Wnt信号通路基因单核苷酸多态性与中国西部藏族人群结核易感性研究

目的 探讨中国西部地区藏族人群Wnt信号通路相关基因多态性位点与结核病易感性的关系。 方法 采用MassARRAY质谱分析法对488例藏族结核病患者（病例组）和454例藏族健康对照（对照组）进行Wnt信号通路中5个基因单核苷酸多态性(SNP)检测,分别为CTNNB1基因rs4135385位点、DKK1基因rs11001553位点、WIF1基因rs56900803位点、SFRP1基因 rs7832767位点和AXIN2基因rs11079571位点。计算目标SNPs的基因型及等位基因频率的分布,并对差异有统计学意义的突变位点进行遗传模型分析(共显性、显性、隐性模型)。同时,比较目标SNPs在藏族与汉族两个群体中的多态性差异。结果 5个SNPs位点在病例组与对照组的频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。SFRP1 rs7832767在病例组和对照组中的基因型和等位基因频率分布差异有统计学意义(P=0.004,0.002)。相较于野生型等位基因C,突变等位基因T可能增加藏族人群患结核病的风险〔比值比(OR)=1.260, 95%可信区间（95%CI）: 1.086~1.471, P=0.002〕。该位点的共显性遗传模型TT/CC,显性遗传模型TC+TT/CC及隐性遗传模型TT/CC+TT都显示出与高结核病发病风险相关（P值分别为0.004,0.030、0.002,OR值分别为2.31、1.33、2.15）。其余4个SNPs位点的基因型频率与等位基因频率分布在两组中相似,差异无统计学意义(P均 > 0.05)。比较汉族、藏族结核人群发现：CTNNB1基因rs4135385位点的基因型频率和等位基因频率在两组人群中的分布不一致,差异有统计学意义(P=0.035, 0.021),其余4个SNPs位点在两民族间的分布差异无统计学意义(P均>0.05)。 结论 Wnt信号通路SFRP1基因多态性与中国西部地区藏族人群结核病的发生相关,SFRP1基因可能属于结核病的易感基因。CTNNB1基因多态性提示藏、汉族人群具有不同的遗传背景。     

SLC1A1基因多态性与中国汉族人群强迫症的相关性

目的：探讨谷氨酸转运体基因（SLC1A1）与中国汉族人群强迫症（OCD）的关系。方法：采用病例对照研究,以125例患者（OCD组）和125例正常人（对照组）作为研究对象,检测SLC1A1基因的3个位点（rs301430、rs301434、rs301979）,分析这些位点等位基因、基因型分布,以及单倍体与OCD之间的关系。结果：3个位点的等位基因和基因型频率分布在OCD组和对照组中的差异无统计学意义（P＞0.05）。经性别分层分析,相较于对照组,女性患者rs301979位点等位基因和基因型频率分布与对照组差异有统计学意义（χ2=7.875,P=0.019;χ2=7.331,P=0.007）,而男性患者中所有位点的等位基因和基因型频率分布差异均无统计学意义（P＞0.05）。三位点单倍体T-A-G在2组中的差异有统计学意义（χ2=6.206,P=0.013）。结论：SLC1A1基因rs301979位点可能是女性OCD的易感基因位点,rs301430、rs301434、rs301979的单倍体T-A-G可能与中国汉族人群OCD发病相关。     

