EZH2在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨EZH2在肝细胞癌中的表达及临床意义方法采用RT-PCR、免疫组织化学和Western blotting方法分析肝癌及癌旁组织EZH2mRNA转录和蛋白表达水平及其与临床病理因素的关系.结果 在42例肝癌组织中检出26例EZH2mRNA,而在相应的42例癌旁组织中只检出12例,癌组织EZH2mRNA阳性率高于...     

Gas2基因在肝细胞癌中的表达及意义

已知Ｇａｓ2在细胞周期阻滞时特异性表达 ,并因其被证实参与细胞凋亡而引起人们的关注[1] 。我们对肝细胞肝癌(ＨＣＣ)和癌旁及正常肝组织中Ｇａｓ2的原位表达作对比观察 ,结合ＨＣＣ中细胞增殖及凋亡状况 ,分析Ｇａｓ2在ＨＣＣ发生、发展中的可能作用。一、材料与方法1.标本处理 :36例ＨＣＣ及相应癌旁组织取自 1999年复旦大学附属中山医院首次住院手术患者 ,另有 8例正常组织 ,取自同期因良性肿瘤而部分切除的肝手术标本。2 .原位杂交检测Ｇａｓ2ｍＲＮＡ :探针由上海肿瘤研究所提供 (与ＧｅｎｅＢａｎｋ的Ｇａｓ2ｍＲＮＡ序列有 98.6 %同…     

PCAF在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨P300/CBP相关因子(PCAF)在肝癌中的表达情况以及临床意义.方法 采用免疫组化技术检测35例手术切除肝癌组织及相应癌旁肝组织中PCAF的表达情况.采用x2检验检测PCAF蛋白的表达和临床资料间的相关性,采用Kaplan-Meier Log Rank检验进行单因素生存分析,采用Cox回归模型进行多因素分析.结果 PCAF蛋白在癌旁肝组织与肝癌组织中的表达具有显著性差异(P＜0.05),并且与肿瘤TNM分期以及肿瘤转移相关(P＜0.05).COX多因素分析表明,肝癌患者术后导致较差预后的独立影响因素包括PCAF表达降低、更高的肿瘤TNM分期以及肿瘤转移.结论 肝细胞癌中的PCAF表达下调,并且与预后相关.PCAF有可能成为肝癌重要的生物学标志.     

CapG在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 利用在线生物信息学数据库,通过组织和细胞水平的实验验证CapG基因在肝癌中的表达和临床意义。方法通过分析UALCAN和GEPIA数据库,获得CapG基因在肝细胞癌患者中的mRNA转录表达水平、DNA甲基化状态和临床病理特征等;用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线,用HPA分析CapG的蛋白水平,用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线,用HPA分析CapG的蛋白水平。用String网站构建相应蛋白的相互作用网络,用LinkedOmics工具对CapG共表达的基因进行富集分析;此外,用免疫组化法验证CapG在肝癌组织芯片中的表达,用定量PCR法测定CapG在肝癌细胞水平的表达。结果 肝癌患者肝组织中CapG基因的mRNA表达水平和蛋白水平均明显升高(P<0.001),CapG的高mRNA表达水平与DNA甲基化状态的降低明显相关。免疫组织学和细胞水平的实验结果证实了CapG在肝细胞癌中的明显高表达(P<0.05)。String在线分析结果表明,与CapG相互作用的蛋白质参与了生物过程,包括参与肌动蛋白聚合、转录调...     

基于公共数据库挖掘UBE2A在肝细胞癌中的表达与调控及其临床意义

目的:探讨泛素结合酶 2A(Ubiquitin binding enzyme 2A,UBE2A)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达与调控因子、预后及其与免疫细胞浸润的关系.方法:通过Timer2.0 数据库初步分析UBE2A在不同肿瘤中肿瘤和正常组织的表达差异;进一步使用GEPIA数据库分析肝细胞癌中UBE2A的表达情况及其与预后的关系.在 GEO 数据库中筛选肝细胞癌数据集(GSE108724)中差异表达 miRNA,并利用 mirDIP 工具构建gene-miRNA调控网络.使用UALCAN数据库探索UBE2A与临床病理特征的关系.Timer数据库分析出肝细胞癌中UBE2A与免疫细胞浸润的关系.结果:肝细胞癌组织中UBE2A基因表达高于正常组织(P＜0.05),UBE2A高表达患者预后较差(P=0.045).hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-375、hsa-miR-93-5p在肝细胞癌中参与UBE2A的调控.UBE2A的表达与年龄、性别、淋巴结转移无关(P＞0.05),与肿瘤分期相关(P＜0.05).UBE2A的表达与肝细胞癌中B细胞、CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平呈正相关.结论:UBE2A有望成为肝细胞癌诊断的新型标志物和治疗的潜在分子靶点.     

