MMP-24基因siRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的:构建基质金属蛋白酶-24(matrix metalloproteinase-24,MMP-24)小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)表达质粒,以研究其对人卵巢浆液性囊腺癌细胞MMP-24基因表达的沉默效果,为探讨肿瘤的基因治疗奠定基础。方法:根据Gen-bank数据库提供的MMP-24基因核苷酸序列,选择设计能转录小发卡RNA(small hairpin RNA,shRNA)结构的DNA序列,克隆到空载体pIU6-B中,构建重组质粒,并进行酶切和PCR鉴定以及测序分析。结果:酶切和PCR鉴定以及测序证实重组质粒构建成功。结论:利用RNA干扰技术可成功构建siRNA表达载体,为进一步探索卵巢癌基因治疗奠定了基础。     

MCHR1基因shRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的构建有效针对小鼠黑色素浓集激素受体1(melanin-concentrating hormone receptor 1,MCHR1)的shRNA(small hairpin RNA)真核表达载体。方法设计合成3条小鼠MCHR1基因的shRNA序列以及1条无同源性的shRNA序列作为阴性对照,与质粒重组构建sh-MCHR1干扰载体,并进行菌液PCR和DNA测序鉴定;脂质体法转染小鼠3T3-L1细胞后观察MCHR1 mRNA和蛋白表达的变化。结果经菌液PCR及DNA测序鉴定表明各shRNA载体构建成功;转染3T3-L1细胞后,与空载体组相比,阴性对照组MCHR1 mRNA和蛋白的表达均无明显差异,但实验组3种干扰载体均能显著抑制MCHR1 mRNA和蛋白的表达(P<0.05),且3种载体的抑制程度有一定的差异,以sh-MCHR1-1载体沉默效果最佳。结论 sh-MCHR1干扰载体构建成功,为进一步探究MCHR1与肥胖症之间的关系奠定了实验基础。     

pU-VEGF-siRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的构建针对血管内皮生长因子的发卡样siRNA真核表达载体pU-VEGF-siRNA,为进一步研究其对动脉粥样硬化的作用奠定基础。方法人工合成一对互补并编码相应短发夹状VEGF-siRNA的寡核苷酸链,将其插入到pSilencerTM2.1-U6 neo载体中,经测序鉴定所构建的重组载体是否正确。结果测序示pU-VEGF-siRNA序列正确。结论测序结果表明pU-VEGF-siRNA真核表达载体构建成功。     

c-myc靶向siRNA真核表达载体的构建和鉴定

目的：设计构建重组体为转染肿瘤细胞，观察癌基因的沉默效果，为探索肿瘤基因治疗的新途径打好基础。方法：以c-myc为靶基因，以pEGFP-C1／U6质粒为载体，设计构建重组体，根据c-myc癌基因cDNA序列，设计有小发夹结构的3条寡核苷酸序列，克隆到空载体pEGFP-C1／U6中，转化DHSa菌株，提取质粒，进行酶切鉴定和测序分析。结果：经酶切鉴定筛出的重组体测序结果与目的序列相同，重组载体构建成功。结论：利用RNAi技术可成功构建小干扰RNA重组体。     

r-PA真核表达载体的构建与鉴定

用SV40和CaMV 35S两种启动子分别启动瑞替普酶(reteplase，r-PA)和标记基因bar基因，构建能在海带中表达外源基因的重组表达载体。通过PCR方法扩增CaMV35S启动子、bar基因和r-PA基因，将扩增的3个片段分别克隆到pGEM-T Easy Vector上。将CaMV片段亚克隆到pCAT3-control载体上得到重组质粒pCAT／CaMV；再将bar基因切下插入到CAT／CaMV上得到重组质粒pCAT／C-B，最后将rPA基因片段切下后插入到pCAT／C-B上获得重组质粒pSVrPA／C-B。PCR、酶切及测序结果均表明已成功扩增出CaMV 35S、r-PA和bar基因片段，并已顺次正确插入到真核表达载体PCAT3-control上，最终成功构建了能在海带中表达r-PA的真核表达载体，用基因枪法转入海带中表达，FAPA法测定得到有体外纤溶活性的阳性海带，为后续研究工作打下坚实的基础。     

构建干扰RhoA的短发夹RNA真核表达载体

目的利用pGenesil-1质粒构建针对RhoA的短发夹RNA(shRNA)表达载体。方法设计2个shRNA结构的互补DNA序列,经退火成双链,胶回收酶切pGenesil-1大片段,T4DNALigase连接酶切大片段和DNA序列,得到质粒pGenesil-1-RhoA1和pGenesil-1-RhoA2.转化感受态细胞DH5a,扩增,提取重组质粒进行酶切鉴定。结果成功构建靶向RhoA的shRNA重组质粒载体.酶切鉴定和测序分析重组质粒,shRNA编码序列与设计的片段完全一致,经酶切凝胶电泳证实载体构建成功。结论表达靶向RhoA的shRNA表达框成功构建在重组质粒载体上。     

