甘肃省汉族、回族人非综合征唇腭裂与转化生长因子-α的基因多态性相关性研究

目的 研究甘肃省汉族和回族人非综合征唇腭裂与转化生长因子-α（Transforming Growth Fator-α,TGF-α）基因多态性的相关性.方法 采用聚合酶链反应--限制性酶切片段长度多态（PCR-RFLP）的方法对50例汉族非综合征唇腭裂患者与25例正常汉族人,50例回族非综合征唇腭裂患者与18例正常回族人进行TGF-α基因检测分析.结果 甘肃省汉族、回族非综合征唇腭裂（NSCL/P）患者的C2等位基因频率较正常人明显增高,2组比较有显著性差异（P〈0.05）,汉族和回族人NSCL/P患者等位基因频率、基因型均无显著性差异.结论 TGF-α基因多态性与甘肃省汉族、回族人群非综合征唇腭裂的发生有关联.     

宁夏惠农区回、汉族人群肿瘤坏死因子α-308位点基因多态性与胃癌前疾病及胃癌相关性研究

目的研究宁夏惠农区回、汉族人群肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)-α-308位点基因多态性与慢性萎缩性胃炎、胃溃疡及胃癌的相关性,明确宁夏惠农区回、汉族人群TNF基因多态性与胃癌易感性的关系。方法采用聚合酶连反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测宁夏惠农区回、汉族383例正常对照者、慢性萎缩性胃炎、胃溃疡和胃癌患者中TNF-α-308位点基因多态性,其中正常对照组99例(回族45例,汉族54例)、慢性萎缩性胃炎组97例(回族45例,汉族52例)、胃溃疡组75例(回族35例,汉族40例)和非贲门胃癌组112例(回族50例,汉族62例)。结果回、汉族TNF-α-308位点A/A、G/G、A/G基因型及A、G基因频率在正常对照组、慢性萎缩性胃炎、胃溃疡和胃癌中差异无统计学意义(P>0.05)。结论惠农区回、汉族TNF-α-308位点基因多态性与胃癌前疾病及胃癌发生无明显关系。     

中国人群非综合征性唇腭裂与转化生长因子-α基因的相关性研究

目的:探讨转化生长因子-α(TGF-α)基因与中国汉族人群非综合征性唇腭裂(NSCLP)的关系.方法:应用聚合酶链式反应(PCR)结合限制性内切酶酶切(RFLP)方法,对57名非综合征性唇腭裂患者和27名健康对照进行TGF-α基因多态性检测.PXR后直接用限制性内切酶酶切,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测基因多态性.结果:在57例NSCLP病例组中TGF-α基因C1等位基因频率为76.3%,C2等位基因频率为23.7%,而在27例健康对照者中C1等位基因频率为93.3%,C2等位基因频率为6.7%.TGF-α基因的C1、C2等位基因频率经χ2检验在NSCLP组和对照组之间无显著性差异(χ2=2.609,ν=1,P=0.106＞0.05).结论:中国人群非综合征性唇腭裂TGF-α基因中存在Taq I多态性位点,TGF-α/Taq I位点与中国汉族人群非综合征性唇腭裂无关.     

中国人群非综合征性唇腭裂TGFA基因TaqⅠ多态性研究

目的探讨转化生长因子-α(TGFA)与中国人群非综合征性唇腭裂(NS-CL/P)的关系.方法应用聚合酶链式反应(PCR)结合限制性内切酶酶切(RFLP)方法,对103名健康体检者和124名非综合征性唇腭裂患者进行TGFA基因多态性检测.PCR后直接用限制性内切酶酶切检测基因多态性.结果单侧唇裂伴腭裂和双侧唇裂伴腭裂均与正常对照组有显著性差异.而单侧唇裂和单纯性腭裂与正常对照组无显著性差异.有家族史患者与无家族史患者等位基因频数在统计学上无显著性差异.结论中国人群非综合征性唇腭裂TGFA基因中存在TaqⅠ多态性位点,TGFA TaqI位点与中国人群非综合征性唇腭裂相关.     

