营养与表观遗传学基因组印记关系的研究进展

表观遗传修饰中印记基因的异常不仅影响胚胎发育,还可诱发出生后的发育异常。早期营养可能改变基因印记的调节,而饮食是影响健康的重要因素,且与肿瘤关系密切。本文概括表观遗传学基因组印记和其在肿瘤发生中的作用机制及研究情况,详述食物营养与表观遗传学基因组印记的关系及研究技术,并对其未来的研究方向进行预测。     

原发性肝癌全基因组杂合性缺失的研究

目的 研究肝癌全基因组等位基因杂合性缺失（ＬＯＨ）及其临床意义。方法 采用３８２对微卫星标志,对６５例肝癌２２条常染色体等位基因ＬＯＨ进行检测。结果 全组平均杂合子６８．１％。ＬＯＨ〉３０％的有１ｑ、３ｑ、４ｑ、８ｐ、１３ｑ、１６ｑ和１７ｐ。ＨＢｓＡｇ阳性者Ｄ４Ｓ２９６４ ＬＯＨ（６６％）较ＨＢｓＡｇ阴性者（３０％）高（Ｐ〈０．０５）;Ｄ３Ｓ３６８１和Ｄ１７Ｓ９３８ ＬＯＨ者术后复发率（９１％、８     

基因印记与胚胎发育

基因印记的擦除、建立和维持是正常胚胎发育的基础,这一过程的实现主要有赖于各种DNA甲基转移酶的准确表达和密切合作,多种遗传综合征和胚胎发育缺陷与基因印记异常有关。基因印记对原始生殖细胞胞核全能性、配子成熟、胚胎生长发育、胎盘结构和功能,以及出生后个体的生长发育均有重要意义。     

膀胱癌中IGF-2和H19基因特异表达模式及印记缺失分析

目的：探讨胰岛素样生长因子-2（IGF-2）和H19等位基因在膀胱癌中特异性表达的模式及基因组印记丢失的分析。方法：结合PCR和限制性片段长度多态性分析RFLP技术以及DNA甲基化检测技术分析我院收集的膀胱癌标本IGF-2和H19等位基因进行杂合子筛选并进一步研究基因印记缺失与膀胱癌两者之间的关系。结果：在40例膀胱癌中IGF-2等位基因筛选出21例杂合子现象的标本,在这21例杂合子标本中有12例发生了基因组印记缺失;H19等位基因筛选出19例杂合子现象的标本,在这19例杂合子标本中有10例发生了基因组印记缺失。H19基因缺失现象与H19DMR区域的高度去甲基化正相关,而IGF-2基因缺失现象与H19DMR区域的高度甲基化正相关。结论：膀胱癌中IGF-2和H19的基因印记缺失与H19DMR区域的甲基化状态有高度的相关性。     

肝癌基因组不稳定性的研究现状与展望

肝细胞癌 (HCC)是十大恶性肿瘤之一 ,发生机制仍不十分清楚。研究证实 ,HBV和 HCV感染以及黄曲霉毒素 B1污染食物的摄入是 HCC发生的最主要病因。分子生物学研究表明 ,包括 HCC在内的许多肿瘤存在基因组不稳定性或遗传学不稳定性 [1,2 ] 。杂合性缺失 (LOH)和因 DNA错配修复(MMR)基因的修复错误引起的微卫星不稳定性(MSI)被认为是基因组不稳定性的两个主要表型特征。染色体 LOH是指肿瘤染色体上一对等位基因的 DNA多态性基因座中的一个发生缺失 ,失去杂合性。通过对特定染色体上的多态性基因座的 LOH分析 ,可准确定位肿瘤抑…     