GRAMD4在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 检测GRAMD4在肝细胞癌中的表达情况,分析其与肝癌临床病理特征之间的相关性.方法 收集40例肝细胞癌及对应癌旁组织,运用RT-PCR、免疫组化技术检测GRAMD4在肝癌及对应癌旁组织中的表达情况,统计学分析GRAMD4mRNA表达与肝癌临床病理特征之间的相关性;应用RT-PCR技术检测人正常肝细胞LO2和肝癌细胞Hep3B、HepG2、SMMC-7721中GRAMD4 mRNA的表达.结果 GRAND4 mRNA及蛋白在肝癌组织中的表达显著高于对应的癌旁组织(P＜0.05);GRAMD4 mRNA的高表达与肿瘤体积增大、高Edmonson分级和高TNM分期呈明显正相关(P＜0.05);肝癌细胞株Hep3B、HepG2和SMMC-7721中GRAMD4 mRNA的表达较正常肝细胞LO2显著增加(P＜0.05).结论 肝癌细胞系及肝癌组织中GRAMD4表达上调,且GRAMD4的表达上调与肝癌的恶性病理特征相关.     

MMP-2,TIMP-1在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的:探讨基质金属蛋白酶-2(MMP-2)及抑制剂-1(TIMP-1)在人肝癌及癌旁组织中的表达及其与肝癌侵袭转移的关系.方法:应用免疫组织化学法研究50例肝癌及癌旁组织中MMP-2和TIMP-1的表达.结果:MMP-2在肝癌和癌旁组织表达阳性率分别为76%和72%,明显高于正常肝组织的表达(P<0.01)a TIMP-1在肝癌组织和癌旁组织中的表达阳性率分别为58%和56%,高于正常肝组织中的表达(P<0.01).而MMP-2洋相表达率与肝细胞癌的转移、淋巴浸润、包膜形成和肿瘤分化有关(P<0.05).而TIMP-1的表达与癌组织的转移,淋巴结浸润和包膜形成有关(P<0.05).结论:MMP-2,TIMP-1在肝癌及癌旁组织中的表达明显增高,可能对于判断肝癌的浸润、转移有重要价值.     

肝细胞癌中lncRNA-CAI2的表达及临床意义

目的探讨lncRNA-CAI2(CDKN2A/ARF/Intron 2 non-coding RNA)在原发性肝细胞癌中的表达及临床意义。方法收集92例手术切除的肝细胞癌及46例癌旁肝组织标本,利用实时荧光定量PCR法检测CAI2 mRNA表达水平,分析其与临床病理特征及生存期的相关性。结果 CAI2在肝细胞癌组织中的表达水平明显高于癌旁肝组织,差异有统计学意义; CAI2高表达率与组织学分级、临床分期、是否有门脉癌栓明显相关,高表达患者的无瘤生存期和总生存期均明显低于低表达者; CAI2高表达与门脉侵犯和临床分期联合分析对肝细胞癌的无瘤生存期和5年总生存期均有明显影响; CAI2高表达是肝细胞癌患者预后不良的独立风险因子。结论 lncRNA-CAI2可作为评估肝细胞癌预后不良的潜在标志物。     

肝细胞癌中NCAPD2的表达及临床意义

目的 探讨染色体凝缩蛋白复合物Ⅰ的亚基D2(non-SMC condensinⅠcomplex subunit D2,NCAPD2)在肝细胞癌(hepato-cellular carcinoma,HCC)组织中的临床价值.方法 应用UALCAN数据库分析正常肝组织和HCC组织中NCAPD2 mRNA的表达及其与临床病理...     