中国东北人群中转化生长因子-α基因rs3771494单核苷酸多态性与非综合征唇腭裂的关系

目的:探讨转化生长因子-α(TGF-α)基因rs3771494多态性与中国东北部人群非综合征唇腭裂的相关性。方法:收集2008-2012年东北地区非综合征唇腭裂患者236例作为病例组,正常对照者400例作为对照组,利用基因芯片检测两组基因型并进行分析比较。结果:病例组基因型TC、CC及TC+CC的频率均高于对照组,比较差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:中国东北人群中TGF-α基因rs3771494位点基因型TC和CC与非综合征唇腭裂的发病密切相关。     

中国人群非综合征性唇腭裂TGFA基因Taq I多态性研究

目的：探讨转化生长因子-α（TGFA）与中国人群非综合征性唇腭裂（NS－CL／P）的关系。方法：应用聚合酶链式反应（PCR）结合限制性内切酶酶切（RFLP）方法，对103名健康体检者和124名非综合征性唇腭裂患者进行TGFA基因多态性检测。PCR后直接用限制性内切酶酶切检测基因多态性。结果：单侧唇裂伴腭裂和双侧唇裂伴腭裂均与正常对照组有显著性差异。而单侧唇裂和单纯性腭裂与正常对照组无显著性差异。有家族史患者与无家族史患者等位基因频数在统计学上无显著性差异。结论：中国人群非综合征性唇腭裂TGFA基因中存在Taq I多态性位点，TGFA TaqI位点与中国人群非综合征性唇腭裂相关。     

青岛地区有家族史非综合征性唇腭裂与TGF-α基因多态性相关性

目的了解青岛地区有家族史的非综合征性唇腭裂与转化生长因子α(TGF-α)基因多态性的相关性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性核苷酸分型结合TaqⅠ限制性内切酶酶切技术,对青岛地区53例有家族史的非综合征性唇腭裂病人、106例正常人(对照组)的TGF-α等位基因进行分析。结果有家族史的非综合征性唇腭裂病人的C2等位基因频率较对照组明显增高,差异有显著性(χ2=22.603,P<0.01);不同类型唇腭裂间比较C2等位基因频率差异无显著性(P>0.05);病人母亲孕期有、无感染史组间C2等位基因频率差异无显著性(P>0.05)。结论青岛地区有家族史的非综合征性唇腭裂TGF-α基因中存在TaqⅠ多态位点,其发生与TGF-α基因多态性有密切关系。     

宁夏回汉族人群中染色体17q22、10q25.3和ABCA4基因多态性与非综合征型唇腭裂的关联

目的 研究中国宁夏地区回汉族人群染色体17q22(rs227731)、ABCA4(rs560426)和10q25.3(7078160)位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂的相关性.方法 研究对象包括非综合征型唇腭裂患儿415例,其中汉族191例,回族224例;患儿父亲205例,母亲240例;其中完整3人核心家系158个.将他们分为单纯唇裂组、单纯腭裂组、唇腭裂组,单纯唇裂组与唇腭裂组合并为唇裂伴或不伴腭裂组;对照组为健康大学生385例,其中汉族281例,回族104例.采用TaqMan基因型鉴定技术检测3个单核苷酸多态位点的基因型,进行病例对照分析、传递不平衡检验、以家系为基础的相关性分析.结果 ①染色体17q22区段的rs227731位点在汉族单纯唇裂组等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P＜0.05),在唇裂伴或不伴腭裂组中等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P＜0.05).回汉族唇腭裂组等位基因频率和唇裂伴或不伴腭裂组基因型、等位基因频率比较均存在统计学差异(P=0.04,P=0.04,P=0.01);②ABCA4基因的rs560426位点在汉族单纯唇裂组基因型与等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P＜0.05),在唇裂伴或不伴腭裂组中基因型与等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P＜0.05),回汉族单纯唇裂组基因型、等位基因比较存在统计学差异(P=0.04,P=0.01);③染色体10q25.3区段的rs7078160位点基因型与等位基因频率与对照组比较及回汉族相互比较均无统计学差异(P＜0.05).结论 在宁夏汉族人群中染色体17q22区段的rs227731位点和ABCA4基因的rs560426位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂有统计学关联,染色体10q25.3区段的rs7078160位点与非综合征型唇腭裂无统计学关联.     