微生物基因组测序策略

在复习近年来有关基因测序的文献基础上,综述了有关测序策略方面的进展。     

着色性干皮病基因组D和胞苷脱氨酶基因单核苷酸多态性与肺癌易感性的关系

目的探讨着色性干皮病基因组D(XPD)和胞苷脱氨酶(CDA)基因单核苷酸多态性与肺癌易感性及其病理类型的关系,并探讨吸烟与基因多态性的交互作用对肺癌发病风险的影响。方法采用病例-对照研究方法纳入肺癌患者和健康对照者各103人,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法分析两组人群XPD基因外显子10G→A(Asp312Asn)、23A→C(Lys751Gln)以及CDA基因外显子1上79A→C(Lys27Gln)、208G→A(Ala70 Thr)的基因型。结果两组XPD312和XPD751位点的基因分布频率比较差异均无统计学意义(P>0.05);但吸烟合并XPD第751位点突变个体发生肺癌的风险显著增加(P=0.044);同时发生XPD第312和751两个位点突变的肺癌风险增加6.13倍(P=0.047)。两组CDA Lys27Gln和CDAAla70 Thr基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。XPD和CDA在不同病理类型中的基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论吸烟可使XPD第751位点发生突变的个体发生肺癌的风险增加,XPD基因第312和751两个位点同时突变使肺...     

癌症中基因外表型遗传性改变的研究与潜在应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,进入了功能基因组学时代,高等生物的复杂性并不在于有更多的结构蛋白基因编码,而在于基因外调控机制更为复杂。深入研究在各种生命过程中基因表达的调控及其在疾病发生中的异常,已成为这一领域的关键课题之一。多细胞有机体的生命过程中,有两大类基因外修饰在决定基因外调控中起非常重要的作用:组蛋白的乙酸化及胞嘧啶的甲基化。许多研究发现基因外表型改变在癌     

基因组研究和基因组工业的现状及思考

1人类基因组计划和后基因组时代1.1人类基因组测序将提前完成：人类基因组计划（HumanGenomeProject,HGP）旨在阐明人类基因组的全部序列,从整体上破译人类遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。主要包括三项任务：人遗传图谱和物理图谱的建立;B．DNA测序;C．基因识别。自1990年实施以来,人类基因组测序已完成测序和正在测序的共计约330Mb,占人基因组的11％左右;已识别出与人类疾病相关的基因200个左右。此外,细菌、支原体等共17种模式生物全基因组序列已测定。随着技术更新和大公司的介入,人类基因组测序将提…     

抽动障碍遗传印迹的家系研究

目的 研究遗传印迹是否与抽动障碍的遗传病因学有关。方法 对171个抽动障碍先证者采用国际标准化的抽动障碍遗传研究定式检查工具（STOBS）以及标准化表型评定程序收集先证者及其一、二、三级亲属的表型资料,将家系研究法与家族史法相结合进行抽动障碍的家系研究。结果 母系传递对于抽动障碍先证者的复杂运动性抽动症状具有显著影响（β偏回归系数＝6．6,P＝0．01）;母系传递的先证者发病年龄提早（对数秩检验Log Rank=4.71,P=0.029);父系传递的先证者CBCL行为量表的注意问题分数显著增高（t=2.78,x^2=0.01)。结论 抽动障碍的传递存在亲源特异性表达,抽动障碍病因学中可能存在遗传印迹机制。     

Different Imprinting Status of IGF—2 in Epithelial Ovarian Tumors

Because of the scarcity of valid diagnosis andsensible symptoms atearly stage,two thirds of theovarian cancers were found terminal when the pa-tients see their doctors atthe first time.Abundantfactors,such as genetic,environmental and en-docrinal factors,are involved in the developmentofthe malignancies but the definite mechanism re-mains unknown.Genomic imprinting is a recentlyfound hereditary phenomenon different toMendel's law.Current evidences showed that thisparent- of- origin specific ge…     

IGF2在先兆子痫产妇胎盘中无印迹丢失

【目的】通过检测印迹基因IGF2在先兆子痫产妇胎盘中的特殊等位基因的表达,探讨IGF2印迹状态与先兆子痫发病的关系。【方法】收集经剖宫产的正常足月妊娠及先兆子痫产妇胎盘,从胎盘中提取基因组DNA,经PCR扩增、Apa1酶切筛选杂合子。提取杂合子胎盘中的总RNA并逆转录合成cDNA,cDNA经PCR扩增、内切酶消化,以评价IGF2特殊等位基因的表达。【结果】IGF2在正常足月胎盘中呈印迹状态;在先兆子痫胎盘中,IGF2为单等位基因表达,无杂合子状态。【结论】在先兆子痫胎盘中未发生IGF2的印迹丢失。     

Transcribed single nucleotide polymorphism: Ideal markers for detecting gene imprinting by 5' nuclease assay