BMI1基因在肝细胞癌患者中的基因富集分析及临床意义

目的探讨B细胞特异的莫洛尼白血病毒插入位点1基因(BMI1)在肝细胞癌(HCC)中表达上调及其与患者预后的关系。方法生物信息学分析BMI1与肝癌患者的临床资料及预后的关系。采用实时定量PCR检测HCC组织中BMI1表达情况,验证BMI1表达水平与患者临床病理学特征关系。从GEO数据库中下载肝癌基因表达数据GSE56140,分析BMI1高表达在HCC中的生物学功能。结果 linkedomics在线分析结果显示,BMI1与377例肝癌患者的病理学N分期、种族、总生存期具有相关性(P 0. 05),BMI1主要表达于细胞核中。Kaplan-Meier plotter分析结果为HR=1. 46,95%CI:1～2. 13,log rank P=0. 048。BMI1高表达组与低表达组相比,差异具有统计学意义(P 0. 05); BMI1的高表达组与肿瘤直径、血管侵犯、TNM分期、Edmonson分级、肿瘤无包膜显著相关,差异有统计学意义(P 0. 05)。Kaplan-Meier结果显示BMI1高表达的HCC患者预后比BMI1低表达的患者预后差;基因富集分析结果显示BMI1可能通过细胞周期、RNA降解、剪接体、DNA复制、氧化磷酸化、错配修复等生物学过程促进肝癌细胞增殖。结论 BMI1可能参与HCC的发生和发展过程,并与预后相关。     

miR-191与miR-221在肝细胞癌中的表达及临床意义

微小RNA(microRNA,miRNA)在肝细胞癌发生与发展过程中呈现出不同的表达水平,具有筛查和诊断价值,同时对肝细胞癌患者预后分析及治疗方案的选择具有潜在的指导作用[1].有学者发现miR-191与miR-221在肝细胞癌细胞系及组织中高表达,与肝细胞癌发生密切相关[2-7].     

Survivin和PTEN基因在原发性肝细胞癌中的表达及意义

目的探讨凋亡抑制基因Survivin和抑癌基因PTEN在原发性肝细胞癌及癌旁组织中的表达及其相关性。方法应用RT-PCR法,对50例原发性肝细胞癌和34例癌旁组织中Survivin和PTEN基因的表达情况进行定量检测。结果 Survivin在原发性肝细胞癌组织中高表达,而在癌旁组织中无表达;原发性肝细胞癌中PTEN的表达量明显低于癌旁组织;Survivin和PTEN的表达量与原发性肝细胞癌的分化程度有关,与患者发病年龄、肿瘤大小、门静脉癌栓、肝内转移无关;随着恶性程度加重,Survivin和PTEN基因表达呈显著负相关。结论 Survivin和PTEN在原发性肝细胞癌发生、发展中起着不同的作用,联合检测对原发性肝细胞癌的早期诊断、判定预后提供一定的临床依据。     

基于TCGA数据库的食管鳞状细胞癌差异表达焦亡相关基因的筛选及GSDMC基因的验证

目的 通过对TCGA数据库中食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)组织基因表达谱RNA测序数据进行生物信息学分析,探讨与ESCC预后有关的焦亡基因,并通过体外实验对筛选出的基因进行验证和功能研究。方法 下载TCGA和GTEx数据库中ESCC和正常食管样本中mRNA数据及临床数据。从文献中获得细胞焦亡相关基因(pyroptosis-related genes, PRG),使用R语言及DESeq2软件获取差异表达的PRG。采用Cox单因素、多因素回归分析,筛选出与预后相关的基因。应用qRT-PCR验证差异表达的PRG在ESCC和正常食管上皮细胞的表达水平;运用siRNA干扰ESCC细胞中已筛基因的表达,qRT-PCR检测siRNA的干扰效率。干扰成功后分别采用CCK-8、平板克隆和qRT-PCR实验,检测干扰已筛基因后ESCC细胞的活力、克隆形成能力和凋亡。运用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,分析gasdermin家族蛋白C(GSMDC)的mRNA表达与食管癌免疫细胞浸润水平的相关性。结果 33个PRG中与ESCC相关的差异...     

蛋白激酶B在乙型肝炎病毒感染原发性肝细胞癌组织中的表达及临床意义

目的:探讨蛋白激酶B(PKB/Akt)在乙型肝炎病毒(HBV)感染原发性肝细胞癌组织中的表达及及临床价值.方法:采用SP免疫组化法,检测35例HBV感染原发性肝细胞癌(HBV肝癌)、乙肝后肝硬化和正常肝组织中PKB/Akt的表达.结果:HBV肝癌组和肝硬化组PKB阳性表达率分别为94.3%和66.7%,显著高于对照组(40.0%),有统计学差异(P<0.05);HBV肝癌组阳性表达率显著高于肝硬化组(P<0.05);肿瘤浸润和淋巴结转移组织中PKB/Akt阳性表达率显著高于无肿瘤浸润和淋巴结转移组织(P<0.05),PKB/Akt阳性表达率在性别、年龄、肿瘤大小和肿瘤分化程度等病理因素之间比较差异无统计学意义(P>0.05).结论:PKB/Akt在HBV肝癌组织中呈高表达,PKB/Akt在HBV肝癌的肿瘤浸润、淋巴结转移的机制中起着重要的作用.     