乙型肝炎病毒preS基因小分子干扰RNA真核表达载体的构建和鉴定

目的以乙型肝炎病毒（HBV）preS基因区为靶位,构建表达siRNA的质粒载体。方法根据Genbank数据库提供的乙型肝炎病毒preS基因核苷酸序列,根据siRNA设计原则和程序,设计2个靶向preS基因的发夹状siRNA,克隆到pSUPER．puro载体中,构建重组质粒,并进行鉴定分析。结果酶切、PCR鉴定以及测序证实重组质粒构建成功。结论利用RNA干扰技术可成功构建siRNA表达载体,为进一步探索卵巢癌基因治疗奠定了基础。     

MBP不同cDNA序列真核表达载体的构建及鉴定

目的以pEGFP-N1质粒载体为介导,构建针对髓鞘碱性蛋白(MBP)不同isoform cDNA的表达载体。方法将三段不同MBPcDNA序列克隆入pEGFP-N1质粒,转化DH5α感受态细胞,酶切鉴定及测序。结果测序结果显示插入的三段目的片段的序列与理论序列一致。结论笔者成功构建了pEGFP-N1-MBP21.5,pEGFP-N1-MBP18.5和pEGFP-N1-MBP17.3三个重组真核表达载体,为进一步研究不同MBP cDNA在真核细胞中的表达情况和功能差异奠定基础。     

bcr／abl特异性siRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的:构建ber/abl的特异性siRNA真核细胞表达载体,并初步探索对K562细胞bcr/abl mRNA和P210蛋白的影响.方法:根据GenBank数据库提供的bcr/abl基因核苷酸序列,按照Tusch Ⅰ设计原则,选择设计双链小干扰RNA(siRNA),再转化为能表达其小发卡结构RNA(shRNA)的DNA序列,并与pTER质粒定向连接,构建受控于人RNA聚合酶Ⅲ启动子H1的真核表达载体pTER117,经限制性内切酶酶切和DNA测序进行鉴定;在脂质体的介导下转染K562细胞,用RT-PCR分析bcr/abl mRNA的表达,细胞化学染色检测P210蛋白的表达.结果:构建bcr/abl融合基因siRNA真核表达载体pTER117经限制性内切酶酶切和DNA测序证实与设计完全一致,转染K562细胞24 h后,pTER117使bcr/abl mRNA的相对水平下降50%,使P210蛋白下降47%.结论:bcr/abl融合基因siR-NA真核细胞表达载体构建成功,并有效干扰K562细胞bcr/abl的表达.     

Bcl-xl和IGF-1受体特异性siRNA真核表达载体的设计、构建及鉴定

目的:构建能表达靶向Bcl-XL mRNA和IGF1RmRNA的siRNA真核表达质粒。方法:从GeneBank中搜索Bcl-XL(NM_138578)和IGF-1R(NM_000875)基因组标准序列,根椐siRNA设计原理各基因选取两段19bp的碱基序列作为靶目标,根据其序列构建siRNA真核表达质粒:psiBcl-XL1和psiBcl-XL2以及psiIGF1R1和psiIGF1R2。随机选取一段与人类基因无同源性的碱基序列,构建表达siRNA的真核表达质粒作为质粒对照psiHK。所构建的质粒均含有增强绿色荧光基因作为报告基因和SalI的酶切位点。质粒经酶切后,电泳鉴定酶切片段;基因测序分析质粒的碱基序列;用脂质体转染鼻咽癌CNE2细胞。转染后培养48h,做流式细胞仪检测转染率并采用共聚焦显微镜检测质粒绿色荧光蛋白的表达,通过RT-PCR检测各组质粒对其基因的干扰率。结果:质粒psiBcl-XL1、psiBcl-XL2、psiIGF1R1、psiIGF1R2和psiHK酶切后均可见400bp小带,与预期插入的目的基因大小一致,基因测序证实碱基序列与模板序列相符;经荧光显微镜下摄片计算转染效率发现:在转染48小时达最高(45%～50%之间);流式细胞仪检测转染后48小时的转染率为48.45%,并在共聚焦显微镜下观察均见大量的细胞表达绿色荧光;psiBcl-XL1、psiIGF-1R1、psiB-clXL2和psiIGF1R2干扰率分别是:22.1%、50%、70.6%、61.8%。结论:本实验构建了靶向Bcl-XLmRNA和IGF1R mRNA、表达短发夹RNA(short hairpin ribonucleic acid,shRNA)的真核表达质粒。重组质粒能有效转染人鼻咽咽癌细胞,psiBcl-XL2和psiIGF-1R2与psiBcl-XL1和psiIGF1R1相比,转染CNE2 48h后其对mRNA的干扰率相对较高。     