乳腺癌易感基因相互作用蛋白1基因功能区单核苷酸多态性与宫颈癌的相关性研究

目的：探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1基因（BRIP1）功能区5个单核苷酸多态性（SNP）位点与宫颈癌的相关性。方法严格按照诊断标准,采集无亲缘关系宫颈癌患者309例（病例组）及健康体检者（对照组）315名静脉血,提取基因组DNA,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测5个SNP的基因型,采用SPSS11.5及Haploview4.2软件分析各基因型、等位基因及单倍型频率在两组中的差异。结果宫颈癌组与正常对照组的BRIP1基因rs4986764（外显子18）及rs7213430（3＇非翻译区）位点基因型及等位基因频率分布差异有统计学意义（P〈0.05）。宫颈癌组rs4986764位点C等位基因频率显著高于对照组（P=0.036,OR=1.294,95%=1.017-1.647）;宫颈癌组 rs7213430位点 A 等位基因频率显著高于对照组（P=0.003,OR=1.435,95%CI=1.133-1.818）。连锁不平衡分析发现一个单倍型（rs11079454-rs7213430-rs4986763）高度连锁（D＇〉0.9）,宫颈癌组T-A-C单倍型频率显著高于对照组（P=0.018）。结论 BRIP1基因功能区rs4986764及rs7213430 SNP位点可能与宫颈癌有关,携带有rs4986764 C等位基因及rs7213430 A等位的个体可能更容易患宫颈癌。     

GUCY 1A3 基因位点rs7692387 单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病的相关性研究

目的 探讨GUCY 1A 3 基因位点rs7692387 单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病（冠心病）的相关性。方法 选取延边大学附属医院收集延边地区汉族冠心病患者204 例（冠心病组）以及健康体检的正常人群201 例（对照组）。采用基于荧光标记单碱基延伸原理的SNaPshot 技术对GUCY 1A 3 基因位点rs7692387 单核苷酸多态性进行分型检测。结果 冠心病组和对照组的GUCY 1A 3 基因位点rs7692387 的基因型分布均符合Hardy-Weinberg 平衡定律。冠心病组GG 基因型频率高于对照组,而对照组GA +AA 基因型频率高于冠心病组,差异有统计学意义（P <0.05）。G 和A 两等位基因频率分布差异亦有统计学意义（P <0.05）。应用Logistic 回归分析调整混杂因素,差异有统计学意义（P <0.05）,并发现GUCY 1A 3 基因位点rs7692387 的GG 基因型可增加冠心病的患病风险（O^R=1.543,95%CI ：1.022,2.327,P =0.039）,而A 等位基因可降低冠心病的患病风险（O^R=0.691,95%CI ：0.494,0.968,P =0.031）。结论 延边地区汉族人群GUCY 1A 3 基因位点rs7692387 单核苷酸多态性可能与冠心病具有相关性,其GG 基因型很可能是冠心病发病的易感基因型,而A等位基因可能是冠心病的保护性基因。     

脂联素基因多态性与多囊卵巢综合征的相关性研究

目的研究多囊卵巢综合征(PCOS)发病机制与脂联素基因(ADIPOQ)4个多态性位点之间的关系。方法随机选择多囊卵巢综合征患者65例为研究组,不孕不育患者60例作为对照组,采集所有研究对象的肘静脉血并提取基因组DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增和Sanger测序的方法检测和分析ADIPOQ的rs17300539、rs1501299、rs2241766、rs12495941四个单核苷酸多肽位点的基因型和等位基因。结果研究组和对照组rs17300539位点基因型之间的差异有统计学意义(χ~2=6.85,P=0.03),研究组rs17300539位点A等位基因频率明显高于对照组(χ~2=4.38,P=0.04),rs17300539位点AA基因型患者PCOS的风险显著高于GG基因型(OR=3.15,P=0.00)。研究组和对照组rs1501299位点基因型之间的差异有统计学意义(χ~2=7.75;P=0.02),研究组rs1501299位点C等位基因频率明显高于对照组,A等位基因频率明显低于对照组,差异有统计学意义(χ~2=4.38,P=0.04),rs1501299位点CC基因型PCOS的风险显著高于AA基因型(OR=2.75,P=0.01)。研究组和对照组rs2241766位点和rs12495941位点的基因型和等位基因频率分布之间的差异均无统计学意义(P0.05)。结论脂联素基因rs17300539位点与rs1501299位点的基因型频率分布和等位基因型频率分布在多囊卵巢综合征患者和不孕不育患者之间存在差异,rs17300539位点与rs1501299位点可能是多囊卵巢综合征的易感基因位点。     