基于TCGA数据库的结直肠癌差异表达基因筛选及CCDC78新基因验证

目的:通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中大样本结直肠癌组织基因表达谱RNA测序(RNA-Seq)数据进行生物信息学分析,挖掘与结直肠癌预后密切相关的新基因,并对筛选出的新基因进行验证和功能研究。方法:从TCGA数据库下载结直肠癌RNA-Seq数据筛选差异表达基因,采用R-survival包对差异表达基因进行生存分析,筛选出与结直肠癌预后相关的基因,并从中挑选尚未在肿瘤研究中报道的表达上调最显著的新基因进行验证。采用RT-qPCR检测新基因在人结肠癌细胞、人正常结肠上皮细胞、人结直肠癌组织及配对的癌旁组织中表达水平的变化。采用慢病毒载体构建稳定沉默新基因表达的结肠癌细胞,以转染阴性对照慢病毒的结肠癌细胞为对照,采用CCK-8和Transwell实验研究稳定沉默新基因表达对结肠癌细胞活力、迁移和侵袭的影响。结果:(1)筛选出结直肠癌差异表达基因4 017个,Kaplan-Meier生存分析显示69个基因与结直肠癌患者预后差密切相关(P<0. 01),其中表达上调基因36个,这36个基因中有11个尚未在肿瘤研究中被报道。(2)表达上调倍数前3位的基因为CCDC78、PGGHG及T...     

鼠双微体和PTEN在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的研究鼠双微体和PTEN在肝细胞癌中的表达,并分析二者的相关性及与患者临床因素的关系。方法应用免疫组织化学SP法检测60例肝细胞癌组织、27例癌旁肝组织和5例正常肝组织标本中的鼠双微体和PTEN蛋白的表达水平;采用SPSS13.0统计软件包进行统计学处理。结果(1)正常肝组织、癌旁肝组织和肝细胞癌组织中MDM2蛋白的阳性表达率分别是0%(0/5)、7.41%(2/27)、31.67%(19/60),差异有统计学意义(χ2=7.977,P=0.019)。鼠双微体蛋白阳性表达与门脉癌栓、包膜侵犯、病灶数目及TNM分期密切相关(P<0.05)。(2)正常肝组织、癌旁肝组织和肝细胞癌组织中PTEN蛋白的阳性表达率分别是100%(5/5)、96.30%(26/27)、56.67%(34/60),差异有统计学意义(χ2=23.956,P=0.001)。PTEN蛋白阳性表达与Endmanson分级、TNM分期、门脉癌栓、包膜侵犯、病灶数目及AFP水平密切相关(P<0.05)。(3)在肝细胞癌组织中,鼠双微体和PTEN蛋白表达呈负相关关系(rs=-0.423,P=0.001)。结论鼠双微体和PTEN的异常表达在肝细胞癌发生、发展、侵袭和转移过程起重要作用,二者可作为判断肝细胞癌生物学行为和预后的参考指标。     

肝细胞癌中SETDB1的表达及临床意义

目的探讨肝细胞癌中组蛋白甲基化酶SETDB1的表达及其临床意义。方法采用qRT-PCR法检测64对肝细胞癌及癌旁正常组织中SETDB1 mRNA的表达,并分析其与不同临床病理特征的相关性。结果41例(64.06%)肝细胞癌组织中SETDB1 mRNA表达量高于癌旁正常组织,肝细胞癌与癌旁正常组织中SETDB1的相对表达量分别为(1.658±1.287)、(1.233±1.070)(t=2.917,P<0.05)。SETDB1表达上调与肿瘤大小、微血管侵犯及pTNM分期具有相关性(P<0.05)。结论SETDB1在肝细胞癌中表达上调,且肿瘤直径>5 cm者、伴有微血管侵犯者及pTNM分期高者,更易出现SETDB1表达上调。     

七种癌-睾丸抗原基因在广西肝细胞癌中的表达

广西是肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma，HCC)的高发区，其死亡率极高。尽管目前已建立了许多治疗的方法，但五年的生存率仍很低。因此急需寻求新的治疗方法，而免疫治疗正是其中新方法之一，但开展免疫治疗的前提是特异性肿瘤抗原的存在。目前己发现了众多的肿瘤相关抗原，其中一类为癌-睾丸抗原(Cancer-Testis Antigen，CTA)，