双启动子shRNA真核表达载体的构建

目的:构建含有双启动子的shRNA真核表达载体.方法:通过PCR分别扩增带有BamH Ⅰ、EcoR Ⅰ酶切位点的人U6启动子序列(U6-B/E)和带有Bgl Ⅱ、HindⅢ酶切位点的人U6启动子序列(U6-B/H),用BamH Ⅰ与EcoRⅠ双酶切pcDNA3.1(+)与PCR产物U6-B/E后进行连接,重组质粒命名为psPRO.再用BglⅡ与HindⅢ双酶切psPRO与PCR产物U6-B/H后进行连接,构建含有双启动子的shRNA真核表达载体.结果:酶切鉴定以及DNA测序结果显示载体构建成功.结论:构建双启动子的shRNA真核表达载体,使其在细胞中表达2个不同的siRNA,不仅筛选方便,而且可以通过建立这种模式化工具载体,为今后RNA干扰实验研究的开展和深入提供手段.     

HOGG1特异性锤头状核酶真核表达载体的构建及鉴定

目的　设计并合成人8 羟基鸟嘌呤 DNA糖苷酶(HOGG1)特异性的锤头状核酶(hammerheadribozyme)基因并构建其真核表达载体。鉴定含有核酶靶基因HOGG1cDNA保守序列的真核表达载体。方法　运用计算机软件人工设计并合成核酶基因(RZ) ,将核酶基因克隆到真核表达载体pcDNA 3 1中,重组子由BamHI和EcoRI酶切,琼脂糖凝胶电泳鉴定及DNA测序证实。含有HOGG1基因cDNA保守序列的真核表达载体经BamHI和EcoRI酶切电泳鉴定。结果　RZ人工合成后与pcDNA 3 1连接,酶切电泳及DNA测序证实合成的核酶基因序列正确并已被准确克隆入pcDNA 3 1的BamHI和EcoRI位点之间,命名为pcDNA 3 1 RZ。1 3kb的HOGG1基因cDNA保守序列准确克隆于pcDNA 3 1的BamHI和EcoRI酶切位点之间,命名为pcDNA 3 1 HOGG1。结论　成功合成HOGG1特异性的锤头状核酶基因并构建了该基因的真核表达载体,以及核酶靶基因的真核表达载体。     

人转化生长因子β1质粒真核表达载体的构建与鉴定

目的构建并鉴定人转化生长因子β1(TGF-β1)基因真核表达栽体。方法设计含XbaI和XhoI酶切住点的TGF-β1cDNA引物，采用RT-PCR法，扩增TGF-β1cDNA片段，纯化PCR产物，XbaI和XhoI双酶切并连接至pcDNA3。转化感受态大肠杆菌DH5α。酶切鉴定阳性重组子，并进行序列测定。结果琼脂糖凝胶电泳显示，用XbaI和XhoI双酶切后可形成两条带，分子量分别为1．2kb和5．38kb。符合物理图谱，表明栽体成功构建，并且测序结果与预期结果完全一致。结论成功构建了人TGF-β1基因真核表达栽体。     

大鼠CRH基因RNA干扰慢病毒载体的构建与鉴定

目的：构建针对大鼠促肾上腺皮质激素释放激素（CRH）基因的RNA干扰（RNAi）慢病毒表达载体并进行鉴定。方法针对CRH基因设计4个RNAi靶点并分别构建入慢病毒骨架载体,测序鉴定。过表达质粒和RNAi质粒共转染293T工具细胞后,用Western blot进行外源筛靶以确定有效靶序列。有效RNAi病毒质粒与辅助质粒通过Lipofectamine 2000共转染293T细胞,培养48 h后,收集细胞培养上清液,将其浓缩后用孔稀释法测定病毒滴度。结果 Western blot外源筛靶显示3个靶点能有效敲减目的基因的表达。测定浓缩病毒悬液的滴度为1．5×109 T U／ml。结论成功构建了CRH基因的RNAi慢病毒载体,可用于CRH在应激反应中作用的研究。     

靶向血管内皮生长因子和神经生长因子的shRNA真核表达载体的构建与鉴定

目的利用RNA干扰（RNAi）技术,构建靶向血管内皮生长因子（VEGF）、神经生长因子（NGF）双基因的短发夹RNA（short hairpin,shRNA）真核表达载体用于胶质瘤基因治疗。方法分别设计并体外合成靶向基因VEGF、NGF的特异性编码shRNA序列的寡核苷酸,克隆到经BglⅡ—HindⅢ酶切线性化的pSUPER质粒H1启动子下游,构建shRNA重组质粒,进而脂质体介导瞬时转染胶质瘤细胞系U251,半定量RT-PCR检测VEGF mRNA、NGF mRNA表达。结果重组质粒经过酶切鉴定和测序,插入片段的序列大小、位点和方向均与已合成的寡核苷酸的序列完全一致,在瞬时转染胶质瘤细胞后下调了VEGF mRNA、NGF mRNA的表达。结论成功构建靶向基因VEGF、NGF的shRNA真核表达载体,为进一步应用RNAi技术,研究其对胶质瘤的抑制作用奠定基础。     