DCK基因多态性与阿糖胞苷治疗急性髓系白血病疗效的关系

目的研究脱氧胞苷激酶（DCK）的单核苷酸多态性（SNP）及其对阿糖胞苷（Ara-C）治疗急性髓系白血病（AML）疗效的影响。方法采用高温连接酶检测反应技术,检测126例接受Ara-C治疗的AML患者（AML组）和100名健康人（正常对照组）DCK基因7个SNP位点（SNP1~7）的基因型和等位基因分布频率,比较DCK不同基因型分布AML组患者的Ara-C治疗效果。结果 DCK基因SNP1（rs2306744）等位基因和SNP2（rs12648166）基因型分布频率,在正常对照组与AML组和Ara-C治疗无效组（n=35）之间比较,差异均有统计学意义（P〈0.05）。在AML组,SNP1的CC型基因型和SNP2的多态性基因型（AG＋GG型）以及SNP3（rs4694362）的野生型基因型,对Ara-C治疗表现出较好的临床反应。结论 DCK基因的SNP能作为潜在的Ara-C治疗AML患者预后的分子标志之一。     

ITGA3、TP53INP2和AXIN2基因多态性与甲状腺乳头状癌发病的关联性分析

目的：探讨ITGA3、TP53INP2和AXIN2基因多态性与甲状腺乳头状癌( PTC )的关联性,为防治PTC提供依据。 方法：收集56例PTC患者(病例组)的血液,同时取50例甲状腺正常人(对照组)血样。应用激光解析电离飞行时间质谱技术检测ITGA3、TP53INP2和AXIN2基因共14个tag SNPs的基因型,比较病例组和对照组各位点基因型频数和等位基因频数分布差异,采用UNPHASED3.1.4软件分析2个及2个以上位点组成的单倍体型与PTC的关系。 结果： Hardy-Weinberg平衡定律检验,14个位点在2组研究对象中的基因型频数分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（P>0.05）。AXIN2基因的rs11655966、rs3923086和rs7591位点在病例组和对照组各等位基因频数分布差异有统计学意义（χ2=6.029,df=1,P=0.014;χ2=4.518,df=1,P=0.034;χ2=4.674,df=1,P=0.031）,TP53INP2基因上rs910870位点在病例组和对照组的各等位基因频数分布差异有统计学意义（χ2=4.583,df=1,P=0.032）,ITGA3基因上5个tag　SNPs基因型在病例组和对照组各位点基因型频数和等位基因频数分布差异无统计学意义(P>0.05)。多位点联合分析,rs7210356-rs7591-rs4074947-rs11655966-rs3923086-rs4791169-rs224030单倍体系统在病例组和对照组中的分布差异有统计学意义（P<0.05）。 结论：AXIN2基因的rs11655966、rs3923086和rs7591位点可能与PTC发病有关联,AXIN2基因中多个位点组成的单倍体型可能与PTC发病有关联;TP53INP2基因的rs910870位点可能与PTC发病有关联,ITGA3可能与PTC发病无关联。     

胶原基因单核苷酸多态性与脑梗死的相关性研究

目的：探讨胶原基因（COL3A1、COLA2）单核苷酸多态性与脑梗死的相关性。方法：收集2012年12月至2013年12月在我院神经内科进行治疗的287例脑梗死患者的血样标本及同期102例健康体检者的血样样本进行相关性研究。采用基因DNA提取及聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性（PCR-RFLP）的方法,对所有研究对象的COL3A1基因rs1800255位点、COLA2基因rs42524位点多态性进行检测。结果：①脑梗死患者和健康体检者COL3A1基因rs1800255位点上的各基因型频率分布存在显著性差异（p<0.05）。②脑梗死患者和健康体检者携带A等位基因（AA+AG）与G等位基因的频率分布虽存在显著性差异（p<0.05）,但A、G等位基因的频率分布无显著性差异（p>0.05）。③脑梗死患者和健康体检者COLA2基因rs42524位点上的各基因型和等位基因的频率分布无显著性差异（p>0.05）。结论：COL3A1基因rs1800255多态性与脑梗死的发病有相关性。脑梗死的发病可能与rs1800255位点基因型AA/AG有一定的关系。COLA2基因rs42524多态性与脑梗死的发病无相关性。基因COL3A1多态性分布与年龄、性别无明显差异性。     