Objective: To establish a novel approach for quick and highly efficient verification of human gene imprinting. Methods: A pair of dye-labelled probes, 5' nuclease assay was combined with RT-PCR to determine the genotype of a transcribed single nucleotide polymorphism (SNP) rs705(C>T) of a known imprinted gene, small nuclear ribonucleotide protein N (SNRPN), on both genomic DNA and cDNA of human lym-phoblast cell lines. Results: Allele discrimination showed a clear monoallelic expression pattern of SNRPN, which was confirmed by RT-PCR based restriction fragment length polymorphism (RFLPs). Pedigree analysis verified the paternal origin of expressed allele, which was in consistency with previous report. Conclusion: Transcribed SNP is an ideal marker for detecting gene imprinting by 5' nuclease assay. This approach also may be used to discover differential allele expression of non-imprinted genes, finding out gene cis-acting functional polymorphism.     

基因印迹与胚胎生长发育

基因印迹为近年来新发现的遗传规律 ,与胚胎的生长发育 ,罕见的遗传病 ,肿瘤发生有着密切的联系 ,且解释了许多孟德尔规律无法企及的现象 ,其意义正逐渐被认识 ,研究也日趋深入。传统的孟德尔规律指出 :胚胎从父亲和母亲遗传的两个拷贝即等位基因 (Ａｌｌｅｌｅｓ)均有同等的机会表达而与其亲代来源无关 ,但近年来发现一小部分基因的表达取决于这些基因是源自父亲还是源自母亲 ,这种等位基因表达取决于亲本来源的现象即是基因印迹 (Ｇｅｎｏｍｉｃｉｍｐｒｉｎｔｉｎｇ) ,也称亲代印迹 (Ｐａｒｅｎｔａｌｉｍｐｒｉｎｔｉｎｇ)或配子印迹 (…     

印迹基因H_(19)在少弱精子症中印迹状态的检测

目的:通过研究印迹基因H19在少弱精子症中的印迹状态,探讨H19与精子发生障碍的相关性。方法:采用聚合酶链式反应与逆转录-聚合酶链式反应,结合限制性片段长度多态性分析法(RFLP),对36例异常精液和15例正常精液标本进行H19印迹状态检测。结果:15例正常精液没有发现印迹丢失,36例异常精液检测出3例印迹丢失,印迹丢失率为8.3%。结论:H19印迹丢失与精子发生障碍有关,可能影响精子的数量。     

鼻咽癌的基因不稳定性

目的:探讨鼻咽癌基因不稳定性对预后的意义.方法:运用单一重复序列间多聚酶链反应(inter-SSR PCR)对38位鼻咽癌患者基因不稳定性进行评估;运用测序和巢式PCR对不同肿瘤的突变片段进行检测.结果:38位患者中有31位(81.6%)显示了基因组失稳,其失稳指数范围为0%～16.2%.6个肿瘤的6q27染色体上证实有获得性基因损害.低于5年生存期患者其基因失稳程度显著高于超过5年生存期的患者(P＜0.05).结论:基因组失稳可作为鼻咽癌发生的早期标志,并且基因组失稳程度加重提示肿瘤预后不良.     

人肝癌中IGF-2表达与基因印迹异常调控的关系

目的研究人肝癌（ＨＣＣ）中ＩＧＦ－２表达特性及与其“基因印迹”状态变化的关系。方法采用Ｎｏｒｔｈｅｒｎｂｌｏｔ、限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）结合ＰＣＲ、ＲＰＡ等方法对１７例ＨＣＣ和６例ＨＣＣ细胞系进行了ＩＧＦ－２基因表达,启动子特异性等位基因的表达和ＩＧＦ－２“基因印迹”状态变化的研究。结果ＨＣＣ中ＩＧＦ－２表达为多样性（低表达,近似正常表达和过度表达）和胚胎性（启动子Ｐ３、Ｐ４重新活化和表达）;１例ＨＣＣ中ＩＧＦ－２双等位基因表达来自于Ｐ３“基因印迹”的丢失。结论在ＩＧＦ－２过度表达的ＨＣＣ中存在功能性的ＩＧＦ－２启动子特异性的“基因印迹”丢失现象。ＩＧＦ－２异常表达与其启动子调控失序有关。