%(30/31);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度为85.0%(17/20)和97.9%(47/48);以耐药基因测序结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为92.3%(12/13)和100.0%(30/30)。以MGIT 960液体药敏试验结果为标准,TruArray芯片技术检测INH耐药的敏感度和特异度分别为78.6%(11/14)和93.8%(30/32);以耐药基因测序结果为判断标准,TruArray芯片检测INH耐药的敏感度和特异度分别为100.0%(11/11)和94.3%(33/35)。 结论 TruArray芯片检测技术快速、可靠,在结核病及耐多药结核病快速诊断方面具有非常好的应用前景。     

不同细菌学与病理学检查技术对骨关节结核诊断的效能研究

目的:回顾性分析脓液标本细菌学检测技术和组织标本病理学检测技术诊断骨关节结核的检测效能。方法:以2016年1月至2018年12月在北京胸科医院住院治疗的213例送检同部位脓液和组织标本进行检测的疑似骨关节结核患者作为研究对象,取新鲜脓液标本进行涂片染色镜检、GeneXpert MTB/RIF(GeneXpert)检测、实时荧光定量PCR(FQ-PCR)检测和BACTEC MGIT 960液体培养(MGIT 960液体培养);组织标本经石蜡包埋后进行抗酸染色镜检和FQ-PCR检测。结果:根据骨结核临床诊断综合参考标准(CRS),186例纳入患者诊断为骨关节结核,其中124例为确诊结核患者,23例为高度疑似结核患者,39例为疑似结核患者;27例患者排除骨关节结核。与CRS比较,脓液标本涂片镜检、MGIT 960液体培养、FQ-PCR、GeneXpert以及组织标本抗酸染色和FQ-PCR检测的敏感度分别为28.7%(49/171)、49.0%(48/98)、58.1%(25/43)、87.5%(161/184)、48.6%(90/185)和85.4%(146/171);特异度分别为100.0...     

粪便GeneXpert MTB/RIF检测在肠结核诊断中的应用价值

目的:评价对粪便标本进行利福平耐药实时荧光定量核酸扩增(GeneXpert MTB/RIF)检测诊断肠结核的临床应用价值。方法:收集2019年1月至2021年12月首都医科大学附属北京胸科医院就诊的538例临床疑似肠结核患者的粪便标本,进行荧光涂片显微镜镜检、BACTEC MGIT 960液体快速培养、GeneXpert MTB/RIF检测,同时行全血结核感染T细胞斑点试验、肠镜及肠黏膜组织病理检查,分析粪便标本通过GeneXpert MTB/RIF方法诊断肠结核的效能。结果:538例疑似肠结核患者经临床诊断标准诊断,其中189例诊断为肠结核,349例诊断为非肠结核(包括溃疡型结肠炎、肠道感染、消化道溃疡、恶性肿瘤、克罗恩病等)。以临床诊断结果为标准,粪便标本GeneXpert MTB/RIF检测的敏感度和特异度分别为77.2%(95%CI:70.5%～82.9%)和51.0%(95%CI:45.6%～56.3%),粪便荧光涂片显微镜镜检的敏感度和特异度分别为23.3%(95%CI:17.6%～30.1%)和92.8%(95%CI:89.5%～95.2%);粪便BACTEC MGIT ...     

DNA微阵列芯片技术检测培阳肺结核患者痰样本中结核分枝杆菌耐药性的价值

目的 评价DNA微阵列芯片法(以下称芯片法)检测培养阳性患者痰样本的利福平和异烟肼相关耐药基因的效能.方法 收集并检测389例疑似肺结核患者痰样,以BACTEC MGIT 960液体药敏(以下称MGIT 960药敏)为参考标准,评价芯片法检测样本利福平(RIF)、异烟肼(INH)耐药性和MDR-TB的灵敏度、特异度及一...     

Evaluation of gene chips for the rapid diagnosis of drug-resistance genes in Mycobacterium tuberculosis

目的 探讨基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值。 方法 收集2017年6月至2018年6月厦门大学附属第一医院肺科门诊及住院的933例疑似肺结核患者初诊时采集的同一份晨痰标本,同时进行基因芯片法、GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)和BACTEC MGIT 960液体培养及其比例法药物敏感性试验(简称“MGIT 960及其比例法药敏试验”)3种方法进行结核分枝杆菌及其耐药性检测,对检测结果进行对比分析。 结果 933例患者的痰标本中,基因芯片法检测出阳性484例,GeneXpert检测出阳性462例,MGIT 960培养出阳性411例。三种检测方法均为阳性的标本有395例,采用Excel表通过完全随机的方式抽取232例进行耐药性检测,以比例法药敏试验结果为参考标准,基因芯片法检测出异烟肼耐药的敏感度为86.67%(26/30),特异度为96.53%(195/202),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.798(0.682~0.914);检测出利福平耐药的敏感度为93.75%(30/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为96.55%(224/232),Kappa值为0.862(0.768~0.956);GeneXpert检测出利福平耐药的敏感度为84.38%(27/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.803(0.691~0.915);基因芯片法与GeneXpert对利福平耐药检测的一致性为96.12%(223/232),Kappa值为0.847(0.749~0.945)。Kappa值均大于0.75,具有良好的一致性。 结论 以MGIT 960及其比例法药敏试验结果为标准,基因芯片法敏感度、特异度和一致性高,与GeneXpert也具有良好的一致性,有助于结核病的早期诊断及防控。     

荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌耐药基因的结果分析

目的 分析和探讨荧光PCR熔解曲线法对结核病的诊断和耐药检测的应用价值。方法 收集2015年9月至2016年12月新疆维吾尔自治区胸科医院的976例疑似结核病患者的痰标本,运用探针荧光PCR熔解曲线法来检测结核分枝杆菌及其对利福平、异烟肼的耐药突变情况。以BACTEC MGIT 960液体培养法及液体药敏试验检测结果为标准,评价探针荧光PCR熔解曲线法鉴定结核分枝杆菌及其耐药突变检测的敏感度、特异度、一致率、Kappa值等。结果 以MGIT 960液体培养结果为标准,荧光PCR熔解曲线法鉴定结核DNA的敏感度为85.44%(135/158),特异度为94.01%(769/818),Kappa值为0.75,诊断符合率为92.62%(904/976)。以MGIT 960液体药敏试验结果为标准,荧光PCR熔解曲线法对异烟肼耐药突变检测的敏感度为83.33%(20/24),特异度为94.59%(105/111),Kappa值为0.76,诊断符合率为92.59%(125/135);荧光PCR熔解曲线法对利福平耐药突变检测的敏感度为95.83%(23/24),特异度为95.50%(106/111),Kappa值为0.86,诊断符合率为95.56%(129/135)。结论 荧光PCR熔解曲线法检测速度快,对利福平和异烟肼耐药突变检测结果具有良好的敏感度和特异度,可用于临床上对结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药情况的快速筛查。     

国产实时荧光定量PCR试剂与GeneXpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌的对比分析

目的评价国产实时荧光定量PCR(FQ-PCR)试剂与GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)检测痰标本结核分枝杆菌的临床应用价值,并比较两者的检测效能。方法收集2017年1月至2018年12月于深圳市南山区慢性病防治院就诊的210例疑似肺结核患者的痰标本,同时做涂片镜检、BACTEC MGIT 960(简称“MGIT 960”)培养、GeneXpert和FQ-PCR检测。以MGIT 960培养为参考,比较GeneXpert和FQ-PCR检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,比较两者与MGIT 960培养结果的一致性及两者之间的一致性。按照涂片镜检结果分级报告标准,将痰标本分为荷菌量逐步递增的6个组,即阴性组、少量组、+组、++组、+++组、++++组,比较GeneXpert和FQ-PCR检测各个组阈值循环数(Ct值)均值的差异。结果GeneXpert检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为83.7%(123/147)、87.9%(51/58)、94.6%(123/130)、68.0%(51/75);FQ-PCR检测的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为83.7%(123/147)、89.8%(53/59)、95.3%(123/129)、68.8%(53/77)。FQ-PCR、GeneXpert分别与MGIT 960行Kappa检验,一致性分别为85.4%(176/206)和84.9%(174/205),Kappa值分别为0.70、0.66;对GeneXpert和FQ-PCR检测结果行Kappa检验,一致性为92.8%(194/209),Kappa值为0.85。FQ-PCR检测显示,阴性组与少量组的Ct值均值比较[(33.87±5.00)和(27.29±1.30)个],差异有统计学意义(t=5.56,P<0.001);GeneXpert检测分别为(33.32±6.05)和(23.99±3.36)个,差异有统计学意义(t=5.19,P<0.001)。检测涂片阴性标本时,FQ-PCR与GeneXpert检测的Ct值均值[(33.87±5.00)和(33.32±6.05)个]差异无统计学意义(t=0.32,P=0.750);检测涂片阳性(少量组、+组、++组、+++组、++++组)标本时,FQ-PCR检测的Ct值均值[分别为(27.29±1.30)、(27.95±2.85)、(25.88±3.62)、(24.79±2.46)、(22.38±2.72)个]均明显高于GeneXpert检测[分别为(23.99±3.36)、(23.10±4.05)、(20.22±2.81)、(20.31±4.16)、(16.48±2.78)个],差异均有统计学意义(t值分别为2.60、4.71、6.08、3.85、9.02,P值分别为0.030、<0.001、<0.001、<0.001、<0.001)。结论国产FQ-PCR试剂与GeneXpert检测结果一致性较好,对结核病大规模筛查、降低检测成本具有临床应用价值。