NFKB1基因多态性与溃疡性结肠炎相关性研究

目的　探讨NFKB1 基因单核苷酸多态性rs3774963 C>G和rs11722146 A>G与溃疡性结肠炎的相关性。方法　采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测149例溃疡性结肠炎患者组和168例健康对照组NFKB1 基因多态性。结果　在rs3774963 C>G位点,溃疡性结肠炎组GG基因型占53.0%,明显高于对照组（38.7%）,差异具有统计学意义（P = 0.005）。G等位基因频率（73.2%）亦明显高于对照组（61.9%）,差异具有统计学意义（P = 0.003）。在rs11722146 A>G位点,两组间基因型和等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。两位点溃疡性结肠炎不同分型基因型和等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。结论　NFKB1 基因rs3774963 C>G多态性与溃疡性结肠炎的发病具有相关性,其中G等位基因是溃疡性结肠炎的遗传危险因素。     

FADS1/FADS2基因多态性与冠心病发病的关联性分析

目的：探讨多不饱和脂肪酸代谢限速酶基因FADS1和FADS2单核苷酸多态性与冠心病的关系,阐明FADS1/FADS2在冠心病发生中的作用机制。方法：在我国北方汉族人群中选择237例冠心病患者和224例健康体检者作为研究对象,采用问卷调查表收集基本信息,应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测FADS1基因的rs174556位点和FADS2基因的rs174617位点,采用遗传学软件UNPHASED 3.012和统计学软件SPSS 13.0分析2位点的联合作用及等位基因和基因型频数分布。结果：病例组和对照组的各位点基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律（P>0.05）。病例组和对照组rs174556位点的等位基因和基因型频数分布差异有统计学意义,病例组次等位基因T及基因型TT的携带者频数显著高于对照组（P=0.009,P=0.038）。rs174556-rs174617基因型系统与冠心病的发生无关联（P>0.05）.结论：在中国北方汉族人群中FADS1基因的rs174556位点基因多态性可能与冠心病发病有关联。     

白细胞介素1A基因3′-UTR插入/缺失多态与中国汉族前列腺癌的相关性研究

目的 研究白细胞介素1A基因（IL1A）3′-UTR区"TTCA"插入（I）/缺失（D）多态性位点与中国汉族男性前列腺癌之间的关系。方法 采用聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳（PCR-PAGE）方法,在131例前列腺癌患者和229例正常对照者样本中对IL1A基因3′-UTR区"TTCA"插入/缺失多态性位点（rs3783553）进行基因分型,分析比较两组样本间等位基因频率及基因型频率分布差异,探讨该位点与前列腺癌的相关性。结果 基因分型结果显示,两组样本中rs3783553位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡;统计结果显示,与D/D基因型相比,基因型为 D/I 或 I/I的个体罹患前列腺癌的风险降低（P=0.48,95%CI:0.31~0.74）;相对于等位基因D,等位基因I罹患前列腺的风险降低（P=0.001,OR=0.56,95%CI:0.40~0.79）。结论 IL1A基因3′-UTR区"TTCA"四碱基插入/缺失多态性可能与中国汉族男性前列腺癌的发病相关。     