豫南地区汉族人群类风湿性关节炎患者TNF-α基因启动子-308G/A多态性检测

目的:探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)基因启动子- 308 G/A多态性与豫南地区汉族人群类风湿性关节炎(RA)的相关性.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分析90例RA患者及100例正常对照TNF-α基因启动子- 308 G/A多态性.结果:RA患者与正常对照相比,- 308基因型...     

宁夏回、汉族脂联素基因+45位点多态性及其血清水平与代谢综合征的相关性

目的探讨宁夏回、汉族人群脂联素(APN)基因+45位核苷酸T/G多态性与代谢综合征(MS)的相关性。方法收集回族MS患者207例(MS组)、正常对照组98例,和汉族MS患者136例(MS组)、正常对照组102例(对照组),采用聚合酶链反应-限制性片段长度(PCR-RFLP)多态性技术和酶联免疫吸附法(ELISA),对各组APN基因+45位核苷酸T/G多态性及其血清APN浓度进行检测。结果回、汉族MS组间与对照组间基因型频率及等位基因频率均差异有统计学意义(P<0.05)。回族MS组GG基因型频率及G等位基因频率高于回族对照组(均P<0.05)。汉族MS组与汉族对照组间基因型频率及等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05)。回、汉族MS组血清APN水平均低于其对照组(P<0.05),回族TG+GG基因型血清APN水平低于TT基因型者,汉族TT基因型血清APN水平低于TG+GG基因型者。Logistic回归分析显示,APN基因45T/G多态性是回族MS的危险因素。结论 APN基因+45T/G多态性在回、汉族人群之间存在差异;回、汉族MS组血清APN均低于正常人群;APN基因+45T/G多态性与宁夏回族人群MS发病具有相关性,与汉族MS无相关性。     

新疆维吾尔族干扰素调节因子6基因单核苷酸多态性与非综合征性唇腭裂相关性研究

目的：探讨新疆地区维吾尔族人群干扰素调节因子6（IRF6）基因 rs 7545538、rs7545542、rs2235373位点单核苷酸多态性与非综合征性唇腭裂的相关性。方法选择新疆地区世居维吾尔族非综合征性唇腭裂（NSCL/P）患者100例,对照组为60例因上呼吸道感染而住院的新疆籍维吾尔族儿童,抽取其静脉血,用新一代测序方法对目标区域测序,进行遗传学分析。结果在新疆维吾尔族人群中,rs7545538位点 CC 基因型（P ＝0．037）和 C等位基因（P ＝0．007）、rs7545542位点 C 等位基因（P ＝0．044）和 rs2235373位点 G 等位基因（P ＝0．049）与NSCL/P 有关联;对以上3个 SNPs 进行连锁不平衡分析,未能证实存在连锁不平衡（r 2＜0．8）。结论新疆维吾尔族人群 IRF6基因 rs7545538、rs7545542、rs2235373位点 SNPs 可能与新疆维吾尔族人群唇腭裂发病可能存在相关性。     

Genome-wide and interaction linkage scan for nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in two multiplex families in Shenyang, China

Objectives To identify the loci involved in nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate （NSCL/P） in Northern Chinese people in Shenyang by using genomewide and interaction linkage scan.Methods Two multiplex families in Shenyang from North China were ascertained through probands with NSCL/P.Blood of every member was drawn for DNA extraction and analysis.Genotypes were available for 382 autosomal short tandem repeat （STR） markers from the ABI Prism Linkage Mapping Set version 2.5.Linkage between markers and NSCL/P was assessed by 2-point parametric LOD scores,multipoint heterogeneity parametric LOD scores （HLODs）,and multipoint nonparametric linkage score （NPL）.Results The initial scan suggested linkage on Chromosomes 1,2,and 15.In subsequent fine mapping,1q32-q42 showed a maximum multipoint LOD score of 1.9（empirical P=0.013） and an NPL score of 2.35 （empirical P=0.053）.For 2p24-p25,the multipoint NPL increased to 2.94 （empirical P=0.007）.2-locus interaction analysis obtained a maximum NPL score of 3.73 （P=0.00078） and a maximum LOD score of 3 for Chromosome 1 （at 221 cM） and Chromosome 2 （at 29 cM）.Conclusion Both parametric and nonparametric linkage scores greatly increased over the initial linkage scores on 1q32-q42,suggesting a susceptibility locus in this region.Nonparametric linkage gave a strong evidence for a candidate region on chromosome 2p24-p25.The superiority of 2-locus linkage scores compared to single-locus scores gave additional evidence for linkage on 1q32-q42 and 2p24-p25,and suggested that certain genes in the two regions may contribute to NCSL/P risks with interaction.     