小鼠NMDA受体NR2B亚基短发夹RNA干扰真核表达载体的构建与鉴定

目的设计并构建小鼠N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体2B亚基(NR2B)短发卡RNA干扰真核表达载体并鉴定。方法根据NMDA受体NR2B mRNA编码序列设计并合成针对NR2B的特异性RNA干涉片段,将其克隆入pYr-1.1质粒载体,构建NR2B短发夹RNA(shRNA)真核表达载体pYr-1.1-GRIN2B-shRNA,并对其进行酶切和测序鉴定。结果酶切和测序结果均证明NMDA受体NR2B shRNA已经插入质粒载体pYr-1.1。结论 NMDA受体NR2B shRNA真核表达载体pYr-1.1-GRIN2B-shRNA构建成功。     

SATB1基因RNAi慢病毒载体的构建与鉴定

目的构建SATB1基因慢病毒载体,为其体内外实验研究提供依据。方法将靶向SATB1基因的shRNA表达序列连接到慢病毒载体pGCSIL-GFP中,获得pGCSIL—GFP-shSATB1质粒,经PCR和测序鉴定后与慢病毒包装质粒pGCSIL-GFP—shSATB1通过Lipofectamine2000共转染至细胞293T,包装产生病毒液,测定其滴度。结果PCR扩增和测序结果证实,SATB1shRNA核苷酸链序列插入正确,包装慢病毒产生病毒悬液的滴度为2×10^7pfu／ml。结论成功构建人SATB1基因慢病毒载体。     

PPARγ基因靶向shRNA真核表达载体的构建及表达

目的研究短发夹RNA(shorthairpin RNA,shRNA)真核表达载体在人脐静脉内皮细胞(human umbilical veinendo-thelial cell,HUVECs)中对人过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)基因表达的抑制作用。方法设计3条靶向PPARγ的shRNA,经退火成互补双链,克隆到质粒pGPU6/GFP/Neo中构建重组载体,经酶切鉴定和测序确认后,将3个重组表达载体转染到HUVECs,利用Western blot检测并筛选出抑制效果最好的重组表达载体。结果通过酶切鉴定和测序分析,靶向PPARγ的3个pGPU6/GFP/Neo-shR-NA重组载体构建成功,Western blot结果显示pGPU6/GFP/NeoshRNAPPARγ3可有效抑制高糖诱导HUVECs中PPARγ基因的表达,抑制率为63.2%。结论 PPARγ基因靶向shRNA真核表达载体构建成功,且能有效抑制HUVECs中PPARγ基因的表达。     

大鼠VR1基因siRNA表达载体的构建及体内研究

目的探讨辣椒素受体(vanilloid receptor subtype1,VR1)在慢性疼痛发生机制中的作用,构建携带VR1siRNA的慢病毒载体并检测其对大鼠DRG神经元VR1基因的干扰作用。方法设计靶向大鼠VR1基因的发夹状siRNA,合成两对互补的寡核苷酸序列,退火后克隆到酶切的pRNAT-U6.2/Lenti siRNA载体,通过PCR和DNA测序鉴定重组质粒。空载体及重组质粒分别与慢病毒包装质粒共转染293T细胞生成慢病毒载体。通过蛛网膜下腔将慢病毒载体注射到大鼠体内,采用RT-PCR方法检测L4-L6DRG神经元内VR1的沉默效果。结果测序鉴定证实目的寡核苷酸片段被克隆到pRNAT-U6.2/Lenti载体中;经蛛网膜下腔注射后,pRNAT-U6.2/Lenti-siVR1可下调正常大鼠L4-L6DRG神经元内VR1mRNA的表达。结论成功构建了靶向VR1基因的siRNA载体,可有效抑制VR1mRNA的表达,为深入研究和治疗慢性痛提供了有力的工具。     

趋化因子受体CXCR4 shRNA真核表达载体的构建

目的构建趋化因子受体4（CXCR4）的特异RNA干扰载体。方法根据GenBank数据库提供的CXCR4基因mRNA序列,选择设计能转录短发夹状RNA（short hairpin RNAs,shRNA）的DNA序列,并与逆转录病毒载体（pRNAT）连接,用酶切、PCR和DNA测序进行鉴定。结果CXCR4 shRNA真核表达载体构建成功。结论CXCR4 shRNA真核表达载体构建成功,可作为进一步研究该基因的功能和探索白血病的基因治疗的工具。