KCNQ1基因多态性与高尿酸血症的关联研究

目的 探讨KCNQ1基因多态性与高尿酸血症发病的关联。方法 采用病例-对照研究和SNaPshot测序技术，对120例高尿酸血症患者（高尿酸血症组）和180例健康对照者（对照组）KCNQ1基因rs179785、rs2283228及rs2237892位点多态性进行分型，并结合其临床资料、生化指标进行关联分析。结果 与对照组比较，高尿酸血症组体重指数（BMI）、收缩压、舒张压、丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天门冬氨酸氨基转移酶（AST）、甘油三酯（TG）、尿素、肌酐（Cr）和尿酸（UA）水平较高（P <0.05），而高密度脂蛋白（HDL）水平较低（P <0.05）；两组的葡萄糖（Glu）、总胆固醇（TC）、低密度脂蛋白（LDL）水平比较，差异无统计学意义（P >0.05）。两组rs2283228、rs2237892位点基因型分布频率比较，差异均有统计学意义（P <0.05）；与对照组比较，高尿酸血症组rs2283228位点AC基因型比例较高（P <0.017），而rs2283228位点CC基因型和rs2237892位点TT基因型比例较低（P <0.017）；两组rs179785位点基因型分布及3个位点等位基因频率比较，差异无统计学意义（P >0.05）。无论是否调整混杂因素，rs2283228位点AC基因型均会增加高尿酸血症的发病风险，调整后［R=4.027（95% CI：1.411，11.492），P <0.05］；rs2237892位点CT、TT基因型和T等位基因均会降低其发病风险，调整后［R=0.263（95% CI：0.094，0.738），P <0.05］、［R=0.125（95% CI：0.024，0.647），P <0.05］、［R=0.309（95% CI：0.147，0.652），P <0.05］。而rs179785位点多态性与高尿酸血症的关联无统计学意义（P >0.05）。结论 KCNQ1基因rs2283228位点AC基因型可能为高尿酸血症发病的危险因素，rs2237892位点CT、TT基因型和T等位基因可能为其发病的保护因素。     

一个先天缺牙家系的基因突变及病例对照研究

目的：探讨非综合征型多数牙先天缺失患者的人类成对盒基因9(PAX9)、同源盒基因1(MSX1)、中轴抑制蛋白2(AXIN2)突变位点,为该疾病的病因学研究提供依据。方法对该例患者及其家庭成员进行全身系统检查、口腔专科检查(含拍摄曲面断层片)及家系调查;抽取外周静脉血,提取基因组DNA,采用聚合酶链式反应( PCR)扩增PAX9基因的外显子1、2、3、4,MSX1基因外显子1、2及AXIN2基因外显子2、3、4、5、6、7、8、9、10、11,通过对分段PCR纯化产物进行测序,并结合系谱图进行基因突变分析。同时,通过病例-对照实验(先天缺牙组50例,健康对照组100例)对突变位点AXIN2G1807C与先天缺牙的相关性进行分析。结果先证者的祖母和外祖父为兄妹关系。口内检查以及曲面断层片发现先证者为无牙牙合,仅见左侧下颌升支处有一阻生牙影像,其余家庭成员牙齿数目发育正常。均未合并其他组织器官的先天发育异常。先证者及部分表型正常者分别发现3个已知突变位点,分别为AXIN2外显子6第1365位A变为 G ( rs9915936),外显子7第1807位 G 变为 C (rs145353986)以及外显子8第2062位 C 变为 T ( p. Leu688Leu)。 PAX9、MSX1未见异常。病例组和对照组间AXIN2G1807C的基因频率和基因型频率差异无统计学意义。结论 AXIN2c.2062C>T突变可能是导致中国人群非综合征型多数牙缺失的危险因素之一。 AXIN2c.1807G>C与此类疾病之间不存在明显的相关性。     