广东人群MSX1编码区(G267C和P278S)突变与非综合征性唇腭裂相关性研究

目的 探讨MSX1基因编码区突变G267C和P278S与广东人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)发病的相关性.方法 收集广东籍NSCL/P患儿100名及健康对照者91名的外周血,提取基因组DNA,应用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对MSX1基因编码区G267C和P278S突变进行研究...     

BHMT gene polymorphisms as risk factors for cleft lip and cleft palate in a Chinese population

Objective Convincing evidence suggests a link between increased risk of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) and low intake of folic acid by the mother during pregnancy. The present study was designed to explore if genetic variation in the betaine‐homocysteine methyltransferase (BHMT) gene contributes to NSCL/P. Methods DNA was obtained from 166 individuals with NSCL/P and 285 healthy subjects. Three known single nucleotide polymorphisms (SNPs) present in the BHMT gene (rs651852, rs3...     

基于核心家系的CES1基因多态性与非综合征型唇腭裂易感性的关联分析

目的：利用以核心家系为基础的关联分析,探讨唇腭裂候选基因羧酸酯酶1 （CES1）基因多态性与非综合征型唇腭裂（NSCL/P）易感性的关系.方法：收集12例完整的患儿-健康父母3人核心家系（包含12例患儿组,24例父母组）作为研究对象,运用家系分析（FBAT）软件分析CES1基因多态性与NSCL/P易感性之间的关联性.结果：在FBAT检验的累加模式、显性模式以及隐性模式下均未显示CES1单核苷酸多态性位点（SNP）等位基因的分布与NSCL/P存在遗传学关联,FBAT累加模式下（A：Z=-0.229,P=0.819;G：Z=0.229,P=0.819）显性模式下（G：Z=-0.333,P=0.739）隐性模式下（A：Z=0.333,P=0.739）.结论：虽然全基因关联性分析发现参与肝脏解毒功能主要基因CES1与唇腭裂的发生有关,但是通过FBAT分析CES1等位基因与唇腭裂无遗传学关联.该基因突变可能是随机产生的,具有这些基因突变的个体,可能对环境因素中化学毒物的敏感性增加,导致唇腭裂的产生.     

中国唇腭裂患者Sonic hedgehog信号通路相关单核苷酸多态性的分析

目的 探讨Sonic hedgehog(Shh)信号通路相关的单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism, SNP)与非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip and/or palate, NSCL/P) 之间的关联,并对唇腭裂疾病的致病风险因素进行探索。方法 收集197例个体的外周血(NSCL/P患者100例,健康对照97例),基于国际人类基因组单体型图计划中中国北京汉族人口数据,使用Haploview软件进行单倍体型分析和标签SNP选择。针对Shh 信号通路中的4个候选基因SHH、PTCH1、SMO和GLI2共选择了27个SNP。使用Sequenom质谱技术检测27个SNP在4个Shh信号通路中候选基因的基因型,并进行分析。结果 所选择的SNP基本涵盖了候选基因的潜在功能性SNP,其最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)>0.05:GLI2 73.5%, PTCH1 91.0%, SMO 100.0%, SHH 75.0%。发现位于SMO基因的SNP(rs12674259)和位于PTCH1基因的SNP(rs2066836)的基因型频率在NSCL/P病例组和对照组之间的差异有统计学意义。同时在4个候选基因所在的3条染色体(第2、7、9号染色体)中均发现了连锁不平衡,但在连锁不平衡单倍体型分析中,病例组和对照组之间的差异无统计学意义。结论 提示Shh信号通路参与NSCL/P的发生,其信号通路中关键基因的某些特殊SNP位点与唇腭裂相关,为NSCL/P的病因研究提供了新的探索方向,可能为NSCL/P的早期筛查与风险预测提供帮助。     