ADAMTS14基因单核苷酸多态性与汉族女性颞下颌关节骨关节炎的相关性研究

目的：探讨ADAMTS14基因rs4747096位点单核苷酸多态性与中国汉族女性颞下颌关节骨关节炎之间的相关性。方法：采用病例-对照研究,纳入213例受试者,均为中国汉族女性,其中病例组103例,健康对照组110例。从采集的外周静脉血中提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应扩增目的片段,对反应产物测序确定基因分型并进行统计分析。病例组及实验组的年龄分布采用t检验,基因型及等位基因频率分布采用卡方检验。结果：病例组103例中基因型频率为38.8%（AA）、55.4%（AG）、5.8%（GG）,对照组110例中基因型频率为40.9%（AA）、43.6%（AG）、15.5%（GG）。基因型频率在两组中的差异有统计学意义（P=0.047）,等位基因频率在两组中差异无统计学意义（P>0.05）。显性遗传模式中,病例组基因型频率为94.2%（AA或AG）、5.8%（GG）,对照组基因型频率为84.5%（AA或AG）、15.5%（GG）,病例组中AA、AG型明显高于对照组,是发病的风险因素（OR=1.114,95% CI：1.015~1.223,P=0.028）。结论：ADAMTS14基因rs4747096位点的单核苷酸多态性与中国汉族女性人群颞下颌关节骨关节炎之间存在明显相关性,rs4747096位点的单核苷酸多态性在颞下颌关节骨关节炎患者及健康人群中的分布存在差异。     

GLP1R基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病风险及血糖、血脂、胰岛功能的关系

目的：探讨中国汉族人群胰高血糖素样肽1 受体（GLP1R）基因rs3765467、rs2268657 和rs6923761位点与2型糖尿病（T2DM）的相关性及对血糖、血脂代谢和胰岛功能的影响。方法：采用竞争性等位基因特异性PCR检测GLP1R基因rs3765467、rs2268657 和rs6923761位点的基因型,并结合血糖、血脂和胰岛功能进行分析。结果：T2DM组GLP1R基因rs3765467位点CC基因型和C等位基因的频率均显著高于对照组（61.0% vs. 51.9%,P =0.040;77.3% vs. 72.3%,P =0.022）。在隐性模型中,T2DM组rs3765467位点CC基因型频率显著高于对照组（61.0% vs. 51.9%,P =0.011）。Logistic回归分析显示rs3765467位点CC基因型是T2DM发病的独立危险因素（OR =1.724,95%CI =1.217～2.443,P =0.002）。rs3765467位点CC基因型HbA1c水平显著高于CT+TT基因型（t =-2.517,P =0.012）;rs2268657位点GG基因型HDL-C水平显著高于GA+AA基因型（t =-2.162,P =0.031）。在T2DM组中,rs3765467位点CC基因型FP-C、HOMA-β、HOMA-IR水平明显低于CT+TT基因型（均P ＜0.05）。结论：GLP1R基因rs3765467位点可能与中国汉族人群T2DM的发病风险相关,GLP1R基因多态性可能影响血糖、血脂代谢及胰岛β细胞功能。     

Association between Polymorphism of Interleukin-23 Receptor and Hashimoto's Thyroiditis in Chinese Han Population of Shandong

Objective:The interleukin-23 receptor (IL-23R) has been shown to be associated with autoimmune diseases in many different populations.This study aimed to investigate the association between IL-23R gene...     

ERAP1基因与山东汉族人群强直性脊柱炎的相关性

目的利用基于群体的病例对照关联分析方法,探讨ERAP1基因是否为北方汉族人群的易感基因。方法从山东省立医院收集了311例临床确诊的强直性脊柱炎病例及320例正常对照资料,利用Taqman探针法对ERAP1基因内的两个单核苷酸多态性位点rs7711564和rs27434分型,利用PLINK软件行Hardy-Weinberg遗传平衡检验、等位基因及基因型频率分布分析。样本统计学效能采用CaTS软件计算。结果两个位点在病例组及对照组中均达到遗传平衡,其中rs7711564位点罕见等位基因频率在病例组及对照组分别为0.430 9和0.489 1(OR=1.26,P=0.04),rs27434位点罕见等位基因频率在病例组和对照组分别为0.483 9与0.421 9(OR=0.78,P=0.03)。结论 ERAP1基因内的遗传变异与北方汉族人群强直性脊柱炎相关,进一步证实了该基因是强直性脊柱炎的易感基因。