视黄酸受体α基因多态性与非综合征性唇腭裂遗传易感性的关联研究

目的探讨视黄酸受体α（RARA）基因D17S579微卫星位点等位基因多态性与中国湖南汉族人群非综合征性唇腭裂（NSCL／P）遗传易感性之间的关系。方法采用PCR和聚丙烯酰胺变性凝胶技术,对132例健康者和140例NSCL／P患者进行研究,分析RARA基因D17S579微卫星位点多态性。结果两组共检出10种等位基因,正常对照组与病例组等位基因频率比较,差异有统计学意义（χ^2=17．163,df=9,P=0．046）;病例组A6（8．93％）、A9（13．21％）等位基因频率明显高于健康对照组A6（4．17％）、A9（5．68％,均P〈0．05）;有家族史的患者等位基因频率与无家族史患者等位基因频率差异无统计学意义（χ^2=2．710,P=0．978）。结论RARA基因D17S579微卫星多态性与中国湖南地区NSCL／P患者存在遗传易感性,等位基因A6、A9可能为NSCL／P发生的危险因子;RARA基因多态性与NSCL／P家族史无相关性。     

43例广东汉族单纯性腭裂患者转化生长因子α基因多态性的研究

目的探讨广东汉族单纯性腭裂患者转化生长因子α（TGF-α）基因多态性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性核苷酸分型技术。以ToqI限制性内切酶消化PCR扩增产物,对43例单纯性腭裂（CPO）患者、68例正常人的TGF-α／ToqI等位基因进行分析。结果单纯性腭裂患者的C2等位基因频率比正常对照组明显增高,差异有统计学意义（P〈0．05）。单纯性完全腭裂患者的TGF-α/ToqI基因型与单纯性部分腭裂患者差异无统计学意义（P〉0．05）。结论TGF-α基因多态性与广东汉族人的单纯性腭裂的发生有关。     

Association of Single Nucleotide Polymorphisms in IRF6 and TGFA Genes With Nonsyndromic Cleft Lip With Or Without Cleft Palate in Chinese Patients

Objective:Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate(NSCL/P) is a common birth defect with unclear etiology. Both genetic and environmental factors may contribute to NSCL/P. Many genes have been identified as candidate genes associated with this disease. Interferon regulatory factor 6(IRF6) gene and transforming growth factor-a(TGFA) gene seem to be crucial in the predisposition of NSCL/P. Here we evaluated some single nucleotide polymorphisms(SNPs) loci of TGFA and IRF6 genes in Chinese nuclear fa...     

中国人群Hedgehog通路基因与非综合征型唇腭裂的亲源效应

目的:探索非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)这一类常见出生缺陷的可能致病机制,在Hedgehog(HH)通路基因中(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)探索基因多态性对NSCL/P的关联关系以及亲源效应(parent-of-origin effects,PoO)对NSCL/P发病风险的影响。方法:纳入806个中国非综合征型唇腭裂核心家系,对HH通路基因(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)的83个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT), 并采用对数线性模型进行亲源效应分析。家系样本来自“唇腭裂基因和交互作用的国际合作研究”项目。采用Plink进行TDT检验;通过R软件中的Haplin v6.2.1软件包开展亲源效应分析。采用Bonferroni法进行多重检验校正。结果:经过质量控制,共纳入65个SNPs进行分析,Bonferroni显著性水平为7.7×10 ^-4(0.05/65)。未校正P值前,关联分析发现rs4448343与NSCL/P存在关联(P=0.023), 6个单体型(rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445、rs10512249-rs4448343、rs16909865-rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445-rs12698335、rs288756-rs288758-rs1151790)与NSCL/P存在关联(P<0.05);6个单体型(rs288765-rs1233563、rs12537550-rs11765352、rs872723-rs288765-rs1233563、rs288765-rs1233563-rs288756、rs6459952-rs12537550-rs11765352、rs12537550-rs11765352-rs6971211)具有潜在的PoO效应(P<0.05)。以上结果经过多重检验校正,均无统计学意义(P>7.7×10 ^-4)。结论:未发现HH通路基因多态性与NSCL/P的关联,未发现HH通路基因通过PoO效应影响NSCL/P发病风险。